src/SMESH/MG_ADAPT.cxx

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   2 //
   3 // Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
   4 // CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
   5 //
   6 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   7 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   8 // License as published by the Free Software Foundation; either
   9 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
  10 //
  11 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
  12 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  13 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  14 // Lesser General Public License for more details.
  15 //
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  17 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  18 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  19 //
  20 // See http://www.salome-platform.org/
  21 // file : MG_ADAPT.cxx
  22
  23 #include "MG_ADAPT.hxx"
  24
  25 #include "MeshFormatReader.hxx"
  26 #include "MeshFormatWriter.hxx"
  27 #include "MEDFileMesh.hxx"
  28 #include "MCAuto.hxx"
  29 #include "MEDFileData.hxx"
  30 #include "MEDFileField.hxx"
  31 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  32
  33 #include <utilities.h>
  34 #include <iostream>
  35 #include <unistd.h>
  36 #include <TCollection_AsciiString.hxx>
  37 #include <cstring>
  38 #include <cstdlib>
  39 #include <boost/filesystem.hpp>
  40
  41 using namespace MG_ADAPT;
  42 static std::string removeFile(std::string fileName, int& notOk)
  43 {
  44         std::string errStr;
  45         notOk = std::remove(fileName.c_str());
  46         if (notOk) errStr = ToComment(" \n error while removing file : ")
  47                  << fileName;
  48     else errStr= ToComment("\n file : ")<< fileName << " succesfully deleted! \n ";
  49
  50     return errStr;
  51 }
  52 std::string remove_extension(const std::string& filename) {
  53     size_t lastdot = filename.find_last_of(".");
  54     if (lastdot == std::string::npos) return filename;
  55     return filename.substr(0, lastdot);
  56 }
  57 namespace
  58 {
  59 struct GET_DEFAULT // struct used to get default value from GetOptionValue()
  60 {
  61     bool isDefault;
  62     operator bool* () {
  63         return &isDefault;
  64     }
  65 };
  66 }
  67
  68 //----------------------------------------------------------------------------------------
  69 MgAdapt::MgAdapt()
  70 {
  71     data = new MgAdaptHypothesisData();
  72     data->myInMeshName = "";
  73     data->fromMedFile = defaultFromMedFile();
  74     data->myFileInDir = defaultWorkingDirectory();
  75     data->myMeshFileIn = "";
  76     data->myFileOutDir = defaultWorkingDirectory();
  77     data->myOutMeshName = "";
  78     data->myMeshFileOut = "";
  79     data->myMeshOutMed = defaultMeshOutMed();
  80     data->myPublish = defaultPublish();
  81     data->myUseLocalMap = defaultUseLocalMap();
  82     data->myUseBackgroundMap = defaultUseBackgroundMap();
  83     data->myFileSizeMapDir = defaultWorkingDirectory();
  84     data->myMeshFileBackground = "";
  85     data->myUseConstantValue = defaultUseConstantValue();
  86     data->myConstantValue = 0.0;
  87     data->myFieldName = "";
  88     data->myUseNoTimeStep = defaultUseNoTimeStep();
  89     data->myUseLastTimeStep = defaultUseLastTimeStep();
  90     data->myUseChosenTimeStep = defaultUseChosenTimeStep();
  91     data->myTimeStep = -2;
  92     data->myRank =  -2;
  93     data->myWorkingDir = defaultWorkingDirectory();
  94     data->myLogFile = defaultLogFile();
  95     data->myVerboseLevel = defaultVerboseLevel();
  96     data->myPrintLogInFile = defaultPrintLogInFile();
  97     data->myKeepFiles = defaultKeepFiles();
  98     data->myRemoveLogOnSuccess = defaultRemoveLogOnSuccess();
  99
 100     buildModel();
 101     setAll();
 102 }
 103 MgAdapt::MgAdapt(MgAdaptHypothesisData* myData)
 104 {
 105     data = new MgAdaptHypothesisData();
 106     setData(myData);
 107     buildModel();
 108 }
 109
 110 MgAdapt::MgAdapt( const MgAdapt& copy)
 111 {
 112
 113     data = new MgAdaptHypothesisData();
 114     MgAdaptHypothesisData *copyData = copy.getData();
 115     copyMgAdaptHypothesisData(copyData);
 116     setAll();
 117
 118     this->_option2value = copy._option2value;
 119     this->_customOption2value = copy._customOption2value;
 120     this->_defaultOptionValues = copy._defaultOptionValues;
 121     this->_doubleOptions = copy._doubleOptions;
 122     this->_charOptions = copy._charOptions;
 123     this->_boolOptions = copy._boolOptions;
 124
 125 }
 126
 127
 128
 129 //-----------------------------------------------------------------------------------------
 130 MgAdapt::~MgAdapt()
 131 {
 132
 133     delete data;
 134
 135 }
 136 void MgAdapt::buildModel()
 137 {
 138
 139     const char* boolOptionNames[] = { "compute_ridges",                          // yes
 140                                       "" // mark of end
 141                                     };
 142     // const char* intOptionNames[] = { "max_number_of_errors_printed", // 1
 143     //                                  "max_number_of_threads",        // 4
 144     //                                  "" // mark of end
 145     // };
 146     const char* doubleOptionNames[] = { "max_memory",  // 0
 147                                         "" // mark of end
 148                                       };
 149     const char* charOptionNames[] = { "components",                    // "yes"
 150                                       "adaptation",            // both
 151                                       "" // mark of end
 152                                     };
 153
 154     int i = 0;
 155     while (boolOptionNames[i][0])
 156     {
 157         _boolOptions.insert( boolOptionNames[i] );
 158         _option2value[boolOptionNames[i++]].clear();
 159     }
 160     // i = 0;
 161     // while (intOptionNames[i][0])
 162     //   _option2value[intOptionNames[i++]].clear();
 163
 164     i = 0;
 165     while (doubleOptionNames[i][0]) {
 166         _doubleOptions.insert(doubleOptionNames[i]);
 167         _option2value[doubleOptionNames[i++]].clear();
 168     }
 169     i = 0;
 170     while (charOptionNames[i][0]) {
 171         _charOptions.insert(charOptionNames[i]);
 172         _option2value[charOptionNames[i++]].clear();
 173     }
 174
 175     // default values to be used while MG-Adapt
 176
 177     _defaultOptionValues["adaptation"                         ] = "both";
 178     _defaultOptionValues["components"                         ] = "outside components";
 179     _defaultOptionValues["compute_ridges"                         ] = "yes";
 180     _defaultOptionValues["max_memory"                         ] = ToComment(defaultMaximumMemory());
 181 }
 182
 183 //=============================================================================
 184 TOptionValues MgAdapt::getOptionValues() const
 185 {
 186     TOptionValues vals;
 187     TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.begin();
 188     for ( ; op_val != _option2value.end(); ++op_val )
 189         vals.insert( make_pair( op_val->first, getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() )));
 190
 191     return vals;
 192 }
 193
 194 std::vector <std::string> MgAdapt::getOptionValuesStrVec() const
 195 {
 196     std::vector <std::string> vals;
 197     TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.begin();
 198     for ( ; op_val != _option2value.end(); ++op_val )
 199         vals.push_back(op_val->first+":"+getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() ));
 200
 201     return vals;
 202 }
 203
 204 std::vector <std::string> MgAdapt::getCustomOptionValuesStrVec() const
 205 {
 206     std::vector <std::string> vals;
 207     TOptionValues::const_iterator op_val;
 208     for ( op_val = _customOption2value.begin(); op_val != _customOption2value.end(); ++op_val )
 209     {
 210         vals.push_back(op_val->first+":"+getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() ));
 211     }
 212     return vals;
 213 }
 214 const TOptionValues& MgAdapt::getCustomOptionValues() const
 215 {
 216     return _customOption2value;
 217 }
 218 void MgAdapt::setData(MgAdaptHypothesisData* myData)
 219 {
 220     copyMgAdaptHypothesisData(myData);
 221     setAll();
 222 }
 223 MgAdaptHypothesisData* MgAdapt::getData() const
 224 {
 225     return data;
 226 }
 227 void MgAdapt::setMedFileIn(std::string fileName)
 228 {
 229     medFileIn  = fileName;
 230     if (medFileOut == "") // default MED file Out
 231         medFileOut = remove_extension( fileName )+ ".adapt.med";
 232 }
 233
 234 std::string MgAdapt::getMedFileIn()
 235 {
 236     return medFileIn;
 237 }
 238
 239 void MgAdapt::setMedFileOut(std::string fileOut)
 240 {
 241     medFileOut = fileOut;
 242 }
 243
 244 std::string MgAdapt::getMedFileOut()
 245 {
 246     return medFileOut;
 247 }
 248 void MgAdapt::setMeshOutMed(bool mybool)
 249 {
 250     meshOutMed = mybool;
 251 }
 252 bool MgAdapt::getMeshOutMed()
 253 {
 254     return meshOutMed;
 255 }
 256 void MgAdapt::setPublish(bool mybool)
 257 {
 258     publish = mybool;
 259 }
 260 bool MgAdapt::getPublish()
 261 {
 262     return publish;
 263 }
 264 void MgAdapt::setFieldName(std::string myFieldName)
 265 {
 266     fieldName = myFieldName;
 267 }
 268 std::string MgAdapt::getFieldName()
 269 {
 270     return fieldName;
 271 }
 272 void MgAdapt::setTimeStep(int time)
 273 {
 274     timeStep = time;
 275 }
 276 int MgAdapt::getTimeStep() const
 277 {
 278     return timeStep;
 279 }
 280
 281 void MgAdapt::setRankTimeStep(int time, int myRank)
 282 {
 283     timeStep = time;
 284     rank = myRank;
 285 }
 286
 287 int MgAdapt::getRank()
 288 {
 289     return rank;
 290 }
 291 void MgAdapt::setTimeStepRankLast()
 292 {
 293         myUseLastTimeStep = true;
 294         myUseChosenTimeStep = false;
 295         myUseNoTimeStep = false;
 296         //~med_int aRank, tmst;
 297         //~std::string fieldFile = useBackgroundMap ? sizeMapFile : medFileIn;
 298         //~getTimeStepInfos(fieldFile, tmst, aRank);
 299         //~setRankTimeStep((int) tmst, (int) aRank);
 300 }
 301 void MgAdapt::setNoTimeStep()
 302 {
 303         myUseLastTimeStep = false;
 304         myUseChosenTimeStep = false;
 305         myUseNoTimeStep = true;
 306         //~int aRank = (int)MED_NO_IT;
 307         //~int tmst  = (int)MED_NO_DT ;
 308         //~setRankTimeStep(tmst, aRank);
 309 }
 310 void MgAdapt::setChosenTimeStepRank()
 311 {
 312         myUseLastTimeStep = false;
 313         myUseChosenTimeStep = true;
 314         myUseNoTimeStep = false;
 315         //~int aRank = (int)MED_NO_IT;
 316         //~int tmst  = (int)MED_NO_DT ;
 317         //~setRankTimeStep(tmst, aRank);
 318 }
 319 void MgAdapt::setUseLocalMap(bool myLocal)
 320 {
 321     useLocalMap = myLocal;
 322 }
 323
 324 bool MgAdapt::getUseLocalMap()
 325 {
 326     return useLocalMap;
 327 }
 328
 329 void MgAdapt::setUseBackgroundMap(bool bckg)
 330 {
 331     useBackgroundMap = bckg;
 332 }
 333
 334 bool MgAdapt::getUseBackgroundMap()
 335 {
 336     return useBackgroundMap;
 337 }
 338
 339 void MgAdapt::setUseConstantValue(bool cnst)
 340 {
 341     useConstantValue = cnst;
 342 }
 343 bool MgAdapt::getUseConstantValue()
 344 {
 345     return useConstantValue;
 346 }
 347 void MgAdapt::setLogFile(std::string myLogFile)
 348 {
 349     logFile = myLogFile;
 350 }
 351 std::string MgAdapt::getLogFile()
 352 {
 353     return logFile;
 354 }
 355 void MgAdapt::setVerbosityLevel(int verboLevel)
 356 {
 357     verbosityLevel = verboLevel;
 358 }
 359 int MgAdapt::getVerbosityLevel()
 360 {
 361     return verbosityLevel;
 362 }
 363 void MgAdapt::setRemoveOnSuccess(bool rmons)
 364 {
 365     removeOnSuccess = rmons;
 366 }
 367 bool MgAdapt::getRemoveOnSuccess()
 368 {
 369     return removeOnSuccess;
 370 }
 371 void MgAdapt::setSizeMapFile(std::string mapFile)
 372 {
 373     sizeMapFile = mapFile;
 374 }
 375 std::string MgAdapt::getSizeMapFile()
 376 {
 377     return sizeMapFile;
 378 }
 379
 380 void MgAdapt::setMeshName(std::string name)
 381 {
 382     meshName = name;
 383 }
 384 std::string MgAdapt::getMeshName()
 385 {
 386     return meshName;
 387 }
 388 void MgAdapt::setMeshNameOut(std::string name)
 389 {
 390     meshNameOut = name;
 391 }
 392 std::string MgAdapt::getMeshNameOut()
 393 {
 394     return meshNameOut;
 395 }
 396 void MgAdapt::setFromMedFile(bool mybool)
 397 {
 398     fromMedFile = mybool;
 399 }
 400 bool MgAdapt::isFromMedFile()
 401 {
 402     return fromMedFile;
 403 }
 404 void MgAdapt::setConstantValue(double cnst)
 405 {
 406     constantValue = cnst;
 407 }
 408 double MgAdapt::getConstantValue() const
 409 {
 410     return constantValue;
 411 }
 412
 413 void MgAdapt::setWorkingDir(std::string dir)
 414 {
 415     workingDir = dir;
 416 }
 417 std::string MgAdapt::getWorkingDir() const
 418 {
 419     return workingDir;
 420 }
 421 void MgAdapt::setKeepWorkingFiles(bool mybool)
 422 {
 423     toKeepWorkingFiles = mybool;
 424 }
 425 bool MgAdapt::getKeepWorkingFiles()
 426 {
 427     return toKeepWorkingFiles;
 428 }
 429 void MgAdapt::setPrintLogInFile(bool print)
 430 {
 431     printLogInFile = print;
 432 }
 433 bool MgAdapt::getPrintLogInFile()
 434 {
 435     return printLogInFile;
 436 }
 437
 438
 439 bool MgAdapt::setAll()
 440 {
 441
 442     setFromMedFile(data->fromMedFile);
 443     std::string file;
 444     checkDirPath(data->myFileInDir);
 445     file = data->myFileInDir+data->myMeshFileIn;
 446     setMedFileIn(file);
 447     setMeshName(data->myInMeshName);
 448     setMeshNameOut(data->myOutMeshName);
 449     checkDirPath(data->myFileOutDir);
 450     std::string out = data->myFileOutDir+data->myMeshFileOut;
 451     setMedFileOut(out);
 452     setPublish(data->myPublish);
 453     setMeshOutMed(data->myMeshOutMed);
 454     setUseLocalMap(data->myUseLocalMap);
 455     setUseBackgroundMap(data->myUseBackgroundMap);
 456     setUseConstantValue(data->myUseConstantValue);
 457
 458     std::string mapfile;
 459     if (useBackgroundMap)
 460     {
 461
 462         checkDirPath(data->myFileSizeMapDir);
 463         mapfile = data->myFileSizeMapDir+data->myMeshFileBackground;
 464         setFieldName(data->myFieldName);
 465     }
 466     else if (useConstantValue)
 467     {
 468         setConstantValue(data->myConstantValue);
 469     }
 470     else
 471     {
 472         mapfile ="";
 473         setConstantValue(0.0);
 474         setFieldName(data->myFieldName);
 475
 476     }
 477
 478     setSizeMapFile(mapfile);
 479     if (data->myUseNoTimeStep)
 480         setNoTimeStep();
 481     else if (data->myUseLastTimeStep)
 482         setTimeStepRankLast();
 483     else
 484         {
 485                 setChosenTimeStepRank();
 486                 setRankTimeStep(data->myTimeStep, data->myRank);
 487         }
 488     /* Advanced options */
 489     setWorkingDir(data->myWorkingDir);
 490     checkDirPath(data->myWorkingDir);
 491     setLogFile(data->myWorkingDir+defaultLogFile());
 492     setVerbosityLevel(data->myVerboseLevel);
 493     setRemoveOnSuccess(data->myRemoveLogOnSuccess);
 494     setPrintLogInFile(data->myPrintLogInFile);
 495     setKeepWorkingFiles(data->myKeepFiles);
 496
 497     return true;
 498 }
 499
 500 void MgAdapt::checkDirPath(std::string& dirPath)
 501 {
 502     const char lastChar = *dirPath.rbegin();
 503 #ifdef WIN32
 504     if(lastChar != '\\') dirPath+='\\';
 505 #else
 506     if(lastChar != '/') dirPath+='/';
 507 #endif
 508 }
 509 //=============================================================================
 510 void MgAdapt::setOptionValue(const std::string& optionName,
 511                              const std::string& optionValue)
 512 throw (std::invalid_argument)
 513 {
 514     TOptionValues::iterator op_val = _option2value.find(optionName);
 515     if (op_val == _option2value.end())
 516     {
 517         op_val = _customOption2value.find( optionName );
 518         _customOption2value[ optionName ] = optionValue;
 519         return;
 520     }
 521
 522     if (op_val->second != optionValue)
 523     {
 524
 525                 std::string lowerOptionValue = toLowerStr(optionValue);
 526         const char* ptr = lowerOptionValue.c_str();
 527         // strip white spaces
 528         while (ptr[0] == ' ')
 529             ptr++;
 530         int i = strlen(ptr);
 531         while (i != 0 && ptr[i - 1] == ' ')
 532             i--;
 533         // check value type
 534         bool typeOk = true;
 535         std::string typeName;
 536         if (i == 0) {
 537             // empty string
 538         } else if (_charOptions.count(optionName)) {
 539             // do not check strings
 540         } else if (_doubleOptions.count(optionName)) {
 541             // check if value is double
 542             toDbl(ptr, &typeOk);
 543             typeName = "real";
 544         } else if (_boolOptions.count(optionName)) {
 545             // check if value is bool
 546             toBool(ptr, &typeOk);
 547             typeName = "bool";
 548         } else {
 549             // check if value is int
 550             toInt(ptr, &typeOk);
 551             typeName = "integer";
 552         }
 553         if ( typeOk ) // check some specific values ?
 554         {
 555         }
 556         if ( !typeOk )
 557         {
 558             std::string msg = "Advanced option '" + optionName + "' = '" + optionValue + "' but must be " + typeName;
 559             throw std::invalid_argument(msg);
 560         }
 561         std::string value( ptr, i );
 562         if ( _defaultOptionValues[ optionName ] == value )
 563             value.clear();
 564
 565
 566         op_val->second = value;
 567
 568     }
 569 }
 570 //=============================================================================
 571 //! Return option value. If isDefault provided, it can be a default value,
 572 //  then *isDefault == true. If isDefault is not provided, the value will be
 573 //  empty if it equals a default one.
 574 std::string MgAdapt::getOptionValue(const std::string& optionName, bool*              isDefault) const
 575 throw (std::invalid_argument)
 576 {
 577     TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.find(optionName);
 578     if (op_val == _option2value.end())
 579     {
 580         op_val = _customOption2value.find(optionName);
 581         if (op_val == _customOption2value.end())
 582         {
 583             std::string msg = "Unknown MG-Adapt option: <" + optionName + ">";
 584             throw std::invalid_argument(msg);
 585         }
 586     }
 587     std::string val = op_val->second;
 588     if ( isDefault ) *isDefault = ( val.empty() );
 589
 590     if ( val.empty() && isDefault )
 591     {
 592         op_val = _defaultOptionValues.find( optionName );
 593         if (op_val != _defaultOptionValues.end())
 594             val = op_val->second;
 595     }
 596     return val;
 597 }
 598 //================================================================================
 599 /*!
 600  * \brief Converts a string to a real value
 601  */
 602 //================================================================================
 603
 604 double MgAdapt::toDbl(const std::string& str, bool* isOk )
 605 throw (std::invalid_argument)
 606 {
 607     if ( str.empty() ) throw std::invalid_argument("Empty value provided");
 608
 609     char * endPtr;
 610     double val = strtod(&str[0], &endPtr);
 611     bool ok = (&str[0] != endPtr);
 612
 613     if ( isOk ) *isOk = ok;
 614
 615     if ( !ok )
 616     {
 617         std::string msg = "Not a real value:'" + str + "'";
 618         throw std::invalid_argument(msg);
 619     }
 620     return val;
 621 }
 622 //================================================================================
 623 /*!
 624  * \brief Converts a string to a lower
 625  */
 626 //================================================================================
 627 std::string MgAdapt::toLowerStr(const std::string& str)
 628 {
 629     std::string s = str;
 630         for ( size_t i = 0; i <= s.size(); ++i )
 631         s[i] = tolower( s[i] );
 632     return s;
 633 }
 634 //================================================================================
 635 /*!
 636  * \brief Converts a string to a bool
 637  */
 638 //================================================================================
 639
 640 bool MgAdapt::toBool(const std::string& str, bool* isOk )
 641 throw (std::invalid_argument)
 642 {
 643     std::string s = str;
 644     if ( isOk ) *isOk = true;
 645
 646     for ( size_t i = 0; i <= s.size(); ++i )
 647         s[i] = tolower( s[i] );
 648
 649     if ( s == "1" || s == "true" || s == "active" || s == "yes" )
 650         return true;
 651
 652     if ( s == "0" || s == "false" || s == "inactive" || s == "no" )
 653         return false;
 654
 655     if ( isOk )
 656         *isOk = false;
 657     else {
 658         std::string msg = "Not a Boolean value:'" + str + "'";
 659         throw std::invalid_argument(msg);
 660     }
 661     return false;
 662 }
 663 //================================================================================
 664 /*!
 665  * \brief Converts a string to a integer value
 666  */
 667 //================================================================================
 668
 669 int MgAdapt::toInt(const std::string& str, bool* isOk )
 670 throw (std::invalid_argument)
 671 {
 672     if ( str.empty() ) throw std::invalid_argument("Empty value provided");
 673
 674     char * endPtr;
 675     int val = (int)strtol( &str[0], &endPtr, 10);
 676     bool ok = (&str[0] != endPtr);
 677
 678     if ( isOk ) *isOk = ok;
 679
 680     if ( !ok )
 681     {
 682         std::string msg = "Not an integer value:'" + str + "'";
 683         throw std::invalid_argument(msg);
 684     }
 685     return val;
 686 }
 687 //=============================================================================
 688 bool MgAdapt::hasOptionDefined( const std::string& optionName ) const
 689 {
 690     bool isDefault = false;
 691     try
 692     {
 693         getOptionValue( optionName, &isDefault );
 694     }
 695     catch ( std::invalid_argument )
 696     {
 697         return false;
 698     }
 699     return !isDefault;
 700 }
 701 //================================================================================
 702 /*!
 703  * \brief Return command to run MG-Tetra mesher excluding file prefix (-f)
 704  */
 705 //================================================================================
 706
 707 std::string MgAdapt::getCommandToRun(MgAdapt* hyp)
 708 {
 709     return hyp ? hyp->getCommandToRun() : ToComment("error with hypothesis!");
 710 }
 711
 712
 713
 714 int MgAdapt::compute(std::string& errStr)
 715 {
 716     std::string cmd = getCommandToRun();
 717     int err = 0;
 718     execCmd( cmd.c_str(), err ); // run
 719
 720     if ( err )
 721     {
 722         errStr = ToComment("system(mg-adapt.exe ...) command failed with error: ")
 723                  << strerror( errno );
 724     }
 725     else
 726     {
 727         convertMeshFile(meshFormatOutputMesh, solFormatOutput);
 728     }
 729     if (!err) cleanUp();
 730     return err;
 731 }
 732
 733 void MgAdapt::execCmd( const char* cmd, int& err)
 734 {
 735     err = 1;
 736     std::array <char, 128> buffer;
 737     std::streambuf* buf;
 738         outFileStream fileStream;
 739     if (printLogInFile)
 740     {
 741                 fileStream.open(logFile);
 742                 buf = fileStream.rdbuf();
 743         }
 744         else
 745         {
 746            buf = std::cout.rdbuf();
 747         }
 748         std::ostream logStream(buf);
 749
 750     std::unique_ptr <FILE, decltype(&pclose)> pipe(popen(cmd, "r"), pclose );
 751     if(!pipe)
 752     {
 753         throw std::runtime_error("popen() failed!");
 754     }
 755     while(fgets(buffer.data(), buffer.size(), pipe.get()) !=nullptr )
 756     {
 757         logStream<<buffer.data() ;
 758     }
 759     err = 0;
 760 }
 761 /*
 762  * to delete tmp files .mesh, .sol and if needed
 763  * the log file
 764  *
 765  */
 766 void MgAdapt::cleanUp()
 767 {
 768         int notOk;
 769         std::string errStr;
 770         if(toKeepWorkingFiles)
 771             return;
 772         if(removeOnSuccess && printLogInFile)
 773             tmpFilesToBeDeleted.push_back(logFile);
 774
 775         std::vector< std::string>::iterator it = tmpFilesToBeDeleted.begin();
 776         for (; it!=tmpFilesToBeDeleted.end(); ++it)
 777         {
 778                 errStr=removeFile(*it, notOk);
 779                 if (notOk)
 780                 {
 781                         appendMsgToLogFile(errStr);
 782                 }
 783
 784         }
 785 }
 786
 787 void MgAdapt::appendMsgToLogFile(std::string& msg)
 788 {
 789         std::ofstream logStream;
 790         logStream.open(logFile, std::ofstream::out | std::ofstream::app);
 791         logStream<< msg;
 792     logStream.close();
 793 }
 794 //================================================================================
 795 /*!
 796  * \brief Return command to run MG-Tetra mesher excluding file prefix (-f)
 797  */
 798 //================================================================================
 799
 800 std::string MgAdapt::getCommandToRun()
 801 {
 802     /*
 803     || return system command with args and options
 804     ||
 805     */
 806     std::string errStr;
 807     std::string cmd = getExeName();
 808     std::string meshIn(""), sizeMapIn(""), solFileIn("");
 809     updateTimeStepRank();
 810     convertMedFile(meshIn, solFileIn, sizeMapIn);
 811     if (!isFileExist(meshIn) || !isFileExist(solFileIn))
 812     {
 813         errStr = ToComment(" failed to find .mesh or .sol file from converter ")<< strerror( errno );
 814         return errStr;
 815     }
 816     tmpFilesToBeDeleted.push_back(meshIn);
 817     tmpFilesToBeDeleted.push_back(solFileIn);
 818     if(useBackgroundMap && !isFileExist(sizeMapIn))
 819     {
 820
 821         errStr = ToComment(" failed to find .mesh size map file from converter ")<< strerror( errno );
 822         return errStr;
 823
 824     }
 825
 826
 827     cmd+= " --in "+ meshIn;
 828     meshFormatOutputMesh = getFileName()+".mesh";
 829     tmpFilesToBeDeleted.push_back(meshFormatOutputMesh);
 830     cmd+= " --out "+ meshFormatOutputMesh;
 831     if (useLocalMap || useConstantValue) cmd+= " --sizemap "+ solFileIn;
 832     else //  (useBackgroundMap)
 833     {
 834         cmd+= " --background_mesh "+ sizeMapIn ;
 835         cmd+= " --background_sizemap "+ solFileIn;
 836                 tmpFilesToBeDeleted.push_back(sizeMapIn);
 837     }
 838     //~else
 839     //~{
 840         //~// constant value TODO
 841     //~}
 842     /* sizemap file is not adapted in case of only surface adaptation see MeshGems docs */
 843     std::string adapOp   = "adaptation";
 844     std::string adpOpVal = getOptionValue(adapOp);
 845     std::string surfaceAdapt = "surface";
 846     if(surfaceAdapt != adpOpVal )
 847     {
 848                 std::string solFileOut = getFileName()+".sol";
 849         cmd+= " --write_sizemap "+ solFileOut;
 850                 solFormatOutput.push_back(solFileOut);
 851                 tmpFilesToBeDeleted.push_back(solFileOut);
 852         }
 853     if (verbosityLevel != defaultVerboseLevel())
 854     {
 855
 856         cmd+= " --verbose "+ ToComment(verbosityLevel);
 857     }
 858
 859     std::string option, value;
 860     bool isDefault;
 861     const TOptionValues* options[] = { &_option2value, &_customOption2value };
 862     for ( int iOp = 0; iOp < 2; ++iOp )
 863     {
 864         TOptionValues::const_iterator o2v = options[iOp]->begin();
 865         for ( ; o2v != options[iOp]->end(); ++o2v )
 866         {
 867             option = o2v->first;
 868             value = getOptionValue( option, &isDefault );
 869
 870             if ( isDefault )
 871                 continue;
 872             if ( value.empty() )//value == NoValue() )
 873             {
 874                 if ( _defaultOptionValues.count( option ))
 875                     continue; // non-custom option with no value
 876                 //value.clear();
 877             }
 878             if ( strncmp( "no", option.c_str(), 2 ) == 0 ) // options w/o values: --no_*
 879             {
 880                 if ( !value.empty() && toBool( value ) == false )
 881                     continue;
 882                 value.clear();
 883             }
 884             if ( option[0] != '-' )
 885                 cmd += " --";
 886             else
 887                 cmd += " ";
 888             cmd += option + " " + value;
 889         }
 890     }
 891     //~}
 892 //~cmd+= " >"
 893 #ifdef WIN32
 894     cmd += " < NUL";
 895 #endif
 896
 897     return cmd;
 898 }
 899
 900
 901 bool MgAdapt::isFileExist(const std::string& fName)
 902 {
 903
 904     if ( fName.empty() )
 905         return false;
 906
 907     boost::system::error_code err;
 908     bool res = boost::filesystem::exists( fName, err );
 909
 910     return err ? false : res;
 911 }
 912 //=======================================================================
 913 //function : defaultMaximumMemory
 914 //=======================================================================
 915
 916 #if defined(WIN32)
 917 #include <windows.h>
 918 #elif !defined(__APPLE__)
 919 #include <sys/sysinfo.h>
 920 #endif
 921
 922 double MgAdapt::defaultMaximumMemory()
 923 {
 924 #if defined(WIN32)
 925     // See http://msdn.microsoft.com/en-us/library/aa366589.aspx
 926     MEMORYSTATUSEX statex;
 927     statex.dwLength = sizeof (statex);
 928     long err = GlobalMemoryStatusEx (&statex);
 929     if (err != 0) {
 930         double totMB = (double)statex.ullAvailPhys / 1024. / 1024.;
 931         return (double)( 0.7 * totMB );
 932     }
 933 #elif !defined(__APPLE__)
 934     struct sysinfo si;
 935     long err = sysinfo( &si );
 936     if ( err == 0 ) {
 937         long ramMB = si.totalram * si.mem_unit / 1024 / 1024;
 938         return ( 0.7 * ramMB );
 939     }
 940 #endif
 941     return 1024;
 942 }
 943
 944
 945 //=======================================================================
 946 //function : defaultWorkingDirectory
 947 //=======================================================================
 948
 949 std::string MgAdapt::defaultWorkingDirectory()
 950 {
 951     TCollection_AsciiString aTmpDir;
 952
 953     char *Tmp_dir = getenv("SALOME_TMP_DIR");
 954     if(Tmp_dir != NULL) {
 955         aTmpDir = Tmp_dir;
 956     }
 957     else {
 958 #ifdef WIN32
 959         aTmpDir = TCollection_AsciiString("C:\\");
 960 #else
 961         aTmpDir = TCollection_AsciiString("/tmp/");
 962 #endif
 963     }
 964     return aTmpDir.ToCString();
 965 }
 966 //================================================================================
 967 /*!
 968  * \brief Return a unique file name
 969  */
 970 //================================================================================
 971
 972 std::string MgAdapt::getFileName() const
 973 {
 974     std::string aTmpDir = workingDir;
 975     const char lastChar = *aTmpDir.rbegin();
 976 #ifdef WIN32
 977     if(lastChar != '\\') aTmpDir+='\\';
 978 #else
 979     if(lastChar != '/') aTmpDir+='/';
 980 #endif
 981
 982     TCollection_AsciiString aGenericName = (char*)aTmpDir.c_str();
 983     aGenericName += "MgAdapt_";
 984     aGenericName += getpid();
 985     aGenericName += "_";
 986     aGenericName += Abs((Standard_Integer)(long) aGenericName.ToCString());
 987
 988     return aGenericName.ToCString();
 989 }
 990 //=======================================================================
 991 //function : defaultLogFile
 992 //=======================================================================
 993
 994 std::string MgAdapt::defaultLogFile()
 995 {
 996     std::string alogFile("MG_ADAPT.log");
 997     return alogFile;
 998 }
 999 //=======================================================================
1000 //function : defaultUseConstantValue
1001 //=======================================================================
1002
1003 bool  MgAdapt::defaultUseConstantValue()
1004 {
1005     return false;
1006 }
1007 //=======================================================================
1008 //function : defaultUseNoTimeStep
1009 //=======================================================================
1010
1011 bool  MgAdapt::defaultUseNoTimeStep()
1012 {
1013     return true;
1014 }
1015 //=======================================================================
1016 //function : defaultRemoveLogOnSuccess
1017 //=======================================================================
1018
1019 bool  MgAdapt::defaultRemoveLogOnSuccess()
1020 {
1021     return true;
1022 }
1023 //=======================================================================
1024 //function : defaultPrintLogInFile
1025 //=======================================================================
1026
1027 bool  MgAdapt::defaultPrintLogInFile()
1028 {
1029     return false;
1030 }
1031 //=======================================================================
1032 //function : defaultUseChosenTimeStep
1033 //=======================================================================
1034
1035 bool  MgAdapt::defaultUseChosenTimeStep()
1036 {
1037     return false;
1038 }
1039 //=======================================================================
1040 //function : UseLastTimeStep
1041 //=======================================================================
1042
1043 bool  MgAdapt::defaultUseLastTimeStep()
1044 {
1045     return false;
1046 }
1047 //=======================================================================
1048 //function : defaultUseBackgroundMap
1049 //=======================================================================
1050
1051 bool   MgAdapt::defaultUseBackgroundMap()
1052 {
1053     return false;
1054 }
1055 //=======================================================================
1056 //function : defaultKeepFiles
1057 //=======================================================================
1058
1059 bool   MgAdapt::defaultKeepFiles()
1060 {
1061     return false;
1062 }
1063 //=======================================================================
1064 //function : defaultUseLocalMap
1065 //=======================================================================
1066
1067 bool   MgAdapt::defaultUseLocalMap()
1068 {
1069     return true;
1070 }
1071 //=======================================================================
1072 //function : defaultPublish
1073 //=======================================================================
1074
1075 bool   MgAdapt::defaultPublish()
1076 {
1077     return false;
1078 }
1079 //=======================================================================
1080 //function : defaultMeshOutMed
1081 //=======================================================================
1082
1083 bool   MgAdapt::defaultMeshOutMed()
1084 {
1085     return true;
1086 }
1087 //=======================================================================
1088 //function : defaultFromMedFile
1089 //=======================================================================
1090
1091 bool   MgAdapt::defaultFromMedFile()
1092 {
1093     return true;
1094 }
1095 //=======================================================================
1096 //function : defaultVerboseLevel
1097 //=======================================================================
1098
1099 int  MgAdapt::defaultVerboseLevel()
1100 {
1101     return 3;
1102 }
1103 std::string MgAdapt::getExeName()
1104 {
1105     return "mg-adapt.exe";
1106 }
1107 void MgAdapt::copyMgAdaptHypothesisData( const MgAdaptHypothesisData* from)
1108 {
1109
1110     data->myFileInDir = from->myFileInDir;
1111     data->myMeshFileIn = from->myMeshFileIn;
1112     data->myMeshFileBackground = from->myMeshFileBackground;
1113     data->myOutMeshName = from->myOutMeshName;
1114     data->myMeshFileOut = from->myMeshFileOut;
1115     data->myFileOutDir = from->myFileOutDir;
1116     data->myFileSizeMapDir = from->myFileSizeMapDir;
1117     data->myFieldName = from->myFieldName;
1118     data->fromMedFile = from->fromMedFile;
1119     data->myPublish = from->myPublish;
1120     data->myMeshOutMed = from->myMeshOutMed;
1121     data->myUseLocalMap = from->myUseLocalMap;
1122     data->myUseBackgroundMap = from->myUseBackgroundMap;
1123     data->myUseConstantValue = from->myUseConstantValue;
1124     data->myConstantValue = from->myConstantValue;
1125     data->myTimeStep = from->myTimeStep;
1126     data->myRank = from->myRank;
1127     data->myUseNoTimeStep = from->myUseNoTimeStep;
1128     data->myUseLastTimeStep = from->myUseLastTimeStep;
1129     data->myUseChosenTimeStep = from->myUseChosenTimeStep;
1130     data->myWorkingDir = from->myWorkingDir;
1131     data->myLogFile = from->myLogFile;
1132     data->myPrintLogInFile = from->myPrintLogInFile;
1133     data->myKeepFiles = from->myKeepFiles;
1134     data->myRemoveLogOnSuccess = from->myRemoveLogOnSuccess;
1135     data->myVerboseLevel = from->myVerboseLevel;
1136
1137 }
1138
1139
1140 void MgAdapt::convertMedFile(std::string& meshFormatMeshFileName, std::string& solFormatFieldFileName, std::string& meshFormatsizeMapFile)
1141 {
1142
1143     std::vector<std::string> fieldFileNames;
1144     MEDCoupling::MeshFormatWriter writer;
1145     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(medFileIn);
1146     MEDCoupling::MEDFileMeshes* meshes = mfd->getMeshes();
1147     MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh = meshes->getMeshAtPos(0); // ok only one mesh in file!
1148     if (meshNameOut =="")
1149         meshNameOut = fileMesh->getName();
1150     storeGroupsAndFams(fileMesh);
1151
1152     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFields> fields = MEDCoupling::MEDFileFields::New();
1153     solFormatFieldFileName = getFileName();
1154     solFormatFieldFileName+=".sol";
1155     fieldFileNames.push_back(solFormatFieldFileName);
1156
1157     if (useBackgroundMap)
1158     {
1159
1160         meshFormatsizeMapFile = getFileName();
1161         meshFormatsizeMapFile += ".mesh";
1162             buildBackGroundMeshAndSolFiles(fieldFileNames, meshFormatsizeMapFile);
1163
1164     }
1165     else if(useLocalMap)
1166     {
1167
1168         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts = dynamic_cast<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS *>( mfd->getFields()->getFieldWithName(fieldName) );
1169         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeField1TS> f = fts->getTimeStep(timeStep, rank);
1170         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS> tmFts = MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS::New();
1171         tmFts->pushBackTimeStep(f);
1172
1173         fields->pushField(tmFts);
1174
1175         writer.setFieldFileNames( fieldFileNames);
1176     }
1177
1178     else
1179     {
1180         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDCouplingMesh> mesh = fileMesh->getMeshAtLevel(1); // nodes mesh
1181         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh> umesh = mesh->buildUnstructured(); // nodes mesh
1182         int dim  =  umesh->getSpaceDimension();
1183         int version =  sizeof(double) < 8 ? 1 : 2;
1184         mcIdType nbNodes =  umesh->getNumberOfNodes();
1185         buildConstantSizeMapSolFile(solFormatFieldFileName, dim, version, nbNodes);
1186
1187     }
1188
1189     mfd->setFields( fields );
1190     meshFormatMeshFileName = getFileName();
1191     meshFormatMeshFileName+=".mesh";
1192     writer.setMeshFileName(meshFormatMeshFileName);
1193     writer.setMEDFileDS( mfd);
1194     writer.write();
1195
1196 }
1197
1198 void MgAdapt::convertMeshFile(std::string& meshFormatIn, std::vector< std::string>& solFieldFileNames) const
1199 {
1200     MEDCoupling::MeshFormatReader reader(meshFormatIn, solFieldFileNames);
1201
1202     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = reader.loadInMedFileDS();
1203     // write MED
1204     MEDCoupling::MEDFileMeshes* meshes = mfd->getMeshes();
1205     MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh = meshes->getMeshAtPos(0); // ok only one mesh in file!
1206     fileMesh->setName(meshNameOut);
1207     restoreGroupsAndFams(fileMesh);
1208     mfd->write(medFileOut, 2);
1209 }
1210
1211
1212 void MgAdapt::storeGroupsAndFams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1213 {
1214     storefams(fileMesh);
1215     storeGroups(fileMesh);
1216 }
1217
1218 void MgAdapt::restoreGroupsAndFams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1219 {
1220     restorefams(fileMesh);
1221     restoreGroups(fileMesh);
1222 }
1223 void MgAdapt::storeGroups(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1224 {
1225     std::map<std::string, std::vector<std::string> > grpFams = fileMesh->getGroupInfo();
1226     std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator g2ff = grpFams.begin();
1227
1228     for ( ; g2ff != grpFams.end(); ++g2ff )
1229     {
1230         std::string        groupName = g2ff->first;
1231         std::vector<std::string> famNames = g2ff->second;
1232
1233         if ( famNames.empty() ) continue;
1234         std::size_t k = 0;
1235         std::vector< mcIdType> famListId;
1236         for ( size_t i = 0; i < famNames.size(); ++i )
1237         {
1238             famListId.push_back( fileMesh->getFamilyId( famNames[i].c_str() ) );
1239         }
1240         group grp(groupName, famListId, famNames);
1241         groupVec.push_back(grp);
1242     }
1243 }
1244
1245 void MgAdapt::storefams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1246 {
1247     std::map<std::string, mcIdType> grpFams = fileMesh->getFamilyInfo();
1248     std::map<std::string, mcIdType >::iterator f = grpFams.begin();
1249
1250     for ( ; f != grpFams.end(); ++f )
1251     {
1252         if(!f->second) continue;  // FAMILLE_ZERO
1253         family fs(f->first, f->second);
1254         famVec.push_back(fs);
1255     }
1256
1257 }
1258
1259 void MgAdapt::restorefams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1260 {
1261     std::vector<family>::const_iterator fIt = famVec.begin();
1262
1263     for (; fIt!=famVec.end(); ++fIt)
1264     {
1265                 try  //
1266         {
1267                         std::string givenFamNameFromMeshGemConverter = fileMesh->getFamilyNameGivenId( std::abs(fIt->_famId) );
1268             fileMesh->changeFamilyId(std::abs(fIt->_famId), fIt->_famId);
1269             fileMesh->changeFamilyName(givenFamNameFromMeshGemConverter, fIt->_famName);
1270         }
1271         catch (const std::exception& e)
1272         {
1273             std::cerr<<e.what();
1274         }
1275     }
1276 }
1277
1278 void MgAdapt::restoreGroups(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1279 {
1280     std::map<std::string, std::vector<std::string> > info;
1281     std::vector <group>::const_iterator grpFams = groupVec.begin();
1282
1283     for (; grpFams!=groupVec.end(); ++grpFams)
1284     {
1285         info.insert(std::pair <std::string, std::vector<std::string> > (grpFams->_name, grpFams->_famNames) );
1286     }
1287
1288     fileMesh->setGroupInfo(info);
1289 }
1290
1291 void MgAdapt::buildConstantSizeMapSolFile(const std::string& solFormatFieldFileName, const int dim, const int version, const mcIdType nbNodes) const
1292 {
1293         MeshFormat::Localizer loc;
1294     MeshFormat::MeshFormatParser writer;
1295     int fileId = writer.GmfOpenMesh( solFormatFieldFileName.c_str(), GmfWrite, version, dim);
1296     int typTab[] = {GmfSca};
1297     writer.GmfSetKwd(fileId, MeshFormat::GmfSolAtVertices, (int)nbNodes, 1, typTab);
1298     for (mcIdType i = 0; i<nbNodes; i++)
1299     {
1300                 double valTab[1] = {constantValue};
1301                 writer.GmfSetLin( fileId, MeshFormat::GmfSolAtVertices, valTab);
1302         }
1303     writer.GmfCloseMesh(fileId);
1304 }
1305
1306 void MgAdapt::buildBackGroundMeshAndSolFiles(const std::vector<std::string>& fieldFileNames, const std::string& meshFormatsizeMapFile) const
1307 {
1308     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> tmpMfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(sizeMapFile);
1309         MEDCoupling::MEDFileFields* tmpFields = tmpMfd->getFields();
1310         MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS* fts = tmpFields->getFieldWithName(fieldName);
1311         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS>  fts1 = dynamic_cast<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS *>(fts);
1312         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeField1TS> f = fts1->getTimeStep(timeStep, rank);
1313         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS> tmFts = MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS::New();
1314         tmFts->pushBackTimeStep(f);
1315
1316         MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFields> tmp_fields = MEDCoupling::MEDFileFields::New();
1317         tmp_fields->pushField(tmFts);
1318
1319
1320         tmpMfd->setFields( tmp_fields );
1321         MEDCoupling::MeshFormatWriter tmpWriter;
1322         tmpWriter.setMeshFileName(meshFormatsizeMapFile);
1323         tmpWriter.setFieldFileNames( fieldFileNames);
1324         tmpWriter.setMEDFileDS(tmpMfd);
1325         tmpWriter.write();
1326 }
1327 // =======================================================================
1328 med_idt MgAdapt::openMedFile(const std::string aFile)
1329 // =======================================================================
1330 // renvoie le medId associe au fichier Med apres ouverture
1331 {
1332     med_idt medIdt = MEDfileOpen(aFile.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1333     if (medIdt <0)
1334     {
1335         //~addMessage( ToComment(" error: Can't open  ") << aFile, /*fatal=*/true );
1336         ;
1337     }
1338     return medIdt;
1339 }
1340
1341 MgAdapt::Status MgAdapt::addMessage(const std::string& msg,
1342                                     const bool         isFatal/*=false*/)
1343 {
1344     if ( isFatal )
1345         _myErrorMessages.clear(); // warnings are useless if a fatal error encounters
1346
1347     _myErrorMessages.push_back( msg );
1348
1349     //~MESSAGE(msg);
1350 #ifdef _DEBUG_
1351     std::cout << msg << std::endl;
1352 #endif
1353     return ( _myStatus = isFatal ? MgAdapt::DRS_FAIL : MgAdapt::DRS_WARN_SKIP_ELEM );
1354 }
1355
1356
1357
1358
1359 // =======================================================================
1360 void MgAdapt::getTimeStepInfos(std::string aFile, med_int& numdt, med_int& numit)
1361 // =======================================================================
1362 {
1363 // Il faut voir si plusieurs maillages
1364
1365
1366     herr_t erreur = 0 ;
1367     med_idt medIdt ;
1368
1369
1370     // Ouverture du fichier
1371     //~SCRUTE(aFile.toStdString());
1372     medIdt = openMedFile(aFile);
1373     if ( medIdt < 0 ) return ;
1374     // Lecture du nombre de champs
1375     med_int ncha = MEDnField(medIdt) ;
1376     if (ncha < 1 )
1377     {
1378         //~addMessage( ToComment(" error: there is no field in  ") << aFile, /*fatal=*/true );
1379         return;
1380     }
1381     // Lecture des caracteristiques du champs
1382
1383     //       Lecture du type du champ, des noms des composantes et du nom de l'unite
1384     char nomcha  [MED_NAME_SIZE+1];
1385     strcpy(nomcha, fieldName.c_str());
1386 //       Lecture du nombre de composantes
1387     med_int ncomp = MEDfieldnComponentByName(medIdt, nomcha);
1388     char meshname[MED_NAME_SIZE+1];
1389     char * comp = (char*) malloc(ncomp*MED_SNAME_SIZE+1);
1390     char * unit = (char*) malloc(ncomp*MED_SNAME_SIZE+1);
1391     char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
1392     med_bool local;
1393     med_field_type typcha;
1394     med_int nbofcstp;
1395     erreur =  MEDfieldInfoByName (medIdt, nomcha, meshname,&local,&typcha,comp,unit,dtunit, &nbofcstp);
1396     free(comp);
1397     free(unit);
1398     if ( erreur < 0 )
1399     {
1400         //~addMessage( ToComment(" error: error while reading field  ") << nomcha << " in file " << aFile , /*fatal=*/true );
1401         return;
1402     }
1403
1404     med_float dt;
1405     med_int tmp_numdt, tmp_numit;
1406
1407     //~med_int step = data->myUseLastTimeStep ? nbofcstp : data->myTimeStep+1;
1408     //~myPrint("step ", step);
1409         erreur = MEDfieldComputingStepInfo      ( medIdt, nomcha, 1, &numdt, &numit, &dt );
1410     for(med_int step = 1; step <= nbofcstp; step++ )
1411     {
1412                 erreur = MEDfieldComputingStepInfo      ( medIdt, nomcha, step, &tmp_numdt, &tmp_numit, &dt );
1413                 if(tmp_numdt > numdt)
1414                 {
1415                     numdt = tmp_numdt;
1416                         numit = tmp_numit;
1417                 }
1418         }
1419     if ( erreur < 0 )
1420     {
1421
1422         //~addMessage( ToComment(" error: error while reading field ") << nomcha << "step (numdt, numit) = " <<"("<< numdt<< ", " \
1423         numit<< ")" <<" in file " << aFile , /*fatal=*/true );
1424         return;
1425     }
1426
1427
1428
1429     // Fermeture du fichier
1430     if ( medIdt > 0 ) MEDfileClose(medIdt);
1431
1432
1433 }
1434
1435 void MgAdapt::updateTimeStepRank()
1436 {
1437
1438     med_int arank;
1439     med_int tmst;
1440     if (myUseNoTimeStep)
1441     {
1442         arank = MED_NO_IT;
1443         tmst  = MED_NO_DT ;
1444                 setRankTimeStep((int)tmst, (int)arank);
1445     }
1446     else if (myUseLastTimeStep)
1447     {
1448         std::string fieldFile = useBackgroundMap ? sizeMapFile : medFileIn;
1449         getTimeStepInfos(fieldFile, tmst, arank);
1450                 setRankTimeStep((int)tmst, (int)arank);
1451     }
1452 }