src/SMESH/MG_ADAPT.cxx

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   2 //
   3 // Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
   4 // CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
   5 //
   6 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   7 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
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   9 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
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  12 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
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  15 //
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  17 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  18 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  19 //
  20 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  21 // file : MG_ADAPT.cxx
  22
  23 #include "MG_ADAPT.hxx"
  24
  25 #include "MeshFormatReader.hxx"
  26 #include "MeshFormatWriter.hxx"
  27 #include "MEDFileMesh.hxx"
  28 #include "MCAuto.hxx"
  29 #include "MEDFileData.hxx"
  30 #include "MEDFileField.hxx"
  31 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  32
  33 #include <SALOME_NamingService.hxx>
  34 #include <Utils_SALOME_Exception.hxx>
  35 #include "Utils_CorbaException.hxx"
  36
  37 #include <utilities.h>
  38 #include <iostream>
  39 #include <unistd.h>
  40 #include <TCollection_AsciiString.hxx>
  41 #include <cstring>
  42 #include <cstdlib>
  43 #include <boost/filesystem.hpp>
  44
  45 using namespace MG_ADAPT;
  46 static std::string removeFile(std::string fileName, int& notOk)
  47 {
  48   std::string errStr;
  49   notOk = std::remove(fileName.c_str());
  50   if (notOk) errStr = ToComment("\n error while removing file : ") << fileName;
  51         else errStr = ToComment("\n file : ") << fileName << " succesfully deleted! \n ";
  52
  53   return errStr;
  54 }
  55 std::string remove_extension(const std::string& filename) {
  56   size_t lastdot = filename.find_last_of(".");
  57   if (lastdot == std::string::npos) return filename;
  58   return filename.substr(0, lastdot);
  59 }
  60 namespace
  61 {
  62 struct GET_DEFAULT // struct used to get default value from GetOptionValue()
  63 {
  64   bool isDefault;
  65   operator bool* () {
  66       return &isDefault;
  67   }
  68 };
  69 }
  70
  71 //----------------------------------------------------------------------------------------
  72 MgAdapt::MgAdapt()
  73 {
  74   data = new MgAdaptHypothesisData();
  75   data->myInMeshName = "";
  76   data->fromMedFile = defaultFromMedFile();
  77   data->myFileInDir = defaultWorkingDirectory();
  78   data->myMeshFileIn = "";
  79   data->myFileOutDir = defaultWorkingDirectory();
  80   data->myOutMeshName = "";
  81   data->myMeshFileOut = "";
  82   data->myMeshOutMed = defaultMeshOutMed();
  83   data->myPublish = defaultPublish();
  84   data->myUseLocalMap = defaultUseLocalMap();
  85   data->myUseBackgroundMap = defaultUseBackgroundMap();
  86   data->myFileSizeMapDir = defaultWorkingDirectory();
  87   data->myMeshFileBackground = "";
  88   data->myUseConstantValue = defaultUseConstantValue();
  89   data->myConstantValue = 0.0;
  90   data->myFieldName = "";
  91   data->myUseNoTimeStep = defaultUseNoTimeStep();
  92   data->myUseLastTimeStep = defaultUseLastTimeStep();
  93   data->myUseChosenTimeStep = defaultUseChosenTimeStep();
  94   data->myTimeStep = -2;
  95   data->myRank =  -2;
  96   data->myWorkingDir = defaultWorkingDirectory();
  97   data->myLogFile = defaultLogFile();
  98   data->myVerboseLevel = defaultVerboseLevel();
  99   data->myPrintLogInFile = defaultPrintLogInFile();
 100   data->myKeepFiles = defaultKeepFiles();
 101   data->myRemoveLogOnSuccess = defaultRemoveLogOnSuccess();
 102
 103   buildModel();
 104   setAll();
 105 }
 106 MgAdapt::MgAdapt(MgAdaptHypothesisData* myData)
 107 {
 108   data = new MgAdaptHypothesisData();
 109   setData(myData);
 110   buildModel();
 111 }
 112
 113 MgAdapt::MgAdapt( const MgAdapt& copy)
 114 {
 115   data = new MgAdaptHypothesisData();
 116   MgAdaptHypothesisData *copyData = copy.getData();
 117   copyMgAdaptHypothesisData(copyData);
 118   setAll();
 119
 120   this->_option2value = copy._option2value;
 121   this->_customOption2value = copy._customOption2value;
 122   this->_defaultOptionValues = copy._defaultOptionValues;
 123   this->_doubleOptions = copy._doubleOptions;
 124   this->_charOptions = copy._charOptions;
 125   this->_boolOptions = copy._boolOptions;
 126 }
 127
 128 //-----------------------------------------------------------------------------------------
 129 MgAdapt::~MgAdapt()
 130 {
 131   delete data;
 132 }
 133 void MgAdapt::buildModel()
 134 {
 135
 136   const char* boolOptionNames[] = { "compute_ridges", // yes
 137                                     "" // mark of end
 138                                   };
 139   // const char* intOptionNames[] = { "max_number_of_errors_printed", // 1
 140   //                                  "max_number_of_threads",        // 4
 141   //                                  "" // mark of end
 142   // };
 143   const char* doubleOptionNames[] = { "max_memory",  // 0
 144                                       "" // mark of end
 145                                     };
 146   const char* charOptionNames[] = { "components",  // "yes"
 147                                     "adaptation",  // both
 148                                     "" // mark of end
 149                                   };
 150
 151   int i = 0;
 152   while (boolOptionNames[i][0])
 153   {
 154     _boolOptions.insert( boolOptionNames[i] );
 155     _option2value[boolOptionNames[i++]].clear();
 156   }
 157   // i = 0;
 158   // while (intOptionNames[i][0])
 159   //   _option2value[intOptionNames[i++]].clear();
 160
 161   i = 0;
 162   while (doubleOptionNames[i][0]) {
 163     _doubleOptions.insert(doubleOptionNames[i]);
 164     _option2value[doubleOptionNames[i++]].clear();
 165   }
 166   i = 0;
 167   while (charOptionNames[i][0]) {
 168     _charOptions.insert(charOptionNames[i]);
 169     _option2value[charOptionNames[i++]].clear();
 170   }
 171
 172   // default values to be used while MG-Adapt
 173
 174   _defaultOptionValues["adaptation"    ] = "both";
 175   _defaultOptionValues["components"    ] = "outside components";
 176   _defaultOptionValues["compute_ridges"] = "yes";
 177   _defaultOptionValues["max_memory"    ] = ToComment(defaultMaximumMemory());
 178 }
 179
 180 //=============================================================================
 181 TOptionValues MgAdapt::getOptionValues() const
 182 {
 183   TOptionValues vals;
 184   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.begin();
 185   for ( ; op_val != _option2value.end(); ++op_val )
 186     vals.insert( make_pair( op_val->first, getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() )));
 187
 188   return vals;
 189 }
 190
 191 std::vector <std::string> MgAdapt::getOptionValuesStrVec() const
 192 {
 193   std::vector <std::string> vals;
 194   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.begin();
 195   for ( ; op_val != _option2value.end(); ++op_val )
 196     vals.push_back(op_val->first+":"+getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() ));
 197
 198   return vals;
 199 }
 200
 201 std::vector <std::string> MgAdapt::getCustomOptionValuesStrVec() const
 202 {
 203   std::vector <std::string> vals;
 204   TOptionValues::const_iterator op_val;
 205   for ( op_val = _customOption2value.begin(); op_val != _customOption2value.end(); ++op_val )
 206   {
 207     vals.push_back(op_val->first+":"+getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() ));
 208   }
 209   return vals;
 210 }
 211 const TOptionValues& MgAdapt::getCustomOptionValues() const
 212 {
 213   return _customOption2value;
 214 }
 215 void MgAdapt::setData(MgAdaptHypothesisData* myData)
 216 {
 217   copyMgAdaptHypothesisData(myData);
 218   setAll();
 219 }
 220 MgAdaptHypothesisData* MgAdapt::getData() const
 221 {
 222   return data;
 223 }
 224 void MgAdapt::setMedFileIn(std::string fileName)
 225 {
 226   if ( isFileExist(fileName) )
 227   {
 228     medFileIn = fileName;
 229
 230     if (medFileOut == "") // default MED file Out
 231       medFileOut = remove_extension( fileName )+ ".adapt.med";
 232   }
 233   else
 234   {
 235     SALOME::ExceptionStruct es;
 236     es.type = SALOME::BAD_PARAM;
 237     std::string text = "\nThe file " + fileName + " does not exist.\n" ;
 238     es.text = CORBA::string_dup(text.c_str());
 239     throw SALOME::SALOME_Exception(es);
 240   }
 241 }
 242
 243 std::string MgAdapt::getMedFileIn()
 244 {
 245   return medFileIn;
 246 }
 247
 248 void MgAdapt::setMedFileOut(std::string fileOut)
 249 {
 250   medFileOut = fileOut;
 251 }
 252 std::string MgAdapt::getMedFileOut()
 253 {
 254   return medFileOut;
 255 }
 256 void MgAdapt::setMeshOutMed(bool mybool)
 257 {
 258   meshOutMed = mybool;
 259 }
 260 bool MgAdapt::getMeshOutMed()
 261 {
 262   return meshOutMed;
 263 }
 264 void MgAdapt::setPublish(bool mybool)
 265 {
 266   publish = mybool;
 267 }
 268 bool MgAdapt::getPublish()
 269 {
 270   return publish;
 271 }
 272 void MgAdapt::setFieldName(std::string myFieldName)
 273 {
 274   fieldName = myFieldName;
 275 }
 276 std::string MgAdapt::getFieldName()
 277 {
 278   return fieldName;
 279 }
 280 void MgAdapt::setTimeStep(int time)
 281 {
 282   timeStep = time;
 283 }
 284 int MgAdapt::getTimeStep() const
 285 {
 286   return timeStep;
 287 }
 288
 289 void MgAdapt::setRankTimeStep(int time, int myRank)
 290 {
 291   timeStep = time;
 292   rank = myRank;
 293 }
 294
 295 int MgAdapt::getRank()
 296 {
 297   return rank;
 298 }
 299 void MgAdapt::setTimeStepRankLast()
 300 {
 301   myUseLastTimeStep = true;
 302   myUseChosenTimeStep = false;
 303   myUseNoTimeStep = false;
 304   //~med_int aRank, tmst;
 305      //~std::string fieldFile = useBackgroundMap ? sizeMapFile : medFileIn;
 306   //~getTimeStepInfos(fieldFile, tmst, aRank);
 307   //~setRankTimeStep((int) tmst, (int) aRank);
 308 }
 309 void MgAdapt::setNoTimeStep()
 310 {
 311   myUseLastTimeStep = false;
 312   myUseChosenTimeStep = false;
 313   myUseNoTimeStep = true;
 314   //~int aRank = (int)MED_NO_IT;
 315   //~int tmst  = (int)MED_NO_DT ;
 316   //~setRankTimeStep(tmst, aRank);
 317 }
 318 void MgAdapt::setChosenTimeStepRank()
 319 {
 320   myUseLastTimeStep = false;
 321   myUseChosenTimeStep = true;
 322   myUseNoTimeStep = false;
 323   //~int aRank = (int)MED_NO_IT;
 324   //~int tmst  = (int)MED_NO_DT ;
 325   //~setRankTimeStep(tmst, aRank);
 326 }
 327 void MgAdapt::setUseLocalMap(bool myLocal)
 328 {
 329   useLocalMap = myLocal;
 330 }
 331
 332 bool MgAdapt::getUseLocalMap()
 333 {
 334   return useLocalMap;
 335 }
 336
 337 void MgAdapt::setUseBackgroundMap(bool bckg)
 338 {
 339   useBackgroundMap = bckg;
 340 }
 341
 342 bool MgAdapt::getUseBackgroundMap()
 343 {
 344   return useBackgroundMap;
 345 }
 346
 347 void MgAdapt::setUseConstantValue(bool cnst)
 348 {
 349   useConstantValue = cnst;
 350 }
 351 bool MgAdapt::getUseConstantValue()
 352 {
 353   return useConstantValue;
 354 }
 355 void MgAdapt::setLogFile(std::string myLogFile)
 356 {
 357   logFile = myLogFile;
 358 }
 359 std::string MgAdapt::getLogFile()
 360 {
 361   return logFile;
 362 }
 363 void MgAdapt::setVerbosityLevel(int verboLevel)
 364 {
 365   verbosityLevel = verboLevel;
 366 }
 367 int MgAdapt::getVerbosityLevel()
 368 {
 369   return verbosityLevel;
 370 }
 371 void MgAdapt::setRemoveOnSuccess(bool rmons)
 372 {
 373   removeOnSuccess = rmons;
 374 }
 375 bool MgAdapt::getRemoveOnSuccess()
 376 {
 377   return removeOnSuccess;
 378 }
 379 void MgAdapt::setSizeMapFile(std::string mapFile)
 380 {
 381   if ( mapFile == "" || isFileExist(mapFile) )
 382   {
 383     sizeMapFile = mapFile;
 384   }
 385   else
 386   {
 387     SALOME::ExceptionStruct es;
 388     es.type = SALOME::BAD_PARAM;
 389     std::string text = "\nThe file " + mapFile + " does not exist.\n" ;
 390     es.text = CORBA::string_dup(text.c_str());
 391     throw SALOME::SALOME_Exception(es);
 392   }
 393 }
 394 std::string MgAdapt::getSizeMapFile()
 395 {
 396   return sizeMapFile;
 397 }
 398
 399 void MgAdapt::setMeshName(std::string name)
 400 {
 401   meshName = name;
 402 }
 403 std::string MgAdapt::getMeshName()
 404 {
 405   return meshName;
 406 }
 407 void MgAdapt::setMeshNameOut(std::string name)
 408 {
 409   meshNameOut = name;
 410 }
 411 std::string MgAdapt::getMeshNameOut()
 412 {
 413   return meshNameOut;
 414 }
 415 void MgAdapt::setFromMedFile(bool mybool)
 416 {
 417   fromMedFile = mybool;
 418 }
 419 bool MgAdapt::isFromMedFile()
 420 {
 421   return fromMedFile;
 422 }
 423 void MgAdapt::setConstantValue(double cnst)
 424 {
 425   constantValue = cnst;
 426 }
 427 double MgAdapt::getConstantValue() const
 428 {
 429   return constantValue;
 430 }
 431
 432 void MgAdapt::setWorkingDir(std::string dir)
 433 {
 434   workingDir = dir;
 435 }
 436 std::string MgAdapt::getWorkingDir() const
 437 {
 438   return workingDir;
 439 }
 440 void MgAdapt::setKeepWorkingFiles(bool mybool)
 441 {
 442   toKeepWorkingFiles = mybool;
 443 }
 444 bool MgAdapt::getKeepWorkingFiles()
 445 {
 446   return toKeepWorkingFiles;
 447 }
 448 void MgAdapt::setPrintLogInFile(bool print)
 449 {
 450   printLogInFile = print;
 451 }
 452 bool MgAdapt::getPrintLogInFile()
 453 {
 454   return printLogInFile;
 455 }
 456
 457 bool MgAdapt::setAll()
 458 {
 459
 460   setFromMedFile(data->fromMedFile);
 461   std::string file;
 462   checkDirPath(data->myFileInDir);
 463   file = data->myFileInDir+data->myMeshFileIn;
 464   setMedFileIn(file);
 465   setMeshName(data->myInMeshName);
 466   setMeshNameOut(data->myOutMeshName);
 467   checkDirPath(data->myFileOutDir);
 468   std::string out = data->myFileOutDir+data->myMeshFileOut;
 469   setMedFileOut(out);
 470   setPublish(data->myPublish);
 471   setMeshOutMed(data->myMeshOutMed);
 472   setUseLocalMap(data->myUseLocalMap);
 473   setUseBackgroundMap(data->myUseBackgroundMap);
 474   setUseConstantValue(data->myUseConstantValue);
 475
 476   std::string mapfile;
 477   if (useBackgroundMap)
 478   {
 479     checkDirPath(data->myFileSizeMapDir);
 480     mapfile = data->myFileSizeMapDir+data->myMeshFileBackground;
 481     setFieldName(data->myFieldName);
 482   }
 483   else if (useConstantValue)
 484   {
 485     setConstantValue(data->myConstantValue);
 486   }
 487   else
 488   {
 489     mapfile ="";
 490     setConstantValue(0.0);
 491     setFieldName(data->myFieldName);
 492   }
 493
 494   setSizeMapFile(mapfile);
 495   if (data->myUseNoTimeStep)
 496     setNoTimeStep();
 497   else if (data->myUseLastTimeStep)
 498     setTimeStepRankLast();
 499   else
 500   {
 501     setChosenTimeStepRank();
 502     setRankTimeStep(data->myTimeStep, data->myRank);
 503   }
 504   /* Advanced options */
 505   setWorkingDir(data->myWorkingDir);
 506   checkDirPath(data->myWorkingDir);
 507   setLogFile(data->myWorkingDir+defaultLogFile());
 508   setVerbosityLevel(data->myVerboseLevel);
 509   setRemoveOnSuccess(data->myRemoveLogOnSuccess);
 510   setPrintLogInFile(data->myPrintLogInFile);
 511   setKeepWorkingFiles(data->myKeepFiles);
 512
 513   return true;
 514 }
 515
 516 void MgAdapt::checkDirPath(std::string& dirPath)
 517 {
 518   const char lastChar = *dirPath.rbegin();
 519 #ifdef WIN32
 520   if(lastChar != '\\') dirPath+='\\';
 521 #else
 522   if(lastChar != '/') dirPath+='/';
 523 #endif
 524 }
 525 //=============================================================================
 526 void MgAdapt::setOptionValue(const std::string& optionName,
 527                              const std::string& optionValue)
 528 throw (std::invalid_argument)
 529 {
 530 //   INFOS("setOptionValue");
 531 //   std::cout << "optionName: " << optionName << ", optionValue: " << optionValue << std::endl;
 532   TOptionValues::iterator op_val = _option2value.find(optionName);
 533   if (op_val == _option2value.end())
 534   {
 535     op_val = _customOption2value.find( optionName );
 536     _customOption2value[ optionName ] = optionValue;
 537     return;
 538   }
 539
 540   if (op_val->second != optionValue)
 541   {
 542
 543     std::string lowerOptionValue = toLowerStr(optionValue);
 544     const char* ptr = lowerOptionValue.c_str();
 545     // strip white spaces
 546     while (ptr[0] == ' ')
 547       ptr++;
 548     int i = strlen(ptr);
 549     while (i != 0 && ptr[i - 1] == ' ')
 550       i--;
 551     // check value type
 552     bool typeOk = true;
 553     std::string typeName;
 554     if (i == 0)
 555     {
 556       // empty string
 557     }
 558     else if (_charOptions.count(optionName))
 559     {
 560       // do not check strings
 561     }
 562     else if (_doubleOptions.count(optionName))
 563     {
 564       // check if value is double
 565       toDbl(ptr, &typeOk);
 566       typeName = "real";
 567     }
 568     else if (_boolOptions.count(optionName))
 569     {
 570       // check if value is bool
 571       toBool(ptr, &typeOk);
 572       typeName = "bool";
 573     }
 574     else
 575     {
 576       // check if value is int
 577       toInt(ptr, &typeOk);
 578       typeName = "integer";
 579     }
 580     if ( typeOk ) // check some specific values ?
 581     {
 582     }
 583     if ( !typeOk )
 584     {
 585       std::string msg = "Advanced option '" + optionName + "' = '" + optionValue + "' but must be " + typeName;
 586       throw std::invalid_argument(msg);
 587     }
 588     std::string value( ptr, i );
 589     if ( _defaultOptionValues[ optionName ] == value ) value.clear();
 590
 591 //     std::cout << "==> value: " << value << std::endl;
 592     op_val->second = value;
 593
 594   }
 595 }
 596 //=============================================================================
 597 //! Return option value. If isDefault provided, it can be a default value,
 598 //  then *isDefault == true. If isDefault is not provided, the value will be
 599 //  empty if it equals a default one.
 600 std::string MgAdapt::getOptionValue(const std::string& optionName, bool* isDefault) const
 601 throw (std::invalid_argument)
 602 {
 603 //   INFOS("getOptionValue");
 604 //   std::cout << "optionName: " << optionName << ", isDefault: " << isDefault << std::endl;
 605   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.find(optionName);
 606   if (op_val == _option2value.end())
 607   {
 608     op_val = _customOption2value.find(optionName);
 609     if (op_val == _customOption2value.end())
 610     {
 611       std::string msg = "Unknown MG-Adapt option: <" + optionName + ">";
 612       throw std::invalid_argument(msg);
 613     }
 614   }
 615   std::string val = op_val->second;
 616   if ( isDefault ) *isDefault = ( val.empty() );
 617
 618   if ( val.empty() && isDefault )
 619   {
 620     op_val = _defaultOptionValues.find( optionName );
 621     if (op_val != _defaultOptionValues.end()) val = op_val->second;
 622   }
 623 //   std::cout << "==> val: " << val << std::endl;
 624
 625   return val;
 626 }
 627 //================================================================================
 628 /*!
 629  * \brief Converts a string to a real value
 630  */
 631 //================================================================================
 632
 633 double MgAdapt::toDbl(const std::string& str, bool* isOk )
 634 throw (std::invalid_argument)
 635 {
 636   if ( str.empty() ) throw std::invalid_argument("Empty value provided");
 637
 638   char * endPtr;
 639   double val = strtod(&str[0], &endPtr);
 640   bool ok = (&str[0] != endPtr);
 641
 642   if ( isOk ) *isOk = ok;
 643
 644   if ( !ok )
 645   {
 646     std::string msg = "Not a real value:'" + str + "'";
 647     throw std::invalid_argument(msg);
 648   }
 649   return val;
 650 }
 651 //================================================================================
 652 /*!
 653  * \brief Converts a string to a lower
 654  */
 655 //================================================================================
 656 std::string MgAdapt::toLowerStr(const std::string& str)
 657 {
 658   std::string s = str;
 659   for ( size_t i = 0; i <= s.size(); ++i )
 660     s[i] = tolower( s[i] );
 661   return s;
 662 }
 663 //================================================================================
 664 /*!
 665  * \brief Converts a string to a bool
 666  */
 667 //================================================================================
 668
 669 bool MgAdapt::toBool(const std::string& str, bool* isOk )
 670 throw (std::invalid_argument)
 671 {
 672   std::string s = str;
 673   if ( isOk ) *isOk = true;
 674
 675   for ( size_t i = 0; i <= s.size(); ++i )
 676     s[i] = tolower( s[i] );
 677
 678   if ( s == "1" || s == "true" || s == "active" || s == "yes" )
 679     return true;
 680
 681   if ( s == "0" || s == "false" || s == "inactive" || s == "no" )
 682     return false;
 683
 684   if ( isOk )
 685     *isOk = false;
 686   else
 687   {
 688     std::string msg = "Not a Boolean value:'" + str + "'";
 689     throw std::invalid_argument(msg);
 690   }
 691   return false;
 692 }
 693 //================================================================================
 694 /*!
 695  * \brief Converts a string to a integer value
 696  */
 697 //================================================================================
 698
 699 int MgAdapt::toInt(const std::string& str, bool* isOk )
 700 throw (std::invalid_argument)
 701 {
 702   if ( str.empty() ) throw std::invalid_argument("Empty value provided");
 703
 704   char * endPtr;
 705   int val = (int)strtol( &str[0], &endPtr, 10);
 706   bool ok = (&str[0] != endPtr);
 707
 708   if ( isOk ) *isOk = ok;
 709
 710   if ( !ok )
 711   {
 712     std::string msg = "Not an integer value:'" + str + "'";
 713     throw std::invalid_argument(msg);
 714   }
 715   return val;
 716 }
 717 //=============================================================================
 718 bool MgAdapt::hasOptionDefined( const std::string& optionName ) const
 719 {
 720   bool isDefault = false;
 721   try
 722   {
 723     getOptionValue( optionName, &isDefault );
 724   }
 725   catch ( std::invalid_argument )
 726   {
 727     return false;
 728   }
 729   return !isDefault;
 730 }
 731 //================================================================================
 732 /*!
 733  * \brief Return command to run MG-Tetra mesher excluding file prefix (-f)
 734  */
 735 //================================================================================
 736
 737 std::string MgAdapt::getCommandToRun(MgAdapt* hyp)
 738 {
 739   return hyp ? hyp->getCommandToRun() : ToComment("error with hypothesis!");
 740 }
 741
 742
 743
 744 int MgAdapt::compute(std::string& errStr)
 745 {
 746   std::string cmd = getCommandToRun();
 747   int err = 0;
 748   execCmd( cmd.c_str(), err ); // run
 749
 750   if ( err )
 751   {
 752     errStr = ToComment("system(mg-adapt.exe ...) command failed with error: ") << strerror( errno );
 753   }
 754   else
 755   {
 756     convertMeshFile(meshFormatOutputMesh, solFormatOutput);
 757   }
 758   if (!err) cleanUp();
 759   return err;
 760 }
 761
 762 void MgAdapt::execCmd( const char* cmd, int& err)
 763 {
 764   err = 1;
 765   std::array <char, 128> buffer;
 766   std::streambuf* buf;
 767 outFileStream fileStream;
 768   if (printLogInFile)
 769   {
 770   fileStream.open(logFile);
 771   buf = fileStream.rdbuf();
 772   }
 773   else
 774   {
 775     buf = std::cout.rdbuf();
 776   }
 777   std::ostream logStream(buf);
 778
 779   std::unique_ptr <FILE, decltype(&pclose)> pipe(popen(cmd, "r"), pclose );
 780   if(!pipe)
 781   {
 782     throw std::runtime_error("popen() failed!");
 783   }
 784   while(fgets(buffer.data(), buffer.size(), pipe.get()) !=nullptr )
 785   {
 786     logStream<<buffer.data() ;
 787   }
 788   err = 0;
 789 }
 790 /*
 791  * to delete tmp files .mesh, .sol and if needed
 792  * the log file
 793  *
 794  */
 795 void MgAdapt::cleanUp()
 796 {
 797   int notOk;
 798   std::string errStr;
 799   if(toKeepWorkingFiles)
 800     return;
 801   if(removeOnSuccess && printLogInFile)
 802     tmpFilesToBeDeleted.push_back(logFile);
 803
 804   std::vector< std::string>::iterator it = tmpFilesToBeDeleted.begin();
 805   for (; it!=tmpFilesToBeDeleted.end(); ++it)
 806   {
 807     errStr=removeFile(*it, notOk);
 808     if (notOk)
 809     {
 810       appendMsgToLogFile(errStr);
 811     }
 812
 813   }
 814 }
 815
 816 void MgAdapt::appendMsgToLogFile(std::string& msg)
 817 {
 818   std::ofstream logStream;
 819   logStream.open(logFile, std::ofstream::out | std::ofstream::app);
 820   logStream<< msg;
 821   logStream.close();
 822 }
 823 //================================================================================
 824 /*!
 825  * \brief Return command to run MG-Tetra mesher excluding file prefix (-f)
 826  */
 827 //================================================================================
 828
 829 std::string MgAdapt::getCommandToRun()
 830 {
 831   /*
 832   || return system command with args and options
 833   ||
 834   */
 835   std::string errStr;
 836   std::string cmd = getExeName();
 837   std::string meshIn(""), sizeMapIn(""), solFileIn("");
 838   updateTimeStepRank();
 839   convertMedFile(meshIn, solFileIn, sizeMapIn);
 840   if (!isFileExist(meshIn) || !isFileExist(solFileIn))
 841   {
 842     errStr = ToComment(" failed to find .mesh or .sol file from converter ")<< strerror( errno );
 843     return errStr;
 844   }
 845   tmpFilesToBeDeleted.push_back(meshIn);
 846   tmpFilesToBeDeleted.push_back(solFileIn);
 847   if(useBackgroundMap && !isFileExist(sizeMapIn))
 848   {
 849     errStr = ToComment(" failed to find .mesh size map file from converter ")<< strerror( errno );
 850     return errStr;
 851   }
 852
 853   cmd+= " --in "+ meshIn;
 854   meshFormatOutputMesh = getFileName()+".mesh";
 855   tmpFilesToBeDeleted.push_back(meshFormatOutputMesh);
 856   cmd+= " --out "+ meshFormatOutputMesh;
 857   if (useLocalMap || useConstantValue) cmd+= " --sizemap "+ solFileIn;
 858   else //  (useBackgroundMap)
 859   {
 860     cmd+= " --background_mesh "+ sizeMapIn ;
 861     cmd+= " --background_sizemap "+ solFileIn;
 862     tmpFilesToBeDeleted.push_back(sizeMapIn);
 863   }
 864   //~else
 865   //~{
 866       //~// constant value TODO
 867   //~}
 868   std::string adapOp   = "adaptation";
 869   std::string adpOpVal = getOptionValue(adapOp);
 870   // Check coherence between mesh dimension and option
 871 //   checkDimensionOption(adpOpVal);
 872   /* sizemap file is not adapted in case of only surface adaptation see MeshGems docs */
 873   std::string surfaceAdapt = "surface";
 874   if(surfaceAdapt != adpOpVal )
 875   {
 876     std::string solFileOut = getFileName()+".sol";
 877     cmd+= " --write_sizemap "+ solFileOut;
 878     solFormatOutput.push_back(solFileOut);
 879     tmpFilesToBeDeleted.push_back(solFileOut);
 880   }
 881
 882   std::string option, value;
 883   bool isDefault;
 884   const TOptionValues* options[] = { &_option2value, &_customOption2value };
 885   for ( int iOp = 0; iOp < 2; ++iOp )
 886   {
 887     TOptionValues::const_iterator o2v = options[iOp]->begin();
 888     for ( ; o2v != options[iOp]->end(); ++o2v )
 889     {
 890       option = o2v->first;
 891       value = getOptionValue( option, &isDefault );
 892
 893       if ( isDefault )
 894           continue;
 895       if ( value.empty() )//value == NoValue() )
 896       {
 897         if ( _defaultOptionValues.count( option ))
 898             continue; // non-custom option with no value
 899         //value.clear();
 900       }
 901       if ( strncmp( "no", option.c_str(), 2 ) == 0 ) // options w/o values: --no_*
 902       {
 903         if ( !value.empty() && toBool( value ) == false )
 904             continue;
 905         value.clear();
 906       }
 907       if ( option[0] != '-' )
 908         cmd += " --";
 909       else
 910         cmd += " ";
 911       cmd += option + " " + value;
 912     }
 913   }
 914
 915   // Verbosity Level
 916   if (verbosityLevel != defaultVerboseLevel())
 917   {
 918     cmd+= " --verbose "+ ToComment(verbosityLevel);
 919   }
 920     //~}
 921 //~cmd+= " >"
 922 #ifdef WIN32
 923     cmd += " < NUL";
 924 #endif
 925
 926   return cmd;
 927 }
 928
 929 bool MgAdapt::isFileExist(const std::string& fName)
 930 {
 931
 932   if ( fName.empty() ) return false;
 933
 934   boost::system::error_code err;
 935   bool res = boost::filesystem::exists( fName, err );
 936
 937   return err ? false : res;
 938 }
 939 //=======================================================================
 940 //function : defaultMaximumMemory
 941 //=======================================================================
 942
 943 #if defined(WIN32)
 944 #include <windows.h>
 945 #elif !defined(__APPLE__)
 946 #include <sys/sysinfo.h>
 947 #endif
 948
 949 double MgAdapt::defaultMaximumMemory()
 950 {
 951 #if defined(WIN32)
 952   // See http://msdn.microsoft.com/en-us/library/aa366589.aspx
 953   MEMORYSTATUSEX statex;
 954   statex.dwLength = sizeof (statex);
 955   long err = GlobalMemoryStatusEx (&statex);
 956   if (err != 0)
 957   {
 958     double totMB = (double)statex.ullAvailPhys / 1024. / 1024.;
 959     return (double)( 0.7 * totMB );
 960   }
 961 #elif !defined(__APPLE__)
 962   struct sysinfo si;
 963   long err = sysinfo( &si );
 964   if ( err == 0 )
 965   {
 966     long ramMB = si.totalram * si.mem_unit / 1024 / 1024;
 967     return ( 0.7 * ramMB );
 968   }
 969 #endif
 970   return 1024;
 971 }
 972
 973 //=======================================================================
 974 //function : defaultWorkingDirectory
 975 //=======================================================================
 976
 977 std::string MgAdapt::defaultWorkingDirectory()
 978 {
 979   TCollection_AsciiString aTmpDir;
 980
 981   char *Tmp_dir = getenv("SALOME_TMP_DIR");
 982   if(Tmp_dir != NULL)
 983   {
 984     aTmpDir = Tmp_dir;
 985   }
 986   else {
 987 #ifdef WIN32
 988     aTmpDir = TCollection_AsciiString("C:\\");
 989 #else
 990     aTmpDir = TCollection_AsciiString("/tmp/");
 991 #endif
 992   }
 993   return aTmpDir.ToCString();
 994 }
 995 //================================================================================
 996 /*!
 997  * \brief Return a unique file name
 998  */
 999 //================================================================================
1000
1001 std::string MgAdapt::getFileName() const
1002 {
1003   std::string aTmpDir = workingDir;
1004   const char lastChar = *aTmpDir.rbegin();
1005 #ifdef WIN32
1006   if(lastChar != '\\') aTmpDir+='\\';
1007 #else
1008   if(lastChar != '/') aTmpDir+='/';
1009 #endif
1010
1011   TCollection_AsciiString aGenericName = (char*)aTmpDir.c_str();
1012   aGenericName += "MgAdapt_";
1013   aGenericName += getpid();
1014   aGenericName += "_";
1015   aGenericName += Abs((Standard_Integer)(long) aGenericName.ToCString());
1016
1017   return aGenericName.ToCString();
1018 }
1019 //=======================================================================
1020 //function : defaultLogFile
1021 //=======================================================================
1022
1023 std::string MgAdapt::defaultLogFile()
1024 {
1025   std::string alogFile("MG_ADAPT.log");
1026   return alogFile;
1027 }
1028 //=======================================================================
1029 //function : defaultUseConstantValue
1030 //=======================================================================
1031
1032 bool MgAdapt::defaultUseConstantValue()
1033 {
1034   return false;
1035 }
1036 //=======================================================================
1037 //function : defaultUseNoTimeStep
1038 //=======================================================================
1039
1040 bool MgAdapt::defaultUseNoTimeStep()
1041 {
1042   return true;
1043 }
1044 //=======================================================================
1045 //function : defaultRemoveLogOnSuccess
1046 //=======================================================================
1047
1048 bool MgAdapt::defaultRemoveLogOnSuccess()
1049 {
1050   return true;
1051 }
1052 //=======================================================================
1053 //function : defaultPrintLogInFile
1054 //=======================================================================
1055
1056 bool MgAdapt::defaultPrintLogInFile()
1057 {
1058   return false;
1059 }
1060 //=======================================================================
1061 //function : defaultUseChosenTimeStep
1062 //=======================================================================
1063
1064 bool MgAdapt::defaultUseChosenTimeStep()
1065 {
1066   return false;
1067 }
1068 //=======================================================================
1069 //function : UseLastTimeStep
1070 //=======================================================================
1071
1072 bool MgAdapt::defaultUseLastTimeStep()
1073 {
1074   return false;
1075 }
1076 //=======================================================================
1077 //function : defaultUseBackgroundMap
1078 //=======================================================================
1079
1080 bool MgAdapt::defaultUseBackgroundMap()
1081 {
1082   return false;
1083 }
1084 //=======================================================================
1085 //function : defaultKeepFiles
1086 //=======================================================================
1087
1088 bool MgAdapt::defaultKeepFiles()
1089 {
1090   return false;
1091 }
1092 //=======================================================================
1093 //function : defaultUseLocalMap
1094 //=======================================================================
1095
1096 bool MgAdapt::defaultUseLocalMap()
1097 {
1098   return true;
1099 }
1100 //=======================================================================
1101 //function : defaultPublish
1102 //=======================================================================
1103
1104 bool MgAdapt::defaultPublish()
1105 {
1106   return false;
1107 }
1108 //=======================================================================
1109 //function : defaultMeshOutMed
1110 //=======================================================================
1111
1112 bool MgAdapt::defaultMeshOutMed()
1113 {
1114   return true;
1115 }
1116 //=======================================================================
1117 //function : defaultFromMedFile
1118 //=======================================================================
1119
1120 bool MgAdapt::defaultFromMedFile()
1121 {
1122   return true;
1123 }
1124 //=======================================================================
1125 //function : defaultVerboseLevel
1126 //=======================================================================
1127
1128 int  MgAdapt::defaultVerboseLevel()
1129 {
1130   return 3;
1131 }
1132 std::string MgAdapt::getExeName()
1133 {
1134   return "mg-adapt.exe";
1135 }
1136 void MgAdapt::copyMgAdaptHypothesisData( const MgAdaptHypothesisData* from)
1137 {
1138   data->myFileInDir = from->myFileInDir;
1139   data->myMeshFileIn = from->myMeshFileIn;
1140   data->myMeshFileBackground = from->myMeshFileBackground;
1141   data->myOutMeshName = from->myOutMeshName;
1142   data->myMeshFileOut = from->myMeshFileOut;
1143   data->myFileOutDir = from->myFileOutDir;
1144   data->myFileSizeMapDir = from->myFileSizeMapDir;
1145   data->myFieldName = from->myFieldName;
1146   data->fromMedFile = from->fromMedFile;
1147   data->myPublish = from->myPublish;
1148   data->myMeshOutMed = from->myMeshOutMed;
1149   data->myUseLocalMap = from->myUseLocalMap;
1150   data->myUseBackgroundMap = from->myUseBackgroundMap;
1151   data->myUseConstantValue = from->myUseConstantValue;
1152   data->myConstantValue = from->myConstantValue;
1153   data->myTimeStep = from->myTimeStep;
1154   data->myRank = from->myRank;
1155   data->myUseNoTimeStep = from->myUseNoTimeStep;
1156   data->myUseLastTimeStep = from->myUseLastTimeStep;
1157   data->myUseChosenTimeStep = from->myUseChosenTimeStep;
1158   data->myWorkingDir = from->myWorkingDir;
1159   data->myLogFile = from->myLogFile;
1160   data->myPrintLogInFile = from->myPrintLogInFile;
1161   data->myKeepFiles = from->myKeepFiles;
1162   data->myRemoveLogOnSuccess = from->myRemoveLogOnSuccess;
1163   data->myVerboseLevel = from->myVerboseLevel;
1164 }
1165
1166 std::vector<std::string> MgAdapt::getListFieldsNames(std::string fileIn)
1167 {
1168   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(fileIn);
1169   std::vector<std::string> listFieldsNames(mfd->getFields()->getFieldsNames());
1170   return listFieldsNames ;
1171 }
1172
1173 void MgAdapt::checkDimensionOption(std::string adpOpVal)
1174 {
1175   // Pas correct.
1176   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(medFileIn);
1177   int meshdim = mfd->getMeshes()->getMeshAtPos(0)->getMeshDimension() ;
1178
1179   if ( ( meshdim == 2 ) & ( adpOpVal != "surface" ) )
1180   {
1181     SALOME::ExceptionStruct es;
1182     es.type = SALOME::BAD_PARAM;
1183     std::string text = "Mesh dimension is 2; the option should be 'surface' instead of '" + adpOpVal + "'." ;
1184     es.text = CORBA::string_dup(text.c_str());
1185     throw SALOME::SALOME_Exception(es);
1186   }
1187 }
1188
1189 void MgAdapt::checkFieldName(std::string fileIn)
1190 {
1191   bool ret = false ;
1192   std::vector<std::string> listFieldsNames = getListFieldsNames(fileIn);
1193   std::size_t jaux(listFieldsNames.size());
1194   for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1195   {
1196     if ( fieldName == listFieldsNames[j] )
1197     {
1198       ret = true ;
1199       break ;
1200     }
1201   }
1202   if ( ! ret )
1203   {
1204     std::cout << "Available field names:" << std::endl;
1205     for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1206     { std::cout << listFieldsNames[j] << std::endl;}
1207     SALOME::ExceptionStruct es;
1208     es.type = SALOME::BAD_PARAM;
1209     std::string text = "Field " + fieldName + " is not found." ;
1210     es.text = CORBA::string_dup(text.c_str());
1211     throw SALOME::SALOME_Exception(es);
1212   }
1213 }
1214
1215 void MgAdapt::checkTimeStepRank(std::string fileIn)
1216 {
1217   bool ret = false ;
1218   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(fileIn);
1219   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts = dynamic_cast<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS *>( mfd->getFields()->getFieldWithName(fieldName) );
1220 //   std::cout << "--- timeStep " << timeStep << std::endl;
1221 //   std::cout << "--- rank " << rank << std::endl;
1222   std::vector<double> timevalue;
1223   std::vector< std::pair<int,int> > timesteprank = fts->getTimeSteps(timevalue);
1224   std::size_t jaux(timesteprank.size());
1225   for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1226   {
1227     if ( ( timeStep == timesteprank[j].first ) & ( rank == timesteprank[j].second ) )
1228     {
1229       ret = true ;
1230       break ;
1231     }
1232   }
1233   if ( ! ret )
1234   {
1235     std::cout << "Available (Time step, Rank):" << std::endl;
1236     for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1237     { std::cout << "(Time step = " << timesteprank[j].first << ", Rank = " << timesteprank[j].second << ")" << std::endl;}
1238     SALOME::ExceptionStruct es;
1239     es.type = SALOME::BAD_PARAM;
1240     std::string text = "(Time step = " + std::to_string(timeStep) + ", Rank = " + std::to_string(rank) + ") is not found." ;
1241     es.text = CORBA::string_dup(text.c_str());
1242     throw SALOME::SALOME_Exception(es);
1243   }
1244 }
1245
1246 void MgAdapt::convertMedFile(std::string& meshFormatMeshFileName, std::string& solFormatFieldFileName, std::string& meshFormatsizeMapFile)
1247 {
1248   std::vector<std::string> fieldFileNames;
1249   MEDCoupling::MeshFormatWriter writer;
1250   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(medFileIn);
1251   MEDCoupling::MEDFileMeshes* meshes = mfd->getMeshes();
1252   MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh = meshes->getMeshAtPos(0); // ok only one mesh in file!
1253   if (meshNameOut =="")
1254       meshNameOut = fileMesh->getName();
1255   storeGroupsAndFams(fileMesh);
1256
1257   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFields> fields = MEDCoupling::MEDFileFields::New();
1258   solFormatFieldFileName = getFileName();
1259   solFormatFieldFileName+=".sol";
1260   fieldFileNames.push_back(solFormatFieldFileName);
1261
1262   if (useBackgroundMap)
1263   {
1264     checkFieldName(sizeMapFile) ;
1265     checkTimeStepRank(sizeMapFile) ;
1266     meshFormatsizeMapFile = getFileName();
1267     meshFormatsizeMapFile += ".mesh";
1268     buildBackGroundMeshAndSolFiles(fieldFileNames, meshFormatsizeMapFile);
1269   }
1270   else if(useLocalMap)
1271   {
1272     checkFieldName(medFileIn) ;
1273     checkTimeStepRank(medFileIn) ;
1274     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts = dynamic_cast<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS *>( mfd->getFields()->getFieldWithName(fieldName) );
1275     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeField1TS> f = fts->getTimeStep(timeStep, rank);
1276     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS> tmFts = MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS::New();
1277     tmFts->pushBackTimeStep(f);
1278
1279     fields->pushField(tmFts);
1280
1281     writer.setFieldFileNames( fieldFileNames);
1282   }
1283   else
1284   {
1285     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDCouplingMesh> mesh = fileMesh->getMeshAtLevel(1); // nodes mesh
1286     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh> umesh = mesh->buildUnstructured(); // nodes mesh
1287     int dim  =  umesh->getSpaceDimension();
1288     int version =  sizeof(double) < 8 ? 1 : 2;
1289     mcIdType nbNodes =  umesh->getNumberOfNodes();
1290     buildConstantSizeMapSolFile(solFormatFieldFileName, dim, version, nbNodes);
1291   }
1292
1293   mfd->setFields( fields );
1294   meshFormatMeshFileName = getFileName();
1295   meshFormatMeshFileName+=".mesh";
1296   writer.setMeshFileName(meshFormatMeshFileName);
1297   writer.setMEDFileDS( mfd);
1298   writer.write();
1299
1300 }
1301
1302 void MgAdapt::convertMeshFile(std::string& meshFormatIn, std::vector< std::string>& solFieldFileNames) const
1303 {
1304   MEDCoupling::MeshFormatReader reader(meshFormatIn, solFieldFileNames);
1305
1306   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = reader.loadInMedFileDS();
1307   // write MED
1308   MEDCoupling::MEDFileMeshes* meshes = mfd->getMeshes();
1309   MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh = meshes->getMeshAtPos(0); // ok only one mesh in file!
1310   fileMesh->setName(meshNameOut);
1311   restoreGroupsAndFams(fileMesh);
1312   mfd->write(medFileOut, 2);
1313 }
1314
1315 void MgAdapt::storeGroupsAndFams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1316 {
1317   storefams(fileMesh);
1318   storeGroups(fileMesh);
1319 }
1320
1321 void MgAdapt::restoreGroupsAndFams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1322 {
1323   restorefams(fileMesh);
1324   restoreGroups(fileMesh);
1325 }
1326 void MgAdapt::storeGroups(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1327 {
1328   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grpFams = fileMesh->getGroupInfo();
1329   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator g2ff = grpFams.begin();
1330
1331   for ( ; g2ff != grpFams.end(); ++g2ff )
1332   {
1333     std::string        groupName = g2ff->first;
1334     std::vector<std::string> famNames = g2ff->second;
1335
1336     if ( famNames.empty() ) continue;
1337     std::size_t k = 0;
1338     std::vector< mcIdType> famListId;
1339     for ( size_t i = 0; i < famNames.size(); ++i )
1340     {
1341       famListId.push_back( fileMesh->getFamilyId( famNames[i].c_str() ) );
1342     }
1343     group grp(groupName, famListId, famNames);
1344     groupVec.push_back(grp);
1345   }
1346 }
1347
1348 void MgAdapt::storefams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1349 {
1350   std::map<std::string, mcIdType> grpFams = fileMesh->getFamilyInfo();
1351   std::map<std::string, mcIdType >::iterator f = grpFams.begin();
1352
1353   for ( ; f != grpFams.end(); ++f )
1354   {
1355     if(!f->second) continue;  // FAMILLE_ZERO
1356     family fs(f->first, f->second);
1357     famVec.push_back(fs);
1358   }
1359
1360 }
1361
1362 void MgAdapt::restorefams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1363 {
1364   std::vector<family>::const_iterator fIt = famVec.begin();
1365
1366   for (; fIt!=famVec.end(); ++fIt)
1367   {
1368     try  //
1369     {
1370       std::string givenFamNameFromMeshGemConverter = fileMesh->getFamilyNameGivenId( std::abs(fIt->_famId) );
1371       fileMesh->changeFamilyId(std::abs(fIt->_famId), fIt->_famId);
1372       fileMesh->changeFamilyName(givenFamNameFromMeshGemConverter, fIt->_famName);
1373     }
1374     catch (const std::exception& e)
1375     {
1376       std::cerr<<e.what();
1377     }
1378   }
1379 }
1380
1381 void MgAdapt::restoreGroups(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1382 {
1383   std::map<std::string, std::vector<std::string> > info;
1384   std::vector <group>::const_iterator grpFams = groupVec.begin();
1385
1386   for (; grpFams!=groupVec.end(); ++grpFams)
1387   {
1388     info.insert(std::pair <std::string, std::vector<std::string> > (grpFams->_name, grpFams->_famNames) );
1389   }
1390
1391   fileMesh->setGroupInfo(info);
1392 }
1393
1394 void MgAdapt::buildConstantSizeMapSolFile(const std::string& solFormatFieldFileName, const int dim, const int version, const mcIdType nbNodes) const
1395 {
1396   MeshFormat::Localizer loc;
1397   MeshFormat::MeshFormatParser writer;
1398   int fileId = writer.GmfOpenMesh( solFormatFieldFileName.c_str(), GmfWrite, version, dim);
1399   int typTab[] = {GmfSca};
1400   writer.GmfSetKwd(fileId, MeshFormat::GmfSolAtVertices, (int)nbNodes, 1, typTab);
1401   for (mcIdType i = 0; i<nbNodes; i++)
1402   {
1403     double valTab[1] = {constantValue};
1404     writer.GmfSetLin( fileId, MeshFormat::GmfSolAtVertices, valTab);
1405   }
1406   writer.GmfCloseMesh(fileId);
1407 }
1408
1409 void MgAdapt::buildBackGroundMeshAndSolFiles(const std::vector<std::string>& fieldFileNames, const std::string& meshFormatsizeMapFile) const
1410 {
1411   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> tmpMfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(sizeMapFile);
1412   MEDCoupling::MEDFileFields* tmpFields = tmpMfd->getFields();
1413   MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS* fts = tmpFields->getFieldWithName(fieldName);
1414   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS>  fts1 = dynamic_cast<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS *>(fts);
1415   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeField1TS> f = fts1->getTimeStep(timeStep, rank);
1416   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS> tmFts = MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS::New();
1417   tmFts->pushBackTimeStep(f);
1418
1419   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFields> tmp_fields = MEDCoupling::MEDFileFields::New();
1420   tmp_fields->pushField(tmFts);
1421
1422   tmpMfd->setFields( tmp_fields );
1423   MEDCoupling::MeshFormatWriter tmpWriter;
1424   tmpWriter.setMeshFileName(meshFormatsizeMapFile);
1425   tmpWriter.setFieldFileNames( fieldFileNames);
1426   tmpWriter.setMEDFileDS(tmpMfd);
1427   tmpWriter.write();
1428 }
1429 // =======================================================================
1430 med_idt MgAdapt::openMedFile(const std::string aFile)
1431 // =======================================================================
1432 // renvoie le medId associe au fichier Med apres ouverture
1433 {
1434   med_idt medIdt = MEDfileOpen(aFile.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1435   if (medIdt <0)
1436   {
1437     SALOME::ExceptionStruct es;
1438     es.type = SALOME::BAD_PARAM;
1439     std::string text = "\nThe med file " + aFile + " cannot be opened.\n" ;
1440     es.text = CORBA::string_dup(text.c_str());
1441     throw SALOME::SALOME_Exception(es);
1442   }
1443   return medIdt;
1444 }
1445
1446 MgAdapt::Status MgAdapt::addMessage(const std::string& msg,
1447                                   const bool         isFatal/*=false*/)
1448 {
1449   if ( isFatal )
1450     _myErrorMessages.clear(); // warnings are useless if a fatal error encounters
1451
1452   _myErrorMessages.push_back( msg );
1453
1454 //~MESSAGE(msg);
1455 #ifdef _DEBUG_
1456   std::cout << msg << std::endl;
1457 #endif
1458   return ( _myStatus = isFatal ? MgAdapt::DRS_FAIL : MgAdapt::DRS_WARN_SKIP_ELEM );
1459 }
1460
1461 // =======================================================================
1462 void MgAdapt::getTimeStepInfos(std::string aFile, med_int& numdt, med_int& numit)
1463 // =======================================================================
1464 {
1465 // Il faut voir si plusieurs maillages
1466
1467   herr_t erreur = 0 ;
1468   med_idt medIdt ;
1469
1470
1471   // Ouverture du fichier
1472   //~SCRUTE(aFile.toStdString());
1473   medIdt = openMedFile(aFile);
1474   if ( medIdt < 0 ) return ;
1475   // Lecture du nombre de champs
1476   med_int ncha = MEDnField(medIdt) ;
1477   if (ncha < 1 )
1478   {
1479     //~addMessage( ToComment(" error: there is no field in  ") << aFile, /*fatal=*/true );
1480     return;
1481   }
1482   // Lecture des caracteristiques du champs
1483
1484   //       Lecture du type du champ, des noms des composantes et du nom de l'unite
1485   char nomcha  [MED_NAME_SIZE+1];
1486   strcpy(nomcha, fieldName.c_str());
1487 //       Lecture du nombre de composantes
1488   med_int ncomp = MEDfieldnComponentByName(medIdt, nomcha);
1489   char meshname[MED_NAME_SIZE+1];
1490   char * comp = (char*) malloc(ncomp*MED_SNAME_SIZE+1);
1491   char * unit = (char*) malloc(ncomp*MED_SNAME_SIZE+1);
1492   char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
1493   med_bool local;
1494   med_field_type typcha;
1495   med_int nbofcstp;
1496   erreur =  MEDfieldInfoByName (medIdt, nomcha, meshname,&local,&typcha,comp,unit,dtunit, &nbofcstp);
1497   free(comp);
1498   free(unit);
1499   if ( erreur < 0 )
1500   {
1501       //~addMessage( ToComment(" error: error while reading field  ") << nomcha << " in file " << aFile , /*fatal=*/true );
1502     return;
1503   }
1504
1505   med_float dt;
1506   med_int tmp_numdt, tmp_numit;
1507
1508   //~med_int step = data->myUseLastTimeStep ? nbofcstp : data->myTimeStep+1;
1509   //~myPrint("step ", step);
1510   erreur = MEDfieldComputingStepInfo ( medIdt, nomcha, 1, &numdt, &numit, &dt );
1511   for(med_int step = 1; step <= nbofcstp; step++ )
1512   {
1513     erreur = MEDfieldComputingStepInfo ( medIdt, nomcha, step, &tmp_numdt, &tmp_numit, &dt );
1514     if(tmp_numdt > numdt)
1515     {
1516       numdt = tmp_numdt;
1517       numit = tmp_numit;
1518     }
1519   }
1520   if ( erreur < 0 )
1521   {
1522     //~addMessage( ToComment(" error: error while reading field ") << nomcha << "step (numdt, numit) = " <<"("<< numdt<< ", " \
1523     numit<< ")" <<" in file " << aFile , /*fatal=*/true );
1524     return;
1525   }
1526
1527   // Fermeture du fichier
1528   if ( medIdt > 0 ) MEDfileClose(medIdt);
1529
1530 }
1531
1532 void MgAdapt::updateTimeStepRank()
1533 {
1534
1535   med_int arank;
1536   med_int tmst;
1537   if (myUseNoTimeStep)
1538   {
1539     arank = MED_NO_IT;
1540     tmst  = MED_NO_DT ;
1541     setRankTimeStep((int)tmst, (int)arank);
1542   }
1543   else if (myUseLastTimeStep)
1544   {
1545     std::string fieldFile = useBackgroundMap ? sizeMapFile : medFileIn;
1546     getTimeStepInfos(fieldFile, tmst, arank);
1547     setRankTimeStep((int)tmst, (int)arank);
1548   }
1549 }