src/MEDCoupling/MEDCouplingMemArray.hxx

   1 // Copyright (C) 2007-2022  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (EDF R&D)
  20
  21 #pragma once
  22
  23 #include "MEDCoupling.hxx"
  24 #include "MCType.hxx"
  25 #include "MCAuto.hxx"
  26 #include "MEDCouplingTimeLabel.hxx"
  27 #include "MEDCouplingRefCountObject.hxx"
  28 #include "InterpKernelException.hxx"
  29 #include "MEDCouplingTraits.hxx"
  30 #include "MEDCouplingMap.hxx"
  31 #include "BBTreePts.txx"
  32
  33 #include <string>
  34 #include <vector>
  35 #include <iterator>
  36
  37 namespace MEDCoupling
  38 {
  39   typedef enum
  40     {
  41       AX_CART = 3,
  42       AX_CYL = 4,
  43       AX_SPHER = 5
  44     } MEDCouplingAxisType;
  45   // -- WARNING this enum must be synchronized with MEDCouplingCommon.i file ! --
  46
  47   class PartDefinition;
  48
  49   template<class T>
  50   class MEDCouplingPointer
  51   {
  52   public:
  53     MEDCouplingPointer():_internal(0),_external(0) { }
  54     void null() { _internal=0; _external=0; }
  55     bool isNull() const { return _internal==0 && _external==0; }
  56     void setInternal(T *pointer);
  57     void setExternal(const T *pointer);
  58     const T *getConstPointer() const { if(_internal) return _internal; else return _external; }
  59     const T *getConstPointerLoc(std::size_t offset) const { if(_internal) return _internal+offset; else return _external+offset; }
  60     T *getPointer() { if(_internal) return _internal; if(_external) throw INTERP_KERNEL::Exception("Trying to write on an external pointer."); else return 0; }
  61   private:
  62     T *_internal;
  63     const T *_external;
  64   };
  65
  66   template<class T>
  67   class MemArray
  68   {
  69   public:
  70     typedef void (*Deallocator)(void *,void *);
  71   public:
  72     MemArray():_nb_of_elem(0),_nb_of_elem_alloc(0),_ownership(false),_dealloc(0),_param_for_deallocator(0) { }
  73     MemArray(const MemArray<T>& other);
  74     bool isNull() const { return _pointer.isNull(); }
  75     const T *getConstPointerLoc(std::size_t offset) const { return _pointer.getConstPointerLoc(offset); }
  76     const T *getConstPointer() const { return _pointer.getConstPointer(); }
  77     std::size_t getNbOfElem() const { return _nb_of_elem; }
  78     std::size_t getNbOfElemAllocated() const { return _nb_of_elem_alloc; }
  79     T *getPointer() { return _pointer.getPointer(); }
  80     MemArray<T> &operator=(const MemArray<T>& other);
  81     T operator[](std::size_t id) const { return _pointer.getConstPointer()[id]; }
  82     T& operator[](std::size_t id) { return _pointer.getPointer()[id]; }
  83     bool isEqual(const MemArray<T>& other, T prec, std::string& reason) const;
  84     void repr(mcIdType sl, std::ostream& stream) const;
  85     bool reprHeader(mcIdType sl, std::ostream& stream) const;
  86     void reprZip(mcIdType sl, std::ostream& stream) const;
  87     void reprNotTooLong(mcIdType sl, std::ostream& stream) const;
  88     void fillWithValue(const T& val);
  89     T *fromNoInterlace(std::size_t nbOfComp) const;
  90     T *toNoInterlace(std::size_t nbOfComp) const;
  91     void sort(bool asc);
  92     void reverse(std::size_t nbOfComp);
  93     void alloc(std::size_t nbOfElements);
  94     void reserve(std::size_t newNbOfElements);
  95     void reAlloc(std::size_t newNbOfElements);
  96     void useArray(const T *array, bool ownership, DeallocType type, std::size_t nbOfElem);
  97     void useExternalArrayWithRWAccess(const T *array, std::size_t nbOfElem);
  98     void writeOnPlace(std::size_t id, T element0, const T *others, std::size_t sizeOfOthers);
  99     template<class InputIterator>
 100     void insertAtTheEnd(InputIterator first, InputIterator last);
 101     void pushBack(T elem);
 102     T popBack();
 103     void pack() const;
 104     bool isDeallocatorCalled() const { return _ownership; }
 105     Deallocator getDeallocator() const { return _dealloc; }
 106     void setSpecificDeallocator(Deallocator dealloc) { _dealloc=dealloc; }
 107     void setParameterForDeallocator(void *param) { _param_for_deallocator=param; }
 108     void *getParameterForDeallocator() const { return _param_for_deallocator; }
 109     void destroy();
 110     ~MemArray() { destroy(); }
 111   public:
 112     static void CPPDeallocator(void *pt, void *param);
 113     static void CDeallocator(void *pt, void *param);
 114     static void COffsetDeallocator(void *pt, void *param);
 115   private:
 116     static void DestroyPointer(T *pt, Deallocator dealloc, void *param);
 117     static Deallocator BuildFromType(DeallocType type);
 118   private:
 119     std::size_t _nb_of_elem;
 120     std::size_t _nb_of_elem_alloc;
 121     bool _ownership;
 122     MEDCouplingPointer<T> _pointer;
 123     Deallocator _dealloc;
 124     void *_param_for_deallocator;
 125   };
 126
 127   template <class T> class DataArrayTools
 128   {
 129   public:
 130     static void GetSlice(T start, T stop, T step, mcIdType sliceId, mcIdType nbOfSlices, T& startSlice, T& stopSlice);
 131     static mcIdType GetNumberOfItemGivenBES(T begin, T end, T step, const std::string& msg);
 132     static mcIdType GetNumberOfItemGivenBESRelative(T begin, T end, T step, const std::string& msg);
 133     static mcIdType GetPosOfItemGivenBESRelativeNoThrow(T value, T begin, T end, T step);
 134   };
 135
 136   class DataArray;
 137   class DataArrayByte;
 138
 139   MEDCOUPLING_EXPORT void DACheckNbOfTuplesAndComp(const DataArray *da, mcIdType nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg);
 140
 141   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArray : public RefCountObject, public TimeLabel
 142   {
 143   public:
 144     std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 145     std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
 146     void setName(const std::string& name);
 147     void copyStringInfoFrom(const DataArray& other);
 148     void copyPartOfStringInfoFrom(const DataArray& other, const std::vector<std::size_t>& compoIds);
 149     void copyPartOfStringInfoFrom2(const std::vector<std::size_t>& compoIds, const DataArray& other);
 150     bool areInfoEqualsIfNotWhy(const DataArray& other, std::string& reason) const;
 151     bool areInfoEquals(const DataArray& other) const;
 152     std::string cppRepr(const std::string& varName) const;
 153     std::string getName() const { return _name; }
 154     const std::vector<std::string> &getInfoOnComponents() const { return _info_on_compo; }
 155     std::vector<std::string> &getInfoOnComponents() { return _info_on_compo; }
 156     void setInfoOnComponents(const std::vector<std::string>& info);
 157     void setInfoAndChangeNbOfCompo(const std::vector<std::string>& info);
 158     std::vector<std::string> getVarsOnComponent() const;
 159     std::vector<std::string> getUnitsOnComponent() const;
 160     std::string getInfoOnComponent(std::size_t i) const;
 161     std::string getVarOnComponent(std::size_t i) const;
 162     std::string getUnitOnComponent(std::size_t i) const;
 163     void setInfoOnComponent(std::size_t i, const std::string& info);
 164     std::size_t getNumberOfComponents() const { return _info_on_compo.size(); }
 165     void setPartOfValuesBase3(const DataArray *aBase, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp, bool strictCompoCompare=true);
 166     virtual void *getVoidStarPointer() = 0;
 167     virtual DataArray *deepCopy() const = 0;
 168     virtual DataArray *copySorted(bool asc=true) const = 0;
 169     virtual DataArray *buildNewEmptyInstance() const = 0;
 170     virtual bool isAllocated() const = 0;
 171     virtual void checkAllocated() const = 0;
 172     virtual void desallocate() = 0;
 173     virtual mcIdType getNumberOfTuples() const = 0;
 174     virtual mcIdType getNbOfElems() const = 0;
 175     virtual std::size_t getNbOfElemAllocated() const = 0;
 176     virtual void alloc(std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo=1) = 0;
 177     virtual void reAlloc(std::size_t newNbOfTuple) = 0;
 178     virtual void renumberInPlace(const mcIdType *old2New) = 0;
 179     virtual void renumberInPlaceR(const mcIdType *new2Old) = 0;
 180     virtual void setContigPartOfSelectedValues(mcIdType tupleIdStart, const DataArray *aBase, const DataArrayIdType *tuplesSelec) = 0;
 181     virtual void setContigPartOfSelectedValuesSlice(mcIdType tupleIdStart, const DataArray *aBase, mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) = 0;
 182     virtual DataArray *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const = 0;
 183     virtual DataArray *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const = 0;
 184     virtual DataArray *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const = 0;
 185     virtual DataArray *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const = 0;
 186     virtual DataArray *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const = 0;
 187     virtual void rearrange(std::size_t newNbOfCompo) = 0;
 188     virtual void circularPermutation(mcIdType nbOfShift=1) = 0;
 189     virtual void circularPermutationPerTuple(mcIdType nbOfShift=1) = 0;
 190     virtual void reversePerTuple() = 0;
 191     void checkNbOfTuples(mcIdType nbOfTuples, const std::string& msg) const;
 192     void checkNbOfComps(std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg) const;
 193     void checkNbOfTuplesAndComp(const DataArray& other, const std::string& msg) const;
 194     void checkNbOfTuplesAndComp(mcIdType nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg) const;
 195     void checkNbOfElems(mcIdType nbOfElems, const std::string& msg) const;
 196     static void GetSlice(mcIdType start, mcIdType stop, mcIdType step, mcIdType sliceId, mcIdType nbOfSlices, mcIdType& startSlice, mcIdType& stopSlice);
 197     static mcIdType GetNumberOfItemGivenBES(mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step, const std::string& msg);
 198     static mcIdType GetNumberOfItemGivenBESRelative(mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step, const std::string& msg);
 199     static mcIdType GetPosOfItemGivenBESRelativeNoThrow(mcIdType value, mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step);
 200     static std::vector<std::string> SplitStringInChuncks(const std::string st, std::size_t sz);
 201     static std::string GetVarNameFromInfo(const std::string& info);
 202     static std::string GetUnitFromInfo(const std::string& info);
 203     static std::string BuildInfoFromVarAndUnit(const std::string& var, const std::string& unit);
 204     static std::string GetAxisTypeRepr(MEDCouplingAxisType at);
 205     static DataArray *Aggregate(const std::vector<const DataArray *>& arrs);
 206     virtual void reprStream(std::ostream& stream) const = 0;
 207     virtual void reprZipStream(std::ostream& stream) const = 0;
 208     virtual void reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 209     virtual void reprZipWithoutNameStream(std::ostream& stream) const = 0;
 210     virtual void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const = 0;
 211     virtual void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const = 0;
 212     virtual void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const = 0;
 213   protected:
 214     DataArray() { }
 215     ~DataArray() { }
 216   protected:
 217     static void CheckValueInRange(mcIdType ref, mcIdType value, const std::string& msg);
 218     static void CheckValueInRangeEx(mcIdType value, mcIdType start, mcIdType end, const std::string& msg);
 219     static void CheckClosingParInRange(mcIdType ref, mcIdType value, const std::string& msg);
 220     static mcIdType EffectiveCircPerm(mcIdType nbOfShift, mcIdType nbOfTuples);
 221   protected:
 222     std::string _name;
 223     std::vector<std::string> _info_on_compo;
 224   };
 225 }
 226
 227 namespace MEDCoupling
 228 {
 229   template<class T>
 230   class DataArrayTemplate : public DataArray
 231   {
 232   public:
 233     typedef T Type;
 234   public:
 235     static MCAuto< typename Traits<T>::ArrayTypeCh > NewFromStdVector(const typename std::vector<T>& v);
 236     static MCAuto< typename Traits<T>::ArrayTypeCh > NewFromArray(const T *arrBegin, const T *arrEnd);
 237     std::vector< MCAuto< typename Traits<T>::ArrayTypeCh > > explodeComponents() const;
 238     //
 239     void printForDebug(std::ostream& oss) const
 240     {
 241       this->checkAllocated();
 242       char comma[3] = {'\0',' ','\0'};
 243       std::for_each(this->begin(),this->end(),[&comma,&oss](const T& elt) { oss << comma << elt; comma[0]=','; } );
 244       oss << std::endl;
 245     }
 246     std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 247     void updateTime() const { }
 248     //
 249     mcIdType getNumberOfTuples() const { return ToIdType(_info_on_compo.empty()?0:_mem.getNbOfElem()/getNumberOfComponents()); }
 250     mcIdType getNbOfElems() const { return ToIdType(_mem.getNbOfElem()); }
 251     bool empty() const;
 252     void *getVoidStarPointer() { return getPointer(); }
 253     const T *getConstPointer() const { return _mem.getConstPointer(); }
 254     const T *begin() const { return getConstPointer(); }
 255     const T *end() const { return getConstPointer()+getNbOfElems(); }
 256     T *rwBegin() { return getPointer(); }
 257     T *rwEnd() { return getPointer()+getNbOfElems(); }
 258     void alloc(std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo=1);
 259     void useArray(const T *array, bool ownership, DeallocType type, std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo);
 260     void useExternalArrayWithRWAccess(const T *array, std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo);
 261     T getIJSafe(std::size_t tupleId, std::size_t compoId) const;
 262     T getIJ(std::size_t tupleId, std::size_t compoId) const { return _mem[tupleId*_info_on_compo.size()+compoId]; }
 263     void setIJ(std::size_t tupleId, std::size_t compoId, T newVal) { _mem[tupleId*_info_on_compo.size()+compoId]=newVal; declareAsNew(); }
 264     void setIJSilent(std::size_t tupleId, std::size_t compoId, T newVal) { _mem[tupleId*_info_on_compo.size()+compoId]=newVal; }
 265     T *getPointer() { declareAsNew(); return getPointerSilent(); }
 266     T *getPointerSilent() { return _mem.getPointer(); }
 267     void pack() const;
 268     bool isAllocated() const override;
 269     void checkAllocated() const;
 270     void desallocate();
 271     void reserve(std::size_t nbOfElems);
 272     void rearrange(std::size_t newNbOfCompo);
 273     void transpose();
 274     void pushBackSilent(T val);
 275     void pushBackValsSilent(const T *valsBg, const T *valsEnd);
 276     T popBackSilent();
 277     T front() const;
 278     T back() const;
 279     std::size_t getNbOfElemAllocated() const { return _mem.getNbOfElemAllocated(); }
 280     void allocIfNecessary(std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo);
 281     void deepCopyFrom(const DataArrayTemplate<T>& other);
 282     void reverse();
 283     void fillWithValue(T val);
 284     void reAlloc(std::size_t newNbOfTuple);
 285     void renumberInPlace(const mcIdType *old2New);
 286     void renumberInPlaceR(const mcIdType *new2Old);
 287     void sort(bool asc=true);
 288     typename Traits<T>::ArrayType *renumber(const mcIdType *old2New) const;
 289     typename Traits<T>::ArrayType *renumberR(const mcIdType *new2Old) const;
 290     typename Traits<T>::ArrayType *renumberAndReduce(const mcIdType *old2New, mcIdType newNbOfTuple) const;
 291     typename Traits<T>::ArrayType *changeNbOfComponents(std::size_t newNbOfComp, T dftValue) const;
 292     typename Traits<T>::ArrayType *subArray(mcIdType tupleIdBg, mcIdType tupleIdEnd=-1) const;
 293     MCAuto<typename Traits<T>::ArrayTypeCh> selectPartDef(const PartDefinition* pd) const;
 294     void circularPermutation(mcIdType nbOfShift=1);
 295     void circularPermutationPerTuple(mcIdType nbOfShift=1);
 296     void reversePerTuple();
 297     void setPartOfValues1(const typename Traits<T>::ArrayType *a, mcIdType bgTuples, mcIdType endTuples, mcIdType stepTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp, bool strictCompoCompare=true);
 298     void setPartOfValuesSimple1(T a, mcIdType bgTuples, mcIdType endTuples, mcIdType stepTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp);
 299     void setPartOfValues2(const typename Traits<T>::ArrayType *a, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, const mcIdType *bgComp, const mcIdType *endComp, bool strictCompoCompare=true);
 300     void setPartOfValuesSimple2(T a, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, const mcIdType *bgComp, const mcIdType *endComp);
 301     void setPartOfValues3(const typename Traits<T>::ArrayType *a, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp, bool strictCompoCompare=true);
 302     void setPartOfValuesSimple3(T a, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp);
 303     void setPartOfValues4(const typename Traits<T>::ArrayType *a, mcIdType bgTuples, mcIdType endTuples, mcIdType stepTuples, const mcIdType *bgComp, const mcIdType *endComp, bool strictCompoCompare=true);
 304     void setPartOfValuesSimple4(T a, mcIdType bgTuples, mcIdType endTuples, mcIdType stepTuples, const mcIdType *bgComp, const mcIdType *endComp);
 305     void setPartOfValuesAdv(const typename Traits<T>::ArrayType *a, const DataArrayIdType *tuplesSelec);
 306     void setContigPartOfSelectedValues(mcIdType tupleIdStart, const DataArray *aBase, const DataArrayIdType *tuplesSelec);
 307     void setContigPartOfSelectedValuesSlice(mcIdType tupleIdStart, const DataArray *aBase, mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step);
 308     T getMaxValue(mcIdType& tupleId) const;
 309     T getMaxValueInArray() const;
 310     T getMaxAbsValue(std::size_t& tupleId) const;
 311     T getMaxAbsValueInArray() const;
 312     T getMinValue(mcIdType& tupleId) const;
 313     T getMinValueInArray() const;
 314     void getTuple(mcIdType tupleId, T *res) const { std::copy(_mem.getConstPointerLoc(tupleId*_info_on_compo.size()),_mem.getConstPointerLoc((tupleId+1)*_info_on_compo.size()),res); }
 315     template<class InputIterator>
 316     void insertAtTheEnd(InputIterator first, InputIterator last);
 317     static void SetArrayIn(typename Traits<T>::ArrayType *newArray, typename Traits<T>::ArrayType* &arrayToSet);
 318     void writeOnPlace(std::size_t id, T element0, const T *others, mcIdType sizeOfOthers) { _mem.writeOnPlace(id,element0,others,sizeOfOthers); }
 319     void fillWithZero();
 320   public:
 321     MemArray<T>& accessToMemArray() { return _mem; }
 322     const MemArray<T>& accessToMemArray() const { return _mem; }
 323   protected:
 324     typename Traits<T>::ArrayTypeCh *copySortedImpl(bool asc) const;
 325     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const;
 326     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const;
 327     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const;
 328     typename Traits<T>::ArrayType *myKeepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const;
 329     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const;
 330     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const;
 331   protected:
 332     MemArray<T> _mem;
 333   };
 334
 335   template<class T>
 336   class DataArrayTemplateClassic : public DataArrayTemplate<T>
 337   {
 338   public:
 339     MCAuto<DataArrayDouble> convertToDblArr() const;
 340     MCAuto<DataArrayInt> convertToIntArr() const;
 341     MCAuto<DataArrayInt64> convertToInt64Arr() const;
 342     MCAuto<DataArrayFloat> convertToFloatArr() const;
 343     void applyLin(T a, T b, std::size_t compoId);
 344     void applyLin(T a, T b);
 345     typename Traits<T>::ArrayType *negate() const;
 346     void addEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 347     void substractEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 348     void multiplyEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 349     void divideEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 350     static typename Traits<T>::ArrayType *Substract(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 351     static typename Traits<T>::ArrayType *Divide(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 352     static typename Traits<T>::ArrayType *Add(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 353     static typename Traits<T>::ArrayType *Multiply(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 354     static typename Traits<T>::ArrayType *Meld(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 355     static typename Traits<T>::ArrayType *Meld(const std::vector<const typename Traits<T>::ArrayType *>& arr);
 356     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsGreaterOrEqualTo(T val) const;
 357     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsGreaterThan(T val) const;
 358     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsLowerOrEqualTo(T val) const;
 359     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsLowerThan(T val) const;
 360     DataArrayIdType *findIdsStrictlyNegative() const;
 361     typename Traits<T>::ArrayType *fromNoInterlace() const;
 362     typename Traits<T>::ArrayType *toNoInterlace() const;
 363     void meldWith(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 364     typename Traits<T>::ArrayType *duplicateEachTupleNTimes(mcIdType nbTimes) const;
 365     void aggregate(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 366     void abs();
 367     typename Traits<T>::ArrayType *computeAbs() const;
 368     typename Traits<T>::ArrayType *performCopyOrIncrRef(bool dCpy) const;
 369     typename Traits<T>::ArrayType *sumPerTuple() const;
 370     void iota(T init=(T)0);
 371     void reprStream(std::ostream& stream) const;
 372     void reprZipStream(std::ostream& stream) const;
 373     void reprNotTooLongStream(std::ostream& stream) const;
 374     void reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 375     void reprZipWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 376     void reprNotTooLongWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 377     std::string repr() const;
 378     std::string reprZip() const;
 379     std::string reprNotTooLong() const;
 380     template<class U>
 381     MCAuto< typename Traits<U>::ArrayType > convertToOtherTypeOfArr() const;
 382   protected:
 383     static typename Traits<T>::ArrayType *PerformCopyOrIncrRef(bool dCpy, const typename Traits<T>::ArrayType& self);
 384     template<class OP>
 385     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsAdv(const OP& op) const;
 386   private:
 387     template<class FCT>
 388     void somethingEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 389   };
 390
 391   template<class T>
 392   class DataArrayTemplateFP : public DataArrayTemplateClassic<T>
 393   {
 394   public:
 395     bool isUniform(T val, T eps) const;
 396   };
 397 }
 398
 399 namespace MEDCoupling
 400 {
 401   class DataArrayFloatIterator;
 402   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayFloat : public DataArrayTemplateFP<float>
 403   {
 404   public:
 405     static DataArrayFloat *New();
 406   public:// abstract method overload
 407     DataArrayFloat *deepCopy() const;
 408     DataArrayFloat *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 409     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayFloat"); }
 410     DataArrayFloat *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayFloat::New(); }
 411     DataArrayFloat *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return DataArrayTemplateFP<float>::mySelectByTupleRanges(ranges); }
 412     DataArrayFloat *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return DataArrayTemplateFP<float>::myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 413     DataArrayFloat *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 414     DataArrayFloat *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return DataArrayTemplateFP<float>::mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 415     DataArrayFloat *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return DataArrayTemplateFP<float>::mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 416     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 417     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 418     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 419   public:// non abstract but essential
 420     bool isEqual(const DataArrayFloat& other, float prec) const;
 421     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayFloat& other, float prec, std::string& reason) const;
 422     bool isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayFloat& other, float prec) const;
 423   public:
 424     DataArrayFloatIterator *iterator();
 425   private:
 426     ~DataArrayFloat() { }
 427     DataArrayFloat() { }
 428   };
 429 }
 430
 431 namespace MEDCoupling
 432 {
 433   class DataArrayDoubleIterator;
 434   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble : public DataArrayTemplateFP<double>
 435   {
 436   public:
 437     static DataArrayDouble *New();
 438     double doubleValue() const;
 439     DataArrayDouble *deepCopy() const;
 440     DataArrayDouble *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 441     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayDouble"); }
 442     DataArrayDouble *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayDouble::New(); }
 443     void checkMonotonic(bool increasing, double eps) const;
 444     bool isMonotonic(bool increasing, double eps) const;
 445     void writeVTK(std::ostream& ofs, mcIdType indent, const std::string& nameInFile, DataArrayByte *byteArr) const;
 446     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 447     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 448     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 449     bool isEqual(const DataArrayDouble& other, double prec) const;
 450     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayDouble& other, double prec, std::string& reason) const;
 451     bool isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayDouble& other, double prec) const;
 452     DataArrayDouble *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 453     DataArrayDouble *selectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const { return this->mySelectByTupleId(di); }
 454     DataArrayDouble *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return DataArrayTemplateFP<double>::mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 455     DataArrayDouble *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return DataArrayTemplateFP<double>::myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 456     DataArrayDouble *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return DataArrayTemplateFP<double>::mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 457     DataArrayDouble *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return DataArrayTemplateFP<double>::mySelectByTupleRanges(ranges); }
 458     bool areIncludedInMe(const DataArrayDouble *other, double prec, DataArrayIdType *&tupleIds) const;
 459     void findCommonTuples(double prec, mcIdType limitTupleId, DataArrayIdType *&comm, DataArrayIdType *&commIndex) const;
 460     double minimalDistanceTo(const DataArrayDouble *other, mcIdType& thisTupleId, mcIdType& otherTupleId) const;
 461     DataArrayDouble *getDifferentValues(double prec, mcIdType limitTupleId=-1) const;
 462     DataArrayIdType *findClosestTupleId(const DataArrayDouble *other) const;
 463     DataArrayIdType *computeNbOfInteractionsWith(const DataArrayDouble *otherBBoxFrmt, double eps) const;
 464     void setSelectedComponents(const DataArrayDouble *a, const std::vector<std::size_t>& compoIds);
 465     DataArrayDoubleIterator *iterator();
 466     void checkNoNullValues() const;
 467     void getMinMaxPerComponent(double *bounds) const;
 468     DataArrayDouble *computeBBoxPerTuple(double epsilon=0.0) const;
 469     void computeTupleIdsNearTuples(const DataArrayDouble *other, double eps, DataArrayIdType *& c, DataArrayIdType *& cI) const;
 470     void recenterForMaxPrecision(double eps);
 471     double getMaxValue2(DataArrayIdType*& tupleIds) const;
 472     double getMinValue2(DataArrayIdType*& tupleIds) const;
 473     mcIdType count(double value, double eps) const;
 474     double getAverageValue() const;
 475     double norm2() const;
 476     double normMax() const;
 477     void normMaxPerComponent(double * res) const;
 478     double normMin() const;
 479     void accumulate(double *res) const;
 480     double accumulate(std::size_t compId) const;
 481     DataArrayDouble *accumulatePerChunck(const mcIdType *bgOfIndex, const mcIdType *endOfIndex) const;
 482     MCAuto<DataArrayDouble> cumSum() const;
 483     double distanceToTuple(const double *tupleBg, const double *tupleEnd, mcIdType& tupleId) const;
 484     DataArrayDouble *fromPolarToCart() const;
 485     DataArrayDouble *fromCylToCart() const;
 486     DataArrayDouble *fromSpherToCart() const;
 487     DataArrayDouble *cartesianize(MEDCouplingAxisType atOfThis) const;
 488     DataArrayDouble *fromCartToPolar() const;
 489     DataArrayDouble *fromCartToCyl() const;
 490     DataArrayDouble *fromCartToSpher() const;
 491     DataArrayDouble *fromCartToCylGiven(const DataArrayDouble *coords, const double center[3], const double vect[3]) const;
 492     DataArrayDouble *doublyContractedProduct() const;
 493     DataArrayDouble *determinant() const;
 494     DataArrayDouble *eigenValues() const;
 495     DataArrayDouble *eigenVectors() const;
 496     DataArrayDouble *inverse() const;
 497     DataArrayDouble *trace() const;
 498     DataArrayDouble *deviator() const;
 499     DataArrayDouble *magnitude() const;
 500     DataArrayDouble *maxPerTuple() const;
 501     DataArrayDouble *maxPerTupleWithCompoId(DataArrayIdType* &compoIdOfMaxPerTuple) const;
 502     DataArrayDouble *buildEuclidianDistanceDenseMatrix() const;
 503     DataArrayDouble *buildEuclidianDistanceDenseMatrixWith(const DataArrayDouble *other) const;
 504     void asArcOfCircle(double center[2], double& radius, double& ang) const;
 505     void sortPerTuple(bool asc);
 506     void applyInv(double numerator);
 507     void applyPow(double val);
 508     void applyRPow(double val);
 509     DataArrayDouble *applyFunc(std::size_t nbOfComp, FunctionToEvaluate func) const;
 510     DataArrayDouble *applyFunc(std::size_t nbOfComp, const std::string& func, bool isSafe=true) const;
 511     DataArrayDouble *applyFunc(const std::string& func, bool isSafe=true) const;
 512     void applyFuncOnThis(const std::string& func, bool isSafe=true);
 513     DataArrayDouble *applyFuncCompo(std::size_t nbOfComp, const std::string& func, bool isSafe=true) const;
 514     DataArrayDouble *applyFuncNamedCompo(std::size_t nbOfComp, const std::vector<std::string>& varsOrder, const std::string& func, bool isSafe=true) const;
 515     void applyFuncFast32(const std::string& func);
 516     void applyFuncFast64(const std::string& func);
 517     MCAuto<DataArrayDouble> symmetry3DPlane(const double point[3], const double normalVector[3]) const;
 518     DataArrayIdType *findIdsInRange(double vmin, double vmax) const;
 519     DataArrayIdType *findIdsNotInRange(double vmin, double vmax) const;
 520     static DataArrayDouble *Aggregate(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 521     static DataArrayDouble *Aggregate(const std::vector<const DataArrayDouble *>& arr);
 522     static DataArrayDouble *Dot(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 523     static DataArrayDouble *CrossProduct(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 524     static DataArrayDouble *Max(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 525     static DataArrayDouble *Min(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 526     static DataArrayDouble *Pow(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 527     void powEqual(const DataArrayDouble *other);
 528     std::vector<bool> toVectorOfBool(double eps) const;
 529     static void Rotate2DAlg(const double *center, double angle, mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut);
 530     static void Rotate3DAlg(const double *center, const double *vect, double angle, mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut);
 531     static void Symmetry3DPlane(const double point[3], const double normalVector[3], mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut);
 532     static void GiveBaseForPlane(const double normalVector[3], double baseOfPlane[9]);
 533     static void ComputeIntegralOfSeg2IntoTri3(const double seg2[4], const double tri3[6], double coeffs[3], double& length);
 534   public:
 535     void getTinySerializationIntInformation(std::vector<mcIdType>& tinyInfo) const;
 536     void getTinySerializationStrInformation(std::vector<std::string>& tinyInfo) const;
 537     bool resizeForUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI);
 538     void finishUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI, const std::vector<std::string>& tinyInfoS);
 539   public:
 540     template<int SPACEDIM>
 541     void findCommonTuplesAlg(const double *bbox, mcIdType nbNodes, mcIdType limitNodeId, double prec, DataArrayIdType *c, DataArrayIdType *cI) const;
 542     template<int SPACEDIM>
 543     static void FindClosestTupleIdAlg(const BBTreePts<SPACEDIM,mcIdType>& myTree, double dist, const double *pos, mcIdType nbOfTuples, const double *thisPt, mcIdType thisNbOfTuples, mcIdType *res);
 544     template<int SPACEDIM>
 545     static void FindTupleIdsNearTuplesAlg(const BBTreePts<SPACEDIM,mcIdType>& myTree, const double *pos, mcIdType nbOfTuples, double eps,
 546                                           DataArrayIdType *c, DataArrayIdType *cI);
 547   private:
 548     ~DataArrayDouble() { }
 549     DataArrayDouble() { }
 550   };
 551 }
 552
 553 namespace MEDCoupling
 554 {
 555   template<class T>
 556   class DataArrayDiscrete : public DataArrayTemplateClassic<T>
 557   {
 558   public:
 559     using DataArrayType = typename Traits<T>::ArrayType;
 560   public:
 561     static DataArrayType *New();
 562     T intValue() const;
 563     bool isEqual(const DataArrayDiscrete<T>& other) const;
 564     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayDiscrete<T>& other, std::string& reason) const;
 565     bool isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayDiscrete<T>& other) const;
 566     bool isEqualWithoutConsideringStrAndOrder(const typename Traits<T>::ArrayType& other) const;
 567     void switchOnTupleEqualTo(T val, std::vector<bool>& vec) const;
 568     void switchOnTupleNotEqualTo(T val, std::vector<bool>& vec) const;
 569     DataArrayIdType *occurenceRankInThis() const;
 570     DataArrayIdType *buildPermutationArr(const DataArrayDiscrete<T>& other) const;
 571     DataArrayIdType *indicesOfSubPart(const DataArrayDiscrete<T>& partOfThis) const;
 572     void checkMonotonic(bool increasing) const;
 573     bool isMonotonic(bool increasing) const;
 574     void checkStrictlyMonotonic(bool increasing) const;
 575     bool isStrictlyMonotonic(bool increasing) const;
 576     mcIdType getHashCode() const;
 577     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 578     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 579     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 580     void writeVTK(std::ostream& ofs, mcIdType indent, const std::string& type, const std::string& nameInFile, DataArrayByte *byteArr) const;
 581     void transformWithIndArr(const T *indArrBg, const T *indArrEnd);
 582     void transformWithIndArr(const MapKeyVal<T, T>& m);
 583     DataArrayIdType *findIdsEqual(T val) const;
 584     DataArrayIdType *transformWithIndArrR(const T *indArr2Bg, const T *indArrEnd) const;
 585     void splitByValueRange(const T *arrBg, const T *arrEnd,
 586                            DataArrayType *& castArr, DataArrayType *& rankInsideCast, DataArrayType *& castsPresent) const;
 587     bool isRange(T& strt, T& sttoopp, T& stteepp) const;
 588     DataArrayIdType *invertArrayO2N2N2O(mcIdType newNbOfElem) const;
 589     DataArrayIdType *invertArrayN2O2O2N(mcIdType oldNbOfElem) const;
 590     DataArrayIdType *invertArrayO2N2N2OBis(mcIdType newNbOfElem) const;
 591     MCAuto< MapKeyVal<T, mcIdType> > invertArrayN2O2O2NOptimized() const;
 592     MCAuto< MapKeyVal<mcIdType, T> > giveN2OOptimized() const;
 593     MCAuto<DataArrayIdType> findIdForEach(const T *valsBg, const T *valsEnd) const;
 594     DataArrayIdType *checkAndPreparePermutation() const;
 595     void changeSurjectiveFormat(T targetNb, DataArrayIdType *&arr, DataArrayIdType *&arrI) const;
 596     DataArrayIdType *buildPermArrPerLevel() const;
 597     bool isIota(mcIdType sizeExpected) const;
 598     bool isUniform(T val) const;
 599     T checkUniformAndGuess() const;
 600     bool hasUniqueValues() const;
 601     void setSelectedComponents(const DataArrayType *a, const std::vector<std::size_t>& compoIds);
 602     DataArrayIdType *findIdsNotEqual(T val) const;
 603     DataArrayIdType *findIdsEqualTuple(const T *tupleBg, const T *tupleEnd) const;
 604     DataArrayIdType *findIdsEqualList(const T *valsBg, const T *valsEnd) const;
 605     DataArrayIdType *findIdsNotEqualList(const T *valsBg, const T *valsEnd) const;
 606     mcIdType findIdFirstEqual(T value) const;
 607     mcIdType findIdFirstEqual(const std::vector<T>& vals) const;
 608     mcIdType findIdFirstEqualTuple(const std::vector<T>& tupl) const;
 609     mcIdType findIdSequence(const std::vector<T>& vals) const;
 610     mcIdType changeValue(T oldValue, T newValue);
 611     mcIdType count(T value) const;
 612     bool presenceOfTuple(const std::vector<T>& tupl) const;
 613     bool presenceOfValue(T value) const;
 614     bool presenceOfValue(const std::vector<T>& vals) const;
 615     void accumulate(T *res) const;
 616     T accumulate(std::size_t compId) const;
 617     DataArrayType *accumulatePerChunck(const mcIdType *bgOfIndex, const mcIdType *endOfIndex) const;
 618     void getMinMaxValues(T& minValue, T& maxValue) const;
 619     void applyInv(T numerator);
 620     void applyDivideBy(T val);
 621     void applyModulus(T val);
 622     void applyRModulus(T val);
 623     void applyPow(T val);
 624     void applyRPow(T val);
 625     DataArrayIdType *findIdsInRange(T vmin, T vmax) const;
 626     DataArrayIdType *findIdsNotInRange(T vmin, T vmax) const;
 627     bool checkAllIdsInRange(T vmin, T vmax) const;
 628     static DataArrayType *Aggregate(const DataArrayType *a1, const DataArrayType *a2, T offsetA2);
 629     static DataArrayType *Aggregate(const std::vector<const DataArrayType *>& arr);
 630     static DataArrayType *AggregateIndexes(const std::vector<const DataArrayType *>& arrs);
 631     static DataArrayType *BuildUnion(const std::vector<const DataArrayType *>& arr);
 632     static DataArrayType *BuildIntersection(const std::vector<const DataArrayType *>& arr);
 633     static void PutIntoToSkylineFrmt(const std::vector< std::vector<T> >& v, DataArrayType *& data, DataArrayIdType *& dataIndex);
 634     DataArrayIdType *buildComplement(mcIdType nbOfElement) const;
 635     DataArrayType *buildSubstraction(const DataArrayType *other) const;
 636     DataArrayType *buildSubstractionOptimized(const DataArrayType *other) const;
 637     DataArrayType *buildUnion(const DataArrayType *other) const;
 638     DataArrayType *buildIntersection(const DataArrayType *other) const;
 639     DataArrayIdType *indexOfSameConsecutiveValueGroups() const;
 640     DataArrayType *buildUnique() const;
 641     DataArrayType *buildUniqueNotSorted() const;
 642     DataArrayType *deltaShiftIndex() const;
 643     void computeOffsets();
 644     void computeOffsetsFull();
 645     void findIdsRangesInListOfIds(const DataArrayType *listOfIds, DataArrayIdType *& rangeIdsFetched, DataArrayType *& idsInInputListThatFetch) const;
 646     DataArrayType *buildExplicitArrByRanges(const DataArrayType *offsets) const;
 647     DataArrayType *buildExplicitArrOfSliceOnScaledArr(T begin, T stop, T step) const;
 648     DataArrayIdType *findRangeIdForEachTuple(const DataArrayType *ranges) const;
 649     DataArrayType *findIdInRangeForEachTuple(const DataArrayType *ranges) const;
 650     void sortEachPairToMakeALinkedList();
 651     void sortToHaveConsecutivePairs();
 652     MCAuto<DataArrayType> fromLinkedListOfPairToList() const;
 653     DataArrayType *getDifferentValues() const;
 654     std::vector<DataArrayIdType *> partitionByDifferentValues(std::vector<T>& differentIds) const;
 655     std::vector< std::pair<mcIdType,mcIdType> > splitInBalancedSlices(mcIdType nbOfSlices) const;
 656     static DataArrayType *Modulus(const DataArrayType *a1, const DataArrayType *a2);
 657     void modulusEqual(const DataArrayType *other);
 658     static DataArrayType *Pow(const DataArrayType *a1, const DataArrayType *a2);
 659     void powEqual(const DataArrayType *other);
 660     //MemArray<T>& accessToMemArray() { return _mem; }
 661     //const MemArray<T>& accessToMemArray() const { return _mem; }
 662   public:
 663     static DataArrayIdType *FindPermutationFromFirstToSecond(const DataArrayType *ids1, const DataArrayType *ids2);
 664     static DataArrayIdType *FindPermutationFromFirstToSecondDuplicate(const DataArrayType *ids1, const DataArrayType *ids2);
 665     static mcIdType *CheckAndPreparePermutation(const T *start, const T *end);
 666     static DataArrayType *BuildListOfSwitchedOn(const std::vector<bool>& v);
 667     static DataArrayType *BuildListOfSwitchedOff(const std::vector<bool>& v);
 668     static DataArrayIdType *ConvertIndexArrayToO2N(mcIdType nbOfOldTuples, const mcIdType *arr, const mcIdType *arrIBg, const mcIdType *arrIEnd, mcIdType &newNbOfTuples);
 669     static DataArrayIdType *MakePartition(const std::vector<const DataArrayType *>& groups, mcIdType newNb, std::vector< std::vector<mcIdType> >& fidsOfGroups);
 670   public:
 671     static void ExtractFromIndexedArrays(const mcIdType *idsOfSelectBg, const mcIdType *idsOfSelectEnd,
 672                                                             const DataArrayType *arrIn, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 673                                                             DataArrayType* &arrOut, DataArrayIdType* &arrIndexOut);
 674     static void ExtractFromIndexedArraysSlice(mcIdType idsOfSelectStart, mcIdType idsOfSelectStop, mcIdType idsOfSelectStep,
 675                                                                  const DataArrayType *arrIn, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 676                                                                  DataArrayType* &arrOut, DataArrayIdType* &arrIndexOut);
 677     static void SetPartOfIndexedArrays(const mcIdType *idsOfSelectBg, const mcIdType *idsOfSelectEnd,
 678                                                           const DataArrayType *arrIn, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 679                                                           const DataArrayType *srcArr, const DataArrayIdType *srcArrIndex,
 680                                                           DataArrayType* &arrOut, DataArrayIdType* &arrIndexOut);
 681     static void SetPartOfIndexedArraysSlice(mcIdType start, mcIdType end, mcIdType step,
 682                                                                const DataArrayType *arrIn, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 683                                                                const DataArrayType *srcArr, const DataArrayIdType *srcArrIndex,
 684                                                                DataArrayType* &arrOut, DataArrayIdType* &arrIndexOut);
 685     static void SetPartOfIndexedArraysSameIdx(const mcIdType *idsOfSelectBg, const mcIdType *idsOfSelectEnd,
 686                                                                  DataArrayType *arrInOut, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 687                                                                  const DataArrayType *srcArr, const DataArrayIdType *srcArrIndex);
 688     static void SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice(mcIdType start, mcIdType end, mcIdType step,
 689                                                                       DataArrayType *arrInOut, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 690                                                                       const DataArrayType *srcArr, const DataArrayIdType *srcArrIndex);
 691     static bool RemoveIdsFromIndexedArrays(const T *idsToRemoveBg, const T *idsToRemoveEnd,
 692                                                               DataArrayType *arr, DataArrayIdType *arrIndx, mcIdType offsetForRemoval=0);
 693     static DataArrayType *Range(T begin, T end, T step);
 694   public:
 695     void getTinySerializationIntInformation(std::vector<mcIdType>& tinyInfo) const;
 696     void getTinySerializationStrInformation(std::vector<std::string>& tinyInfo) const;
 697     bool resizeForUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI);
 698     void finishUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI, const std::vector<std::string>& tinyInfoS);
 699   protected:
 700     template<class ALG>
 701     void switchOnTupleAlg(T val, std::vector<bool>& vec, ALG algo) const;
 702   protected:
 703     ~DataArrayDiscrete() { }
 704   };
 705
 706   template<class T>
 707   class DataArrayDiscreteSigned : public DataArrayDiscrete<T>
 708   {
 709   public:
 710     bool isFittingWith(const std::vector<bool>& v) const;
 711   protected:
 712     ~DataArrayDiscreteSigned() { }
 713   };
 714
 715   class DataArrayInt32Iterator;
 716
 717   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt32 : public DataArrayDiscreteSigned<Int32>
 718   {
 719     friend class DataArrayDiscrete<Int32>;
 720   public:
 721     DataArrayInt32 *deepCopy() const;
 722     DataArrayInt32 *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 723     DataArrayInt32 *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayInt32::New(); }
 724     MCAuto<DataArrayInt64> convertToInt64Arr() const;
 725   public:
 726     DataArrayInt32 *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 727     DataArrayInt32 *selectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const { return this->mySelectByTupleId(di); }
 728     DataArrayInt32 *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 729     DataArrayInt32 *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return this->myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 730     DataArrayInt32 *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return this->mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 731     DataArrayInt32 *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return this->mySelectByTupleRanges(ranges); }
 732     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayInt32"); }
 733   public:
 734     DataArrayInt32Iterator *iterator();
 735   private:
 736     ~DataArrayInt32() { }
 737     DataArrayInt32() { }
 738   };
 739
 740   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt64 : public DataArrayDiscreteSigned<Int64>
 741   {
 742     friend class DataArrayDiscrete<Int64>;
 743   public:
 744     DataArrayInt64 *deepCopy() const;
 745     DataArrayInt64 *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 746     DataArrayInt64 *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayInt64::New(); }//ok
 747     MCAuto<DataArrayInt32> convertToInt32Arr() const;
 748   public:
 749     DataArrayInt64 *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 750     DataArrayInt64 *selectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const { return this->mySelectByTupleId(di); }
 751     DataArrayInt64 *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return DataArrayTemplate<Int64>::mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 752     DataArrayInt64 *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return DataArrayTemplate<Int64>::myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 753     DataArrayInt64 *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return DataArrayTemplate<Int64>::mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 754     DataArrayInt64 *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return DataArrayTemplate<Int64>::mySelectByTupleRanges(ranges); }
 755     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayInt64"); }
 756   public:
 757     DataArrayInt64Iterator *iterator();
 758   private:
 759     ~DataArrayInt64() { }
 760     DataArrayInt64() { }
 761   };
 762 }
 763
 764 namespace MEDCoupling
 765 {
 766
 767   template<class T>
 768   template<class OP>
 769   MCAuto<DataArrayIdType> DataArrayTemplateClassic<T>::findIdsAdv(const OP& op) const
 770   {
 771     this->checkAllocated();
 772     if(this->getNumberOfComponents()!=1)
 773       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::findIdsAdv : this must have exactly one component !");
 774     const T *cptr(this->begin());
 775     MCAuto<DataArrayIdType> ret(DataArrayIdType::New()); ret->alloc(0,1);
 776     mcIdType nbOfTuples=this->getNumberOfTuples();
 777     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,cptr++)
 778       if(op(*cptr))
 779         ret->pushBackSilent(i);
 780     return ret;
 781   }
 782
 783   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayChar : public DataArrayTemplate<char>
 784   {
 785   public:
 786     virtual DataArrayChar *buildEmptySpecializedDAChar() const = 0;
 787     mcIdType getHashCode() const;
 788     bool isEqual(const DataArrayChar& other) const;
 789     virtual bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayChar& other, std::string& reason) const;
 790     bool isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayChar& other) const;
 791     std::string repr() const;
 792     std::string reprZip() const;
 793     DataArrayInt *convertToIntArr() const;
 794     DataArrayChar *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 795     DataArrayChar *selectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const { return this->mySelectByTupleId(di); }
 796     DataArrayChar *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return DataArrayTemplate<char>::mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 797     DataArrayChar *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return DataArrayTemplate<char>::myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 798     DataArrayChar *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return DataArrayTemplate<char>::mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 799     bool isUniform(char val) const;
 800     void meldWith(const DataArrayChar *other);
 801     DataArray *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return DataArrayTemplate<char>::mySelectByTupleRanges(ranges); }
 802     DataArrayIdType *findIdsEqual(char val) const;
 803     DataArrayIdType *findIdsNotEqual(char val) const;
 804     mcIdType findIdSequence(const std::vector<char>& vals) const;
 805     mcIdType findIdFirstEqualTuple(const std::vector<char>& tupl) const;
 806     mcIdType findIdFirstEqual(char value) const;
 807     mcIdType findIdFirstEqual(const std::vector<char>& vals) const;
 808     bool presenceOfTuple(const std::vector<char>& tupl) const;
 809     bool presenceOfValue(char value) const;
 810     bool presenceOfValue(const std::vector<char>& vals) const;
 811     DataArrayIdType *findIdsInRange(char vmin, char vmax) const;
 812     static DataArrayChar *Aggregate(const DataArrayChar *a1, const DataArrayChar *a2);
 813     static DataArrayChar *Aggregate(const std::vector<const DataArrayChar *>& arr);
 814     static DataArrayChar *Meld(const DataArrayChar *a1, const DataArrayChar *a2);
 815     static DataArrayChar *Meld(const std::vector<const DataArrayChar *>& arr);
 816     MemArray<char>& accessToMemArray() { return _mem; }
 817     const MemArray<char>& accessToMemArray() const { return _mem; }
 818   public:
 819     //void getTinySerializationIntInformation(std::vector<mcIdType>& tinyInfo) const;
 820     //void getTinySerializationStrInformation(std::vector<std::string>& tinyInfo) const;
 821     //bool resizeForUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI);
 822     //void finishUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI, const std::vector<std::string>& tinyInfoS);
 823   protected:
 824     DataArrayChar() { }
 825   };
 826
 827   class DataArrayByteIterator;
 828
 829   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayByte : public DataArrayChar
 830   {
 831   public:
 832     static DataArrayByte *New();
 833     DataArrayChar *buildEmptySpecializedDAChar() const;
 834     DataArrayByteIterator *iterator();
 835     DataArrayByte *deepCopy() const;
 836     DataArrayByte *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 837     DataArrayByte *performCopyOrIncrRef(bool deepCopy) const;
 838     DataArrayByte *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayByte::New(); }
 839     char byteValue() const;
 840     void reprStream(std::ostream& stream) const;
 841     void reprZipStream(std::ostream& stream) const;
 842     void reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 843     void reprZipWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 844     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 845     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 846     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 847     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayChar& other, std::string& reason) const;
 848     std::vector<bool> toVectorOfBool() const;
 849     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayByte"); }
 850   private:
 851     ~DataArrayByte() { }
 852     DataArrayByte() { }
 853   };
 854
 855   class DataArrayAsciiCharIterator;
 856
 857   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayAsciiChar : public DataArrayChar
 858   {
 859   public:
 860     static DataArrayAsciiChar *New();
 861     static DataArrayAsciiChar *New(const std::string& st);
 862     static DataArrayAsciiChar *New(const std::vector<std::string>& vst, char defaultChar);
 863     DataArrayChar *buildEmptySpecializedDAChar() const;
 864     DataArrayAsciiCharIterator *iterator();
 865     DataArrayAsciiChar *deepCopy() const;
 866     DataArrayAsciiChar *copySorted(bool asc=true) const override { (void)asc;throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayAsciiChar::copySorted : not implemented for DataArrayByte"); }
 867     DataArrayAsciiChar *performCopyOrIncrRef(bool deepCopy) const;
 868     DataArrayAsciiChar *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayAsciiChar::New(); }
 869     char asciiCharValue() const;
 870     void reprStream(std::ostream& stream) const;
 871     void reprZipStream(std::ostream& stream) const;
 872     void reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 873     void reprZipWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 874     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 875     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 876     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 877     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayChar& other, std::string& reason) const;
 878     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayAsciiChar"); }
 879   private:
 880     ~DataArrayAsciiChar() { }
 881     DataArrayAsciiChar() { }
 882     DataArrayAsciiChar(const std::string& st);
 883     DataArrayAsciiChar(const std::vector<std::string>& vst, char defaultChar);
 884   };
 885
 886   template<class T>
 887   class DataArrayIterator
 888   {
 889   public:
 890     DataArrayIterator(typename Traits<T>::ArrayType *da);
 891     ~DataArrayIterator();
 892     typename Traits<T>::ArrayTuple *nextt();
 893   private:
 894     typename Traits<T>::ArrayType *_da;
 895     T *_pt;
 896     mcIdType _tuple_id;
 897     std::size_t _nb_comp;
 898     mcIdType _nb_tuple;
 899   };
 900
 901   template<class T>
 902   class DataArrayTuple
 903   {
 904   public:
 905     DataArrayTuple(T *pt, std::size_t nbOfComp);
 906     std::string repr() const;
 907     std::size_t getNumberOfCompo() const { return _nb_of_compo; }
 908     const T *getConstPointer() const { return  _pt; }
 909     T *getPointer() { return _pt; }
 910     typename Traits<T>::ArrayType *buildDA(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 911   protected:
 912     T zeValue() const;
 913   protected:
 914     T *_pt;
 915     std::size_t _nb_of_compo;
 916   };
 917
 918   class DataArrayDoubleTuple;
 919
 920   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDoubleIterator : public DataArrayIterator<double>
 921   {
 922   public:
 923     DataArrayDoubleIterator(DataArrayDouble *da);
 924     ~DataArrayDoubleIterator() { }
 925   };
 926
 927   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDoubleTuple : public DataArrayTuple<double>
 928   {
 929   public:
 930     DataArrayDoubleTuple(double *pt, std::size_t nbOfComp);
 931     std::string repr() const;
 932     double doubleValue() const;
 933     DataArrayDouble *buildDADouble(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 934   };
 935
 936   class DataArrayFloatTuple;
 937
 938   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayFloatIterator : public DataArrayIterator<float>
 939   {
 940   public:
 941     DataArrayFloatIterator(DataArrayFloat *da);
 942     ~DataArrayFloatIterator() { }
 943   };
 944
 945   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayFloatTuple : public DataArrayTuple<float>
 946   {
 947   public:
 948     DataArrayFloatTuple(float *pt, std::size_t nbOfComp);
 949     std::string repr() const;
 950     float floatValue() const;
 951     DataArrayFloat *buildDAFloat(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 952   };
 953
 954   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt32Iterator : public DataArrayIterator<Int32>
 955   {
 956   public:
 957     DataArrayInt32Iterator(DataArrayInt32 *da);
 958     ~DataArrayInt32Iterator() { }
 959   };
 960
 961   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt64Iterator : public DataArrayIterator<Int64>
 962   {
 963   public:
 964     DataArrayInt64Iterator(DataArrayInt64 *da);
 965     ~DataArrayInt64Iterator() { }
 966   };
 967
 968   class MEDCOUPLING_EXPORT  DataArrayInt32Tuple : public DataArrayTuple<Int32>
 969   {
 970   public:
 971      DataArrayInt32Tuple(Int32 *pt, std::size_t nbOfComp);
 972     std::string repr() const;
 973     Int32 intValue() const;
 974     DataArrayInt32 *buildDAInt(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 975   };
 976
 977   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt64Tuple : public DataArrayTuple<Int64>
 978   {
 979   public:
 980      DataArrayInt64Tuple(Int64 *pt, std::size_t nbOfComp);
 981     std::string repr() const;
 982     Int64 intValue() const;
 983     DataArrayInt64 *buildDAInt(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 984   };
 985
 986   typedef DataArrayInt32Tuple DataArrayIntTuple;
 987
 988   class DataArrayAsciiCharTuple;
 989
 990   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayAsciiCharIterator
 991   {
 992   public:
 993     DataArrayAsciiCharIterator(DataArrayAsciiChar *da);
 994     ~DataArrayAsciiCharIterator();
 995     DataArrayAsciiCharTuple *nextt();
 996   private:
 997     DataArrayAsciiChar *_da;
 998     char *_pt;
 999     mcIdType _tuple_id;
1000     std::size_t _nb_comp;
1001     mcIdType _nb_tuple;
1002   };
1003
1004   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayAsciiCharTuple
1005   {
1006   public:
1007     DataArrayAsciiCharTuple(char *pt, std::size_t nbOfComp);
1008     std::string repr() const;
1009     std::size_t getNumberOfCompo() const { return _nb_of_compo; }
1010     const char *getConstPointer() const { return  _pt; }
1011     char *getPointer() { return _pt; }
1012     char asciiCharValue() const;
1013     DataArrayAsciiChar *buildDAAsciiChar(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
1014   private:
1015     char *_pt;
1016     std::size_t _nb_of_compo;
1017   };
1018
1019   class DataArrayByteTuple;
1020
1021   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayByteIterator
1022   {
1023   public:
1024      DataArrayByteIterator(DataArrayByte *da);
1025     ~DataArrayByteIterator();
1026     DataArrayByteTuple *nextt();
1027   private:
1028     DataArrayByte *_da;
1029     char *_pt;
1030     mcIdType _tuple_id;
1031     std::size_t _nb_comp;
1032     mcIdType _nb_tuple;
1033   };
1034
1035   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayByteTuple
1036   {
1037   public:
1038     DataArrayByteTuple(char *pt, std::size_t nbOfComp);
1039     std::string repr() const;
1040     std::size_t getNumberOfCompo() const { return _nb_of_compo; }
1041     const char *getConstPointer() const { return  _pt; }
1042     char *getPointer() { return _pt; }
1043     char byteValue() const;
1044     DataArrayByte *buildDAByte(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
1045   private:
1046     char *_pt;
1047     std::size_t _nb_of_compo;
1048   };
1049 }
1050
1051 namespace MEDCoupling
1052 {
1053   template<class T>
1054   template<class InputIterator>
1055   void MemArray<T>::insertAtTheEnd(InputIterator first, InputIterator last)
1056   {
1057     T *pointer=_pointer.getPointer();
1058     while(first!=last)
1059       {
1060         if(_nb_of_elem>=_nb_of_elem_alloc)
1061           {
1062             reserve(_nb_of_elem_alloc>0?2*_nb_of_elem_alloc:1);
1063             pointer=_pointer.getPointer();
1064           }
1065         pointer[_nb_of_elem++]=*first++;
1066       }
1067   }
1068
1069   template<class T>
1070   template<class InputIterator>
1071   void DataArrayTemplate<T>::insertAtTheEnd(InputIterator first, InputIterator last)
1072   {
1073     std::size_t nbCompo(this->getNumberOfComponents());
1074     if(nbCompo==1)
1075       this->_mem.insertAtTheEnd(first,last);
1076     else if(nbCompo==0)
1077       {
1078         this->_info_on_compo.resize(1);
1079         this->_mem.insertAtTheEnd(first,last);
1080       }
1081     else
1082       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::insertAtTheEnd : not available for DataArrayDouble with number of components different than 1 !");
1083   }
1084 }