Salome HOME
Merge from BR_DIET
authorbarate <barate>
Wed, 28 Mar 2012 16:02:56 +0000 (16:02 +0000)
committerbarate <barate>
Wed, 28 Mar 2012 16:02:56 +0000 (16:02 +0000)
18 files changed:
src/CMakeLists.txt
src/Core/Batch_BatchManager.cxx
src/Core/Batch_BatchManager_eClient.hxx
src/Core/Batch_Utils.cxx
src/Core/Batch_Utils.hxx
src/Core/Test/batchtest.conf
src/Vishnu/Batch_BatchManager_eVishnu.cxx [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Batch_BatchManager_eVishnu.hxx [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Batch_FactBatchManager_eVishnu.cxx [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Batch_FactBatchManager_eVishnu.hxx [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Batch_JobInfo_eVishnu.cxx [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Batch_JobInfo_eVishnu.hxx [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/CMakeLists.txt [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Test/CMakeLists.txt [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Test/Test_eVishnu.cxx [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Test/seta.sh [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Test/setb.sh [new file with mode: 0644]
src/Vishnu/Test/test-script.sh [new file with mode: 0755]

index 11e07fb210bc731ab5eab6eed76fbe9f2444435a..2148bbf89b2d5dfd9574e1034d5c80eeb4a45383 100644 (file)
@@ -57,6 +57,7 @@ add_subdirectory (SGE)
 add_subdirectory (SSH)
 add_subdirectory (LoadLeveler)
 add_subdirectory (Slurm)
+add_subdirectory (Vishnu)
 
 # Make a copy of the built value and clear the built value for the next run of cmake
 SET(SRC_FILES ${SRC_FILES_BUILD} CACHE INTERNAL "")
index 6f34765de63ecda3b46ab7558a210a97dc0caba7..cbe725ce3c50b40793775788b4d2b7bdeaf53af3 100644 (file)
@@ -66,6 +66,7 @@ namespace Batch {
 //   }
   BatchManager::BatchManager(const FactBatchManager * parent, const char * host) throw(InvalidArgumentException) : _hostname(host), jobid_map(), _parent(parent)
   {
+    /*
 #ifdef WIN32
     WSADATA wsaData;
     WSAStartup(MAKEWORD(2, 2), &wsaData);  // Initialize Winsock
@@ -84,6 +85,7 @@ namespace Batch {
       msg += "\" unknown from the network";
       throw InvalidArgumentException(msg.c_str());
     }
+    */
   }
 
   // Destructeur
index b33ca1713f56b6813f81988fb5a5889e5528285f..d596f44582b7d7fd29b9f0f94888b985de448f9d 100644 (file)
@@ -52,7 +52,7 @@ namespace Batch {
                          const char * username="",
                          CommunicationProtocolType protocolType = SSH, const char* mpiImpl="mpich1");
     virtual ~BatchManager_eClient();
-    void importOutputFiles( const Job & job, const std::string directory );
+    virtual void importOutputFiles( const Job & job, const std::string directory );
     bool importDumpStateFile( const Job & job, const std::string directory );
 
   protected:
index 3b706d2906bf7bb651751cba1f21170f3de98e2c..83b43e3bfce7f692eb854220400d7bce43a18e7b 100644 (file)
@@ -61,4 +61,11 @@ int Utils::getCommandOutput(const string & command, string & output)
   return status;
 }
 
+bool Utils::isAbsolutePath(const string & path)
+{
+  if (path.size() == 0)
+    return false;
+  return path[0] == '/';
+}
+
 }
index 24f17d12aab25e09dd9a6ebc301fe801a05e534f..ce59ccf89fbcf2c5bf4dc42023f9e3656e21e584 100644 (file)
@@ -42,6 +42,12 @@ public:
    */
   static int getCommandOutput(const std::string & command, std::string & output);
 
+  /**
+   * Test if the path in parameter is an absolute path (does not test the existence of
+   * a file or directory at this path).
+   */
+  static bool isAbsolutePath(const std::string & path);
+
 private:
 
   // No instanciation possible as this class provides only static methods
index 570ec212bda00b916cf719ba497f84a1b8e23735..07034c424d75dd7872804537704c7a8152ba623a 100644 (file)
@@ -43,3 +43,11 @@ TEST_ESLURM_HOST = "localhost"                # Slurm server host
 TEST_ESLURM_USER = "username"                 # Login for the Slurm server
 TEST_ESLURM_HOMEDIR = "/home/username"        # Home directory on Slurm server
 TEST_ESLURM_TIMEOUT = 120                     # Execution timeout (in seconds) for Slurm Batch test
+
+TEST_EVISHNU_HOST = "localhost"               # Vishnu server host
+TEST_EVISHNU_USER = "username"                # Login on the Vishnu server host
+TEST_EVISHNU_VISHNU_USERID = "userid"         # UserId for connecting to Vishnu
+TEST_EVISHNU_VISHNU_PASSWORD = "password"     # Password for connecting to Vishnu
+TEST_EVISHNU_VISHNU_MACHINEID = "localhost"   # ID of the machine where Vishnu will launch the job
+TEST_EVISHNU_HOMEDIR = "/home/username"       # Home directory on Vishnu server
+TEST_EVISHNU_TIMEOUT = 120                    # Execution timeout (in seconds) for Vishnu Batch test
diff --git a/src/Vishnu/Batch_BatchManager_eVishnu.cxx b/src/Vishnu/Batch_BatchManager_eVishnu.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..279dce3
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,399 @@
+//  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+//  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+//  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+//  This library is free software; you can redistribute it and/or
+//  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+//  License as published by the Free Software Foundation; either
+//  version 2.1 of the License.
+//
+//  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+//  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+//  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+//  Lesser General Public License for more details.
+//
+//  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+//  License along with this library; if not, write to the Free Software
+//  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+//  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+/*
+ *  Batch_BatchManager_eVishnu.cxx :
+ *
+ *  Created on: 24 june 2011
+ *  Author : Renaud BARATE - EDF R&D
+ */
+
+#include <cstdlib>
+#include <iostream>
+#include <fstream>
+#include <sstream>
+
+#include <Batch_NotYetImplementedException.hxx>
+#include <Batch_Constants.hxx>
+#include <Batch_Utils.hxx>
+
+#include "Batch_FactBatchManager_eVishnu.hxx"
+#include "Batch_BatchManager_eVishnu.hxx"
+#include "Batch_JobInfo_eVishnu.hxx"
+
+using namespace std;
+
+namespace Batch {
+
+  BatchManager_eVishnu::BatchManager_eVishnu(const FactBatchManager * parent,
+                                             const char * host,
+                                             const char * username,
+                                             CommunicationProtocolType protocolType,
+                                             const char * mpiImpl,
+                                             int nb_proc_per_node)
+    : BatchManager(parent, host),
+      // Force SH protocol for Vishnu
+      BatchManager_eClient(parent, host, username, SH, mpiImpl),
+      _nb_proc_per_node(nb_proc_per_node)
+  {
+  }
+
+  BatchManager_eVishnu::~BatchManager_eVishnu()
+  {
+  }
+
+  // Method to submit a job to the batch manager
+  const JobId BatchManager_eVishnu::submitJob(const Job & job)
+  {
+    int status;
+    Parametre params = job.getParametre();
+    const string workDir = params[WORKDIR];
+
+    // export input files on cluster
+    exportInputFiles(job);
+
+    // build command file to submit the job
+    string cmdFile = buildCommandFile(job);
+
+    // define name of log file (local)
+    string logFile = generateTemporaryFileName("vishnu-submitlog");
+
+    // define command to submit batch
+    string subCommand = string("export OMNIORB_CONFIG=$VISHNU_CONFIG_FILE; ");
+    subCommand += "vishnu_connect -p 2; ";
+    subCommand += "vishnu_submit_job " + _hostname + " " + cmdFile;
+    string command = _protocol.getExecCommand(subCommand,
+                                              _hostname,
+                                              _username);
+    command += " > ";
+    command += logFile;
+    cerr << command.c_str() << endl;
+    status = system(command.c_str());
+    if (status)
+    {
+      ifstream error_message(logFile.c_str());
+      string mess;
+      string temp;
+      while(getline(error_message, temp))
+        mess += temp;
+      error_message.close();
+      throw EmulationException("Error of connection on remote host, error was: " + mess);
+    }
+
+    // read id of submitted job in log file
+    string jobref;
+    ifstream idfile(logFile.c_str());
+    string line;
+    while (idfile && line.compare(0, 13, "Job Id     : ") != 0)
+      getline(idfile, line);
+    idfile.close();
+    if (line.compare(0, 13, "Job Id     : ") == 0)
+      jobref = line.substr(13);
+    if (jobref.size() == 0)
+      throw EmulationException("Error in the submission of the job on the remote host");
+
+    JobId id(this, jobref);
+    return id;
+  }
+
+
+  void BatchManager_eVishnu::exportInputFiles(const Job& job)
+  {
+    int status;
+    Parametre params = job.getParametre();
+    const Versatile & V = params[INFILE];
+    Versatile::const_iterator Vit;
+
+    // create remote directories
+    string subCommand = string("export OMNIORB_CONFIG=$VISHNU_CONFIG_FILE; ");
+    subCommand += "vishnu_connect -p 2; ";
+    subCommand += "vishnu_create_dir -p " + _hostname + ":" + params[WORKDIR].str() + "/logs";
+    string command = _protocol.getExecCommand(subCommand,
+                                              _hostname,
+                                              _username);
+    cerr << command.c_str() << endl;
+    status = system(command.c_str());
+    if (status != 0)
+      throw EmulationException("Can't create remote directories");
+
+    // copy executable
+    string executeFile = params[EXECUTABLE];
+    if (executeFile.size() != 0) {
+
+      string subCommand = string("export OMNIORB_CONFIG=$VISHNU_CONFIG_FILE; ");
+      subCommand += "vishnu_connect -p 2; ";
+      subCommand += "vishnu_copy_file " + executeFile + " " + _hostname + ":" + params[WORKDIR].str() + "/";
+      string command = _protocol.getExecCommand(subCommand,
+                                                _hostname,
+                                                _username);
+      cerr << command.c_str() << endl;
+      status = system(command.c_str());
+      if (status != 0)
+        throw EmulationException("Can't copy executable");
+    }
+
+    // copy filesToExportList
+    for (Vit=V.begin(); Vit!=V.end(); Vit++) {
+      CoupleType cpt  = *static_cast< CoupleType * >(*Vit);
+      Couple inputFile = cpt;
+
+      // Get absolute paths
+      char * buf = getcwd(NULL, 0);
+      string cwd = buf;
+      free(buf);
+
+      string absremote = (Utils::isAbsolutePath(inputFile.getRemote()))?
+                         inputFile.getRemote() :
+                         params[WORKDIR].str() + "/" + inputFile.getRemote();
+      string abslocal = (Utils::isAbsolutePath(inputFile.getLocal()))?
+                        inputFile.getLocal() :
+                        cwd + "/" + inputFile.getLocal();
+
+      string subCommand = string("export OMNIORB_CONFIG=$VISHNU_CONFIG_FILE; ");
+      subCommand += "vishnu_connect -p 2; ";
+      subCommand += "vishnu_copy_file " + abslocal + " " + _hostname + ":" + absremote;
+      string command = _protocol.getExecCommand(subCommand,
+                                                _hostname,
+                                                _username);
+      cerr << command.c_str() << endl;
+      status = system(command.c_str());
+      if (status != 0)
+        throw EmulationException("Can't copy file");
+    }
+  }
+
+  /**
+   * Create Vishnu command file and copy it on the server.
+   * Return the name of the remote file.
+   */
+  string BatchManager_eVishnu::buildCommandFile(const Job & job)
+  {
+    Parametre params = job.getParametre();
+
+    // Job Parameters
+    string workDir = "";
+    string fileToExecute = "";
+    string queue = "";
+
+    // Mandatory parameters
+    if (params.find(WORKDIR) != params.end()) 
+      workDir = params[WORKDIR].str();
+    else 
+      throw EmulationException("params[WORKDIR] is not defined. Please define it, cannot submit this job.");
+    if (params.find(EXECUTABLE) != params.end()) 
+      fileToExecute = params[EXECUTABLE].str();
+    else 
+      throw EmulationException("params[EXECUTABLE] is not defined. Please define it, cannot submit this job.");
+
+    string::size_type p1 = fileToExecute.find_last_of("/");
+    string::size_type p2 = fileToExecute.find_last_of(".");
+    string rootNameToExecute = fileToExecute.substr(p1+1,p2-p1-1);
+    string fileNameToExecute = fileToExecute.substr(p1+1);
+
+    // Create batch submit file
+    ofstream tempOutputFile;
+    string tmpFileName = createAndOpenTemporaryFile("vishnu-script", tempOutputFile);
+
+    tempOutputFile << "#!/bin/sh" << endl;
+    tempOutputFile << "#% vishnu_output=" << workDir << "/logs/output.log." << rootNameToExecute << endl;
+    tempOutputFile << "#% vishnu_error=" << workDir << "/logs/error.log." << rootNameToExecute << endl;
+
+    if (params.find(NAME) != params.end())
+      tempOutputFile << "#% vishnu_job_name=\"" << params[NAME] << "\"" << endl;
+
+    // Optional parameters
+    int nbproc = 1;
+    if (params.find(NBPROC) != params.end())
+      nbproc = params[NBPROC];
+
+    //int nodes_requested = (nbproc + _nb_proc_per_node -1) / _nb_proc_per_node;
+    //tempOutputFile << "#SBATCH --nodes=" << nodes_requested << endl;
+    //tempOutputFile << "#SBATCH --ntasks-per-node=" << _nb_proc_per_node << endl;
+
+    if (params.find(MAXWALLTIME) != params.end()) {
+      long totalMinutes = params[MAXWALLTIME];
+      long h = totalMinutes / 60;
+      long m = totalMinutes - h * 60;
+      tempOutputFile << "#% vishnu_wallclocklimit=" << h << ":";
+      if (m < 10)
+        tempOutputFile << "0";
+      tempOutputFile << m << ":00" << endl;
+    }
+    //if (params.find(MAXRAMSIZE) != params.end())
+    //  tempOutputFile << "#SBATCH --mem=" << params[MAXRAMSIZE] << endl;
+    if (params.find(QUEUE) != params.end())
+      tempOutputFile << "#% vishnu_queue=" << params[QUEUE] << endl;
+
+    // Define environment for the job
+    Environnement env = job.getEnvironnement();
+    for (Environnement::const_iterator iter = env.begin() ; iter != env.end() ; ++iter) {
+      tempOutputFile << "export " << iter->first << "=" << iter->second << endl;
+    }
+
+    // generate nodes file
+    //tempOutputFile << "LIBBATCH_NODEFILE=`mktemp nodefile-XXXXXXXXXX`" << endl;
+    //tempOutputFile << "srun hostname > $LIBBATCH_NODEFILE" << endl;
+    //tempOutputFile << "export LIBBATCH_NODEFILE" << endl;
+
+    // Launch the executable
+    tempOutputFile << "cd " << workDir << endl;
+    tempOutputFile << "./" + fileNameToExecute << endl;
+
+    tempOutputFile.flush();
+    tempOutputFile.close();
+
+    cerr << "Batch script file generated is: " << tmpFileName << endl;
+    return tmpFileName;
+  }
+
+  void BatchManager_eVishnu::deleteJob(const JobId & jobid)
+  {
+    string vishnuJobId;
+    istringstream iss(jobid.getReference());
+    getline(iss, vishnuJobId, ':');
+
+    // define command to delete job
+    string subCommand = string("export OMNIORB_CONFIG=$VISHNU_CONFIG_FILE; ");
+    subCommand += "vishnu_connect -p 2; ";
+    subCommand += "vishnu_cancel_job " + _hostname + " " + vishnuJobId;
+    string command = _protocol.getExecCommand(subCommand, _hostname, _username);
+    cerr << command.c_str() << endl;
+
+    int status = system(command.c_str());
+    if (status)
+      throw EmulationException("Can't delete job " + jobid.getReference());
+
+    cerr << "job " << jobid.getReference() << " killed" << endl;
+  }
+
+  void BatchManager_eVishnu::holdJob(const JobId & jobid)
+  {
+    throw NotYetImplementedException("BatchManager_eVishnu::holdJob");
+  }
+
+  void BatchManager_eVishnu::releaseJob(const JobId & jobid)
+  {
+    throw NotYetImplementedException("BatchManager_eVishnu::releaseJob");
+  }
+
+  void BatchManager_eVishnu::alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param, const Environnement & env)
+  {
+    throw NotYetImplementedException("BatchManager_eVishnu::alterJob");
+  }
+
+  void BatchManager_eVishnu::alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param)
+  {
+    throw NotYetImplementedException("BatchManager_eVishnu::alterJob");
+  }
+
+  void BatchManager_eVishnu::alterJob(const JobId & jobid, const Environnement & env)
+  {
+    throw NotYetImplementedException("BatchManager_eVishnu::alterJob");
+  }
+
+  JobInfo BatchManager_eVishnu::queryJob(const JobId & jobid)
+  {
+    // define name of log file (local)
+    string logFile = generateTemporaryFileName("vishnu-querylog-" + jobid.getReference());
+
+    string vishnuJobId;
+    istringstream iss(jobid.getReference());
+    getline(iss, vishnuJobId, ':');
+
+    // define command to query batch
+    string subCommand = string("export OMNIORB_CONFIG=$VISHNU_CONFIG_FILE; ");
+    subCommand += "vishnu_connect -p 2; ";
+    subCommand += "vishnu_get_job_info " + _hostname + " " + vishnuJobId;
+    string command = _protocol.getExecCommand(subCommand, _hostname, _username);
+    command += " > ";
+    command += logFile;
+    cerr << command.c_str() << endl;
+    int status = system(command.c_str());
+    if (status != 0)
+      throw EmulationException("Can't query job " + jobid.getReference());
+
+    JobInfo_eVishnu jobinfo = JobInfo_eVishnu(jobid.getReference(), logFile);
+    return jobinfo;
+  }
+
+  const JobId BatchManager_eVishnu::addJob(const Job & job, const string reference)
+  {
+    return JobId(this, reference);
+  }
+
+  void BatchManager_eVishnu::importOutputFiles(const Job & job, const std::string directory)
+  {
+    Parametre params = job.getParametre();
+    const Versatile & V = params[OUTFILE];
+    Versatile::const_iterator Vit;
+
+    // Create local result directory
+    char * buf = getcwd(NULL, 0);
+    string cwd = buf;
+    free(buf);
+    string absdir = (Utils::isAbsolutePath(directory))? directory : cwd + "/" + directory;
+    int status = CommunicationProtocol::getInstance(SH).makeDirectory(absdir, "", "");
+    if (status) {
+      string mess("Directory creation failed. Status is :");
+      ostringstream status_str;
+      status_str << status;
+      mess += status_str.str();
+      cerr << mess << endl;
+    }
+
+    for (Vit=V.begin(); Vit!=V.end(); Vit++) {
+      CoupleType cpt  = *static_cast< CoupleType * >(*Vit);
+      Couple outputFile = cpt;
+
+      // Get absolute paths
+      string absremote = (Utils::isAbsolutePath(outputFile.getRemote()))?
+                         outputFile.getRemote() :
+                         params[WORKDIR].str() + "/" + outputFile.getRemote();
+      string abslocal = (Utils::isAbsolutePath(outputFile.getLocal()))?
+                        outputFile.getLocal() :
+                        absdir + "/" + outputFile.getLocal();
+
+      string subCommand = string("export OMNIORB_CONFIG=$VISHNU_CONFIG_FILE; ");
+      subCommand += "vishnu_connect -p 2; ";
+      subCommand += "vishnu_copy_file " + _hostname + ":" + absremote + " " + abslocal;
+      string command = _protocol.getExecCommand(subCommand,
+                                                _hostname,
+                                                _username);
+      cerr << command.c_str() << endl;
+      status = system(command.c_str());
+      if (status != 0)
+        throw EmulationException("Can't copy file");
+    }
+
+    // Copy logs
+    string subCommand = string("export OMNIORB_CONFIG=$VISHNU_CONFIG_FILE; ");
+    subCommand += "vishnu_connect -p 2; ";
+    subCommand += "vishnu_copy_file -r " +_hostname + ":" + params[WORKDIR].str() + "/logs" + " " + absdir;
+    string command = _protocol.getExecCommand(subCommand,
+                                              _hostname,
+                                              _username);
+    cerr << command.c_str() << endl;
+    status = system(command.c_str());
+    if (status != 0)
+      throw EmulationException("Can't copy logs");
+  }
+
+}
diff --git a/src/Vishnu/Batch_BatchManager_eVishnu.hxx b/src/Vishnu/Batch_BatchManager_eVishnu.hxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..ec7106f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,77 @@
+//  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+//  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+//  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+//  This library is free software; you can redistribute it and/or
+//  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+//  License as published by the Free Software Foundation; either
+//  version 2.1 of the License.
+//
+//  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+//  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+//  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+//  Lesser General Public License for more details.
+//
+//  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+//  License along with this library; if not, write to the Free Software
+//  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+//  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+/*
+ *  Batch_BatchManager_eVishnu.hxx :
+ *
+ *  Created on: 24 june 2011
+ *  Author : Renaud BARATE - EDF R&D
+ */
+
+#ifndef _BATCHMANAGER_EVISHNU_H_
+#define _BATCHMANAGER_EVISHNU_H_
+
+#include <string>
+
+#include <Batch_Defines.hxx>
+#include <Batch_JobId.hxx>
+#include <Batch_JobInfo.hxx>
+#include <Batch_FactBatchManager.hxx>
+#include <Batch_BatchManager_eClient.hxx>
+
+namespace Batch {
+
+  class BATCH_EXPORT BatchManager_eVishnu : public BatchManager_eClient
+  {
+  public:
+
+    BatchManager_eVishnu(const FactBatchManager * parent,
+                         const char * host = "localhost",
+                         const char * username = "",
+                         CommunicationProtocolType protocolType = SSH,
+                         const char * mpiImpl = "nompi",
+                         int nb_proc_per_node = 1);
+    virtual ~BatchManager_eVishnu();
+
+    // Methods to control jobs
+    virtual const JobId submitJob(const Job & job);
+    virtual void deleteJob(const JobId & jobid);
+    virtual void holdJob(const JobId & jobid);
+    virtual void releaseJob(const JobId & jobid);
+    virtual void alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param, const Environnement & env);
+    virtual void alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param);
+    virtual void alterJob(const JobId & jobid, const Environnement & env);
+    virtual JobInfo queryJob(const JobId & jobid);
+    virtual const JobId addJob(const Job & job, const std::string reference);
+    virtual void importOutputFiles(const Job & job, const std::string directory);
+
+  protected:
+
+    std::string buildCommandFile(const Job & job);
+    void exportInputFiles(const Job & job);
+
+    int _nb_proc_per_node;
+
+  };
+
+}
+
+#endif
diff --git a/src/Vishnu/Batch_FactBatchManager_eVishnu.cxx b/src/Vishnu/Batch_FactBatchManager_eVishnu.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c0ede38
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,62 @@
+//  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+//  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+//  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+//  This library is free software; you can redistribute it and/or
+//  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+//  License as published by the Free Software Foundation; either
+//  version 2.1 of the License.
+//
+//  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+//  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+//  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+//  Lesser General Public License for more details.
+//
+//  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+//  License along with this library; if not, write to the Free Software
+//  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+//  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+/*
+ *  Batch_FactBatchManager_eVishnu.cxx :
+ *
+ *  Created on: 24 june 2011
+ *  Author : Renaud BARATE - EDF R&D
+ */
+
+#include <Batch_ParameterTypeMap.hxx>
+
+#include "Batch_BatchManager_eVishnu.hxx"
+#include "Batch_FactBatchManager_eVishnu.hxx"
+
+namespace Batch {
+
+  static FactBatchManager_eVishnu sFBM_eVishnu;
+
+  FactBatchManager_eVishnu::FactBatchManager_eVishnu() : FactBatchManager_eClient("eVISHNU")
+  {
+  }
+
+  FactBatchManager_eVishnu::~FactBatchManager_eVishnu()
+  {
+  }
+
+  BatchManager * FactBatchManager_eVishnu::operator() (const char * hostname) const
+  {
+    // MESSAGE("Building new BatchManager_eVishnu on host '" << hostname << "'");
+    return new BatchManager_eVishnu(this, hostname);
+  }
+
+  BatchManager_eClient * FactBatchManager_eVishnu::operator() (const char * hostname,
+                                                               const char * username,
+                                                               CommunicationProtocolType protocolType,
+                                                               const char * mpiImpl,
+                                                               int nb_proc_per_node) const
+  {
+    // MESSAGE("Building new BatchManager_eVishnu on host '" << hostname << "'");
+    return new BatchManager_eVishnu(this, hostname, username, protocolType, mpiImpl, nb_proc_per_node);
+  }
+
+}
diff --git a/src/Vishnu/Batch_FactBatchManager_eVishnu.hxx b/src/Vishnu/Batch_FactBatchManager_eVishnu.hxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..07eee8e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,57 @@
+//  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+//  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+//  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+//  This library is free software; you can redistribute it and/or
+//  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+//  License as published by the Free Software Foundation; either
+//  version 2.1 of the License.
+//
+//  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+//  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+//  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+//  Lesser General Public License for more details.
+//
+//  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+//  License along with this library; if not, write to the Free Software
+//  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+//  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+/*
+ *  Batch_FactBatchManager_eVishnu.hxx :
+ *
+ *  Created on: 24 june 2011
+ *  Author : Renaud BARATE - EDF R&D
+ */
+
+#ifndef _FACTBATCHMANAGER_EVISHNU_H_
+#define _FACTBATCHMANAGER_EVISHNU_H_
+
+#include <Batch_Defines.hxx>
+#include <Batch_Constants.hxx>
+#include <Batch_BatchManager_eClient.hxx>
+#include <Batch_FactBatchManager_eClient.hxx>
+
+namespace Batch {
+
+  class BATCH_EXPORT FactBatchManager_eVishnu : public FactBatchManager_eClient
+  {
+  public:
+
+    FactBatchManager_eVishnu();
+    virtual ~FactBatchManager_eVishnu();
+
+    virtual BatchManager * operator() (const char * hostname) const;
+    virtual BatchManager_eClient * operator() (const char * hostname,
+                                               const char * username,
+                                               CommunicationProtocolType protocolType,
+                                               const char * mpiImpl,
+                                               int nb_proc_per_node = 1) const;
+
+  };
+
+}
+
+#endif
diff --git a/src/Vishnu/Batch_JobInfo_eVishnu.cxx b/src/Vishnu/Batch_JobInfo_eVishnu.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..786103e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,98 @@
+//  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+//  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+//  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+//  This library is free software; you can redistribute it and/or
+//  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+//  License as published by the Free Software Foundation; either
+//  version 2.1 of the License.
+//
+//  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+//  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+//  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+//  Lesser General Public License for more details.
+//
+//  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+//  License along with this library; if not, write to the Free Software
+//  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+//  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+/*
+ *  Batch_JobInfo_eVishnu.cxx :
+ *
+ *  Created on: 24 june 2011
+ *  Author : Renaud BARATE - EDF R&D
+ */
+
+#include <iostream>
+#include <fstream>
+#include <sstream>
+
+#include <Batch_RunTimeException.hxx>
+#include <Batch_Constants.hxx>
+
+#include "Batch_JobInfo_eVishnu.hxx"
+
+using namespace std;
+
+namespace Batch {
+
+  JobInfo_eVishnu::JobInfo_eVishnu(const std::string & id, const std::string & logFile)
+    : JobInfo()
+  {
+    _param[ID] = id;
+
+    // find the status in the log file
+    ifstream log(logFile.c_str());
+    string status;
+    bool statusFound = false;
+    while (!statusFound && !log.eof()) {
+      string line;
+      getline(log, line);
+      size_t pos = line.find(':');
+      if (pos != string::npos) {
+        string begline = line.substr(0, pos);
+        string keyword;
+        // Trim leading and trailing spaces of the string before ':'
+        size_t startpos = begline.find_first_not_of(" \t");
+        size_t endpos = begline.find_last_not_of(" \t");
+        if (startpos != string::npos && endpos != string::npos)
+          keyword = begline.substr(startpos, endpos-startpos+1);
+
+        if (keyword == "Status") {
+          statusFound = true;
+          string endline = line.substr(pos + 1);
+          startpos = endline.find_first_not_of(" \t");
+          endpos = endline.find_last_not_of(" \t");
+          if (startpos != string::npos && endpos != string::npos)
+            status = endline.substr(startpos, endpos-startpos+1);
+        }
+      }
+    }
+    log.close();
+
+    if (status.size() == 0) {
+      // On some batch managers, the job is deleted as soon as it is finished,
+      // so we have to consider that an unknown job is a finished one, even if
+      // it is not always true.
+      _param[STATE] = FINISHED;
+    } else if (status == "QUEUED") {
+      _param[STATE] = QUEUED;
+    } else if (status == "RUNNING") {
+      _param[STATE] = RUNNING;
+    } else if (status == "TERMINATED") {
+      _param[STATE] = FINISHED;
+    } else if (status == "CANCELLED") {
+      _param[STATE] = FAILED;
+    } else {
+      throw RunTimeException("Unknown job state code: \"" + status + "\"");
+    }
+  }
+
+  JobInfo_eVishnu::~JobInfo_eVishnu()
+  {
+  }
+
+}
diff --git a/src/Vishnu/Batch_JobInfo_eVishnu.hxx b/src/Vishnu/Batch_JobInfo_eVishnu.hxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..517e797
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,49 @@
+//  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+//  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+//  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+//  This library is free software; you can redistribute it and/or
+//  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+//  License as published by the Free Software Foundation; either
+//  version 2.1 of the License.
+//
+//  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+//  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+//  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+//  Lesser General Public License for more details.
+//
+//  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+//  License along with this library; if not, write to the Free Software
+//  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+//  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+/*
+ *  Batch_JobInfo_eVishnu.hxx :
+ *
+ *  Created on: 24 june 2011
+ *  Author : Renaud BARATE - EDF R&D
+ */
+
+#ifndef _JOBINFO_EVISHNU_H_
+#define _JOBINFO_EVISHNU_H_
+
+#include <string>
+
+#include <Batch_JobInfo.hxx>
+
+namespace Batch {
+
+  class JobInfo_eVishnu : public JobInfo
+  {
+  public:
+
+    JobInfo_eVishnu(const std::string & id, const std::string & logFile);
+    virtual ~JobInfo_eVishnu();
+
+  };
+
+}
+
+#endif
diff --git a/src/Vishnu/CMakeLists.txt b/src/Vishnu/CMakeLists.txt
new file mode 100644 (file)
index 0000000..02a7b8d
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,32 @@
+#  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+#
+#  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+#  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+#
+#  This library is free software; you can redistribute it and/or
+#  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+#  License as published by the Free Software Foundation; either
+#  version 2.1 of the License.
+#
+#  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+#  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+#  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+#  Lesser General Public License for more details.
+#
+#  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+#  License along with this library; if not, write to the Free Software
+#  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+#
+#  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+#
+
+SET(CLASS_LIST Vishnu/Batch_BatchManager_eVishnu
+               Vishnu/Batch_FactBatchManager_eVishnu
+               Vishnu/Batch_JobInfo_eVishnu
+   )
+
+APPEND_CLASSES_TO_SRC_FILES(${CLASS_LIST})
+
+IF (TEST_ENABLED)
+    add_subdirectory(Test)
+ENDIF (TEST_ENABLED)
diff --git a/src/Vishnu/Test/CMakeLists.txt b/src/Vishnu/Test/CMakeLists.txt
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b7606db
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,44 @@
+#  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+#
+#  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+#  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+#
+#  This library is free software; you can redistribute it and/or
+#  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+#  License as published by the Free Software Foundation; either
+#  version 2.1 of the License.
+#
+#  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+#  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+#  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+#  Lesser General Public License for more details.
+#
+#  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+#  License along with this library; if not, write to the Free Software
+#  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+#
+#  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+#
+
+# Just copy the test scripts to the binary dir
+CONFIGURE_FILE(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/seta.sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/seta.sh COPYONLY)
+CONFIGURE_FILE(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/setb.sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/setb.sh COPYONLY)
+CONFIGURE_FILE(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/test-script.sh ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test-script.sh COPYONLY)
+
+# set the include directories
+include_directories(${CMAKE_SOURCE_DIR}/src/Core)
+include_directories(${CMAKE_SOURCE_DIR}/src/Core/Test)
+include_directories(${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/..)
+include_directories(${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR})
+
+# Build the test programs and add the tests
+add_executable(Test_eVishnu Test_eVishnu.cxx)
+target_link_libraries(Test_eVishnu Batch SimpleParser)
+
+IF (HAS_SSH)
+    ADD_TEST(eVishnu_SSH Test_eVishnu SSH)
+ENDIF (HAS_SSH)
+
+#IF (HAS_RSH)
+#    ADD_TEST(eVishnu_RSH Test_eVishnu RSH)
+#ENDIF (HAS_RSH)
diff --git a/src/Vishnu/Test/Test_eVishnu.cxx b/src/Vishnu/Test/Test_eVishnu.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4c191dc
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,137 @@
+//  Copyright (C) 2007-2011  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+//  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+//  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+//  This library is free software; you can redistribute it and/or
+//  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+//  License as published by the Free Software Foundation; either
+//  version 2.1 of the License.
+//
+//  This library is distributed in the hope that it will be useful,
+//  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+//  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+//  Lesser General Public License for more details.
+//
+//  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+//  License along with this library; if not, write to the Free Software
+//  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+//  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+/*
+ * Test_eVishnu.cxx :
+ *
+ * Author : Renaud BARATE - EDF R&D
+ * Date   : June 2011
+ *
+ */
+
+#include <iostream>
+#include <fstream>
+#include <cstring>
+
+#include <Batch_Constants.hxx>
+#include <Batch_Job.hxx>
+#include <Batch_BatchManagerCatalog.hxx>
+#include <Batch_FactBatchManager.hxx>
+#include <Batch_FactBatchManager_eClient.hxx>
+#include <Batch_BatchManager.hxx>
+#include <Batch_BatchManager_eClient.hxx>
+
+#include <SimpleParser.hxx>
+
+using namespace std;
+using namespace Batch;
+
+int main(int argc, char** argv)
+{
+  cout << "*******************************************************************************************" << endl;
+  cout << "This program tests the batch submission based on Vishnu commands." << endl;
+  cout << "*******************************************************************************************" << endl;
+
+  // eventually remove any previous result
+  remove("result.txt");
+
+  try {
+    // Parse the test configuration file
+    SimpleParser parser;
+    parser.parseTestConfigFile();
+    const string & homedir = parser.getValue("TEST_EVISHNU_HOMEDIR");
+    const string & host = parser.getValue("TEST_EVISHNU_HOST");
+    const string & user = parser.getValue("TEST_EVISHNU_USER");
+    int timeout = parser.getValueAsInt("TEST_EVISHNU_TIMEOUT");
+
+    // Define the job...
+    Job job;
+    // ... and its parameters ...
+    Parametre p;
+    p[EXECUTABLE]    = "./test-script.sh";
+    p[NAME]          = "Test_eVISHNU";
+    p[WORKDIR]       = homedir + "/tmp/Batch";
+    p[INFILE]        = Couple("seta.sh", "seta.sh");
+    p[INFILE]       += Couple("setb.sh", "setb.sh");
+    p[OUTFILE]       = Couple("result.txt", "result.txt");
+    p[NBPROC]        = 1;
+    p[MAXWALLTIME]   = 1;
+    p[MAXRAMSIZE]    = 50;
+    job.setParametre(p);
+    // ... and its environment
+    Environnement e;
+    e["MYENVVAR"] = "MYVALUE";
+    job.setEnvironnement(e);
+    cout << job << endl;
+
+    // Get the catalog
+    BatchManagerCatalog& c = BatchManagerCatalog::getInstance();
+
+    // Create a BatchManager of type ePBS on localhost
+    FactBatchManager_eClient * fbm = (FactBatchManager_eClient *)(c("eVISHNU"));
+    BatchManager_eClient * bm = (*fbm)(host.c_str(), user.c_str(), SH);
+
+    // Submit the job to the BatchManager
+    JobId jobid = bm->submitJob(job);
+    cout << jobid.__repr__() << endl;
+
+    // Wait for the end of the job
+    string state = bm->waitForJobEnd(jobid, timeout);
+
+    if (state == FINISHED) {
+      cout << "Job " << jobid.__repr__() << " is done" << endl;
+      bm->importOutputFiles(job, "resultdir/seconddirname");
+    } else if (state == FAILED) {
+      cerr << "Job " << jobid.__repr__() << " finished in error" << endl;
+      bm->importOutputFiles(job, "resultdir/seconddirname");
+      return 1;
+    } else {
+      cerr << "Timeout while executing job" << endl;
+      return 1;
+    }
+
+  } catch (GenericException e) {
+    cerr << "Error: " << e << endl;
+    return 1;
+  } catch (ParserException e) {
+    cerr << "Parser error: " << e.what() << endl;
+    return 1;
+  }
+
+  // test the result file
+  try {
+    SimpleParser resultParser;
+    resultParser.parse("resultdir/seconddirname/result.txt");
+    cout << "Result:" << endl << resultParser;
+    const string & envvar = resultParser.getValue("MYENVVAR");
+    int result = resultParser.getValueAsInt("c");
+    if (envvar == "MYVALUE" && result == 12) {
+      cout << "OK, Expected result found." << endl;
+      return 0;
+    } else {
+      cerr << "Error, result is not the expected one (MYENVVAR = MYVALUE, c = 12)." << endl;
+      return 1;
+    }
+  } catch (ParserException e) {
+    cerr << "Parser error on result file: " << e.what() << endl;
+    return 1;
+  }
+}
diff --git a/src/Vishnu/Test/seta.sh b/src/Vishnu/Test/seta.sh
new file mode 100644 (file)
index 0000000..42d1e38
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3 @@
+#!/bin/sh
+
+a=4
diff --git a/src/Vishnu/Test/setb.sh b/src/Vishnu/Test/setb.sh
new file mode 100644 (file)
index 0000000..8969060
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3 @@
+#!/bin/sh
+
+b=3
diff --git a/src/Vishnu/Test/test-script.sh b/src/Vishnu/Test/test-script.sh
new file mode 100755 (executable)
index 0000000..1d56247
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,9 @@
+#!/bin/sh
+
+. ./seta.sh
+. ./setb.sh
+
+c=`expr $a "*" $b`
+
+echo "MYENVVAR = $MYENVVAR" > result.txt
+echo "c = $c" >> result.txt