bin/mg-tetra_hpc.bash

   1 #!/bin/bash
   2
   3 #bash script mg-tetra_hpc.bash
   4 #could assume overriding set licence file of user/other new version distene products
   5 #this script is used for only one call of mg-tetra_hpc.bash from salome plugin GHS3DPRLPLUGIN
   6
   7 #$0 have to be ignored: name of script
   8 echo "mg-tetra_hpc.bash initial parameters are:\n  "$@"\n"
   9
  10 #example mg-tetra_hpc_mpi v2.1.11
  11 #mpirun -n 6 mg-tetra_hpc_mpi.exe --gradation 1.05 --max_size 0 --min_size 0 --verbose 3 --in /tmp/GHS3DPRL.mesh --out /tmp/GHS3DPRL_out.mesh
  12
  13
  14 #this is for example, sometimes DISTENE_LICENSE_FILE have to be overriden
  15 #if [ $HOST == "hpcspot" ]
  16 # then
  17 #  export DISTENE_LICENSE_FILE="Use global envvar: DLIM8VAR"
  18 #  export DLIM8VAR="dlim8 1:1:29030@10.27.51.1/002590c96d98::8fbdc02cde090ca0369ad028e839065b97709e3c33e640eb6a3c2c7e40fe3985"
  19 # else
  20 #   export DISTENE_LICENSE_FILE="Use global envvar: DLIM8VAR"
  21 #   export DLIM8VAR="dlim8 1:1:29030@132.166.151.49/84c419b8::87af196ab2a936ab31363624539bff8096fbe1f3c83028c8f6b399b0a904ef85"
  22 #fi
  23
  24
  25 #this is for example, sometimes need to compile stubs/libmeshgems_mpi.so for mg-tetra_hpc.exe, depends of openmpi system or not#CURRENTDIR=`pwd`
  26 CURRENTDIR=`pwd`
  27 COMPILDIR=$MESHGEMSHOME/stubs           #/export/home/prerequisites_SALOME_780/MeshGems-2.1-11/FROM_nothing/stubs
  28 MPI_EXE=`which mg-tetra_hpc_mpi.exe`
  29 TARGETDIR=$MESHGEMSHOME/lib/Linux_64    #/export/home/prerequisites_SALOME_780/MeshGems-2.1-11/FROM_nothing/lib/Linux_64
  30 echo "CURRENTDIR=" $CURRENTDIR
  31 #rm $TARGETDIR/libmeshgems_mpi.so #compile every times
  32 #if [ ! -f $TARGETDIR/libmeshgems_mpi.so ]
  33 #then
  34   echo "Compile libmeshgems_mpi.so with current openmpi:"
  35   echo `which mpicc`
  36   echo "COMPILDIR=" $COMPILDIR
  37   echo "TARGETDIR=" $TARGETDIR
  38   cd $COMPILDIR
  39   mpicc  meshgems_mpi.c -DMESHGEMS_LINUX_BUILD -I../include -shared -fPIC -o $TARGETDIR/libmeshgems_mpi.so
  40   find $MESHGEMSHOME -name "libmeshgems_mpi.so"
  41   cd $CURRENTDIR
  42 #fi
  43
  44 #example version mpi a mano
  45 #cd /export/home/prerequisites_SALOME_780/MeshGems-2.1-11/FROM_nothing/stubs
  46 #mpicc meshgems_mpi.c -DMESHGEMS_LINUX_BUILD -I../include -shared -fPIC -o libmeshgems_mpi.so
  47 #cp -f libmeshgems_mpi.so /export/home/prerequisites_SALOME_780/MeshGems-2.1-11/FROM_nothing/lib/Linux_64/.
  48
  49 echo "mg-tetra_hpc.bash assume licence file set:"
  50 echo DLIM8VAR=$DLIM8VAR
  51 echo DISTENE_LICENSE_FILE=$DISTENE_LICENSE_FILE
  52
  53 #version multithread: why not use plugin/hypothesis mg-tetra.exe instead?
  54 #which mg-tetra_hpc.exe
  55 #echo mg-tetra_hpc.exe --max_number_of_threads $2 --number_of_subdomains $2 --in ... --out /tmp/GHS3DPRL_out.mesh --verbose 3
  56 #for multithread only one /tmp/GHS3DPRL_out.mesh created...
  57 #TODO create one med file from /tmp/GHS3DPRL_out.mesh if utile later
  58
  59
  60 which mg-tetra_hpc_mpi.exe
  61 #echo mpirun -n $2 mg-tetra_hpc_mpi.exe ${@:3:30}
  62 echo mpirun -n $2 mg-tetra_hpc_mpi.exe --in /tmp/GHS3DPRL.mesh --out /tmp/GHS3DPRL_out.mesh
  63 mpirun -n $2 mg-tetra_hpc_mpi.exe --in /tmp/GHS3DPRL.mesh --out /tmp/GHS3DPRL_out.mesh
  64
  65 #typically write files /tmp/GHS3DPRL_out.00000?.mesh  & /tmp/GHS3DPRL_out.00000?.global
  66
  67