]> SALOME platform Git repositories - plugins/ghs3dprlplugin.git/commitdiff
Salome HOME
23308: [EDF] Re-implement DISTENE meshing plugins to use libraries instead of executables
authoreap <eap@opencascade.com>
Tue, 23 Aug 2016 10:37:38 +0000 (13:37 +0300)
committereap <eap@opencascade.com>
Tue, 23 Aug 2016 10:37:38 +0000 (13:37 +0300)
CMakeLists.txt
resources/GHS3DPRLPlugin.xml
src/GHS3DPRLPlugin/CMakeLists.txt
src/GHS3DPRLPlugin/GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL.cxx
src/GHS3DPRLPlugin/MG_TetraHPC_API.cxx [new file with mode: 0644]
src/GHS3DPRLPlugin/MG_TetraHPC_API.hxx [new file with mode: 0644]
src/gui/GHS3DPRLPluginGUI_HypothesisCreator.cxx
src/tepal2med/tetrahpc2med.cxx

index 4f84c1278b99ef68799cf44dd28e8d16d343d755..e921bcfce91ca93247c9cb3d76fdf3223630fd10 100755 (executable)
@@ -67,6 +67,8 @@ SET(BUILD_SHARED_LIBS TRUE)
 # ============
 OPTION(SALOME_BUILD_TESTS "Build SALOME tests" ON)
 OPTION(SALOME_BUILD_DOC "Generate SALOME GHS3DPRLPLUGIN documentation" ON)
+OPTION(SALOME_USE_MG_LIBS "Use MeshGems libraries" ON)
+MARK_AS_ADVANCED(SALOME_USE_MG_LIBS)
 
 IF(SALOME_BUILD_TESTS)
   ENABLE_TESTING()
@@ -164,9 +166,18 @@ IF(EXISTS ${SMESH_ROOT_DIR})
 ELSE(EXISTS ${SMESH_ROOT_DIR})
   MESSAGE(FATAL_ERROR "We absolutely need a Salome SMESH, please define SMESH_ROOT_DIR")
 ENDIF(EXISTS ${SMESH_ROOT_DIR})
+
 # MEDFile
 FIND_PACKAGE(SalomeMEDFile REQUIRED)
 
+# Find MESHGEMS
+# =============
+IF(SALOME_USE_MG_LIBS)
+  FIND_PACKAGE(SalomeMESHGEMS)
+  SALOME_LOG_OPTIONAL_PACKAGE(MESHGEMS SALOME_USE_MG_LIBS)
+  ADD_DEFINITIONS(-DUSE_MG_LIBS)
+ENDIF(SALOME_USE_MG_LIBS)
+
 # Detection summary:
 SALOME_PACKAGE_REPORT_AND_CHECK()
 
@@ -256,11 +267,12 @@ EXPORT(TARGETS ${_${PROJECT_NAME}_exposed_targets}
 
 # Ensure the variables are always defined for the configure:
 SET(SMESH_ROOT_DIR "${SMESH_ROOT_DIR}")
+SET(MESHGEMS_ROOT_DIR "${MESHGEMS_ROOT_DIR}")
  
 SET(CONF_INCLUDE_DIRS "${PROJECT_SOURCE_DIR}/include" "${PROJECT_BINARY_DIR}/include")
 
 # Build variables that will be expanded when configuring Salome<MODULE>Config.cmake:
-# SALOME_CONFIGURE_PREPARE() #For use in the future
+SALOME_CONFIGURE_PREPARE(MESHGEMS)
 
 CONFIGURE_PACKAGE_CONFIG_FILE(${PROJECT_NAME}Config.cmake.in 
     ${PROJECT_BINARY_DIR}/${PROJECT_NAME}Config.cmake
index dd76e94e0cad3e61e29e61193be60c5fd26bc5fc..e45e20afb1a25ad6f0f55867c77dc0f09dba5a95 100755 (executable)
     <algorithm type="MG-Tetra Parallel"
                label-id="MG-Tetra Parallel"
                icon-id="mesh_algo_GHS3DPRL.png"
-               opt-hypos="MG-Tetra Parallel Parameters"
+               hypos="MG-Tetra Parallel Parameters"
                input="TRIA"
                output="TETRA"
+               need-hyp="true"
                dim="3">
       <python-wrap>
         <algo>MG-Tetra Parallel=Tetrahedron(algo=smeshBuilder.MG_Tetra_Parallel)</algo>
index 4f2fe3bced30372d138e1b6009e7b73ff7f8c0d2..a4a5e333ae7413bbf9e7905a561f5057688a8e9a 100644 (file)
@@ -24,6 +24,7 @@ INCLUDE_DIRECTORIES(
   ${GEOM_INCLUDE_DIRS}
   ${CAS_INCLUDE_DIRS}
   ${VTK_INCLUDE_DIRS}
+  ${MESHGEMS_INCLUDE_DIRS}
   ${SMESH_INCLUDE_DIRS}
   ${OMNIORB_INCLUDE_DIR}
   ${Boost_INCLUDE_DIRS}
@@ -46,6 +47,7 @@ SET(_link_LIBRARIES
   ${CAS_TKGeomBase}
   ${CAS_TKGeomAlgo}
   ${CAS_TKCDF}
+  ${MESHGEMS_TETRA_HPC_LIBRARY}
   ${SMESH_SMESHimpl}
   ${SMESH_SMESHEngine}
   ${SMESH_SMESHDS}
@@ -69,6 +71,7 @@ SET(GHS3DPRLEngine_HEADERS
   GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL_i.hxx
   GHS3DPRLPlugin_Hypothesis.hxx
   GHS3DPRLPlugin_Hypothesis_i.hxx
+  MG_TetraHPC_API.hxx
 )
 
 # --- sources ---
@@ -85,6 +88,7 @@ SET(GHS3DPRLEngine_SOURCES
   GHS3DPRLPlugin_Hypothesis_i.hxx
   GHS3DPRLPlugin_Hypothesis_i.cxx
   GHS3DPRLPlugin_i.cxx
+  MG_TetraHPC_API.cxx
 )
 
 # --- scripts ---
index 9b75f7bd2ccf78e81891ecb4c4e53aa9c14cdf36..20d122dce29a11081caaea3d92e5e89b974b3085 100755 (executable)
 //
 #include "GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL.hxx"
 #include "GHS3DPRLPlugin_Hypothesis.hxx"
+#include "MG_TetraHPC_API.hxx"
 
 #include <SMESHDS_Mesh.hxx>
 #include <SMESH_Gen.hxx>
+#include <SMESH_TypeDefs.hxx>
 #include <SMESH_subMesh.hxx>
 
-#include <TopExp_Explorer.hxx>
-#include <OSD_File.hxx>
-
 #include "utilities.h"
 
-#ifndef WIN32
-#include <sys/sysinfo.h>
-#endif
-
-#ifdef _DEBUG_
-#define DUMP(txt) \
-//  cout << txt
-#else
-#define DUMP(txt)
-#endif
-
 #include <list>
 
 #include <BRepGProp.hxx>
 #include <GProp_GProps.hxx>
+#include <OSD_File.hxx>
 #include <Standard_ProgramError.hxx>
 #include <TCollection_AsciiString.hxx>
+#include <TopExp_Explorer.hxx>
 #include <TopTools_MapOfShape.hxx>
 #include <TopoDS.hxx>
 #include <TopoDS_Edge.hxx>
 #include <TopoDS_Face.hxx>
 
+#define GMFVERSION GmfDouble
+#define GMFDIMENSION 3
+
 using namespace std;
 
 static void removeFile( const TCollection_AsciiString& fileName )
@@ -75,6 +68,7 @@ GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL(int hypId, int studyId, SMESH_G
   MESSAGE("GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL");
   _name = "MG-Tetra Parallel";
   _shapeType = (1 << TopAbs_SHELL) | (1 << TopAbs_SOLID);// 1 bit /shape type
+  _onlyUnaryInput = false; // Compute() will be called on a compound of solids
   _countSubMesh=0;
   _nodeRefNumber=0;
   _compatibleHypothesis.push_back(GHS3DPRLPlugin_Hypothesis::GetHypType());
@@ -102,8 +96,8 @@ bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::CheckHypothesis
   int nbHyp = hyps.size();
   if (!nbHyp)
   {
-    aStatus = SMESH_Hypothesis::HYP_OK;
-    return true;  // can work with no hypothesis
+    aStatus = SMESH_Hypothesis::HYP_MISSING;
+    return false;  // can't work with no hypothesis
   }
 
   itl = hyps.begin();
@@ -122,124 +116,6 @@ bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::CheckHypothesis
   return aStatus == SMESH_Hypothesis::HYP_OK;
 }
 
-//=======================================================================
-// static bool writeGHS3DPRLFiles (const TCollection_AsciiString &  GHS3DPRL_In,
-//                                 SMESHDS_Mesh *                   theMesh,
-//                                 map <int,int> &                  theSmdsToGHS3DPRLIdMap,
-//                                 map <int,const SMDS_MeshNode*> & theGHS3DPRLIdToNodeMap)
-// {
-//    bool Ok;
-//    int ifam=0;
-//    TCollection_AsciiString namefile(GHS3DPRL_In);
-//    namefile+=".points";
-//    removeFile(namefile);
-//    ofstream theFile;
-//    theFile.open(namefile.ToCString(),ios::out);
-// #ifdef WIN32
-//    Ok = theFile.is_open();
-// #else
-//    Ok=theFile.rdbuf()->is_open();
-// #endif
-//    if (!Ok)
-//    {
-//       INFOS("Can't write into "<<namefile.ToCString());
-//       return false;
-//    }
-//    cout<<endl<<"writeGHS3DPRLFiles version tetra_hpc v2.1.11 "<<endl;
-//    cout<<endl<<"Creating GHS3DPRL processed mesh file : "<<namefile<<endl;
-
-//    int nbVertices=theMesh->NbNodes();
-//    int nbFaces=theMesh->NbFaces();        //triangles or quadrangles
-//    const char* space="  ";
-//    //const int dummyint=1;                  //nrs,nsd,refnum=1 (for wrap)
-
-//    // Writing SMESH points into GHS3DPRL File.points
-//    theFile<<nbVertices<<endl;
-
-//    int aSmdsNodeID=1;
-//    const SMDS_MeshNode* node_2;
-//    SMDS_NodeIteratorPtr itOnNode=theMesh->nodesIterator();
-//    //int ifam=100;//test famille
-//    theFile.precision(15); theFile.setf(ios::scientific,ios::floatfield);
-//    //cout<<"set precision 15 on float\n";
-//    while (itOnNode->more())
-//    {
-//       node_2 = itOnNode->next();
-//       theSmdsToGHS3DPRLIdMap.insert(map <int,int>::value_type(node_2->GetID(),aSmdsNodeID));
-//       theGHS3DPRLIdToNodeMap.insert(map <int,const SMDS_MeshNode*>::value_type(aSmdsNodeID,node_2));
-//       theFile<<node_2->X()<<space<<node_2->Y()<<space<<node_2->Z()<<space<<ifam<<endl;
-//       aSmdsNodeID++;
-//       //if (aSmdsNodeID==11) ifam++;
-//    }
-//    //no specified points;
-//    theFile.close();
-
-//    namefile=GHS3DPRL_In+".faces";
-//    removeFile(namefile);
-//    theFile.open(namefile.ToCString(),ios::out);
-// #ifdef WIN32
-//    Ok=theFile.is_open();
-// #else
-//    Ok=theFile.rdbuf()->is_open();
-// #endif
-//    if (!Ok)
-//    {
-//       INFOS("Can't write into "<<namefile.ToCString());
-//       return false;
-//    }
-//    cout<<endl<<"Creating GHS3DPRL processed mesh file : "<<namefile<<endl;
-
-//    // Writing SMESH faces into GHS3DPRL File.faces
-//    theFile<<nbFaces<<" 0"<<endl;   //NB_ELEMS DUMMY_INT
-//                                    //" 0" is a reserved parameter
-
-//    const SMDS_MeshElement* aFace;
-//    map<int,int>::const_iterator itOnSmdsNode;
-//    SMDS_ElemIteratorPtr itOnFaceNode;
-//    SMDS_FaceIteratorPtr itOnSmdsFace = theMesh->facesIterator();
-//    long nbNoTriangles=0;
-//    int ifaces=0;
-//    //ifam=300;
-//    while (itOnSmdsFace->more())
-//    {
-//       aFace=itOnSmdsFace->next();
-//       itOnFaceNode=aFace->nodesIterator();
-//       const int nbNodes=aFace->NbNodes();
-//       if (nbNodes!=3) nbNoTriangles++;
-//       ifaces++;
-//       theFile<<nbNodes<<space;        // NB_NODES
-//       while (itOnFaceNode->more())
-//       {
-//           aSmdsNodeID=itOnFaceNode->next()->GetID();
-//           itOnSmdsNode=theSmdsToGHS3DPRLIdMap.find(aSmdsNodeID);
-//           ASSERT(itOnSmdsNode!=theSmdsToGHS3DPRLIdMap.end());
-//           theFile<<space<<(*itOnSmdsNode).second; //NODE_1 NODE_2 ...
-//       }
-//       //(NB_NODES+1) times: DUMMY_INT
-//       //if (ifaces==11) ifam++;
-//       theFile<<space<<ifam;
-//       for ( int i=1; i<=nbNodes; i++) theFile<<space<<200+i;
-//       theFile<<endl;
-//    }
-//    theFile.close();
-
-//    cout<<"Processed mesh files created, they contains :\n";
-//    cout<<"    "<<nbVertices<<" vertices\n";
-//    if (nbNoTriangles==0)
-//       cout<<"    "<<nbFaces<<" faces\n\n";
-//    else
-//       cout<<"    "<<nbFaces<<" faces with "<<nbNoTriangles<<"faces no triangles\n\n";
-//    return true;
-// }
-
-
-//=======================================================================
-
-#define GHS3DPRLPlugin_BUFLENGTH 256
-#define GHS3DPRLPlugin_ReadLine(aPtr,aBuf,aFile,aLineNb) \
-{  aPtr = fgets( aBuf, GHS3DPRLPlugin_BUFLENGTH - 2, aFile ); aLineNb++; DUMP(endl); }
-
-
 //=============================================================================
 // Pass parameters to GHS3DPRL
 void GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::SetParameters(const GHS3DPRLPlugin_Hypothesis* hyp)
@@ -286,28 +162,55 @@ static TCollection_AsciiString getTmpDir()
   return aTmpDir;
 }
 
+//=============================================================================
+// Write a skin mesh into a GMF file or pass it to MG-TetraHPC API
+static void exportGMF(MG_TetraHPC_API*    theTetraInput,
+                      const char*         theFile,
+                      const SMESHDS_Mesh* theMeshDS)
+{
+  int meshID = theTetraInput->GmfOpenMesh( theFile, GmfWrite, GMFVERSION, GMFDIMENSION);
+  
+  // nodes
+  int iN = 0, nbNodes = theMeshDS->NbNodes();
+  theTetraInput->GmfSetKwd( meshID, GmfVertices, nbNodes );
+  std::map< const SMDS_MeshNode*, int, TIDCompare > node2IdMap;
+  SMDS_NodeIteratorPtr nodeIt = theMeshDS->nodesIterator();
+  SMESH_TNodeXYZ n;
+  while ( nodeIt->more() )
+  {
+    n.Set( nodeIt->next() );
+    theTetraInput->GmfSetLin( meshID, GmfVertices, n.X(), n.Y(), n.Z(), n._node->getshapeId() );
+    node2IdMap.insert( node2IdMap.end(), std::make_pair( n._node, ++iN ));
+  }
+
+  // triangles
+  SMDS_ElemIteratorPtr elemIt = theMeshDS->elementGeomIterator( SMDSGeom_TRIANGLE );
+  if ( elemIt->more() )
+  {
+    int nbTria = theMeshDS->GetMeshInfo().NbElements( SMDSGeom_TRIANGLE );
+    theTetraInput->GmfSetKwd(meshID, GmfTriangles, nbTria );
+    for ( int gmfID = 1; elemIt->more(); ++gmfID )
+    {
+      const SMDS_MeshElement* tria = elemIt->next();
+      theTetraInput->GmfSetLin(meshID, GmfTriangles, 
+                              node2IdMap[ tria->GetNode( 0 )],
+                              node2IdMap[ tria->GetNode( 1 )],
+                              node2IdMap[ tria->GetNode( 2 )],
+                              tria->getshapeId() );
+    }
+  }
+  theTetraInput->GmfCloseMesh( meshID );
+}
+
 //=============================================================================
 // Here we are going to use the GHS3DPRL mesher for tetra-hpc (formerly tepal in v3 (2014))
-bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::Compute(SMESH_Mesh&        theMesh,
+bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::Compute(SMESH_Mesh&         theMesh,
                                       const TopoDS_Shape& theShape)
 {
   bool Ok=false;
   TCollection_AsciiString pluginerror("ghs3dprl: ");
   SMESHDS_Mesh* meshDS = theMesh.GetMeshDS();
-  //cout<<"GetMeshDS done\n";
-  if (_countSubMesh==0){
-    MESSAGE("GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::Compute for tetra-hpc");
-    _countTotal=0;
-    TopExp_Explorer expf(meshDS->ShapeToMesh(), TopAbs_SOLID);
-    for ( ; expf.More(); expf.Next() ) _countTotal++;
-  }
-  _countSubMesh++;
-  //cout<<"Compute _countSubMesh "<<_countSubMesh<<endl;
-  //no stuff if multiples submesh, multiple call compute
-  //mesh all in one pass tepal (the last)
-  if (_countSubMesh != _countTotal ) return true;
 
-  //stuff on last call
   if (_hypothesis==NULL){
     pluginerror += "No existing parameters/hypothesis for GHS3DPRL";
     cout <<"\n"<<pluginerror<<"\n\n";
@@ -326,12 +229,13 @@ bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::Compute(SMESH_Mesh&        theMesh,
   cout << "   multithread = " << _Multithread << "\n\n";
   cout << "   adv. options = '" << _AdvOptions << "'\n\n";
 
-  //string tmpDir=getTmpDir_new();
   TCollection_AsciiString
     tmpDir=getTmpDir(),
     GHS3DPRL_In,
     GHS3DPRL_Out,
+    GHS3DPRL_Out_Mesh,
     GHS3DPRL_Outxml,
+    logFileName,
     run_GHS3DPRL("tetrahpc2med "),
     rm("rm -f "),
     run_nokeep_files,
@@ -357,14 +261,14 @@ bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::Compute(SMESH_Mesh&        theMesh,
     casenamemed=casenamemed.SubString(1,20);
     cerr<<"MEDName truncated (no more 20 characters) = "<<casenamemed<<endl;
   }
-  //cout<<"path="<<path<<endl;
-  //cout<<"casenamemed="<<casenamemed<<endl;
 
   map <int,int> aSmdsToGHS3DPRLIdMap;
   map <int,const SMDS_MeshNode*> aGHS3DPRLIdToNodeMap;
   GHS3DPRL_In = path + "GHS3DPRL";
   GHS3DPRL_Out = path + casenamemed;
+  GHS3DPRL_Out_Mesh = path + casenamemed + "_out.mesh";
   GHS3DPRL_Outxml = path + casenamemed + ".xml"; //master file
+  logFileName = path + casenamemed + ".log"; // MG library output
   NbPart=_NbPart;
   Gradation=_Gradation;
   MinSize=_MinSize;
@@ -391,31 +295,57 @@ bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::Compute(SMESH_Mesh&        theMesh,
   system( run_nokeep_files.ToCString() ); //clean files
   run_nokeep_files = rm + GHS3DPRL_In + "* ";
 
-  cout<<"GHS3DPRL command :\n  "<<run_GHS3DPRL.ToCString()<<endl;
   fileskinmesh=path + "GHS3DPRL.mesh";
-  cout<<"  Write input file for tetra_hpc.exe "<<fileskinmesh<<"...";
   GHS3DPRL_Out = path + casenamemed;
   removeFile( GHS3DPRL_Outxml ); //only the master xml file
-  //Ok=writeGHS3DPRLFiles(GHS3DPRL_In, meshDS, aSmdsToGHS3DPRLIdMap, aGHS3DPRLIdToNodeMap);
-  bool toCreateGroups = false;
-  theMesh.ExportGMF(fileskinmesh.ToCString(), meshDS, toCreateGroups );
-  cout<<" ...done\n";
-  //else {
-  //   cout<<" ...NOT done\n";
-  //   pluginerror = pluginerror + "problem writing input tepal files " + GHS3DPRL_In + ".mesh";
-
-  //Ecriture dans un fichier MED ?v2.? meme si not Ok
-  //create empty file -> avoid warning message
-  //med_idt fid=MEDouvrir((const char *)fileskinmed.ToCString(),MED_CREATION);
-  //med_err ret=MEDfermer(fid);
-  //fileskinmed=fileskinmed + "cp /home/wambeke/empty.med "+ path + "GHS3DPRL_skin.med";
-  //system( fileskinmed.ToCString() );
+
+  MG_TetraHPC_API mgTetraHPC( _computeCanceled, _progress );
+  bool useLib = ( mgTetraHPC.IsLibrary() && !_Background && _Multithread );
+  if ( !useLib )
+    mgTetraHPC.SetUseExecutable();
+
+  exportGMF( &mgTetraHPC, fileskinmesh.ToCString(), meshDS );
+
+  if ( useLib )
+  {
+    TCollection_AsciiString cmd = TCollection_AsciiString("mg-tetra_hpc.exe") + 
+      " --number_of_subdomains=" + NbPart +
+      " --gradation=" + Gradation +
+      " --min_size=" + MinSize +
+      " --max_size=" + MaxSize +
+      " --verbose=3" +
+      " --out=" + GHS3DPRL_Out_Mesh +
+      " " + _AdvOptions.c_str();
+
+    cout << endl
+         << "  Run mg-tetra_hpc as library. Creating a mesh file " << GHS3DPRL_Out_Mesh << endl
+         << "  Creating a log file : " << logFileName << endl << endl;
+    mgTetraHPC.SetLogFile( logFileName.ToCString() );
+
+    mgTetraHPC.Compute( cmd.ToCString() );
+
+    std::string log = mgTetraHPC.GetLog();
+    if ( log.find(" Dlim "   ) != std::string::npos ||
+         log.find(" license ") != std::string::npos )
+      return error("License problem");
+
+    // set --launchtetra=no
+    int yesPos = run_GHS3DPRL.Search("launchtetra") + sizeof("launchtetra");
+    run_GHS3DPRL.SetValue( yesPos+0, 'n' );
+    run_GHS3DPRL.SetValue( yesPos+1, 'o' );
+    run_GHS3DPRL.SetValue( yesPos+2, ' ' );
+  }
+  else
+  {
+    cout<<"  Write input file for mg-tetra_hpc "<<fileskinmesh<<"...";
+    cout<<" ...done\n";
+  }
   fileskinmed=path + "GHS3DPRL_skin.med";
   cout<<"  Write file "<<fileskinmed<<"...";
   theMesh.ExportMED(fileskinmed.ToCString(),"SKIN_INITIAL",true,1);
   cout<<" ...done\n\n";
 
-
+  cout<<"GHS3DPRL command :\n  "<<run_GHS3DPRL.ToCString()<<endl;
   //sometimes it is better to wait flushing files on slow filesystem...
   system( "sleep 3" );
   //launch tetrahpc2med which launch mg-tetra_hpc.py which launch mg-tetra_hpc(_mpi?).exe
@@ -433,8 +363,6 @@ bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::Compute(SMESH_Mesh&        theMesh,
   // read a result, GHS3DPRL_Out is the name of master file (previous xml format)
   FILE * aResultFile = fopen( GHS3DPRL_Outxml.ToCString(), "r" );
   if (aResultFile){
-    //Ok = readResult( aResultFile, meshDS, theShape, aGHS3DPRLIdToNodeMap, GHS3DPRL_Out, _nodeRefNumber );
-    Ok = true;
     Ok = false; //but it is not a problem but if true my message is overwritten
     fclose(aResultFile);
     cout<<"GHS3DPRL OK output master file "<<casenamemed<<".xml exist !\n\n";
@@ -454,8 +382,6 @@ bool GHS3DPRLPlugin_GHS3DPRL::Compute(SMESH_Mesh&        theMesh,
     system( run_list_files.ToCString() );
     cout<<endl;
   }
-  _countSubMesh=0;
-
 
   return Ok;
 }
diff --git a/src/GHS3DPRLPlugin/MG_TetraHPC_API.cxx b/src/GHS3DPRLPlugin/MG_TetraHPC_API.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6bd90d5
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1181 @@
+// Copyright (C) 2004-2016  CEA/DEN, EDF R&D
+//
+// This library is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// This library is distributed in the hope that it will be useful,
+// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+// Lesser General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License along with this library; if not, write to the Free Software
+// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+
+#include "MG_TetraHPC_API.hxx"
+
+#include <SMESH_Comment.hxx>
+#include <SMESH_File.hxx>
+#include <Utils_SALOME_Exception.hxx>
+
+#include <vector>
+#include <iterator>
+#include <cstring>
+
+#ifdef USE_MG_LIBS
+
+extern "C"{
+#include <meshgems/meshgems.h>
+#include <meshgems/tetra_hpc.h>
+}
+
+struct MG_TetraHPC_API::LibData
+{
+  // MG objects
+  context_t *           _context;
+  tetra_hpc_session_t * _session;
+  mesh_t *              _tria_mesh;
+  sizemap_t *           _sizemap;
+  mesh_t *              _tetra_mesh;
+
+  // data to pass to MG
+  std::vector<double> _xyz;
+  std::vector<double> _nodeSize; // required nodes
+  std::vector<int>    _edgeNodes;
+  int                 _nbRequiredEdges;
+  std::vector<int>    _triaNodes;
+  int                 _nbRequiredTria;
+
+  int                 _count;
+  volatile bool&      _cancelled_flag;
+  std::string         _errorStr;
+  double&             _progress;
+
+  LibData( volatile bool & cancelled_flag, double& progress )
+    : _context(0), _session(0), _tria_mesh(0), _sizemap(0), _tetra_mesh(0),
+      _nbRequiredEdges(0), _nbRequiredTria(0),
+      _cancelled_flag( cancelled_flag ), _progress( progress )
+  {
+  }
+  // methods setting callbacks implemented after callback definitions
+  void Init();
+  bool Compute( const std::string& outFile );
+
+  ~LibData()
+  {
+    if ( _tetra_mesh )
+      tetra_hpc_regain_mesh( _session, _tetra_mesh );
+    if ( _session )
+      tetra_hpc_session_delete( _session );
+    if ( _tria_mesh )
+      mesh_delete( _tria_mesh );
+    if ( _sizemap )
+      sizemap_delete( _sizemap );
+    if ( _context )
+      context_delete( _context );
+
+    _tetra_mesh = 0;
+    _session = 0;
+    _tria_mesh = 0;
+    _sizemap = 0;
+    _context = 0;
+  }
+
+  void AddError( const char *txt )
+  {
+    if ( txt )
+      _errorStr += txt;
+  }
+
+  const std::string& GetErrors()
+  {
+    return _errorStr;
+  }
+
+  void MG_Error(const char* txt="")
+  {
+    SMESH_Comment msg("\nMeshGems error. ");
+    msg << txt << "\n";
+    AddError( msg.c_str() );
+  }
+
+  bool SetParam( const std::string& param, const std::string& value )
+  {
+    status_t ret = tetra_hpc_set_param( _session, param.c_str(), value.c_str() );
+#ifdef _DEBUG_
+    //std::cout << param << " = " << value << std::endl;
+#endif
+    return ( ret == STATUS_OK );
+  }
+
+  bool Cancelled()
+  {
+    return _cancelled_flag;
+  }
+
+  int ReadNbSubDomains()
+  {
+    integer nb = 0;
+    status_t ret = mesh_get_subdomain_count( _tetra_mesh, & nb );
+
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("mesh_get_subdomain_count problem");
+    return nb;
+  }
+
+  int ReadNbNodes()
+  {
+    integer nb = 0;
+    status_t ret = mesh_get_vertex_count( _tetra_mesh, & nb );
+
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("mesh_get_vertex_count problem");
+    return nb;
+  }
+
+  int ReadNbEdges()
+  {
+    integer nb = 0;
+    status_t ret = mesh_get_edge_count( _tetra_mesh, & nb );
+
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("mesh_get_edge_count problem");
+    return nb;
+  }
+
+  int ReadNbTria()
+  {
+    integer nb = 0;
+    status_t ret = mesh_get_triangle_count( _tetra_mesh, & nb );
+
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("mesh_get_triangle_count problem");
+    return nb;
+  }
+
+  int ReadNbQuads()
+  {
+    integer nb = 0;
+    status_t ret = mesh_get_quadrangle_count( _tetra_mesh, & nb );
+
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("mesh_get_quadrangle_count problem");
+    return nb;
+  }
+
+  int ReadNbTetra()
+  {
+    integer nb = 0;
+    status_t ret = mesh_get_tetrahedron_count( _tetra_mesh, & nb );
+
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("mesh_get_tetrahedron_count problem");
+    return nb;
+  }
+
+  int ReadNbHexa()
+  {
+    integer nb = 0;
+    status_t ret = mesh_get_hexahedron_count( _tetra_mesh, & nb );
+
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("mesh_get_hexahedron_count problem");
+    return nb;
+  }
+
+  void ResetCounter()
+  {
+    _count = 1;
+  }
+
+  void ReadSubDomain( int* nbNodes, int* faceInd, int* ori, int* domain )
+  {
+    integer tag, seed_type, seed_idx, seed_orientation;
+    status_t ret = mesh_get_subdomain_description( _tetra_mesh, _count,
+                                                   &tag, &seed_type, &seed_idx, &seed_orientation);
+
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error( "unable to get a sub-domain description");
+
+    *nbNodes = 3;
+    *faceInd = seed_idx;
+    *domain  = tag;
+    *ori     = seed_orientation;
+
+    ++_count;
+  }
+  void ReadNodeXYZ( double* x, double* y, double *z, int* /*domain*/  )
+  {
+    real coo[3];
+    status_t ret = mesh_get_vertex_coordinates( _tetra_mesh, _count, coo );
+    if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error( "unable to get resulting vertices" );
+
+    *x = coo[0];
+    *y = coo[1];
+    *z = coo[2];
+
+    ++_count;
+  }
+
+  void ReadEdgeNodes( int* node1, int* node2, int* domain )
+  {
+    integer vtx[2], tag;
+    status_t ret = mesh_get_edge_vertices( _tetra_mesh, _count, vtx);
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting edge" );
+
+    *node1 = vtx[0];
+    *node2 = vtx[1];
+
+    ret = mesh_get_edge_tag( _tetra_mesh, _count, &tag );
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting edge tag" );
+
+    *domain = tag;
+
+    ++_count;
+  }
+
+  void ReadTriaNodes( int* node1, int* node2, int* node3, int* domain )
+  {
+    integer vtx[3], tag;
+    status_t ret = mesh_get_triangle_vertices( _tetra_mesh, _count, vtx);
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting triangle" );
+
+    *node1 = vtx[0];
+    *node2 = vtx[1];
+    *node3 = vtx[2];
+
+    ret = mesh_get_triangle_tag( _tetra_mesh, _count, &tag );
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting triangle tag" );
+
+    *domain = tag;
+
+    ++_count;
+  }
+
+  void ReadQuadNodes( int* node1, int* node2, int* node3, int* node4, int* domain )
+  {
+    integer vtx[4], tag;
+    status_t ret = mesh_get_quadrangle_vertices( _tetra_mesh, _count, vtx);
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting quadrangle" );
+
+    *node1 = vtx[0];
+    *node2 = vtx[1];
+    *node3 = vtx[2];
+    *node4 = vtx[3];
+
+    ret = mesh_get_quadrangle_tag( _tetra_mesh, _count, &tag );
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting quadrangle tag" );
+
+    *domain = tag;
+
+    ++_count;
+  }
+
+  void ReadTetraNodes( int* node1, int* node2, int* node3, int* node4, int* domain )
+  {
+    integer vtx[4], tag;
+    status_t ret = mesh_get_tetrahedron_vertices( _tetra_mesh, _count, vtx);
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting tetrahedron" );
+
+    *node1 = vtx[0];
+    *node2 = vtx[1];
+    *node3 = vtx[2];
+    *node4 = vtx[3];
+
+    ret = mesh_get_tetrahedron_tag( _tetra_mesh, _count, &tag );
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting tetrahedron tag" );
+
+    *domain = tag;
+
+    ++_count;
+  }
+
+  void ReadHexaNodes( int* node1, int* node2, int* node3, int* node4,
+                     int* node5, int* node6, int* node7, int* node8, int* domain )
+  {
+    integer vtx[8], tag;
+    status_t ret = mesh_get_hexahedron_vertices( _tetra_mesh, _count, vtx);
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting hexahedron" );
+
+    *node1 = vtx[0];
+    *node2 = vtx[1];
+    *node3 = vtx[2];
+    *node4 = vtx[3];
+    *node5 = vtx[4];
+    *node6 = vtx[5];
+    *node7 = vtx[6];
+    *node8 = vtx[7];
+
+    ret = mesh_get_hexahedron_tag( _tetra_mesh, _count, &tag );
+    if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting hexahedron tag" );
+
+    *domain = tag;
+
+    ++_count;
+  }
+
+  void SetNbVertices( int nb )
+  {
+    _xyz.reserve( _xyz.capacity() + nb );
+  }
+
+  void SetNbEdges( int nb )
+  {
+    _edgeNodes.reserve( nb * 2 );
+  }
+
+  void SetNbTria( int nb )
+  {
+    _triaNodes.reserve( nb * 3 );
+  }
+
+  void SetNbReqVertices( int nb )
+  {
+    _nodeSize.reserve( nb );
+  }
+
+  void SetNbReqEdges( int nb )
+  {
+    _nbRequiredEdges = nb;
+  }
+
+  void SetNbReqTria( int nb )
+  {
+    _nbRequiredTria = nb;
+  }
+
+  void AddNode( double x, double y, double z, int domain )
+  {
+    _xyz.push_back( x );
+    _xyz.push_back( y );
+    _xyz.push_back( z );
+  }
+
+  void AddSizeAtNode( double size )
+  {
+    _nodeSize.push_back( size );
+  }
+  
+  void AddEdgeNodes( int node1, int node2, int domain )
+  {
+    _edgeNodes.push_back( node1 );
+    _edgeNodes.push_back( node2 );
+  }
+  
+  void AddTriaNodes( int node1, int node2, int node3, int domain )
+  {
+    _triaNodes.push_back( node1 );
+    _triaNodes.push_back( node2 );
+    _triaNodes.push_back( node3 );
+  }
+
+  int NbNodes()
+  {
+    return _xyz.size() / 3;
+  }
+
+  double* NodeCoord( int iNode )
+  {
+    return & _xyz[ iNode * 3 ];
+  }
+
+  int NbEdges()
+  {
+    return _edgeNodes.size() / 2;
+  }
+
+  int* GetEdgeNodes( int iEdge )
+  {
+    return & _edgeNodes[ iEdge * 2 ];
+  }
+
+  int NbTriangles()
+  {
+    return _triaNodes.size() / 3;
+  }
+
+  int * GetTriaNodes( int iTria )
+  {
+    return & _triaNodes[ iTria * 3 ];
+  }
+
+  int IsVertexRequired( int iNode )
+  {
+    return ! ( iNode < int( _xyz.size() - _nodeSize.size() ));
+  }
+
+  double GetSizeAtVertex( int iNode )
+  {
+    return IsVertexRequired( iNode ) ? _nodeSize[ iNode - _xyz.size() + _nodeSize.size() ] : 0.;
+  }
+};
+
+namespace // functions called by MG library to exchange with the application
+{
+  status_t get_vertex_count(integer * nbvtx, void *user_data)
+  {
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    *nbvtx = data->NbNodes();
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+
+  status_t get_vertex_coordinates(integer ivtx, real * xyz, void *user_data)
+  {
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    double* coord = data->NodeCoord( ivtx-1 );
+    for (int j = 0; j < 3; j++)
+      xyz[j] = coord[j];
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+  status_t get_edge_count(integer * nbedge, void *user_data)
+  {
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    *nbedge = data->NbEdges();
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+
+  status_t get_edge_vertices(integer iedge, integer * vedge, void *user_data)
+  {
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    int* nodes = data->GetEdgeNodes( iedge-1 );
+    vedge[0] = nodes[0];
+    vedge[1] = nodes[1];
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+
+  status_t get_triangle_count(integer * nbtri, void *user_data)
+  {
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    *nbtri = data->NbTriangles();
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+
+  status_t get_triangle_vertices(integer itri, integer * vtri, void *user_data)
+  {
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    int* nodes = data->GetTriaNodes( itri-1 );
+    vtri[0] = nodes[0];
+    vtri[1] = nodes[1];
+    vtri[2] = nodes[2];
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+
+  // status_t get_triangle_extra_vertices(integer itri, integer * typetri,
+  //                                      integer * evtri, void *user_data)
+  // {
+  //   int j;
+  //   MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+
+  //   if (1) {
+  //     /* We want to describe a linear "3 nodes" triangle */
+  //     *typetri = MESHGEMS_MESH_ELEMENT_TYPE_TRIA3;
+  //   } else {
+  //     /* We want to describe a quadratic "6 nodes" triangle */
+  //     *typetri = MESHGEMS_MESH_ELEMENT_TYPE_TRIA6;
+  //     for (j = 0; j < 3; j++)
+  //       evtri[j] = 0;             /* the j'th quadratic vertex index of the itri'th triangle */
+  //   }
+
+  //   return STATUS_OK;
+  // }
+
+  // status_t get_tetrahedron_count(integer * nbtetra, void *user_data)
+  // {
+  //   MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+
+  //   *nbtetra = 0;                 /* the number of tetra in your input mesh (0 if you describe a surface mesh) */
+
+  //   return STATUS_OK;
+  // }
+
+  // status_t get_tetrahedron_vertices(integer itetra, integer * vtetra,
+  //                                   void *user_data)
+  // {
+  //   int j;
+  //   MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+
+  //   for (j = 0; j < 4; j++)
+  //     vtetra[j] = 0;              /* the j'th vertex index of the itetra'th tetrahedron */
+
+  //   return STATUS_OK;
+  // }
+
+  status_t get_vertex_required_property(integer ivtx, integer * rvtx, void *user_data)
+  {
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    *rvtx = data->IsVertexRequired( ivtx - 1 );
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+
+  // status_t get_vertex_weight(integer ivtx, real * wvtx, void *user_data)
+  // {
+  //   MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+  //   *wvtx = data->GetSizeAtVertex( ivtx - 1 );
+
+  //   return STATUS_OK;
+  // }
+
+  status_t my_message_cb(message_t * msg, void *user_data)
+  {
+    char *desc;
+    message_get_description(msg, &desc);
+
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    data->AddError( desc );
+
+#ifdef _DEBUG_
+    //std::cout << desc << std::endl;
+#endif
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+
+  status_t my_interrupt_callback(integer *interrupt_status, void *user_data)
+  {
+    MG_TetraHPC_API::LibData* data = (MG_TetraHPC_API::LibData *) user_data;
+    *interrupt_status = ( data->Cancelled() ? INTERRUPT_STOP : INTERRUPT_CONTINUE );
+
+    //std::cout << "INTERRUPT_STOP" << std::endl;
+
+
+    return STATUS_OK;
+  }
+
+} // end namespace
+
+
+void MG_TetraHPC_API::LibData::Init()
+{
+  status_t ret;
+
+  // Create the meshgems working context
+  _context = context_new();
+  if ( !_context ) MG_Error( "unable to create a new context" );
+
+  // Set the message callback for the _context.
+  ret = context_set_message_callback( _context, my_message_cb, this );
+  if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("in context_set_message_callback");
+
+  // Create the structure holding the callbacks giving access to triangle mesh
+  _tria_mesh = mesh_new( _context );
+  if ( !_tria_mesh ) MG_Error("unable to create a new mesh");
+
+  // Set callbacks to provide triangle mesh data
+  mesh_set_get_vertex_count( _tria_mesh, get_vertex_count, this );
+  mesh_set_get_vertex_coordinates( _tria_mesh, get_vertex_coordinates, this );
+  mesh_set_get_vertex_required_property( _tria_mesh, get_vertex_required_property, this );
+  mesh_set_get_edge_count( _tria_mesh, get_edge_count, this);
+  mesh_set_get_edge_vertices( _tria_mesh, get_edge_vertices, this );
+  mesh_set_get_triangle_count( _tria_mesh, get_triangle_count, this );
+  mesh_set_get_triangle_vertices( _tria_mesh, get_triangle_vertices, this );
+
+  // Create a tetra session
+  _session = tetra_hpc_session_new( _context );
+  if ( !_session ) MG_Error( "unable to create a new tetra_hpc session");
+
+  ret = tetra_hpc_set_interrupt_callback( _session, my_interrupt_callback, this );
+  if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error("in tetra_set_interrupt_callback");
+
+}
+
+bool MG_TetraHPC_API::LibData::Compute( const std::string& outFile )
+{
+  // Set surface mesh
+  status_t ret = tetra_hpc_set_input_mesh( _session, _tria_mesh );
+  if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error( "unable to set surface mesh");
+
+  // // Set a sizemap
+  // if ( !_nodeSize.empty() )
+  // {
+  //   _sizemap = meshgems_sizemap_new( _tria_mesh, meshgems_sizemap_type_iso_mesh_vertex,
+  //                                    (void*) &get_vertex_weight, this );
+  //   if ( !_sizemap ) MG_Error("unable to create a new sizemap");
+
+  //   ret = tetra_hpc_set_sizemap( _session, _sizemap );
+  //   if ( ret != STATUS_OK ) MG_Error( "unable to set sizemap");
+  // }
+
+  //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+  // const char* file  =  "/tmp/ghs3d_IN.mesh";
+  // mesh_write_mesh( _tria_mesh,file);
+  // std::cout << std::endl << std::endl << "Write " << file << std::endl << std::endl << std::endl;
+
+  ret = tetra_hpc_mesh( _session );
+  if ( ret != STATUS_OK ) return false;
+
+  ret = tetra_hpc_get_mesh( _session, &_tetra_mesh);
+  if (ret != STATUS_OK) MG_Error( "unable to get resulting mesh");
+
+  mesh_write_mesh( _tetra_mesh, outFile.c_str() );
+
+  return true;
+}
+
+
+#endif // ifdef USE_MG_LIBS
+
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Constructor
+ */
+//================================================================================
+
+MG_TetraHPC_API::MG_TetraHPC_API(volatile bool& cancelled_flag, double& progress)
+{
+#ifdef USE_MG_LIBS
+  _useLib = true;
+  _libData = new LibData( cancelled_flag, progress );
+  _libData->Init();
+#endif
+  if ( getenv("MG_TetraHPC_USE_EXE"))
+    _useLib = false;
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Destructor
+ */
+//================================================================================
+
+MG_TetraHPC_API::~MG_TetraHPC_API()
+{
+#ifdef USE_MG_LIBS
+  delete _libData;
+  _libData = 0;
+#endif
+  std::set<int>::iterator id = _openFiles.begin();
+  for ( ; id != _openFiles.end(); ++id )
+    ::GmfCloseMesh( *id );
+  _openFiles.clear();
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return the way of MG usage
+ */
+//================================================================================
+
+bool MG_TetraHPC_API::IsLibrary()
+{
+  return _useLib;
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Switch to usage of MG-Tetra executable
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::SetUseExecutable()
+{
+  _useLib = false;
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Compute the tetra mesh
+ *  \param [in] cmdLine - a command to run mg_tetra.exe
+ *  \return bool - Ok or not
+ */
+//================================================================================
+
+bool MG_TetraHPC_API::Compute( const std::string& cmdLine )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+
+    // split cmdLine
+    std::istringstream strm( cmdLine );
+    std::istream_iterator<std::string> sIt( strm ), sEnd;
+    std::vector< std::string > args( sIt, sEnd );
+
+    std::string outFile;
+
+    // set parameters
+    std::string arg, param, value;
+    for ( size_t i = 1; i < args.size(); ++i )
+    {
+      // look for a param name; it starts from "-"
+      arg = args[i];
+      if ( arg.size() < 2 || arg[0] != '-')
+        continue;
+      while ( arg[0] == '-')
+        arg = arg.substr( 1 );
+
+      size_t eqPos = arg.find('=');
+      if ( eqPos != std::string::npos )
+      {
+        param = arg.substr( 0, eqPos );
+        value = arg.substr( eqPos+1 );
+      }
+      else
+      {
+        param = arg;
+        value = "";
+      }
+      if ( param == "out" )
+      {
+        outFile = value;
+        continue;
+      }
+      while ( i+1 < args.size() && args[i+1][0] != '-' )
+      {
+        if ( !value.empty() ) value += " ";
+        value += args[++i];
+      }
+      if ( !_libData->SetParam( param, value ))
+        std::cout << "Warning: wrong param: '" << param <<"' = '" << value << "'" << std::endl;
+    }
+
+    // compute
+    return _libData->Compute( outFile );
+#endif
+  }
+
+  // Run library ONLY
+
+  // int err = system( cmdLine.c_str() ); // run
+
+  // if ( err )
+  //   errStr = SMESH_Comment("system(mg-tetra.exe ...) command failed with error: ")
+  //     << strerror( errno );
+
+  // GetLog(); // write a log file
+  // _logFile = ""; // not to write it again
+
+  return false;
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Prepare for reading a mesh data
+ */
+//================================================================================
+
+int  MG_TetraHPC_API::GmfOpenMesh(const char* theFile, int rdOrWr, int * ver, int * dim)
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    return 1;
+#endif
+  }
+  int id = ::GmfOpenMesh(theFile, rdOrWr, ver, dim );
+  _openFiles.insert( id );
+  return id;
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return nb of entities
+ */
+//================================================================================
+
+int MG_TetraHPC_API::GmfStatKwd( int iMesh, GmfKwdCod what )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    switch ( what )
+    {
+    case GmfSubDomainFromGeom: return _libData->ReadNbSubDomains();
+    case GmfVertices:          return _libData->ReadNbNodes();
+    case GmfEdges:             return _libData->ReadNbEdges();
+    case GmfTriangles:         return _libData->ReadNbTria();
+    case GmfQuadrilaterals:    return _libData->ReadNbQuads();
+    case GmfTetrahedra:        return _libData->ReadNbTetra();
+    case GmfHexahedra:         return _libData->ReadNbHexa();
+    default:                   return 0;
+    }
+    return 0;
+#endif
+  }
+  return ::GmfStatKwd( iMesh, what );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Prepare for reading some data
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGotoKwd( int iMesh, GmfKwdCod what )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->ResetCounter();
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGotoKwd( iMesh, what );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return index of a domain identified by a triangle normal
+ *  \param [in] iMesh - mesh file index
+ *  \param [in] what - must be GmfSubDomainFromGeom
+ *  \param [out] nbNodes - nb nodes in a face
+ *  \param [out] faceInd - face index
+ *  \param [out] ori - face orientation
+ *  \param [out] domain - domain index
+ *  \param [in] dummy - an artificial param used to discriminate from GmfGetLin() reading
+ *              a triangle
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGetLin( int iMesh, GmfKwdCod what, int* nbNodes, int* faceInd, int* ori, int* domain, int dummy )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->ReadSubDomain( nbNodes, faceInd, ori, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGetLin( iMesh, what, nbNodes, faceInd, ori, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return coordinates of a next node
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what,
+                             double* x, double* y, double *z, int* domain )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->ReadNodeXYZ( x, y, z, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGetLin(iMesh, what, x, y, z, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return coordinates of a next node
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what,
+                             float* x, float* y, float *z, int* domain )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    double X,Y,Z;
+    _libData->ReadNodeXYZ( &X, &Y, &Z, domain );
+    *x = X;
+    *y = Y;
+    *z = Z;
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGetLin(iMesh, what, x, y, z, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return node index of a next corner
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int* node )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    node = 0;
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGetLin(iMesh, what, node );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return node indices of a next edge
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int* node1, int* node2, int* domain )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->ReadEdgeNodes( node1, node2, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGetLin( iMesh, what, node1, node2, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return node indices of a next triangle
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what,
+                             int* node1, int* node2, int* node3, int* domain )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->ReadTriaNodes( node1, node2, node3, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGetLin(iMesh, what, node1, node2, node3, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return node indices of a next tetrahedron or quadrangle
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what,
+                             int* node1, int* node2, int* node3, int* node4, int* domain )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    if ( what == GmfQuadrilaterals )
+      _libData->ReadQuadNodes( node1, node2, node3, node4, domain );
+    else
+      _libData->ReadTetraNodes( node1, node2, node3, node4, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGetLin(iMesh, what, node1, node2, node3, node4, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return node indices of a next hexahedron
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what,
+                             int* node1, int* node2, int* node3, int* node4,
+                             int* node5, int* node6, int* node7, int* node8,
+                             int* domain )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->ReadHexaNodes( node1, node2, node3, node4,
+                             node5, node6, node7, node8, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfGetLin(iMesh, what, node1, node2, node3, node4, node5, node6, node7, node8, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Prepare for passing data to MeshGems
+ */
+//================================================================================
+
+int  MG_TetraHPC_API::GmfOpenMesh(const char* theFile, int rdOrWr, int ver, int dim)
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    return 1;
+#endif
+  }
+  int id = ::GmfOpenMesh(theFile, rdOrWr, ver, dim);
+  _openFiles.insert( id );
+  return id;
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Set number of entities
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfSetKwd(int iMesh, GmfKwdCod what, int nb )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    switch ( what ) {
+    case GmfVertices:          _libData->SetNbVertices( nb ); break;
+    case GmfEdges:             _libData->SetNbEdges   ( nb ); break;
+    case GmfRequiredEdges:     _libData->SetNbReqEdges( nb ); break;
+    case GmfTriangles:         _libData->SetNbTria    ( nb ); break;
+    case GmfRequiredTriangles: _libData->SetNbReqTria ( nb ); break;
+    default:;
+    }
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfSetKwd(iMesh, what, nb );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Add coordinates of a node
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, double x, double y, double z, int domain)
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->AddNode( x, y, z, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfSetLin(iMesh, what, x, y, z, domain);
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Set number of field entities
+ *  \param [in] iMesh - solution file index
+ *  \param [in] what - solution type
+ *  \param [in] nbNodes - nb of entities
+ *  \param [in] nbTypes - nb of data entries in each entity
+ *  \param [in] type - types of the data entries
+ *
+ * Used to prepare to storing size at nodes
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfSetKwd(int iMesh, GmfKwdCod what, int nbNodes, int dummy, int type[] )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    if ( what == GmfSolAtVertices ) _libData->SetNbReqVertices( nbNodes );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfSetKwd(iMesh, what, nbNodes, dummy, type );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Add solution data
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, double vals[])
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->AddSizeAtNode( vals[0] );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfSetLin(iMesh, what, vals);
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Add edge nodes
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int node1, int node2, int domain )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->AddEdgeNodes( node1, node2, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfSetLin(iMesh, what, node1, node2, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Add a 'required' flag
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int id )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfSetLin(iMesh, what, id );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Add triangle nodes
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int node1, int node2, int node3, int domain )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    _libData->AddTriaNodes( node1, node2, node3, domain );
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfSetLin(iMesh, what, node1, node2, node3, domain );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Close a file
+ */
+//================================================================================
+
+void MG_TetraHPC_API::GmfCloseMesh( int iMesh )
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    return;
+#endif
+  }
+  ::GmfCloseMesh( iMesh );
+  _openFiles.erase( iMesh );
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return true if the log is not empty
+ */
+//================================================================================
+
+bool MG_TetraHPC_API::HasLog()
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    return !_libData->GetErrors().empty();
+#endif
+  }
+  SMESH_File file( _logFile );
+  return file.size() > 0;
+}
+
+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Return log contents
+ */
+//================================================================================
+
+std::string MG_TetraHPC_API::GetLog()
+{
+  if ( _useLib ) {
+#ifdef USE_MG_LIBS
+    const std::string& err = _libData->GetErrors();
+    if ( !_logFile.empty() && !err.empty() )
+    {
+      SMESH_File file( _logFile, /*openForReading=*/false );
+      file.openForWriting();
+      file.write( err.c_str(), err.size() );
+    }
+    return err;
+#endif
+  }
+  SMESH_File file( _logFile );
+  return file.getPos();
+}
diff --git a/src/GHS3DPRLPlugin/MG_TetraHPC_API.hxx b/src/GHS3DPRLPlugin/MG_TetraHPC_API.hxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4c14192
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,86 @@
+// Copyright (C) 2004-2016  CEA/DEN, EDF R&D
+//
+// This library is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// This library is distributed in the hope that it will be useful,
+// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+// Lesser General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License along with this library; if not, write to the Free Software
+// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+
+#ifndef __MG_TetraHPC_IO_HXX__
+#define __MG_TetraHPC_IO_HXX__
+
+extern "C"
+{
+#include "libmesh5.h"
+}
+#include <string>
+#include <set>
+
+/*!
+ * \brief Class providing a transparent switch between MG_TetraHPC usage as
+ *        a library and as an executable. API of libmesh5 inherited.
+ */
+class MG_TetraHPC_API
+{
+public:
+
+  MG_TetraHPC_API( volatile bool& cancelled_flag, double& progress );
+  ~MG_TetraHPC_API();
+
+  bool IsLibrary();
+  bool IsExecutable() { return !IsLibrary(); }
+  void SetUseExecutable();
+
+  // IN to MESHGEMS
+  int  GmfOpenMesh(const char* theFile, int rdOrWr, int ver, int dim);
+  void GmfSetKwd(int iMesh, GmfKwdCod what, int nb );
+  void GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, double x, double y, double z, int domain);
+  void GmfSetKwd(int iMesh, GmfKwdCod what, int nbNodes, int dummy, int type[] ); // sol type
+  void GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, double vals[]); // sol
+  void GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int node1, int node2, int domain ); // edge
+  void GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int id ); // required
+  void GmfSetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int node1, int node2, int node3, int domain ); // tria
+
+  bool Compute( const std::string& cmdLine );
+
+  // OUT from MESHGEMS
+  int  GmfOpenMesh(const char* theFile, int rdOrWr, int * ver, int * dim);
+  int  GmfStatKwd( int iMesh, GmfKwdCod what );
+  void GmfGotoKwd( int iMesh, GmfKwdCod what );
+  void GmfGetLin( int iMesh, GmfKwdCod what, int* nbNodes, int* faceInd, int* ori, int* domain, int dummy );
+  void GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, float* x, float* y, float *z, int* domain );
+  void GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, double* x, double* y, double *z, int* domain );
+  void GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int* node );
+  void GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int* node1, int* node2, int* domain );
+  void GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int* node1, int* node2, int* node3, int* domain );
+  void GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int* node1, int* node2, int* node3, int* node4, int* domain );
+  void GmfGetLin(int iMesh, GmfKwdCod what, int* node1, int* node2, int* node3, int* node4, int* node5, int* node6, int* node7, int* node8, int* domain );
+  void GmfCloseMesh( int iMesh );
+
+  void SetLogFile( const std::string& logFileName ) { _logFile = logFileName; }
+  bool HasLog();
+  std::string GetLog();
+
+
+  struct LibData;
+
+private:
+
+  bool          _useLib;
+  LibData*      _libData;
+  std::set<int> _openFiles;
+  std::string   _logFile;
+};
+
+#endif
index 28d533b2bddf8fb0813eadd4f772d441af078186..c48727379f1d04effa69454bb3fcae18143ab3fb 100755 (executable)
@@ -269,6 +269,7 @@ bool GHS3DPRLPluginGUI_HypothesisCreator::readParamsFromWidgets( GHS3DPRLHypothe
   h_data.myNbPart     = myNbPart->value();
   h_data.myKeepFiles  = myKeepFiles->isChecked();
   h_data.myBackground = myBackground->isChecked();
+  h_data.myMultithread= myMultithread->isChecked();
   h_data.myGradation  = myGradation->value();
   h_data.myMinSize    = myMinSize->value();
   h_data.myMaxSize    = myMaxSize->value();
index d3ba409c8b7202f1804cd59e2bb94b9abbeec546..6e4d432789b1f9476b32d191bbf3b02bde7dabeb 100755 (executable)
@@ -107,7 +107,7 @@ bool ReadFileMED(QString nomfilemed,ghs3dprl_mesh_wrap *mymailw)
 {
    med_err ret;
    med_idt fid=0;
-   med_int i,j,sdim,mdim,nmaa,edim,majeur_lu,mineur_lu,release_lu,nprofils,nstep;
+   med_int i,j,sdim,mdim,nmaa,/*edim,majeur_lu,mineur_lu,release_lu,nprofils,*/nstep;
    med_mesh_type type_maillage;
    char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
    char axisname[MED_SNAME_SIZE+1];
@@ -174,14 +174,14 @@ bool ReadFileMED(QString nomfilemed,ghs3dprl_mesh_wrap *mymailw)
    }
 
    //nombre d'objets MED : mailles, faces, aretes , ... 
-   med_int nmailles[MED_N_CELL_GEO],nbtria3;
-   med_int nfaces[MED_N_FACE_GEO];
-   med_int naretes[MED_N_EDGE_FIXED_GEO],nbseg2;
+   med_int /*nmailles[MED_N_CELL_GEO],*/nbtria3;
+   //med_int nfaces[MED_N_FACE_GEO];
+   med_int /*naretes[MED_N_EDGE_FIXED_GEO],*/nbseg2;
    //med_int nmailles[MED_NBR_GEOMETRIE_MAILLE],nbtria3;
    //med_int nfaces[MED_NBR_GEOMETRIE_FACE];
    //med_int naretes[MED_NBR_GEOMETRIE_ARETE],nbseg2;
    //polygones et polyedres familles equivalences joints
-   med_int nmpolygones,npolyedres,nfpolygones,nfam,nequ,njnt;
+   med_int /*nmpolygones,npolyedres,nfpolygones,*/nfam/*,nequ,njnt*/;
 
    //Combien de mailles, faces ou aretes pour chaque type geometrique ?
    /*for (i=0;i<MED_NBR_GEOMETRIE_MAILLE;i++){
@@ -216,7 +216,7 @@ std::vector<med_int> famdelete = std::vector<med_int>(nfam);
   char *gro;
   char nomfam[MED_NAME_SIZE+1];
   med_int numfam;
-  char str1[MED_COMMENT_SIZE+1];
+  //char str1[MED_COMMENT_SIZE+1];
   char str2[MED_LNAME_SIZE+1];
   med_err ret = 0;
   
@@ -799,6 +799,13 @@ int main(int argc, char *argv[])
       std::cout<<"\nlaunch tetra_hpc command:"<<
                  "\n   "<<cmd.toLatin1().constData()<<"\n"<<std::endl;
    }
+   else if ( std::ifstream(( pathini+casename + "_out.mesh").toLatin1().constData() ).is_open() )
+   {
+     // mesh file exists (created by using MG as a library), copy it to *.000001.mesh
+     QString copyCmd = ( QString("cp -f %1_out.mesh %2_out.000001.mesh")
+                         .arg( pathini+casename ).arg( pathini+casename ));
+     system( copyCmd.toLatin1().constData()); // run
+   }
    
    //utile si appel par plugin ghs3dprl sur big meshes et tetra_hpc sur plusieurs jours
 #ifndef WIN32