src/SMDS/SMDS_UnstructuredGrid.cxx

   1 // Copyright (C) 2010-2014  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "SMDS_UnstructuredGrid.hxx"
  21 #include "SMDS_Mesh.hxx"
  22 #include "SMDS_MeshInfo.hxx"
  23 #include "SMDS_Downward.hxx"
  24 #include "SMDS_MeshVolume.hxx"
  25
  26 #include "utilities.h"
  27
  28 #include <vtkCellArray.h>
  29 #include <vtkCellData.h>
  30 #include <vtkCellLinks.h>
  31 #include <vtkDoubleArray.h>
  32 #include <vtkIdTypeArray.h>
  33 #include <vtkUnsignedCharArray.h>
  34
  35 #include <list>
  36 #include <climits>
  37
  38 using namespace std;
  39
  40 SMDS_CellLinks* SMDS_CellLinks::New()
  41 {
  42   MESSAGE("SMDS_CellLinks::New");
  43   return new SMDS_CellLinks();
  44 }
  45
  46 void SMDS_CellLinks::ResizeForPoint(vtkIdType vtkID)
  47 {
  48   if ( vtkID > this->MaxId )
  49   {
  50     this->MaxId = vtkID;
  51     if ( vtkID >= this->Size )
  52       vtkCellLinks::Resize( vtkID+SMDS_Mesh::chunkSize );
  53   }
  54 }
  55
  56 SMDS_CellLinks::SMDS_CellLinks() :
  57   vtkCellLinks()
  58 {
  59 }
  60
  61 SMDS_CellLinks::~SMDS_CellLinks()
  62 {
  63 }
  64
  65 SMDS_UnstructuredGrid* SMDS_UnstructuredGrid::New()
  66 {
  67   MESSAGE("SMDS_UnstructuredGrid::New");
  68   return new SMDS_UnstructuredGrid();
  69 }
  70
  71 SMDS_UnstructuredGrid::SMDS_UnstructuredGrid() :
  72   vtkUnstructuredGrid()
  73 {
  74   _cellIdToDownId.clear();
  75   _downTypes.clear();
  76   _downArray.clear();
  77   _mesh = 0;
  78 }
  79
  80 SMDS_UnstructuredGrid::~SMDS_UnstructuredGrid()
  81 {
  82 }
  83
  84 unsigned long SMDS_UnstructuredGrid::GetMTime()
  85 {
  86   unsigned long mtime = vtkUnstructuredGrid::GetMTime();
  87   MESSAGE("vtkUnstructuredGrid::GetMTime: " << mtime);
  88   return mtime;
  89 }
  90 // OUV_PORTING_VTK6: seems to be useless
  91 /*
  92 void SMDS_UnstructuredGrid::Update()
  93 {
  94   MESSAGE("SMDS_UnstructuredGrid::Update");
  95   return vtkUnstructuredGrid::Update();
  96 }
  97
  98 void SMDS_UnstructuredGrid::UpdateInformation()
  99 {
 100   MESSAGE("SMDS_UnstructuredGrid::UpdateInformation");
 101   return vtkUnstructuredGrid::UpdateInformation();
 102 }
 103 */
 104 vtkPoints* SMDS_UnstructuredGrid::GetPoints()
 105 {
 106   // TODO erreur incomprehensible de la macro vtk GetPoints apparue avec la version paraview de fin aout 2010
 107   //MESSAGE("*********************** SMDS_UnstructuredGrid::GetPoints " << this->Points << " " << vtkUnstructuredGrid::GetPoints());
 108   return this->Points;
 109 }
 110
 111 //#ifdef VTK_HAVE_POLYHEDRON
 112 int SMDS_UnstructuredGrid::InsertNextLinkedCell(int type, int npts, vtkIdType *pts)
 113 {
 114   if (type != VTK_POLYHEDRON)
 115     return vtkUnstructuredGrid::InsertNextLinkedCell(type, npts, pts);
 116
 117   // --- type = VTK_POLYHEDRON
 118   //MESSAGE("InsertNextLinkedCell VTK_POLYHEDRON");
 119   int cellid = this->InsertNextCell(type, npts, pts);
 120
 121   set<vtkIdType> setOfNodes;
 122   setOfNodes.clear();
 123   int nbfaces = npts;
 124   int i = 0;
 125   for (int nf = 0; nf < nbfaces; nf++)
 126     {
 127       int nbnodes = pts[i];
 128       i++;
 129       for (int k = 0; k < nbnodes; k++)
 130         {
 131           //MESSAGE(" cell " << cellid << " face " << nf << " node " << pts[i]);
 132           setOfNodes.insert(pts[i]);
 133           i++;
 134         }
 135     }
 136
 137   set<vtkIdType>::iterator it = setOfNodes.begin();
 138   for (; it != setOfNodes.end(); ++it)
 139     {
 140       //MESSAGE("reverse link for node " << *it << " cell " << cellid);
 141       this->Links->ResizeCellList(*it, 1);
 142       this->Links->AddCellReference(cellid, *it);
 143     }
 144
 145   return cellid;
 146 }
 147 //#endif
 148
 149 void SMDS_UnstructuredGrid::setSMDS_mesh(SMDS_Mesh *mesh)
 150 {
 151   _mesh = mesh;
 152 }
 153
 154 void SMDS_UnstructuredGrid::compactGrid(std::vector<int>& idNodesOldToNew, int newNodeSize,
 155                                         std::vector<int>& idCellsOldToNew, int newCellSize)
 156 {
 157   MESSAGE("------------------------- SMDS_UnstructuredGrid::compactGrid " << newNodeSize << " " << newCellSize);//CHRONO(1);
 158   int alreadyCopied = 0;
 159
 160   // --- if newNodeSize, create a new compacted vtkPoints
 161
 162   vtkPoints *newPoints = vtkPoints::New();
 163   newPoints->SetDataType(VTK_DOUBLE);
 164   newPoints->SetNumberOfPoints(newNodeSize);
 165   if (newNodeSize)
 166     {
 167       MESSAGE("-------------- compactGrid, newNodeSize " << newNodeSize);
 168       // rnv: to fix bug "21125: EDF 1233 SMESH: Degradation of precision in a test case for quadratic conversion"
 169       // using double type for storing coordinates of nodes instead float.
 170       int oldNodeSize = idNodesOldToNew.size();
 171
 172       int i = 0;
 173       while ( i < oldNodeSize )
 174       {
 175         // skip a hole if any
 176         while ( i < oldNodeSize && idNodesOldToNew[i] < 0 )
 177           ++i;
 178         int startBloc = i;
 179         // look for a block end
 180         while ( i < oldNodeSize && idNodesOldToNew[i] >= 0 )
 181           ++i;
 182         int endBloc = i;
 183         copyNodes(newPoints, idNodesOldToNew, alreadyCopied, startBloc, endBloc);
 184       }
 185       newPoints->Squeeze();
 186     }
 187
 188   // --- create new compacted Connectivity, Locations and Types
 189
 190   int oldCellSize = this->Types->GetNumberOfTuples();
 191
 192   vtkCellArray *newConnectivity = vtkCellArray::New();
 193   newConnectivity->Initialize();
 194   int oldCellDataSize = this->Connectivity->GetData()->GetSize();
 195   newConnectivity->Allocate(oldCellDataSize);
 196   MESSAGE("oldCellSize="<< oldCellSize << " oldCellDataSize=" << oldCellDataSize);
 197
 198   vtkUnsignedCharArray *newTypes = vtkUnsignedCharArray::New();
 199   newTypes->Initialize();
 200   newTypes->SetNumberOfValues(newCellSize);
 201
 202   vtkIdTypeArray *newLocations = vtkIdTypeArray::New();
 203   newLocations->Initialize();
 204   newLocations->SetNumberOfValues(newCellSize);
 205
 206   // TODO some polyhedron may be huge (only in some tests)
 207   vtkIdType tmpid[NBMAXNODESINCELL];
 208   vtkIdType *pointsCell = &tmpid[0]; // --- points id to fill a new cell
 209
 210   alreadyCopied = 0;
 211   int i = 0;
 212   while ( i < oldCellSize )
 213   {
 214     // skip a hole if any
 215     while ( i < oldCellSize && this->Types->GetValue(i) == VTK_EMPTY_CELL )
 216       ++i;
 217     int startBloc = i;
 218     // look for a block end
 219     while ( i < oldCellSize && this->Types->GetValue(i) != VTK_EMPTY_CELL )
 220       ++i;
 221     int endBloc = i;
 222     if ( endBloc > startBloc )
 223       copyBloc(newTypes,
 224                idCellsOldToNew, idNodesOldToNew,
 225                newConnectivity, newLocations,
 226                pointsCell, alreadyCopied,
 227                startBloc, endBloc);
 228   }
 229   newConnectivity->Squeeze();
 230
 231   if (1/*newNodeSize*/)
 232     {
 233       MESSAGE("------- newNodeSize, setPoints");
 234       this->SetPoints(newPoints);
 235       MESSAGE("NumberOfPoints: " << this->GetNumberOfPoints());
 236     }
 237
 238   if (vtkDoubleArray* diameters =
 239       vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() )) // Balls
 240   {
 241     for (int oldCellID = 0; oldCellID < oldCellSize; oldCellID++)
 242     {
 243       if (this->Types->GetValue(oldCellID) == VTK_EMPTY_CELL)
 244         continue;
 245       int newCellId = idCellsOldToNew[ oldCellID ];
 246       if (newTypes->GetValue(newCellId) == VTK_POLY_VERTEX)
 247         diameters->SetValue( newCellId, diameters->GetValue( oldCellID ));
 248     }
 249   }
 250
 251   if (this->FaceLocations)
 252     {
 253       vtkIdTypeArray *newFaceLocations = vtkIdTypeArray::New();
 254       newFaceLocations->Initialize();
 255       newFaceLocations->Allocate(newTypes->GetSize());
 256       vtkIdTypeArray *newFaces = vtkIdTypeArray::New();
 257       newFaces->Initialize();
 258       newFaces->Allocate(this->Faces->GetSize());
 259       for (int i = 0; i < oldCellSize; i++)
 260         {
 261           if (this->Types->GetValue(i) == VTK_EMPTY_CELL)
 262             continue;
 263           int newCellId = idCellsOldToNew[i];
 264           if (newTypes->GetValue(newCellId) == VTK_POLYHEDRON)
 265             {
 266                newFaceLocations->InsertNextValue(newFaces->GetMaxId()+1);
 267                int oldFaceLoc = this->FaceLocations->GetValue(i);
 268                int nCellFaces = this->Faces->GetValue(oldFaceLoc++);
 269                newFaces->InsertNextValue(nCellFaces);
 270                for (int n=0; n<nCellFaces; n++)
 271                  {
 272                    int nptsInFace = this->Faces->GetValue(oldFaceLoc++);
 273                    newFaces->InsertNextValue(nptsInFace);
 274                    for (int k=0; k<nptsInFace; k++)
 275                      {
 276                        int oldpt = this->Faces->GetValue(oldFaceLoc++);
 277                        newFaces->InsertNextValue(idNodesOldToNew[oldpt]);
 278                      }
 279                  }
 280             }
 281           else
 282             {
 283                newFaceLocations->InsertNextValue(-1);
 284             }
 285         }
 286       newFaceLocations->Squeeze();
 287       newFaces->Squeeze();
 288       this->SetCells(newTypes, newLocations, newConnectivity, newFaceLocations, newFaces);
 289       newFaceLocations->Delete();
 290       newFaces->Delete();
 291     }
 292   else
 293   {
 294     this->SetCells(newTypes, newLocations, newConnectivity, FaceLocations, Faces);
 295   }
 296
 297   newPoints->Delete();
 298   newTypes->Delete();
 299   newLocations->Delete();
 300   newConnectivity->Delete();
 301   this->BuildLinks();
 302 }
 303
 304 void SMDS_UnstructuredGrid::copyNodes(vtkPoints *newPoints, std::vector<int>& idNodesOldToNew, int& alreadyCopied,
 305                                       int start, int end)
 306 {
 307   MESSAGE("copyNodes " << alreadyCopied << " " << start << " " << end << " size: " << end - start << " total: " << alreadyCopied + end - start);
 308   void *target = newPoints->GetVoidPointer(3 * alreadyCopied);
 309   void *source = this->Points->GetVoidPointer(3 * start);
 310   int nbPoints = end - start;
 311   if (nbPoints > 0)
 312     {
 313       memcpy(target, source, 3 * sizeof(double) * nbPoints);
 314       for (int j = start; j < end; j++)
 315         idNodesOldToNew[j] = alreadyCopied++; // old vtkId --> new vtkId
 316     }
 317 }
 318
 319 void SMDS_UnstructuredGrid::copyBloc(vtkUnsignedCharArray *newTypes,
 320                                      std::vector<int>&     idCellsOldToNew,
 321                                      std::vector<int>&     idNodesOldToNew,
 322                                      vtkCellArray*         newConnectivity,
 323                                      vtkIdTypeArray*       newLocations,
 324                                      vtkIdType*            pointsCell,
 325                                      int&                  alreadyCopied,
 326                                      int                   start,
 327                                      int                   end)
 328 {
 329   //MESSAGE("copyBloc " << alreadyCopied << " " << start << " " << end << " size: " << end - start << " total: " << alreadyCopied + end - start);
 330   for (int j = start; j < end; j++)
 331     {
 332       newTypes->SetValue(alreadyCopied, this->Types->GetValue(j));
 333       idCellsOldToNew[j] = alreadyCopied; // old vtkId --> new vtkId
 334       vtkIdType oldLoc = this->Locations->GetValue(j);
 335       vtkIdType nbpts;
 336       vtkIdType *oldPtsCell = 0;
 337       this->Connectivity->GetCell(oldLoc, nbpts, oldPtsCell);
 338       assert(nbpts < NBMAXNODESINCELL);
 339       //MESSAGE(j << " " << alreadyCopied << " " << (int)this->Types->GetValue(j) << " " << oldLoc << " " << nbpts );
 340       for (int l = 0; l < nbpts; l++)
 341         {
 342           int oldval = oldPtsCell[l];
 343           pointsCell[l] = idNodesOldToNew[oldval];
 344           //MESSAGE("   " << oldval << " " << pointsCell[l]);
 345         }
 346       /*int newcnt = */newConnectivity->InsertNextCell(nbpts, pointsCell);
 347       int newLoc = newConnectivity->GetInsertLocation(nbpts);
 348       //MESSAGE(newcnt << " " << newLoc);
 349       newLocations->SetValue(alreadyCopied, newLoc);
 350       alreadyCopied++;
 351     }
 352 }
 353
 354 int SMDS_UnstructuredGrid::CellIdToDownId(int vtkCellId)
 355 {
 356   if((vtkCellId < 0) || (vtkCellId >= _cellIdToDownId.size()))
 357     {
 358       //MESSAGE("SMDS_UnstructuredGrid::CellIdToDownId structure not up to date: vtkCellId="
 359       //    << vtkCellId << " max="<< _cellIdToDownId.size());
 360       return -1;
 361     }
 362   return _cellIdToDownId[vtkCellId];
 363 }
 364
 365 void SMDS_UnstructuredGrid::setCellIdToDownId(int vtkCellId, int downId)
 366 {
 367   // ASSERT((vtkCellId >= 0) && (vtkCellId < _cellIdToDownId.size()));
 368   _cellIdToDownId[vtkCellId] = downId;
 369 }
 370
 371 void SMDS_UnstructuredGrid::CleanDownwardConnectivity()
 372 {
 373   for (int i = 0; i < _downArray.size(); i++)
 374     {
 375       if (_downArray[i])
 376         delete _downArray[i];
 377       _downArray[i] = 0;
 378     }
 379   _cellIdToDownId.clear();
 380 }
 381
 382 /*! Build downward connectivity: to do only when needed because heavy memory load.
 383  *  Downward connectivity is no more valid if vtkUnstructuredGrid is modified.
 384  *
 385  */
 386 void SMDS_UnstructuredGrid::BuildDownwardConnectivity(bool withEdges)
 387 {
 388   MESSAGE("SMDS_UnstructuredGrid::BuildDownwardConnectivity");CHRONO(2);
 389   // TODO calcul partiel sans edges
 390
 391   // --- erase previous data if any
 392
 393   this->CleanDownwardConnectivity();
 394
 395   // --- create SMDS_Downward structures (in _downArray vector[vtkCellType])
 396
 397   _downArray.resize(VTK_MAXTYPE + 1, 0);
 398
 399   _downArray[VTK_LINE]                    = new SMDS_DownEdge(this);
 400   _downArray[VTK_QUADRATIC_EDGE]          = new SMDS_DownQuadEdge(this);
 401   _downArray[VTK_TRIANGLE]                = new SMDS_DownTriangle(this);
 402   _downArray[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]      = new SMDS_DownQuadTriangle(this);
 403   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]    = new SMDS_DownQuadTriangle(this);
 404   _downArray[VTK_QUAD]                    = new SMDS_DownQuadrangle(this);
 405   _downArray[VTK_QUADRATIC_QUAD]          = new SMDS_DownQuadQuadrangle(this);
 406   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]        = new SMDS_DownQuadQuadrangle(this);
 407   _downArray[VTK_TETRA]                   = new SMDS_DownTetra(this);
 408   _downArray[VTK_QUADRATIC_TETRA]         = new SMDS_DownQuadTetra(this);
 409   _downArray[VTK_PYRAMID]                 = new SMDS_DownPyramid(this);
 410   _downArray[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]       = new SMDS_DownQuadPyramid(this);
 411   _downArray[VTK_WEDGE]                   = new SMDS_DownPenta(this);
 412   _downArray[VTK_QUADRATIC_WEDGE]         = new SMDS_DownQuadPenta(this);
 413   _downArray[VTK_HEXAHEDRON]              = new SMDS_DownHexa(this);
 414   _downArray[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]    = new SMDS_DownQuadHexa(this);
 415   _downArray[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON] = new SMDS_DownQuadHexa(this);
 416   _downArray[VTK_HEXAGONAL_PRISM]         = new SMDS_DownPenta(this);
 417
 418   // --- get detailed info of number of cells of each type, allocate SMDS_downward structures
 419
 420   const SMDS_MeshInfo &meshInfo = _mesh->GetMeshInfo();
 421
 422   int nbLinTetra  = meshInfo.NbTetras  (ORDER_LINEAR);
 423   int nbQuadTetra = meshInfo.NbTetras  (ORDER_QUADRATIC);
 424   int nbLinPyra   = meshInfo.NbPyramids(ORDER_LINEAR);
 425   int nbQuadPyra  = meshInfo.NbPyramids(ORDER_QUADRATIC);
 426   int nbLinPrism  = meshInfo.NbPrisms  (ORDER_LINEAR);
 427   int nbQuadPrism = meshInfo.NbPrisms  (ORDER_QUADRATIC);
 428   int nbLinHexa   = meshInfo.NbHexas   (ORDER_LINEAR);
 429   int nbQuadHexa  = meshInfo.NbHexas   (ORDER_QUADRATIC);
 430   int nbHexPrism  = meshInfo.NbHexPrisms();
 431
 432   int nbLineGuess     = int((4.0 / 3.0) * nbLinTetra + 2 * nbLinPrism + 2.5 * nbLinPyra + 3 * nbLinHexa);
 433   int nbQuadEdgeGuess = int((4.0 / 3.0) * nbQuadTetra + 2 * nbQuadPrism + 2.5 * nbQuadPyra + 3 * nbQuadHexa);
 434   int nbLinTriaGuess  = 2 * nbLinTetra + nbLinPrism + 2 * nbLinPyra;
 435   int nbQuadTriaGuess = 2 * nbQuadTetra + nbQuadPrism + 2 * nbQuadPyra;
 436   int nbLinQuadGuess  = int((2.0 / 3.0) * nbLinPrism + (1.0 / 2.0) * nbLinPyra + 3 * nbLinHexa);
 437   int nbQuadQuadGuess = int((2.0 / 3.0) * nbQuadPrism + (1.0 / 2.0) * nbQuadPyra + 3 * nbQuadHexa);
 438
 439   int GuessSize[VTK_MAXTYPE];
 440   GuessSize[VTK_LINE]                    = nbLineGuess;
 441   GuessSize[VTK_QUADRATIC_EDGE]          = nbQuadEdgeGuess;
 442   GuessSize[VTK_TRIANGLE]                = nbLinTriaGuess;
 443   GuessSize[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]      = nbQuadTriaGuess;
 444   GuessSize[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]    = nbQuadTriaGuess;
 445   GuessSize[VTK_QUAD]                    = nbLinQuadGuess;
 446   GuessSize[VTK_QUADRATIC_QUAD]          = nbQuadQuadGuess;
 447   GuessSize[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]        = nbQuadQuadGuess;
 448   GuessSize[VTK_TETRA]                   = nbLinTetra;
 449   GuessSize[VTK_QUADRATIC_TETRA]         = nbQuadTetra;
 450   GuessSize[VTK_PYRAMID]                 = nbLinPyra;
 451   GuessSize[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]       = nbQuadPyra;
 452   GuessSize[VTK_WEDGE]                   = nbLinPrism;
 453   GuessSize[VTK_QUADRATIC_WEDGE]         = nbQuadPrism;
 454   GuessSize[VTK_HEXAHEDRON]              = nbLinHexa;
 455   GuessSize[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]    = nbQuadHexa;
 456   GuessSize[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON] = nbQuadHexa;
 457   GuessSize[VTK_HEXAGONAL_PRISM]         = nbHexPrism;
 458
 459   _downArray[VTK_LINE]                   ->allocate(nbLineGuess);
 460   _downArray[VTK_QUADRATIC_EDGE]         ->allocate(nbQuadEdgeGuess);
 461   _downArray[VTK_TRIANGLE]               ->allocate(nbLinTriaGuess);
 462   _downArray[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]     ->allocate(nbQuadTriaGuess);
 463   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]   ->allocate(nbQuadTriaGuess);
 464   _downArray[VTK_QUAD]                   ->allocate(nbLinQuadGuess);
 465   _downArray[VTK_QUADRATIC_QUAD]         ->allocate(nbQuadQuadGuess);
 466   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]       ->allocate(nbQuadQuadGuess);
 467   _downArray[VTK_TETRA]                  ->allocate(nbLinTetra);
 468   _downArray[VTK_QUADRATIC_TETRA]        ->allocate(nbQuadTetra);
 469   _downArray[VTK_PYRAMID]                ->allocate(nbLinPyra);
 470   _downArray[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]      ->allocate(nbQuadPyra);
 471   _downArray[VTK_WEDGE]                  ->allocate(nbLinPrism);
 472   _downArray[VTK_QUADRATIC_WEDGE]        ->allocate(nbQuadPrism);
 473   _downArray[VTK_HEXAHEDRON]             ->allocate(nbLinHexa);
 474   _downArray[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]   ->allocate(nbQuadHexa);
 475   _downArray[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON]->allocate(nbQuadHexa);
 476   _downArray[VTK_HEXAGONAL_PRISM]        ->allocate(nbHexPrism);
 477
 478   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only faces
 479   //     for each vtk face:
 480   //       create a downward face entry with its downward id.
 481   //       compute vtk volumes, create downward volumes entry.
 482   //       mark face in downward volumes
 483   //       mark volumes in downward face
 484
 485   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only faces");CHRONO(20);
 486   int cellSize = this->Types->GetNumberOfTuples();
 487   _cellIdToDownId.resize(cellSize, -1);
 488
 489   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 490     {
 491       int vtkFaceType = this->GetCellType(i);
 492       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkFaceType) == 2)
 493         {
 494           int vtkFaceId = i;
 495           //ASSERT(_downArray[vtkFaceType]);
 496           int connFaceId = _downArray[vtkFaceType]->addCell(vtkFaceId);
 497           SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 498           downFace->setTempNodes(connFaceId, vtkFaceId);
 499           int vols[2] = { -1, -1 };
 500           int nbVolumes = downFace->computeVolumeIds(vtkFaceId, vols);
 501           //MESSAGE("nbVolumes="<< nbVolumes);
 502           for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 503             {
 504               int vtkVolId = vols[ivol];
 505               int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId);
 506               //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 507               int connVolId = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId);
 508               _downArray[vtkVolType]->addDownCell(connVolId, connFaceId, vtkFaceType);
 509               _downArray[vtkFaceType]->addUpCell(connFaceId, connVolId, vtkVolType);
 510               // MESSAGE("Face " << vtkFaceId << " belongs to volume " << vtkVolId);
 511             }
 512         }
 513     }
 514
 515   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only volumes
 516   //     for each vtk volume:
 517   //       create downward volumes entry if not already done
 518   //       build a temporary list of faces described with their nodes
 519   //       for each face
 520   //         compute the vtk volumes containing this face
 521   //         check if the face is already listed in the volumes (comparison of ordered list of nodes)
 522   //         if not, create a downward face entry (resizing of structure required)
 523   //         (the downward faces store a temporary list of nodes to ease the comparison)
 524   //         create downward volumes entry if not already done
 525   //         mark volumes in downward face
 526   //         mark face in downward volumes
 527
 528   CHRONOSTOP(20);
 529   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only volumes");CHRONO(21);
 530
 531   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 532     {
 533       int vtkType = this->GetCellType(i);
 534       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType) == 3)
 535         {
 536           //CHRONO(31);
 537           int vtkVolId = i;
 538           // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId);
 539           //ASSERT(_downArray[vtkType]);
 540           /*int connVolId = */_downArray[vtkType]->addCell(vtkVolId);
 541
 542           // --- find all the faces of the volume, describe the faces by their nodes
 543
 544           SMDS_Down3D* downVol = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkType]);
 545           ListElemByNodesType facesWithNodes;
 546           downVol->computeFacesWithNodes(vtkVolId, facesWithNodes);
 547           // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId << " contains " << facesWithNodes.nbElems << " faces");
 548           //CHRONOSTOP(31);
 549           for (int iface = 0; iface < facesWithNodes.nbElems; iface++)
 550             {
 551               // --- find the volumes containing the face
 552
 553               //CHRONO(32);
 554               int vtkFaceType = facesWithNodes.elems[iface].vtkType;
 555               SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 556               int vols[2] = { -1, -1 };
 557               int *nodes = &facesWithNodes.elems[iface].nodeIds[0];
 558               int lg = facesWithNodes.elems[iface].nbNodes;
 559               int nbVolumes = downFace->computeVolumeIdsFromNodesFace(nodes, lg, vols);
 560               // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId << " face " << iface << " belongs to " << nbVolumes << " volumes");
 561
 562               // --- check if face is registered in the volumes
 563               //CHRONOSTOP(32);
 564
 565               //CHRONO(33);
 566               int connFaceId = -1;
 567               for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 568                 {
 569                   int vtkVolId2 = vols[ivol];
 570                   int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId2);
 571                   //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 572                   int connVolId2 = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId2);
 573                   SMDS_Down3D* downVol2 = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkVolType]);
 574                   connFaceId = downVol2->FindFaceByNodes(connVolId2, facesWithNodes.elems[iface]);
 575                   if (connFaceId >= 0)
 576                     break; // --- face already created
 577                 }//CHRONOSTOP(33);
 578
 579               // --- if face is not registered in the volumes, create face
 580
 581               //CHRONO(34);
 582               if (connFaceId < 0)
 583                 {
 584                   connFaceId = _downArray[vtkFaceType]->addCell();
 585                   downFace->setTempNodes(connFaceId, facesWithNodes.elems[iface]);
 586                 }//CHRONOSTOP(34);
 587
 588               // --- mark volumes in downward face and mark face in downward volumes
 589
 590               //CHRONO(35);
 591               for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 592                 {
 593                   int vtkVolId2 = vols[ivol];
 594                   int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId2);
 595                   //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 596                   int connVolId2 = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId2);
 597                   _downArray[vtkVolType]->addDownCell(connVolId2, connFaceId, vtkFaceType);
 598                   _downArray[vtkFaceType]->addUpCell(connFaceId, connVolId2, vtkVolType);
 599                   // MESSAGE(" From volume " << vtkVolId << " face " << connFaceId << " belongs to volume " << vtkVolId2);
 600                 }//CHRONOSTOP(35);
 601             }
 602         }
 603     }
 604
 605   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only edges
 606   //     for each vtk edge:
 607   //       create downward edge entry
 608   //       store the nodes id's in downward edge (redundant with vtkUnstructuredGrid)
 609   //       find downward faces
 610   //       (from vtk faces or volumes, get downward faces, they have a temporary list of nodes)
 611   //       mark edge in downward faces
 612   //       mark faces in downward edge
 613
 614   CHRONOSTOP(21);
 615   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only edges");CHRONO(22);
 616
 617   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 618     {
 619       int vtkEdgeType = this->GetCellType(i);
 620       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkEdgeType) == 1)
 621         {
 622           int vtkEdgeId = i;
 623           //ASSERT(_downArray[vtkEdgeType]);
 624           int connEdgeId = _downArray[vtkEdgeType]->addCell(vtkEdgeId);
 625           SMDS_Down1D* downEdge = static_cast<SMDS_Down1D*> (_downArray[vtkEdgeType]);
 626           downEdge->setNodes(connEdgeId, vtkEdgeId);
 627           vector<int> vtkIds;
 628           int nbVtkCells = downEdge->computeVtkCells(connEdgeId, vtkIds);
 629           int downFaces[1000];
 630           unsigned char downTypes[1000];
 631           int nbDownFaces = downEdge->computeFaces(connEdgeId, &vtkIds[0], nbVtkCells, downFaces, downTypes);
 632           for (int n = 0; n < nbDownFaces; n++)
 633             {
 634               _downArray[downTypes[n]]->addDownCell(downFaces[n], connEdgeId, vtkEdgeType);
 635               _downArray[vtkEdgeType]->addUpCell(connEdgeId, downFaces[n], downTypes[n]);
 636             }
 637         }
 638     }
 639
 640   // --- iteration on downward faces (they are all listed now)
 641   //     for each downward face:
 642   //       build a temporary list of edges with their ordered list of nodes
 643   //       for each edge:
 644   //         find all the vtk cells containing this edge
 645   //         then identify all the downward faces containing the edge, from the vtk cells
 646   //         check if the edge is already listed in the faces (comparison of ordered list of nodes)
 647   //         if not, create a downward edge entry with the node id's
 648   //         mark edge in downward faces
 649   //         mark downward faces in edge (size of list unknown, to be allocated)
 650
 651   CHRONOSTOP(22);CHRONO(23);
 652
 653   for (int vtkFaceType = 0; vtkFaceType < VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkFaceType++)
 654     {
 655       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkFaceType) != 2)
 656         continue;
 657
 658       // --- find all the edges of the face, describe the edges by their nodes
 659
 660       SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 661       int maxId = downFace->getMaxId();
 662       for (int faceId = 0; faceId < maxId; faceId++)
 663         {
 664           //CHRONO(40);
 665           ListElemByNodesType edgesWithNodes;
 666           downFace->computeEdgesWithNodes(faceId, edgesWithNodes);
 667           // MESSAGE("downward face type " << vtkFaceType << " num " << faceId << " contains " << edgesWithNodes.nbElems << " edges");
 668
 669           //CHRONOSTOP(40);
 670           for (int iedge = 0; iedge < edgesWithNodes.nbElems; iedge++)
 671             {
 672
 673               // --- check if the edge is already registered by exploration of the faces
 674
 675               //CHRONO(41);
 676               vector<int> vtkIds;
 677               unsigned char vtkEdgeType = edgesWithNodes.elems[iedge].vtkType;
 678               int *pts = &edgesWithNodes.elems[iedge].nodeIds[0];
 679               SMDS_Down1D* downEdge = static_cast<SMDS_Down1D*> (_downArray[vtkEdgeType]);
 680               int nbVtkCells = downEdge->computeVtkCells(pts, vtkIds);
 681               //CHRONOSTOP(41);CHRONO(42);
 682               int downFaces[1000];
 683               unsigned char downTypes[1000];
 684               int nbDownFaces = downEdge->computeFaces(pts, &vtkIds[0], nbVtkCells, downFaces, downTypes);
 685               //CHRONOSTOP(42);
 686
 687               //CHRONO(43);
 688               int connEdgeId = -1;
 689               for (int idf = 0; idf < nbDownFaces; idf++)
 690                 {
 691                   int faceId2 = downFaces[idf];
 692                   int faceType = downTypes[idf];
 693                   //ASSERT(_downArray[faceType]);
 694                   SMDS_Down2D* downFace2 = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[faceType]);
 695                   connEdgeId = downFace2->FindEdgeByNodes(faceId2, edgesWithNodes.elems[iedge]);
 696                   if (connEdgeId >= 0)
 697                     break; // --- edge already created
 698                 }//CHRONOSTOP(43);
 699
 700               // --- if edge is not registered in the faces, create edge
 701
 702               if (connEdgeId < 0)
 703                 {
 704                   //CHRONO(44);
 705                   connEdgeId = _downArray[vtkEdgeType]->addCell();
 706                   downEdge->setNodes(connEdgeId, edgesWithNodes.elems[iedge].nodeIds);
 707                   //CHRONOSTOP(44);
 708                 }
 709
 710               // --- mark faces in downward edge and mark edge in downward faces
 711
 712               //CHRONO(45);
 713               for (int idf = 0; idf < nbDownFaces; idf++)
 714                 {
 715                   int faceId2 = downFaces[idf];
 716                   int faceType = downTypes[idf];
 717                   //ASSERT(_downArray[faceType]);
 718                   //SMDS_Down2D* downFace2 = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[faceType]);
 719                   _downArray[vtkEdgeType]->addUpCell(connEdgeId, faceId2, faceType);
 720                   _downArray[faceType]->addDownCell(faceId2, connEdgeId, vtkEdgeType);
 721                   // MESSAGE(" From face t:" << vtkFaceType << " " << faceId <<
 722                   //  " edge " << connEdgeId << " belongs to face t:" << faceType << " " << faceId2);
 723                 }//CHRONOSTOP(45);
 724             }
 725         }
 726     }
 727
 728   CHRONOSTOP(23);CHRONO(24);
 729
 730   // compact downward connectivity structure: adjust downward arrays size, replace vector<vector int>> by a single vector<int>
 731   // 3D first then 2D and last 1D to release memory before edge upCells reorganization, (temporary memory use)
 732
 733   for (int vtkType = VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkType >= 0; vtkType--)
 734     {
 735       if (SMDS_Downward *down = _downArray[vtkType])
 736         {
 737           down->compactStorage();
 738         }
 739     }
 740
 741   // --- Statistics
 742
 743   for (int vtkType = 0; vtkType <= VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkType++)
 744     {
 745       if (SMDS_Downward *down = _downArray[vtkType])
 746         {
 747           if (down->getMaxId())
 748             {
 749               MESSAGE("Cells of Type " << vtkType << " : number of entities, est: "
 750                   << GuessSize[vtkType] << " real: " << down->getMaxId());
 751             }
 752         }
 753     }CHRONOSTOP(24);CHRONOSTOP(2);
 754   counters::stats();
 755 }
 756
 757 /*! Get the neighbors of a cell.
 758  * Only the neighbors having the dimension of the cell are taken into account
 759  * (neighbors of a volume are the volumes sharing a face with this volume,
 760  *  neighbors of a face are the faces sharing an edge with this face...).
 761  * @param neighborsVtkIds vector of neighbors vtk id's to fill (reserve enough space).
 762  * @param downIds downward id's of cells of dimension n-1, to fill (reserve enough space).
 763  * @param downTypes vtk types of cells of dimension n-1, to fill (reserve enough space).
 764  * @param vtkId the vtk id of the cell
 765  * @return number of neighbors
 766  */
 767 int SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors(int* neighborsVtkIds, int* downIds, unsigned char* downTypes, int vtkId, bool getSkin)
 768 {
 769   int vtkType = this->GetCellType(vtkId);
 770   int cellDim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 771   if (cellDim <2)
 772     return 0; // TODO voisins des edges = edges connectees
 773   int cellId = this->_cellIdToDownId[vtkId];
 774
 775   int nbCells = _downArray[vtkType]->getNumberOfDownCells(cellId);
 776   const int *downCells = _downArray[vtkType]->getDownCells(cellId);
 777   const unsigned char* downTyp = _downArray[vtkType]->getDownTypes(cellId);
 778
 779   // --- iteration on faces of the 3D cell (or edges on the 2D cell).
 780
 781   int nb = 0;
 782   for (int i = 0; i < nbCells; i++)
 783     {
 784       int downId = downCells[i];
 785       int cellType = downTyp[i];
 786       int nbUp = _downArray[cellType]->getNumberOfUpCells(downId);
 787       const int *upCells = _downArray[cellType]->getUpCells(downId);
 788       const unsigned char* upTypes = _downArray[cellType]->getUpTypes(downId);
 789
 790       // ---for a volume, max 2 upCells, one is this cell, the other is a neighbor
 791       //    for a face, number of neighbors (connected faces) not known
 792
 793       for (int j = 0; j < nbUp; j++)
 794         {
 795           if ((upCells[j] == cellId) && (upTypes[j] == vtkType))
 796             continue;
 797           int vtkNeighbor = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 798           neighborsVtkIds[nb] = vtkNeighbor;
 799           downIds[nb] = downId;
 800           downTypes[nb] = cellType;
 801           nb++;
 802           if (nb >= NBMAXNEIGHBORS)
 803             {
 804               INFOS("SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors problem: NBMAXNEIGHBORS=" <<NBMAXNEIGHBORS << " not enough");
 805               return nb;
 806             }
 807         }
 808       if (getSkin)
 809         {
 810           if (cellDim == 3 && nbUp == 1) // this face is on the skin of the volume
 811             {
 812               neighborsVtkIds[nb] = _downArray[cellType]->getVtkCellId(downId); // OK if skin present
 813               downIds[nb] = downId;
 814               downTypes[nb] = cellType;
 815               nb++;
 816               if (nb >= NBMAXNEIGHBORS)
 817                 {
 818                   INFOS("SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors problem: NBMAXNEIGHBORS=" <<NBMAXNEIGHBORS << " not enough");
 819                   return nb;
 820                 }
 821             }
 822         }
 823     }
 824   return nb;
 825 }
 826
 827 /*! get the volumes containing a face or an edge of the grid
 828  * The edge or face belongs to the vtkUnstructuredGrid
 829  * @param volVtkIds vector of parent volume ids to fill (reserve enough space!)
 830  * @param vtkId vtk id of the face or edge
 831  */
 832 int SMDS_UnstructuredGrid::GetParentVolumes(int* volVtkIds, int vtkId)
 833 {
 834   int vtkType = this->GetCellType(vtkId);
 835   int dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 836   int nbFaces = 0;
 837   unsigned char cellTypes[1000];
 838   int downCellId[1000];
 839   if (dim == 1)
 840     {
 841       int downId = this->CellIdToDownId(vtkId);
 842       if (downId < 0)
 843         {
 844           MESSAGE("Downward structure not up to date: new edge not taken into account");
 845           return 0;
 846         }
 847       nbFaces = _downArray[vtkType]->getNumberOfUpCells(downId);
 848       const int *upCells = _downArray[vtkType]->getUpCells(downId);
 849       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkType]->getUpTypes(downId);
 850       for (int i=0; i< nbFaces; i++)
 851         {
 852           cellTypes[i] = upTypes[i];
 853           downCellId[i] = upCells[i];
 854         }
 855     }
 856   else if (dim == 2)
 857     {
 858       nbFaces = 1;
 859       cellTypes[0] = this->GetCellType(vtkId);
 860       int downId = this->CellIdToDownId(vtkId);
 861       if (downId < 0)
 862         {
 863           MESSAGE("Downward structure not up to date: new face not taken into account");
 864           return 0;
 865         }
 866       downCellId[0] = downId;
 867     }
 868
 869   int nbvol =0;
 870   for (int i=0; i<nbFaces; i++)
 871     {
 872       int vtkTypeFace = cellTypes[i];
 873       int downId = downCellId[i];
 874       int nv = _downArray[vtkTypeFace]->getNumberOfUpCells(downId);
 875       const int *upCells = _downArray[vtkTypeFace]->getUpCells(downId);
 876       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkTypeFace]->getUpTypes(downId);
 877        for (int j=0; j<nv; j++)
 878         {
 879           int vtkVolId = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 880           if (vtkVolId >= 0)
 881             volVtkIds[nbvol++] = vtkVolId;
 882         }
 883     }
 884   return nbvol;
 885 }
 886
 887 /*! get the volumes containing a face or an edge of the downward structure
 888  * The edge or face does not necessary belong to the vtkUnstructuredGrid
 889  * @param volVtkIds vector of parent volume ids to fill (reserve enough space!)
 890  * @param downId id in the downward structure
 891  * @param downType type of cell
 892  */
 893 int SMDS_UnstructuredGrid::GetParentVolumes(int* volVtkIds, int downId, unsigned char downType)
 894 {
 895   int vtkType = downType;
 896   int dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 897   int nbFaces = 0;
 898   unsigned char cellTypes[1000];
 899   int downCellId[1000];
 900   if (dim == 1)
 901     {
 902       nbFaces = _downArray[vtkType]->getNumberOfUpCells(downId);
 903       const int *upCells = _downArray[vtkType]->getUpCells(downId);
 904       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkType]->getUpTypes(downId);
 905       for (int i=0; i< nbFaces; i++)
 906         {
 907           cellTypes[i] = upTypes[i];
 908           downCellId[i] = upCells[i];
 909         }
 910     }
 911   else if (dim == 2)
 912     {
 913       nbFaces = 1;
 914       cellTypes[0] = vtkType;
 915       downCellId[0] = downId;
 916     }
 917
 918   int nbvol =0;
 919   for (int i=0; i<nbFaces; i++)
 920     {
 921       int vtkTypeFace = cellTypes[i];
 922       int downId = downCellId[i];
 923       int nv = _downArray[vtkTypeFace]->getNumberOfUpCells(downId);
 924       const int *upCells = _downArray[vtkTypeFace]->getUpCells(downId);
 925       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkTypeFace]->getUpTypes(downId);
 926        for (int j=0; j<nv; j++)
 927         {
 928           int vtkVolId = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 929           if (vtkVolId >= 0)
 930             volVtkIds[nbvol++] = vtkVolId;
 931         }
 932     }
 933   return nbvol;
 934 }
 935
 936 /*! get the node id's of a cell.
 937  * The cell is defined by it's downward connectivity id and type.
 938  * @param nodeSet set of of vtk node id's to fill.
 939  * @param downId downward connectivity id of the cell.
 940  * @param downType type of cell.
 941  */
 942 void SMDS_UnstructuredGrid::GetNodeIds(std::set<int>& nodeSet, int downId, unsigned char downType)
 943 {
 944   _downArray[downType]->getNodeIds(downId, nodeSet);
 945 }
 946
 947 /*! change some nodes in cell without modifying type or internal connectivity.
 948  * Nodes inverse connectivity is maintained up to date.
 949  * @param vtkVolId vtk id of the cell
 950  * @param localClonedNodeIds map old node id to new node id.
 951  */
 952 void SMDS_UnstructuredGrid::ModifyCellNodes(int vtkVolId, std::map<int, int> localClonedNodeIds)
 953 {
 954   vtkIdType npts = 0;
 955   vtkIdType *pts; // will refer to the point id's of the face
 956   this->GetCellPoints(vtkVolId, npts, pts);
 957   for (int i = 0; i < npts; i++)
 958     {
 959       if (localClonedNodeIds.count(pts[i]))
 960         {
 961           vtkIdType oldpt = pts[i];
 962           pts[i] = localClonedNodeIds[oldpt];
 963           //MESSAGE(oldpt << " --> " << pts[i]);
 964           //this->RemoveReferenceToCell(oldpt, vtkVolId);
 965           //this->AddReferenceToCell(pts[i], vtkVolId);
 966         }
 967     }
 968 }
 969
 970 /*! reorder the nodes of a face
 971  * @param vtkVolId vtk id of a volume containing the face, to get an orientation for the face.
 972  * @param orderedNodes list of nodes to reorder (in out)
 973  * @return size of the list
 974  */
 975 int SMDS_UnstructuredGrid::getOrderedNodesOfFace(int vtkVolId, int& dim, std::vector<vtkIdType>& orderedNodes)
 976 {
 977   int vtkType = this->GetCellType(vtkVolId);
 978   dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 979   if (dim == 3)
 980     {
 981       SMDS_Down3D *downvol = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkType]);
 982       int downVolId = this->_cellIdToDownId[vtkVolId];
 983       downvol->getOrderedNodesOfFace(downVolId, orderedNodes);
 984     }
 985   // else nothing to do;
 986   return orderedNodes.size();
 987 }
 988
 989 void SMDS_UnstructuredGrid::BuildLinks()
 990 {
 991   // Remove the old links if they are already built
 992   if (this->Links)
 993     {
 994     this->Links->UnRegister(this);
 995     }
 996
 997   this->Links = SMDS_CellLinks::New();
 998   this->Links->Allocate(this->GetNumberOfPoints());
 999   this->Links->Register(this);
1000   this->Links->BuildLinks(this, this->Connectivity);
1001   this->Links->Delete();
1002 }
1003
1004 /*! Create a volume (prism or hexahedron) by duplication of a face.
1005  * Designed for use in creation of flat elements separating volume domains.
1006  * A face separating two domains is shared by two volume cells.
1007  * All the nodes are already created (for the two faces).
1008  * Each original Node is associated to corresponding nodes in the domains.
1009  * Some nodes may be duplicated for more than two domains, when domain separations intersect.
1010  * In that case, even some of the nodes to use for the original face may be changed.
1011  * @param vtkVolId: vtk id of a volume containing the face, to get an orientation for the face.
1012  * @param domain1: domain of the original face
1013  * @param domain2: domain of the duplicated face
1014  * @param originalNodes: the vtk node ids of the original face
1015  * @param nodeDomains: map(original id --> map(domain --> duplicated node id))
1016  * @return ok if success.
1017  */
1018 SMDS_MeshCell* SMDS_UnstructuredGrid::extrudeVolumeFromFace(int vtkVolId,
1019                                                   int domain1,
1020                                                   int domain2,
1021                                                   std::set<int>& originalNodes,
1022                                                   std::map<int, std::map<int, int> >& nodeDomains,
1023                                                   std::map<int, std::map<long, int> >& nodeQuadDomains)
1024 {
1025   //MESSAGE("extrudeVolumeFromFace " << vtkVolId);
1026   vector<vtkIdType> orderedOriginals;
1027   orderedOriginals.clear();
1028   set<int>::const_iterator it = originalNodes.begin();
1029   for (; it != originalNodes.end(); ++it)
1030     orderedOriginals.push_back(*it);
1031
1032   int dim = 0;
1033   int nbNodes = this->getOrderedNodesOfFace(vtkVolId, dim, orderedOriginals);
1034   vector<vtkIdType> orderedNodes;
1035
1036   bool isQuadratic = false;
1037   switch (orderedOriginals.size())
1038   {
1039     case 3:
1040       if (dim == 2)
1041         isQuadratic = true;
1042       break;
1043     case 6:
1044     case 8:
1045       isQuadratic = true;
1046       break;
1047     default:
1048       isQuadratic = false;
1049       break;
1050   }
1051
1052   if (isQuadratic)
1053     {
1054       long dom1 = domain1;
1055       long dom2 = domain2;
1056       long dom1_2; // for nodeQuadDomains
1057       if (domain1 < domain2)
1058         dom1_2 = dom1 + INT_MAX * dom2;
1059       else
1060         dom1_2 = dom2 + INT_MAX * dom1;
1061       //cerr << "dom1=" << dom1 << " dom2=" << dom2 << " dom1_2=" << dom1_2 << endl;
1062       int ima = orderedOriginals.size();
1063       int mid = orderedOriginals.size() / 2;
1064       //cerr << "ima=" << ima << " mid=" << mid << endl;
1065       for (int i = 0; i < mid; i++)
1066         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1067       for (int i = 0; i < mid; i++)
1068         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1069       for (int i = mid; i < ima; i++)
1070         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1071       for (int i = mid; i < ima; i++)
1072         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1073       for (int i = 0; i < mid; i++)
1074         {
1075           int oldId = orderedOriginals[i];
1076           int newId;
1077           if (nodeQuadDomains.count(oldId) && nodeQuadDomains[oldId].count(dom1_2))
1078             newId = nodeQuadDomains[oldId][dom1_2];
1079           else
1080             {
1081               double *coords = this->GetPoint(oldId);
1082               SMDS_MeshNode *newNode = _mesh->AddNode(coords[0], coords[1], coords[2]);
1083               newId = newNode->getVtkId();
1084               if (! nodeQuadDomains.count(oldId))
1085                 {
1086                   std::map<long, int> emptyMap;
1087                   nodeQuadDomains[oldId] = emptyMap;
1088                 }
1089               nodeQuadDomains[oldId][dom1_2] = newId;
1090             }
1091           orderedNodes.push_back(newId);
1092         }
1093     }
1094   else
1095     {
1096       for (int i = 0; i < nbNodes; i++)
1097         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1098       if (dim == 3)
1099         for (int i = 0; i < nbNodes; i++)
1100           orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1101       else
1102         for (int i = nbNodes-1; i >= 0; i--)
1103           orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1104
1105     }
1106
1107   if (dim == 3)
1108     {
1109       SMDS_MeshVolume *vol = _mesh->AddVolumeFromVtkIds(orderedNodes);
1110       return vol;
1111     }
1112   else if (dim == 2)
1113     {
1114       SMDS_MeshFace *face = _mesh->AddFaceFromVtkIds(orderedNodes);
1115       return face;
1116     }
1117
1118   // TODO update sub-shape list of elements and nodes
1119   return 0;
1120 }
1121
1122 //================================================================================
1123 /*!
1124  * \brief Allocates data array for ball diameters
1125  *  \param MaxVtkID - max ID of a ball element
1126  */
1127 //================================================================================
1128
1129 void SMDS_UnstructuredGrid::AllocateDiameters( vtkIdType MaxVtkID )
1130 {
1131   SetBallDiameter( MaxVtkID, 0 );
1132 }
1133
1134 //================================================================================
1135 /*!
1136  * \brief Sets diameter of a ball element
1137  *  \param vtkID - vtk id of the ball element
1138  *  \param diameter - diameter of the ball element
1139  */
1140 //================================================================================
1141
1142 void SMDS_UnstructuredGrid::SetBallDiameter( vtkIdType vtkID, double diameter )
1143 {
1144   vtkDoubleArray* array = vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() );
1145   if ( !array )
1146   {
1147     array = vtkDoubleArray::New();
1148     array->SetNumberOfComponents(1);
1149     vtkDataSet::CellData->SetScalars( array );
1150   }
1151   array->InsertValue( vtkID, diameter );
1152 }
1153
1154 //================================================================================
1155 /*!
1156  * \brief Returns diameter of a ball element
1157  *  \param vtkID - vtk id of the ball element
1158  */
1159 //================================================================================
1160
1161 double SMDS_UnstructuredGrid::GetBallDiameter( vtkIdType vtkID ) const
1162 {
1163   if ( vtkDataSet::CellData )
1164     return vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() )->GetValue( vtkID );
1165   return 0;
1166 }
1167