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Updated GUI documentation
[tools/solverlab.git] / README.md
index d93202988d5f604915206ad197242e90476fd90d..d9eaa9c5804fff7379ba45e37b925c5e19671974 100755 (executable)
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -25,7 +25,7 @@ The main research objectives of SOLVERLAB are the study of
 - New preconditioners for implicit methods for two phase flows
 - The coupling of fluid models or multiphysics coupling (eg thermal hydraulics and neutronics or thermal hydraulics and solid thermics)
 
-The library is currently maintained and distributed by the SALOME developpement team on various linux distributions (Ubuntu, CentOS, Fedora, Debian) and on Windows10.
+The library is currently maintained and distributed by the SALOME developpement team on various linux distributions (Ubuntu, CentOS, Fedora, Debian) and on Windows-10.
 The corresponding binary files can be found  [here](https://www.salome-platform.org/downloads/current-version).
 
 Examples of use
@@ -41,14 +41,16 @@ Examples of use
 - [Surface Finite elements for the Poisson-Beltrami problem on a sphere in 3D (by M. Nguemfouo, PhD student)](CDMATH/tests/doc/3DPoissonSphereEF/SynthesisConvergenceFESphere.pdf)
 - [Surface Finite elements for the Poisson-Beltrami problem on a torus in 3D (by M. Nguemfouo, PhD student)](CDMATH/tests/doc/3DPoissonTorusEF/SynthesisConvergenceFETorus.pdf)
 
-Download SOLVERLABĀ sources to compile
+Download SOLVERLABĀ sources for compilation
 ----------------------------------
+The easiest way to use SOLVERLAB is to download the SALOME binary file corresponding to your operating system [here](https://www.salome-platform.org/downloads/current-version).
+However the binary file can be very large (up to 5GB). Compilation of SOLVERLAB from source files can provide a better alternative using less disk and memory space.
 
-Create your source directory. For instance:
+To compile SOLVERLAB source, first create a source directory, for instance with:
 * `mkdir ~/workspace/SOLVERLAB`
 * `cd ~/workspace/SOLVERLAB`
 
-Download from GitHub
+Download SOLVERLAB source from GitHub
 * click on the following link : `https://github.com/ndjinga/SOLVERLAB/archive/master.zip`, then unzip the file in a directory SOLVERLAB-master
 * or type the following in a terminal : `wget https://github.com/ndjinga/SOLVERLAB/archive/master.zip`, then unzip the file in a directory SOLVERLAB-master
 * or clone the git repository to a folder SOLVERLAB-master:  `git clone https://github.com/ndjinga/SOLVERLAB.git SOLVERLAB-master`
@@ -56,14 +58,15 @@ Download from GitHub
 
 Set the environment for the compilation of SOLVERLAB
 ---------------------------------------------
-Dependencies. The following package list is sufficient on Ubuntu 14.04, Ubuntu 16.04, Ubuntu 18.04 :
+Dependencies. The following package list is sufficient on Ubuntu 20.04 :
 
  - `cmake3` (mandatory)
  - `g++` or another C++ compiler (mandatory)
- - `python-dev`, `python-numpy` and `swig3`for python scripts (mandatory)
- - `python-matplotlib` and `paraview` for postprocessing tools such as plotting curves (matplotlib) or generating 3D view images (paraview) (mandatory)
+ - `python3-dev`, `python3-numpy` and `swig3`for python scripts (mandatory)
+ - `pyqt5-dev-tools` to generate the Graphical User Interface (optional)
+ - `python3-matplotlib`, `paraview-dev`, `libnetcdf-dev` (on Ubuntu 20.04) and `python3-paraview` for postprocessing tools such as plotting curves (matplotlib) or generating 3D view images (paraview) (optional)
  - `ffmpeg` and `ffmpeg-devel` to generate an animation from a set of curves (optional)
- - `doxygen`, `graphviz` and `mscgen`, if you want to generate a nice source code documentation in `~/workspace/SOLVERLAB/SOLVERLAB_install/share/doc/`. Use the compilation option `-DSOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION=ON` (optional).
+ - `python3-sphinx` for the GUI documentation, and `doxygen`, `graphviz` and `mscgen` to generate a developper documentation. Use the compilation option `-DSOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION=ON` (optional).
  - `libcppunit-dev`, if you want to generate unit tests. Use the compilation option `-DSOLVERLAB_WITH_TESTS=ON` (optional).
  - `rpm`, if you want to generate RPM installation packages. Use the compilation option `-DSOLVERLAB_WITH_PACKAGE=ON` (optional).
 
@@ -77,22 +80,22 @@ Directories. Create the suggested build and installation folders:
 Compile and install SOLVERLAB
 --------------------------
 Simpler build for a minimum version:
-* `cmake ../SOLVERLAB-master/ -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=../SOLVERLAB_install -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release `  
+* `cmake ../SOLVERLAB-master/ -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=../SOLVERLAB_install -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DSOLVERLAB_WITH_GUI=ON -DSOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION=ON `  
 > This will download and build the following dependencies
-> - PETSc from http://ftp.mcs.anl.gov/pub/petsc/release-snapshots/petsc-3.15.0.tar.gz
-> - SLEPc from https://slepc.upv.es/download/distrib/slepc-3.15.0.tar.gz
+> - PETSc from http://ftp.mcs.anl.gov/pub/petsc/release-snapshots/petsc-3.16.0.tar.gz
+> - SLEPc from https://slepc.upv.es/download/distrib/slepc-3.16.0.tar.gz
 > - F2CBLASLAPACK from http://ftp.mcs.anl.gov/pub/petsc/externalpackages/f2cblaslapack-3.4.2.q4.tar.gz
 > - HDF5 https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.10/hdf5-1.10.3/src/hdf5-1.10.3.tar.gz
 > - MEDFILE from http://files.salome-platform.org/Salome/other/med-4.1.0.tar.gz
 > - MEDCOUPLING from http://files.salome-platform.org/Salome/other/medCoupling-9.7.0.tar.gz
 
-If you already have an installation of PETSC, MED and MEDCoupling, you may save computational time and memory by using the advanced build version:
-* `cmake ../SOLVERLAB-master -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=../SOLVERLAB_install -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -G"Eclipse CDT4 - Unix Makefiles" -D_ECLIPSE_VERSION=4.3 -DSOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION=ON -DPETSC_DIR=${PETSC_DIR} -DPETSC_ARCH=${PETSC_ARCH} -DMEDFILE_ROOT_DIR=${MEDFILE_ROOT_DIR} -DMEDCOUPLING_ROOT_DIR=${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}`  
+If you already have an installation of PETSC, MED and MEDCoupling, you may save computational time and memory by using the following cmake instruction:
+* `cmake ../SOLVERLAB-master -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=../SOLVERLAB_install -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -G"Eclipse CDT4 - Unix Makefiles" -D_ECLIPSE_VERSION=4.3 -DSOLVERLAB_WITH_DOCUMENTATION=ON -DPETSC_DIR=${PETSC_DIR} -DPETSC_ARCH=${PETSC_ARCH} -DMEDFILE_ROOT_DIR=${MEDFILE_ROOT_DIR} -DMEDCOUPLING_ROOT_DIR=${MEDCOUPLING_ROOT_DIR}  -DSOLVERLAB_WITH_GUI=ON`  
 > This assumes that you have an existing 
-> - install of PETSc (with submodules SLEPC and HDF5) at the location given by the environment variable PETSC_DIR and the architecture variable PETSC_ARCH  
+> - installation of PETSc (with submodules SLEPC and HDF5) at the location given by the environment variable PETSC_DIR and the architecture variable PETSC_ARCH  
 > See the instructions given in [the official documentation](http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/installation.html)
-> - install of MED                                    at the location given by the environment variable MEDFILE_ROOT_DIR
-> - install of MEDCOUPLING                            at the location given by the environment variable MEDCOUPLING_ROOT_DIR
+> - installation of MED                                    at the location given by the environment variable MEDFILE_ROOT_DIR
+> - installation of MEDCOUPLING                            at the location given by the environment variable MEDCOUPLING_ROOT_DIR
 
 The 3 dependencies PETSC, MED and MEDCOUPLING should have been compiled with the same version of HDF5  
 Warning : the linux package libhdf5-dev is generally not compatible with the libraries MED and MEDCoupling  
@@ -101,7 +104,7 @@ Compile and install:
 * `make install`
 
 Run unit and example tests:
-* make example
+* make examples
 
 Run validation tests:
 * make validation
@@ -115,10 +118,15 @@ Generate documentation of CoreFlows module
 Use of SOLVERLAB
 -------------
 
-To use SOLVERLAB with your Python code, you can load the SOLVERLAB environment in your terminal using the command
+To use SOLVERLAB in your Python code `main.py `, you can load the SOLVERLAB environment in your terminal using the command
  * source `~/workspace/SOLVERLAB/SOLVERLAB_install/env_SOLVERLAB.sh`
 Then in your terminal simply type
-- `python main.py `
+- `python3 main.py `
+
+To use the Graphical User Interface of SOLVERLAB, you can load the SOLVERLAB environment in your terminal using the command
+ * source `~/workspace/SOLVERLAB/SOLVERLAB_install/env_SOLVERLAB.sh`
+Then in your terminal simply type
+- `python3 $SOLVERLABGUI `
 
 If performance or parallelism is an issue for your simulations, you can use SOLVERLAB librairies with your C++ code :
  * C++ libraries: `export LD_LIBRARY_PATH=~/workspace/SOLVERLAB/SOLVERLAB_install/lib`