Fix configure problem (caused by previous integration).
AC_PROG_MKDIR_P is not available for autoconf 2.59 (Debian Sarge, Mandriva 2006)

inline TCollection_AsciiString ElementTypeString (SMESH::ElementType theElemType)
{
...
+    CASE2STRING( ELEM0D );

Patch for the generation of the documentation

0021015: EDF 1578 SMESH: Free nodes are removed when translating a mesh
 * Pass empty set of elements if the whole mesh is to be transformed
 * Fix incorrect treatment of groups of nodes
 * Call SMESH_MeshEditor::Transform() from Scale*()

0021015: EDF 1578 SMESH: Free nodes are removed when translating a mesh
 * Treate orphan nodes in Transform()
 * Remove Scale() as being a paricular case of Transform()

-            theObject = self.editor.MakeIDSource(theObject)
+            theObject = self.editor.MakeIDSource(theObject, SMESH.ALL)

improve comment for Scale

0021016: [CEA] non regression test KO
  Implement
      SMDS_ElemIteratorPtr Q2TAdaptor_Triangle::elementsIterator(SMDSAbs_ElementType type) const

0021012: [CEA] Different names between GUI and TUI function

-#include "SMDS_FaceOfNodes.hxx"

0021006: EDF 1546 SMESH : Convert To Quadratic fails

+  const SMDS_MeshNode* getMediumNodeOnComposedWire(const SMDS_MeshNode* n1,
+                                                   const SMDS_MeshNode* n2,
+                                                   bool                 force3d);

RNC: Completed the documentation of GetElementsByType with the values taken by ElementType

Merge from BR_pypkg (python packaging)

RNC: Fixed documentation of SetGeometricMesh
Parameter theGeometricMesh takes the value 0 or 1

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
   One more redesign

Remove unused method

-  bool emptyInverseElements();

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

Improve dialog box's layout

Remove compilation warning

EDF 1575 SMESH: Filters and precision preferences

Fix crash in Length2D::GetValues() and MultiConnection2D::GetValues() methods.

Hack libtool (!) to workaround problem with wrong linkage of native libraries

issue 0020959: HEXA_3D fails on shell
   Fix DependsOn() for a not-closed SHELL not in SOLID

0020986: EDF 1557 SMESH: Convert to quadratic with medium node on geometry fails on a GHS3D mesh
   Optimize FixQuadraticElements()

0020996: EDF 1549 SMESH: Projection 1D/2D algorithms fail
   implement FindFaceAssociation() by UV correspondence which is used
   in case if correspondent vertices belong to inner wires

GDD:
- fix documentation of ConvertToQuadratic (inform about theForce3d parameter)
- New function PrintDoubleValue added in PluginUtils

0020996: EDF 1549 SMESH: Projection 1D/2D algorithms fail
   Fix FindFaceAssociation():
     1) exit from loop on outer_wire_algo as soon as solution is found
     2) treat edges of inner wires

Correct name of an argument

   static int GetOrderedEdges (const TopoDS_Face&        theFace,
                               TopoDS_Vertex             theFirstVertex,
                               std::list< TopoDS_Edge >& theEdges,
-                              std::list< int >  &       theNbVertexInWires,
+                              std::list< int >  &       theNbEdgesInWires,
                               const bool                theShapeAnalysisAlgo=false);

Issue 0020226: [CEA 329] Invalid glyphs position in vector fields on polyhedrons cell.

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
-    if ( !subMeshId )
+    if ( !subMeshId && ! _impl->GetMeshDS()->IsGroupOfSubShapes( myLocSubShape ))
       THROW_SALOME_CORBA_EXCEPTION("not sub-shape of the main shape", SALOME::BAD_PARAM);

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
   Fix fillAncestorsMap(theShape) for the case if a sub-shape of
   theShape is not in _mapAncestors

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
    Move all checks of shape validity from AddCompoundSubmesh() to IsGroupOfSubShapes()

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids

   bool IsLinked (const SMDS_MeshNode* theNode1,
                  const SMDS_MeshNode* theNode2,
+                 const bool           theIgnoreMediumNodes=false) const;
   // Return true if theNode1 is linked with theNode2.
+  // If theIgnoreMediumNodes then corner nodes of quadratic cell are considered linked as well

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
   Replace VTK_CONVEX_POINT_SET with VTK_QUADRATIC_PYRAMID

0020983: EDF 1569 SMESH: Numbering Display Elements with several groups selected does not work

indentation

0020876: EDF 1246 SMESH: DoubleNodes fonctions available in the GUI
  Add an argument to DoubleNodeXXX() creating groups

0020876: EDF 1246 SMESH: DoubleNodes fonctions available in the GUI
  No need in new commands in smeshDC.py, so DoubleNodeXXXNew() is replaced by DoubleNodeXXX()

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

     ## Finds groups of ajacent nodes within Tolerance.
     #  @param Tolerance the value of tolerance
     #  @param SubMeshOrGroup SubMesh or Group
+    #  @param exceptNodes list of either SubMeshes, Groups or node IDs to exclude from search
     #  @return the list of groups of nodes
     #  @ingroup l2_modif_trsf
-    def FindCoincidentNodesOnPart (self, SubMeshOrGroup, Tolerance):
+    def FindCoincidentNodesOnPart (self, SubMeshOrGroup, Tolerance, exceptNodes=[]):

Use TIDSortedNodeSet instead of set< const SMDS_MeshNode*> when looking for coincident nodes

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

+  /*!
+   * Returns types of elements it contains
+   */
+  virtual SMESH::array_of_ElementType* GetTypes();

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

+    TPythonDump&
+    operator<<(const SMESH::ListOfIDSources& theList);
+

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

+  // set "FindCoincidentNodesOnPart()" instead of "FindCoincidentNodesOnPartBut()"
+  if ( !isPyMeshMethod && method == "FindCoincidentNodesOnPartBut")
+  {
+    isPyMeshMethod=true;
+    theCommand->SetMethod("FindCoincidentNodesOnPart");
+  }

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

interface SMESH_MeshEditor
{
-    SMESH_IDSource MakeIDSource(in long_array IDsOfElements);
+    SMESH_IDSource MakeIDSource(in long_array IDsOfElements, in ElementType type);

+    void FindCoincidentNodesOnPartBut (in  SMESH_IDSource      SubMeshOrGroup,
+                                       in  double              Tolerance,
+                                       out array_of_long_array GroupsOfNodes,
+                                       in  ListOfIDSources     ExceptSubMeshOrGroups);
+

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

-    SMESH_IDSource MakeIDSource(in long_array IDsOfElements);
+    SMESH_IDSource MakeIDSource(in long_array IDsOfElements, in ElementType type);

+    void FindCoincidentNodesOnPartBut (in  SMESH_IDSource      SubMeshOrGroup,
+                                       in  double              Tolerance,
+                                       out array_of_long_array GroupsOfNodes,
+                                       in  ListOfIDSources     ExceptSubMeshOrGroups);
+

+  interface SMESH_IDSource;
+  typedef sequence<SMESH_IDSource> ListOfIDSources;

+  typedef sequence<ElementType> array_of_ElementType ;

  interface SMESH_IDSource
  {
+
+    /*!
+     * Returns types of elements it contains
+     */
+    array_of_ElementType GetTypes();
   };

rename SMESHGUI_EditMeshDlg to SMESHGUI_MergeDlg

Use TIDSortedNodeSet instead of set< const SMDS_MeshNode*> when looking for coincident nodes

+typedef std::set< const SMDS_MeshNode*,    TIDCompare >      TIDSortedNodeSet;

WinTC5.1.4: Application crash after open Linux study

0020082: EDF 869 GEOM : Edges Orientation indicator/reverse

GDD: Some mispell corrections

use linked nodes to get an upward direction when defining orientation

0020968: EDF1545 SMESH: Problem in de creation of a mesh group on geometry
   Detect not computed sub-shapes in case if algo computes many
   submeshes at once

0020963: EDF 1528 SMESH: How to combine Netgen1D2D with sizemap with Quadrangle(Mapping) ?

-              sm->ComputeStateEngine(SMESH_subMesh::COMPUTE);
+              _gen->Compute( theMesh, _mainEdge, /*anUpward=*/true);

sm->ComputeStateEngine() fails if vertices it depends on are not yet created

improve comment

 bool SMESH_HypoFilter::IsMoreLocalThanPredicate::IsOk(const SMESH_Hypothesis* aHyp,
                                                       const TopoDS_Shape&     aShape) const
 {
+  // issue 0020963
+  // if aShape is COMPOUND (i.e. most probably a GEOM group) then
+  // it is more local if it contains shapes of less dimension than _shapeType
+  ...

0020959: EDF 1531: HEXA_3D fails on shell

in DependsOn(), do not make a sub-mesh of a not closed SHELL

SALOME internationalization: add textual resources for French language

SALOME internationalization: add textual resources for French language

untabify

Fix dump python of DoubleNode*()

Fix TPythonDump::operator<<(const SMESH::ListOfGroups& theList) for an empty list

Fix for imp 0020876: EDF 1246 SMESH: DoubleNodes fonctions available in the GUI.

Issue: 0020935: A group created with a type of element criteria is empty
- Improve documentation for the filters functionality

Issue: 0020935: A group created with a type of element criteria is empty
- Fix some filters bugs in Python API

Avoid doxygen warnings

0020958: EDF 1529 SMESH : If some faces have been meshed with small
quadrangles Netgen 3D creates pyramids with volume zero and fails

   bool CheckIntersection(const gp_Pnt& P, const gp_Pnt& PC,
                          gp_Pnt& Pint, SMESH_Mesh& aMesh,
                          const TopoDS_Shape& aShape,
-                         const TopoDS_Shape& NotCheckedFace);
+                         const SMDS_MeshElement* NotCheckedFace);

Fix for SIGSEGV on Mandriva2008 in optimize mode only
==21300== Invalid read of size 4
==21300==    at 0x1445EA23: StdMeshers_Penta_3D::MakeVolumeMesh() (StdMeshers_Penta_3D.cxx:681)

  while (aItNodes->more()) {

It seems to be an error of optimization, aItNodes.px becomes invalid
before aItNodes->more() returns false but after the loop code is
performed for the last time.

remove debug output

0020958: EDF 1529 SMESH : If some faces have been meshed with small
quadrangles Netgen 3D creates pyramids with volume zero and fails

* Fix HasIntersection3(): use reasonable tolerances
* Improve performace using SMESH_ElementSearcher

fix removing from the std::map being iterated over

0020958: EDF 1529 SMESH : If some faces have been meshed with small
quadrangles Netgen 3D creates pyramids with volume zero and fails

struct SMESH_ElementSearcher
{
+  /*!
+   * \brief Return elements possibly intersecting the line
+   */
+  virtual void GetElementsNearLine( const gp_Ax1&                           line,
+                                    SMDSAbs_ElementType                     type,
+                                    std::vector< const SMDS_MeshElement* >& foundElems)=0;

Implement iteration in id increasing order

-  SMDS_NodeIteratorPtr nodesIterator(bool idInceasingOrder=false) const;
-  SMDS_0DElementIteratorPtr elements0dIterator() const;
-  SMDS_EdgeIteratorPtr edgesIterator() const;
-  SMDS_FaceIteratorPtr facesIterator() const;
-  SMDS_VolumeIteratorPtr volumesIterator() const;
+  SMDS_NodeIteratorPtr nodesIterator          (bool idInceasingOrder=false) const;
+  SMDS_0DElementIteratorPtr elements0dIterator(bool idInceasingOrder=false) const;
+  SMDS_EdgeIteratorPtr edgesIterator          (bool idInceasingOrder=false) const;
+  SMDS_FaceIteratorPtr facesIterator          (bool idInceasingOrder=false) const;
+  SMDS_VolumeIteratorPtr volumesIterator      (bool idInceasingOrder=false) const;

avoid unused variables in release mode

fix the case of already meshed sole straight edge

0020855: [CEA] Problem with ijk algo
     find out orientation by a least distorted hexahedron

-theFileName = thePath + "/Shapes/Brep/slots.brep"
+theFileName = os.path.join( thePath,"Shapes","Brep","slots.brep")

0020955: EDF 1493 SMESH: Bad import of .unv file
  * Complete the set of readable 2D elements

Remove unused variables

0020951: EDF 1501 SMESH: Conversion linear/quadratic with medium nodes on geometry fails with GHS3D
 * Fix splitTrianglesIntoChains()

0020951: EDF 1501 SMESH: Conversion linear/quadratic with medium nodes on geometry fails with GHS3D
 * Fix for usecase: open the atached study, convert Mesh_1 from
   quadratic, unassign GHS3D algo -> SIGSEGV. Reason is that the same
   SMDS_SpacePosition is shared by all nodes in different solids.

untabify

0020951: EDF 1501 SMESH: Conversion linear/quadratic with medium nodes on geometry fails with GHS3D
 * Fix GetNodeUV() for a node on seam edge: enable projection of node in face
 * Fix GetMediumNode(): set a node in volume #1 as well
 * Fix QFace::GetLinkChain(), case of triangles

Additional fix for issue 20755

0020920: EDF 1478 SMESH: Conversion linear to quadratic fails (BLSURF Mesh)
 * fix FixQuadraticElements(): ignore internal chains

0020919: EDF 1472 SMESH: Linear to quadratic conversion fails with hexaedron algorithm
 * fix FixQuadraticElements()

improve comment

Patch from Anthony to be compliant with MED

untabify

Issue 0020921: EDF 1462 SMESH: Regression in 5.1.4. a quadrangle meshing fails

0020742: EDF 1270 SMESH : Delete Group with contents and remove Orphan Nodes

windows port

IPAL21820 TC6.1.0: Lost new nodes

IPAL21831 Can't load the Python dump after Export to MED

Bug IPAL21801: preferences for SMESH: color of Group name text should be added
EDF 703 SMESH VISU : Display Mesh Groups names in viewer (as a caption)
Additional fix: add preferences for the names groups color

0020752: EDF 1303 SMESH : Add a 'Select All' button in Create Group dialog box

Mantis issue 0020812: Register() and Destroy() of the GenericObj.

Improve documentation generation mechanism

Issue 0020755: EDF 1279 MESH : 'Mesh to Pass Through a Point' enhancement

Fix bug of NodeSearcher: search fails if point is outside the mesh on the distance more than octree node precision value. Version 2 with improved performance.