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23514: EDF 16031 - SMESH freezes
[modules/smesh.git] / src / SMESH_I / SMESH_PreMeshInfo.cxx
index db4a1779073d950e25d43722324a598494b46ca3..c7e753d89c3d5f9cda95af08eb166be2aa8b14c6 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-// Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+// Copyright (C) 2007-2016  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
 //
 // Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
 // CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
@@ -6,7 +6,7 @@
 // This library is free software; you can redistribute it and/or
 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
 // License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License.
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
 //
 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
 
 #include "SMESH_PreMeshInfo.hxx"
 
+#include "DriverMED.hxx"
 #include "DriverMED_R_SMESHDS_Mesh.h"
+#include "MED_Factory.hxx"
 #include "SMDS_EdgePosition.hxx"
 #include "SMDS_FacePosition.hxx"
 #include "SMDS_SpacePosition.hxx"
 #include "SMDS_VertexPosition.hxx"
 #include "SMESHDS_Group.hxx"
 #include "SMESHDS_GroupOnFilter.hxx"
+#include "SMESHDS_Mesh.hxx"
 #include "SMESH_Gen_i.hxx"
 #include "SMESH_Group_i.hxx"
 #include "SMESH_Mesh_i.hxx"
 #include "SMESH_subMesh_i.hxx"
 
-#include <MED_Factory.hxx>
-
 #include <HDFarray.hxx>
 #include <HDFdataset.hxx>
 #include <HDFfile.hxx>
@@ -54,6 +55,7 @@
 
 #include CORBA_SERVER_HEADER(SALOME_Session)
 
+using namespace std;
 
 #define MYDEBUGOUT(msg) //std::cout << msg << std::endl;
 
@@ -62,7 +64,7 @@ namespace
   enum {  GroupOnFilter_OutOfDate = -1 };
 
   // a map to count not yet loaded meshes 
-  static map< int, int > theStudyIDToMeshCounter;
+  static std::map< int, int > theStudyIDToMeshCounter;
 
   //================================================================================
   /*!
@@ -72,8 +74,8 @@ namespace
 
   void meshInfoLoaded( SMESH_Mesh_i* mesh )
   {
-    map< int, int >::iterator id2counter =
-      theStudyIDToMeshCounter.insert( make_pair( (int) mesh->GetStudyId(), 0 )).first;
+    std::map< int, int >::iterator id2counter =
+      theStudyIDToMeshCounter.insert( std::make_pair( (int) mesh->GetStudyId(), 0 )).first;
     id2counter->second++;
   }
   //================================================================================
@@ -88,7 +90,7 @@ namespace
   {
     if ( --theStudyIDToMeshCounter[ (int) mesh->GetStudyId() ] == 0 )
     {
-      string tmpDir = SALOMEDS_Tool::GetDirFromPath( hdfFile );
+      std::string tmpDir = SALOMEDS_Tool::GetDirFromPath( hdfFile );
 
       SALOMEDS::ListOfFileNames_var aFiles = new SALOMEDS::ListOfFileNames;
       aFiles->length(2);
@@ -109,7 +111,7 @@ namespace
 
   class SignalToGUI
   {
-    string              _messagePrefix;
+    std::string         _messagePrefix;
     SALOME::Session_var _session;
   public:
     SignalToGUI( SMESH_Mesh_i* mesh )
@@ -127,7 +129,7 @@ namespace
           _messagePrefix = "SMESH/mesh_loading/";
           _messagePrefix += meshEntry.in();
 
-          string msgToGUI = _messagePrefix + "/";
+          std::string msgToGUI = _messagePrefix + "/";
           msgToGUI += SMESH_Comment( mesh->NbNodes() );
           msgToGUI += "/";
           msgToGUI += SMESH_Comment( mesh->NbElements() );
@@ -140,7 +142,7 @@ namespace
     {
       if ( !_messagePrefix.empty() )
       {
-        string msgToGUI = _messagePrefix + "/stop";
+        std::string msgToGUI = _messagePrefix + "/stop";
         _session->emitMessageOneWay( msgToGUI.c_str());
         _messagePrefix.clear();
       }
@@ -173,7 +175,7 @@ namespace
     SMDS_PositionPtr vertexPosition()  const { return SMDS_PositionPtr( new SMDS_VertexPosition); }
     SMDS_PositionPtr defaultPosition() const { return SMDS_SpacePosition::originSpacePosition();  }
     typedef SMDS_PositionPtr (PositionCreator:: * FmakePos)() const;
-    vector<FmakePos> myFuncTable;
+    std::vector<FmakePos> myFuncTable;
   };
 
   //================================================================================
@@ -182,12 +184,12 @@ namespace
    */
   //================================================================================
 
-  vector<int> getSimpleSubMeshIds( SMESHDS_Mesh* meshDS, int shapeId )
+  std::vector<int> getSimpleSubMeshIds( SMESHDS_Mesh* meshDS, int shapeId )
   {
-    vector<int> ids;
+    std::vector<int> ids;
 
-    list<TopoDS_Shape> shapeQueue( 1, meshDS->IndexToShape( shapeId ));
-    list<TopoDS_Shape>::iterator shape = shapeQueue.begin();
+    std::list<TopoDS_Shape> shapeQueue( 1, meshDS->IndexToShape( shapeId ));
+    std::list<TopoDS_Shape>::iterator shape = shapeQueue.begin();
     for ( ; shape != shapeQueue.end(); ++shape )
     {
       if ( shape->IsNull() ) continue;
@@ -222,59 +224,23 @@ namespace
    */
   //================================================================================
 
-  typedef map< MED::EGeometrieElement, SMDSAbs_EntityType > Tmed2smeshElemTypeMap;
+  typedef std::map< MED::EGeometrieElement, SMDSAbs_EntityType > Tmed2smeshElemTypeMap;
   const Tmed2smeshElemTypeMap& med2smeshElemTypeMap()
   {
-    static map< MED::EGeometrieElement, SMDSAbs_EntityType> med2smeshTypes;
+    static Tmed2smeshElemTypeMap med2smeshTypes;
     if ( med2smeshTypes.empty() )
     {
-      med2smeshTypes[ MED::ePOINT1   ] = SMDSEntity_0D                ;
-      med2smeshTypes[ MED::eSEG2     ] = SMDSEntity_Edge              ;
-      med2smeshTypes[ MED::eSEG3     ] = SMDSEntity_Quad_Edge         ;
-      med2smeshTypes[ MED::eTRIA3    ] = SMDSEntity_Triangle          ;
-      med2smeshTypes[ MED::eTRIA6    ] = SMDSEntity_Quad_Triangle     ;
-      med2smeshTypes[ MED::eQUAD4    ] = SMDSEntity_Quadrangle        ;
-      med2smeshTypes[ MED::eQUAD8    ] = SMDSEntity_Quad_Quadrangle   ;
-      med2smeshTypes[ MED::eQUAD9    ] = SMDSEntity_BiQuad_Quadrangle ;
-      med2smeshTypes[ MED::eTETRA4   ] = SMDSEntity_Tetra             ;
-      med2smeshTypes[ MED::ePYRA5    ] = SMDSEntity_Pyramid           ;
-      med2smeshTypes[ MED::ePENTA6   ] = SMDSEntity_Penta             ;
-      med2smeshTypes[ MED::eHEXA8    ] = SMDSEntity_Hexa              ;
-      med2smeshTypes[ MED::eOCTA12   ] = SMDSEntity_Hexagonal_Prism   ;
-      med2smeshTypes[ MED::eTETRA10  ] = SMDSEntity_Quad_Tetra        ;
-      med2smeshTypes[ MED::ePYRA13   ] = SMDSEntity_Quad_Pyramid      ;
-      med2smeshTypes[ MED::ePENTA15  ] = SMDSEntity_Quad_Penta        ;
-      med2smeshTypes[ MED::eHEXA20   ] = SMDSEntity_Quad_Hexa         ;
-      med2smeshTypes[ MED::eHEXA27   ] = SMDSEntity_TriQuad_Hexa      ;
-      med2smeshTypes[ MED::ePOLYGONE ] = SMDSEntity_Polygon           ;
-      med2smeshTypes[ MED::ePOLYEDRE ] = SMDSEntity_Polyhedra         ;
-      med2smeshTypes[ MED::eNONE     ] = SMDSEntity_Node              ;
-      med2smeshTypes[ MED::eBALL     ] = SMDSEntity_Ball              ;
+      for  ( int iG = 0; iG < SMDSEntity_Last; ++iG )
+      {
+        SMDSAbs_EntityType    smdsType = (SMDSAbs_EntityType) iG;
+        MED::EGeometrieElement medType =
+          (MED::EGeometrieElement) DriverMED::GetMedGeoType( smdsType );
+        med2smeshTypes.insert( std::make_pair( medType, smdsType ));
+      }
     }
     return med2smeshTypes;
   }
 
-  //================================================================================
-  /*!
-   * \brief Return a vector<MED::EGeometrieElement> intended to retrieve
-   *        MED::EGeometrieElement by SMDSAbs_EntityType
-   */
-  //================================================================================
-
-  const vector<MED::EGeometrieElement>& mesh2medElemType()
-  {
-    static vector<MED::EGeometrieElement> mesh2medElemTypes;
-    if ( mesh2medElemTypes.empty() )
-    {
-      mesh2medElemTypes.resize( SMDSEntity_Last + 1 );
-      Tmed2smeshElemTypeMap::const_iterator me2sme    = med2smeshElemTypeMap().begin();
-      Tmed2smeshElemTypeMap::const_iterator me2smeEnd = med2smeshElemTypeMap().end();
-      for ( ; me2sme != me2smeEnd; ++me2sme )
-        mesh2medElemTypes[ me2sme->second ] = me2sme->first;
-    }
-    return mesh2medElemTypes;
-  }
-
   //================================================================================
   /*!
    * \brief Writes meshInfo into a HDF file
@@ -285,17 +251,17 @@ namespace
                      const std::string&    name,
                      HDFgroup*             hdfGroup)
   {
-    // we use med identification of element (MED::EGeometrieElement>) types
+    // we use med identification of element (MED::EGeometrieElement) types
     // but not enum SMDSAbs_EntityType because values of SMDSAbs_EntityType may
     // change at insertion of new items in the middle.
-    const vector<MED::EGeometrieElement>& medTypes = mesh2medElemType();
+    //const vector<MED::EGeometrieElement>& medTypes = mesh2medElemType();
 
-    vector<int> data;
+    std::vector<int> data;
 
     for ( size_t i = 0; i < meshInfo->length(); ++i )
       if ( meshInfo[i] > 0 )
       {
-        data.push_back( medTypes[ i ] );
+        data.push_back( DriverMED::GetMedGeoType( SMDSAbs_EntityType( i ))); //medTypes[ i ] );
         data.push_back( meshInfo[ i ] );
       }
 
@@ -321,10 +287,12 @@ namespace
  */
 //================================================================================
 
-void SMESH_PreMeshInfo::hdf2meshInfo( const std::string& name,
-                                      HDFgroup*          hdfGroup)
+void SMESH_PreMeshInfo::hdf2meshInfo( const std::string&              name,
+                                      HDFgroup*                       hdfGroup,
+                                      const TColStd_MapOfAsciiString& allHdfNames)
 {
-  if ( hdfGroup->ExistInternalObject( name.c_str()) )
+  //if ( hdfGroup->ExistInternalObject( name.c_str()) ) PAL23514
+  if ( allHdfNames.Contains( name.c_str() ))
   {
     HDFdataset* dataset = new HDFdataset( name.c_str(), hdfGroup );
     dataset->OpenOnDisk();
@@ -334,7 +302,7 @@ void SMESH_PreMeshInfo::hdf2meshInfo( const std::string& name,
     // // array->GetDim( datasetSize );
     // int size = dataset->GetSize();
 
-    vector<int> info( SMDSEntity_Last * 2, 0 );
+    std::vector<int> info( SMDSEntity_Last * 2, 0 );
     dataset->ReadFromDisk( &info[0] );
     dataset->CloseOnDisk();
 
@@ -453,7 +421,17 @@ bool SMESH_PreMeshInfo::readPreInfoFromHDF()
     HDFgroup* infoHdfGroup = new HDFgroup( hdfGroupName, aFile );
     infoHdfGroup->OpenOnDisk();
 
-    _mesh->changePreMeshInfo()->hdf2meshInfo( "Mesh", infoHdfGroup );
+    // PAL23514: get all names from the HDFgroup to avoid iteration on its contents
+    // within aGroup->ExistInternalObject( name )
+    TColStd_MapOfAsciiString mapOfNames;
+    {
+      std::vector< std::string > subNames;
+      infoHdfGroup->GetAllObjects( subNames );
+      for ( size_t iN = 0; iN < subNames.size(); ++iN )
+        mapOfNames.Add( subNames[ iN ].c_str() );
+    }
+
+    _mesh->changePreMeshInfo()->hdf2meshInfo( "Mesh", infoHdfGroup, mapOfNames );
 
     // read SMESH_PreMeshInfo of groups
     map<int, SMESH::SMESH_GroupBase_ptr>::const_iterator i2group = _mesh->_mapGroups.begin();
@@ -465,8 +443,8 @@ bool SMESH_PreMeshInfo::readPreInfoFromHDF()
         group_i->changePreMeshInfo() = newInstance();
         if ( SMESHDS_GroupBase* group = group_i->GetGroupDS() )
         {
-          const string name = group->GetStoreName();
-          group_i->changePreMeshInfo()->hdf2meshInfo( name, infoHdfGroup );
+          const std::string name = group->GetStoreName();
+          group_i->changePreMeshInfo()->hdf2meshInfo( name, infoHdfGroup, mapOfNames );
         }
       }
     }
@@ -478,7 +456,9 @@ bool SMESH_PreMeshInfo::readPreInfoFromHDF()
       if ( SMESH_subMesh_i* sm = SMESH::DownCast<SMESH_subMesh_i*>( id2sm->second ))
       {
         sm->changePreMeshInfo() = newInstance();
-        sm->changePreMeshInfo()->hdf2meshInfo( SMESH_Comment( sm->GetId()), infoHdfGroup );
+        sm->changePreMeshInfo()->hdf2meshInfo( SMESH_Comment( sm->GetId()),
+                                               infoHdfGroup,
+                                               mapOfNames );
       }
     }
   }
@@ -535,7 +515,7 @@ void SMESH_PreMeshInfo::readGroupInfo()
   if ( _mesh->_mapGroups.empty() ) return;
 
   // make SMESH_PreMeshInfo of groups
-  map< string, SMESH_PreMeshInfo* > name2GroupInfo;
+  map< std::string, SMESH_PreMeshInfo* > name2GroupInfo;
   map<int, SMESH::SMESH_GroupBase_ptr>::const_iterator i2group = _mesh->_mapGroups.begin();
   for ( ; i2group != _mesh->_mapGroups.end(); ++i2group )
   {
@@ -546,8 +526,8 @@ void SMESH_PreMeshInfo::readGroupInfo()
       group_i->changePreMeshInfo() = info;
       if ( SMESHDS_Group* group = dynamic_cast< SMESHDS_Group* >( group_i->GetGroupDS() ))
       {
-        string name = group->GetStoreName();
-        name2GroupInfo.insert( make_pair( name, info ));
+        std::string name = group->GetStoreName();
+        name2GroupInfo.insert( std::make_pair( name, info ));
         info->_isInfoOk = true;
       }
     }
@@ -570,8 +550,8 @@ void SMESH_PreMeshInfo::readGroupInfo()
     vector< SMESH_PreMeshInfo* >& grInfoVec = famId2grInfo[ medFamInfo->GetId() ];
     for ( int iG = 0; iG < nbGroups; ++iG )
     {
-      const string grName = medFamInfo->GetGroupName( iG );
-      map< string, SMESH_PreMeshInfo* >::iterator n2i = name2GroupInfo.find( grName );
+      const std::string grName = medFamInfo->GetGroupName( iG );
+      map< std::string, SMESH_PreMeshInfo* >::iterator n2i = name2GroupInfo.find( grName );
       if ( n2i != name2GroupInfo.end() )
         grInfoVec.push_back( n2i->second );
     }
@@ -596,14 +576,14 @@ void SMESH_PreMeshInfo::readGroupInfo()
         f2infos = famId2grInfo.find( famNums[i] );
         if ( f2infos == famId2grInfo.end() )
           f2infos = famId2grInfo.insert
-            ( make_pair( famNums[i], vector< SMESH_PreMeshInfo*>())).first;
+            ( std::make_pair( famNums[i], vector< SMESH_PreMeshInfo*>())).first;
       }
       vector< SMESH_PreMeshInfo* >& infoVec = f2infos->second ;
       for ( size_t j = 0; j < infoVec.size(); ++j )
         infoVec[j]->_elemCounter++;
     }
     // pass _elemCounter to a real elem type
-    map< string, SMESH_PreMeshInfo* >::iterator n2i = name2GroupInfo.begin();
+    map< std::string, SMESH_PreMeshInfo* >::iterator n2i = name2GroupInfo.begin();
     for ( ; n2i != name2GroupInfo.end(); ++n2i )
     {
       SMESH_PreMeshInfo* info = n2i->second;
@@ -654,7 +634,7 @@ void SMESH_PreMeshInfo::readSubMeshInfo()
 
       for ( int isNode = 0; isNode < 2; ++isNode )
       {
-        string aDSName( isNode ? "Node Submeshes" : "Element Submeshes");
+        std::string aDSName( isNode ? "Node Submeshes" : "Element Submeshes");
         if ( aGroup->ExistInternalObject( (char*) aDSName.c_str() ))
         {
           // read sub-mesh id of all nodes or elems
@@ -929,13 +909,13 @@ void SMESH_PreMeshInfo::readSubMeshes(DriverMED_R_SMESHDS_Mesh* reader) const
       SMDS_ElemIteratorPtr eIt = meshDS->elementsIterator();
       for ( int isNode = 0; isNode < 2; ++isNode )
       {
-        string aDSName( isNode ? "Node Submeshes" : "Element Submeshes");
+        std::string aDSName( isNode ? "Node Submeshes" : "Element Submeshes");
         if ( aGroup->ExistInternalObject( (char*) aDSName.c_str() ))
         {
           HDFdataset* aDataset = new HDFdataset( (char*) aDSName.c_str(), aGroup );
           aDataset->OpenOnDisk();
           // read submesh IDs for all elements sorted by ID
-          int nbElems = aDataset->GetSize();
+          size_t nbElems = aDataset->GetSize();
           int* smIDs = new int [ nbElems ];
           aDataset->ReadFromDisk( smIDs );
           aDataset->CloseOnDisk();
@@ -955,9 +935,9 @@ void SMESH_PreMeshInfo::readSubMeshes(DriverMED_R_SMESHDS_Mesh* reader) const
 #endif
             nbElems = elemSet.size();
           }
-          // add elements to submeshes
+          // add elements to sub-meshes
           TIDSortedElemSet::iterator iE = elemSet.begin();
-          for ( int i = 0; i < nbElems; ++i, ++iE )
+          for ( size_t i = 0; i < nbElems; ++i, ++iE )
           {
             int smID = smIDs[ i ];
             if ( smID == 0 ) continue;