src/SMESH/MG_ADAPT.cxx

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   2 //
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   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
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  12 //
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  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "MG_ADAPT.hxx"
  21
  22 #include "SMESH_File.hxx"
  23 #include "SMESH_Comment.hxx"
  24
  25 #include <MEDFileData.hxx>
  26 #include <MEDFileField.hxx>
  27 #include <MEDFileMesh.hxx>
  28 #include <MeshFormatReader.hxx>
  29 #include <MeshFormatWriter.hxx>
  30
  31 #include <Utils_SALOME_Exception.hxx>
  32 #include <Basics_Utils.hxx>
  33
  34 #ifndef WIN32
  35 #include <unistd.h> // getpid()
  36 #else
  37 #include <process.h>
  38 #endif
  39 #include <fcntl.h>
  40 #include <array>
  41 #include <memory>   // unique_ptr
  42
  43 typedef SMESH_Comment ToComment;
  44
  45 using namespace MG_ADAPT;
  46 static std::string removeFile(std::string fileName, int& notOk)
  47 {
  48   std::string errStr;
  49   notOk = std::remove(fileName.c_str());
  50   if (notOk) errStr = ToComment("\n error while removing file : ") << fileName;
  51         else errStr = ToComment("\n file : ") << fileName << " succesfully deleted! \n ";
  52
  53   return errStr;
  54 }
  55 std::string MG_ADAPT::remove_extension(const std::string& filename) {
  56   size_t lastdot = filename.find_last_of(".");
  57   if (lastdot == std::string::npos) return filename;
  58   return filename.substr(0, lastdot);
  59 }
  60 namespace
  61 {
  62
  63   bool isFileExist( const std::string& fName )
  64   {
  65     return SMESH_File( fName ).exists();
  66   }
  67
  68 // =======================================================================
  69 med_idt openMedFile(const std::string aFile)
  70 // =======================================================================
  71 // renvoie le medId associe au fichier Med apres ouverture
  72 {
  73   med_idt medIdt = MEDfileOpen(aFile.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
  74   if (medIdt <0)
  75   {
  76     THROW_SALOME_EXCEPTION("\nThe med file " << aFile << " cannot be opened.\n");
  77   }
  78   return medIdt;
  79 }
  80
  81
  82 // =======================================================================
  83 void getTimeStepInfos(std::string aFile, med_int& numdt, med_int& numit, std::string fieldName)
  84 // =======================================================================
  85 {
  86 // Il faut voir si plusieurs maillages
  87
  88   herr_t erreur = 0 ;
  89   med_idt medIdt ;
  90
  91
  92   // Ouverture du fichier
  93   //~SCRUTE(aFile.toStdString());
  94   medIdt = openMedFile(aFile);
  95   if ( medIdt < 0 ) return ;
  96   // Lecture du nombre de champs
  97   med_int ncha = MEDnField(medIdt) ;
  98   if (ncha < 1 )
  99   {
 100     //~addMessage( ToComment(" error: there is no field in  ") << aFile, /*fatal=*/true );
 101     return;
 102   }
 103   // Lecture des caracteristiques du champs
 104
 105   //       Lecture du type du champ, des noms des composantes et du nom de l'unite
 106   char nomcha  [MED_NAME_SIZE+1];
 107   strcpy(nomcha, fieldName.c_str());
 108 //       Lecture du nombre de composantes
 109   med_int ncomp = MEDfieldnComponentByName(medIdt, nomcha);
 110   char meshname[MED_NAME_SIZE+1];
 111   char * comp = (char*) malloc(ncomp*MED_SNAME_SIZE+1);
 112   char * unit = (char*) malloc(ncomp*MED_SNAME_SIZE+1);
 113   char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
 114   med_bool local;
 115   med_field_type typcha;
 116   med_int nbofcstp;
 117   erreur =  MEDfieldInfoByName (medIdt, nomcha, meshname,&local,&typcha,comp,unit,dtunit, &nbofcstp);
 118   free(comp);
 119   free(unit);
 120   if ( erreur < 0 )
 121   {
 122       //~addMessage( ToComment(" error: error while reading field  ") << nomcha << " in file " << aFile , /*fatal=*/true );
 123     return;
 124   }
 125
 126   med_float dt;
 127   med_int tmp_numdt, tmp_numit;
 128
 129   //~med_int step = data->myUseLastTimeStep ? nbofcstp : data->myTimeStep+1;
 130   //~myPrint("step ", step);
 131   erreur = MEDfieldComputingStepInfo ( medIdt, nomcha, 1, &numdt, &numit, &dt );
 132   for( int step = 1; step <= nbofcstp; step++ )
 133   {
 134     erreur = MEDfieldComputingStepInfo ( medIdt, nomcha, step, &tmp_numdt, &tmp_numit, &dt );
 135     if(tmp_numdt > numdt)
 136     {
 137       numdt = tmp_numdt;
 138       numit = tmp_numit;
 139     }
 140   }
 141   if ( erreur < 0 )
 142   {
 143     //~addMessage( ToComment(" error: error while reading field ") << nomcha << "step (numdt, numit) = " <<"("<< numdt<< ", "
 144     //numit<< ")" <<" in file " << aFile , /*fatal=*/true );
 145     return;
 146   }
 147
 148   // Fermeture du fichier
 149   if ( medIdt > 0 ) MEDfileClose(medIdt);
 150
 151 }
 152
 153 struct GET_DEFAULT // struct used to get default value from GetOptionValue()
 154 {
 155   bool isDefault;
 156   operator bool* () {
 157       return &isDefault;
 158   }
 159 };
 160
 161 class outFileStream : public std::ofstream{
 162 public:
 163     ~outFileStream(){close();} //to close file at dtor
 164 };
 165 }
 166
 167 //----------------------------------------------------------------------------------------
 168 MgAdapt::MgAdapt()
 169 {
 170   data = new MgAdaptHypothesisData();
 171   data->myInMeshName = "";
 172   data->fromMedFile = defaultFromMedFile();
 173   data->myFileInDir = defaultWorkingDirectory();
 174   data->myMeshFileIn = "";
 175   data->myFileOutDir = defaultWorkingDirectory();
 176   data->myOutMeshName = "";
 177   data->myMeshFileOut = "";
 178   data->myMeshOutMed = defaultMeshOutMed();
 179   data->myPublish = defaultPublish();
 180   data->myUseLocalMap = defaultUseLocalMap();
 181   data->myUseBackgroundMap = defaultUseBackgroundMap();
 182   data->myFileSizeMapDir = defaultWorkingDirectory();
 183   data->myMeshFileBackground = "";
 184   data->myUseConstantValue = defaultUseConstantValue();
 185   data->myConstantValue = 0.0;
 186   data->myFieldName = "";
 187   data->myUseNoTimeStep = defaultUseNoTimeStep();
 188   data->myUseLastTimeStep = defaultUseLastTimeStep();
 189   data->myUseChosenTimeStep = defaultUseChosenTimeStep();
 190   data->myTimeStep = -2;
 191   data->myRank =  -2;
 192   data->myWorkingDir = defaultWorkingDirectory();
 193   data->myLogFile = defaultLogFile();
 194   data->myVerboseLevel = defaultVerboseLevel();
 195   data->myPrintLogInFile = defaultPrintLogInFile();
 196   data->myKeepFiles = defaultKeepFiles();
 197   data->myRemoveLogOnSuccess = defaultRemoveLogOnSuccess();
 198
 199   buildModel();
 200   setAll();
 201 }
 202 MgAdapt::MgAdapt(MgAdaptHypothesisData* myData)
 203 {
 204   data = new MgAdaptHypothesisData();
 205   setData(myData);
 206   buildModel();
 207 }
 208
 209 MgAdapt::MgAdapt( const MgAdapt& copy)
 210 {
 211   data = new MgAdaptHypothesisData();
 212   MgAdaptHypothesisData *copyData = copy.getData();
 213   copyMgAdaptHypothesisData(copyData);
 214   setAll();
 215
 216   this->_option2value = copy._option2value;
 217   this->_customOption2value = copy._customOption2value;
 218   this->_defaultOptionValues = copy._defaultOptionValues;
 219   this->_doubleOptions = copy._doubleOptions;
 220   this->_charOptions = copy._charOptions;
 221   this->_boolOptions = copy._boolOptions;
 222 }
 223
 224 //-----------------------------------------------------------------------------------------
 225 MgAdapt::~MgAdapt()
 226 {
 227   delete data;
 228 }
 229 void MgAdapt::buildModel()
 230 {
 231
 232   const char* boolOptionNames[] = { "compute_ridges", // yes
 233                                     "" // mark of end
 234                                   };
 235   // const char* intOptionNames[] = { "max_number_of_errors_printed", // 1
 236   //                                  "max_number_of_threads",        // 4
 237   //                                  "" // mark of end
 238   // };
 239   const char* doubleOptionNames[] = { "max_memory",  // 0
 240                                       "" // mark of end
 241                                     };
 242   const char* charOptionNames[] = { "components",  // "yes"
 243                                     "adaptation",  // both
 244                                     "" // mark of end
 245                                   };
 246
 247   int i = 0;
 248   while (boolOptionNames[i][0])
 249   {
 250     _boolOptions.insert( boolOptionNames[i] );
 251     _option2value[boolOptionNames[i++]].clear();
 252   }
 253   // i = 0;
 254   // while (intOptionNames[i][0])
 255   //   _option2value[intOptionNames[i++]].clear();
 256
 257   i = 0;
 258   while (doubleOptionNames[i][0]) {
 259     _doubleOptions.insert(doubleOptionNames[i]);
 260     _option2value[doubleOptionNames[i++]].clear();
 261   }
 262   i = 0;
 263   while (charOptionNames[i][0]) {
 264     _charOptions.insert(charOptionNames[i]);
 265     _option2value[charOptionNames[i++]].clear();
 266   }
 267
 268   // default values to be used while MG-Adapt
 269
 270   _defaultOptionValues["adaptation"    ] = "both";
 271   _defaultOptionValues["components"    ] = "outside components";
 272   _defaultOptionValues["compute_ridges"] = "yes";
 273   _defaultOptionValues["max_memory"    ] = ToComment(defaultMaximumMemory());
 274 }
 275
 276 //=============================================================================
 277 TOptionValues MgAdapt::getOptionValues() const
 278 {
 279   TOptionValues vals;
 280   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.begin();
 281   for ( ; op_val != _option2value.end(); ++op_val )
 282     vals.insert( make_pair( op_val->first, getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() )));
 283
 284   return vals;
 285 }
 286
 287 std::vector <std::string> MgAdapt::getOptionValuesStrVec() const
 288 {
 289   std::vector <std::string> vals;
 290   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.begin();
 291   for ( ; op_val != _option2value.end(); ++op_val )
 292     vals.push_back(op_val->first+":"+getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() ));
 293
 294   return vals;
 295 }
 296
 297 std::vector <std::string> MgAdapt::getCustomOptionValuesStrVec() const
 298 {
 299   std::vector <std::string> vals;
 300   TOptionValues::const_iterator op_val;
 301   for ( op_val = _customOption2value.begin(); op_val != _customOption2value.end(); ++op_val )
 302   {
 303     vals.push_back(op_val->first+":"+getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() ));
 304   }
 305   return vals;
 306 }
 307 const TOptionValues& MgAdapt::getCustomOptionValues() const
 308 {
 309   return _customOption2value;
 310 }
 311 void MgAdapt::setData(MgAdaptHypothesisData* myData)
 312 {
 313   copyMgAdaptHypothesisData(myData);
 314   setAll();
 315 }
 316 MgAdaptHypothesisData* MgAdapt::getData() const
 317 {
 318   return data;
 319 }
 320 void MgAdapt::setMedFileIn(std::string fileName)
 321 {
 322   if ( isFileExist(fileName) )
 323   {
 324     medFileIn = fileName;
 325
 326     if (medFileOut == "") // default MED file Out
 327       medFileOut = remove_extension( fileName )+ ".adapt.med";
 328   }
 329   else
 330   {
 331     THROW_SALOME_EXCEPTION("\nThe file "<< fileName <<" does not exist.\n");
 332   }
 333 }
 334
 335 std::string MgAdapt::getMedFileIn()
 336 {
 337   return medFileIn;
 338 }
 339
 340 void MgAdapt::setMedFileOut(std::string fileOut)
 341 {
 342   medFileOut = fileOut;
 343 }
 344 std::string MgAdapt::getMedFileOut()
 345 {
 346   return medFileOut;
 347 }
 348 void MgAdapt::setMeshOutMed(bool mybool)
 349 {
 350   meshOutMed = mybool;
 351 }
 352 bool MgAdapt::getMeshOutMed()
 353 {
 354   return meshOutMed;
 355 }
 356 void MgAdapt::setPublish(bool mybool)
 357 {
 358   publish = mybool;
 359 }
 360 bool MgAdapt::getPublish()
 361 {
 362   return publish;
 363 }
 364 void MgAdapt::setFieldName(std::string myFieldName)
 365 {
 366   fieldName = myFieldName;
 367 }
 368 std::string MgAdapt::getFieldName()
 369 {
 370   return fieldName;
 371 }
 372 void MgAdapt::setTimeStep(int time)
 373 {
 374   timeStep = time;
 375 }
 376 int MgAdapt::getTimeStep() const
 377 {
 378   return timeStep;
 379 }
 380
 381 void MgAdapt::setRankTimeStep(int time, int myRank)
 382 {
 383   timeStep = time;
 384   rank = myRank;
 385 }
 386
 387 int MgAdapt::getRank()
 388 {
 389   return rank;
 390 }
 391 void MgAdapt::setTimeStepRankLast()
 392 {
 393   myUseLastTimeStep = true;
 394   myUseChosenTimeStep = false;
 395   myUseNoTimeStep = false;
 396   //~med_int aRank, tmst;
 397      //~std::string fieldFile = useBackgroundMap ? sizeMapFile : medFileIn;
 398   //~getTimeStepInfos(fieldFile, tmst, aRank);
 399   //~setRankTimeStep((int) tmst, (int) aRank);
 400 }
 401 void MgAdapt::setNoTimeStep()
 402 {
 403   myUseLastTimeStep = false;
 404   myUseChosenTimeStep = false;
 405   myUseNoTimeStep = true;
 406   //~int aRank = (int)MED_NO_IT;
 407   //~int tmst  = (int)MED_NO_DT ;
 408   //~setRankTimeStep(tmst, aRank);
 409 }
 410 void MgAdapt::setChosenTimeStepRank()
 411 {
 412   myUseLastTimeStep = false;
 413   myUseChosenTimeStep = true;
 414   myUseNoTimeStep = false;
 415   //~int aRank = (int)MED_NO_IT;
 416   //~int tmst  = (int)MED_NO_DT ;
 417   //~setRankTimeStep(tmst, aRank);
 418 }
 419 void MgAdapt::setUseLocalMap(bool myLocal)
 420 {
 421   useLocalMap = myLocal;
 422 }
 423
 424 bool MgAdapt::getUseLocalMap()
 425 {
 426   return useLocalMap;
 427 }
 428
 429 void MgAdapt::setUseBackgroundMap(bool bckg)
 430 {
 431   useBackgroundMap = bckg;
 432 }
 433
 434 bool MgAdapt::getUseBackgroundMap()
 435 {
 436   return useBackgroundMap;
 437 }
 438
 439 void MgAdapt::setUseConstantValue(bool cnst)
 440 {
 441   useConstantValue = cnst;
 442 }
 443 bool MgAdapt::getUseConstantValue()
 444 {
 445   return useConstantValue;
 446 }
 447 void MgAdapt::setLogFile(std::string myLogFile)
 448 {
 449   logFile = myLogFile;
 450 }
 451 std::string MgAdapt::getLogFile()
 452 {
 453   return logFile;
 454 }
 455 void MgAdapt::setVerbosityLevel(int verboLevel)
 456 {
 457   verbosityLevel = verboLevel;
 458 }
 459 int MgAdapt::getVerbosityLevel()
 460 {
 461   return verbosityLevel;
 462 }
 463 void MgAdapt::setRemoveOnSuccess(bool rmons)
 464 {
 465   removeOnSuccess = rmons;
 466 }
 467 bool MgAdapt::getRemoveOnSuccess()
 468 {
 469   return removeOnSuccess;
 470 }
 471 void MgAdapt::setSizeMapFile(std::string mapFile)
 472 {
 473   if ( mapFile == "" || isFileExist(mapFile) )
 474   {
 475     sizeMapFile = mapFile;
 476   }
 477   else
 478   {
 479     THROW_SALOME_EXCEPTION("\nThe file "<< mapFile <<" does not exist.\n");
 480   }
 481 }
 482 std::string MgAdapt::getSizeMapFile()
 483 {
 484   return sizeMapFile;
 485 }
 486
 487 void MgAdapt::setMeshName(std::string name)
 488 {
 489   meshName = name;
 490 }
 491 std::string MgAdapt::getMeshName()
 492 {
 493   return meshName;
 494 }
 495 void MgAdapt::setMeshNameOut(std::string name)
 496 {
 497   meshNameOut = name;
 498 }
 499 std::string MgAdapt::getMeshNameOut()
 500 {
 501   return meshNameOut;
 502 }
 503 void MgAdapt::setFromMedFile(bool mybool)
 504 {
 505   fromMedFile = mybool;
 506 }
 507 bool MgAdapt::isFromMedFile()
 508 {
 509   return fromMedFile;
 510 }
 511 void MgAdapt::setConstantValue(double cnst)
 512 {
 513   constantValue = cnst;
 514 }
 515 double MgAdapt::getConstantValue() const
 516 {
 517   return constantValue;
 518 }
 519
 520 void MgAdapt::setWorkingDir(std::string dir)
 521 {
 522   workingDir = dir;
 523 }
 524 std::string MgAdapt::getWorkingDir() const
 525 {
 526   return workingDir;
 527 }
 528 void MgAdapt::setKeepWorkingFiles(bool mybool)
 529 {
 530   toKeepWorkingFiles = mybool;
 531 }
 532 bool MgAdapt::getKeepWorkingFiles()
 533 {
 534   return toKeepWorkingFiles;
 535 }
 536 void MgAdapt::setPrintLogInFile(bool print)
 537 {
 538   printLogInFile = print;
 539 }
 540 bool MgAdapt::getPrintLogInFile()
 541 {
 542   return printLogInFile;
 543 }
 544
 545 bool MgAdapt::setAll()
 546 {
 547
 548   setFromMedFile(data->fromMedFile);
 549   std::string file;
 550   checkDirPath(data->myFileInDir);
 551   file = data->myFileInDir+data->myMeshFileIn;
 552   setMedFileIn(file);
 553   setMeshName(data->myInMeshName);
 554   setMeshNameOut(data->myOutMeshName);
 555   checkDirPath(data->myFileOutDir);
 556   std::string out = data->myFileOutDir+data->myMeshFileOut;
 557   setMedFileOut(out);
 558   setPublish(data->myPublish);
 559   setMeshOutMed(data->myMeshOutMed);
 560   setUseLocalMap(data->myUseLocalMap);
 561   setUseBackgroundMap(data->myUseBackgroundMap);
 562   setUseConstantValue(data->myUseConstantValue);
 563
 564   std::string mapfile;
 565   if (useBackgroundMap)
 566   {
 567     checkDirPath(data->myFileSizeMapDir);
 568     mapfile = data->myFileSizeMapDir+data->myMeshFileBackground;
 569     setFieldName(data->myFieldName);
 570   }
 571   else if (useConstantValue)
 572   {
 573     setConstantValue(data->myConstantValue);
 574   }
 575   else
 576   {
 577     mapfile ="";
 578     setConstantValue(0.0);
 579     setFieldName(data->myFieldName);
 580   }
 581
 582   setSizeMapFile(mapfile);
 583   if (data->myUseNoTimeStep)
 584     setNoTimeStep();
 585   else if (data->myUseLastTimeStep)
 586     setTimeStepRankLast();
 587   else
 588   {
 589     setChosenTimeStepRank();
 590     setRankTimeStep(data->myTimeStep, data->myRank);
 591   }
 592   /* Advanced options */
 593   setWorkingDir(data->myWorkingDir);
 594   checkDirPath(data->myWorkingDir);
 595   setLogFile(data->myWorkingDir+defaultLogFile());
 596   setVerbosityLevel(data->myVerboseLevel);
 597   setRemoveOnSuccess(data->myRemoveLogOnSuccess);
 598   setPrintLogInFile(data->myPrintLogInFile);
 599   setKeepWorkingFiles(data->myKeepFiles);
 600
 601   return true;
 602 }
 603
 604 void MgAdapt::checkDirPath(std::string& dirPath)
 605 {
 606   const char lastChar = *dirPath.rbegin();
 607 #ifdef WIN32
 608   if(lastChar != '\\') dirPath+='\\';
 609 #else
 610   if(lastChar != '/') dirPath+='/';
 611 #endif
 612 }
 613 //=============================================================================
 614 void MgAdapt::setOptionValue(const std::string& optionName,
 615                              const std::string& optionValue)
 616 {
 617 //   INFOS("setOptionValue");
 618 //   std::cout << "optionName: " << optionName << ", optionValue: " << optionValue << std::endl;
 619   TOptionValues::iterator op_val = _option2value.find(optionName);
 620   if (op_val == _option2value.end())
 621   {
 622     op_val = _customOption2value.find( optionName );
 623     _customOption2value[ optionName ] = optionValue;
 624     return;
 625   }
 626
 627   if (op_val->second != optionValue)
 628   {
 629     std::string lowerOptionValue = toLowerStr(optionValue);
 630     const char* ptr = lowerOptionValue.c_str();
 631     // strip white spaces
 632     while (ptr[0] == ' ')
 633       ptr++;
 634     size_t i = strlen(ptr);
 635     while (i != 0 && ptr[i - 1] == ' ')
 636       i--;
 637     // check value type
 638     bool typeOk = true;
 639     std::string typeName;
 640     if (i == 0)
 641     {
 642       // empty string
 643     }
 644     else if (_charOptions.count(optionName))
 645     {
 646       // do not check strings
 647     }
 648     else if (_doubleOptions.count(optionName))
 649     {
 650       // check if value is double
 651       toDbl(ptr, &typeOk);
 652       typeName = "real";
 653     }
 654     else if (_boolOptions.count(optionName))
 655     {
 656       // check if value is bool
 657       toBool(ptr, &typeOk);
 658       typeName = "bool";
 659     }
 660     else
 661     {
 662       // check if value is int
 663       toInt(ptr, &typeOk);
 664       typeName = "integer";
 665     }
 666     if ( typeOk ) // check some specific values ?
 667     {
 668     }
 669     if ( !typeOk )
 670     {
 671       std::string msg = "Advanced option '" + optionName + "' = '" + optionValue + "' but must be " + typeName;
 672       throw std::invalid_argument(msg);
 673     }
 674     std::string value( ptr, i );
 675 //     std::cout << "==> value: " << value << std::endl;
 676     if ( _defaultOptionValues[ optionName ] == value ) value.clear();
 677
 678 //     std::cout << "==> value: " << value << std::endl;
 679     op_val->second = value;
 680   }
 681 }
 682 //=============================================================================
 683 //! Return option value. If isDefault provided, it can be a default value,
 684 //  then *isDefault == true. If isDefault is not provided, the value will be
 685 //  empty if it equals a default one.
 686 std::string MgAdapt::getOptionValue(const std::string& optionName, bool* isDefault) const
 687 {
 688 //   INFOS("getOptionValue");
 689 //   std::cout << "optionName: " << optionName << ", isDefault: " << isDefault << std::endl;
 690   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.find(optionName);
 691   if (op_val == _option2value.end())
 692   {
 693     op_val = _customOption2value.find(optionName);
 694     if (op_val == _customOption2value.end())
 695     {
 696       std::string msg = "Unknown MG-Adapt option: <" + optionName + ">";
 697       throw std::invalid_argument(msg);
 698     }
 699   }
 700   std::string val = op_val->second;
 701   if ( isDefault ) *isDefault = ( val.empty() );
 702
 703   if ( val.empty() && isDefault )
 704   {
 705     op_val = _defaultOptionValues.find( optionName );
 706     if (op_val != _defaultOptionValues.end()) val = op_val->second;
 707   }
 708 //   std::cout << "==> val: " << val << std::endl;
 709
 710   return val;
 711 }
 712 //================================================================================
 713 /*!
 714  * \brief Converts a string to a real value
 715  */
 716 //================================================================================
 717
 718 double MgAdapt::toDbl(const std::string& str, bool* isOk )
 719 {
 720   if ( str.empty() ) throw std::invalid_argument("Empty value provided");
 721
 722   char * endPtr;
 723   double val = strtod(&str[0], &endPtr);
 724   bool ok = (&str[0] != endPtr);
 725
 726   if ( isOk ) *isOk = ok;
 727
 728   if ( !ok )
 729   {
 730     std::string msg = "Not a real value:'" + str + "'";
 731     throw std::invalid_argument(msg);
 732   }
 733   return val;
 734 }
 735 //================================================================================
 736 /*!
 737  * \brief Converts a string to a lower
 738  */
 739 //================================================================================
 740 std::string MgAdapt::toLowerStr(const std::string& str)
 741 {
 742   std::string s = str;
 743   for ( size_t i = 0; i <= s.size(); ++i )
 744     s[i] = (char) tolower( s[i] );
 745   return s;
 746 }
 747 //================================================================================
 748 /*!
 749  * \brief Converts a string to a bool
 750  */
 751 //================================================================================
 752
 753 bool MgAdapt::toBool(const std::string& str, bool* isOk )
 754 {
 755   std::string s = str;
 756   if ( isOk ) *isOk = true;
 757
 758   for ( size_t i = 0; i <= s.size(); ++i )
 759     s[i] = (char) tolower( s[i] );
 760
 761   if ( s == "1" || s == "true" || s == "active" || s == "yes" )
 762     return true;
 763
 764   if ( s == "0" || s == "false" || s == "inactive" || s == "no" )
 765     return false;
 766
 767   if ( isOk )
 768     *isOk = false;
 769   else
 770   {
 771     std::string msg = "Not a Boolean value:'" + str + "'";
 772     throw std::invalid_argument(msg);
 773   }
 774   return false;
 775 }
 776 //================================================================================
 777 /*!
 778  * \brief Converts a string to a integer value
 779  */
 780 //================================================================================
 781
 782 int MgAdapt::toInt(const std::string& str, bool* isOk )
 783 {
 784   if ( str.empty() ) throw std::invalid_argument("Empty value provided");
 785
 786   char * endPtr;
 787   int val = (int)strtol( &str[0], &endPtr, 10);
 788   bool ok = (&str[0] != endPtr);
 789
 790   if ( isOk ) *isOk = ok;
 791
 792   if ( !ok )
 793   {
 794     std::string msg = "Not an integer value:'" + str + "'";
 795     throw std::invalid_argument(msg);
 796   }
 797   return val;
 798 }
 799 //=============================================================================
 800 bool MgAdapt::hasOptionDefined( const std::string& optionName ) const
 801 {
 802   bool isDefault = false;
 803   try
 804   {
 805     getOptionValue( optionName, &isDefault );
 806   }
 807   catch ( std::invalid_argument )
 808   {
 809     return false;
 810   }
 811   return !isDefault;
 812 }
 813 //================================================================================
 814 /*!
 815  * \brief Return command to run MG-Adapt mesher excluding file prefix (-f)
 816  */
 817 //================================================================================
 818
 819 std::string MgAdapt::getCommandToRun(MgAdapt* hyp)
 820 {
 821   return hyp ? hyp->getCommandToRun() : ToComment("error with hypothesis!");
 822 }
 823
 824 int MgAdapt::compute(std::string& errStr)
 825 {
 826   std::string cmd = getCommandToRun();
 827 //   std::cout << cmd << std::endl;
 828
 829   int err = 0;
 830   execCmd( cmd.c_str(), err ); // run
 831
 832   if ( err )
 833   {
 834     errStr = ToComment("system(mg-adapt.exe ...) command failed with error: ") << strerror( errno );
 835   }
 836   else if ( !isFileExist( meshFormatOutputMesh ))
 837   {
 838     errStr = ToComment(" failed to find file ") << meshFormatOutputMesh
 839                                                 << " output from MG-Adapt run";
 840   }
 841   else
 842   {
 843     convertMeshFile(meshFormatOutputMesh, solFormatOutput);
 844   }
 845   if (!err) cleanUp();
 846   return err;
 847 }
 848
 849 void MgAdapt::execCmd( const char* cmd, int& err)
 850 {
 851   err = 1;
 852   std::array <char, 128> buffer;
 853   std::streambuf* buf;
 854   outFileStream fileStream;
 855   if (printLogInFile)
 856   {
 857     fileStream.open(logFile);
 858     buf = fileStream.rdbuf();
 859   }
 860   else
 861   {
 862     buf = std::cout.rdbuf();
 863   }
 864   std::ostream logStream(buf);
 865
 866
 867 #if defined(WIN32)
 868 #if defined(UNICODE)
 869   const wchar_t * aCmd = Kernel_Utils::utf8_decode(cmd);
 870   std::unique_ptr <FILE, decltype(&_pclose)> pipe(_wpopen(aCmd, O_RDONLY), _pclose );
 871 #else
 872   std::unique_ptr <FILE, decltype(&_pclose)> pipe(_popen(cmd, "r"), _pclose );
 873 #endif
 874 #else
 875   std::unique_ptr <FILE, decltype(&pclose)> pipe(popen(cmd, "r"), pclose );
 876 #endif
 877
 878   if(!pipe)
 879   {
 880     throw std::runtime_error("popen() failed!");
 881   }
 882   while(fgets(buffer.data(), buffer.size(), pipe.get()) !=nullptr )
 883   {
 884     logStream<<buffer.data() ;
 885   }
 886   err = 0;
 887 }
 888 /*
 889  * to delete tmp files .mesh, .sol and if needed
 890  * the log file
 891  *
 892  */
 893 void MgAdapt::cleanUp()
 894 {
 895   int notOk;
 896   std::string errStr;
 897   if(toKeepWorkingFiles)
 898     return;
 899   if(removeOnSuccess && printLogInFile)
 900     tmpFilesToBeDeleted.push_back(logFile);
 901
 902   std::vector< std::string>::iterator it = tmpFilesToBeDeleted.begin();
 903   for (; it!=tmpFilesToBeDeleted.end(); ++it)
 904   {
 905     errStr=removeFile(*it, notOk);
 906     if (notOk)
 907     {
 908       appendMsgToLogFile(errStr);
 909     }
 910
 911   }
 912 }
 913
 914 void MgAdapt::appendMsgToLogFile(std::string& msg)
 915 {
 916   std::ofstream logStream;
 917   logStream.open(logFile, std::ofstream::out | std::ofstream::app);
 918   logStream<< msg;
 919   logStream.close();
 920 }
 921 //================================================================================
 922 /*!
 923  * \brief Return command to run MG-Tetra mesher excluding file prefix (-f)
 924  */
 925 //================================================================================
 926
 927 std::string MgAdapt::getCommandToRun()
 928 {
 929   /*
 930   || return system command with args and options
 931   ||
 932   */
 933   std::string errStr;
 934   std::string cmd = getExeName();
 935   std::string meshIn(""), sizeMapIn(""), solFileIn("");
 936   updateTimeStepRank();
 937   convertMedFile(meshIn, solFileIn, sizeMapIn);
 938   if (!isFileExist(meshIn) || !isFileExist(solFileIn))
 939   {
 940     errStr = ToComment(" failed to find .mesh or .sol file from converter ")<< strerror( errno );
 941     return errStr;
 942   }
 943   tmpFilesToBeDeleted.push_back(meshIn);
 944   tmpFilesToBeDeleted.push_back(solFileIn);
 945   if(useBackgroundMap && !isFileExist(sizeMapIn))
 946   {
 947     errStr = ToComment(" failed to find .mesh size map file from converter ")<< strerror( errno );
 948     return errStr;
 949   }
 950
 951   cmd+= " --in "+ meshIn;
 952   meshFormatOutputMesh = getFileName()+".mesh";
 953   tmpFilesToBeDeleted.push_back(meshFormatOutputMesh);
 954   cmd+= " --out "+ meshFormatOutputMesh;
 955   if (useLocalMap || useConstantValue) cmd+= " --sizemap "+ solFileIn;
 956   else //  (useBackgroundMap)
 957   {
 958     cmd+= " --background_mesh "+ sizeMapIn ;
 959     cmd+= " --background_sizemap "+ solFileIn;
 960     tmpFilesToBeDeleted.push_back(sizeMapIn);
 961   }
 962   //~else
 963   //~{
 964       //~// constant value TODO
 965   //~}
 966   // Check coherence between mesh dimension and option fo adaptation
 967   checkDimensionOptionAdaptation();
 968
 969 //   sizemap file is written only if level is higher than 3
 970   if ( verbosityLevel > 3)
 971   {
 972     std::string solFileOut = getFileName()+".sol";
 973     cmd+= " --write_sizemap "+ solFileOut;
 974     solFormatOutput.push_back(solFileOut);
 975     tmpFilesToBeDeleted.push_back(solFileOut);
 976   }
 977
 978   std::string option, value;
 979   bool isDefault;
 980   const TOptionValues* options[] = { &_option2value, &_customOption2value };
 981   for ( int iOp = 0; iOp < 2; ++iOp )
 982   {
 983     TOptionValues::const_iterator o2v = options[iOp]->begin();
 984     for ( ; o2v != options[iOp]->end(); ++o2v )
 985     {
 986       option = o2v->first;
 987       value = getOptionValue( option, &isDefault );
 988
 989       if ( isDefault )
 990         continue;
 991       if ( value.empty() )//value == NoValue() )
 992       {
 993         if ( _defaultOptionValues.count( option ))
 994           continue; // non-custom option with no value
 995         //value.clear();
 996       }
 997       if ( strncmp( "no", option.c_str(), 2 ) == 0 ) // options w/o values: --no_*
 998       {
 999         if ( !value.empty() && toBool( value ) == false )
1000           continue;
1001         value.clear();
1002       }
1003       if ( option[0] != '-' )
1004         cmd += " --";
1005       else
1006         cmd += " ";
1007 //       std::cout << "--- option: '" << option << ", value: '" << value <<"'"<< std::endl;
1008       cmd += option + " " + value;
1009     }
1010   }
1011
1012   // Verbosity Level
1013   if (verbosityLevel != defaultVerboseLevel())
1014   {
1015     cmd+= " --verbose "+ ToComment(verbosityLevel);
1016   }
1017     //~}
1018 //~cmd+= " >"
1019 #ifdef WIN32
1020     cmd += " < NUL";
1021 #endif
1022 //   std::cout << "--- cmd :"<< std::endl;
1023 //   std::cout << cmd << std::endl;
1024
1025   return cmd;
1026 }
1027
1028 //=======================================================================
1029 //function : defaultMaximumMemory
1030 //=======================================================================
1031
1032 #if defined(WIN32)
1033 #include <windows.h>
1034 #elif !defined(__APPLE__)
1035 #include <sys/sysinfo.h>
1036 #endif
1037
1038 double MgAdapt::defaultMaximumMemory()
1039 {
1040 #if defined(WIN32)
1041   // See http://msdn.microsoft.com/en-us/library/aa366589.aspx
1042   MEMORYSTATUSEX statex;
1043   statex.dwLength = sizeof (statex);
1044   long err = GlobalMemoryStatusEx (&statex);
1045   if (err != 0)
1046   {
1047     double totMB = (double)statex.ullAvailPhys / 1024. / 1024.;
1048     return (double)( 0.7 * totMB );
1049   }
1050 #elif !defined(__APPLE__)
1051   struct sysinfo si;
1052   long err = sysinfo( &si );
1053   if ( err == 0 )
1054   {
1055     long ramMB = si.totalram * si.mem_unit / 1024 / 1024;
1056     return ( 0.7 * double( ramMB ));
1057   }
1058 #endif
1059   return 1024;
1060 }
1061
1062 //=======================================================================
1063 //function : defaultWorkingDirectory
1064 //=======================================================================
1065
1066 std::string MgAdapt::defaultWorkingDirectory()
1067 {
1068   std::string aTmpDir;
1069
1070   char *Tmp_dir = getenv("SALOME_TMP_DIR");
1071   if(Tmp_dir != NULL)
1072   {
1073     aTmpDir = Tmp_dir;
1074   }
1075   else {
1076 #ifdef WIN32
1077     aTmpDir = "C:\\";
1078 #else
1079     aTmpDir = "/tmp/";
1080 #endif
1081   }
1082   return aTmpDir;
1083 }
1084 //================================================================================
1085 /*!
1086  * \brief Return a unique file name
1087  */
1088 //================================================================================
1089
1090 std::string MgAdapt::getFileName() const
1091 {
1092   std::string aTmpDir = workingDir;
1093   const char lastChar = *aTmpDir.rbegin();
1094 #ifdef WIN32
1095   if(lastChar != '\\') aTmpDir+='\\';
1096 #else
1097   if(lastChar != '/') aTmpDir+='/';
1098 #endif
1099
1100   SMESH_Comment aGenericName( aTmpDir );
1101   aGenericName << "MgAdapt_";
1102 #ifndef WIN32
1103   aGenericName << getpid();
1104 #else
1105 aGenericName << _getpid();
1106 #endif
1107   aGenericName << "_";
1108   aGenericName << std::abs((int)(long) aGenericName.data());
1109
1110   return aGenericName;
1111 }
1112 //=======================================================================
1113 //function : defaultLogFile
1114 //=======================================================================
1115
1116 std::string MgAdapt::defaultLogFile()
1117 {
1118   std::string alogFile("MG_ADAPT.log");
1119   return alogFile;
1120 }
1121 //=======================================================================
1122 //function : defaultUseConstantValue
1123 //=======================================================================
1124
1125 bool MgAdapt::defaultUseConstantValue()
1126 {
1127   return false;
1128 }
1129 //=======================================================================
1130 //function : defaultUseNoTimeStep
1131 //=======================================================================
1132
1133 bool MgAdapt::defaultUseNoTimeStep()
1134 {
1135   return true;
1136 }
1137 //=======================================================================
1138 //function : defaultRemoveLogOnSuccess
1139 //=======================================================================
1140
1141 bool MgAdapt::defaultRemoveLogOnSuccess()
1142 {
1143   return true;
1144 }
1145 //=======================================================================
1146 //function : defaultPrintLogInFile
1147 //=======================================================================
1148
1149 bool MgAdapt::defaultPrintLogInFile()
1150 {
1151   return false;
1152 }
1153 //=======================================================================
1154 //function : defaultUseChosenTimeStep
1155 //=======================================================================
1156
1157 bool MgAdapt::defaultUseChosenTimeStep()
1158 {
1159   return false;
1160 }
1161 //=======================================================================
1162 //function : UseLastTimeStep
1163 //=======================================================================
1164
1165 bool MgAdapt::defaultUseLastTimeStep()
1166 {
1167   return false;
1168 }
1169 //=======================================================================
1170 //function : defaultUseBackgroundMap
1171 //=======================================================================
1172
1173 bool MgAdapt::defaultUseBackgroundMap()
1174 {
1175   return false;
1176 }
1177 //=======================================================================
1178 //function : defaultKeepFiles
1179 //=======================================================================
1180
1181 bool MgAdapt::defaultKeepFiles()
1182 {
1183   return false;
1184 }
1185 //=======================================================================
1186 //function : defaultUseLocalMap
1187 //=======================================================================
1188
1189 bool MgAdapt::defaultUseLocalMap()
1190 {
1191   return true;
1192 }
1193 //=======================================================================
1194 //function : defaultPublish
1195 //=======================================================================
1196
1197 bool MgAdapt::defaultPublish()
1198 {
1199   return false;
1200 }
1201 //=======================================================================
1202 //function : defaultMeshOutMed
1203 //=======================================================================
1204
1205 bool MgAdapt::defaultMeshOutMed()
1206 {
1207   return true;
1208 }
1209 //=======================================================================
1210 //function : defaultFromMedFile
1211 //=======================================================================
1212
1213 bool MgAdapt::defaultFromMedFile()
1214 {
1215   return true;
1216 }
1217 //=======================================================================
1218 //function : defaultVerboseLevel
1219 //=======================================================================
1220
1221 int  MgAdapt::defaultVerboseLevel()
1222 {
1223   return 3;
1224 }
1225 std::string MgAdapt::getExeName()
1226 {
1227   return "mg-adapt.exe";
1228 }
1229 void MgAdapt::copyMgAdaptHypothesisData( const MgAdaptHypothesisData* from)
1230 {
1231   data->myFileInDir = from->myFileInDir;
1232   data->myMeshFileIn = from->myMeshFileIn;
1233   data->myMeshFileBackground = from->myMeshFileBackground;
1234   data->myOutMeshName = from->myOutMeshName;
1235   data->myMeshFileOut = from->myMeshFileOut;
1236   data->myFileOutDir = from->myFileOutDir;
1237   data->myFileSizeMapDir = from->myFileSizeMapDir;
1238   data->myFieldName = from->myFieldName;
1239   data->fromMedFile = from->fromMedFile;
1240   data->myPublish = from->myPublish;
1241   data->myMeshOutMed = from->myMeshOutMed;
1242   data->myUseLocalMap = from->myUseLocalMap;
1243   data->myUseBackgroundMap = from->myUseBackgroundMap;
1244   data->myUseConstantValue = from->myUseConstantValue;
1245   data->myConstantValue = from->myConstantValue;
1246   data->myTimeStep = from->myTimeStep;
1247   data->myRank = from->myRank;
1248   data->myUseNoTimeStep = from->myUseNoTimeStep;
1249   data->myUseLastTimeStep = from->myUseLastTimeStep;
1250   data->myUseChosenTimeStep = from->myUseChosenTimeStep;
1251   data->myWorkingDir = from->myWorkingDir;
1252   data->myLogFile = from->myLogFile;
1253   data->myPrintLogInFile = from->myPrintLogInFile;
1254   data->myKeepFiles = from->myKeepFiles;
1255   data->myRemoveLogOnSuccess = from->myRemoveLogOnSuccess;
1256   data->myVerboseLevel = from->myVerboseLevel;
1257 }
1258
1259 std::vector<std::string> MgAdapt::getListFieldsNames(std::string fileIn)
1260 {
1261   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(fileIn);
1262   std::vector<std::string> listFieldsNames(mfd->getFields()->getFieldsNames());
1263   return listFieldsNames ;
1264 }
1265
1266 void MgAdapt::checkDimensionOptionAdaptation()
1267 {
1268   // Quand le maillage est 3D, tout est possible
1269   // Quand le maillage est 2D, il faut 'surface' sauf si carte de fonds 3D
1270   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(medFileIn);
1271   int meshdim = mfd->getMeshes()->getMeshAtPos(0)->getMeshDimension() ;
1272 //   std::cout << "meshdim = " << meshdim << std::endl;
1273
1274   if ( meshdim == 2 )
1275   {
1276     std::string optionName   = "adaptation";
1277     std::string optionValue = getOptionValue(optionName);
1278 //     std::cout << "optionValue = '" << optionValue <<"'"<< std::endl;
1279     bool a_tester = false ;
1280     // carte locale ou constante : impératif d'avoir "surface"
1281     if ( useLocalMap || useConstantValue) a_tester = true ;
1282     // carte de fond : impératif d'avoir "surface" si le fonds est aussi 2D
1283     else
1284     {
1285       MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfdbg = MEDCoupling::MEDFileData::New(sizeMapFile);
1286       int meshdimbg = mfdbg->getMeshes()->getMeshAtPos(0)->getMeshDimension() ;
1287 //       std::cout << "meshdimbg = " << meshdimbg << std::endl;
1288       if ( meshdimbg == 2 ) a_tester = true ;
1289     }
1290     if ( a_tester )
1291     {
1292       if ( optionValue == "" ) setOptionValue (optionName, "surface");
1293       else
1294       {
1295         if ( optionValue != "surface" )
1296         {
1297           THROW_SALOME_EXCEPTION("Mesh dimension is 2; the option should be 'surface'"
1298                                  " instead of '" << optionValue << "'.");
1299         }
1300       }
1301     }
1302   }
1303 }
1304
1305 void MgAdapt::checkFieldName(std::string fileIn)
1306 {
1307   bool ret = false ;
1308   std::vector<std::string> listFieldsNames = getListFieldsNames(fileIn);
1309   std::size_t jaux(listFieldsNames.size());
1310   for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1311   {
1312     if ( fieldName == listFieldsNames[j] )
1313     {
1314       ret = true ;
1315       break ;
1316     }
1317   }
1318   if ( ! ret )
1319   {
1320     std::cout << "Available field names:" << std::endl;
1321     for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1322     { std::cout << listFieldsNames[j] << std::endl;}
1323     THROW_SALOME_EXCEPTION( "Field " << fieldName << " is not found.");
1324   }
1325 }
1326
1327 void MgAdapt::checkTimeStepRank(std::string fileIn)
1328 {
1329   bool ret = false ;
1330   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(fileIn);
1331   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts( mfd->getFields()->getFieldWithName(fieldName) );
1332   std::vector<double> timevalue;
1333   std::vector< std::pair<int,int> > timesteprank = fts->getTimeSteps(timevalue);
1334   std::size_t jaux(timesteprank.size());
1335   for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1336   {
1337     if ( ( timeStep == timesteprank[j].first ) & ( rank == timesteprank[j].second ) )
1338     {
1339       ret = true ;
1340       break ;
1341     }
1342   }
1343   if ( ! ret )
1344   {
1345     std::cout << "Available (Time step, Rank):" << std::endl;
1346     for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1347     { std::cout << "(Time step = " << timesteprank[j].first << ", Rank = " << timesteprank[j].second << ")" << std::endl;}
1348     THROW_SALOME_EXCEPTION("(Time step = " << timeStep << ", Rank = " << rank << ") is not found.");
1349   }
1350 }
1351
1352 void MgAdapt::convertMedFile(std::string& meshFormatMeshFileName, std::string& solFormatFieldFileName, std::string& meshFormatsizeMapFile)
1353 {
1354   std::vector<std::string> fieldFileNames;
1355   MEDCoupling::MeshFormatWriter writer;
1356   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(medFileIn);
1357   MEDCoupling::MEDFileMeshes* meshes = mfd->getMeshes();
1358   MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh = meshes->getMeshAtPos(0); // ok only one mesh in file!
1359   if (meshNameOut =="")
1360       meshNameOut = fileMesh->getName();
1361   storeGroupsAndFams(fileMesh);
1362
1363   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFields> fields = MEDCoupling::MEDFileFields::New();
1364   solFormatFieldFileName = getFileName();
1365   solFormatFieldFileName+=".sol";
1366   fieldFileNames.push_back(solFormatFieldFileName);
1367
1368   if (useBackgroundMap)
1369   {
1370     checkFieldName(sizeMapFile) ;
1371     checkTimeStepRank(sizeMapFile) ;
1372     meshFormatsizeMapFile = getFileName();
1373     meshFormatsizeMapFile += ".mesh";
1374     buildBackGroundMeshAndSolFiles(fieldFileNames, meshFormatsizeMapFile);
1375   }
1376   else if(useLocalMap)
1377   {
1378     checkFieldName(medFileIn) ;
1379     checkTimeStepRank(medFileIn) ;
1380     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts( mfd->getFields()->getFieldWithName(fieldName) );
1381     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeField1TS> f = fts->getTimeStep(timeStep, rank);
1382     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS> tmFts = MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS::New();
1383     tmFts->pushBackTimeStep(f);
1384
1385     fields->pushField(tmFts);
1386
1387     writer.setFieldFileNames( fieldFileNames);
1388   }
1389   else
1390   {
1391     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDCouplingMesh> mesh = fileMesh->getMeshAtLevel(1); // nodes mesh
1392     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh> umesh = mesh->buildUnstructured(); // nodes mesh
1393     int dim  =  umesh->getSpaceDimension();
1394     int version =  sizeof(double) < 8 ? 1 : 2;
1395     mcIdType nbNodes =  umesh->getNumberOfNodes();
1396     buildConstantSizeMapSolFile(solFormatFieldFileName, dim, version, nbNodes);
1397   }
1398
1399   mfd->setFields( fields );
1400   meshFormatMeshFileName = getFileName();
1401   meshFormatMeshFileName+=".mesh";
1402   writer.setMeshFileName(meshFormatMeshFileName);
1403   writer.setMEDFileDS( mfd);
1404   writer.write();
1405
1406 }
1407
1408 void MgAdapt::convertMeshFile(std::string& meshFormatIn, std::vector< std::string>& solFieldFileNames) const
1409 {
1410   MEDCoupling::MeshFormatReader reader(meshFormatIn, solFieldFileNames);
1411
1412   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = reader.loadInMedFileDS();
1413   // write MED
1414   MEDCoupling::MEDFileMeshes* meshes = mfd->getMeshes();
1415   MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh = meshes->getMeshAtPos(0); // ok only one mesh in file!
1416   fileMesh->setName(meshNameOut);
1417   restoreGroupsAndFams(fileMesh);
1418   mfd->write(medFileOut, 2);
1419 }
1420
1421 void MgAdapt::storeGroupsAndFams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1422 {
1423   storefams(fileMesh);
1424   storeGroups(fileMesh);
1425 }
1426
1427 void MgAdapt::restoreGroupsAndFams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1428 {
1429   restorefams(fileMesh);
1430   restoreGroups(fileMesh);
1431 }
1432 void MgAdapt::storeGroups(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1433 {
1434   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grpFams = fileMesh->getGroupInfo();
1435   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator g2ff = grpFams.begin();
1436
1437   for ( ; g2ff != grpFams.end(); ++g2ff )
1438   {
1439     std::string             groupName = g2ff->first;
1440     std::vector<std::string> famNames = g2ff->second;
1441
1442     if ( famNames.empty() ) continue;
1443     std::vector< int> famListId;
1444     for ( size_t i = 0; i < famNames.size(); ++i )
1445     {
1446       famListId.push_back( FromIdType<int>( fileMesh->getFamilyId( famNames[i].c_str() )));
1447     }
1448     group grp(groupName, famListId, famNames);
1449     groupVec.push_back(grp);
1450   }
1451 }
1452
1453 void MgAdapt::storefams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1454 {
1455   std::map<std::string, mcIdType> grpFams = fileMesh->getFamilyInfo();
1456   std::map<std::string, mcIdType >::iterator f = grpFams.begin();
1457
1458   for ( ; f != grpFams.end(); ++f )
1459   {
1460     if(!f->second) continue;  // FAMILLE_ZERO
1461     family fs(f->first, FromIdType<int>( f->second ));
1462     famVec.push_back(fs);
1463   }
1464
1465 }
1466
1467 void MgAdapt::restorefams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1468 {
1469   std::vector<family>::const_iterator fIt = famVec.begin();
1470
1471   for (; fIt!=famVec.end(); ++fIt)
1472   {
1473     try  //
1474     {
1475       std::string givenFamNameFromMeshGemConverter = fileMesh->getFamilyNameGivenId( std::abs(fIt->_famId) );
1476       fileMesh->changeFamilyId(std::abs(fIt->_famId), fIt->_famId);
1477       fileMesh->changeFamilyName(givenFamNameFromMeshGemConverter, fIt->_famName);
1478     }
1479     catch (const std::exception& e)
1480     {
1481       std::cerr<<e.what();
1482     }
1483   }
1484 }
1485
1486 void MgAdapt::restoreGroups(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1487 {
1488   std::map<std::string, std::vector<std::string> > info;
1489   std::vector <group>::const_iterator grpFams = groupVec.begin();
1490
1491   for (; grpFams!=groupVec.end(); ++grpFams)
1492   {
1493     info.insert(std::pair <std::string, std::vector<std::string> > (grpFams->_name, grpFams->_famNames) );
1494   }
1495
1496   fileMesh->setGroupInfo(info);
1497 }
1498
1499 void MgAdapt::buildConstantSizeMapSolFile(const std::string& solFormatFieldFileName, const int dim, const int version, const size_t nbNodes) const
1500 {
1501   MeshFormat::Localizer loc;
1502   MeshFormat::MeshFormatParser writer;
1503   int fileId = writer.GmfOpenMesh( solFormatFieldFileName.c_str(), GmfWrite, version, dim);
1504   int typTab[] = {GmfSca};
1505   writer.GmfSetKwd(fileId, MeshFormat::GmfSolAtVertices, (int)nbNodes, 1, typTab);
1506   for (size_t i = 0; i<nbNodes; i++)
1507   {
1508     double valTab[1] = {constantValue};
1509     writer.GmfSetLin( fileId, MeshFormat::GmfSolAtVertices, valTab);
1510   }
1511   writer.GmfCloseMesh(fileId);
1512 }
1513
1514 void MgAdapt::buildBackGroundMeshAndSolFiles(const std::vector<std::string>& fieldFileNames, const std::string& meshFormatsizeMapFile) const
1515 {
1516   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> tmpMfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(sizeMapFile);
1517   MEDCoupling::MEDFileFields* tmpFields = tmpMfd->getFields();
1518   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts( tmpFields->getFieldWithName(fieldName) );
1519   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS>  fts1 = MEDCoupling::DynamicCastSafe<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS,MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS>(fts);
1520   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeField1TS> f = fts1->getTimeStep(timeStep, rank);
1521   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS> tmFts = MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS::New();
1522   tmFts->pushBackTimeStep(f);
1523
1524   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFields> tmp_fields = MEDCoupling::MEDFileFields::New();
1525   tmp_fields->pushField(tmFts);
1526
1527   tmpMfd->setFields( tmp_fields );
1528   MEDCoupling::MeshFormatWriter tmpWriter;
1529   tmpWriter.setMeshFileName(meshFormatsizeMapFile);
1530   tmpWriter.setFieldFileNames( fieldFileNames);
1531   tmpWriter.setMEDFileDS(tmpMfd);
1532   tmpWriter.write();
1533 }
1534
1535 MgAdapt::Status MgAdapt::addMessage(const std::string& msg,
1536                                     const bool         isFatal/*=false*/)
1537 {
1538   if ( isFatal )
1539     _errorMessages.clear(); // warnings are useless if a fatal error encounters
1540
1541   _errorMessages.push_back( msg );
1542
1543   //~MESSAGE(msg);
1544 #ifdef _DEBUG_
1545   std::cout << msg << std::endl;
1546 #endif
1547   return ( _status = isFatal ? MgAdapt::DRS_FAIL : MgAdapt::DRS_WARN_SKIP_ELEM );
1548 }
1549
1550 void MgAdapt::updateTimeStepRank()
1551 {
1552
1553   med_int arank;
1554   med_int tmst;
1555   if (myUseNoTimeStep)
1556   {
1557     arank = MED_NO_IT;
1558     tmst  = MED_NO_DT ;
1559     setRankTimeStep((int)tmst, (int)arank);
1560   }
1561   else if (myUseLastTimeStep)
1562   {
1563     std::string fieldFile = useBackgroundMap ? sizeMapFile : medFileIn;
1564     getTimeStepInfos(fieldFile, tmst, arank, fieldName);
1565     setRankTimeStep((int)tmst, (int)arank);
1566   }
1567 }