src/SMESH/MG_ADAPT.cxx

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   2 //
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   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
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  12 //
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  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "MG_ADAPT.hxx"
  21
  22 #include <DriverGMF_Read.hxx>
  23 #include <SMESH_Comment.hxx>
  24 #include <SMESH_File.hxx>
  25 #include <SMESH_MGLicenseKeyGen.hxx>
  26 #include <SMESH_TypeDefs.hxx>
  27
  28 #include <MEDFileData.hxx>
  29 #include <MEDFileField.hxx>
  30 #include <MEDFileMesh.hxx>
  31 #include <MeshFormatReader.hxx>
  32 #include <MeshFormatWriter.hxx>
  33
  34 #include <Utils_SALOME_Exception.hxx>
  35 #include <Basics_Utils.hxx>
  36 #include "SMESH_TypeDefs.hxx"
  37
  38 #ifndef WIN32
  39 #include <unistd.h> // getpid()
  40 #else
  41 #include <process.h>
  42 #endif
  43 #include <fcntl.h>
  44 #include <array>
  45 #include <memory>   // unique_ptr
  46
  47 typedef SMESH_Comment ToComment;
  48
  49 using namespace MG_ADAPT;
  50 static std::string removeFile(std::string fileName, int& notOk)
  51 {
  52   std::string errStr;
  53   notOk = std::remove(fileName.c_str());
  54   if (notOk) errStr = ToComment("\n error while removing file : ") << fileName;
  55   else       errStr = ToComment("\n file : ") << fileName << " succesfully deleted! \n ";
  56
  57   return errStr;
  58 }
  59 std::string MG_ADAPT::remove_extension(const std::string& filename)
  60 {
  61   size_t lastdot = filename.find_last_of(".");
  62   if (lastdot == std::string::npos) return filename;
  63   return filename.substr(0, lastdot);
  64 }
  65 namespace
  66 {
  67
  68   bool isFileExist( const std::string& fName )
  69   {
  70     return SMESH_File( fName ).exists();
  71   }
  72
  73   // =======================================================================
  74   med_idt openMedFile(const std::string aFile)
  75   // =======================================================================
  76   // renvoie le medId associe au fichier Med apres ouverture
  77   {
  78     med_idt medIdt = MEDfileOpen(aFile.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
  79     if (medIdt <0)
  80     {
  81       THROW_SALOME_EXCEPTION("\nThe med file " << aFile << " cannot be opened.\n");
  82     }
  83     return medIdt;
  84   }
  85
  86   // =======================================================================
  87   void getTimeStepInfos(std::string aFile, med_int& numdt, med_int& numit, std::string fieldName)
  88   // =======================================================================
  89   {
  90     // Il faut voir si plusieurs maillages
  91
  92     herr_t erreur = 0 ;
  93     med_idt medIdt ;
  94
  95     // Ouverture du fichier
  96     //~SCRUTE(aFile.toStdString());
  97     medIdt = openMedFile(aFile);
  98     if ( medIdt < 0 ) return ;
  99     // Lecture du nombre de champs
 100     med_int ncha = MEDnField(medIdt) ;
 101     if (ncha < 1 )
 102     {
 103       //~addMessage( ToComment(" error: there is no field in  ") << aFile, /*fatal=*/true );
 104       return;
 105     }
 106     // Lecture des caracteristiques du champs
 107
 108     //       Lecture du type du champ, des noms des composantes et du nom de l'unite
 109     char nomcha  [MED_NAME_SIZE+1];
 110     strcpy(nomcha, fieldName.c_str());
 111     //       Lecture du nombre de composantes
 112     med_int ncomp = MEDfieldnComponentByName(medIdt, nomcha);
 113     char meshname[MED_NAME_SIZE+1];
 114     char * comp = (char*) malloc(ncomp*MED_SNAME_SIZE+1);
 115     char * unit = (char*) malloc(ncomp*MED_SNAME_SIZE+1);
 116     char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
 117     med_bool local;
 118     med_field_type typcha;
 119     med_int nbofcstp;
 120     erreur =  MEDfieldInfoByName (medIdt, nomcha, meshname,&local,&typcha,comp,unit,dtunit, &nbofcstp);
 121     free(comp);
 122     free(unit);
 123     if ( erreur < 0 )
 124     {
 125       //~addMessage( ToComment(" error: error while reading field  ") << nomcha << " in file " << aFile , /*fatal=*/true );
 126       return;
 127     }
 128
 129     med_float dt;
 130     med_int tmp_numdt, tmp_numit;
 131
 132     //~med_int step = data->myUseLastTimeStep ? nbofcstp : data->myTimeStep+1;
 133     //~myPrint("step ", step);
 134     erreur = MEDfieldComputingStepInfo ( medIdt, nomcha, 1, &numdt, &numit, &dt );
 135     for( int step = 1; step <= nbofcstp; step++ )
 136     {
 137       erreur = MEDfieldComputingStepInfo ( medIdt, nomcha, step, &tmp_numdt, &tmp_numit, &dt );
 138       if(tmp_numdt > numdt)
 139       {
 140         numdt = tmp_numdt;
 141         numit = tmp_numit;
 142       }
 143     }
 144     if ( erreur < 0 )
 145     {
 146       //~addMessage( ToComment(" error: error while reading field ") << nomcha << "step (numdt, numit) = " <<"("<< numdt<< ", "
 147       //numit<< ")" <<" in file " << aFile , /*fatal=*/true );
 148       return;
 149     }
 150
 151     // Fermeture du fichier
 152     if ( medIdt > 0 ) MEDfileClose(medIdt);
 153
 154   }
 155
 156   struct GET_DEFAULT // struct used to get default value from GetOptionValue()
 157   {
 158     bool isDefault;
 159     operator bool* () {
 160       return &isDefault;
 161     }
 162   };
 163
 164   class outFileStream : public std::ofstream{
 165   public:
 166     ~outFileStream(){close();} //to close file at dtor
 167   };
 168
 169 } // anonymous namespace
 170
 171 //----------------------------------------------------------------------------------------
 172 MgAdapt::MgAdapt()
 173 {
 174   data = new MgAdaptHypothesisData();
 175   data->myInMeshName = "";
 176   data->fromMedFile = defaultFromMedFile();
 177   data->myFileInDir = defaultWorkingDirectory();
 178   data->myMeshFileIn = "";
 179   data->myFileOutDir = defaultWorkingDirectory();
 180   data->myOutMeshName = "";
 181   data->myMeshFileOut = "";
 182   data->myMeshOutMed = defaultMeshOutMed();
 183   data->myPublish = defaultPublish();
 184   data->myUseLocalMap = defaultUseLocalMap();
 185   data->myUseBackgroundMap = defaultUseBackgroundMap();
 186   data->myFileSizeMapDir = defaultWorkingDirectory();
 187   data->myMeshFileBackground = "";
 188   data->myUseConstantValue = defaultUseConstantValue();
 189   data->myConstantValue = 0.0;
 190   data->myFieldName = "";
 191   data->myUseNoTimeStep = defaultUseNoTimeStep();
 192   data->myUseLastTimeStep = defaultUseLastTimeStep();
 193   data->myUseChosenTimeStep = defaultUseChosenTimeStep();
 194   data->myTimeStep = -2;
 195   data->myRank =  -2;
 196   data->myWorkingDir = defaultWorkingDirectory();
 197   data->myLogFile = defaultLogFile();
 198   data->myVerboseLevel = defaultVerboseLevel();
 199   data->myPrintLogInFile = defaultPrintLogInFile();
 200   data->myKeepFiles = defaultKeepFiles();
 201   data->myRemoveLogOnSuccess = defaultRemoveLogOnSuccess();
 202
 203   buildModel();
 204   setAll();
 205 }
 206 MgAdapt::MgAdapt(MgAdaptHypothesisData* myData)
 207 {
 208   data = new MgAdaptHypothesisData();
 209   setData(myData);
 210   buildModel();
 211 }
 212
 213 MgAdapt::MgAdapt( const MgAdapt& copy)
 214 {
 215   data = new MgAdaptHypothesisData();
 216   MgAdaptHypothesisData *copyData = copy.getData();
 217   copyMgAdaptHypothesisData(copyData);
 218   setAll();
 219
 220   this->_option2value = copy._option2value;
 221   this->_customOption2value = copy._customOption2value;
 222   this->_defaultOptionValues = copy._defaultOptionValues;
 223   this->_doubleOptions = copy._doubleOptions;
 224   this->_charOptions = copy._charOptions;
 225   this->_boolOptions = copy._boolOptions;
 226 }
 227
 228 //-----------------------------------------------------------------------------------------
 229 MgAdapt::~MgAdapt()
 230 {
 231   delete data;
 232 }
 233 void MgAdapt::buildModel()
 234 {
 235
 236   const char* boolOptionNames[] = { "compute_ridges", // yes
 237                                     "" // mark of end
 238                                   };
 239   // const char* intOptionNames[] = { "max_number_of_errors_printed", // 1
 240   //                                  "max_number_of_threads",        // 4
 241   //                                  "" // mark of end
 242   // };
 243   const char* doubleOptionNames[] = { "max_memory",  // 0
 244                                       "" // mark of end
 245                                     };
 246   const char* charOptionNames[] = { "components",  // "yes"
 247                                     "adaptation",  // both
 248                                     "" // mark of end
 249                                   };
 250
 251   int i = 0;
 252   while (boolOptionNames[i][0])
 253   {
 254     _boolOptions.insert( boolOptionNames[i] );
 255     _option2value[boolOptionNames[i++]].clear();
 256   }
 257   // i = 0;
 258   // while (intOptionNames[i][0])
 259   //   _option2value[intOptionNames[i++]].clear();
 260
 261   i = 0;
 262   while (doubleOptionNames[i][0]) {
 263     _doubleOptions.insert(doubleOptionNames[i]);
 264     _option2value[doubleOptionNames[i++]].clear();
 265   }
 266   i = 0;
 267   while (charOptionNames[i][0]) {
 268     _charOptions.insert(charOptionNames[i]);
 269     _option2value[charOptionNames[i++]].clear();
 270   }
 271
 272   // default values to be used while MG-Adapt
 273
 274   _defaultOptionValues["adaptation"    ] = "both";
 275   _defaultOptionValues["components"    ] = "outside components";
 276   _defaultOptionValues["compute_ridges"] = "yes";
 277   _defaultOptionValues["max_memory"    ] = ToComment(defaultMaximumMemory());
 278 }
 279
 280 //=============================================================================
 281 TOptionValues MgAdapt::getOptionValues() const
 282 {
 283   TOptionValues vals;
 284   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.begin();
 285   for ( ; op_val != _option2value.end(); ++op_val )
 286     vals.insert( make_pair( op_val->first, getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() )));
 287
 288   return vals;
 289 }
 290
 291 std::vector <std::string> MgAdapt::getOptionValuesStrVec() const
 292 {
 293   std::vector <std::string> vals;
 294   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.begin();
 295   for ( ; op_val != _option2value.end(); ++op_val )
 296     vals.push_back(op_val->first+":"+getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() ));
 297
 298   return vals;
 299 }
 300
 301 std::vector <std::string> MgAdapt::getCustomOptionValuesStrVec() const
 302 {
 303   std::vector <std::string> vals;
 304   TOptionValues::const_iterator op_val;
 305   for ( op_val = _customOption2value.begin(); op_val != _customOption2value.end(); ++op_val )
 306   {
 307     vals.push_back(op_val->first+":"+getOptionValue( op_val->first, GET_DEFAULT() ));
 308   }
 309   return vals;
 310 }
 311 const TOptionValues& MgAdapt::getCustomOptionValues() const
 312 {
 313   return _customOption2value;
 314 }
 315 void MgAdapt::setData(MgAdaptHypothesisData* myData)
 316 {
 317   copyMgAdaptHypothesisData(myData);
 318   setAll();
 319 }
 320 MgAdaptHypothesisData* MgAdapt::getData() const
 321 {
 322   return data;
 323 }
 324 void MgAdapt::setMedFileIn(std::string fileName)
 325 {
 326   if ( isFileExist( fileName ))
 327   {
 328     medFileIn = fileName;
 329
 330     if (medFileOut == "") // default MED file Out
 331       medFileOut = remove_extension( fileName )+ ".adapt.med";
 332   }
 333   else
 334   {
 335     THROW_SALOME_EXCEPTION("\nThe file "<< fileName <<" does not exist.\n");
 336   }
 337 }
 338
 339 std::string MgAdapt::getMedFileIn()
 340 {
 341   return medFileIn;
 342 }
 343
 344 void MgAdapt::setMedFileOut(std::string fileOut)
 345 {
 346   medFileOut = fileOut;
 347 }
 348 std::string MgAdapt::getMedFileOut()
 349 {
 350   return medFileOut;
 351 }
 352 void MgAdapt::setMeshOutMed(bool mybool)
 353 {
 354   meshOutMed = mybool;
 355 }
 356 bool MgAdapt::getMeshOutMed()
 357 {
 358   return meshOutMed;
 359 }
 360 void MgAdapt::setPublish(bool mybool)
 361 {
 362   publish = mybool;
 363 }
 364 bool MgAdapt::getPublish()
 365 {
 366   return publish;
 367 }
 368 void MgAdapt::setFieldName(std::string myFieldName)
 369 {
 370   fieldName = myFieldName;
 371 }
 372 std::string MgAdapt::getFieldName()
 373 {
 374   return fieldName;
 375 }
 376 void MgAdapt::setTimeStep(int time)
 377 {
 378   timeStep = time;
 379 }
 380 int MgAdapt::getTimeStep() const
 381 {
 382   return timeStep;
 383 }
 384
 385 void MgAdapt::setRankTimeStep(int time, int myRank)
 386 {
 387   timeStep = time;
 388   rank = myRank;
 389 }
 390
 391 int MgAdapt::getRank()
 392 {
 393   return rank;
 394 }
 395 void MgAdapt::setTimeStepRankLast()
 396 {
 397   myUseLastTimeStep = true;
 398   myUseChosenTimeStep = false;
 399   myUseNoTimeStep = false;
 400   //~med_int aRank, tmst;
 401      //~std::string fieldFile = useBackgroundMap ? sizeMapFile : medFileIn;
 402   //~getTimeStepInfos(fieldFile, tmst, aRank);
 403   //~setRankTimeStep((int) tmst, (int) aRank);
 404 }
 405 void MgAdapt::setNoTimeStep()
 406 {
 407   myUseLastTimeStep = false;
 408   myUseChosenTimeStep = false;
 409   myUseNoTimeStep = true;
 410   //~int aRank = (int)MED_NO_IT;
 411   //~int tmst  = (int)MED_NO_DT ;
 412   //~setRankTimeStep(tmst, aRank);
 413 }
 414 void MgAdapt::setChosenTimeStepRank()
 415 {
 416   myUseLastTimeStep = false;
 417   myUseChosenTimeStep = true;
 418   myUseNoTimeStep = false;
 419   //~int aRank = (int)MED_NO_IT;
 420   //~int tmst  = (int)MED_NO_DT ;
 421   //~setRankTimeStep(tmst, aRank);
 422 }
 423 void MgAdapt::setUseLocalMap(bool myLocal)
 424 {
 425   useLocalMap = myLocal;
 426 }
 427
 428 bool MgAdapt::getUseLocalMap()
 429 {
 430   return useLocalMap;
 431 }
 432
 433 void MgAdapt::setUseBackgroundMap(bool bckg)
 434 {
 435   useBackgroundMap = bckg;
 436 }
 437
 438 bool MgAdapt::getUseBackgroundMap()
 439 {
 440   return useBackgroundMap;
 441 }
 442
 443 void MgAdapt::setUseConstantValue(bool cnst)
 444 {
 445   useConstantValue = cnst;
 446 }
 447 bool MgAdapt::getUseConstantValue()
 448 {
 449   return useConstantValue;
 450 }
 451 void MgAdapt::setLogFile(std::string myLogFile)
 452 {
 453   logFile = myLogFile;
 454 }
 455 std::string MgAdapt::getLogFile()
 456 {
 457   return logFile;
 458 }
 459 void MgAdapt::setVerbosityLevel(int verboLevel)
 460 {
 461   verbosityLevel = verboLevel;
 462 }
 463 int MgAdapt::getVerbosityLevel()
 464 {
 465   return verbosityLevel;
 466 }
 467 void MgAdapt::setRemoveOnSuccess(bool rmons)
 468 {
 469   removeOnSuccess = rmons;
 470 }
 471 bool MgAdapt::getRemoveOnSuccess()
 472 {
 473   return removeOnSuccess;
 474 }
 475 void MgAdapt::setSizeMapFile(std::string mapFile)
 476 {
 477   if ( mapFile == "" || isFileExist(mapFile) )
 478   {
 479     sizeMapFile = mapFile;
 480   }
 481   else
 482   {
 483     THROW_SALOME_EXCEPTION("\nThe file "<< mapFile <<" does not exist.\n");
 484   }
 485 }
 486 std::string MgAdapt::getSizeMapFile()
 487 {
 488   return sizeMapFile;
 489 }
 490
 491 void MgAdapt::setMeshName(std::string name)
 492 {
 493   meshName = name;
 494 }
 495 std::string MgAdapt::getMeshName()
 496 {
 497   return meshName;
 498 }
 499 void MgAdapt::setMeshNameOut(std::string name)
 500 {
 501   meshNameOut = name;
 502 }
 503 std::string MgAdapt::getMeshNameOut()
 504 {
 505   return meshNameOut;
 506 }
 507 void MgAdapt::setFromMedFile(bool mybool)
 508 {
 509   fromMedFile = mybool;
 510 }
 511 bool MgAdapt::isFromMedFile()
 512 {
 513   return fromMedFile;
 514 }
 515 void MgAdapt::setConstantValue(double cnst)
 516 {
 517   constantValue = cnst;
 518 }
 519 double MgAdapt::getConstantValue() const
 520 {
 521   return constantValue;
 522 }
 523
 524 void MgAdapt::setWorkingDir(std::string dir)
 525 {
 526   workingDir = dir;
 527 }
 528 std::string MgAdapt::getWorkingDir() const
 529 {
 530   return workingDir;
 531 }
 532 void MgAdapt::setKeepWorkingFiles(bool mybool)
 533 {
 534   toKeepWorkingFiles = mybool;
 535 }
 536 bool MgAdapt::getKeepWorkingFiles()
 537 {
 538   return toKeepWorkingFiles;
 539 }
 540 void MgAdapt::setPrintLogInFile(bool print)
 541 {
 542   printLogInFile = print;
 543 }
 544 bool MgAdapt::getPrintLogInFile()
 545 {
 546   return printLogInFile;
 547 }
 548
 549 bool MgAdapt::setAll()
 550 {
 551
 552   setFromMedFile(data->fromMedFile);
 553   std::string file;
 554   checkDirPath(data->myFileInDir);
 555   file = data->myFileInDir+data->myMeshFileIn;
 556   setMedFileIn(file);
 557   setMeshName(data->myInMeshName);
 558   setMeshNameOut(data->myOutMeshName);
 559   checkDirPath(data->myFileOutDir);
 560   std::string out = data->myFileOutDir+data->myMeshFileOut;
 561   setMedFileOut(out);
 562   setPublish(data->myPublish);
 563   setMeshOutMed(data->myMeshOutMed);
 564   setUseLocalMap(data->myUseLocalMap);
 565   setUseBackgroundMap(data->myUseBackgroundMap);
 566   setUseConstantValue(data->myUseConstantValue);
 567
 568   std::string mapfile;
 569   if (useBackgroundMap)
 570   {
 571     checkDirPath(data->myFileSizeMapDir);
 572     mapfile = data->myFileSizeMapDir+data->myMeshFileBackground;
 573     setFieldName(data->myFieldName);
 574   }
 575   else if (useConstantValue)
 576   {
 577     setConstantValue(data->myConstantValue);
 578   }
 579   else
 580   {
 581     mapfile ="";
 582     setConstantValue(0.0);
 583     setFieldName(data->myFieldName);
 584   }
 585
 586   setSizeMapFile(mapfile);
 587   if (data->myUseNoTimeStep)
 588     setNoTimeStep();
 589   else if (data->myUseLastTimeStep)
 590     setTimeStepRankLast();
 591   else
 592   {
 593     setChosenTimeStepRank();
 594     setRankTimeStep(data->myTimeStep, data->myRank);
 595   }
 596   /* Advanced options */
 597   setWorkingDir(data->myWorkingDir);
 598   checkDirPath(data->myWorkingDir);
 599   setLogFile(data->myWorkingDir+defaultLogFile());
 600   setVerbosityLevel(data->myVerboseLevel);
 601   setRemoveOnSuccess(data->myRemoveLogOnSuccess);
 602   setPrintLogInFile(data->myPrintLogInFile);
 603   setKeepWorkingFiles(data->myKeepFiles);
 604
 605   return true;
 606 }
 607
 608 void MgAdapt::checkDirPath(std::string& dirPath)
 609 {
 610   const char lastChar = *dirPath.rbegin();
 611 #ifdef WIN32
 612   if(lastChar != '\\') dirPath+='\\';
 613 #else
 614   if(lastChar != '/') dirPath+='/';
 615 #endif
 616 }
 617 //=============================================================================
 618 void MgAdapt::setOptionValue(const std::string& optionName,
 619                              const std::string& optionValue)
 620 {
 621 //   INFOS("setOptionValue");
 622 //   std::cout << "optionName: " << optionName << ", optionValue: " << optionValue << std::endl;
 623   TOptionValues::iterator op_val = _option2value.find(optionName);
 624   if (op_val == _option2value.end())
 625   {
 626     op_val = _customOption2value.find( optionName );
 627     _customOption2value[ optionName ] = optionValue;
 628     return;
 629   }
 630
 631   if (op_val->second != optionValue)
 632   {
 633     std::string lowerOptionValue = toLowerStr(optionValue);
 634     const char* ptr = lowerOptionValue.c_str();
 635     // strip white spaces
 636     while (ptr[0] == ' ')
 637       ptr++;
 638     size_t i = strlen(ptr);
 639     while (i != 0 && ptr[i - 1] == ' ')
 640       i--;
 641     // check value type
 642     bool typeOk = true;
 643     std::string typeName;
 644     if (i == 0)
 645     {
 646       // empty string
 647     }
 648     else if (_charOptions.count(optionName))
 649     {
 650       // do not check strings
 651     }
 652     else if (_doubleOptions.count(optionName))
 653     {
 654       // check if value is double
 655       toDbl(ptr, &typeOk);
 656       typeName = "real";
 657     }
 658     else if (_boolOptions.count(optionName))
 659     {
 660       // check if value is bool
 661       toBool(ptr, &typeOk);
 662       typeName = "bool";
 663     }
 664     else
 665     {
 666       // check if value is int
 667       toInt(ptr, &typeOk);
 668       typeName = "integer";
 669     }
 670     if ( typeOk ) // check some specific values ?
 671     {
 672     }
 673     if ( !typeOk )
 674     {
 675       std::string msg = "Advanced option '" + optionName + "' = '" + optionValue + "' but must be " + typeName;
 676       throw std::invalid_argument(msg);
 677     }
 678     std::string value( ptr, i );
 679 //     std::cout << "==> value: " << value << std::endl;
 680     if ( _defaultOptionValues[ optionName ] == value ) value.clear();
 681
 682 //     std::cout << "==> value: " << value << std::endl;
 683     op_val->second = value;
 684   }
 685 }
 686 //=============================================================================
 687 //! Return option value. If isDefault provided, it can be a default value,
 688 //  then *isDefault == true. If isDefault is not provided, the value will be
 689 //  empty if it equals a default one.
 690 std::string MgAdapt::getOptionValue(const std::string& optionName, bool* isDefault) const
 691 {
 692 //   INFOS("getOptionValue");
 693 //   std::cout << "optionName: " << optionName << ", isDefault: " << isDefault << std::endl;
 694   TOptionValues::const_iterator op_val = _option2value.find(optionName);
 695   if (op_val == _option2value.end())
 696   {
 697     op_val = _customOption2value.find(optionName);
 698     if (op_val == _customOption2value.end())
 699     {
 700       std::string msg = "Unknown MG-Adapt option: <" + optionName + ">";
 701       throw std::invalid_argument(msg);
 702     }
 703   }
 704   std::string val = op_val->second;
 705   if ( isDefault ) *isDefault = ( val.empty() );
 706
 707   if ( val.empty() && isDefault )
 708   {
 709     op_val = _defaultOptionValues.find( optionName );
 710     if (op_val != _defaultOptionValues.end()) val = op_val->second;
 711   }
 712 //   std::cout << "==> val: " << val << std::endl;
 713
 714   return val;
 715 }
 716 //================================================================================
 717 /*!
 718  * \brief Converts a string to a real value
 719  */
 720 //================================================================================
 721
 722 double MgAdapt::toDbl(const std::string& str, bool* isOk )
 723 {
 724   if ( str.empty() ) throw std::invalid_argument("Empty value provided");
 725
 726   char * endPtr;
 727   double val = strtod(&str[0], &endPtr);
 728   bool ok = (&str[0] != endPtr);
 729
 730   if ( isOk ) *isOk = ok;
 731
 732   if ( !ok )
 733   {
 734     std::string msg = "Not a real value:'" + str + "'";
 735     throw std::invalid_argument(msg);
 736   }
 737   return val;
 738 }
 739 //================================================================================
 740 /*!
 741  * \brief Converts a string to a lower
 742  */
 743 //================================================================================
 744 std::string MgAdapt::toLowerStr(const std::string& str)
 745 {
 746   std::string s = str;
 747   for ( size_t i = 0; i <= s.size(); ++i )
 748     s[i] = (char) tolower( s[i] );
 749   return s;
 750 }
 751 //================================================================================
 752 /*!
 753  * \brief Converts a string to a bool
 754  */
 755 //================================================================================
 756
 757 bool MgAdapt::toBool(const std::string& str, bool* isOk )
 758 {
 759   std::string s = str;
 760   if ( isOk ) *isOk = true;
 761
 762   for ( size_t i = 0; i <= s.size(); ++i )
 763     s[i] = (char) tolower( s[i] );
 764
 765   if ( s == "1" || s == "true" || s == "active" || s == "yes" )
 766     return true;
 767
 768   if ( s == "0" || s == "false" || s == "inactive" || s == "no" )
 769     return false;
 770
 771   if ( isOk )
 772     *isOk = false;
 773   else
 774   {
 775     std::string msg = "Not a Boolean value:'" + str + "'";
 776     throw std::invalid_argument(msg);
 777   }
 778   return false;
 779 }
 780 //================================================================================
 781 /*!
 782  * \brief Converts a string to a integer value
 783  */
 784 //================================================================================
 785
 786 int MgAdapt::toInt(const std::string& str, bool* isOk )
 787 {
 788   if ( str.empty() ) throw std::invalid_argument("Empty value provided");
 789
 790   char * endPtr;
 791   int val = (int)strtol( &str[0], &endPtr, 10);
 792   bool ok = (&str[0] != endPtr);
 793
 794   if ( isOk ) *isOk = ok;
 795
 796   if ( !ok )
 797   {
 798     std::string msg = "Not an integer value:'" + str + "'";
 799     throw std::invalid_argument(msg);
 800   }
 801   return val;
 802 }
 803 //=============================================================================
 804 bool MgAdapt::hasOptionDefined( const std::string& optionName ) const
 805 {
 806   bool isDefault = false;
 807   try
 808   {
 809     getOptionValue( optionName, &isDefault );
 810   }
 811   catch ( std::invalid_argument )
 812   {
 813     return false;
 814   }
 815   return !isDefault;
 816 }
 817 //================================================================================
 818 /*!
 819  * \brief Return command to run MG-Adapt mesher excluding file prefix (-f)
 820  */
 821 //================================================================================
 822
 823 std::string MgAdapt::getCommandToRun(MgAdapt* hyp)
 824 {
 825   return hyp ? hyp->getCommandToRun() : ToComment("error with hypothesis!");
 826 }
 827
 828 int MgAdapt::compute(std::string& errStr)
 829 {
 830   std::string cmd = getCommandToRun();
 831 //   std::cout << cmd << std::endl;
 832
 833   int err = 0;
 834   execCmd( cmd.c_str(), err ); // run
 835
 836   if ( err )
 837   {
 838     errStr = ToComment("system(mg-adapt.exe ...) command failed with error: ") << strerror( errno );
 839   }
 840   else if ( !isFileExist( meshFormatOutputMesh ))
 841   {
 842     errStr = ToComment(" failed to find file ") << meshFormatOutputMesh
 843                                                 << " output from MG-Adapt run";
 844   }
 845   else
 846   {
 847     convertMeshFile(meshFormatOutputMesh, solFormatOutput);
 848   }
 849   if (!err) cleanUp();
 850   return err;
 851 }
 852
 853 void MgAdapt::execCmd( const char* cmd, int& err)
 854 {
 855   err = 1;
 856   std::array <char, 128> buffer;
 857   std::streambuf* buf;
 858   outFileStream fileStream;
 859   if (printLogInFile)
 860   {
 861     fileStream.open(logFile);
 862     buf = fileStream.rdbuf();
 863   }
 864   else
 865   {
 866     buf = std::cout.rdbuf();
 867   }
 868   std::ostream logStream(buf);
 869
 870
 871 #if defined(WIN32)
 872 #  if defined(UNICODE)
 873   const wchar_t * aCmd = Kernel_Utils::utf8_decode(cmd);
 874   SMESHUtils::ArrayDeleter<const wchar_t> deleter( aCmd );
 875   std::unique_ptr <FILE, decltype(&_pclose)> pipe(_wpopen(aCmd, O_RDONLY), _pclose );
 876 #  else
 877   std::unique_ptr <FILE, decltype(&_pclose)> pipe(_popen(cmd, "r"), _pclose );
 878 #  endif
 879 #else
 880   std::unique_ptr <FILE, decltype(&pclose)> pipe(popen(cmd, "r"), pclose );
 881 #endif
 882
 883   if(!pipe)
 884   {
 885     throw std::runtime_error("popen() failed!");
 886   }
 887   while(fgets(buffer.data(), buffer.size(), pipe.get()) !=nullptr )
 888   {
 889     logStream<<buffer.data() ;
 890   }
 891   err = 0;
 892 }
 893 /*
 894  * to delete tmp files .mesh, .sol and if needed
 895  * the log file
 896  *
 897  */
 898 void MgAdapt::cleanUp()
 899 {
 900   int notOk;
 901   std::string errStr;
 902   if(toKeepWorkingFiles)
 903     return;
 904   if(removeOnSuccess && printLogInFile)
 905     tmpFilesToBeDeleted.push_back(logFile);
 906
 907   std::vector< std::string>::iterator it = tmpFilesToBeDeleted.begin();
 908   for (; it!=tmpFilesToBeDeleted.end(); ++it)
 909   {
 910     errStr=removeFile(*it, notOk);
 911     if (notOk)
 912     {
 913       appendMsgToLogFile(errStr);
 914     }
 915
 916   }
 917 }
 918
 919 void MgAdapt::appendMsgToLogFile(std::string& msg)
 920 {
 921   std::ofstream logStream;
 922   logStream.open(logFile, std::ofstream::out | std::ofstream::app);
 923   logStream<< msg;
 924   logStream.close();
 925 }
 926 //================================================================================
 927 /*!
 928  * \brief Return command to run MG-Tetra mesher excluding file prefix (-f)
 929  */
 930 //================================================================================
 931
 932 std::string MgAdapt::getCommandToRun()
 933 {
 934   /*
 935   || return system command with args and options
 936   ||
 937   */
 938   std::string errStr;
 939   std::string cmd = getExeName();
 940   std::string meshIn(""), sizeMapIn(""), solFileIn("");
 941   updateTimeStepRank();
 942   convertMedFile(meshIn, solFileIn, sizeMapIn);
 943   if (!isFileExist(meshIn) || !isFileExist(solFileIn))
 944   {
 945     errStr = ToComment(" failed to find .mesh or .sol file from converter ")<< strerror( errno );
 946     return errStr;
 947   }
 948   tmpFilesToBeDeleted.push_back(meshIn);
 949   tmpFilesToBeDeleted.push_back(solFileIn);
 950   if(useBackgroundMap && !isFileExist(sizeMapIn))
 951   {
 952     errStr = ToComment(" failed to find .mesh size map file from converter ")<< strerror( errno );
 953     return errStr;
 954   }
 955
 956   cmd+= " --in "+ meshIn;
 957   meshFormatOutputMesh = getFileName()+".mesh";
 958   tmpFilesToBeDeleted.push_back(meshFormatOutputMesh);
 959   cmd+= " --out "+ meshFormatOutputMesh;
 960   if (useLocalMap || useConstantValue) cmd+= " --sizemap "+ solFileIn;
 961   else //  (useBackgroundMap)
 962   {
 963     cmd+= " --background_mesh "+ sizeMapIn ;
 964     cmd+= " --background_sizemap "+ solFileIn;
 965     tmpFilesToBeDeleted.push_back(sizeMapIn);
 966   }
 967   //~else
 968   //~{
 969   //~// constant value TODO
 970   //~}
 971   // Check coherence between mesh dimension and option fo adaptation
 972   checkDimensionOptionAdaptation();
 973
 974   //   sizemap file is written only if level is higher than 3
 975   if ( verbosityLevel > 3)
 976   {
 977     std::string solFileOut = getFileName()+".sol";
 978     cmd+= " --write_sizemap "+ solFileOut;
 979     solFormatOutput.push_back(solFileOut);
 980     tmpFilesToBeDeleted.push_back(solFileOut);
 981   }
 982
 983   std::string option, value;
 984   bool isDefault;
 985   const TOptionValues* options[] = { &_option2value, &_customOption2value };
 986   for ( int iOp = 0; iOp < 2; ++iOp )
 987   {
 988     TOptionValues::const_iterator o2v = options[iOp]->begin();
 989     for ( ; o2v != options[iOp]->end(); ++o2v )
 990     {
 991       option = o2v->first;
 992       value = getOptionValue( option, &isDefault );
 993
 994       if ( isDefault )
 995         continue;
 996       if ( value.empty() )//value == NoValue() )
 997       {
 998         if ( _defaultOptionValues.count( option ))
 999           continue; // non-custom option with no value
1000         //value.clear();
1001       }
1002       if ( strncmp( "no", option.c_str(), 2 ) == 0 ) // options w/o values: --no_*
1003       {
1004         if ( !value.empty() && toBool( value ) == false )
1005           continue;
1006         value.clear();
1007       }
1008       if ( option[0] != '-' )
1009         cmd += " --";
1010       else
1011         cmd += " ";
1012       //       std::cout << "--- option: '" << option << ", value: '" << value <<"'"<< std::endl;
1013       cmd += option + " " + value;
1014     }
1015   }
1016
1017   // Verbosity Level
1018   if (verbosityLevel != defaultVerboseLevel())
1019   {
1020     cmd+= " --verbose "+ ToComment(verbosityLevel);
1021   }
1022   // get license key
1023   {
1024     smIdType nbVertex, nbEdge, nbFace, nbVol;
1025     DriverGMF_Read gmfReader;
1026     gmfReader.SetFile( meshIn );
1027     gmfReader.GetMeshInfo( nbVertex, nbEdge, nbFace, nbVol );
1028
1029     std::string errorTxt;
1030     std::string key = SMESHUtils_MGLicenseKeyGen::GetKey( meshIn,
1031                                                           FromSmIdType<int>( nbVertex ),
1032                                                           FromSmIdType<int>( nbEdge ),
1033                                                           FromSmIdType<int>( nbFace ),
1034                                                           FromSmIdType<int>( nbVol ),
1035                                                           errorTxt );
1036     if ( key.empty() )
1037       return ToComment( "Problem with library SalomeMeshGemsKeyGenerator: " + errorTxt );
1038
1039     cmd += " --key " + key;
1040   }
1041
1042 #ifdef WIN32
1043   cmd += " < NUL";
1044 #endif
1045   //   std::cout << "--- cmd :"<< std::endl;
1046   //   std::cout << cmd << std::endl;
1047
1048   return cmd;
1049 }
1050
1051 //=======================================================================
1052 //function : defaultMaximumMemory
1053 //=======================================================================
1054
1055 #if defined(WIN32)
1056 #include <windows.h>
1057 #elif !defined(__APPLE__)
1058 #include <sys/sysinfo.h>
1059 #endif
1060
1061 double MgAdapt::defaultMaximumMemory()
1062 {
1063 #if defined(WIN32)
1064   // See http://msdn.microsoft.com/en-us/library/aa366589.aspx
1065   MEMORYSTATUSEX statex;
1066   statex.dwLength = sizeof (statex);
1067   long err = GlobalMemoryStatusEx (&statex);
1068   if (err != 0)
1069   {
1070     double totMB = (double)statex.ullAvailPhys / 1024. / 1024.;
1071     return (double)( 0.7 * totMB );
1072   }
1073 #elif !defined(__APPLE__)
1074   struct sysinfo si;
1075   long err = sysinfo( &si );
1076   if ( err == 0 )
1077   {
1078     long ramMB = si.totalram * si.mem_unit / 1024 / 1024;
1079     return ( 0.7 * double( ramMB ));
1080   }
1081 #endif
1082   return 1024;
1083 }
1084
1085 //=======================================================================
1086 //function : defaultWorkingDirectory
1087 //=======================================================================
1088
1089 std::string MgAdapt::defaultWorkingDirectory()
1090 {
1091   std::string aTmpDir;
1092
1093   char *Tmp_dir = getenv("SALOME_TMP_DIR");
1094   if(Tmp_dir != NULL)
1095   {
1096     aTmpDir = Tmp_dir;
1097   }
1098
1099   if ( ! isFileExist( aTmpDir ))
1100   {
1101 #ifdef WIN32
1102     aTmpDir = "C:\\";
1103 #else
1104     aTmpDir = "/tmp/";
1105 #endif
1106   }
1107   return aTmpDir;
1108 }
1109 //================================================================================
1110 /*!
1111  * \brief Return a unique file name
1112  */
1113 //================================================================================
1114
1115 std::string MgAdapt::getFileName() const
1116 {
1117   std::string aTmpDir = workingDir;
1118   const char lastChar = *aTmpDir.rbegin();
1119 #ifdef WIN32
1120   if(lastChar != '\\') aTmpDir+='\\';
1121 #else
1122   if(lastChar != '/') aTmpDir+='/';
1123 #endif
1124
1125   SMESH_Comment aGenericName( aTmpDir );
1126   aGenericName << "MgAdapt_";
1127 #ifndef WIN32
1128   aGenericName << getpid();
1129 #else
1130 aGenericName << _getpid();
1131 #endif
1132   aGenericName << "_";
1133   aGenericName << std::abs((int)(long) aGenericName.data());
1134
1135   return aGenericName;
1136 }
1137 //=======================================================================
1138 //function : defaultLogFile
1139 //=======================================================================
1140
1141 std::string MgAdapt::defaultLogFile()
1142 {
1143   std::string alogFile("MG_ADAPT.log");
1144   return alogFile;
1145 }
1146 //=======================================================================
1147 //function : defaultUseConstantValue
1148 //=======================================================================
1149
1150 bool MgAdapt::defaultUseConstantValue()
1151 {
1152   return false;
1153 }
1154 //=======================================================================
1155 //function : defaultUseNoTimeStep
1156 //=======================================================================
1157
1158 bool MgAdapt::defaultUseNoTimeStep()
1159 {
1160   return true;
1161 }
1162 //=======================================================================
1163 //function : defaultRemoveLogOnSuccess
1164 //=======================================================================
1165
1166 bool MgAdapt::defaultRemoveLogOnSuccess()
1167 {
1168   return true;
1169 }
1170 //=======================================================================
1171 //function : defaultPrintLogInFile
1172 //=======================================================================
1173
1174 bool MgAdapt::defaultPrintLogInFile()
1175 {
1176   return false;
1177 }
1178 //=======================================================================
1179 //function : defaultUseChosenTimeStep
1180 //=======================================================================
1181
1182 bool MgAdapt::defaultUseChosenTimeStep()
1183 {
1184   return false;
1185 }
1186 //=======================================================================
1187 //function : UseLastTimeStep
1188 //=======================================================================
1189
1190 bool MgAdapt::defaultUseLastTimeStep()
1191 {
1192   return false;
1193 }
1194 //=======================================================================
1195 //function : defaultUseBackgroundMap
1196 //=======================================================================
1197
1198 bool MgAdapt::defaultUseBackgroundMap()
1199 {
1200   return false;
1201 }
1202 //=======================================================================
1203 //function : defaultKeepFiles
1204 //=======================================================================
1205
1206 bool MgAdapt::defaultKeepFiles()
1207 {
1208   return false;
1209 }
1210 //=======================================================================
1211 //function : defaultUseLocalMap
1212 //=======================================================================
1213
1214 bool MgAdapt::defaultUseLocalMap()
1215 {
1216   return true;
1217 }
1218 //=======================================================================
1219 //function : defaultPublish
1220 //=======================================================================
1221
1222 bool MgAdapt::defaultPublish()
1223 {
1224   return false;
1225 }
1226 //=======================================================================
1227 //function : defaultMeshOutMed
1228 //=======================================================================
1229
1230 bool MgAdapt::defaultMeshOutMed()
1231 {
1232   return true;
1233 }
1234 //=======================================================================
1235 //function : defaultFromMedFile
1236 //=======================================================================
1237
1238 bool MgAdapt::defaultFromMedFile()
1239 {
1240   return true;
1241 }
1242 //=======================================================================
1243 //function : defaultVerboseLevel
1244 //=======================================================================
1245
1246 int  MgAdapt::defaultVerboseLevel()
1247 {
1248   return 3;
1249 }
1250 std::string MgAdapt::getExeName()
1251 {
1252   return "mg-adapt.exe";
1253 }
1254 void MgAdapt::copyMgAdaptHypothesisData( const MgAdaptHypothesisData* from)
1255 {
1256   data->myFileInDir = from->myFileInDir;
1257   data->myMeshFileIn = from->myMeshFileIn;
1258   data->myMeshFileBackground = from->myMeshFileBackground;
1259   data->myOutMeshName = from->myOutMeshName;
1260   data->myMeshFileOut = from->myMeshFileOut;
1261   data->myFileOutDir = from->myFileOutDir;
1262   data->myFileSizeMapDir = from->myFileSizeMapDir;
1263   data->myFieldName = from->myFieldName;
1264   data->fromMedFile = from->fromMedFile;
1265   data->myPublish = from->myPublish;
1266   data->myMeshOutMed = from->myMeshOutMed;
1267   data->myUseLocalMap = from->myUseLocalMap;
1268   data->myUseBackgroundMap = from->myUseBackgroundMap;
1269   data->myUseConstantValue = from->myUseConstantValue;
1270   data->myConstantValue = from->myConstantValue;
1271   data->myTimeStep = from->myTimeStep;
1272   data->myRank = from->myRank;
1273   data->myUseNoTimeStep = from->myUseNoTimeStep;
1274   data->myUseLastTimeStep = from->myUseLastTimeStep;
1275   data->myUseChosenTimeStep = from->myUseChosenTimeStep;
1276   data->myWorkingDir = from->myWorkingDir;
1277   data->myLogFile = from->myLogFile;
1278   data->myPrintLogInFile = from->myPrintLogInFile;
1279   data->myKeepFiles = from->myKeepFiles;
1280   data->myRemoveLogOnSuccess = from->myRemoveLogOnSuccess;
1281   data->myVerboseLevel = from->myVerboseLevel;
1282 }
1283
1284 std::vector<std::string> MgAdapt::getListFieldsNames(std::string fileIn)
1285 {
1286   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(fileIn);
1287   std::vector<std::string> listFieldsNames(mfd->getFields()->getFieldsNames());
1288   return listFieldsNames ;
1289 }
1290
1291 void MgAdapt::checkDimensionOptionAdaptation()
1292 {
1293   // Quand le maillage est 3D, tout est possible
1294   // Quand le maillage est 2D, il faut 'surface' sauf si carte de fonds 3D
1295   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(medFileIn);
1296   int meshdim = mfd->getMeshes()->getMeshAtPos(0)->getMeshDimension() ;
1297 //   std::cout << "meshdim = " << meshdim << std::endl;
1298
1299   if ( meshdim == 2 )
1300   {
1301     std::string optionName   = "adaptation";
1302     std::string optionValue = getOptionValue(optionName);
1303 //     std::cout << "optionValue = '" << optionValue <<"'"<< std::endl;
1304     bool a_tester = false ;
1305     // carte locale ou constante : impératif d'avoir "surface"
1306     if ( useLocalMap || useConstantValue) a_tester = true ;
1307     // carte de fond : impératif d'avoir "surface" si le fonds est aussi 2D
1308     else
1309     {
1310       MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfdbg = MEDCoupling::MEDFileData::New(sizeMapFile);
1311       int meshdimbg = mfdbg->getMeshes()->getMeshAtPos(0)->getMeshDimension() ;
1312 //       std::cout << "meshdimbg = " << meshdimbg << std::endl;
1313       if ( meshdimbg == 2 ) a_tester = true ;
1314     }
1315     if ( a_tester )
1316     {
1317       if ( optionValue == "" ) setOptionValue (optionName, "surface");
1318       else
1319       {
1320         if ( optionValue != "surface" )
1321         {
1322           THROW_SALOME_EXCEPTION("Mesh dimension is 2; the option should be 'surface'"
1323                                  " instead of '" << optionValue << "'.");
1324         }
1325       }
1326     }
1327   }
1328 }
1329
1330 void MgAdapt::checkFieldName(std::string fileIn)
1331 {
1332   bool ret = false ;
1333   std::vector<std::string> listFieldsNames = getListFieldsNames(fileIn);
1334   std::size_t jaux(listFieldsNames.size());
1335   for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1336   {
1337     if ( fieldName == listFieldsNames[j] )
1338     {
1339       ret = true ;
1340       break ;
1341     }
1342   }
1343   if ( ! ret )
1344   {
1345     std::cout << "Available field names:" << std::endl;
1346     for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1347     { std::cout << listFieldsNames[j] << std::endl;}
1348     THROW_SALOME_EXCEPTION( "Field " << fieldName << " is not found.");
1349   }
1350 }
1351
1352 void MgAdapt::checkTimeStepRank(std::string fileIn)
1353 {
1354   bool ret = false ;
1355   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(fileIn);
1356   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts( mfd->getFields()->getFieldWithName(fieldName) );
1357   std::vector<double> timevalue;
1358   std::vector< std::pair<int,int> > timesteprank = fts->getTimeSteps(timevalue);
1359   std::size_t jaux(timesteprank.size());
1360   for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1361   {
1362     if ( ( timeStep == timesteprank[j].first ) & ( rank == timesteprank[j].second ) )
1363     {
1364       ret = true ;
1365       break ;
1366     }
1367   }
1368   if ( ! ret )
1369   {
1370     std::cout << "Available (Time step, Rank):" << std::endl;
1371     for(std::size_t j=0;j<jaux;j++)
1372     { std::cout << "(Time step = " << timesteprank[j].first << ", Rank = " << timesteprank[j].second << ")" << std::endl;}
1373     THROW_SALOME_EXCEPTION("(Time step = " << timeStep << ", Rank = " << rank << ") is not found.");
1374   }
1375 }
1376
1377 void MgAdapt::convertMedFile(std::string& meshFormatMeshFileName, std::string& solFormatFieldFileName, std::string& meshFormatsizeMapFile)
1378 {
1379   std::vector<std::string> fieldFileNames;
1380   MEDCoupling::MeshFormatWriter writer;
1381   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(medFileIn);
1382   MEDCoupling::MEDFileMeshes* meshes = mfd->getMeshes();
1383   MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh = meshes->getMeshAtPos(0); // ok only one mesh in file!
1384   if (meshNameOut =="")
1385     meshNameOut = fileMesh->getName();
1386   storeGroupsAndFams(fileMesh);
1387
1388   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFields> fields = MEDCoupling::MEDFileFields::New();
1389   solFormatFieldFileName = getFileName();
1390   solFormatFieldFileName+=".sol";
1391   fieldFileNames.push_back(solFormatFieldFileName);
1392
1393   if (useBackgroundMap)
1394   {
1395     checkFieldName(sizeMapFile) ;
1396     checkTimeStepRank(sizeMapFile) ;
1397     meshFormatsizeMapFile = getFileName();
1398     meshFormatsizeMapFile += ".mesh";
1399     buildBackGroundMeshAndSolFiles(fieldFileNames, meshFormatsizeMapFile);
1400   }
1401   else if(useLocalMap)
1402   {
1403     checkFieldName(medFileIn) ;
1404     checkTimeStepRank(medFileIn) ;
1405     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts( mfd->getFields()->getFieldWithName(fieldName) );
1406     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeField1TS> f = fts->getTimeStep(timeStep, rank);
1407     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS> tmFts = MEDCoupling::DynamicCast<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS,MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS>(fts);
1408
1409     // if not able to cast to double field, try float field
1410     if (!tmFts)
1411     {
1412       MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFloatFieldMultiTS>  tmFtsFloat = MEDCoupling::DynamicCast<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS,MEDCoupling::MEDFileFloatFieldMultiTS>(fts);
1413       if (!tmFtsFloat)
1414         THROW_SALOME_EXCEPTION("\nUnexpected field type.\n");
1415       // convert float field to double
1416       tmFts = tmFtsFloat->convertToDouble();
1417     }
1418
1419     fields->pushField(tmFts);
1420
1421     writer.setFieldFileNames( fieldFileNames);
1422   }
1423   else
1424   {
1425     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDCouplingMesh> mesh = fileMesh->getMeshAtLevel(1); // nodes mesh
1426     MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh> umesh = mesh->buildUnstructured(); // nodes mesh
1427     int dim  =  umesh->getSpaceDimension();
1428     int version =  sizeof(double) < 8 ? 1 : 2;
1429     mcIdType nbNodes =  umesh->getNumberOfNodes();
1430     buildConstantSizeMapSolFile(solFormatFieldFileName, dim, version, nbNodes);
1431   }
1432
1433   mfd->setFields( fields );
1434   meshFormatMeshFileName = getFileName();
1435   meshFormatMeshFileName+=".mesh";
1436   writer.setMeshFileName(meshFormatMeshFileName);
1437   writer.setMEDFileDS( mfd);
1438   writer.write();
1439
1440 }
1441
1442 void MgAdapt::convertMeshFile(std::string& meshFormatIn, std::vector< std::string>& solFieldFileNames) const
1443 {
1444   MEDCoupling::MeshFormatReader reader(meshFormatIn, solFieldFileNames);
1445
1446   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> mfd = reader.loadInMedFileDS();
1447   // write MED
1448   MEDCoupling::MEDFileMeshes* meshes = mfd->getMeshes();
1449   MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh = meshes->getMeshAtPos(0); // ok only one mesh in file!
1450   fileMesh->setName(meshNameOut);
1451   restoreGroupsAndFams(fileMesh);
1452   mfd->write(medFileOut, 2);
1453 }
1454
1455 void MgAdapt::storeGroupsAndFams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1456 {
1457   storefams(fileMesh);
1458   storeGroups(fileMesh);
1459 }
1460
1461 void MgAdapt::restoreGroupsAndFams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1462 {
1463   restorefams(fileMesh);
1464   restoreGroups(fileMesh);
1465 }
1466 void MgAdapt::storeGroups(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1467 {
1468   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grpFams = fileMesh->getGroupInfo();
1469   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator g2ff = grpFams.begin();
1470
1471   for ( ; g2ff != grpFams.end(); ++g2ff )
1472   {
1473     std::string             groupName = g2ff->first;
1474     std::vector<std::string> famNames = g2ff->second;
1475
1476     if ( famNames.empty() ) continue;
1477     std::vector< int> famListId;
1478     for ( size_t i = 0; i < famNames.size(); ++i )
1479     {
1480       famListId.push_back( FromIdType<int>( fileMesh->getFamilyId( famNames[i].c_str() )));
1481     }
1482     group grp(groupName, famListId, famNames);
1483     groupVec.push_back(grp);
1484   }
1485 }
1486
1487 void MgAdapt::storefams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh)
1488 {
1489   std::map<std::string, mcIdType> grpFams = fileMesh->getFamilyInfo();
1490   std::map<std::string, mcIdType >::iterator f = grpFams.begin();
1491
1492   for ( ; f != grpFams.end(); ++f )
1493   {
1494     if(!f->second) continue;  // FAMILLE_ZERO
1495     family fs(f->first, FromIdType<int>( f->second ));
1496     famVec.push_back(fs);
1497   }
1498
1499 }
1500
1501 void MgAdapt::restorefams(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1502 {
1503   std::vector<family>::const_iterator fIt = famVec.begin();
1504
1505   for (; fIt!=famVec.end(); ++fIt)
1506   {
1507     try  //
1508     {
1509       std::string givenFamNameFromMeshGemConverter = fileMesh->getFamilyNameGivenId( std::abs(fIt->_famId) );
1510       fileMesh->changeFamilyId(std::abs(fIt->_famId), fIt->_famId);
1511       fileMesh->changeFamilyName(givenFamNameFromMeshGemConverter, fIt->_famName);
1512     }
1513     catch (const std::exception& e)
1514     {
1515       std::cerr<<e.what();
1516     }
1517   }
1518 }
1519
1520 void MgAdapt::restoreGroups(MEDCoupling::MEDFileMesh* fileMesh) const
1521 {
1522   std::map<std::string, std::vector<std::string> > info;
1523   std::vector <group>::const_iterator grpFams = groupVec.begin();
1524
1525   for (; grpFams!=groupVec.end(); ++grpFams)
1526   {
1527     info.insert(std::pair <std::string, std::vector<std::string> > (grpFams->_name, grpFams->_famNames) );
1528   }
1529
1530   fileMesh->setGroupInfo(info);
1531 }
1532
1533 void MgAdapt::buildConstantSizeMapSolFile(const std::string& solFormatFieldFileName, const int dim, const int version, const size_t nbNodes) const
1534 {
1535   MeshFormat::Localizer loc;
1536   MeshFormat::MeshFormatParser writer;
1537   int fileId = writer.GmfOpenMesh( solFormatFieldFileName.c_str(), GmfWrite, version, dim);
1538   int typTab[] = {GmfSca};
1539   writer.GmfSetKwd(fileId, MeshFormat::GmfSolAtVertices, (int)nbNodes, 1, typTab);
1540   for (size_t i = 0; i<nbNodes; i++)
1541   {
1542     double valTab[1] = {constantValue};
1543     writer.GmfSetLin( fileId, MeshFormat::GmfSolAtVertices, valTab);
1544   }
1545   writer.GmfCloseMesh(fileId);
1546 }
1547
1548 void MgAdapt::buildBackGroundMeshAndSolFiles(const std::vector<std::string>& fieldFileNames, const std::string& meshFormatsizeMapFile) const
1549 {
1550   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileData> tmpMfd = MEDCoupling::MEDFileData::New(sizeMapFile);
1551   MEDCoupling::MEDFileFields* tmpFields = tmpMfd->getFields();
1552   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> fts( tmpFields->getFieldWithName(fieldName) );
1553   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS>  fts1 = MEDCoupling::DynamicCastSafe<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeFieldMultiTS,MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS>(fts);
1554   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileAnyTypeField1TS> f = fts1->getTimeStep(timeStep, rank);
1555   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS> tmFts = MEDCoupling::MEDFileFieldMultiTS::New();
1556   tmFts->pushBackTimeStep(f);
1557
1558   MEDCoupling::MCAuto<MEDCoupling::MEDFileFields> tmp_fields = MEDCoupling::MEDFileFields::New();
1559   tmp_fields->pushField(tmFts);
1560
1561   tmpMfd->setFields( tmp_fields );
1562   MEDCoupling::MeshFormatWriter tmpWriter;
1563   tmpWriter.setMeshFileName(meshFormatsizeMapFile);
1564   tmpWriter.setFieldFileNames( fieldFileNames);
1565   tmpWriter.setMEDFileDS(tmpMfd);
1566   tmpWriter.write();
1567 }
1568
1569 MgAdapt::Status MgAdapt::addMessage(const std::string& msg,
1570                                     const bool         isFatal/*=false*/)
1571 {
1572   if ( isFatal )
1573     _errorMessages.clear(); // warnings are useless if a fatal error encounters
1574
1575   _errorMessages.push_back( msg );
1576
1577   //~MESSAGE(msg);
1578 #ifdef _DEBUG_
1579   std::cout << msg << std::endl;
1580 #endif
1581   return ( _status = isFatal ? MgAdapt::DRS_FAIL : MgAdapt::DRS_WARN_SKIP_ELEM );
1582 }
1583
1584 void MgAdapt::updateTimeStepRank()
1585 {
1586
1587   med_int arank;
1588   med_int tmst;
1589   if (myUseNoTimeStep)
1590   {
1591     arank = MED_NO_IT;
1592     tmst  = MED_NO_DT ;
1593     setRankTimeStep((int)tmst, (int)arank);
1594   }
1595   else if (myUseLastTimeStep)
1596   {
1597     std::string fieldFile = useBackgroundMap ? sizeMapFile : medFileIn;
1598     getTimeStepInfos(fieldFile, tmst, arank, fieldName);
1599     setRankTimeStep((int)tmst, (int)arank);
1600   }
1601 }