src/SMDS/SMDS_UnstructuredGrid.cxx

   1 // Copyright (C) 2010-2019  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "SMDS_UnstructuredGrid.hxx"
  21 #include "SMDS_Mesh.hxx"
  22 #include "SMDS_MeshInfo.hxx"
  23 #include "SMDS_Downward.hxx"
  24 #include "SMDS_MeshVolume.hxx"
  25
  26 #include "utilities.h"
  27 #include "chrono.hxx"
  28
  29 #include <vtkCellArray.h>
  30 #include <vtkCellData.h>
  31 #include <vtkCellLinks.h>
  32 #include <vtkDoubleArray.h>
  33 #include <vtkIdTypeArray.h>
  34 #include <vtkUnsignedCharArray.h>
  35
  36 #include <list>
  37 #include <climits>
  38
  39 SMDS_CellLinks* SMDS_CellLinks::New()
  40 {
  41   return new SMDS_CellLinks();
  42 }
  43
  44 void SMDS_CellLinks::ResizeForPoint(vtkIdType vtkID)
  45 {
  46   if ( vtkID > this->MaxId )
  47   {
  48     this->MaxId = vtkID;
  49     if ( vtkID >= this->Size )
  50       vtkCellLinks::Resize( vtkID+SMDS_Mesh::chunkSize );
  51   }
  52 }
  53
  54 void SMDS_CellLinks::BuildLinks(vtkDataSet *data, vtkCellArray *Connectivity, vtkUnsignedCharArray* types)
  55 {
  56   // build links taking into account removed cells
  57
  58   vtkIdType numPts = data->GetNumberOfPoints();
  59   vtkIdType j, cellId = 0;
  60   unsigned short *linkLoc;
  61   vtkIdType npts=0;
  62   vtkIdType *pts=0;
  63   vtkIdType loc = Connectivity->GetTraversalLocation();
  64
  65   // traverse data to determine number of uses of each point
  66   cellId = 0;
  67   for (Connectivity->InitTraversal();
  68        Connectivity->GetNextCell(npts,pts); cellId++)
  69   {
  70     if ( types->GetValue( cellId ) != VTK_EMPTY_CELL )
  71       for (j=0; j < npts; j++)
  72       {
  73         this->IncrementLinkCount(pts[j]);
  74       }
  75   }
  76
  77   // now allocate storage for the links
  78   this->AllocateLinks(numPts);
  79   this->MaxId = numPts - 1;
  80
  81   // fill out lists with references to cells
  82   linkLoc = new unsigned short[numPts];
  83   memset(linkLoc, 0, numPts*sizeof(unsigned short));
  84
  85   cellId = 0;
  86   for (Connectivity->InitTraversal();
  87        Connectivity->GetNextCell(npts,pts); cellId++)
  88   {
  89     if ( types->GetValue( cellId ) != VTK_EMPTY_CELL )
  90       for (j=0; j < npts; j++)
  91       {
  92         this->InsertCellReference(pts[j], (linkLoc[pts[j]])++, cellId);
  93       }
  94   }
  95   delete [] linkLoc;
  96   Connectivity->SetTraversalLocation(loc);
  97 }
  98
  99 SMDS_CellLinks::SMDS_CellLinks() :
 100   vtkCellLinks()
 101 {
 102 }
 103
 104 SMDS_CellLinks::~SMDS_CellLinks()
 105 {
 106 }
 107
 108 SMDS_UnstructuredGrid* SMDS_UnstructuredGrid::New()
 109 {
 110   return new SMDS_UnstructuredGrid();
 111 }
 112
 113 SMDS_UnstructuredGrid::SMDS_UnstructuredGrid() :
 114   vtkUnstructuredGrid()
 115 {
 116   _cellIdToDownId.clear();
 117   _downTypes.clear();
 118   _downArray.clear();
 119   _mesh = 0;
 120 }
 121
 122 SMDS_UnstructuredGrid::~SMDS_UnstructuredGrid()
 123 {
 124 }
 125
 126 vtkMTimeType SMDS_UnstructuredGrid::GetMTime()
 127 {
 128   vtkMTimeType mtime = vtkUnstructuredGrid::GetMTime();
 129   return mtime;
 130 }
 131
 132 vtkPoints* SMDS_UnstructuredGrid::GetPoints()
 133 {
 134   // TODO erreur incomprehensible de la macro vtk GetPoints apparue avec la version paraview de fin aout 2010
 135   return this->Points;
 136 }
 137
 138 int SMDS_UnstructuredGrid::InsertNextLinkedCell(int type, int npts, vtkIdType *pts)
 139 {
 140   if ( !this->Links ) // don't create Links until they are needed
 141   {
 142     return this->InsertNextCell(type, npts, pts);
 143   }
 144
 145   if ( type != VTK_POLYHEDRON )
 146     return vtkUnstructuredGrid::InsertNextLinkedCell(type, npts, pts);
 147
 148   // --- type = VTK_POLYHEDRON
 149   int cellid = this->InsertNextCell(type, npts, pts);
 150
 151   std::set<vtkIdType> setOfNodes;
 152   setOfNodes.clear();
 153   int nbfaces = npts;
 154   int i = 0;
 155   for (int nf = 0; nf < nbfaces; nf++)
 156   {
 157     int nbnodes = pts[i];
 158     i++;
 159     for (int k = 0; k < nbnodes; k++)
 160     {
 161       if ( setOfNodes.insert( pts[i] ).second )
 162       {
 163         this->Links->ResizeCellList( pts[i], 1 );
 164         this->Links->AddCellReference( cellid, pts[i] );
 165       }
 166       i++;
 167     }
 168   }
 169
 170   return cellid;
 171 }
 172
 173 void SMDS_UnstructuredGrid::setSMDS_mesh(SMDS_Mesh *mesh)
 174 {
 175   _mesh = mesh;
 176 }
 177
 178 void SMDS_UnstructuredGrid::compactGrid(std::vector<int>& idNodesOldToNew, int newNodeSize,
 179                                         std::vector<int>& idCellsNewToOld, int newCellSize)
 180 {
 181   this->DeleteLinks();
 182
 183   // IDs of VTK nodes always correspond to SMDS IDs but there can be "holes" in SMDS numeration.
 184   // We compact only if there were holes
 185
 186   int oldNodeSize = this->GetNumberOfPoints();
 187   bool updateNodes = ( oldNodeSize > newNodeSize );
 188   if ( true /*updateNodes*/ )
 189   {
 190     // 21125: EDF 1233 SMESH: Degradation of precision in a test case for quadratic conversion
 191     // Use double type for storing coordinates of nodes instead float.
 192     vtkPoints *newPoints = vtkPoints::New();
 193     newPoints->SetDataType( VTK_DOUBLE );
 194     newPoints->SetNumberOfPoints( newNodeSize );
 195
 196     int i = 0, alreadyCopied = 0;
 197     while ( i < oldNodeSize )
 198     {
 199       // skip a hole if any
 200       while ( i < oldNodeSize && idNodesOldToNew[i] < 0 )
 201         ++i;
 202       int startBloc = i;
 203       // look for a block end
 204       while ( i < oldNodeSize && idNodesOldToNew[i] >= 0 )
 205         ++i;
 206       int endBloc = i;
 207       copyNodes(newPoints, idNodesOldToNew, alreadyCopied, startBloc, endBloc);
 208     }
 209     this->SetPoints(newPoints);
 210     newPoints->Delete();
 211   }
 212   else
 213   {
 214     this->Points->Squeeze();
 215     this->Points->Modified();
 216   }
 217
 218   // Compact cells if VTK IDs do not correspond to SMDS IDs or nodes compacted
 219
 220   int  oldCellSize = this->Types->GetNumberOfTuples();
 221   bool updateCells = ( updateNodes || newCellSize != oldCellSize );
 222   for ( int newID = 0, nbIDs = idCellsNewToOld.size(); newID < nbIDs &&  !updateCells; ++newID )
 223     updateCells = ( idCellsNewToOld[ newID ] != newID );
 224
 225   if ( false /*!updateCells*/ ) // no holes in elements
 226   {
 227     this->Connectivity->Squeeze();
 228     this->Locations->Squeeze();
 229     this->Types->Squeeze();
 230     if ( this->FaceLocations )
 231     {
 232       this->FaceLocations->Squeeze();
 233       this->Faces->Squeeze();
 234     }
 235     this->Connectivity->Modified();
 236     return;
 237   }
 238
 239   if ((int) idNodesOldToNew.size() < oldNodeSize )
 240   {
 241     idNodesOldToNew.reserve( oldNodeSize );
 242     for ( int i = idNodesOldToNew.size(); i < oldNodeSize; ++i )
 243       idNodesOldToNew.push_back( i );
 244   }
 245
 246   // --- create new compacted Connectivity, Locations and Types
 247
 248   int newConnectivitySize = this->Connectivity->GetNumberOfConnectivityEntries();
 249   if ( newCellSize != oldCellSize )
 250     for ( int i = 0; i < oldCellSize - 1; ++i )
 251       if ( this->Types->GetValue( i ) == VTK_EMPTY_CELL )
 252         newConnectivitySize -= this->Locations->GetValue( i+1 ) - this->Locations->GetValue( i );
 253
 254   vtkCellArray *newConnectivity = vtkCellArray::New();
 255   newConnectivity->Initialize();
 256   newConnectivity->Allocate( newConnectivitySize );
 257
 258   vtkUnsignedCharArray *newTypes = vtkUnsignedCharArray::New();
 259   newTypes->Initialize();
 260   newTypes->SetNumberOfValues(newCellSize);
 261
 262   vtkIdTypeArray *newLocations = vtkIdTypeArray::New();
 263   newLocations->Initialize();
 264   newLocations->SetNumberOfValues(newCellSize);
 265
 266   std::vector< vtkIdType > pointsCell(1024); // --- points id to fill a new cell
 267
 268   copyBloc(newTypes, idCellsNewToOld, idNodesOldToNew,
 269            newConnectivity, newLocations, pointsCell );
 270
 271   if (vtkDoubleArray* diameters =
 272       vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() )) // Balls
 273   {
 274     vtkDoubleArray* newDiameters = vtkDoubleArray::New();
 275     newDiameters->SetNumberOfComponents(1);
 276     for ( int newCellID = 0; newCellID < newCellSize; newCellID++ )
 277     {
 278       if ( newTypes->GetValue( newCellID ) == VTK_POLY_VERTEX )
 279       {
 280         int oldCellID = idCellsNewToOld[ newCellID ];
 281         newDiameters->InsertValue( newCellID, diameters->GetValue( oldCellID ));
 282       }
 283       vtkDataSet::CellData->SetScalars( newDiameters );
 284     }
 285   }
 286
 287   if (this->FaceLocations)
 288   {
 289     vtkIdTypeArray *newFaceLocations = vtkIdTypeArray::New();
 290     newFaceLocations->Initialize();
 291     newFaceLocations->Allocate(newTypes->GetSize());
 292     vtkIdTypeArray *newFaces = vtkIdTypeArray::New();
 293     newFaces->Initialize();
 294     newFaces->Allocate(this->Faces->GetSize());
 295     for ( int newCellID = 0; newCellID < newCellSize; newCellID++ )
 296     {
 297       if ( newTypes->GetValue( newCellID ) == VTK_POLYHEDRON )
 298       {
 299         int oldCellId = idCellsNewToOld[ newCellID ];
 300         newFaceLocations->InsertNextValue( newFaces->GetMaxId()+1 );
 301         int oldFaceLoc = this->FaceLocations->GetValue( oldCellId );
 302         int nCellFaces = this->Faces->GetValue( oldFaceLoc++ );
 303         newFaces->InsertNextValue( nCellFaces );
 304         for ( int n = 0; n < nCellFaces; n++ )
 305         {
 306           int nptsInFace = this->Faces->GetValue( oldFaceLoc++ );
 307           newFaces->InsertNextValue( nptsInFace );
 308           for ( int k = 0; k < nptsInFace; k++ )
 309           {
 310             int oldpt = this->Faces->GetValue( oldFaceLoc++ );
 311             newFaces->InsertNextValue( idNodesOldToNew[ oldpt ]);
 312           }
 313         }
 314       }
 315       else
 316       {
 317         newFaceLocations->InsertNextValue(-1);
 318       }
 319     }
 320     newFaceLocations->Squeeze();
 321     newFaces->Squeeze();
 322     this->SetCells( newTypes, newLocations, newConnectivity, newFaceLocations, newFaces );
 323     newFaceLocations->Delete();
 324     newFaces->Delete();
 325   }
 326   else
 327   {
 328     this->SetCells( newTypes, newLocations, newConnectivity, FaceLocations, Faces );
 329   }
 330
 331   newTypes->Delete();
 332   newLocations->Delete();
 333   newConnectivity->Delete();
 334 }
 335
 336 void SMDS_UnstructuredGrid::copyNodes(vtkPoints *       newPoints,
 337                                       std::vector<int>& idNodesOldToNew,
 338                                       int&              alreadyCopied,
 339                                       int               start,
 340                                       int               end)
 341 {
 342   void *target = newPoints->GetVoidPointer(3 * alreadyCopied);
 343   void *source = this->Points->GetVoidPointer(3 * start);
 344   int nbPoints = end - start;
 345   if (nbPoints > 0)
 346   {
 347     memcpy(target, source, 3 * sizeof(double) * nbPoints);
 348     alreadyCopied += nbPoints;
 349   }
 350 }
 351
 352 void SMDS_UnstructuredGrid::copyBloc(vtkUnsignedCharArray *  newTypes,
 353                                      const std::vector<int>& idCellsNewToOld,
 354                                      const std::vector<int>& idNodesOldToNew,
 355                                      vtkCellArray*           newConnectivity,
 356                                      vtkIdTypeArray*         newLocations,
 357                                      std::vector<vtkIdType>& pointsCell)
 358 {
 359   for ( size_t iNew = 0; iNew < idCellsNewToOld.size(); iNew++ )
 360   {
 361     int iOld = idCellsNewToOld[ iNew ];
 362     newTypes->SetValue( iNew, this->Types->GetValue( iOld ));
 363     vtkIdType oldLoc = this->Locations->GetValue( iOld );
 364     vtkIdType nbpts;
 365     vtkIdType *oldPtsCell = 0;
 366     this->Connectivity->GetCell( oldLoc, nbpts, oldPtsCell );
 367     if ((vtkIdType) pointsCell.size() < nbpts )
 368       pointsCell.resize( nbpts );
 369     for ( int l = 0; l < nbpts; l++ )
 370     {
 371       int oldval = oldPtsCell[l];
 372       pointsCell[l] = idNodesOldToNew[oldval];
 373     }
 374     /*int newcnt = */newConnectivity->InsertNextCell( nbpts, pointsCell.data() );
 375     int newLoc = newConnectivity->GetInsertLocation( nbpts );
 376     newLocations->SetValue( iNew, newLoc );
 377   }
 378 }
 379
 380 int SMDS_UnstructuredGrid::CellIdToDownId(int vtkCellId)
 381 {
 382   if ((vtkCellId < 0) || (vtkCellId >= (int)_cellIdToDownId.size()))
 383   {
 384     return -1;
 385   }
 386   return _cellIdToDownId[vtkCellId];
 387 }
 388
 389 void SMDS_UnstructuredGrid::setCellIdToDownId(int vtkCellId, int downId)
 390 {
 391   // ASSERT((vtkCellId >= 0) && (vtkCellId < _cellIdToDownId.size()));
 392   _cellIdToDownId[vtkCellId] = downId;
 393 }
 394
 395 void SMDS_UnstructuredGrid::CleanDownwardConnectivity()
 396 {
 397   for (size_t i = 0; i < _downArray.size(); i++)
 398   {
 399     if (_downArray[i])
 400       delete _downArray[i];
 401     _downArray[i] = 0;
 402   }
 403   _cellIdToDownId.clear();
 404 }
 405
 406 /*! Build downward connectivity: to do only when needed because heavy memory load.
 407  *  Downward connectivity is no more valid if vtkUnstructuredGrid is modified.
 408  *
 409  */
 410 void SMDS_UnstructuredGrid::BuildDownwardConnectivity(bool withEdges)
 411 {
 412   MESSAGE("SMDS_UnstructuredGrid::BuildDownwardConnectivity");CHRONO(2);
 413   // TODO calcul partiel sans edges
 414
 415   // --- erase previous data if any
 416
 417   this->CleanDownwardConnectivity();
 418
 419   // --- create SMDS_Downward structures (in _downArray vector[vtkCellType])
 420
 421   _downArray.resize(VTK_MAXTYPE + 1, 0);
 422
 423   _downArray[VTK_LINE]                    = new SMDS_DownEdge(this);
 424   _downArray[VTK_QUADRATIC_EDGE]          = new SMDS_DownQuadEdge(this);
 425   _downArray[VTK_TRIANGLE]                = new SMDS_DownTriangle(this);
 426   _downArray[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]      = new SMDS_DownQuadTriangle(this);
 427   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]    = new SMDS_DownQuadTriangle(this);
 428   _downArray[VTK_QUAD]                    = new SMDS_DownQuadrangle(this);
 429   _downArray[VTK_QUADRATIC_QUAD]          = new SMDS_DownQuadQuadrangle(this);
 430   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]        = new SMDS_DownQuadQuadrangle(this);
 431   _downArray[VTK_TETRA]                   = new SMDS_DownTetra(this);
 432   _downArray[VTK_QUADRATIC_TETRA]         = new SMDS_DownQuadTetra(this);
 433   _downArray[VTK_PYRAMID]                 = new SMDS_DownPyramid(this);
 434   _downArray[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]       = new SMDS_DownQuadPyramid(this);
 435   _downArray[VTK_WEDGE]                   = new SMDS_DownPenta(this);
 436   _downArray[VTK_QUADRATIC_WEDGE]         = new SMDS_DownQuadPenta(this);
 437   _downArray[VTK_HEXAHEDRON]              = new SMDS_DownHexa(this);
 438   _downArray[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]    = new SMDS_DownQuadHexa(this);
 439   _downArray[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON] = new SMDS_DownQuadHexa(this);
 440   _downArray[VTK_HEXAGONAL_PRISM]         = new SMDS_DownPenta(this);
 441
 442   // --- get detailed info of number of cells of each type, allocate SMDS_downward structures
 443
 444   const SMDS_MeshInfo &meshInfo = _mesh->GetMeshInfo();
 445
 446   int nbLinTetra  = meshInfo.NbTetras  (ORDER_LINEAR);
 447   int nbQuadTetra = meshInfo.NbTetras  (ORDER_QUADRATIC);
 448   int nbLinPyra   = meshInfo.NbPyramids(ORDER_LINEAR);
 449   int nbQuadPyra  = meshInfo.NbPyramids(ORDER_QUADRATIC);
 450   int nbLinPrism  = meshInfo.NbPrisms  (ORDER_LINEAR);
 451   int nbQuadPrism = meshInfo.NbPrisms  (ORDER_QUADRATIC);
 452   int nbLinHexa   = meshInfo.NbHexas   (ORDER_LINEAR);
 453   int nbQuadHexa  = meshInfo.NbHexas   (ORDER_QUADRATIC);
 454   int nbHexPrism  = meshInfo.NbHexPrisms();
 455
 456   int nbLineGuess     = int((4.0 / 3.0) * nbLinTetra + 2 * nbLinPrism + 2.5 * nbLinPyra + 3 * nbLinHexa);
 457   int nbQuadEdgeGuess = int((4.0 / 3.0) * nbQuadTetra + 2 * nbQuadPrism + 2.5 * nbQuadPyra + 3 * nbQuadHexa);
 458   int nbLinTriaGuess  = 2 * nbLinTetra + nbLinPrism + 2 * nbLinPyra;
 459   int nbQuadTriaGuess = 2 * nbQuadTetra + nbQuadPrism + 2 * nbQuadPyra;
 460   int nbLinQuadGuess  = int((2.0 / 3.0) * nbLinPrism + (1.0 / 2.0) * nbLinPyra + 3 * nbLinHexa);
 461   int nbQuadQuadGuess = int((2.0 / 3.0) * nbQuadPrism + (1.0 / 2.0) * nbQuadPyra + 3 * nbQuadHexa);
 462
 463   int GuessSize[VTK_MAXTYPE];
 464   GuessSize[VTK_LINE]                    = nbLineGuess;
 465   GuessSize[VTK_QUADRATIC_EDGE]          = nbQuadEdgeGuess;
 466   GuessSize[VTK_TRIANGLE]                = nbLinTriaGuess;
 467   GuessSize[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]      = nbQuadTriaGuess;
 468   GuessSize[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]    = nbQuadTriaGuess;
 469   GuessSize[VTK_QUAD]                    = nbLinQuadGuess;
 470   GuessSize[VTK_QUADRATIC_QUAD]          = nbQuadQuadGuess;
 471   GuessSize[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]        = nbQuadQuadGuess;
 472   GuessSize[VTK_TETRA]                   = nbLinTetra;
 473   GuessSize[VTK_QUADRATIC_TETRA]         = nbQuadTetra;
 474   GuessSize[VTK_PYRAMID]                 = nbLinPyra;
 475   GuessSize[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]       = nbQuadPyra;
 476   GuessSize[VTK_WEDGE]                   = nbLinPrism;
 477   GuessSize[VTK_QUADRATIC_WEDGE]         = nbQuadPrism;
 478   GuessSize[VTK_HEXAHEDRON]              = nbLinHexa;
 479   GuessSize[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]    = nbQuadHexa;
 480   GuessSize[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON] = nbQuadHexa;
 481   GuessSize[VTK_HEXAGONAL_PRISM]         = nbHexPrism;
 482
 483   _downArray[VTK_LINE]                   ->allocate(nbLineGuess);
 484   _downArray[VTK_QUADRATIC_EDGE]         ->allocate(nbQuadEdgeGuess);
 485   _downArray[VTK_TRIANGLE]               ->allocate(nbLinTriaGuess);
 486   _downArray[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]     ->allocate(nbQuadTriaGuess);
 487   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]   ->allocate(nbQuadTriaGuess);
 488   _downArray[VTK_QUAD]                   ->allocate(nbLinQuadGuess);
 489   _downArray[VTK_QUADRATIC_QUAD]         ->allocate(nbQuadQuadGuess);
 490   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]       ->allocate(nbQuadQuadGuess);
 491   _downArray[VTK_TETRA]                  ->allocate(nbLinTetra);
 492   _downArray[VTK_QUADRATIC_TETRA]        ->allocate(nbQuadTetra);
 493   _downArray[VTK_PYRAMID]                ->allocate(nbLinPyra);
 494   _downArray[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]      ->allocate(nbQuadPyra);
 495   _downArray[VTK_WEDGE]                  ->allocate(nbLinPrism);
 496   _downArray[VTK_QUADRATIC_WEDGE]        ->allocate(nbQuadPrism);
 497   _downArray[VTK_HEXAHEDRON]             ->allocate(nbLinHexa);
 498   _downArray[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]   ->allocate(nbQuadHexa);
 499   _downArray[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON]->allocate(nbQuadHexa);
 500   _downArray[VTK_HEXAGONAL_PRISM]        ->allocate(nbHexPrism);
 501
 502   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only faces
 503   //     for each vtk face:
 504   //       create a downward face entry with its downward id.
 505   //       compute vtk volumes, create downward volumes entry.
 506   //       mark face in downward volumes
 507   //       mark volumes in downward face
 508
 509   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only faces");CHRONO(20);
 510   int cellSize = this->Types->GetNumberOfTuples();
 511   _cellIdToDownId.resize(cellSize, -1);
 512
 513   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 514     {
 515       int vtkFaceType = this->GetCellType(i);
 516       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkFaceType) == 2)
 517         {
 518           int vtkFaceId = i;
 519           //ASSERT(_downArray[vtkFaceType]);
 520           int connFaceId = _downArray[vtkFaceType]->addCell(vtkFaceId);
 521           SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 522           downFace->setTempNodes(connFaceId, vtkFaceId);
 523           int vols[2] = { -1, -1 };
 524           int nbVolumes = downFace->computeVolumeIds(vtkFaceId, vols);
 525           //MESSAGE("nbVolumes="<< nbVolumes);
 526           for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 527             {
 528               int vtkVolId = vols[ivol];
 529               int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId);
 530               //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 531               int connVolId = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId);
 532               _downArray[vtkVolType]->addDownCell(connVolId, connFaceId, vtkFaceType);
 533               _downArray[vtkFaceType]->addUpCell(connFaceId, connVolId, vtkVolType);
 534               // MESSAGE("Face " << vtkFaceId << " belongs to volume " << vtkVolId);
 535             }
 536         }
 537     }
 538
 539   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only volumes
 540   //     for each vtk volume:
 541   //       create downward volumes entry if not already done
 542   //       build a temporary list of faces described with their nodes
 543   //       for each face
 544   //         compute the vtk volumes containing this face
 545   //         check if the face is already listed in the volumes (comparison of ordered list of nodes)
 546   //         if not, create a downward face entry (resizing of structure required)
 547   //         (the downward faces store a temporary list of nodes to ease the comparison)
 548   //         create downward volumes entry if not already done
 549   //         mark volumes in downward face
 550   //         mark face in downward volumes
 551
 552   CHRONOSTOP(20);
 553   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only volumes");CHRONO(21);
 554
 555   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 556     {
 557       int vtkType = this->GetCellType(i);
 558       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType) == 3)
 559         {
 560           //CHRONO(31);
 561           int vtkVolId = i;
 562           // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId);
 563           //ASSERT(_downArray[vtkType]);
 564           /*int connVolId = */_downArray[vtkType]->addCell(vtkVolId);
 565
 566           // --- find all the faces of the volume, describe the faces by their nodes
 567
 568           SMDS_Down3D* downVol = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkType]);
 569           ListElemByNodesType facesWithNodes;
 570           downVol->computeFacesWithNodes(vtkVolId, facesWithNodes);
 571           // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId << " contains " << facesWithNodes.nbElems << " faces");
 572           //CHRONOSTOP(31);
 573           for (int iface = 0; iface < facesWithNodes.nbElems; iface++)
 574             {
 575               // --- find the volumes containing the face
 576
 577               //CHRONO(32);
 578               int vtkFaceType = facesWithNodes.elems[iface].vtkType;
 579               SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 580               int vols[2] = { -1, -1 };
 581               int *nodes = &facesWithNodes.elems[iface].nodeIds[0];
 582               int lg = facesWithNodes.elems[iface].nbNodes;
 583               int nbVolumes = downFace->computeVolumeIdsFromNodesFace(nodes, lg, vols);
 584               // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId << " face " << iface << " belongs to " << nbVolumes << " volumes");
 585
 586               // --- check if face is registered in the volumes
 587               //CHRONOSTOP(32);
 588
 589               //CHRONO(33);
 590               int connFaceId = -1;
 591               for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 592                 {
 593                   int vtkVolId2 = vols[ivol];
 594                   int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId2);
 595                   //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 596                   int connVolId2 = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId2);
 597                   SMDS_Down3D* downVol2 = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkVolType]);
 598                   connFaceId = downVol2->FindFaceByNodes(connVolId2, facesWithNodes.elems[iface]);
 599                   if (connFaceId >= 0)
 600                     break; // --- face already created
 601                 }//CHRONOSTOP(33);
 602
 603               // --- if face is not registered in the volumes, create face
 604
 605               //CHRONO(34);
 606               if (connFaceId < 0)
 607                 {
 608                   connFaceId = _downArray[vtkFaceType]->addCell();
 609                   downFace->setTempNodes(connFaceId, facesWithNodes.elems[iface]);
 610                 }//CHRONOSTOP(34);
 611
 612               // --- mark volumes in downward face and mark face in downward volumes
 613
 614               //CHRONO(35);
 615               for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 616                 {
 617                   int vtkVolId2 = vols[ivol];
 618                   int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId2);
 619                   //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 620                   int connVolId2 = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId2);
 621                   _downArray[vtkVolType]->addDownCell(connVolId2, connFaceId, vtkFaceType);
 622                   _downArray[vtkFaceType]->addUpCell(connFaceId, connVolId2, vtkVolType);
 623                   // MESSAGE(" From volume " << vtkVolId << " face " << connFaceId << " belongs to volume " << vtkVolId2);
 624                 }//CHRONOSTOP(35);
 625             }
 626         }
 627     }
 628
 629   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only edges
 630   //     for each vtk edge:
 631   //       create downward edge entry
 632   //       store the nodes id's in downward edge (redundant with vtkUnstructuredGrid)
 633   //       find downward faces
 634   //       (from vtk faces or volumes, get downward faces, they have a temporary list of nodes)
 635   //       mark edge in downward faces
 636   //       mark faces in downward edge
 637
 638   CHRONOSTOP(21);
 639   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only edges");CHRONO(22);
 640
 641   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 642     {
 643       int vtkEdgeType = this->GetCellType(i);
 644       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkEdgeType) == 1)
 645         {
 646           int vtkEdgeId = i;
 647           //ASSERT(_downArray[vtkEdgeType]);
 648           int connEdgeId = _downArray[vtkEdgeType]->addCell(vtkEdgeId);
 649           SMDS_Down1D* downEdge = static_cast<SMDS_Down1D*> (_downArray[vtkEdgeType]);
 650           downEdge->setNodes(connEdgeId, vtkEdgeId);
 651           std::vector<int> vtkIds;
 652           int nbVtkCells = downEdge->computeVtkCells(connEdgeId, vtkIds);
 653           int downFaces[1000];
 654           unsigned char downTypes[1000];
 655           int nbDownFaces = downEdge->computeFaces(connEdgeId, &vtkIds[0], nbVtkCells, downFaces, downTypes);
 656           for (int n = 0; n < nbDownFaces; n++)
 657             {
 658               _downArray[downTypes[n]]->addDownCell(downFaces[n], connEdgeId, vtkEdgeType);
 659               _downArray[vtkEdgeType]->addUpCell(connEdgeId, downFaces[n], downTypes[n]);
 660             }
 661         }
 662     }
 663
 664   // --- iteration on downward faces (they are all listed now)
 665   //     for each downward face:
 666   //       build a temporary list of edges with their ordered list of nodes
 667   //       for each edge:
 668   //         find all the vtk cells containing this edge
 669   //         then identify all the downward faces containing the edge, from the vtk cells
 670   //         check if the edge is already listed in the faces (comparison of ordered list of nodes)
 671   //         if not, create a downward edge entry with the node id's
 672   //         mark edge in downward faces
 673   //         mark downward faces in edge (size of list unknown, to be allocated)
 674
 675   CHRONOSTOP(22);CHRONO(23);
 676
 677   for (int vtkFaceType = 0; vtkFaceType < VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkFaceType++)
 678     {
 679       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkFaceType) != 2)
 680         continue;
 681
 682       // --- find all the edges of the face, describe the edges by their nodes
 683
 684       SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 685       int maxId = downFace->getMaxId();
 686       for (int faceId = 0; faceId < maxId; faceId++)
 687         {
 688           //CHRONO(40);
 689           ListElemByNodesType edgesWithNodes;
 690           downFace->computeEdgesWithNodes(faceId, edgesWithNodes);
 691           // MESSAGE("downward face type " << vtkFaceType << " num " << faceId << " contains " << edgesWithNodes.nbElems << " edges");
 692
 693           //CHRONOSTOP(40);
 694           for (int iedge = 0; iedge < edgesWithNodes.nbElems; iedge++)
 695             {
 696
 697               // --- check if the edge is already registered by exploration of the faces
 698
 699               //CHRONO(41);
 700               std::vector<int> vtkIds;
 701               unsigned char vtkEdgeType = edgesWithNodes.elems[iedge].vtkType;
 702               int *pts = &edgesWithNodes.elems[iedge].nodeIds[0];
 703               SMDS_Down1D* downEdge = static_cast<SMDS_Down1D*> (_downArray[vtkEdgeType]);
 704               int nbVtkCells = downEdge->computeVtkCells(pts, vtkIds);
 705               //CHRONOSTOP(41);CHRONO(42);
 706               int downFaces[1000];
 707               unsigned char downTypes[1000];
 708               int nbDownFaces = downEdge->computeFaces(pts, &vtkIds[0], nbVtkCells, downFaces, downTypes);
 709               //CHRONOSTOP(42);
 710
 711               //CHRONO(43);
 712               int connEdgeId = -1;
 713               for (int idf = 0; idf < nbDownFaces; idf++)
 714                 {
 715                   int faceId2 = downFaces[idf];
 716                   int faceType = downTypes[idf];
 717                   //ASSERT(_downArray[faceType]);
 718                   SMDS_Down2D* downFace2 = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[faceType]);
 719                   connEdgeId = downFace2->FindEdgeByNodes(faceId2, edgesWithNodes.elems[iedge]);
 720                   if (connEdgeId >= 0)
 721                     break; // --- edge already created
 722                 }//CHRONOSTOP(43);
 723
 724               // --- if edge is not registered in the faces, create edge
 725
 726               if (connEdgeId < 0)
 727                 {
 728                   //CHRONO(44);
 729                   connEdgeId = _downArray[vtkEdgeType]->addCell();
 730                   downEdge->setNodes(connEdgeId, edgesWithNodes.elems[iedge].nodeIds);
 731                   //CHRONOSTOP(44);
 732                 }
 733
 734               // --- mark faces in downward edge and mark edge in downward faces
 735
 736               //CHRONO(45);
 737               for (int idf = 0; idf < nbDownFaces; idf++)
 738                 {
 739                   int faceId2 = downFaces[idf];
 740                   int faceType = downTypes[idf];
 741                   //ASSERT(_downArray[faceType]);
 742                   //SMDS_Down2D* downFace2 = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[faceType]);
 743                   _downArray[vtkEdgeType]->addUpCell(connEdgeId, faceId2, faceType);
 744                   _downArray[faceType]->addDownCell(faceId2, connEdgeId, vtkEdgeType);
 745                   // MESSAGE(" From face t:" << vtkFaceType << " " << faceId <<
 746                   //  " edge " << connEdgeId << " belongs to face t:" << faceType << " " << faceId2);
 747                 }//CHRONOSTOP(45);
 748             }
 749         }
 750     }
 751
 752   CHRONOSTOP(23);CHRONO(24);
 753
 754   // compact downward connectivity structure: adjust downward arrays size, replace std::vector<vector int>> by a single std::vector<int>
 755   // 3D first then 2D and last 1D to release memory before edge upCells reorganization, (temporary memory use)
 756
 757   for (int vtkType = VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkType >= 0; vtkType--)
 758     {
 759       if (SMDS_Downward *down = _downArray[vtkType])
 760         {
 761           down->compactStorage();
 762         }
 763     }
 764
 765   // --- Statistics
 766
 767   for (int vtkType = 0; vtkType <= VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkType++)
 768     {
 769       if (SMDS_Downward *down = _downArray[vtkType])
 770         {
 771           if (down->getMaxId())
 772             {
 773               MESSAGE("Cells of Type " << vtkType << " : number of entities, est: "
 774                   << GuessSize[vtkType] << " real: " << down->getMaxId());
 775             }
 776         }
 777     }CHRONOSTOP(24);CHRONOSTOP(2);
 778   counters::stats();
 779 }
 780
 781 /*! Get the neighbors of a cell.
 782  * Only the neighbors having the dimension of the cell are taken into account
 783  * (neighbors of a volume are the volumes sharing a face with this volume,
 784  *  neighbors of a face are the faces sharing an edge with this face...).
 785  * @param neighborsVtkIds vector of neighbors vtk id's to fill (reserve enough space).
 786  * @param downIds downward id's of cells of dimension n-1, to fill (reserve enough space).
 787  * @param downTypes vtk types of cells of dimension n-1, to fill (reserve enough space).
 788  * @param vtkId the vtk id of the cell
 789  * @return number of neighbors
 790  */
 791 int SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors(int* neighborsVtkIds, int* downIds, unsigned char* downTypes, int vtkId, bool getSkin)
 792 {
 793   int vtkType = this->GetCellType(vtkId);
 794   int cellDim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 795   if (cellDim <2)
 796     return 0; // TODO voisins des edges = edges connectees
 797   int cellId = this->_cellIdToDownId[vtkId];
 798
 799   int nbCells = _downArray[vtkType]->getNumberOfDownCells(cellId);
 800   const int *downCells = _downArray[vtkType]->getDownCells(cellId);
 801   const unsigned char* downTyp = _downArray[vtkType]->getDownTypes(cellId);
 802
 803   // --- iteration on faces of the 3D cell (or edges on the 2D cell).
 804
 805   int nb = 0;
 806   for (int i = 0; i < nbCells; i++)
 807     {
 808       int downId = downCells[i];
 809       int cellType = downTyp[i];
 810       int nbUp = _downArray[cellType]->getNumberOfUpCells(downId);
 811       const int *upCells = _downArray[cellType]->getUpCells(downId);
 812       const unsigned char* upTypes = _downArray[cellType]->getUpTypes(downId);
 813
 814       // ---for a volume, max 2 upCells, one is this cell, the other is a neighbor
 815       //    for a face, number of neighbors (connected faces) not known
 816
 817       for (int j = 0; j < nbUp; j++)
 818         {
 819           if ((upCells[j] == cellId) && (upTypes[j] == vtkType))
 820             continue;
 821           int vtkNeighbor = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 822           neighborsVtkIds[nb] = vtkNeighbor;
 823           downIds[nb] = downId;
 824           downTypes[nb] = cellType;
 825           nb++;
 826           if (nb >= NBMAXNEIGHBORS)
 827             {
 828               INFOS("SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors problem: NBMAXNEIGHBORS=" <<NBMAXNEIGHBORS << " not enough");
 829               return nb;
 830             }
 831         }
 832       if (getSkin)
 833         {
 834           if (cellDim == 3 && nbUp == 1) // this face is on the skin of the volume
 835             {
 836               neighborsVtkIds[nb] = _downArray[cellType]->getVtkCellId(downId); // OK if skin present
 837               downIds[nb] = downId;
 838               downTypes[nb] = cellType;
 839               nb++;
 840               if (nb >= NBMAXNEIGHBORS)
 841                 {
 842                   INFOS("SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors problem: NBMAXNEIGHBORS=" <<NBMAXNEIGHBORS << " not enough");
 843                   return nb;
 844                 }
 845             }
 846         }
 847     }
 848   return nb;
 849 }
 850
 851 /*! get the volumes containing a face or an edge of the grid
 852  * The edge or face belongs to the vtkUnstructuredGrid
 853  * @param volVtkIds vector of parent volume ids to fill (reserve enough space!)
 854  * @param vtkId vtk id of the face or edge
 855  */
 856 int SMDS_UnstructuredGrid::GetParentVolumes(int* volVtkIds, int vtkId)
 857 {
 858   int vtkType = this->GetCellType(vtkId);
 859   int dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 860   int nbFaces = 0;
 861   unsigned char cellTypes[1000];
 862   int downCellId[1000];
 863   if (dim == 1)
 864     {
 865       int downId = this->CellIdToDownId(vtkId);
 866       if (downId < 0)
 867         {
 868           MESSAGE("Downward structure not up to date: new edge not taken into account");
 869           return 0;
 870         }
 871       nbFaces = _downArray[vtkType]->getNumberOfUpCells(downId);
 872       const int *upCells = _downArray[vtkType]->getUpCells(downId);
 873       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkType]->getUpTypes(downId);
 874       for (int i=0; i< nbFaces; i++)
 875         {
 876           cellTypes[i] = upTypes[i];
 877           downCellId[i] = upCells[i];
 878         }
 879     }
 880   else if (dim == 2)
 881     {
 882       nbFaces = 1;
 883       cellTypes[0] = this->GetCellType(vtkId);
 884       int downId = this->CellIdToDownId(vtkId);
 885       if (downId < 0)
 886         {
 887           MESSAGE("Downward structure not up to date: new face not taken into account");
 888           return 0;
 889         }
 890       downCellId[0] = downId;
 891     }
 892
 893   int nbvol =0;
 894   for (int i=0; i<nbFaces; i++)
 895     {
 896       int vtkTypeFace = cellTypes[i];
 897       int downId = downCellId[i];
 898       int nv = _downArray[vtkTypeFace]->getNumberOfUpCells(downId);
 899       const int *upCells = _downArray[vtkTypeFace]->getUpCells(downId);
 900       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkTypeFace]->getUpTypes(downId);
 901        for (int j=0; j<nv; j++)
 902         {
 903           int vtkVolId = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 904           if (vtkVolId >= 0)
 905             volVtkIds[nbvol++] = vtkVolId;
 906         }
 907     }
 908   return nbvol;
 909 }
 910
 911 /*! get the volumes containing a face or an edge of the downward structure
 912  * The edge or face does not necessary belong to the vtkUnstructuredGrid
 913  * @param volVtkIds vector of parent volume ids to fill (reserve enough space!)
 914  * @param downId id in the downward structure
 915  * @param downType type of cell
 916  */
 917 int SMDS_UnstructuredGrid::GetParentVolumes(int* volVtkIds, int downId, unsigned char downType)
 918 {
 919   int vtkType = downType;
 920   int dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 921   int nbFaces = 0;
 922   unsigned char cellTypes[1000];
 923   int downCellId[1000];
 924   if (dim == 1)
 925     {
 926       nbFaces = _downArray[vtkType]->getNumberOfUpCells(downId);
 927       const int *upCells = _downArray[vtkType]->getUpCells(downId);
 928       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkType]->getUpTypes(downId);
 929       for (int i=0; i< nbFaces; i++)
 930         {
 931           cellTypes[i] = upTypes[i];
 932           downCellId[i] = upCells[i];
 933         }
 934     }
 935   else if (dim == 2)
 936     {
 937       nbFaces = 1;
 938       cellTypes[0] = vtkType;
 939       downCellId[0] = downId;
 940     }
 941
 942   int nbvol =0;
 943   for (int i=0; i<nbFaces; i++)
 944     {
 945       int vtkTypeFace = cellTypes[i];
 946       int downId = downCellId[i];
 947       int nv = _downArray[vtkTypeFace]->getNumberOfUpCells(downId);
 948       const int *upCells = _downArray[vtkTypeFace]->getUpCells(downId);
 949       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkTypeFace]->getUpTypes(downId);
 950        for (int j=0; j<nv; j++)
 951         {
 952           int vtkVolId = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 953           if (vtkVolId >= 0)
 954             volVtkIds[nbvol++] = vtkVolId;
 955         }
 956     }
 957   return nbvol;
 958 }
 959
 960 /*! get the node id's of a cell.
 961  * The cell is defined by it's downward connectivity id and type.
 962  * @param nodeSet set of of vtk node id's to fill.
 963  * @param downId downward connectivity id of the cell.
 964  * @param downType type of cell.
 965  */
 966 void SMDS_UnstructuredGrid::GetNodeIds(std::set<int>& nodeSet, int downId, unsigned char downType)
 967 {
 968   _downArray[downType]->getNodeIds(downId, nodeSet);
 969 }
 970
 971 /*! change some nodes in cell without modifying type or internal connectivity.
 972  * Nodes inverse connectivity is maintained up to date.
 973  * @param vtkVolId vtk id of the cell
 974  * @param localClonedNodeIds map old node id to new node id.
 975  */
 976 void SMDS_UnstructuredGrid::ModifyCellNodes(int vtkVolId, std::map<int, int> localClonedNodeIds)
 977 {
 978   vtkIdType npts = 0;
 979   vtkIdType *pts; // will refer to the point id's of the face
 980   this->GetCellPoints(vtkVolId, npts, pts);
 981   for (int i = 0; i < npts; i++)
 982     {
 983       if (localClonedNodeIds.count(pts[i]))
 984         {
 985           vtkIdType oldpt = pts[i];
 986           pts[i] = localClonedNodeIds[oldpt];
 987           //MESSAGE(oldpt << " --> " << pts[i]);
 988           //this->RemoveReferenceToCell(oldpt, vtkVolId);
 989           //this->AddReferenceToCell(pts[i], vtkVolId);
 990         }
 991     }
 992 }
 993
 994 /*! reorder the nodes of a face
 995  * @param vtkVolId vtk id of a volume containing the face, to get an orientation for the face.
 996  * @param orderedNodes list of nodes to reorder (in out)
 997  * @return size of the list
 998  */
 999 int SMDS_UnstructuredGrid::getOrderedNodesOfFace(int vtkVolId, int& dim, std::vector<vtkIdType>& orderedNodes)
1000 {
1001   int vtkType = this->GetCellType(vtkVolId);
1002   dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
1003   if (dim == 3)
1004     {
1005       SMDS_Down3D *downvol = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkType]);
1006       int downVolId = this->_cellIdToDownId[vtkVolId];
1007       downvol->getOrderedNodesOfFace(downVolId, orderedNodes);
1008     }
1009   // else nothing to do;
1010   return orderedNodes.size();
1011 }
1012
1013 void SMDS_UnstructuredGrid::BuildLinks()
1014 {
1015   // Remove the old links if they are already built
1016   if (this->Links)
1017   {
1018     this->Links->UnRegister(this);
1019   }
1020
1021   SMDS_CellLinks* links;
1022   this->Links = links = SMDS_CellLinks::New();
1023   this->Links->Allocate(this->GetNumberOfPoints());
1024   this->Links->Register(this);
1025   links->BuildLinks(this, this->Connectivity,this->GetCellTypesArray() );
1026   this->Links->Delete();
1027 }
1028
1029 void SMDS_UnstructuredGrid::DeleteLinks()
1030 {
1031   // Remove the old links if they are already built
1032   if (this->Links)
1033   {
1034     this->Links->UnRegister(this);
1035     this->Links = NULL;
1036   }
1037 }
1038 SMDS_CellLinks* SMDS_UnstructuredGrid::GetLinks()
1039 {
1040   if ( !this->Links )
1041     BuildLinks();
1042   return static_cast< SMDS_CellLinks* >( this->Links );
1043 }
1044
1045 /*! Create a volume (prism or hexahedron) by duplication of a face.
1046  * Designed for use in creation of flat elements separating volume domains.
1047  * A face separating two domains is shared by two volume cells.
1048  * All the nodes are already created (for the two faces).
1049  * Each original Node is associated to corresponding nodes in the domains.
1050  * Some nodes may be duplicated for more than two domains, when domain separations intersect.
1051  * In that case, even some of the nodes to use for the original face may be changed.
1052  * @param vtkVolId: vtk id of a volume containing the face, to get an orientation for the face.
1053  * @param domain1: domain of the original face
1054  * @param domain2: domain of the duplicated face
1055  * @param originalNodes: the vtk node ids of the original face
1056  * @param nodeDomains: map(original id --> map(domain --> duplicated node id))
1057  * @return ok if success.
1058  */
1059 SMDS_MeshCell*
1060 SMDS_UnstructuredGrid::extrudeVolumeFromFace(int vtkVolId,
1061                                              int domain1,
1062                                              int domain2,
1063                                              std::set<int>& originalNodes,
1064                                              std::map<int, std::map<int, int> >& nodeDomains,
1065                                              std::map<int, std::map<long, int> >& nodeQuadDomains)
1066 {
1067   //MESSAGE("extrudeVolumeFromFace " << vtkVolId);
1068   std::vector<vtkIdType> orderedOriginals( originalNodes.begin(), originalNodes.end() );
1069
1070   int dim = 0;
1071   int nbNodes = this->getOrderedNodesOfFace(vtkVolId, dim, orderedOriginals);
1072   std::vector<vtkIdType> orderedNodes;
1073
1074   bool isQuadratic = false;
1075   switch (orderedOriginals.size())
1076   {
1077   case 3:
1078     if (dim == 2)
1079       isQuadratic = true;
1080     break;
1081   case 6:
1082   case 8:
1083     isQuadratic = true;
1084     break;
1085   default:
1086     isQuadratic = false;
1087       break;
1088   }
1089
1090   if (isQuadratic)
1091     {
1092       long dom1 = domain1;
1093       long dom2 = domain2;
1094       long dom1_2; // for nodeQuadDomains
1095       if (domain1 < domain2)
1096         dom1_2 = dom1 + INT_MAX * dom2;
1097       else
1098         dom1_2 = dom2 + INT_MAX * dom1;
1099       //cerr << "dom1=" << dom1 << " dom2=" << dom2 << " dom1_2=" << dom1_2 << endl;
1100       int ima = orderedOriginals.size();
1101       int mid = orderedOriginals.size() / 2;
1102       //cerr << "ima=" << ima << " mid=" << mid << endl;
1103       for (int i = 0; i < mid; i++)
1104         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1105       for (int i = 0; i < mid; i++)
1106         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1107       for (int i = mid; i < ima; i++)
1108         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1109       for (int i = mid; i < ima; i++)
1110         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1111       for (int i = 0; i < mid; i++)
1112         {
1113           int oldId = orderedOriginals[i];
1114           int newId;
1115           if (nodeQuadDomains.count(oldId) && nodeQuadDomains[oldId].count(dom1_2))
1116             newId = nodeQuadDomains[oldId][dom1_2];
1117           else
1118             {
1119               double *coords = this->GetPoint(oldId);
1120               SMDS_MeshNode *newNode = _mesh->AddNode(coords[0], coords[1], coords[2]);
1121               newId = newNode->GetVtkID();
1122               if (! nodeQuadDomains.count(oldId))
1123                 {
1124                   std::map<long, int> emptyMap;
1125                   nodeQuadDomains[oldId] = emptyMap;
1126                 }
1127               nodeQuadDomains[oldId][dom1_2] = newId;
1128             }
1129           orderedNodes.push_back(newId);
1130         }
1131     }
1132   else
1133     {
1134       for (int i = 0; i < nbNodes; i++)
1135         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1136       if (dim == 3)
1137         for (int i = 0; i < nbNodes; i++)
1138           orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1139       else
1140         for (int i = nbNodes-1; i >= 0; i--)
1141           orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1142
1143     }
1144
1145   if (dim == 3)
1146     {
1147       SMDS_MeshVolume *vol = _mesh->AddVolumeFromVtkIds(orderedNodes);
1148       return vol;
1149     }
1150   else if (dim == 2)
1151     {
1152       SMDS_MeshFace *face = _mesh->AddFaceFromVtkIds(orderedNodes);
1153       return face;
1154     }
1155
1156   // TODO update sub-shape list of elements and nodes
1157   return 0;
1158 }
1159
1160 //================================================================================
1161 /*!
1162  * \brief Allocates data array for ball diameters
1163  *  \param MaxVtkID - max ID of a ball element
1164  */
1165 //================================================================================
1166
1167 void SMDS_UnstructuredGrid::AllocateDiameters( vtkIdType MaxVtkID )
1168 {
1169   SetBallDiameter( MaxVtkID, 0 );
1170 }
1171
1172 //================================================================================
1173 /*!
1174  * \brief Sets diameter of a ball element
1175  *  \param vtkID - vtk id of the ball element
1176  *  \param diameter - diameter of the ball element
1177  */
1178 //================================================================================
1179
1180 void SMDS_UnstructuredGrid::SetBallDiameter( vtkIdType vtkID, double diameter )
1181 {
1182   vtkDoubleArray* array = vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() );
1183   if ( !array )
1184   {
1185     array = vtkDoubleArray::New();
1186     array->SetNumberOfComponents(1);
1187     vtkDataSet::CellData->SetScalars( array );
1188   }
1189   array->InsertValue( vtkID, diameter );
1190 }
1191
1192 //================================================================================
1193 /*!
1194  * \brief Returns diameter of a ball element
1195  *  \param vtkID - vtk id of the ball element
1196  */
1197 //================================================================================
1198
1199 double SMDS_UnstructuredGrid::GetBallDiameter( vtkIdType vtkID ) const
1200 {
1201   if ( vtkDataSet::CellData )
1202     return vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() )->GetValue( vtkID );
1203   return 0;
1204 }
1205