src/SMDS/SMDS_UnstructuredGrid.cxx

   1 // Copyright (C) 2010-2016  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "SMDS_UnstructuredGrid.hxx"
  21 #include "SMDS_Mesh.hxx"
  22 #include "SMDS_MeshInfo.hxx"
  23 #include "SMDS_Downward.hxx"
  24 #include "SMDS_MeshVolume.hxx"
  25
  26 #include "utilities.h"
  27 #include "chrono.hxx"
  28
  29 #include <vtkCellArray.h>
  30 #include <vtkCellData.h>
  31 #include <vtkCellLinks.h>
  32 #include <vtkDoubleArray.h>
  33 #include <vtkIdTypeArray.h>
  34 #include <vtkUnsignedCharArray.h>
  35
  36 #include <list>
  37 #include <climits>
  38
  39 using namespace std;
  40
  41 SMDS_CellLinks* SMDS_CellLinks::New()
  42 {
  43   return new SMDS_CellLinks();
  44 }
  45
  46 void SMDS_CellLinks::ResizeForPoint(vtkIdType vtkID)
  47 {
  48   if ( vtkID > this->MaxId )
  49   {
  50     this->MaxId = vtkID;
  51     if ( vtkID >= this->Size )
  52       vtkCellLinks::Resize( vtkID+SMDS_Mesh::chunkSize );
  53   }
  54 }
  55
  56 void SMDS_CellLinks::BuildLinks(vtkDataSet *data, vtkCellArray *Connectivity, vtkUnsignedCharArray* types)
  57 {
  58   // build links taking into account removed cells
  59
  60   vtkIdType numPts = data->GetNumberOfPoints();
  61   vtkIdType j, cellId = 0;
  62   unsigned short *linkLoc;
  63   vtkIdType npts=0;
  64   vtkIdType *pts=0;
  65   vtkIdType loc = Connectivity->GetTraversalLocation();
  66
  67   // traverse data to determine number of uses of each point
  68   cellId = 0;
  69   for (Connectivity->InitTraversal();
  70        Connectivity->GetNextCell(npts,pts); cellId++)
  71   {
  72     if ( types->GetValue( cellId ) != VTK_EMPTY_CELL )
  73       for (j=0; j < npts; j++)
  74       {
  75         this->IncrementLinkCount(pts[j]);
  76       }
  77   }
  78
  79   // now allocate storage for the links
  80   this->AllocateLinks(numPts);
  81   this->MaxId = numPts - 1;
  82
  83   // fill out lists with references to cells
  84   linkLoc = new unsigned short[numPts];
  85   memset(linkLoc, 0, numPts*sizeof(unsigned short));
  86
  87   cellId = 0;
  88   for (Connectivity->InitTraversal();
  89        Connectivity->GetNextCell(npts,pts); cellId++)
  90   {
  91     if ( types->GetValue( cellId ) != VTK_EMPTY_CELL )
  92       for (j=0; j < npts; j++)
  93       {
  94         this->InsertCellReference(pts[j], (linkLoc[pts[j]])++, cellId);
  95       }
  96   }
  97   delete [] linkLoc;
  98   Connectivity->SetTraversalLocation(loc);
  99 }
 100
 101 SMDS_CellLinks::SMDS_CellLinks() :
 102   vtkCellLinks()
 103 {
 104 }
 105
 106 SMDS_CellLinks::~SMDS_CellLinks()
 107 {
 108 }
 109
 110 SMDS_UnstructuredGrid* SMDS_UnstructuredGrid::New()
 111 {
 112   return new SMDS_UnstructuredGrid();
 113 }
 114
 115 SMDS_UnstructuredGrid::SMDS_UnstructuredGrid() :
 116   vtkUnstructuredGrid()
 117 {
 118   _cellIdToDownId.clear();
 119   _downTypes.clear();
 120   _downArray.clear();
 121   _mesh = 0;
 122 }
 123
 124 SMDS_UnstructuredGrid::~SMDS_UnstructuredGrid()
 125 {
 126 }
 127
 128 unsigned long SMDS_UnstructuredGrid::GetMTime()
 129 {
 130   unsigned long mtime = vtkUnstructuredGrid::GetMTime();
 131   return mtime;
 132 }
 133
 134 vtkPoints* SMDS_UnstructuredGrid::GetPoints()
 135 {
 136   // TODO erreur incomprehensible de la macro vtk GetPoints apparue avec la version paraview de fin aout 2010
 137   return this->Points;
 138 }
 139
 140 int SMDS_UnstructuredGrid::InsertNextLinkedCell(int type, int npts, vtkIdType *pts)
 141 {
 142   if ( !this->Links )
 143     BuildLinks();
 144
 145   if (type != VTK_POLYHEDRON)
 146     return vtkUnstructuredGrid::InsertNextLinkedCell(type, npts, pts);
 147
 148   // --- type = VTK_POLYHEDRON
 149   int cellid = this->InsertNextCell(type, npts, pts);
 150
 151   set<vtkIdType> setOfNodes;
 152   setOfNodes.clear();
 153   int nbfaces = npts;
 154   int i = 0;
 155   for (int nf = 0; nf < nbfaces; nf++)
 156   {
 157     int nbnodes = pts[i];
 158     i++;
 159     for (int k = 0; k < nbnodes; k++)
 160     {
 161       setOfNodes.insert(pts[i]);
 162       i++;
 163     }
 164   }
 165
 166   set<vtkIdType>::iterator it = setOfNodes.begin();
 167   for (; it != setOfNodes.end(); ++it)
 168   {
 169     this->Links->ResizeCellList(*it, 1);
 170     this->Links->AddCellReference(cellid, *it);
 171   }
 172
 173   return cellid;
 174 }
 175
 176 void SMDS_UnstructuredGrid::setSMDS_mesh(SMDS_Mesh *mesh)
 177 {
 178   _mesh = mesh;
 179 }
 180
 181 void SMDS_UnstructuredGrid::compactGrid(std::vector<int>& idNodesOldToNew, int newNodeSize,
 182                                         std::vector<int>& idCellsOldToNew, int newCellSize)
 183 {
 184   int alreadyCopied = 0;
 185
 186   this->DeleteLinks();
 187
 188   // --- if newNodeSize, create a new compacted vtkPoints
 189
 190   vtkPoints *newPoints = vtkPoints::New();
 191   newPoints->SetDataType(VTK_DOUBLE);
 192   newPoints->SetNumberOfPoints(newNodeSize);
 193   if (newNodeSize)
 194   {
 195     // rnv: to fix bug "21125: EDF 1233 SMESH: Degradation of precision in a test case for quadratic conversion"
 196     // using double type for storing coordinates of nodes instead float.
 197     int oldNodeSize = idNodesOldToNew.size();
 198
 199     int i = 0;
 200     while ( i < oldNodeSize )
 201     {
 202       // skip a hole if any
 203       while ( i < oldNodeSize && idNodesOldToNew[i] < 0 )
 204         ++i;
 205       int startBloc = i;
 206       // look for a block end
 207       while ( i < oldNodeSize && idNodesOldToNew[i] >= 0 )
 208         ++i;
 209       int endBloc = i;
 210       copyNodes(newPoints, idNodesOldToNew, alreadyCopied, startBloc, endBloc);
 211     }
 212     newPoints->Squeeze();
 213   }
 214
 215   if (1/*newNodeSize*/)
 216   {
 217     this->SetPoints(newPoints);
 218   }
 219   newPoints->Delete();
 220
 221
 222   // --- create new compacted Connectivity, Locations and Types
 223
 224   int oldCellSize = this->Types->GetNumberOfTuples();
 225
 226   if ( oldCellSize == newCellSize ) // no holes in elements
 227   {
 228     this->Connectivity->Squeeze();
 229     this->Locations->Squeeze();
 230     this->Types->Squeeze();
 231     if ( this->FaceLocations )
 232     {
 233       this->FaceLocations->Squeeze();
 234       this->Faces->Squeeze();
 235     }
 236     for ( int i = 0; i < oldCellSize; ++i )
 237       idCellsOldToNew[i] = i;
 238     return;
 239   }
 240   vtkCellArray *newConnectivity = vtkCellArray::New();
 241   newConnectivity->Initialize();
 242   int oldCellDataSize = this->Connectivity->GetData()->GetSize();
 243   newConnectivity->Allocate(oldCellDataSize);
 244
 245   vtkUnsignedCharArray *newTypes = vtkUnsignedCharArray::New();
 246   newTypes->Initialize();
 247   newTypes->SetNumberOfValues(newCellSize);
 248
 249   vtkIdTypeArray *newLocations = vtkIdTypeArray::New();
 250   newLocations->Initialize();
 251   newLocations->SetNumberOfValues(newCellSize);
 252
 253   // TODO some polyhedron may be huge (only in some tests)
 254   vtkIdType tmpid[NBMAXNODESINCELL];
 255   vtkIdType *pointsCell = &tmpid[0]; // --- points id to fill a new cell
 256
 257   alreadyCopied = 0;
 258   int i = 0;
 259   while ( i < oldCellSize )
 260   {
 261     // skip a hole if any
 262     while ( i < oldCellSize && this->Types->GetValue(i) == VTK_EMPTY_CELL )
 263       ++i;
 264     int startBloc = i;
 265     // look for a block end
 266     while ( i < oldCellSize && this->Types->GetValue(i) != VTK_EMPTY_CELL )
 267       ++i;
 268     int endBloc = i;
 269     if ( endBloc > startBloc )
 270       copyBloc(newTypes,
 271                idCellsOldToNew, idNodesOldToNew,
 272                newConnectivity, newLocations,
 273                pointsCell, alreadyCopied,
 274                startBloc, endBloc);
 275   }
 276   newConnectivity->Squeeze();
 277
 278   if (vtkDoubleArray* diameters =
 279       vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() )) // Balls
 280   {
 281     for (int oldCellID = 0; oldCellID < oldCellSize; oldCellID++)
 282     {
 283       if (this->Types->GetValue(oldCellID) == VTK_EMPTY_CELL)
 284         continue;
 285       int newCellId = idCellsOldToNew[ oldCellID ];
 286       if (newTypes->GetValue(newCellId) == VTK_POLY_VERTEX)
 287         diameters->SetValue( newCellId, diameters->GetValue( oldCellID ));
 288     }
 289   }
 290
 291   if (this->FaceLocations)
 292   {
 293     vtkIdTypeArray *newFaceLocations = vtkIdTypeArray::New();
 294     newFaceLocations->Initialize();
 295     newFaceLocations->Allocate(newTypes->GetSize());
 296     vtkIdTypeArray *newFaces = vtkIdTypeArray::New();
 297     newFaces->Initialize();
 298     newFaces->Allocate(this->Faces->GetSize());
 299     for (int i = 0; i < oldCellSize; i++)
 300     {
 301       if (this->Types->GetValue(i) == VTK_EMPTY_CELL)
 302         continue;
 303       int newCellId = idCellsOldToNew[i];
 304       if (newTypes->GetValue(newCellId) == VTK_POLYHEDRON)
 305       {
 306         newFaceLocations->InsertNextValue(newFaces->GetMaxId()+1);
 307         int oldFaceLoc = this->FaceLocations->GetValue(i);
 308         int nCellFaces = this->Faces->GetValue(oldFaceLoc++);
 309         newFaces->InsertNextValue(nCellFaces);
 310         for (int n=0; n<nCellFaces; n++)
 311         {
 312           int nptsInFace = this->Faces->GetValue(oldFaceLoc++);
 313           newFaces->InsertNextValue(nptsInFace);
 314           for (int k=0; k<nptsInFace; k++)
 315           {
 316             int oldpt = this->Faces->GetValue(oldFaceLoc++);
 317             newFaces->InsertNextValue(idNodesOldToNew[oldpt]);
 318           }
 319         }
 320       }
 321       else
 322       {
 323         newFaceLocations->InsertNextValue(-1);
 324       }
 325     }
 326     newFaceLocations->Squeeze();
 327     newFaces->Squeeze();
 328     this->SetCells(newTypes, newLocations, newConnectivity, newFaceLocations, newFaces);
 329     newFaceLocations->Delete();
 330     newFaces->Delete();
 331   }
 332   else
 333   {
 334     this->SetCells(newTypes, newLocations, newConnectivity, FaceLocations, Faces);
 335   }
 336
 337   newTypes->Delete();
 338   newLocations->Delete();
 339   newConnectivity->Delete();
 340 }
 341
 342 void SMDS_UnstructuredGrid::copyNodes(vtkPoints *       newPoints,
 343                                       std::vector<int>& idNodesOldToNew,
 344                                       int&              alreadyCopied,
 345                                       int               start,
 346                                       int               end)
 347 {
 348   void *target = newPoints->GetVoidPointer(3 * alreadyCopied);
 349   void *source = this->Points->GetVoidPointer(3 * start);
 350   int nbPoints = end - start;
 351   if (nbPoints > 0)
 352   {
 353     memcpy(target, source, 3 * sizeof(double) * nbPoints);
 354     for (int j = start; j < end; j++)
 355       idNodesOldToNew[j] = alreadyCopied++; // old vtkId --> new vtkId
 356   }
 357 }
 358
 359 void SMDS_UnstructuredGrid::copyBloc(vtkUnsignedCharArray *newTypes,
 360                                      std::vector<int>&     idCellsOldToNew,
 361                                      std::vector<int>&     idNodesOldToNew,
 362                                      vtkCellArray*         newConnectivity,
 363                                      vtkIdTypeArray*       newLocations,
 364                                      vtkIdType*            pointsCell,
 365                                      int&                  alreadyCopied,
 366                                      int                   start,
 367                                      int                   end)
 368 {
 369   for (int j = start; j < end; j++)
 370   {
 371     newTypes->SetValue(alreadyCopied, this->Types->GetValue(j));
 372     idCellsOldToNew[j] = alreadyCopied; // old vtkId --> new vtkId
 373     vtkIdType oldLoc = this->Locations->GetValue(j);
 374     vtkIdType nbpts;
 375     vtkIdType *oldPtsCell = 0;
 376     this->Connectivity->GetCell(oldLoc, nbpts, oldPtsCell);
 377     assert(nbpts < NBMAXNODESINCELL);
 378     for (int l = 0; l < nbpts; l++)
 379     {
 380       int oldval = oldPtsCell[l];
 381       pointsCell[l] = idNodesOldToNew[oldval];
 382     }
 383     /*int newcnt = */newConnectivity->InsertNextCell(nbpts, pointsCell);
 384     int newLoc = newConnectivity->GetInsertLocation(nbpts);
 385     newLocations->SetValue(alreadyCopied, newLoc);
 386     alreadyCopied++;
 387   }
 388 }
 389
 390 int SMDS_UnstructuredGrid::CellIdToDownId(int vtkCellId)
 391 {
 392   if ((vtkCellId < 0) || (vtkCellId >= (int)_cellIdToDownId.size()))
 393   {
 394     return -1;
 395   }
 396   return _cellIdToDownId[vtkCellId];
 397 }
 398
 399 void SMDS_UnstructuredGrid::setCellIdToDownId(int vtkCellId, int downId)
 400 {
 401   // ASSERT((vtkCellId >= 0) && (vtkCellId < _cellIdToDownId.size()));
 402   _cellIdToDownId[vtkCellId] = downId;
 403 }
 404
 405 void SMDS_UnstructuredGrid::CleanDownwardConnectivity()
 406 {
 407   for (size_t i = 0; i < _downArray.size(); i++)
 408   {
 409     if (_downArray[i])
 410       delete _downArray[i];
 411     _downArray[i] = 0;
 412   }
 413   _cellIdToDownId.clear();
 414 }
 415
 416 /*! Build downward connectivity: to do only when needed because heavy memory load.
 417  *  Downward connectivity is no more valid if vtkUnstructuredGrid is modified.
 418  *
 419  */
 420 void SMDS_UnstructuredGrid::BuildDownwardConnectivity(bool withEdges)
 421 {
 422   MESSAGE("SMDS_UnstructuredGrid::BuildDownwardConnectivity");CHRONO(2);
 423   // TODO calcul partiel sans edges
 424
 425   // --- erase previous data if any
 426
 427   this->CleanDownwardConnectivity();
 428
 429   // --- create SMDS_Downward structures (in _downArray vector[vtkCellType])
 430
 431   _downArray.resize(VTK_MAXTYPE + 1, 0);
 432
 433   _downArray[VTK_LINE]                    = new SMDS_DownEdge(this);
 434   _downArray[VTK_QUADRATIC_EDGE]          = new SMDS_DownQuadEdge(this);
 435   _downArray[VTK_TRIANGLE]                = new SMDS_DownTriangle(this);
 436   _downArray[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]      = new SMDS_DownQuadTriangle(this);
 437   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]    = new SMDS_DownQuadTriangle(this);
 438   _downArray[VTK_QUAD]                    = new SMDS_DownQuadrangle(this);
 439   _downArray[VTK_QUADRATIC_QUAD]          = new SMDS_DownQuadQuadrangle(this);
 440   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]        = new SMDS_DownQuadQuadrangle(this);
 441   _downArray[VTK_TETRA]                   = new SMDS_DownTetra(this);
 442   _downArray[VTK_QUADRATIC_TETRA]         = new SMDS_DownQuadTetra(this);
 443   _downArray[VTK_PYRAMID]                 = new SMDS_DownPyramid(this);
 444   _downArray[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]       = new SMDS_DownQuadPyramid(this);
 445   _downArray[VTK_WEDGE]                   = new SMDS_DownPenta(this);
 446   _downArray[VTK_QUADRATIC_WEDGE]         = new SMDS_DownQuadPenta(this);
 447   _downArray[VTK_HEXAHEDRON]              = new SMDS_DownHexa(this);
 448   _downArray[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]    = new SMDS_DownQuadHexa(this);
 449   _downArray[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON] = new SMDS_DownQuadHexa(this);
 450   _downArray[VTK_HEXAGONAL_PRISM]         = new SMDS_DownPenta(this);
 451
 452   // --- get detailed info of number of cells of each type, allocate SMDS_downward structures
 453
 454   const SMDS_MeshInfo &meshInfo = _mesh->GetMeshInfo();
 455
 456   int nbLinTetra  = meshInfo.NbTetras  (ORDER_LINEAR);
 457   int nbQuadTetra = meshInfo.NbTetras  (ORDER_QUADRATIC);
 458   int nbLinPyra   = meshInfo.NbPyramids(ORDER_LINEAR);
 459   int nbQuadPyra  = meshInfo.NbPyramids(ORDER_QUADRATIC);
 460   int nbLinPrism  = meshInfo.NbPrisms  (ORDER_LINEAR);
 461   int nbQuadPrism = meshInfo.NbPrisms  (ORDER_QUADRATIC);
 462   int nbLinHexa   = meshInfo.NbHexas   (ORDER_LINEAR);
 463   int nbQuadHexa  = meshInfo.NbHexas   (ORDER_QUADRATIC);
 464   int nbHexPrism  = meshInfo.NbHexPrisms();
 465
 466   int nbLineGuess     = int((4.0 / 3.0) * nbLinTetra + 2 * nbLinPrism + 2.5 * nbLinPyra + 3 * nbLinHexa);
 467   int nbQuadEdgeGuess = int((4.0 / 3.0) * nbQuadTetra + 2 * nbQuadPrism + 2.5 * nbQuadPyra + 3 * nbQuadHexa);
 468   int nbLinTriaGuess  = 2 * nbLinTetra + nbLinPrism + 2 * nbLinPyra;
 469   int nbQuadTriaGuess = 2 * nbQuadTetra + nbQuadPrism + 2 * nbQuadPyra;
 470   int nbLinQuadGuess  = int((2.0 / 3.0) * nbLinPrism + (1.0 / 2.0) * nbLinPyra + 3 * nbLinHexa);
 471   int nbQuadQuadGuess = int((2.0 / 3.0) * nbQuadPrism + (1.0 / 2.0) * nbQuadPyra + 3 * nbQuadHexa);
 472
 473   int GuessSize[VTK_MAXTYPE];
 474   GuessSize[VTK_LINE]                    = nbLineGuess;
 475   GuessSize[VTK_QUADRATIC_EDGE]          = nbQuadEdgeGuess;
 476   GuessSize[VTK_TRIANGLE]                = nbLinTriaGuess;
 477   GuessSize[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]      = nbQuadTriaGuess;
 478   GuessSize[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]    = nbQuadTriaGuess;
 479   GuessSize[VTK_QUAD]                    = nbLinQuadGuess;
 480   GuessSize[VTK_QUADRATIC_QUAD]          = nbQuadQuadGuess;
 481   GuessSize[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]        = nbQuadQuadGuess;
 482   GuessSize[VTK_TETRA]                   = nbLinTetra;
 483   GuessSize[VTK_QUADRATIC_TETRA]         = nbQuadTetra;
 484   GuessSize[VTK_PYRAMID]                 = nbLinPyra;
 485   GuessSize[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]       = nbQuadPyra;
 486   GuessSize[VTK_WEDGE]                   = nbLinPrism;
 487   GuessSize[VTK_QUADRATIC_WEDGE]         = nbQuadPrism;
 488   GuessSize[VTK_HEXAHEDRON]              = nbLinHexa;
 489   GuessSize[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]    = nbQuadHexa;
 490   GuessSize[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON] = nbQuadHexa;
 491   GuessSize[VTK_HEXAGONAL_PRISM]         = nbHexPrism;
 492
 493   _downArray[VTK_LINE]                   ->allocate(nbLineGuess);
 494   _downArray[VTK_QUADRATIC_EDGE]         ->allocate(nbQuadEdgeGuess);
 495   _downArray[VTK_TRIANGLE]               ->allocate(nbLinTriaGuess);
 496   _downArray[VTK_QUADRATIC_TRIANGLE]     ->allocate(nbQuadTriaGuess);
 497   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_TRIANGLE]   ->allocate(nbQuadTriaGuess);
 498   _downArray[VTK_QUAD]                   ->allocate(nbLinQuadGuess);
 499   _downArray[VTK_QUADRATIC_QUAD]         ->allocate(nbQuadQuadGuess);
 500   _downArray[VTK_BIQUADRATIC_QUAD]       ->allocate(nbQuadQuadGuess);
 501   _downArray[VTK_TETRA]                  ->allocate(nbLinTetra);
 502   _downArray[VTK_QUADRATIC_TETRA]        ->allocate(nbQuadTetra);
 503   _downArray[VTK_PYRAMID]                ->allocate(nbLinPyra);
 504   _downArray[VTK_QUADRATIC_PYRAMID]      ->allocate(nbQuadPyra);
 505   _downArray[VTK_WEDGE]                  ->allocate(nbLinPrism);
 506   _downArray[VTK_QUADRATIC_WEDGE]        ->allocate(nbQuadPrism);
 507   _downArray[VTK_HEXAHEDRON]             ->allocate(nbLinHexa);
 508   _downArray[VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON]   ->allocate(nbQuadHexa);
 509   _downArray[VTK_TRIQUADRATIC_HEXAHEDRON]->allocate(nbQuadHexa);
 510   _downArray[VTK_HEXAGONAL_PRISM]        ->allocate(nbHexPrism);
 511
 512   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only faces
 513   //     for each vtk face:
 514   //       create a downward face entry with its downward id.
 515   //       compute vtk volumes, create downward volumes entry.
 516   //       mark face in downward volumes
 517   //       mark volumes in downward face
 518
 519   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only faces");CHRONO(20);
 520   int cellSize = this->Types->GetNumberOfTuples();
 521   _cellIdToDownId.resize(cellSize, -1);
 522
 523   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 524     {
 525       int vtkFaceType = this->GetCellType(i);
 526       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkFaceType) == 2)
 527         {
 528           int vtkFaceId = i;
 529           //ASSERT(_downArray[vtkFaceType]);
 530           int connFaceId = _downArray[vtkFaceType]->addCell(vtkFaceId);
 531           SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 532           downFace->setTempNodes(connFaceId, vtkFaceId);
 533           int vols[2] = { -1, -1 };
 534           int nbVolumes = downFace->computeVolumeIds(vtkFaceId, vols);
 535           //MESSAGE("nbVolumes="<< nbVolumes);
 536           for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 537             {
 538               int vtkVolId = vols[ivol];
 539               int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId);
 540               //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 541               int connVolId = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId);
 542               _downArray[vtkVolType]->addDownCell(connVolId, connFaceId, vtkFaceType);
 543               _downArray[vtkFaceType]->addUpCell(connFaceId, connVolId, vtkVolType);
 544               // MESSAGE("Face " << vtkFaceId << " belongs to volume " << vtkVolId);
 545             }
 546         }
 547     }
 548
 549   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only volumes
 550   //     for each vtk volume:
 551   //       create downward volumes entry if not already done
 552   //       build a temporary list of faces described with their nodes
 553   //       for each face
 554   //         compute the vtk volumes containing this face
 555   //         check if the face is already listed in the volumes (comparison of ordered list of nodes)
 556   //         if not, create a downward face entry (resizing of structure required)
 557   //         (the downward faces store a temporary list of nodes to ease the comparison)
 558   //         create downward volumes entry if not already done
 559   //         mark volumes in downward face
 560   //         mark face in downward volumes
 561
 562   CHRONOSTOP(20);
 563   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only volumes");CHRONO(21);
 564
 565   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 566     {
 567       int vtkType = this->GetCellType(i);
 568       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType) == 3)
 569         {
 570           //CHRONO(31);
 571           int vtkVolId = i;
 572           // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId);
 573           //ASSERT(_downArray[vtkType]);
 574           /*int connVolId = */_downArray[vtkType]->addCell(vtkVolId);
 575
 576           // --- find all the faces of the volume, describe the faces by their nodes
 577
 578           SMDS_Down3D* downVol = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkType]);
 579           ListElemByNodesType facesWithNodes;
 580           downVol->computeFacesWithNodes(vtkVolId, facesWithNodes);
 581           // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId << " contains " << facesWithNodes.nbElems << " faces");
 582           //CHRONOSTOP(31);
 583           for (int iface = 0; iface < facesWithNodes.nbElems; iface++)
 584             {
 585               // --- find the volumes containing the face
 586
 587               //CHRONO(32);
 588               int vtkFaceType = facesWithNodes.elems[iface].vtkType;
 589               SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 590               int vols[2] = { -1, -1 };
 591               int *nodes = &facesWithNodes.elems[iface].nodeIds[0];
 592               int lg = facesWithNodes.elems[iface].nbNodes;
 593               int nbVolumes = downFace->computeVolumeIdsFromNodesFace(nodes, lg, vols);
 594               // MESSAGE("vtk volume " << vtkVolId << " face " << iface << " belongs to " << nbVolumes << " volumes");
 595
 596               // --- check if face is registered in the volumes
 597               //CHRONOSTOP(32);
 598
 599               //CHRONO(33);
 600               int connFaceId = -1;
 601               for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 602                 {
 603                   int vtkVolId2 = vols[ivol];
 604                   int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId2);
 605                   //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 606                   int connVolId2 = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId2);
 607                   SMDS_Down3D* downVol2 = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkVolType]);
 608                   connFaceId = downVol2->FindFaceByNodes(connVolId2, facesWithNodes.elems[iface]);
 609                   if (connFaceId >= 0)
 610                     break; // --- face already created
 611                 }//CHRONOSTOP(33);
 612
 613               // --- if face is not registered in the volumes, create face
 614
 615               //CHRONO(34);
 616               if (connFaceId < 0)
 617                 {
 618                   connFaceId = _downArray[vtkFaceType]->addCell();
 619                   downFace->setTempNodes(connFaceId, facesWithNodes.elems[iface]);
 620                 }//CHRONOSTOP(34);
 621
 622               // --- mark volumes in downward face and mark face in downward volumes
 623
 624               //CHRONO(35);
 625               for (int ivol = 0; ivol < nbVolumes; ivol++)
 626                 {
 627                   int vtkVolId2 = vols[ivol];
 628                   int vtkVolType = this->GetCellType(vtkVolId2);
 629                   //ASSERT(_downArray[vtkVolType]);
 630                   int connVolId2 = _downArray[vtkVolType]->addCell(vtkVolId2);
 631                   _downArray[vtkVolType]->addDownCell(connVolId2, connFaceId, vtkFaceType);
 632                   _downArray[vtkFaceType]->addUpCell(connFaceId, connVolId2, vtkVolType);
 633                   // MESSAGE(" From volume " << vtkVolId << " face " << connFaceId << " belongs to volume " << vtkVolId2);
 634                 }//CHRONOSTOP(35);
 635             }
 636         }
 637     }
 638
 639   // --- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only edges
 640   //     for each vtk edge:
 641   //       create downward edge entry
 642   //       store the nodes id's in downward edge (redundant with vtkUnstructuredGrid)
 643   //       find downward faces
 644   //       (from vtk faces or volumes, get downward faces, they have a temporary list of nodes)
 645   //       mark edge in downward faces
 646   //       mark faces in downward edge
 647
 648   CHRONOSTOP(21);
 649   MESSAGE("--- iteration on vtkUnstructuredGrid cells, only edges");CHRONO(22);
 650
 651   for (int i = 0; i < cellSize; i++)
 652     {
 653       int vtkEdgeType = this->GetCellType(i);
 654       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkEdgeType) == 1)
 655         {
 656           int vtkEdgeId = i;
 657           //ASSERT(_downArray[vtkEdgeType]);
 658           int connEdgeId = _downArray[vtkEdgeType]->addCell(vtkEdgeId);
 659           SMDS_Down1D* downEdge = static_cast<SMDS_Down1D*> (_downArray[vtkEdgeType]);
 660           downEdge->setNodes(connEdgeId, vtkEdgeId);
 661           vector<int> vtkIds;
 662           int nbVtkCells = downEdge->computeVtkCells(connEdgeId, vtkIds);
 663           int downFaces[1000];
 664           unsigned char downTypes[1000];
 665           int nbDownFaces = downEdge->computeFaces(connEdgeId, &vtkIds[0], nbVtkCells, downFaces, downTypes);
 666           for (int n = 0; n < nbDownFaces; n++)
 667             {
 668               _downArray[downTypes[n]]->addDownCell(downFaces[n], connEdgeId, vtkEdgeType);
 669               _downArray[vtkEdgeType]->addUpCell(connEdgeId, downFaces[n], downTypes[n]);
 670             }
 671         }
 672     }
 673
 674   // --- iteration on downward faces (they are all listed now)
 675   //     for each downward face:
 676   //       build a temporary list of edges with their ordered list of nodes
 677   //       for each edge:
 678   //         find all the vtk cells containing this edge
 679   //         then identify all the downward faces containing the edge, from the vtk cells
 680   //         check if the edge is already listed in the faces (comparison of ordered list of nodes)
 681   //         if not, create a downward edge entry with the node id's
 682   //         mark edge in downward faces
 683   //         mark downward faces in edge (size of list unknown, to be allocated)
 684
 685   CHRONOSTOP(22);CHRONO(23);
 686
 687   for (int vtkFaceType = 0; vtkFaceType < VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkFaceType++)
 688     {
 689       if (SMDS_Downward::getCellDimension(vtkFaceType) != 2)
 690         continue;
 691
 692       // --- find all the edges of the face, describe the edges by their nodes
 693
 694       SMDS_Down2D* downFace = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[vtkFaceType]);
 695       int maxId = downFace->getMaxId();
 696       for (int faceId = 0; faceId < maxId; faceId++)
 697         {
 698           //CHRONO(40);
 699           ListElemByNodesType edgesWithNodes;
 700           downFace->computeEdgesWithNodes(faceId, edgesWithNodes);
 701           // MESSAGE("downward face type " << vtkFaceType << " num " << faceId << " contains " << edgesWithNodes.nbElems << " edges");
 702
 703           //CHRONOSTOP(40);
 704           for (int iedge = 0; iedge < edgesWithNodes.nbElems; iedge++)
 705             {
 706
 707               // --- check if the edge is already registered by exploration of the faces
 708
 709               //CHRONO(41);
 710               vector<int> vtkIds;
 711               unsigned char vtkEdgeType = edgesWithNodes.elems[iedge].vtkType;
 712               int *pts = &edgesWithNodes.elems[iedge].nodeIds[0];
 713               SMDS_Down1D* downEdge = static_cast<SMDS_Down1D*> (_downArray[vtkEdgeType]);
 714               int nbVtkCells = downEdge->computeVtkCells(pts, vtkIds);
 715               //CHRONOSTOP(41);CHRONO(42);
 716               int downFaces[1000];
 717               unsigned char downTypes[1000];
 718               int nbDownFaces = downEdge->computeFaces(pts, &vtkIds[0], nbVtkCells, downFaces, downTypes);
 719               //CHRONOSTOP(42);
 720
 721               //CHRONO(43);
 722               int connEdgeId = -1;
 723               for (int idf = 0; idf < nbDownFaces; idf++)
 724                 {
 725                   int faceId2 = downFaces[idf];
 726                   int faceType = downTypes[idf];
 727                   //ASSERT(_downArray[faceType]);
 728                   SMDS_Down2D* downFace2 = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[faceType]);
 729                   connEdgeId = downFace2->FindEdgeByNodes(faceId2, edgesWithNodes.elems[iedge]);
 730                   if (connEdgeId >= 0)
 731                     break; // --- edge already created
 732                 }//CHRONOSTOP(43);
 733
 734               // --- if edge is not registered in the faces, create edge
 735
 736               if (connEdgeId < 0)
 737                 {
 738                   //CHRONO(44);
 739                   connEdgeId = _downArray[vtkEdgeType]->addCell();
 740                   downEdge->setNodes(connEdgeId, edgesWithNodes.elems[iedge].nodeIds);
 741                   //CHRONOSTOP(44);
 742                 }
 743
 744               // --- mark faces in downward edge and mark edge in downward faces
 745
 746               //CHRONO(45);
 747               for (int idf = 0; idf < nbDownFaces; idf++)
 748                 {
 749                   int faceId2 = downFaces[idf];
 750                   int faceType = downTypes[idf];
 751                   //ASSERT(_downArray[faceType]);
 752                   //SMDS_Down2D* downFace2 = static_cast<SMDS_Down2D*> (_downArray[faceType]);
 753                   _downArray[vtkEdgeType]->addUpCell(connEdgeId, faceId2, faceType);
 754                   _downArray[faceType]->addDownCell(faceId2, connEdgeId, vtkEdgeType);
 755                   // MESSAGE(" From face t:" << vtkFaceType << " " << faceId <<
 756                   //  " edge " << connEdgeId << " belongs to face t:" << faceType << " " << faceId2);
 757                 }//CHRONOSTOP(45);
 758             }
 759         }
 760     }
 761
 762   CHRONOSTOP(23);CHRONO(24);
 763
 764   // compact downward connectivity structure: adjust downward arrays size, replace vector<vector int>> by a single vector<int>
 765   // 3D first then 2D and last 1D to release memory before edge upCells reorganization, (temporary memory use)
 766
 767   for (int vtkType = VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkType >= 0; vtkType--)
 768     {
 769       if (SMDS_Downward *down = _downArray[vtkType])
 770         {
 771           down->compactStorage();
 772         }
 773     }
 774
 775   // --- Statistics
 776
 777   for (int vtkType = 0; vtkType <= VTK_QUADRATIC_PYRAMID; vtkType++)
 778     {
 779       if (SMDS_Downward *down = _downArray[vtkType])
 780         {
 781           if (down->getMaxId())
 782             {
 783               MESSAGE("Cells of Type " << vtkType << " : number of entities, est: "
 784                   << GuessSize[vtkType] << " real: " << down->getMaxId());
 785             }
 786         }
 787     }CHRONOSTOP(24);CHRONOSTOP(2);
 788   counters::stats();
 789 }
 790
 791 /*! Get the neighbors of a cell.
 792  * Only the neighbors having the dimension of the cell are taken into account
 793  * (neighbors of a volume are the volumes sharing a face with this volume,
 794  *  neighbors of a face are the faces sharing an edge with this face...).
 795  * @param neighborsVtkIds vector of neighbors vtk id's to fill (reserve enough space).
 796  * @param downIds downward id's of cells of dimension n-1, to fill (reserve enough space).
 797  * @param downTypes vtk types of cells of dimension n-1, to fill (reserve enough space).
 798  * @param vtkId the vtk id of the cell
 799  * @return number of neighbors
 800  */
 801 int SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors(int* neighborsVtkIds, int* downIds, unsigned char* downTypes, int vtkId, bool getSkin)
 802 {
 803   int vtkType = this->GetCellType(vtkId);
 804   int cellDim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 805   if (cellDim <2)
 806     return 0; // TODO voisins des edges = edges connectees
 807   int cellId = this->_cellIdToDownId[vtkId];
 808
 809   int nbCells = _downArray[vtkType]->getNumberOfDownCells(cellId);
 810   const int *downCells = _downArray[vtkType]->getDownCells(cellId);
 811   const unsigned char* downTyp = _downArray[vtkType]->getDownTypes(cellId);
 812
 813   // --- iteration on faces of the 3D cell (or edges on the 2D cell).
 814
 815   int nb = 0;
 816   for (int i = 0; i < nbCells; i++)
 817     {
 818       int downId = downCells[i];
 819       int cellType = downTyp[i];
 820       int nbUp = _downArray[cellType]->getNumberOfUpCells(downId);
 821       const int *upCells = _downArray[cellType]->getUpCells(downId);
 822       const unsigned char* upTypes = _downArray[cellType]->getUpTypes(downId);
 823
 824       // ---for a volume, max 2 upCells, one is this cell, the other is a neighbor
 825       //    for a face, number of neighbors (connected faces) not known
 826
 827       for (int j = 0; j < nbUp; j++)
 828         {
 829           if ((upCells[j] == cellId) && (upTypes[j] == vtkType))
 830             continue;
 831           int vtkNeighbor = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 832           neighborsVtkIds[nb] = vtkNeighbor;
 833           downIds[nb] = downId;
 834           downTypes[nb] = cellType;
 835           nb++;
 836           if (nb >= NBMAXNEIGHBORS)
 837             {
 838               INFOS("SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors problem: NBMAXNEIGHBORS=" <<NBMAXNEIGHBORS << " not enough");
 839               return nb;
 840             }
 841         }
 842       if (getSkin)
 843         {
 844           if (cellDim == 3 && nbUp == 1) // this face is on the skin of the volume
 845             {
 846               neighborsVtkIds[nb] = _downArray[cellType]->getVtkCellId(downId); // OK if skin present
 847               downIds[nb] = downId;
 848               downTypes[nb] = cellType;
 849               nb++;
 850               if (nb >= NBMAXNEIGHBORS)
 851                 {
 852                   INFOS("SMDS_UnstructuredGrid::GetNeighbors problem: NBMAXNEIGHBORS=" <<NBMAXNEIGHBORS << " not enough");
 853                   return nb;
 854                 }
 855             }
 856         }
 857     }
 858   return nb;
 859 }
 860
 861 /*! get the volumes containing a face or an edge of the grid
 862  * The edge or face belongs to the vtkUnstructuredGrid
 863  * @param volVtkIds vector of parent volume ids to fill (reserve enough space!)
 864  * @param vtkId vtk id of the face or edge
 865  */
 866 int SMDS_UnstructuredGrid::GetParentVolumes(int* volVtkIds, int vtkId)
 867 {
 868   int vtkType = this->GetCellType(vtkId);
 869   int dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 870   int nbFaces = 0;
 871   unsigned char cellTypes[1000];
 872   int downCellId[1000];
 873   if (dim == 1)
 874     {
 875       int downId = this->CellIdToDownId(vtkId);
 876       if (downId < 0)
 877         {
 878           MESSAGE("Downward structure not up to date: new edge not taken into account");
 879           return 0;
 880         }
 881       nbFaces = _downArray[vtkType]->getNumberOfUpCells(downId);
 882       const int *upCells = _downArray[vtkType]->getUpCells(downId);
 883       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkType]->getUpTypes(downId);
 884       for (int i=0; i< nbFaces; i++)
 885         {
 886           cellTypes[i] = upTypes[i];
 887           downCellId[i] = upCells[i];
 888         }
 889     }
 890   else if (dim == 2)
 891     {
 892       nbFaces = 1;
 893       cellTypes[0] = this->GetCellType(vtkId);
 894       int downId = this->CellIdToDownId(vtkId);
 895       if (downId < 0)
 896         {
 897           MESSAGE("Downward structure not up to date: new face not taken into account");
 898           return 0;
 899         }
 900       downCellId[0] = downId;
 901     }
 902
 903   int nbvol =0;
 904   for (int i=0; i<nbFaces; i++)
 905     {
 906       int vtkTypeFace = cellTypes[i];
 907       int downId = downCellId[i];
 908       int nv = _downArray[vtkTypeFace]->getNumberOfUpCells(downId);
 909       const int *upCells = _downArray[vtkTypeFace]->getUpCells(downId);
 910       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkTypeFace]->getUpTypes(downId);
 911        for (int j=0; j<nv; j++)
 912         {
 913           int vtkVolId = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 914           if (vtkVolId >= 0)
 915             volVtkIds[nbvol++] = vtkVolId;
 916         }
 917     }
 918   return nbvol;
 919 }
 920
 921 /*! get the volumes containing a face or an edge of the downward structure
 922  * The edge or face does not necessary belong to the vtkUnstructuredGrid
 923  * @param volVtkIds vector of parent volume ids to fill (reserve enough space!)
 924  * @param downId id in the downward structure
 925  * @param downType type of cell
 926  */
 927 int SMDS_UnstructuredGrid::GetParentVolumes(int* volVtkIds, int downId, unsigned char downType)
 928 {
 929   int vtkType = downType;
 930   int dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
 931   int nbFaces = 0;
 932   unsigned char cellTypes[1000];
 933   int downCellId[1000];
 934   if (dim == 1)
 935     {
 936       nbFaces = _downArray[vtkType]->getNumberOfUpCells(downId);
 937       const int *upCells = _downArray[vtkType]->getUpCells(downId);
 938       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkType]->getUpTypes(downId);
 939       for (int i=0; i< nbFaces; i++)
 940         {
 941           cellTypes[i] = upTypes[i];
 942           downCellId[i] = upCells[i];
 943         }
 944     }
 945   else if (dim == 2)
 946     {
 947       nbFaces = 1;
 948       cellTypes[0] = vtkType;
 949       downCellId[0] = downId;
 950     }
 951
 952   int nbvol =0;
 953   for (int i=0; i<nbFaces; i++)
 954     {
 955       int vtkTypeFace = cellTypes[i];
 956       int downId = downCellId[i];
 957       int nv = _downArray[vtkTypeFace]->getNumberOfUpCells(downId);
 958       const int *upCells = _downArray[vtkTypeFace]->getUpCells(downId);
 959       const unsigned char* upTypes = _downArray[vtkTypeFace]->getUpTypes(downId);
 960        for (int j=0; j<nv; j++)
 961         {
 962           int vtkVolId = _downArray[upTypes[j]]->getVtkCellId(upCells[j]);
 963           if (vtkVolId >= 0)
 964             volVtkIds[nbvol++] = vtkVolId;
 965         }
 966     }
 967   return nbvol;
 968 }
 969
 970 /*! get the node id's of a cell.
 971  * The cell is defined by it's downward connectivity id and type.
 972  * @param nodeSet set of of vtk node id's to fill.
 973  * @param downId downward connectivity id of the cell.
 974  * @param downType type of cell.
 975  */
 976 void SMDS_UnstructuredGrid::GetNodeIds(std::set<int>& nodeSet, int downId, unsigned char downType)
 977 {
 978   _downArray[downType]->getNodeIds(downId, nodeSet);
 979 }
 980
 981 /*! change some nodes in cell without modifying type or internal connectivity.
 982  * Nodes inverse connectivity is maintained up to date.
 983  * @param vtkVolId vtk id of the cell
 984  * @param localClonedNodeIds map old node id to new node id.
 985  */
 986 void SMDS_UnstructuredGrid::ModifyCellNodes(int vtkVolId, std::map<int, int> localClonedNodeIds)
 987 {
 988   vtkIdType npts = 0;
 989   vtkIdType *pts; // will refer to the point id's of the face
 990   this->GetCellPoints(vtkVolId, npts, pts);
 991   for (int i = 0; i < npts; i++)
 992     {
 993       if (localClonedNodeIds.count(pts[i]))
 994         {
 995           vtkIdType oldpt = pts[i];
 996           pts[i] = localClonedNodeIds[oldpt];
 997           //MESSAGE(oldpt << " --> " << pts[i]);
 998           //this->RemoveReferenceToCell(oldpt, vtkVolId);
 999           //this->AddReferenceToCell(pts[i], vtkVolId);
1000         }
1001     }
1002 }
1003
1004 /*! reorder the nodes of a face
1005  * @param vtkVolId vtk id of a volume containing the face, to get an orientation for the face.
1006  * @param orderedNodes list of nodes to reorder (in out)
1007  * @return size of the list
1008  */
1009 int SMDS_UnstructuredGrid::getOrderedNodesOfFace(int vtkVolId, int& dim, std::vector<vtkIdType>& orderedNodes)
1010 {
1011   int vtkType = this->GetCellType(vtkVolId);
1012   dim = SMDS_Downward::getCellDimension(vtkType);
1013   if (dim == 3)
1014     {
1015       SMDS_Down3D *downvol = static_cast<SMDS_Down3D*> (_downArray[vtkType]);
1016       int downVolId = this->_cellIdToDownId[vtkVolId];
1017       downvol->getOrderedNodesOfFace(downVolId, orderedNodes);
1018     }
1019   // else nothing to do;
1020   return orderedNodes.size();
1021 }
1022
1023 void SMDS_UnstructuredGrid::BuildLinks()
1024 {
1025   // Remove the old links if they are already built
1026   if (this->Links)
1027   {
1028     this->Links->UnRegister(this);
1029   }
1030
1031   SMDS_CellLinks* links;
1032   this->Links = links = SMDS_CellLinks::New();
1033   this->Links->Allocate(this->GetNumberOfPoints());
1034   this->Links->Register(this);
1035   links->BuildLinks(this, this->Connectivity,this->GetCellTypesArray() );
1036   this->Links->Delete();
1037 }
1038
1039 void SMDS_UnstructuredGrid::DeleteLinks()
1040 {
1041   // Remove the old links if they are already built
1042   if (this->Links)
1043   {
1044     this->Links->UnRegister(this);
1045     this->Links = NULL;
1046   }
1047 }
1048 SMDS_CellLinks* SMDS_UnstructuredGrid::GetLinks()
1049 {
1050   if ( !this->Links )
1051     BuildLinks();
1052   return static_cast< SMDS_CellLinks* >( this->Links );
1053 }
1054
1055 /*! Create a volume (prism or hexahedron) by duplication of a face.
1056  * Designed for use in creation of flat elements separating volume domains.
1057  * A face separating two domains is shared by two volume cells.
1058  * All the nodes are already created (for the two faces).
1059  * Each original Node is associated to corresponding nodes in the domains.
1060  * Some nodes may be duplicated for more than two domains, when domain separations intersect.
1061  * In that case, even some of the nodes to use for the original face may be changed.
1062  * @param vtkVolId: vtk id of a volume containing the face, to get an orientation for the face.
1063  * @param domain1: domain of the original face
1064  * @param domain2: domain of the duplicated face
1065  * @param originalNodes: the vtk node ids of the original face
1066  * @param nodeDomains: map(original id --> map(domain --> duplicated node id))
1067  * @return ok if success.
1068  */
1069 SMDS_MeshCell*
1070 SMDS_UnstructuredGrid::extrudeVolumeFromFace(int vtkVolId,
1071                                              int domain1,
1072                                              int domain2,
1073                                              std::set<int>& originalNodes,
1074                                              std::map<int, std::map<int, int> >& nodeDomains,
1075                                              std::map<int, std::map<long, int> >& nodeQuadDomains)
1076 {
1077   //MESSAGE("extrudeVolumeFromFace " << vtkVolId);
1078   vector<vtkIdType> orderedOriginals;
1079   orderedOriginals.clear();
1080   set<int>::const_iterator it = originalNodes.begin();
1081   for (; it != originalNodes.end(); ++it)
1082     orderedOriginals.push_back(*it);
1083
1084   int dim = 0;
1085   int nbNodes = this->getOrderedNodesOfFace(vtkVolId, dim, orderedOriginals);
1086   vector<vtkIdType> orderedNodes;
1087
1088   bool isQuadratic = false;
1089   switch (orderedOriginals.size())
1090   {
1091   case 3:
1092     if (dim == 2)
1093       isQuadratic = true;
1094     break;
1095   case 6:
1096   case 8:
1097     isQuadratic = true;
1098     break;
1099   default:
1100     isQuadratic = false;
1101       break;
1102   }
1103
1104   if (isQuadratic)
1105     {
1106       long dom1 = domain1;
1107       long dom2 = domain2;
1108       long dom1_2; // for nodeQuadDomains
1109       if (domain1 < domain2)
1110         dom1_2 = dom1 + INT_MAX * dom2;
1111       else
1112         dom1_2 = dom2 + INT_MAX * dom1;
1113       //cerr << "dom1=" << dom1 << " dom2=" << dom2 << " dom1_2=" << dom1_2 << endl;
1114       int ima = orderedOriginals.size();
1115       int mid = orderedOriginals.size() / 2;
1116       //cerr << "ima=" << ima << " mid=" << mid << endl;
1117       for (int i = 0; i < mid; i++)
1118         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1119       for (int i = 0; i < mid; i++)
1120         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1121       for (int i = mid; i < ima; i++)
1122         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1123       for (int i = mid; i < ima; i++)
1124         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1125       for (int i = 0; i < mid; i++)
1126         {
1127           int oldId = orderedOriginals[i];
1128           int newId;
1129           if (nodeQuadDomains.count(oldId) && nodeQuadDomains[oldId].count(dom1_2))
1130             newId = nodeQuadDomains[oldId][dom1_2];
1131           else
1132             {
1133               double *coords = this->GetPoint(oldId);
1134               SMDS_MeshNode *newNode = _mesh->AddNode(coords[0], coords[1], coords[2]);
1135               newId = newNode->getVtkId();
1136               if (! nodeQuadDomains.count(oldId))
1137                 {
1138                   std::map<long, int> emptyMap;
1139                   nodeQuadDomains[oldId] = emptyMap;
1140                 }
1141               nodeQuadDomains[oldId][dom1_2] = newId;
1142             }
1143           orderedNodes.push_back(newId);
1144         }
1145     }
1146   else
1147     {
1148       for (int i = 0; i < nbNodes; i++)
1149         orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain1]);
1150       if (dim == 3)
1151         for (int i = 0; i < nbNodes; i++)
1152           orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1153       else
1154         for (int i = nbNodes-1; i >= 0; i--)
1155           orderedNodes.push_back(nodeDomains[orderedOriginals[i]][domain2]);
1156
1157     }
1158
1159   if (dim == 3)
1160     {
1161       SMDS_MeshVolume *vol = _mesh->AddVolumeFromVtkIds(orderedNodes);
1162       return vol;
1163     }
1164   else if (dim == 2)
1165     {
1166       SMDS_MeshFace *face = _mesh->AddFaceFromVtkIds(orderedNodes);
1167       return face;
1168     }
1169
1170   // TODO update sub-shape list of elements and nodes
1171   return 0;
1172 }
1173
1174 //================================================================================
1175 /*!
1176  * \brief Allocates data array for ball diameters
1177  *  \param MaxVtkID - max ID of a ball element
1178  */
1179 //================================================================================
1180
1181 void SMDS_UnstructuredGrid::AllocateDiameters( vtkIdType MaxVtkID )
1182 {
1183   SetBallDiameter( MaxVtkID, 0 );
1184 }
1185
1186 //================================================================================
1187 /*!
1188  * \brief Sets diameter of a ball element
1189  *  \param vtkID - vtk id of the ball element
1190  *  \param diameter - diameter of the ball element
1191  */
1192 //================================================================================
1193
1194 void SMDS_UnstructuredGrid::SetBallDiameter( vtkIdType vtkID, double diameter )
1195 {
1196   vtkDoubleArray* array = vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() );
1197   if ( !array )
1198   {
1199     array = vtkDoubleArray::New();
1200     array->SetNumberOfComponents(1);
1201     vtkDataSet::CellData->SetScalars( array );
1202   }
1203   array->InsertValue( vtkID, diameter );
1204 }
1205
1206 //================================================================================
1207 /*!
1208  * \brief Returns diameter of a ball element
1209  *  \param vtkID - vtk id of the ball element
1210  */
1211 //================================================================================
1212
1213 double SMDS_UnstructuredGrid::GetBallDiameter( vtkIdType vtkID ) const
1214 {
1215   if ( vtkDataSet::CellData )
1216     return vtkDoubleArray::SafeDownCast( vtkDataSet::CellData->GetScalars() )->GetValue( vtkID );
1217   return 0;
1218 }
1219