0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements

-  bin_PROGRAMS=medpartitioner_para
+  bin_PROGRAMS+=medpartitioner_para

Changing error messages

Bug correction in DataArray*::setSelectedComponents

Protect against throw in MEDFileMesh::New(arg0,arg1)

MEDCouplingFieldDouble::copyAllTinyAttrFrom

Bug correction in reverseTransferField

Little check.

sync of umesh::getBary with curvel::getBary in 3D.

End of implementation of "not implemented methods"

clean up

Implementation of CurveLinear::getMeasureField

Bug correction spaceDim->meshDim

VTK writing of cartesian mesh

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /

Test both medpartitioner and medpartitioner_para (if available)

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /

--creates-boundary-faces is not a numeric argument

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /

Create the class ParMETISGraph to enable co-existence of Metis and Parmetis

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /

Wrap Metis functions into a C function located in a
MEDPARTITIONER_metis.c to avoid problems with Metis included in
Parmetis-3 that campilation breaks at extern "C" {#include "metis.h"}
because "metis.h" includes C++ declarations of MPI

-#include "metis.h"
+#include "MEDPARTITIONER_metis.h"

VTK writing of curve linear mesh

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /
Move filtering face mesh and face families in to MeshCollection::filterFaceOnCell() in order
   to create valid boundary groups in MeshCollection::buildConnectZones() with MPI

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /
1) - in MPI configuration, only medpartitioner_para is compiled, while having medpartitioner is still relevant.
2) fix SIGSEGV with MPI
3) Filter face mesh and face families in filterFaceOnCell() in order
   to create valid boundary groups in buildConnectZones()

VTK writing of curve linear mesh

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements

+        if test "x$parmetis_ok" != "xyes"; then
+                CHECK_PARMETISV4
+        fi

CurveLinearMesh 2

CurveLinearMesh 2

CurveLinearMesh 2

CurveLinearMesh 2

CurveLinearMesh 2

Correcting test to be compatible with python 2.6. These bad lines will be destroyed in Salome7

MEDCouplingUMesh::simplexize with PLANAR_5 and PLANAR_6

MEDCouplingUMesh::simplexize with PLANAR_5 and PLANAR_6

Splitting policy can be used outside interpolation

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /
Can you :
1/ add the corresponding tests

+  CPPUNIT_TEST( testCreateBoundaryFaces2D );

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /
- creates boundary faces option is not handled

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /
- in MPI configuration, only medpartitioner_para is compiled, while having medpartitioner is still relevant.

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements /
- creates boundary faces option is not handled

+    //constructing connect zones
+    void buildConnectZones();

+    void createJointGroup( const std::vector< int >& faces,
+                           const int                 inew1,
+                           const int                 inew2,
+                           const bool                is2nd );

remove a comment being at improper place

0021856: [CEA 663] Documenting API of MEDCoupling and MEDLoader

Addition of MEDCouplingCurveLinearMesh

Addition of MEDCouplingCurveLinearMesh

Addition of MEDCouplingCurveLinearMesh

Debug

swig of MEDCouplingUMesh.insertNextCell more general

Changing default time discretizaton of fields. By default now ONE_TIME.

End of redesign of partitionBySpreadZone

Bug correction in MEDCouplingUMesh::ComputeSpreadZoneGradually when a cell has no neighbours.

Bug correction in MEDCouplingUMesh::ComputeSpreadZoneGradually when a cell has no neighbours.

distance to mesh end of implementation

distance to mesh end of implementation

distance from point to mesh implementation

distance from point to mesh implementation

Warning hunting

addition of RefCount::getHeapMemorySize

addition of RefCount::getHeapMemorySize

Debugging orientCorrectlyPoly. More general implementation (2) without compilation warnings.

DataArrayInt::accumulate

Modification of splitting policy in 3D. From GENERAL48->PLANAR_FACE_5

renaming of buildPartOf was not a good idea in the perspective of MEDLoader interaction

checkConsecutiveCellTypesForMEDFileFrmt

Debugging orientCorrectlyPoly. More general implementation

Enable components with size of str equal to 16

MEDCouplingUMesh::findAndCorrectBadOriented3DCells

MEDCouplingUMesh::findAndCorrectBadOriented3DCells

Tests

Clean-up

Some performance loss linked to users having non uniform numbering in source mesh.

Some performance loss linked to users having non uniform numbering in source mesh.

clean-up

MEDFileUMesh::addGroup implementation

Protection of getMeasureField when no mesh specified.

MEDFileUMesh::addNodeGroup end of implementation

MEDFileUMesh::addNodeGroup

MEDFileUMesh::zipCoords

MEDFileField*::deepCpy debug

MEDFileField*::deepCpy

MEDFileMesh::deepCpy and shallowCpy

python len(MEDFileFieldMultiTS)

DataArrayInt::setValues and DataArrayDouble::setValues now check the size as New methods do.

More additionnal tests

buildDescendingConnectivity has been reimplemented to improve perf.
OK on all tests.

On the road of rewritting buildDescendingConn implementation

On the road of rewritting buildDescendingConn implementation

API modif of getCellsInBoundingBox to avoid copies.

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements

1) Enable work in 2D space
2) In remapIntField(), take into accound coincident elements
3) Protect filterFaceOnCell() from invalid elements

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements

+  return false;

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements

   use BBTreeOfDim

0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements

+  /*!
+   * \brief Class encapsulating BBTree of dimension given at construction and
+   *        providing all features of BBTree
+   */
+  class BBTreeOfDim

Win32 compatibility

Warning hunting

DataArrayInt instead of vector<int> to avoid copies

DataArrayInt,DataArrayDouble pushBack and popBack

DataArrayInt,DataArrayDouble pushBack and popBack

AutoRef::retn

AutoRef::retn

Improvement of perf of zipConnectivityTraducer.

Improvement of perf of zipConnectivityTraducer.

Improvement of perf of zipConnectivityTraducer.

Bug when several ouput polygons in residual of m1 inter m2.

Bug when several ouput polygons in residual of m1 inter m2.

Bug when several ouput polygons in residual of m1 inter m2.

Protection against infinite loop when computing residuals of invalid input mesh.