Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

Rewrote eraseCurrent() in a more efficient way + disabling one test not stable enough yet.

Bug correction into MEDCouplingUMesh::getMeasureFieldOnNode on non simplex cells. Consequence : FieldDouble::integral on P1 field may change in case of non simplex use.

Useful valgrind suppr file for SWIG ...

Intersec bug fix: point not added properly inserted in splitting.

Intersect bug fix : quad point was not inserted in the map even when used as an extremity
for another seg.

Protect MEDCouplingFieldDouble::getValueOnMulti from SIGEGV on PENTA6

Nasty one! Was OK on FED20, but not on more recent compilers.

Intersec bug fix: correct polygons with flat corners, they crash residual computation ...

also added test.

Bug fix in compute residual: the stop condition is really on pol1Zip only.

We might end up with remaining boundary edges from pol2 (and that's OK)

Intersection : ComputeResidual -> some refactoring for readability

Intersec bug fix: when intersecting nodes are merged, they were not properly
added on pol2.

Bug fix: seg seg intersector epsilon is to be taken absolutely for colinearity test:

+ even for very small vectors we don't want to have false positive on colinearity. So go back to a comparison with an angle.
+ removed spurious *2 in comparison
+ test IntersectionPointOnlyUnitarySegSeg precision was relaxed a bit

Intersection: renaming some variables and refactor to make the algo easier to read.

Rewrote _matrix in a more natural way in SegSegIntersetor

Implementation of mergefields on Gauss Points + unification of mergefields(f1,f2) and mergefields([f1,f2])

Porting python3

First draft of int64.

Add reading of record 8 of sauv file (ascii and XDR) for Castem 17

Make the static counters atomic

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

Update the documentation

Merge branch 'V9_2_BR'

Bug correction in the medcoupling <-> numpy layer

Quick and dirty patch

BUG correction : During P0P0 remapping on tetra. If tetra is very small the TetraAffine matrix could be falsely detected as not inversible.

BUG correction : During P0P0 remapping on tetra. If tetra is very small the TetraAffine matrix could be falsely detected as not inversible.

Increment version: 9.2.0

Removing debug print messages !

Test correction: Python3: print '...' -> print('...')

Bug fix: IsPolygonWellOriented() was not working properly QPLOYG

If the linearized version was self-intersecting, algo was faulty.

Bug fix : Edge::sortIdAbs() was merging points too agressively.

Test case for the prev fix of ComputeResidual ... never hurts ...

Intersec bug fix: ComputeResidual buggy for quad polyg with 2 edges.

Move Case*.py installation directory from bin to lib/python-MinMag

Fix parallel compilation error on building of ParaMEDMEM python module.

Typo and whitespace fixes by Kunda

http://www.salome-platform.org/forum/forum_9/454200149#834683007

Minor doxygen fix

Windows support

MEDLoader is now able to export to 3.3 MED file version.

A test of MEDCouplingUMesh::removeDegenerated1DCells

Context manager for MEDFile*Field1TS

New MEDCouplingUMesh::removeDegenerated1DCells method

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

Minor bug fix : convertDegeneratedCellsAndRemoveFlatOnes()

Test of DataArrayDouble.ComputeIntegralOfSeg2IntoTri3

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

Take advantage of a nice property of barycentric coords

Increment version: 9.1.0

Further fix for CaseReader Py3 ...

[EDF17279] : integration computation

Finalizing windows porting.

Sacrifice of MEDRenumber python module for windows due to lack of time. medcoupling python module is now the right module.

Extra deps update

Windows porting

Proposal SWIG CMake fix

Correction of error during Py3 porting

MEDCoupling python module is expected to be replaced by medcoupling python module

Ajouts des tests

getCellsContainingPoints is sensitive to 2D quadratic static cells.

- MEDLoader ReadField is now dealing int32, float64 and float32
- Support of Gauss Points on SEG2 with ref coo equal to [0., 1.]
- Addition of DAI.giveN2OOptimized
- MEDCouplingPointSet.renumberNodesInConn support maps as input in python wrapping

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

Further porting to Python3

Merge branch 'abn/norm_max'

Porting Case tools to Python3

1) Detect sphinx theme directly in conf.py.in file
2) Migration to Sphinx-1.7.6: remove deprecated 'sphinx.ext.pngmath' extension

API change: MEDCouplingFieldDouble::normMax is now aligned with normL1 and normL2

New functionality: colinearizeKeepingConform2D().

Intel17 portability.

Fix failure of UsersGuideExamplesTest in MICROMED mode

Additional check into MEDFileMesh.rearrangeFamilies thanks to Yutaka feedback

Thank you to Yutaka Nishizawa for having report this bug (SALOME forum).

A py3 translation of a forgotten test py file

Merge branch 'abn/seg_seg_intersec'

SegSegIntersector fix: fix eps comparison to detect seg/seg overlap

Getting rid of QuadraticArcDetectionPrecision which is now merged with QuadraticPlanarPrecision.

SegSegIntersector areOverlappedOrOnlyColinears() and areColinears() now aligned.

getArcDetectionPrecision() is no more needed.

Typo-fix by Kunda

http://www.salome-platform.org/forum/forum_9/625363577

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

New func: MEDCouplingUMesh::convertDegeneratedCellsAndRemoveFlatOnes

- does the same as convertDegeneratedCells() but also remove cells which are exactly flat according to their connectivity
- also improved convertDegeneratedCells()

C++11 for everybody ! youhouuuuu

medcoupling documentation modification

ArcCSegIntersector fix: more precise usage of machine epsilon.

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

ArcCSegIntersector fix: tangent cases were not properly handled.

(also removed a duplicated test case)

Merge branch 'V8_5_BR'

Increment version: 8.5.0

Merge remote-tracking branch 'origin/abn/bug_fixes' into V8_5_BR

Clarification: 'Triangulation' intersection type is the only valid choice
for non-unstruct/non-unstruct remapping.

Bug fix: SegSegIntersector::areColinears() was too tolerant.

(non homogeneous comparison of eps and quadratic term)

Bug fix: points located on the arc where wrongly detected by arc/arc intersector.

Bug fix: conformize3D() was not properly void returned array.

Bug fix: Intersect2DMeshWith1DLine now correctly handling closed lines ...

Bug fix in colinearize2D(): last seg not handled properly.

Bug correction for structure elt

Clarification: 'Triangulation' intersection type is the only valid choice
for non-unstruct/non-unstruct remapping.

Bug fix: SegSegIntersector::areColinears() was too tolerant.

(non homogeneous comparison of eps and quadratic term)

Bug correction for structure elt

Bug fix: points located on the arc where wrongly detected by arc/arc intersector.

Bug fix: conformize3D() was not properly void returned array.