[EDF23738] : bug correction to avoid regressions

Merge branch 'agy/edf23738_mix_struc_el_integ'

[EDF23738] : implementation in structure elements (SE) context of case of multiple SE in a same field. Each SE lies on
different GEOM Type of a same mesh.

[doc] Updating tutorial to only use "import medcoupling as mc"

Minor fix in ICoCo header ...

[EDF23738] : multi geometric type in a single mesh having structure elements on each geometric type

[EDF23724] : protection against intersection on a single array that can be ambigous and so return an unexpected result

[EDF23724] : Get rid of DataArrayMedInt class not castable into DataArrayInt32 nor DataArrayInt64

Patch from Intel

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

Fix of reference connectivity of faces of PENTA15 cell from Roberto Da Via

Merge branch 'V9_7_BR'

[ICoCo] renamed header and symbol for decl spec

+ shell script to test equality between GitHub and MC version

[ICoCo] renamed header and symbol for decl spec

+ shell script to test equality between GitHub and MC version

[Intersect2D] Keep flexibility on orientation of mesh2

+ for Voronoi and Gauss points notably

[Intersect2D] Bug fix: residual cell construction

+ was buggy when mesh2 fully included in mesh1 and points
of mesh2 on edges of mesh1

[Intersect2D] Keep flexibility on orientation of mesh2

+ for Voronoi and Gauss points notably

[Intersect2D] Bug fix: residual cell construction

+ was buggy when mesh2 fully included in mesh1 and points
of mesh2 on edges of mesh1

Useful python function to transfert data without copy from SMESH

Increment version: 9.7.0

implementation of useful DataArray::SplitStringInChuncks for SMESH 2 MC layer

#24166 [OCC][Windows] MEDCoupling can't be built under Windows after 34b392fa96 commit: fix compilation on Linux with MPI

Fix compilation error due to integration of windows porting 894bcbdeb7

Fix compilation error due to integration of windows porting 894bcbdeb7

[OCC][Windows] MEDCoupling can't be built under Windows after 34b392fa96 commit

Avoid installing redundant files

Fix salome test tests

[ICoCo]: ICoCo part as a new sub library: libmedicoco.so

+ Python wrapping is done in "medcoupling"

synchronize make test and salome test

Synchronize medcoupling tests between ctest and salome test

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

Add MEDCouplingMesh.computeMeshCenterOfMass

[ICoCo] ICoCo interface version 2

+ renamed MEDField into MEDDoubleField.
+ added MEDIntField.
+ rename getField() into getMCField() into MED*Field class for clarity
+ proper field name management
+ proper doc

Remove useless ifdef

Bug fix: interpolation 2D/3D -> no bounding box adjustment was made

+ added bbox adj for this case
+ factorized adjustBoundingBox method at TargetIntersector level (root
class)

Merge branch 'occ/24009'

Remove \t...

Copyright update 2021

Shame on me

compute_interpolation_P0P0_matrix_with_geom method to check medcoupling matrix

Add MEDCouplingRemapper.ToCSRMatrix static method to compare matrices

fix for OS Windows

export geom shape from medcoupling mesh

DataArrayInt32.convertToInt64Arr and DataArrayInt64.convertToInt32Arr

[ParaMEDMEM] Adding SWIG interface for OverlapDEC + py tests of DEC

+ added 'release()' method for some classes (gives a chance to Python wrapping
to call MPI clean up operations without having to wait for destructor)
+ added Python tests

Moving MPIAccess to a subfolder for clarity

Fix warning due to 999b10494c931d01a

Compilation under Windows.

Get rid of tab introduced in 7fef2459b44

[EDF22895] : Fix snippets in documentation

Compilation under CentOS 6 and 7

Merge commit

Compilation under Windows

Vadim s review of 47fc37875313e44

CS work : MeshGems reader/writer

activate paramedmem test with "salome test" mechanism

Add to med30 convertor.

Implementation of basic mesh checker to detect avoidable errors

ParaMEDMemTest: bug fix: dangling pointer on stack.

+ indentation on MEDCouplingRemapperTest.cxx

Minor doc clarification following user feedback.

Doc

Minor: SPACEDIM remains an int

2D PointLocator remapping now works properly on non-convex polygons.

+ unified PointLocator logic (getCell*ContainingPoint* functions are always
using PointLocator algorithms)

buildInnerBoundaryAlongM1Group: bug fix for singular point in 3D

Unwanted trailing spaces ...

Fix 32bits config bug

Suppress default rev nodal computation in case of num of nodes.

Small imp

Adapt for C++17

Intersection: fixed seg fault on Ubuntu 20

Fix SIGSEGV on string representation of empty MEDCoupling1[S,D]GTUMesh

Non reg test linked to previous commit

MEDFileMeshLL::renumberNodesInConnWithoutComputation did not notify correctly wich internal DS was changed

[EDF22126] : eigen values with identity matrix

Optimize memory peak during coordinates loading implied by MEDFileUMesh.LoadPart.

Merge branch 'master' of https://codev-tuleap.cea.fr/plugins/git/salome/medcoupling

[EDF22126] : doc about convention of components for eigenValues and eigenVectors method

Merge branch 'V9_6_BR'

Reduce number of collective calls that kill performance even if mem peak is higher

Intersect2DMeshWith1DLine: bug fix (collinear edges not always detected)

+ with test case
+ and doc

CMake-ish propagation of MEDCOUPLING_USE_64BIT_IDS define

MEDFileCMesh: bug fix: getFamsNonEmptyLevels{Ext} was buggy

Increment version: 9.6.0

MEDFileCurveLinearMesh -> getSpaceDimension() was missing

Bug with FindClosestTupleIdAlg fixed (preventing the threshold to be null)

Set default value of MEDCOUPLING_USE_64BIT_IDS option to ON

Generalization of MEDCouplingUMesh::fillCellIdsToKeepFromNodeIds and MEDFileUMesh::LoadPart with empty mesh

Fix error on int64 config due to bf521630bd93aec8 commit

Propagate to medcoupling C++ client code MEDCOUPLING_USE_64BIT_IDS definition

Compilation with debian8 native MPI

bos #20133 Wrap numpy-dependent code with preprocessor check

Revert "bos #20133 Wrap numpy-dependent code with preprocessor check"

This reverts commit d3d55547e9f984a9de4852477c03a49e1a909412.

bos #20133 Wrap numpy-dependent code with preprocessor check

Various fixes for test runs - introducing MEDCOUPLING_RESOURCE_DIR env variable

+ tests should work w/o having done the install
+ new variable MEDCOUPLING_RESOURCE_DIR set at test time and pointing to BUILD resource dir
+ renaming UsersGuideExample for MEDLoader so that we don't have twice the same test name overall (confusing CTest)
+ fixing env for RENUMBER

Parallel partitionner compile fix ...

+ seems like no one is using this ??

Fix compilation with openmpi < 4.0

Fix clang compilation (template instanciations) + clang warnings

+ CMakeLists: adding (in comment) a useful set of warnings.
+ Constructors throwing should not call instance (ie non-static) methods.
+ Various doc fixes - thanks "-Wdocumentation" in clang
+ Removing unnecessary comparison (clang -Wtautological-compare)
+ replacing throw() by noexcept(true)
+ clang -Wconditional-uninitialized. Some remaining in SWIG generated code.
+ missing breaks, shadow variable, etc ...
+ clang -Wshorten-64-to-32-bits
+ AutoPyPtr in an anonymous namespace to avoid suboject-linkage warning.

Bug fixes: cartesianize() and WriteFieldOnAlreadyWrittenMesh()

+ WriteFieldOnAlreadyWrittenMesh() for MCFieldInt and MCFieldFloat
+ cartesianize() not doing the job when AX_CART set (should only copy)

UserGuideExample test of RENUMBER needs Partitioner

Portability: MPICH does not support "--oversubscribe" option