Merge branch 'origin/agy/V731rc2'

cherry-pick between a669 and 19a96 of V7_main

Merge branch V7_main

Added missing method to SWIG: isFullyQuadratic()

lack of display of geo types in the tree in new MEDReader. Add methods for information only.

Feedback from Patrick : lack of geo types in new MEDReader

Increment version: 7.3.1

Addition of new reference coords including degenerated cells.

MEDFileUMesh::setName forward name to the leaves.

MEDFileUMesh::setName forward name to the leaves.

MEDFileMesh::getGeoTypesAtLevel has been virtualized.

Extend the lib to support orphan nodes in profiles.
Extend the lib to support umeshes with no cells.

"Supporting" Fortran case file.

Fixing compilation error under Visual2012.

22464: [CEA 1046] SEGFAULT when reading a SAUV file in V7.3.0 and V7_main

+//================================================================================
+/*!
+ * \brief Safely adds a new Group
+ */
+//================================================================================
+
+Group* IntermediateMED::addNewGroup(std::vector<SauvUtilities::Group*>* groupsToFix)

Correction of bug found thanks to MEDReader. ZE TEST !

Correction of bug found thanks to MEDReader.

Suppression of remaining

Ease the use of loadArraysIfNecessary for new MEDReader.

Warning hunting

kill

API modification : input string have type :
const std::string& instead of const char *

API modification : input string have type :
const std::string& instead of const char *

improve error message.

Install the *.cmake in $MED_ROOT_DIR/adm_local when compiled in STANDALONE mode.

Correction of bug on Cartesian and CurveLinear mesh when a profile on that mesh leads to cartesian/curvelinear mesh

Addition of QUAD8 to pass MEDReader tests.

Addition of QUAD9 to pass MEDReader tests.

Correct bug on CMesh with no profiles !

Correct bug on CMesh with no profiles !

MEDLoader.WriteFieldUsingAlreadyWrittenMesh works with mesh not unstructured.

getMeshDimension and getSpaceDimension do not return systematically the same thing in CMesh.

Adding test of self intersecting quadratic mesh.

Little optimization in InOut detection.

memory leak !

+ Bug fix : ComposedEdge::applyGlobalSimilarity() was potentially passing twice on the same (Edge*).
+ Various comments

 + Field::cellToNode implementation
 + fast reverseNodal computation for structured mesh.

Debug for new MEDReader

Debug for new MEDReader

Debug for new MEDReader EDF:2219

CMake:
- Delete a condition to add adm_local directory, because it is necessary to install FindSalome* files for current project

Correcting ref coords for QUAD4 to be compliant with existing shape function in MEDCoupling.
Adding a test to generate a case containing only a mesh to test MEDReader.

gives localization of gauss points of GAUSS_NE fields.

Merge from V7_3_BR branch 18/12/2013

Addition of family field on nodes and number field on node for meshes.

Addition of family field on nodes and number field on node for meshes.

DataArrayInt::getIdsEqualTuple

Exclude 'CVS' directories from source files processing.

Additionnal tests for MEDReader.

Non regression test with gauss points in MEDReader.

Little bug : missing info on components during field spliting when the loading is done only the first time.

Nicer constructors of SauvReader and SauvWriter.

MEDReader can read Sauv file too.

Debug

Micro addon for new MEDReader with GaussPoints.

In MEDLoader basic API export the static policy in the MEDLoader advanced objects in basic write mode.

Forward eps to the bbox computation during getCellsContainingPoints process.

Non regression test for MEDReader on ELNO.

Bounding box for BBTree in MEDCouplingPointSet takes into account quadratic 2D cells

Some missing tiny services for implementation of a general implementation of MEDCouplingUMesh::getCellsContainingPoints

Fix *** buffer overflow detected *** in TestMEDPARTITIONER on Ubuntu.
 Get more space for printing a date

Minor: documentation and comments

Some missing tiny services for implementation of a general implementation of MEDCouplingUMesh::getCellsContainingPoints

CMake:
- add environment property for test

Additional methods for edition of groups and families.

Final tuning with polyhedron

Small modification for ParaView happiness.

Additionnal test for several meshes

0022430: [CEA 1017] Memory corruption on sauv to med operation

Sort field sub-components by cell type to correspond to cell order
after relocation

-  SauvUtilities::Group* getFieldSupport(const std::vector<SauvUtilities::Group*>& fieldSupports);
+  void setFieldSupport(const std::vector<SauvUtilities::Group*>& supports,
+                       SauvUtilities::DoubleField*               field);

Management of the new kid of the block VTK_QUADRATIC_POLYGON in VTK

fix indentation

Fix problem with tests: add missing 'import os'

CMake:
-generate tests environment to run test

CMake:
-generate tests environment to run test

CMake:
-generate tests environment to run test

New SauvWriter option for copy group lying on a single family

getAllTypes->getAllGeoTypes

Optimizations for new MEDReader

MEDCouplingUMesh::getAllGeoTypesSorted

MEDCouplingUMesh::getAllGeoTypesSorted

MEDCouplingUMesh::getAllTypes -> MEDCouplingUMesh::getAllGeoTypes

Debugging session

Don't run the test with numpy if this optional product is not used

Optimization of reading process to reduce at most copies.
Externalize famIds for new MEDReader to perform filtering on output datasets.

Optimization of reading process to reduce at most copies.
Externalize famIds for new MEDReader to perform filtering on output datasets.

Increment version to 7.3.0

CMake:
- add files to remove using command "make clean"

Some doc

CMake:
- add files to remove using command "make clean"

Most effective and safe method to state if the data returned is the same than inside the code.

Adding a test to stress new MEDReader when the int * and double * are shared without copy between VTK and MEDCoupling.

For 0.11.0 scipy users. spdiags used instead of diags.

Returned value that informs the caller about the nature of returned coords pointer.

Split Numpy and Scipy detection

Split Numpy and Scipy detection

Split Numpy and Scipy detection

DataArrayDouble::normMin, DataArrayDouble::computeAbs, DataArrayInt::computeAbs

In english

Protection against no scipy presence.

Temporary fix: specify missing environment for tests (should be done with SALOME_COLLECT_ENVIRONMENT/SALOME_GENERATE_TESTS_ENVIRONMENT macros.