[Backport from 8.5] Bug fix: points located on the arc where wrongly detected by arc/arc intersector.

Backport from 8.5:

[43cbbcc0fc]: Bug fix in colinearize2D(): last seg not handled properly.
[305e7a338]:  Bug fix: Intersect2DMeshWith1DLine now correctly handling closed lines ...

Refactoring QuadraticPlanar precision tuning. Fixes intersector bugs.

+ Backport of bug fix in Intersect2DMeshWith1DLine (commit e12ff086a9)
+ Backport of commit 629c436ac5b1a (epsilon bug fix)
+ Backport of commit 62227e92 (epsilon refactoring)

MEDLoader bug fix. Detected by FLICA non regression tests.

Backport of BBox adjustment for 3D1D interpolation (PointLocator)

Minor: fixing test to use V7 API (was still using V8)

Remapper: added new P1P1 method: MappedBarycentric. See doc
for more infos.

Fix tests environment

Fix salome tests

Increment version: 7.8.0

Synchronize adm files

Windows compatibility

Doc fix.

Make PARMETIS and METIS partitioner mutually exclusive.

Otherwise they mix up in certain configurations.

Fix test to work with metis 5.1.0 (to be confirmed)

Tests: minor fixes:

+ Make MEDCOUPLING_WITH_FILE_EXAMPLES and MEDCOUPLING_BUILD_TESTS compatible.
+ Fix test MEDLoaderCouplingTrainingSession

Remapper: missing error message in InterpPlanar

Minor fix.

ParaMEDMEM: DisjointDEC

+ bug fix in copy ctor
+ new tests: both IDs and procs groups tested in constructor
+ added method to check group consistency.

All users free to choose whether to use XDR or not.

Default value is OFF when WIN32, ON otherwise.

Minor portability: Cygwin compiler seems to have _X as a standard symbol ...

Porting to metis 5.1

A useful method for global vars.

MEDCoupling has now a simple global map.

Make the medcoupling to VTK accessible from the outside. For MEDWriter.

Minor fix : CMake version 2.8.11 is sufficient for POSITION_INDEPENT_CODE flag

Added option MEDCOUPLING_BUILD_STATIC to build static libs.

Synchronize adm files

Fix problem with detection python libraries.

Synchronize adm files

Add missing license file

Synchronize adm files

Synchronize adm files

Bug linked with multi node field read in parallel. The first one was modifying the second one in context where field PartDef was a DataArrayPartDef.

Synchronize adm files

Bug correction EDF12533

Synchronize adm files

Copyright update: 2016

Synchronize adm files

Copyright update: 2016

Minor bug fix.

buildInnerBoundaryAlongM1Group(): bug fix for triangular/tetra mesh.

Synchronize adm files

Use "default" theme for Sphinx < 1.3

Conditional test37 and test38 depending on medfile version.

C++98 compatibility (remove C++11 staff)

Synchronize adm files

Synchronize adm files

Fix compilation with NumPy/SciPy.

Merge relevant changes from V8_0_0_BR branch

CMake: simplifying Python detection mechanism.

Doc fix and enhancement.

getWarpField(): documentation

getSkewField(): documentation.

Introduced check functions in MEDFileUMesh:

   + checkCoherency(),
   + checkSMESHCoherency()
   + and clearNodeAndCellNumbers()

Also added hasUniqueValues() in DataArrayInt

Merge branch 'V7_dev' of https://git.salome-platform.org/git/tools/medcoupling into V7_dev

Manual sync. from KERNEL.

Synchronize adm files

Bug fix: some missing CMake files at install

Merge branch 'master' into V7_dev - taking only stuff not for V8

A forgotten C++ test

Ensure sequential run of MEDLoader 1,2,3 tests.

MEDFile 3.2.0 porting to support CYL and SPHER.

Simple porting to medfile 3.2.0

Remove checkCoherency2.

MEDCouplingUMesh.tessellate2D - only one entry point now.

Merge branch 'master' of https://git.salome-platform.org/git/tools/medcoupling

Remove DataArrayInt::isIdentity-> DataArrayInt::isIdentity2 for everybody. Remove DataArrayInt::replaceOneValByInThis replaced by DataArrayInt::changeValue.

Script to perform automatic renaming should be installed.

Merge branch 'master' of ssh://git.salome-platform.org/tools/medcoupling

Conflicts:
v8_work/TODO.txt -- keeping Anthony's last word!

Covariance: last fixes.

Modif b4 apply.

Covariance: forgot the most important one deepCpy() !!

Fixing various C++ covariances mismatches in the API

    + MEDCouplingUMesh
        deepCpyConnectivityOnly
        mergeMyselfWithOnSameCoords
        buildPartOfMySelf
        buildPartOfMySelfNode
        buildPartOfMySelf2
        buildFacePartOfMySelfNode
        buildBoundaryMesh
        buildPartOfMySelfKeepCoords
        buildPartOfMySelfKeepCoords2
    + MEDCouplingExtrudedMesh
        deepCpy
    + MEDCouplingIMesh
        deepCpy

API renaming: preparation.

Synchronize adm files

Merge branch 'V8_0_BR'

Quick Sphinx 1.2 porting

Synchronize adm files

Fix possible problem with enclosed reloading of targets from SALOME modules

Generalization of some Fam/grp methods from MEDFileUMesh->MEDFileMesh.

Documentation buildExtrudedMesh()

One more test.

3D2D -> 2D3D to ease readability.

Compile interp_kerneltests only if asked.

Quick solve of bug with interpolation 3DSurf<->3D using PointLocator.

Standardize behaviour of graphviz. When GRAPHVIZ_ROOT_DIR cmake var is NOT defined and that dot is in the path now it works.

Encourage users at most to use cartesian.

API modification (simplification) : MEDFileMesh::getGenMeshAtLevel -> MEDFileMesh::getMeshAtLevel.

Fix compilation issue with option MEDCOUPLING_USE_MPI.

Signed-off-by: Anthony Geay <anthony.geay@edf.fr>

Merge branch 'abn/tests_from_build'

Conflicts:
src/INTERP_KERNELTest/TestInterpKernelUtils.cxx
src/MEDLoader/Test/MEDLoaderTest.cxx
src/MEDLoader/Test/SauvLoaderTest.cxx
src/MEDPartitioner/Test/MEDPARTITIONERTest.cxx

Reduced version of INTERPKernel tests can be run in MICROMED mode.

Small fix.

Now deal with Cylindric, Spheric coordinates for UMesh, CLMesh, And only Cylindric for CMesh (MED file extension needed).

debug EDF11911. For serialkiller users having families on mesh lying both on cells and nodes.

Merge branch 'master' of ssh://git.salome-platform.org/tools/medcoupling

Tests are now all runnable from BUILD dir only with no install.

Overriding CMake sync process to push again bug fix

Windows compatibility

Test file management:
  + Splitting MEDCouplingBasicTest into 5 files
  + grouping dependent MEDLoader tests together
  + deactivating failing ParaMEDMEM test (will be fixed soon)