Merge from V7_2_BR 09/08/2013

Remove warning messages on resources when launching batch jobs

Remove distinction between batch managers ssh_batch and none

Fix Libbatch usage with CMake compilation

Remove test

Python containers are no more supported

CMake: minor fix to avoid detection of a package on the system in CONFIG mode.

define _DEBUG_

[CEA 900] Regression: on test glue_performance.py
Fix problem with missing env variable OMNIORB_USER_PATH.

test inexisting config fiele for error

filename for warning

CMake: Sphinx: simplifying Win32 command

sh->cfg convert procedure, no delete temporary generated .cfg

skip clean calls with ending ";" problem

skip cleandup in EnvFileConverter .sh

bug recursive history xml_parser

0022287: [CEA 912] Notebook: clicking on "update study" returns an error message

initialize myValue in constructor

Set VERSION variable.

22261: EDF 2698 SMESH: Memory leak when displaying 2D quadratic elements as arcs

+  typedef SALOME::GenericObj_wrap< UseCaseBuilder     > UseCaseBuilder_wrap;

22261: EDF 2698 SMESH: Memory leak when displaying 2D quadratic elements as arcs

Fix leaks of CORBA objects

CMake: documented FindPaco.cmake. New macro SALOME_ADD_MPI_TO_HDF5()
to overload HDF5 variables with MPI stuff when HDF5 was compiled parallel.

Enable KERNEL compilation with PACO

script update in order to take into account MED evolution and VISU module disappearance.

CMake: documenting FindMEDFile.cmake

because on Fedora, check error :
 /usr/bin/ld: /tmp/ccQHybYu.o: undefined reference to symbol 'MEDfileOpen'
usr/bin/ld: note: 'MEDfileOpen' is defined in DSO /data/tmplgls/salome/prerequis/install/FD18_64/med-dev/FROM_hdf5-1.8.10/lib/libmedC.so so try adding it to the linker command line
See http://comments.gmane.org/gmane.linux.redhat.fedora.devel/160632

CMake: minor: marking HDF5_DIR as advanced variable

CMake: bug fix in HDF5 detection. Making CONFIG mode and MODULE mode consistent:
both give out variables HDF5_LIBRARIES and HDF5_INCLUDE_DIRS

CMake: in CONFIG mode, adding NO_CMAKE_SYSTEM_PATH option to avoid looking into
system directories. See documentation of macro SALOME_FIND_PACKAGE().

CMake: fixes for MPI and PACO compilation

Killing autotools files.

CMake: set the flag Boost_NO_BOOST_CMAKE to avoid that the *standard* FindBoost.cmake
tries to do a find_package() in config mode ... man what were they having in mind
when they wrote this ...

CMake: added warning message when the reference variable passed to the macro
SALOME_FIND_PACKAGE_AND_DETECT_CONFLICTS() is not defined or empty.

Bug fix on path names

CMake: nicer error message (hinting to the ROOT_DIR variable) when a
package is not found.

Consider echo and unset keywords when parsing configuration files

CMake: re-activating the option to overload PYTHONPATH of Sphinx.

Fix bug with CMAKE_FIND_ROOT_PATH variable in FindOmniORBPy.cmake

Fix an error in killSalome.py

+FindSalomeMEDFile.cmake \
 FindSphinx.cmake \
-FindMEDFILE.cmake \
+FindMEDFile.cmake \

CMake: replacing CMAKE_* variables by PROJECT_* variables

CMake: MARK_AS_ADVANCED some advanced vars in CppUnit detection.

CMake: changed variable used for conflict detection: MEDFILE_INCLUDE_DIRS
which exists in both CONFIG and MODULE mode.

little bug

CMake: Adding DOCUTILS_ROOT_DIR and SETUPTOOLS_ROOT_DIR to the PYTHONPATH
when invoking the sphinx-build command.

0021708: [CEA 586] Object browser sort only children:
Add sorting function to the UseCaseBuilder CORBA interface to sort child data objects of the specified parent data object according to the specified sort order (ascending or descending).

Fixed MEDFile detection files installation. Provided the ability to override the PYTHONPATH for the run of SPHINX.
Exposed OMNIORBPY_PYTHONPATH giving the path to the Python modules for OmniORB.

Fix filenames of CMake modules

From Francis

MEDFile detection

addition of numpy

Improve CPPUNIT detection to avoid -ldl problem on link.

forgot to remove a line

BUG: KERNEL/CMake: Added missing lines and fixed some problems for omniorbpy configuration export

CMake: splitting OmniORB and OmniORBPy detection

CMake: bug fix: OmniORB detection: Python backend is detected by looking
for the file omniidl_be/python.py (was omniidl_be/__init__.py)

CMake: FIND_PACKAGE(CONFIG) is called with options to ignore
Windows registry and builds done with a Cmake GUI.
KERNEL config file now automatically import required dependent targets
(for example HDF5 targets, if HDF5 was used in CONFIG mode)

BUG: KERNEL/CMake: missing check_med3.m4 in the CMakeLists.txt

CMake: restoring FindKERNEL.cmake for compatibility with AutoTools

CoTech decision: move MEDWrapper from MED to SMESH

+  FindMEDFILE.cmake

CMake: renamed FindKERNEL.cmake into FindSalomeKERNEL.cmake

CMake: updated CMake procedure mainly to correctly expose targets needed by GUI.

CoTech decision: move MEDWrapper from MED to SMESH

move FindMEDFILE.cmake from MED to KERNEL

Roll back the previous modif

CoTech decision: move MEDWrapper from MED to SMESH

MED_CHECK_SIZEOF_MEDINT not needed

CoTech decision: move MEDWrapper from MED to SMESH

+check_med3.m4

Add PATHs passed via env vars to find on Linux

CMake: minor: renamed exported target group to ${PROJECT_NAME}targets.

0022232: [CEA 837] Memory corruption in GEOM/SMESH that leads to segfault on debian64

Initialize myModified in constructor

Remove my ugly fix after adrien's fix

CMake: Fixed bug at installation: directories should be set after
prerequisite detection to have the correct Python version string.

Change some flags from CXX to CPP because they are defined as the pre processor flags

Define the PYLOGLEVEL variable used in KERNEL_PY

Ugly fix to correctly define the python lib install path

Fix compilation issues using CMake new procedure

Fix autotools compilation error

BUG: CMake: master find macro was improperly using CMAKE_PREFIX_PATH

(was appending instead of overriding)

Fix make problem (with automake)

enable running without "APPLI" env var

CMake: tweaks for Win32 platform: configuration is successful

Removed old files

New CMake procedure.

** Here are the Git logs describing the change:
Renamed two flags to: SALOME_BUILD_TESTS and SALOME_BUILD_DOC
Versioning in root CMakeLists.txt
New prerequisite detection for: PThread, Python, HDF5, MPI and SWIG.
New prerequisite system for Sphinx, Doxygen, Graphviz, Boost.
Rewrote OmniORB find logic.
Rewrote LibBatch detection procedure.
Renaming functino to avoid name conflict with HDF5.
Fixed path detection for Graphiz and Doxygen. Added PTHREAD_LIBRARY where needed.
Removed SWIG warning: specifying lang in typemap is deprecated.
Rewrote FindCppUnit. Renamed flags.
Option WITHONLYLAUNCHER renamed to SALOME_LAUNCHER_ONLY. Not tested.
Added export logic.

Fix bug in OMNIORB_USER_PATH

Rename new launcher as "salome".
Use default value in os.getenv (fix bug for PYTHONPATH).
Introduce OMNIORB_USER_PATH variable.

Possibility to use HDF5 compiled with CMake (and with MPI support)

Fix bug to ensure compatibility with Python < 2.6

Remove display in console of information messages related to new salome.py launcher

Enable an old way to launch application, because salome.py script is missing.

Add CACHE keyword to put 'PYTHON_INCLUDE_DIR' and 'PYTHON_LIBRARY' variables into cache file.

aguerre and rnc : runSalome was missing in the Makefile.am and CmakeLists.txt file list and thus not installed. This prevented the other modules from detecting the KERNEL

Merge from BR_KERNEL_REFACTORING

Add missing include directory for CMake compilation.

Test of PARAVIS module has been added.

Fix regression with multi-node schemas on clusters with blaunch internal protocol

Minor fix for notebokk access

Correction of dumped string to initialize of NoteBook by a new instance of the study.

Fix regression in Launcher with ForEach-like batch jobs

Update documentation for 7.2.0

Fix cmake compilation problem.

Fix build with CMake - process nesting variables substitutions properly

Increment version to 7.2.0