Intersec bug fix: point not added properly inserted in splitting.

Intersect bug fix : quad point was not inserted in the map even when used as an extremity
for another seg.

Nasty one! Was OK on FED20, but not on more recent compilers.

Intersec bug fix: correct polygons with flat corners, they crash residual computation ...

also added test.

Conflicts:
src/MEDCoupling/MEDCouplingUMesh_intersection.cxx
src/MEDCoupling_Swig/MEDCouplingIntersectTest.py

Bug fix in compute residual: the stop condition is really on pol1Zip only.

We might end up with remaining boundary edges from pol2 (and that's OK)

Intersection : ComputeResidual -> some refactoring for readability

Conflicts:
src/INTERP_KERNEL/Geometric2D/InterpKernelGeo2DComposedEdge.cxx

Intersec bug fix: when intersecting nodes are merged, they were not properly
added on pol2.

Bug fix: seg seg intersector epsilon is to be taken absolutely for colinearity test:

+ even for very small vectors we don't want to have false positive on colinearity. So go back to a comparison with an angle.
+ removed spurious *2 in comparison
+ test IntersectionPointOnlyUnitarySegSeg precision was relaxed a bit

Intersection: renaming some variables and refactor to make the algo easier to read.

Conflicts:
src/INTERP_KERNEL/Geometric2D/InterpKernelGeo2DQuadraticPolygon.cxx
src/MEDCoupling/MEDCouplingUMesh_intersection.cxx

Rewrote _matrix in a more natural way in SegSegIntersetor

Bug fix: IsPolygonWellOriented() was not working properly QPLOYG

If the linearized version was self-intersecting, algo was faulty.

Bug fix : Edge::sortIdAbs() was merging points too agressively.

Intersec bug fix: ComputeResidual buggy for quad polyg with 2 edges.

Minor test fixes following backport.

[backport] minor bug fix

[Backport fix] : SWIG for convertDegeneratedCellsAndRemoveFlatOnes()

[backport] New functionality: colinearizeKeepingConform2D().

Fix to use v7 API.

SegSegIntersector fix: fix eps comparison to detect seg/seg overlap

Conflicts:
src/MEDCoupling_Swig/MEDCouplingIntersectTest.py

SegSegIntersector areOverlappedOrOnlyColinears() and areColinears() now aligned.

getArcDetectionPrecision() is no more needed.

Conflicts:
src/MEDCoupling/MEDCouplingUMesh_intersection.cxx

ArcCSegIntersector fix: more precise usage of machine epsilon.

New func: MEDCouplingUMesh::convertDegeneratedCellsAndRemoveFlatOnes

- does the same as convertDegeneratedCells() but also remove cells which are exactly flat according to their connectivity
- also improved convertDegeneratedCells()

ArcCSegIntersector fix: tangent cases were not properly handled.

[Backport from 8.5] Bug fix: SegSegIntersector::areColinears() was too tolerant.

(non homogeneous comparison of eps and quadratic term)

[Backport from 8.5] Bug fix: points located on the arc where wrongly detected by arc/arc intersector.

Backport from 8.5:

[43cbbcc0fc]: Bug fix in colinearize2D(): last seg not handled properly.
[305e7a338]:  Bug fix: Intersect2DMeshWith1DLine now correctly handling closed lines ...

Refactoring QuadraticPlanar precision tuning. Fixes intersector bugs.

+ Backport of bug fix in Intersect2DMeshWith1DLine (commit e12ff086a9)
+ Backport of commit 629c436ac5b1a (epsilon bug fix)
+ Backport of commit 62227e92 (epsilon refactoring)

MEDLoader bug fix. Detected by FLICA non regression tests.

Backport of BBox adjustment for 3D1D interpolation (PointLocator)

Minor: fixing test to use V7 API (was still using V8)

Remapper: added new P1P1 method: MappedBarycentric. See doc
for more infos.

Fix tests environment

Fix salome tests

Increment version: 7.8.0

Synchronize adm files

Windows compatibility

Doc fix.

Make PARMETIS and METIS partitioner mutually exclusive.

Otherwise they mix up in certain configurations.

Fix test to work with metis 5.1.0 (to be confirmed)

Tests: minor fixes:

+ Make MEDCOUPLING_WITH_FILE_EXAMPLES and MEDCOUPLING_BUILD_TESTS compatible.
+ Fix test MEDLoaderCouplingTrainingSession

Remapper: missing error message in InterpPlanar

Minor fix.

ParaMEDMEM: DisjointDEC

+ bug fix in copy ctor
+ new tests: both IDs and procs groups tested in constructor
+ added method to check group consistency.

All users free to choose whether to use XDR or not.

Default value is OFF when WIN32, ON otherwise.

Minor portability: Cygwin compiler seems to have _X as a standard symbol ...

Porting to metis 5.1

A useful method for global vars.

MEDCoupling has now a simple global map.

Make the medcoupling to VTK accessible from the outside. For MEDWriter.

Minor fix : CMake version 2.8.11 is sufficient for POSITION_INDEPENT_CODE flag

Added option MEDCOUPLING_BUILD_STATIC to build static libs.

Synchronize adm files

Fix problem with detection python libraries.

Synchronize adm files

Add missing license file

Synchronize adm files

Synchronize adm files

Bug linked with multi node field read in parallel. The first one was modifying the second one in context where field PartDef was a DataArrayPartDef.

Synchronize adm files

Bug correction EDF12533

Synchronize adm files

Copyright update: 2016

Synchronize adm files

Copyright update: 2016

Minor bug fix.

buildInnerBoundaryAlongM1Group(): bug fix for triangular/tetra mesh.

Synchronize adm files

Use "default" theme for Sphinx < 1.3

Conditional test37 and test38 depending on medfile version.

C++98 compatibility (remove C++11 staff)

Synchronize adm files

Synchronize adm files

Fix compilation with NumPy/SciPy.

Merge relevant changes from V8_0_0_BR branch

CMake: simplifying Python detection mechanism.

Doc fix and enhancement.

getWarpField(): documentation

getSkewField(): documentation.

Introduced check functions in MEDFileUMesh:

   + checkCoherency(),
   + checkSMESHCoherency()
   + and clearNodeAndCellNumbers()

Also added hasUniqueValues() in DataArrayInt

Merge branch 'V7_dev' of https://git.salome-platform.org/git/tools/medcoupling into V7_dev

Manual sync. from KERNEL.

Synchronize adm files

Bug fix: some missing CMake files at install

Merge branch 'master' into V7_dev - taking only stuff not for V8

A forgotten C++ test

Ensure sequential run of MEDLoader 1,2,3 tests.

MEDFile 3.2.0 porting to support CYL and SPHER.

Simple porting to medfile 3.2.0

Remove checkCoherency2.

MEDCouplingUMesh.tessellate2D - only one entry point now.

Merge branch 'master' of https://git.salome-platform.org/git/tools/medcoupling

Remove DataArrayInt::isIdentity-> DataArrayInt::isIdentity2 for everybody. Remove DataArrayInt::replaceOneValByInThis replaced by DataArrayInt::changeValue.

Script to perform automatic renaming should be installed.

Merge branch 'master' of ssh://git.salome-platform.org/tools/medcoupling

Conflicts:
v8_work/TODO.txt -- keeping Anthony's last word!

Covariance: last fixes.

Modif b4 apply.

Covariance: forgot the most important one deepCpy() !!

Fixing various C++ covariances mismatches in the API

    + MEDCouplingUMesh
        deepCpyConnectivityOnly
        mergeMyselfWithOnSameCoords
        buildPartOfMySelf
        buildPartOfMySelfNode
        buildPartOfMySelf2
        buildFacePartOfMySelfNode
        buildBoundaryMesh
        buildPartOfMySelfKeepCoords
        buildPartOfMySelfKeepCoords2
    + MEDCouplingExtrudedMesh
        deepCpy
    + MEDCouplingIMesh
        deepCpy

API renaming: preparation.

Synchronize adm files