Merge branch 'master' of ssh://git.salome-platform.org/tools/medcoupling

Synchronize adm files

Fix tests environment

Fix salome tests

Fix problem with detection python libraries.

Get relevant changes from V7_dev branch (copyright update, adm files etc)

Little refactoring for extractPart.

Useful extractPart method on MEDFileField series.

Bug correction EDF12533

Bug correction EDF12533

Merge branch 'V8_0_0_BR'

Minor bug fix.

buildInnerBoundaryAlongM1Group(): bug fix for triangular/tetra mesh.

Synchronize adm files

Use "default" theme for Sphinx < 1.3

C++98 compatibility (remove C++11 staff)

Windows compatibility

Charly is responsible of this modification :)

Bug linked with multi node field read in parallel. The first one was modifying the second one in context where field PartDef was a DataArrayPartDef.

getWarpField(): documentation

getSkewField(): documentation.

Minor doc fix about namespace and parallelism

Introduced check functions in MEDFileUMesh:

       + checkCoherency(),
       + checkSMESHCoherency()
       + and clearNodeAndCellNumbers()

Also added hasUniqueValues() in DataArrayInt

GlobalNodeIds in MEDReader in // context.

Charly is responsible of this modification :)

Bug linked with multi node field read in parallel. The first one was modifying the second one in context where field PartDef was a DataArrayPartDef.

Doc fix and enhancement.

getWarpField(): documentation

getSkewField(): documentation.

Minor doc fix about namespace and parallelism

Introduced check functions in MEDFileUMesh:

       + checkCoherency(),
       + checkSMESHCoherency()
       + and clearNodeAndCellNumbers()

Also added hasUniqueValues() in DataArrayInt

GlobalNodeIds in MEDReader in // context.

Increment version: 8.0.0

Fix bug: MEDCoupling_version.h file is not installed due to misprint.

Bug fix: some missing CMake files at install

Synchronize adm files

Merge branch 'V7_dev'

Conflicts:
cmake_files/SalomeMacros.cmake - staying aligned with master of KERNEL

Bug fix: some missing CMake files at install

Merge branch 'V8_0_0_BR'

Conflicts:
src/MEDLoader/Test/MEDLoaderTest.cxx - due to MEDLoader removal

Merge branch 'master' into V7_dev - taking only stuff not for V8

A forgotten C++ test

Sphinx portability

Synchronize adm files

Ensure sequential run of MEDLoader 1,2,3 tests.

Synchronize adm files

MEDCoupling API renaming - stage #3: documentation

+ Created a page about porting to 7 to 8
+ Fixed tutorial and various other places, mostly about
MEDLoader high level API

MEDCoupling API renaming - stage #2

   DataArray*::search -> DataArray*::findIdSequence
   DataArray*::substr -> DataArray*::subArray

MEDCoupling API change - stage #1

Automatic renaming through script medcoup7to8.py.
Following names have been changed:

Interpolation
-------------
    RevIntegral / IntensiveConservation
    ConservativeVolumic / IntensiveMaximum
    IntegralGlobConstraint / ExtensiveConservation
    Integral / ExtensiveMaximum

All classes
-----------
    deepCpy / deepCopy
    performCpy / performCopyOrIncrRef

Auto-pointeur
-------------
    MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr / MCAuto

MEDCouplingExtrudedMesh
-----------------------
    MEDCouplingExtrudedMesh / MEDCouplingMappedExtrudedMesh

MEDCouplingMesh
---------------
    getBarycenterAndOwner / computeCellCenterOfMass
    checkCoherency / checkConsistencyLight
    checkCoherency1 / checkConsistency

MEDCouplingPointSet
-------------------
    mergeNodes2 / mergeNodesCenter
    renumberNodes2 / renumberNodesCenter
    buildPartOfMySelf2 / buildPartOfMySelfSlice
    buildPartOfMySelfKeepCoords2 / buildPartOfMySelfKeepCoordsSlice
    deepCpyConnectivityOnly / deepCopyConnectivityOnly

MEDCoupling1DGTUMesh
--------------------
    checkCoherencyOfConnectivity / checkConsistencyOfConnectivity

MEDCouplingUMesh
----------------
    getMeshLength / getNodalConnectivityArrayLen
    AreCellsEqual0 / AreCellsEqualPolicy0
    AreCellsEqual1 / AreCellsEqualPolicy1
    AreCellsEqual2 / AreCellsEqualPolicy2
    AreCellsEqual7 / AreCellsEqualPolicy7
    AreCellsEqual3 / AreCellsEqualPolicy2NoType
    areCellsIncludedIn2 / areCellsIncludedInPolicy7
    setPartOfMySelf2 / setPartOfMySelfSlice
    ExtractFromIndexedArrays2 / ExtractFromIndexedArraysSlice
    SetPartOfIndexedArrays2 / SetPartOfIndexedArraysSlice
    SetPartOfIndexedArraysSameIdx2 / SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice
    deepCpyConnectivityOnly / deepCopyConnectivityOnly

DataArray
---------
    setContigPartOfSelectedValues2 / setContigPartOfSelectedValuesSlice
    selectByTupleId2 / selectByTupleIdSafe
    GetAxTypeRepr / GetAxisTypeRepr
    cpyFrom / deepCopyFrom

DataArrayInt
------------
    isIdentity2 / isIota
    selectByTupleId2 / selectByTupleIdSlice
    BuildOld2NewArrayFromSurjectiveFormat2 / ConvertIndexArrayToO2N

    getIdsEqual / findIdsEqual
    getIdsNotEqual / findIdsNotEqual
    getIdsEqualList / findIdsEqualList
    getIdsNotEqualList / findIdsNotEqualList
    getIdsEqualTuple / findIdsEqualTuple
    locateValue / findIdFirstEqual
    locateTuple / findIdFirstEqualTuple
    getIdsInRange / findIdsInRange
    getIdsNotInRange / findIdsNotInRange
    getIdsStrictlyNegative / findIdsStricltyNegative
    searchRangesInListOfIds / findIdsRangesInListOfIds

    computeOffsets2 / computeOffsetsFull

DataArrayDouble
---------------
    applyFunc2 / applyFuncCompo
    applyFunc3 / applyFuncNamedCompo

MEDCouplingFieldDouble
----------------------
    getIdsInRange / findIdsInRange
    fillFromAnalytic2 / fillFromAnalyticCompo
    fillFromAnalytic3 / fillFromAnalyticNamedCompo
    applyFunc2 / applyFuncCompo
    applyFunc3 / applyFuncNamedCompo
    mergeNodes2 / mergeNodesCenter

MEDFileMesh
-----------
    setAxType / setAxisType
    getAxType / getAxisType

API rename #1: preparing script and updating TODO

End of namespace modif.

Ensure sequential run of MEDLoader 1,2,3 tests.

7th step - Update doc.

6th step : Remove the additional MEDLoader level from MEDLoader.

5th step

4th step

3rd step.

2nd step.

A forgotten C++ test

First step of ParaMEDMEM -> MEDCoupling

MEDFile 3.2.0 porting to support CYL and SPHER.

Simple porting to medfile 3.2.0

Remove checkCoherency2.

MEDCouplingUMesh.tessellate2D - only one entry point now.

Merge branch 'master' of https://git.salome-platform.org/git/tools/medcoupling

Remove DataArrayInt::isIdentity-> DataArrayInt::isIdentity2 for everybody. Remove DataArrayInt::replaceOneValByInThis replaced by DataArrayInt::changeValue.

Script to perform automatic renaming should be installed.

Merge branch 'master' of ssh://git.salome-platform.org/tools/medcoupling

Conflicts:
v8_work/TODO.txt -- keeping Anthony's last word!

Covariance: last fixes.

Modif b4 apply.

Covariance: forgot the most important one deepCpy() !!

Fixing various C++ covariances mismatches in the API

    + MEDCouplingUMesh
        deepCpyConnectivityOnly
        mergeMyselfWithOnSameCoords
        buildPartOfMySelf
        buildPartOfMySelfNode
        buildPartOfMySelf2
        buildFacePartOfMySelfNode
        buildBoundaryMesh
        buildPartOfMySelfKeepCoords
        buildPartOfMySelfKeepCoords2
    + MEDCouplingExtrudedMesh
        deepCpy
    + MEDCouplingIMesh
        deepCpy

API renaming: preparation.

Synchronize adm files

Merge branch 'V8_0_BR'

Quick Sphinx 1.2 porting

Synchronize adm files

Fix possible problem with enclosed reloading of targets from SALOME modules

Generalization of some Fam/grp methods from MEDFileUMesh->MEDFileMesh.

Documentation buildExtrudedMesh()

One more test.

3D2D -> 2D3D to ease readability.

Compile interp_kerneltests only if asked.

Quick solve of bug with interpolation 3DSurf<->3D using PointLocator.

Standardize behaviour of graphviz. When GRAPHVIZ_ROOT_DIR cmake var is NOT defined and that dot is in the path now it works.

Encourage users at most to use cartesian.

API modification (simplification) : MEDFileMesh::getGenMeshAtLevel -> MEDFileMesh::getMeshAtLevel.

Fix compilation issue with option MEDCOUPLING_USE_MPI.

Signed-off-by: Anthony Geay <anthony.geay@edf.fr>

Merge branch 'abn/tests_from_build'

Conflicts:
src/INTERP_KERNELTest/TestInterpKernelUtils.cxx
src/MEDLoader/Test/MEDLoaderTest.cxx
src/MEDLoader/Test/SauvLoaderTest.cxx
src/MEDPartitioner/Test/MEDPARTITIONERTest.cxx

Reduced version of INTERPKernel tests can be run in MICROMED mode.

Small fix.

Now deal with Cylindric, Spheric coordinates for UMesh, CLMesh, And only Cylindric for CMesh (MED file extension needed).

debug EDF11911. For serialkiller users having families on mesh lying both on cells and nodes.

Merge branch 'master' of ssh://git.salome-platform.org/tools/medcoupling

Tests are now all runnable from BUILD dir only with no install.

Overriding CMake sync process to push again bug fix

Windows compatibility

Test file management:
  + Splitting MEDCouplingBasicTest into 5 files
  + grouping dependent MEDLoader tests together
  + deactivating failing ParaMEDMEM test (will be fixed soon)

Doc: Triangulation instead of Triangle in interp doc.
Thanks Christophe.

Bug correction on computeOffsets2 for empty arrayint. Shame on me \!

Synchronize adm files