0021196: [CEA 456] Integration and merge modification for debian packages

  roll back kernel-install-without-docs.patch

fix "Replacing smeshDC by smesh"
   make temporary smesh.py in the current dir to avoid overwriting
   smesh.py when building in SMESH_SRC

fix "Replacing smeshDC by smesh"
1) make global functions of class smeshDC only, class Mesh and others remain untouched
2) make temporary smesh.py in the current dir to avoid overwriting
   smesh.py when building in SMESH_SRC

0021196: [CEA 456] Integration and merge modification for debian packages

smesh-install-python.patch
  This patch helps to install Python packages in the dedicated Python path

0021196: [CEA 456] Integration and merge modification for debian packages

smesh-fix-clean.patch
  This patch is for cleaning completely the build directory

0021196: [CEA 456] Integration and merge modification for debian packages

smesh-fix-clean.patch
  This patch is for cleaning completely the build directory

smesh-install-without-docs.patch
  We think that building and installing the documentation should not
  be the default behavior but reserved to interested users

Merge from PHASE_25_BR 09/12/2010

0020749: EDF 1291 SMESH : Create 2D Mesh from 3D improvement
    wrap MakeBoundaryMesh()

0020749: EDF 1291 SMESH : Create 2D Mesh from 3D improvement
    fix type of created group and python dump

0020742: EDF 1270 SMESH : Delete Group with contents and remove Orphan Nodes
Additional change: move "Remove Groups" menu item to the Modification/Remove submenu

+  // Try to associate by common vertices of an edge
+ ...

-  //delete myDlg;
+  //delete myDlg; since WA_DeleteOnClose==true

untabify

0021087: EDF 1673 GEOM: Start and End length hypotheses don't always match edges orientation
   Make orientation FORWARD to show direction of 3D curve

Merge from V5_1_5_BR branch 26/11/2010

0021086: EDF 1686 GEOM: Bad triangle in a BLSURF + GHS3D mesh after converting to quadratic
    Store the fixed node position in the node

+  bool toCheckPosOnShape(int shapeID ) const;
+  void setPosOnShapeValidity(int shapeID, bool ok ) const;

0021084: EDF 1696 SMESH: Convert to quadratic generates contorted triangles
  Bend links of triangles iff a boundary link is bent towards inside of a QFace

Merge from V5_1_5_BR 23/11/2010

020716: EDF 1229 SMESH : Improvement of reversed edges dialog box
   add geom filters

0020946: EDF 1466 SMESH: Add a new control criteria: Max element length
Rename "Max Element LEngth 2D/3D" control to "Element Diameter 2D/3D"

020716: EDF 1229 SMESH : Improvement of reversed edges dialog box
   convert reversedEdges into indices

020716: EDF 1229 SMESH : Improvement of reversed edges dialog box
  fix taking into account ( reversing edges + hyp propagation )

untabify

Fix complilation problem on Mandriva 2010 (gcc 4.4)

0021077: EDF 1695 SMESH: Netgen works bad with 1D hypothesis on an elliptic torus
  Make propagation work w/o any hypotheses assigned to edges where an
  1D hypothesis is propagated to.

improve code readability

-//  $Header:

0021074: EDF 1682 MESH: Bug with start and end length hypothesis
  fix compensateError()

Merge from PHASE_25_BR 14/11/2010

Merge from BR_WIN_INDUS_514 13/11/2010

Merge from V5_1_5_BR branch 12/11/2010

0021058: EDF 1674 SMESH: SetTriangleVertex ends in error with strange message
   prevent problems with TopAbs_INTERNAL shapes

Length GUI: replaced slider by SMESHGUI_SpinBox. Previously the value was unknown until study was dumped.

Merge from BR_WIN_INDUS_514 04/10/2010

0020889: EDF 1433 SMESH: SplitHexaToTetra: add the 24 tetras mode
 * Add HEXA_TO_24 splitting mode

+</ol>

0020889: EDF 1433 SMESH: SplitHexaToTetra: add the 24 tetras mode
 * Add HEXA_TO_24 splitting mode

0020889: EDF 1433 SMESH: SplitHexaToTetra: add the 24 tetras mode
 * Add Hex_24Tet splitting mode

0020889: EDF 1433 SMESH: SplitHexaToTetra: add the 24 tetras mode

void SMESH_MeshEditor_i::SplitVolumesIntoTetra (SMESH::SMESH_IDSource_ptr elems,
                                                CORBA::Short              methodFlags)
  throw (SALOME::SALOME_Exception)
{
  Unexpect aCatch(SALOME_SalomeException);

+  initData();

+  SMDS_MeshFace* AddPolygonalFace (const std::vector<const SMDS_MeshNode*>& nodes,
+  SMDS_MeshVolume* AddPolyhedralVolume (const std::vector<const SMDS_MeshNode*>& nodes,

0020889: EDF 1433 SMESH: SplitHexaToTetra: add the 24 tetras mode
 * Add HEXA_TO_24 splitting mode
 * Fix ConvertToQuadratic() to avoid disappearance of poly elements

Do not pass vector arguments by value

0020889: EDF 1433 SMESH: SplitHexaToTetra: add the 24 tetras mode
 * Fix IsLinked()
 * Add GetFaceBaryCenter():

Fix configure problem (caused by previous integration).
AC_PROG_MKDIR_P is not available for autoconf 2.59 (Debian Sarge, Mandriva 2006)

inline TCollection_AsciiString ElementTypeString (SMESH::ElementType theElemType)
{
...
+    CASE2STRING( ELEM0D );

Patch for the generation of the documentation

0021015: EDF 1578 SMESH: Free nodes are removed when translating a mesh
 * Pass empty set of elements if the whole mesh is to be transformed
 * Fix incorrect treatment of groups of nodes
 * Call SMESH_MeshEditor::Transform() from Scale*()

0021015: EDF 1578 SMESH: Free nodes are removed when translating a mesh
 * Treate orphan nodes in Transform()
 * Remove Scale() as being a paricular case of Transform()

-            theObject = self.editor.MakeIDSource(theObject)
+            theObject = self.editor.MakeIDSource(theObject, SMESH.ALL)

improve comment for Scale

0021016: [CEA] non regression test KO
  Implement
      SMDS_ElemIteratorPtr Q2TAdaptor_Triangle::elementsIterator(SMDSAbs_ElementType type) const

0021012: [CEA] Different names between GUI and TUI function

-#include "SMDS_FaceOfNodes.hxx"

0021006: EDF 1546 SMESH : Convert To Quadratic fails

+  const SMDS_MeshNode* getMediumNodeOnComposedWire(const SMDS_MeshNode* n1,
+                                                   const SMDS_MeshNode* n2,
+                                                   bool                 force3d);

RNC: Completed the documentation of GetElementsByType with the values taken by ElementType

Merge from BR_pypkg (python packaging)

RNC: Fixed documentation of SetGeometricMesh
Parameter theGeometricMesh takes the value 0 or 1

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
   One more redesign

Remove unused method

-  bool emptyInverseElements();

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

Improve dialog box's layout

Remove compilation warning

EDF 1575 SMESH: Filters and precision preferences

Fix crash in Length2D::GetValues() and MultiConnection2D::GetValues() methods.

Hack libtool (!) to workaround problem with wrong linkage of native libraries

issue 0020959: HEXA_3D fails on shell
   Fix DependsOn() for a not-closed SHELL not in SOLID

0020986: EDF 1557 SMESH: Convert to quadratic with medium node on geometry fails on a GHS3D mesh
   Optimize FixQuadraticElements()

0020996: EDF 1549 SMESH: Projection 1D/2D algorithms fail
   implement FindFaceAssociation() by UV correspondence which is used
   in case if correspondent vertices belong to inner wires

GDD:
- fix documentation of ConvertToQuadratic (inform about theForce3d parameter)
- New function PrintDoubleValue added in PluginUtils

0020996: EDF 1549 SMESH: Projection 1D/2D algorithms fail
   Fix FindFaceAssociation():
     1) exit from loop on outer_wire_algo as soon as solution is found
     2) treat edges of inner wires

Correct name of an argument

   static int GetOrderedEdges (const TopoDS_Face&        theFace,
                               TopoDS_Vertex             theFirstVertex,
                               std::list< TopoDS_Edge >& theEdges,
-                              std::list< int >  &       theNbVertexInWires,
+                              std::list< int >  &       theNbEdgesInWires,
                               const bool                theShapeAnalysisAlgo=false);

Issue 0020226: [CEA 329] Invalid glyphs position in vector fields on polyhedrons cell.

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
-    if ( !subMeshId )
+    if ( !subMeshId && ! _impl->GetMeshDS()->IsGroupOfSubShapes( myLocSubShape ))
       THROW_SALOME_CORBA_EXCEPTION("not sub-shape of the main shape", SALOME::BAD_PARAM);

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
   Fix fillAncestorsMap(theShape) for the case if a sub-shape of
   theShape is not in _mapAncestors

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
    Move all checks of shape validity from AddCompoundSubmesh() to IsGroupOfSubShapes()

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids

   bool IsLinked (const SMDS_MeshNode* theNode1,
                  const SMDS_MeshNode* theNode2,
+                 const bool           theIgnoreMediumNodes=false) const;
   // Return true if theNode1 is linked with theNode2.
+  // If theIgnoreMediumNodes then corner nodes of quadratic cell are considered linked as well

0020982: EDF 1547 SMESH: Creation of non-conformal quadratic pyramids
   Replace VTK_CONVEX_POINT_SET with VTK_QUADRATIC_PYRAMID

0020983: EDF 1569 SMESH: Numbering Display Elements with several groups selected does not work

indentation

0020876: EDF 1246 SMESH: DoubleNodes fonctions available in the GUI
  Add an argument to DoubleNodeXXX() creating groups

0020876: EDF 1246 SMESH: DoubleNodes fonctions available in the GUI
  No need in new commands in smeshDC.py, so DoubleNodeXXXNew() is replaced by DoubleNodeXXX()

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

     ## Finds groups of ajacent nodes within Tolerance.
     #  @param Tolerance the value of tolerance
     #  @param SubMeshOrGroup SubMesh or Group
+    #  @param exceptNodes list of either SubMeshes, Groups or node IDs to exclude from search
     #  @return the list of groups of nodes
     #  @ingroup l2_modif_trsf
-    def FindCoincidentNodesOnPart (self, SubMeshOrGroup, Tolerance):
+    def FindCoincidentNodesOnPart (self, SubMeshOrGroup, Tolerance, exceptNodes=[]):

Use TIDSortedNodeSet instead of set< const SMDS_MeshNode*> when looking for coincident nodes

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

+  /*!
+   * Returns types of elements it contains
+   */
+  virtual SMESH::array_of_ElementType* GetTypes();

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

+    TPythonDump&
+    operator<<(const SMESH::ListOfIDSources& theList);
+

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

+  // set "FindCoincidentNodesOnPart()" instead of "FindCoincidentNodesOnPartBut()"
+  if ( !isPyMeshMethod && method == "FindCoincidentNodesOnPartBut")
+  {
+    isPyMeshMethod=true;
+    theCommand->SetMethod("FindCoincidentNodesOnPart");
+  }

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

interface SMESH_MeshEditor
{
-    SMESH_IDSource MakeIDSource(in long_array IDsOfElements);
+    SMESH_IDSource MakeIDSource(in long_array IDsOfElements, in ElementType type);

+    void FindCoincidentNodesOnPartBut (in  SMESH_IDSource      SubMeshOrGroup,
+                                       in  double              Tolerance,
+                                       out array_of_long_array GroupsOfNodes,
+                                       in  ListOfIDSources     ExceptSubMeshOrGroups);
+

0020746: EDF 1274 SMESH : MergeAllNodesButNodesFromGroup feature

-    SMESH_IDSource MakeIDSource(in long_array IDsOfElements);
+    SMESH_IDSource MakeIDSource(in long_array IDsOfElements, in ElementType type);

+    void FindCoincidentNodesOnPartBut (in  SMESH_IDSource      SubMeshOrGroup,
+                                       in  double              Tolerance,
+                                       out array_of_long_array GroupsOfNodes,
+                                       in  ListOfIDSources     ExceptSubMeshOrGroups);
+

+  interface SMESH_IDSource;
+  typedef sequence<SMESH_IDSource> ListOfIDSources;

+  typedef sequence<ElementType> array_of_ElementType ;

  interface SMESH_IDSource
  {
+
+    /*!
+     * Returns types of elements it contains
+     */
+    array_of_ElementType GetTypes();
   };

rename SMESHGUI_EditMeshDlg to SMESHGUI_MergeDlg

Use TIDSortedNodeSet instead of set< const SMDS_MeshNode*> when looking for coincident nodes

+typedef std::set< const SMDS_MeshNode*,    TIDCompare >      TIDSortedNodeSet;

WinTC5.1.4: Application crash after open Linux study

0020082: EDF 869 GEOM : Edges Orientation indicator/reverse

GDD: Some mispell corrections

use linked nodes to get an upward direction when defining orientation

0020968: EDF1545 SMESH: Problem in de creation of a mesh group on geometry
   Detect not computed sub-shapes in case if algo computes many
   submeshes at once

0020963: EDF 1528 SMESH: How to combine Netgen1D2D with sizemap with Quadrangle(Mapping) ?

-              sm->ComputeStateEngine(SMESH_subMesh::COMPUTE);
+              _gen->Compute( theMesh, _mainEdge, /*anUpward=*/true);

sm->ComputeStateEngine() fails if vertices it depends on are not yet created

improve comment

 bool SMESH_HypoFilter::IsMoreLocalThanPredicate::IsOk(const SMESH_Hypothesis* aHyp,
                                                       const TopoDS_Shape&     aShape) const
 {
+  // issue 0020963
+  // if aShape is COMPOUND (i.e. most probably a GEOM group) then
+  // it is more local if it contains shapes of less dimension than _shapeType
+  ...

0020959: EDF 1531: HEXA_3D fails on shell

in DependsOn(), do not make a sub-mesh of a not closed SHELL