]> SALOME platform Git repositories - plugins/netgenplugin.git/commitdiff
Salome HOME
Adapt Netgen 5.3.1 patch for usage with Open CASCADE Technology 7.2
authorvsr <vsr@opencascade.com>
Wed, 27 Sep 2017 11:13:18 +0000 (14:13 +0300)
committervsr <vsr@opencascade.com>
Wed, 27 Sep 2017 11:13:18 +0000 (14:13 +0300)
src/NETGEN/ReadMeForNgUsers
src/NETGEN/netgen49ForSalome.patch [deleted file]
src/NETGEN/netgen50ForSalome.patch [deleted file]
src/NETGEN/netgen53ForSalome.patch
src/NETGEN/netgen_copy_include_for_salome

index 85d4f3f9084bb6e1fd3ca0b87e8f29bddbf04df5..b123658ff1dd7a84ad02ba4010df4be4cd193f3d 100644 (file)
@@ -1,48 +1,63 @@
 # ------------------------------------------------------------------
+# Notes about usage of Netgen with SALOME
 # ------------------------------------------------------------------
-# Notes for Netgen >= 4.9.13
-# ------------------------------------------------------------------
-# ------------------------------------------------------------------
 
-Netgen home page: http://sourceforge.net/apps/mediawiki/netgen-mesher.
+-------------------
+1. Netgen home page
+-------------------
+
+Netgen mesher's home page is: https://sourceforge.net/projects/netgen-mesher/.
+
+-----------------------
+2. Minimal requirements
+-----------------------
+
+Minimal version of Netgen required for SALOME is 5.3.1.
 
-1. Minimal requirements
+----------------------------------------
+3. Build Netgen for SALOME NETGEN Plugin
+----------------------------------------
 
-Minimal version of Netgen required for SALOME is 4.9.13.
+3.1. Download Netgen archive (here netgen-5.3.1.tar.gz) from the project's site:
 
-2. How to build Netgen for SALOME NETGEN Plugin
------------------------------------------
+       $ wget https://vorboss.dl.sourceforge.net/project/netgen-mesher/netgen-mesher/5.3/netgen-5.3.1.tar.gz
 
-2.1. Download Netgen archive (here netgen-4.9.13.tar.gz) and unpack it
+3.2. Unpack an archive:
 
-2.2. Patch the Netgen distribution for SALOME
+       $ tar xfz netgen-5.3.1.tar.gz
 
-       $ cd netgen45
-       $ patch -p1 < patch_directory/netgen49ForSalome.patch
+3.3. Patch the Netgen distribution for SALOME
 
-     Note that patch corresponds to the version of Netgen you use.
-     For example, netgen49ForSalome.patch mentioned above is a patch
-     file for Netgen 4.9.13. The patch for Netgen can be found in
-     NETGENPLUGIN_SRC/src/NETGEN directory.
+       $ cd netgen-5.3.1
+       $ patch -p1 < /path/to/netgenplugin_src_dir/src/NETGEN/netgen53ForSalome.patch
 
-2.3. Configure the netgen compilation. For example
+     Here, "/path/to/netgenplugin_src_dir" is a path to NETGENPLUGIN source directory.
+     This is the same directory where this Readme file is located.
+     Netgen plugin sources can be retrieved from the Git repository:
+     
+       $ git clone http://git.salome-platform.org/gitpub/plugins/netgenplugin.git
 
-       $ cd netgen-4.9.13
-       $ ./configure --prefix=THE_INSTALLATION_PATH \
-         --with-occ=${CASROOT} \
+3.4. Configure the netgen compilation:
+
+       $ cd netgen-5.3.1
+       $ ./configure --prefix=/path/to/the/installation/directory \
+         --with-occ=${CAS_ROOT_DIR} \
          --with-tcl=${TCLHOME}/lib --with-tk=${TCLHOME}/lib \
          --with-tclinclude=${TCLHOME}/include
 
-     Note that Netgen depends on some products like Open CASCADE
-     Technology and Tcl/Tk. These products should be specified
-     to the configure script via options.
+     Note: Netgen depends on some products like Open CASCADE Technology and Tcl/Tk.
+     These products should be specified to the configure script via options.
+
+3.5. Compile and install netgen mesher:
+
+        $ make install
+
+3.6. Patch the installation directory by copying header files
+     needed by NETGEN Plugin. For this purpose you can use the script
+     /path/to/netgenplugin_src_dir/src/NETGEN/netgen_copy_include_for_salome.
 
-2.4. Compile the netgen product
-       $ make 
-       $ make install
+        $ /path/to/netgenplugin_src_dir/src/NETGEN/netgen_copy_include_for_salome \
+         . /path/to/the/installation/directory
 
-2.5. Patch the installation directory by copying include files
-     needed by NETGEN Plugin. Use the script
-     NETGENPLUGIN_SRC/src/NETGEN/netgen_copy_include_for_salome
-     to achieve that. The first argument is the directory containing
-     the Netgen sources. The second argument is THE_INSTALLATION_PATH
+     The first argument is the directory containing the Netgen sources.
+     The second argument is the installation directory of Netgen mesher.
diff --git a/src/NETGEN/netgen49ForSalome.patch b/src/NETGEN/netgen49ForSalome.patch
deleted file mode 100755 (executable)
index 022bd21..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,1121 +0,0 @@
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp netgen-4.9.13_new/libsrc/meshing/meshtype.cpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp     2009-09-13 14:28:38.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/meshing/meshtype.cpp      2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -1,4 +1,5 @@
- #include <mystdlib.h>
-+#include <float.h> // to get DBL_MIN defined
- #include "meshing.hpp"  
-@@ -650,7 +651,8 @@
-         double det = trans.Det();
--        if (det <= 0)
-+        // if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           err += frob * frob / det;
-@@ -706,7 +708,8 @@
-             double det = trans(0,0)*trans(1,1)-trans(1,0)*trans(0,1);
--            if (det <= 0)
-+            // if (det <= 0)
-+            if (det <= DBL_MIN)  // avoid FPE
-               {
-                 dd = 0;
-                 return 1e12;
-@@ -790,7 +793,8 @@
-           = dtrans(0,0) * trans(1,1) - trans(0,1) * dtrans(1,0)
-           + trans(0,0) * dtrans(1,1) - dtrans(0,1) * trans(1,0);
--        if (det <= 0)
-+        // if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           {
-@@ -840,7 +844,8 @@
-         frob /= 2;
-         double det = trans.Det();
--        if (det <= 0)
-+        //if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           err += frob * frob / det;
-@@ -1857,7 +1862,8 @@
-       case PYRAMID:
-         {
-           double noz = 1-p(2);
--          if (noz == 0.0) noz = 1e-10;
-+          //if (noz == 0.0) noz = 1e-10;
-+          if (noz <= DBL_MIN) noz = 1e-10; // avoid FPE
-           double xi  = p(0) / noz;
-           double eta = p(1) / noz;
-@@ -2035,7 +2041,8 @@
-         double det = -trans.Det();
-       
--        if (det <= 0)
-+        //if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           err += frob * frob * frob / det;
-@@ -2107,7 +2114,8 @@
-         ddet *= -1;
-       
--        if (det <= 0)
-+        //if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           {
-@@ -2189,7 +2197,7 @@
-       
-         det *= -1;
-       
--        if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN)
-           err += 1e12;
-         else
-           {
-@@ -2522,10 +2530,10 @@
-   MeshingParameters :: MeshingParameters ()
-   {
--    optimize3d = "cmdmustm";
-+    optimize3d = (char*)"cmdmustm"; // optimize3d = "cmdmustm";
-     //optimize3d = "cmdmstm";
-     optsteps3d = 3;
--    optimize2d = "smsmsmSmSmSm";
-+    optimize2d = (char*)"smsmsmSmSmSm"; // optimize2d = "smsmsmSmSmSm";
-     optsteps2d = 3;
-     opterrpow = 2;
-     blockfill = 1;
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp netgen-4.9.13_new/libsrc/meshing/meshtype.hpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp     2009-11-09 13:50:43.000000000 +0300
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/meshing/meshtype.hpp      2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -12,6 +12,7 @@
-     Classes for NETGEN
- */
-+class Mesh; // added due to compilation errors on some platforms
- enum ELEMENT_TYPE { 
-   SEGMENT = 1, SEGMENT3 = 2,
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/meshing/smoothing2.cpp netgen-4.9.13_new/libsrc/meshing/smoothing2.cpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/meshing/smoothing2.cpp   2009-11-09 13:47:09.000000000 +0300
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/meshing/smoothing2.cpp    2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -302,7 +302,8 @@
-     vgrad = 0;
-     badness = 0;
--    meshthis -> GetNormalVector (surfi, sp1, gi1, n);
-+    //normal already computed: meshthis -> GetNormalVector (surfi, sp1, gi1, n);
-+    n = normal;
-     pp1 = sp1 + x(0) * t1 + x(1) * t2;
-     //  meshthis -> ProjectPoint (surfi, pp1);
-@@ -360,7 +361,8 @@
-     vgrad = 0;
-     badness = 0;
--    meshthis -> GetNormalVector (surfi, sp1, gi1, n);
-+    //normal already computed: meshthis -> GetNormalVector (surfi, sp1, gi1, n);
-+    n = normal;
-     pp1 = sp1 + x(0) * t1 + x(1) * t2;
-@@ -514,7 +516,8 @@
-     vgrad = 0;
-     badness = 0;
--    meshthis -> GetNormalVector (surfi, sp1, gi1, n);
-+    //normal already computed: meshthis -> GetNormalVector (surfi, sp1, gi1, n);
-+    n = normal;
-     pp1 = sp1 + x(0) * t1 + x(1) * t2;
-@@ -586,7 +589,8 @@
-     vgrad = 0;
-     badness = 0;
--    meshthis -> GetNormalVector (surfi, sp1, gi1, n);
-+    //normal already computed: meshthis -> GetNormalVector (surfi, sp1, gi1, n);
-+    n = normal;
-     // pp1 = sp1;
-     //    pp1.Add2 (x.Get(1), t1, x.Get(2), t2);
-@@ -973,7 +977,7 @@
-               {
-                 mesh[pi] = Point<3> (origp);
-               }
--          
-+            break; // exit as <fact> is not used anymore
-           }
-       }
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occconstruction.cpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp  2009-08-24 06:32:47.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occconstruction.cpp   2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -28,7 +28,7 @@
- #include <BRepAlgoAPI_Common.hxx>
- #include <BRepAlgoAPI_Fuse.hxx>
- #include <BRepAlgoAPI_Section.hxx>
--#include <BRepOffsetAPI_Sewing.hxx>
-+//#include <BRepOffsetAPI_Sewing.hxx>
- //#include <BRepAlgo_Sewing.hxx>
- #include <BRepOffsetAPI_MakeOffsetShape.hxx>
- #include <ShapeFix_Shape.hxx>
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occgenmesh.cpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp       2010-03-16 09:30:07.000000000 +0300
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occgenmesh.cpp        2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -15,6 +15,8 @@
- #define DIVIDEEDGESECTIONS 1000
- #define IGNORECURVELENGTH 1e-4
-+// a small value used to avoid FPE
-+#define VSMALL 1e-10
-    bool merge_solids = 1;
-@@ -26,7 +28,8 @@
-       double nq = n*q;
-       Point<3> p = p0 + 0.5*n;
--      double lambda = (p-l.p0)*n / nq;
-+      // double lambda = (p-l.p0)*n / nq;  -- avoid FPE
-+      double lambda = (fabs(nq) > 1e-10) ? (p-l.p0)*n / nq : -1;
-       if (lambda >= 0 && lambda <= 1)
-       {
-@@ -54,6 +57,8 @@
-+   
-+   static // useless out of this file
-    double ComputeH (double kappa)
-    {
-       double hret;
-@@ -62,7 +67,8 @@
-       if (mparam.maxh * kappa < 1)
-          hret = mparam.maxh;
-       else
--         hret = 1 / kappa;
-+        // hret = 1 / kappa; -- avoid FPE
-+        hret = 1 / (kappa + VSMALL);
-       if (mparam.maxh < hret)
-          hret = mparam.maxh;
-@@ -71,8 +77,7 @@
-    }
--
--
-+   static // useless out of this file
-    void RestrictHTriangle (gp_Pnt2d & par0, gp_Pnt2d & par1, gp_Pnt2d & par2,
-                            BRepLProp_SLProps * prop, Mesh & mesh, int depth, double h = 0)
-    {
-@@ -168,8 +173,8 @@
-          if(h < 1e-4*maxside)
-             return;
--
--         if (h > 30) return;
-+         // commented to restrict H on a large sphere for example
-+         //if (h > 30) return;
-       }
-       if (h < maxside && depth < 10)
-@@ -228,6 +233,7 @@
-+   static // useless out of this file
-    void DivideEdge (TopoDS_Edge & edge, Array<MeshPoint> & ps,
-                     Array<double> & params, Mesh & mesh)
-    {
-@@ -247,8 +253,8 @@
-       hvalue[0] = 0;
-       pnt = c->Value(s0);
--      double olddist = 0;
--      double dist = 0;
-+      //double olddist = 0; -- useless variables
-+      //double dist = 0;
-       int tmpVal = (int)(DIVIDEEDGESECTIONS);
-@@ -256,15 +262,19 @@
-       {
-          oldpnt = pnt;
-          pnt = c->Value(s0+(i/double(DIVIDEEDGESECTIONS))*(s1-s0));
-+         // -- no more than 1 segment per <edge length>/DIVIDEEDGESECTIONS
-          hvalue[i] = hvalue[i-1] +
--            1.0/mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()))*
--            pnt.Distance(oldpnt);
-+         //   1.0/mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()))*
-+         //   pnt.Distance(oldpnt);
-+           min( 1.0,
-+                1.0/mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()))*
-+                pnt.Distance(oldpnt));
-          //(*testout) << "mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z())) " << mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()))
-          //      <<  " pnt.Distance(oldpnt) " << pnt.Distance(oldpnt) << endl;
--         olddist = dist;
--         dist = pnt.Distance(oldpnt);
-+         //olddist = dist; -- useless variables
-+         //dist = pnt.Distance(oldpnt);
-       }
-       //  nsubedges = int(ceil(hvalue[DIVIDEEDGESECTIONS]));
-@@ -279,7 +289,10 @@
-       {
-          if (hvalue[i1]/hvalue[DIVIDEEDGESECTIONS]*nsubedges >= i)
-          {
--            params[i] = s0+(i1/double(DIVIDEEDGESECTIONS))*(s1-s0);
-+            // -- for nsubedges comparable to DIVIDEEDGESECTIONS
-+            //params[i] = s0+(i1/double(DIVIDEEDGESECTIONS))*(s1-s0);
-+            double d1 = i1 - (hvalue[i1] - i*hvalue[DIVIDEEDGESECTIONS]/nsubedges)/(hvalue[i1]-hvalue[i1-1]);
-+            params[i] = s0+(d1/double(DIVIDEEDGESECTIONS))*(s1-s0);
-             pnt = c->Value(params[i]);
-             ps[i-1] = MeshPoint (Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()));
-             i++;
-@@ -323,6 +336,9 @@
-       (*testout) << "nedges = " << nedges << endl;
-       double eps = 1e-6 * geom.GetBoundingBox().Diam();
-+      const double eps2 = eps * eps; // -- small optimization
-+
-+      int first_vp = mesh.GetNP()+1; // -- to support SALOME sub-meshes
-       for (int i = 1; i <= nvertices; i++)
-       {
-@@ -332,7 +348,8 @@
-          bool exists = 0;
-          if (merge_solids)
-             for (PointIndex pi = 1; pi <= mesh.GetNP(); pi++)
--               if ( Dist2 (mesh[pi], Point<3>(mp)) < eps*eps)
-+               //if ( Dist2 (mesh[pi], Point<3>(mp)) < eps*eps)              
-+               if ( Dist2 (mesh[pi], Point<3>(mp)) < eps2 ) // -- small optimization
-                {
-                   exists = 1;
-                   break;
-@@ -362,6 +379,7 @@
-          {
-             TopoDS_Face face = TopoDS::Face(exp1.Current());
-             int facenr = geom.fmap.FindIndex(face);
-+            if ( facenr < 1 ) continue; // -- to support SALOME sub-meshes
-             if (face2solid[0][facenr-1] == 0)
-                face2solid[0][facenr-1] = solidnr;
-@@ -381,6 +399,7 @@
-       int facenr = 0;
-       int edgenr = 0;
-+      edgenr = mesh.GetNSeg(); // to support SALOME sub-meshes
-       (*testout) << "faces = " << geom.fmap.Extent() << endl;
-       int curr = 0;
-@@ -442,6 +461,7 @@
-                   //(*testout) << "ignoring degenerated edge" << endl;
-                   continue;
-                }
-+               if ( geom.emap.FindIndex(edge) < 1 ) continue; // to support SALOME sub-meshes
-                if (geom.vmap.FindIndex(TopExp::FirstVertex (edge)) ==
-                   geom.vmap.FindIndex(TopExp::LastVertex (edge)))
-@@ -474,20 +494,104 @@
-                if (!merge_solids)
-                {
--                  pnums[0] = geom.vmap.FindIndex (TopExp::FirstVertex (edge));
--                  pnums[pnums.Size()-1] = geom.vmap.FindIndex (TopExp::LastVertex (edge));
-+                 //pnums[0] = geom.vmap.FindIndex (TopExp::FirstVertex (edge));
-+                 //pnums[pnums.Size()-1] = geom.vmap.FindIndex (TopExp::LastVertex (edge));
-+                 MeshPoint dfltP ( Point<3> ( 0, 0, 0 ) );
-+                 int *ipp[] = { &pnums[0], &pnums[pnums.Size()-1] };
-+                 TopoDS_Iterator vIt( edge, false );
-+                 TopoDS_Vertex v[2];
-+                 v[0] = TopoDS::Vertex( vIt.Value() ); vIt.Next();
-+                 v[1] = TopoDS::Vertex( vIt.Value() );
-+                 if ( v[0].Orientation() == TopAbs_REVERSED )
-+                   std::swap( v[0], v[1] );
-+                 for ( int i = 0; i < 2; ++i)
-+                 {
-+                   int &ip = *ipp[i];
-+                   ip = geom.vmap.FindIndex ( v[i] );
-+                   if ( ip == 0 || ip > nvertices )
-+                   {
-+                     int iv = ip;
-+                     if ( ip == 0 )
-+                       ip = iv = geom.vmap.Add( v[i] );
-+                     gp_Pnt pnt = BRep_Tool::Pnt( v[i] );
-+                     MeshPoint mp( Point<3>(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()) );
-+                     for (PointIndex pi = 1; pi < first_vp; pi++)
-+                       if ( Dist2 (mesh.Point(pi), Point<3>(mp)) < 1e-100 )
-+                       {
-+                         ip = pi;
-+                         if ( mesh.Point(ip).GetLayer() != dfltP.GetLayer() && mesh.Point(ip).GetLayer() != iv )
-+                           continue;
-+                         if ( mesh.Point(ip).GetLayer() == dfltP.GetLayer())
-+                           mesh.Point(ip) = MeshPoint( mesh.Point(ip), iv );
-+                         break;
-+                       }
-+                   }
-+                   else
-+                   {
-+                     ip += first_vp - 1;
-+                   }
-+                 }
-                }
-                else
-                {
--                  Point<3> fp = occ2ng (BRep_Tool::Pnt (TopExp::FirstVertex (edge)));
--                  Point<3> lp = occ2ng (BRep_Tool::Pnt (TopExp::LastVertex (edge)));
-+                 TopoDS_Iterator vIt( edge, false );
-+                 TopoDS_Vertex v1 = TopoDS::Vertex( vIt.Value() ); vIt.Next();
-+                 TopoDS_Vertex v2 = TopoDS::Vertex( vIt.Value() );
-+                 if ( v1.Orientation() == TopAbs_REVERSED )
-+                   std::swap( v1, v2 );
-+                 const bool isClosedEdge = v1.IsSame( v2 );
-+                 
-+                  Point<3> fp = occ2ng (BRep_Tool::Pnt (v1));
-+                  Point<3> lp = occ2ng (BRep_Tool::Pnt (v2));
-+                  double tol2 = std::min( eps*eps, 1e-6 * Dist2( fp, lp ));
-+                  if ( isClosedEdge )
-+                    tol2 = BRep_Tool::Tolerance( v1 ) * BRep_Tool::Tolerance( v1 );
-                   pnums[0] = -1;
-                   pnums.Last() = -1;
-                   for (PointIndex pi = 1; pi < first_ep; pi++)
-                   {
--                     if (Dist2 (mesh[pi], fp) < eps*eps) pnums[0] = pi;
--                     if (Dist2 (mesh[pi], lp) < eps*eps) pnums.Last() = pi;
-+                    if (Dist2 (mesh[pi], fp) < tol2) pnums[0] = pi;
-+                    if (Dist2 (mesh[pi], lp) < tol2) pnums.Last() = pi;
-+                  }
-+                  if (( isClosedEdge && pnums[0] != pnums.Last() ) ||
-+                      ( !isClosedEdge && pnums[0] == pnums.Last() ))
-+                    pnums[0] = pnums.Last() = -1;
-+                  if ( pnums[0] == -1 || pnums.Last() == -1 )
-+                  {
-+                    // take into account a possible large gap between a vertex and an edge curve
-+                    // end and a large vertex tolerance covering the whole edge
-+                    if ( pnums[0] == -1 )
-+                    {
-+                      double tol = BRep_Tool::Tolerance( v1 );
-+                      for (PointIndex pi = 1; pi < first_ep; pi++)
-+                        if (pi != pnums.Last() && Dist2 (mesh[pi], fp) < 2*tol*tol)
-+                          pnums[0] = pi;
-+
-+                      if ( pnums[0] == -1 )
-+                        pnums[0] = first_ep-1- nvertices + geom.vmap.FindIndex ( v1 );
-+                    }
-+                    if ( isClosedEdge )
-+                    {
-+                      pnums.Last() = pnums[0];
-+                    }
-+                    else
-+                    {
-+                      if ( pnums.Last() == -1 )
-+                      {
-+                        double tol = BRep_Tool::Tolerance( v2 );
-+                        for (PointIndex pi = 1; pi < first_ep; pi++)
-+                          if (pi != pnums[0] && Dist2 (mesh[pi], lp) < 2*tol*tol)
-+                            pnums.Last() = pi;
-+
-+                        if ( pnums.Last() == -1 )
-+                          pnums.Last() = first_ep-1-nvertices + geom.vmap.FindIndex ( v2 );
-+                      }
-+
-+                      if ( Dist2( fp, mesh[PointIndex(pnums[0])]) >
-+                           Dist2( lp, mesh[PointIndex(pnums.Last())]))
-+                      std::swap( pnums[0], pnums.Last() );
-+                    }
-                   }
-                }
-@@ -497,17 +601,20 @@
-                   bool exists = 0;
-                   int j;
-                   for (j = first_ep; j <= mesh.GetNP(); j++)
-+                  {
-+                     if (!merge_solids && mesh.Point(j).GetLayer() != geomedgenr ) continue; // to support SALOME fuse edges
-                      if ((mesh.Point(j)-Point<3>(mp[i-1])).Length() < eps)
-                      {
-                         exists = 1;
-                         break;
-                      }
-+                  }
-                      if (exists)
-                         pnums[i] = j;
-                      else
-                      {
--                        mesh.AddPoint (mp[i-1]);
-+                        mesh.AddPoint (mp[i-1], geomedgenr); // to support SALOME fuse edges
-                         (*testout) << "add meshpoint " << mp[i-1] << endl;
-                         pnums[i] = mesh.GetNP();
-                      }
-@@ -591,6 +698,8 @@
-       //              (*testout) << "edge " << mesh.LineSegment(i).edgenr << " face " << mesh.LineSegment(i).si
-       //                              << " p1 " << mesh.LineSegment(i)[0] << " p2 " << mesh.LineSegment(i)[1] << endl;
-       //      exit(10);
-+      for (int j = 1; j <= mesh.GetNP(); j++) // to support SALOME fuse edges: set level to zero
-+        mesh.Point(j) = MeshPoint( (Point<3>&) mesh.Point(j) );
-       mesh.CalcSurfacesOfNode();
-       multithread.task = savetask;
-@@ -633,7 +742,8 @@
-          }
-          (*testout) << "mesh face " << k << endl;
--         multithread.percent = 100 * k / (mesh.GetNFD()+1e-10);
-+         // multithread.percent = 100 * k / (mesh.GetNFD()+1e-10); -- avoid FPE
-+         multithread.percent = 100 * k / (mesh.GetNFD() + VSMALL);
-          geom.facemeshstatus[k-1] = -1;
-@@ -901,7 +1011,8 @@
-          //      if (k != 36) continue;
-          //      (*testout) << "optimize face " << k << endl;
--         multithread.percent = 100 * k / (mesh.GetNFD()+1e-10);
-+         //multithread.percent = 100 * k / (mesh.GetNFD()+1e-10); -- avoid FPE
-+         multithread.percent = 100 * k / (mesh.GetNFD() + VSMALL);
-          FaceDescriptor & fd = mesh.GetFaceDescriptor(k);
-@@ -1456,3 +1567,4 @@
- }
- #endif
-+
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occgeom.cpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp  2010-03-05 16:16:21.000000000 +0300
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occgeom.cpp   2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -8,6 +8,8 @@
- #include "ShapeAnalysis_CheckSmallFace.hxx"
- #include "ShapeAnalysis_DataMapOfShapeListOfReal.hxx"
- #include "ShapeAnalysis_Surface.hxx"
-+#include <BRepTopAdaptor_FClass2d.hxx> // -- to optimize Project() and FastProject()
-+#include <TopAbs_State.hxx>
- #include "BRepAlgoAPI_Fuse.hxx"
- #include "BRepCheck_Analyzer.hxx"
- #include "BRepLib.hxx"
-@@ -16,10 +18,17 @@
- #include "ShapeFix_FixSmallFace.hxx"
- #include "Partition_Spliter.hxx"
--
- namespace netgen
- {
--   void OCCGeometry :: PrintNrShapes ()
-+  // free data used to optimize Project() and FastProject()
-+  OCCGeometry::~OCCGeometry()
-+  {
-+    NCollection_DataMap<int,BRepTopAdaptor_FClass2d*>::Iterator it(fclsmap);
-+    for (; it.More(); it.Next())
-+      delete it.Value();
-+  }
-+
-+  void OCCGeometry :: PrintNrShapes ()
-    {
-       TopExp_Explorer e;
-       int count = 0;
-@@ -951,25 +960,58 @@
-    }
-+   // returns a projector and a classifier for the given surface
-+   void OCCGeometry::GetFaceTools(int surfi, Handle(ShapeAnalysis_Surface)& proj,
-+                                  BRepTopAdaptor_FClass2d*& cls) const
-+   {
-+     //MSV: organize caching projector in the map
-+     if (fprjmap.IsBound(surfi))
-+     {
-+       proj = fprjmap.Find(surfi);
-+       cls = fclsmap.Find(surfi);
-+     }
-+     else
-+     {
-+       const TopoDS_Face& aFace = TopoDS::Face(fmap(surfi));
-+       Handle(Geom_Surface) aSurf = BRep_Tool::Surface(aFace);
-+       proj = new ShapeAnalysis_Surface(aSurf);
-+       fprjmap.Bind(surfi, proj);
-+       cls = new BRepTopAdaptor_FClass2d(aFace,Precision::Confusion());
-+       fclsmap.Bind(surfi, cls);
-+     }
-+   }
--
--   void OCCGeometry :: Project (int surfi, Point<3> & p) const
-+   // void OCCGeometry :: Project (int surfi, Point<3> & p) const
-+   bool OCCGeometry :: Project (int surfi, Point<3> & p, double& u, double& v) const
-    {
-       static int cnt = 0;
-       if (++cnt % 1000 == 0) cout << "Project cnt = " << cnt << endl;
-       gp_Pnt pnt(p(0), p(1), p(2));
--      double u,v;
--      Handle( Geom_Surface ) thesurf = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
--      Handle( ShapeAnalysis_Surface ) su = new ShapeAnalysis_Surface( thesurf );
--      gp_Pnt2d suval = su->ValueOfUV ( pnt, BRep_Tool::Tolerance( TopoDS::Face(fmap(surfi)) ) );
--      suval.Coord( u, v);
--      pnt = thesurf->Value( u, v );
--
--
-+      // -- Optimization: use cached projector and classifier
-+      // double u,v;
-+      // Handle( Geom_Surface ) thesurf = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
-+      // Handle( ShapeAnalysis_Surface ) su = new ShapeAnalysis_Surface( thesurf );
-+      // gp_Pnt2d suval = su->ValueOfUV ( pnt, BRep_Tool::Tolerance( TopoDS::Face(fmap(surfi)) ) );
-+      // suval.Coord( u, v);
-+      // pnt = thesurf->Value( u, v );  
-+
-+      Handle(ShapeAnalysis_Surface) proj;
-+      BRepTopAdaptor_FClass2d *cls;
-+      GetFaceTools(surfi, proj, cls);
-+  
-+      gp_Pnt2d p2d = proj->ValueOfUV(pnt, Precision::Confusion());
-+      if (cls->Perform(p2d) == TopAbs_OUT)
-+      {
-+        return false;
-+      }
-+      pnt = proj->Value(p2d);
-+      p2d.Coord(u, v);
-+  
-       p = Point<3> (pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z());
-+      return true;
-    }
-@@ -979,54 +1021,69 @@
-    {
-       gp_Pnt p(ap(0), ap(1), ap(2));
--      Handle(Geom_Surface) surface = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
--
--      gp_Pnt x = surface->Value (u,v);
--
--      if (p.SquareDistance(x) <= sqr(PROJECTION_TOLERANCE)) return true;
--
--      gp_Vec du, dv;
--
--      surface->D1(u,v,x,du,dv);
--
--      int count = 0;
--
--      gp_Pnt xold;
--      gp_Vec n;
--      double det, lambda, mu;
--
--      do {
--         count++;
--
--         n = du^dv;
--
--         det = Det3 (n.X(), du.X(), dv.X(),
--            n.Y(), du.Y(), dv.Y(),
--            n.Z(), du.Z(), dv.Z());
--
--         if (det < 1e-15) return false;
--
--         lambda = Det3 (n.X(), p.X()-x.X(), dv.X(),
--            n.Y(), p.Y()-x.Y(), dv.Y(),
--            n.Z(), p.Z()-x.Z(), dv.Z())/det;
--
--         mu     = Det3 (n.X(), du.X(), p.X()-x.X(),
--            n.Y(), du.Y(), p.Y()-x.Y(),
--            n.Z(), du.Z(), p.Z()-x.Z())/det;
--
--         u += lambda;
--         v += mu;
--
--         xold = x;
--         surface->D1(u,v,x,du,dv);
--
--      } while (xold.SquareDistance(x) > sqr(PROJECTION_TOLERANCE) && count < 50);
--
--      //    (*testout) << "FastProject count: " << count << endl;
--
--      if (count == 50) return false;
--
--      ap = Point<3> (x.X(), x.Y(), x.Z());
-+      // -- Optimization: use cached projector and classifier
-+      // Handle(Geom_Surface) surface = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
-+      // 
-+      // gp_Pnt x = surface->Value (u,v);
-+      // 
-+      // if (p.SquareDistance(x) <= sqr(PROJECTION_TOLERANCE)) return true;
-+      // 
-+      // gp_Vec du, dv;
-+      // 
-+      // surface->D1(u,v,x,du,dv);
-+      // 
-+      // int count = 0;
-+      // 
-+      // gp_Pnt xold;
-+      // gp_Vec n;
-+      // double det, lambda, mu;
-+      // 
-+      // do {
-+      //    count++;
-+      // 
-+      //    n = du^dv;
-+      // 
-+      //    det = Det3 (n.X(), du.X(), dv.X(),
-+      //       n.Y(), du.Y(), dv.Y(),
-+      //       n.Z(), du.Z(), dv.Z());
-+      // 
-+      //    if (det < 1e-15) return false;
-+      // 
-+      //    lambda = Det3 (n.X(), p.X()-x.X(), dv.X(),
-+      //       n.Y(), p.Y()-x.Y(), dv.Y(),
-+      //       n.Z(), p.Z()-x.Z(), dv.Z())/det;
-+      // 
-+      //    mu     = Det3 (n.X(), du.X(), p.X()-x.X(),
-+      //       n.Y(), du.Y(), p.Y()-x.Y(),
-+      //       n.Z(), du.Z(), p.Z()-x.Z())/det;
-+      // 
-+      //    u += lambda;
-+      //    v += mu;
-+      // 
-+      //    xold = x;
-+      //    surface->D1(u,v,x,du,dv);
-+      // 
-+      // } while (xold.SquareDistance(x) > sqr(PROJECTION_TOLERANCE) && count < 50);
-+      // 
-+      // //    (*testout) << "FastProject count: " << count << endl;
-+      // 
-+      // if (count == 50) return false;
-+      // 
-+      // ap = Point<3> (x.X(), x.Y(), x.Z());
-+      Handle(ShapeAnalysis_Surface) proj;
-+      BRepTopAdaptor_FClass2d *cls;
-+      GetFaceTools(surfi, proj, cls);
-+    
-+      gp_Pnt2d p2d = proj->NextValueOfUV(gp_Pnt2d(u,v), p, Precision::Confusion());
-+      if (cls->Perform(p2d) == TopAbs_OUT)
-+      {
-+        //cout << "Projection fails" << endl;
-+        return false;
-+      }
-+    
-+      p = proj->Value(p2d);
-+      p2d.Coord(u, v);
-+      ap = Point<3> (p.X(), p.Y(), p.Z());
-       return true;
-    }
-@@ -1038,9 +1095,9 @@
-    {
-       cout << "writing stl..."; cout.flush();
-       StlAPI_Writer writer;
--      writer.RelativeMode() = Standard_False;
-+      // writer.RelativeMode() = Standard_False;
--      writer.SetDeflection(0.02);
-+      // writer.SetDeflection(0.02);
-       writer.Write(shape,filename);
-       cout << "done" << endl;
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occgeom.hpp netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occgeom.hpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occgeom.hpp  2010-01-14 19:56:19.000000000 +0300
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occgeom.hpp   2014-07-22 13:09:03.000000000 +0400
-@@ -15,8 +15,8 @@
- #include "Geom_Curve.hxx"
- #include "Geom2d_Curve.hxx"
- #include "Geom_Surface.hxx"
--#include "GeomAPI_ProjectPointOnSurf.hxx"
--#include "GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx"
-+// #include "GeomAPI_ProjectPointOnSurf.hxx"
-+// #include "GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx"
- #include "BRepTools.hxx"
- #include "TopExp.hxx"
- #include "BRepBuilderAPI_MakeVertex.hxx"
-@@ -42,8 +42,8 @@
- #include "Geom_Curve.hxx"
- #include "Geom2d_Curve.hxx"
- #include "Geom_Surface.hxx"
--#include "GeomAPI_ProjectPointOnSurf.hxx"
--#include "GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx"
-+// #include "GeomAPI_ProjectPointOnSurf.hxx"
-+// #include "GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx"
- #include "TopoDS_Wire.hxx"
- #include "BRepTools_WireExplorer.hxx"
- #include "BRepTools.hxx"
-@@ -68,18 +68,26 @@
- #include "IGESToBRep_Reader.hxx"
- #include "Interface_Static.hxx"
- #include "GeomAPI_ExtremaCurveCurve.hxx"
--#include "Standard_ErrorHandler.hxx"
-+//#include "Standard_ErrorHandler.hxx"
- #include "Standard_Failure.hxx"
- #include "ShapeUpgrade_ShellSewing.hxx"
- #include "ShapeFix_Shape.hxx"
- #include "ShapeFix_Wireframe.hxx"
-+#include <Standard_Version.hxx>
-+#if (OCC_VERSION_MAJOR << 16 | OCC_VERSION_MINOR << 8 | OCC_VERSION_MAINTENANCE) <= 0x060702
-+// porting to OCCT6.7.3
- #include "BRepMesh.hxx"
-+#endif
- #include "BRepMesh_IncrementalMesh.hxx"
- #include "BRepBndLib.hxx"
- #include "Bnd_Box.hxx"
- #include "ShapeAnalysis.hxx"
- #include "ShapeBuild_ReShape.hxx"
-+// -- Optimization: to use cached projector and classifier
-+#include <NCollection_DataMap.hxx>
-+class Handle_ShapeAnalysis_Surface;
-+class BRepTopAdaptor_FClass2d;
- // Philippose - 29/01/2009
- // OpenCascade XDE Support
-@@ -190,6 +198,9 @@
-    class OCCGeometry : public NetgenGeometry
-    {
-       Point<3> center;
-+      // -- Optimization: to use cached projector and classifier
-+      mutable NCollection_DataMap<int,Handle_ShapeAnalysis_Surface> fprjmap;
-+      mutable NCollection_DataMap<int,BRepTopAdaptor_FClass2d*> fclsmap;
-    public:
-       TopoDS_Shape shape;
-@@ -241,6 +252,8 @@
-          vmap.Clear();
-       }
-+      ~OCCGeometry();      // -- to free cached projector and classifier
-+
-       void BuildFMap();
-       Box<3> GetBoundingBox()
-@@ -260,9 +273,14 @@
-       Point<3> Center()
-       {  return center;}
--      void Project (int surfi, Point<3> & p) const;
-+      // void Project (int surfi, Point<3> & p) const; -- optimization
-+      bool Project (int surfi, Point<3> & p, double& u, double& v) const;
-       bool FastProject (int surfi, Point<3> & ap, double& u, double& v) const;
-+      // -- Optimization: to use cached projector and classifier
-+      void GetFaceTools(int surfi, Handle(ShapeAnalysis_Surface)& proj,
-+                        BRepTopAdaptor_FClass2d*& cls) const;
-+
-       OCCSurface GetSurface (int surfi)
-       {
-          cout << "OCCGeometry::GetSurface using PLANESPACE" << endl;
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp      2009-08-24 06:32:47.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp       2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -6,6 +6,7 @@
- #include <meshing.hpp>
- #include <GeomLProp_SLProps.hxx>
- #include <ShapeAnalysis_Surface.hxx>
-+#include <GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx> // -- moved here from occgeom.hpp
- namespace netgen
-@@ -434,23 +435,33 @@
-   void MeshOptimize2dOCCSurfaces :: ProjectPoint (INDEX surfind, Point<3> & p) const
-   {
--    geometry.Project (surfind, p);
-+    // geometry.Project (surfind, p); -- signature of Project() changed for optimization
-+    double u, v;
-+    geometry.Project (surfind, p, u, v);
-   }
-   int MeshOptimize2dOCCSurfaces :: ProjectPointGI (INDEX surfind, Point<3> & p, PointGeomInfo & gi) const
-   {
--    double u = gi.u;
--    double v = gi.v;
-+    //double u = gi.u;
-+    //double v = gi.v;
-     Point<3> hp = p;
--    if (geometry.FastProject (surfind, hp, u, v))
--      {
--      p = hp;
--      return 1;
--      }
--    ProjectPoint (surfind, p); 
--    return CalcPointGeomInfo (surfind, gi, p); 
-+    // -- u and v are computed by FastProject() and Project(), no need to call CalcPointGeomInfo()
-+    // if (geometry.FastProject (surfind, hp, u, v))
-+    //   {
-+    //    p = hp;
-+    //    return 1;
-+    //   }
-+    // ProjectPoint (surfind, p); 
-+    // return CalcPointGeomInfo (surfind, gi, p); 
-+    bool ok;
-+    if (gi.trignum > 0)
-+      ok = geometry.FastProject (surfind, hp, gi.u, gi.v);
-+    else
-+      ok = geometry.Project (surfind, hp, gi.u, gi.v);
-+    p = hp;
-+    return ok;
-   }
-@@ -680,7 +691,8 @@
-       if (!geometry.FastProject (surfi, hnewp, u, v))
-         {
-         //  cout << "Fast projection to surface fails! Using OCC projection" << endl;
--          geometry.Project (surfi, hnewp);
-+          // geometry.Project (surfi, hnewp); -- Project() changed for optimization
-+          geometry.Project (surfi, hnewp, u, v);
-         }
-       newgi.trignum = 1;
-@@ -689,7 +701,7 @@
-       }
-   
-     newp = hnewp;
--  }
-+  }//; -- to compile with -Wall -pedantic
-   void OCCRefinementSurfaces :: 
-@@ -708,14 +720,18 @@
-     hnewp = Point<3> (pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z());
-     newp = hnewp;
-     newgi = ap1;
--  };
-+  }
-   void OCCRefinementSurfaces :: ProjectToSurface (Point<3> & p, int surfi)
-   {
-     if (surfi > 0)
--      geometry.Project (surfi, p);
--  };
-+      // geometry.Project (surfi, p); -- Project() changed for optimization
-+    {
-+      double u, v;
-+      geometry.Project (surfi, p, u, v);
-+    }
-+  }//; -- to compile with -Wall -pedantic
-   void OCCRefinementSurfaces :: ProjectToSurface (Point<3> & p, int surfi, PointGeomInfo & gi)
-   {
-@@ -723,9 +739,10 @@
-       if (!geometry.FastProject (surfi, p, gi.u, gi.v))
-       {
-         cout << "Fast projection to surface fails! Using OCC projection" << endl;
--        geometry.Project (surfi, p);
-+          double u, v;
-+        geometry.Project (surfi, p, u, v);
-       }
--  };
-+  }
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx        2009-08-24 06:12:24.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx 2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -86,6 +86,9 @@
- #include <TopOpeBRepTool_OutCurveType.hxx>
- #include <TopOpeBRep_DSFiller.hxx>
- #include <TopTools_DataMapIteratorOfDataMapOfShapeShape.hxx>
-+
-+#include <Standard_Version.hxx>
-+
- #include <stdio.h>
- //=======================================================================
-@@ -243,7 +246,12 @@
-       Standard_Integer i, nbExt = anExtPS.NbExt();
-       Extrema_POnSurf aPOnSurf;
-       for (i = 1; i <= nbExt; ++i )
-+#if (OCC_VERSION_MAJOR << 16 | OCC_VERSION_MINOR << 8 | OCC_VERSION_MAINTENANCE) > 0x060400
-+// porting to OCCT6.5.1
-+        if (anExtPS.SquareDistance( i ) <= TolE * TolE) {
-+#else
-         if (anExtPS.Value( i ) <= TolE) {
-+#endif
-           aPOnSurf = anExtPS.Point( i );
-           break;
-         }
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx 2009-08-24 06:12:24.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx  2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -22,7 +22,6 @@
- #include <BRepAdaptor_Surface.hxx>
- #include <BRepAlgo_AsDes.hxx>
- #include <BRepAlgo_FaceRestrictor.hxx>
--#include <BRepOffset_DataMapOfShapeReal.hxx>
- #include <BRepTopAdaptor_FClass2d.hxx>
- #include <BRep_Builder.hxx>
- #include <BRep_Tool.hxx>
-@@ -51,6 +50,15 @@
- #include <gp_Pnt.hxx>
- #include <gp_Pnt2d.hxx>
-+#include <Standard_Version.hxx>
-+
-+#if (OCC_VERSION_MAJOR << 16 | OCC_VERSION_MINOR << 8 | OCC_VERSION_MAINTENANCE) > 0x060400
-+// porting to OCCT6.5.1
-+#include <TopTools_DataMapOfShapeReal.hxx>
-+#else
-+#include <BRepOffset_DataMapOfShapeReal.hxx>
-+#endif
-+
- //=======================================================================
- //function : Partition_Loop2d
- //purpose  :
-@@ -209,7 +217,7 @@
-     Cc->D1(uc, PC, CTg1);
-     if (!isForward) CTg1.Reverse();
--    Standard_Real anglemin = 3 * PI, tolAng = 1.e-8;
-+    Standard_Real anglemin = 3 * M_PI, tolAng = 1.e-8;
-     // select an edge whose first derivative is most left of CTg1
-     // ie an angle between Tg1 and CTg1 is least
-@@ -233,7 +241,7 @@
-       // -PI < angle < PI
-       Standard_Real angle = Tg1.Angle(CTg1);
--      if (PI - Abs(angle) <= tolAng)
-+      if (M_PI - Abs(angle) <= tolAng)
-       {
-         // an angle is too close to PI; assure that an angle sign really
-         // reflects an edge position: +PI - an edge is worst,
-@@ -519,7 +527,12 @@
-     DC.Initialize( DegEdge, F );
-   // avoid intersecting twice the same edge
-+#if (OCC_VERSION_MAJOR << 16 | OCC_VERSION_MINOR << 8 | OCC_VERSION_MAINTENANCE) > 0x060400
-+// porting to OCCT6.5.1
-+  TopTools_DataMapOfShapeReal EUMap ( EdgesList.Extent() );
-+#else
-   BRepOffset_DataMapOfShapeReal EUMap ( EdgesList.Extent() );
-+#endif
-   Standard_Real U, f, l;
-   BRep_Tool::Range (DegEdge, f, l);
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/Partition_Loop.cxx netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/Partition_Loop.cxx
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/Partition_Loop.cxx   2009-08-24 06:12:24.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/Partition_Loop.cxx    2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -178,7 +178,7 @@
-       }
-     }
--    Standard_Real anglemax = - PI;
-+    Standard_Real anglemax = - M_PI;
-     TopoDS_Edge   SelectedEdge;       
-     for ( itl.Initialize(LE); itl.More(); itl.Next()) {
-       const TopoDS_Edge& E = TopoDS::Edge(itl.Value());
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx        2009-08-24 06:12:24.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx 2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -79,6 +79,8 @@
- #include <GeomAdaptor_Curve.hxx>
- #include <TopOpeBRepTool_CurveTool.hxx>
-+#include <Standard_Version.hxx>
-+
- #ifdef DEB
- //# define PART_PERF
- #endif
-@@ -1169,7 +1171,12 @@
-           for (; j<=nbj && ok; ++j) {
-             if (Extrema.IsMin(j)) {
-             hasMin = Standard_True;
-+#if (OCC_VERSION_MAJOR << 16 | OCC_VERSION_MINOR << 8 | OCC_VERSION_MAINTENANCE) > 0x060400
-+// porting to OCCT6.5.1
-+              ok = Extrema.SquareDistance(j) <= tol * tol;
-+#else
-               ok = Extrema.Value(j) <= tol;
-+#endif
-           }
-           }
-         }
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/utilities.h netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/utilities.h
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/occ/utilities.h  2009-08-24 06:12:24.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/occ/utilities.h   2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -33,6 +33,7 @@
- #include <string>
- #include <iostream>
-+#include <iomanip>
- #include <cstdlib>
- // #include "SALOME_Log.hxx"
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/libsrc/stlgeom/stlgeommesh.cpp netgen-4.9.13_new/libsrc/stlgeom/stlgeommesh.cpp
---- netgen-4.9.13_orig/libsrc/stlgeom/stlgeommesh.cpp  2009-08-10 15:40:51.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/libsrc/stlgeom/stlgeommesh.cpp   2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -1435,7 +1435,8 @@
-         if (!optstring || strlen(optstring) == 0)
-           {
--            mparam.optimize2d = "smcm";
-+            //mparam.optimize2d = (char*)"smcm";
-+              mparam.optimize2d = (char*)"smcm";
-           }
-         else
-           {
-@@ -1451,7 +1452,8 @@
-                                mparam.grading);
-             mesh -> LoadLocalMeshSize (mparam.meshsizefilename);            
-             mesh -> CalcLocalHFromSurfaceCurvature (stlparam.resthsurfmeshcurvfac);
--            mparam.optimize2d = "cmsmSm";
-+            //mparam.optimize2d = (char*)"cmsmSm";
-+              mparam.optimize2d = (char*)"cmsmSm";
-             STLSurfaceOptimization (*stlgeometry, *mesh, mparam);
- #ifdef STAT_STREAM
-             (*statout) << GetTime() << " & ";
-@@ -1557,7 +1559,8 @@
-         if (!optstring || strlen(optstring) == 0)
-           {
--            mparam.optimize3d = "cmdmstm";
-+              //mparam.optimize3d = "cmdmstm";
-+            mparam.optimize3d = (char*)"cmdmstm";
-           }
-         else
-           {
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/ng/Makefile.in netgen-4.9.13_new/ng/Makefile.in
---- netgen-4.9.13_orig/ng/Makefile.in  2010-05-21 01:29:28.000000000 +0200
-+++ netgen-4.9.13_new/ng/Makefile.in   2016-05-26 14:39:47.128141997 +0200
-@@ -287,7 +287,7 @@
-       $(top_builddir)/libsrc/gprim/libgprim.la \
-       $(top_builddir)/libsrc/linalg/libla.la \
-       $(top_builddir)/libsrc/general/libgen.la \
--      $(OCCLIBS) -L$(TK_BIN_DIR)/Togl1.7 $(TOGLLIBDIR) -lTogl1.7 $(LIBGLU) $(TK_LIB_SPEC) $(TCL_LIB_SPEC) $(MPI_LIBS) $(FFMPEG_LIBS) $(JPEGLIB_LIBS) $(PKG_LIBS) 
-+      $(OCCLIBS) -L$(TK_BIN_DIR)/Togl1.7 $(TOGLLIBDIR) -lTogl $(LIBGLU) $(TK_LIB_SPEC) $(TCL_LIB_SPEC) $(MPI_LIBS) $(FFMPEG_LIBS) $(JPEGLIB_LIBS) $(PKG_LIBS) 
- # add for static linkage of ngsolve:
-diff -Naur netgen-4.9.13_orig/nglib/nglib.h netgen-4.9.13_new/nglib/nglib.h
---- netgen-4.9.13_orig/nglib/nglib.h   2010-05-18 15:20:25.000000000 +0400
-+++ netgen-4.9.13_new/nglib/nglib.h    2014-07-22 13:01:28.000000000 +0400
-@@ -24,7 +24,7 @@
- // Philippose - 14.02.2009
- // Modifications for creating a DLL in Windows
- #ifdef WIN32
--   #ifdef NGLIB_EXPORTS || nglib_EXPORTS
-+   #if defined NGLIB_EXPORTS || defined nglib_EXPORTS
-       #define DLL_HEADER   __declspec(dllexport)
-    #else
-       #define DLL_HEADER   __declspec(dllimport)
diff --git a/src/NETGEN/netgen50ForSalome.patch b/src/NETGEN/netgen50ForSalome.patch
deleted file mode 100644 (file)
index ae7b2ed..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,897 +0,0 @@
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/meshing/meshtype.cpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp      2012-11-09 19:15:04.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/meshing/meshtype.cpp   2013-02-21 17:46:13.000000000 +0400
-@@ -1,4 +1,5 @@
- #include <mystdlib.h>
-+#include <float.h> // to get DBL_MIN defined
- #include "meshing.hpp"  
-@@ -666,7 +667,8 @@
-         double det = trans.Det();
--        if (det <= 0)
-+        // if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           err += frob * frob / det;
-@@ -722,7 +724,8 @@
-             double det = trans(0,0)*trans(1,1)-trans(1,0)*trans(0,1);
--            if (det <= 0)
-+            // if (det <= 0)
-+            if (det <= DBL_MIN)  // avoid FPE
-               {
-                 dd = 0;
-                 return 1e12;
-@@ -806,7 +809,8 @@
-           = dtrans(0,0) * trans(1,1) - trans(0,1) * dtrans(1,0)
-           + trans(0,0) * dtrans(1,1) - dtrans(0,1) * trans(1,0);
--        if (det <= 0)
-+        // if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           {
-@@ -856,7 +860,8 @@
-         frob /= 2;
-         double det = trans.Det();
--        if (det <= 0)
-+        //if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           err += frob * frob / det;
-@@ -1864,7 +1869,8 @@
-       case PYRAMID:
-         {
-           double noz = 1-p(2);
--          if (noz == 0.0) noz = 1e-10;
-+          //if (noz == 0.0) noz = 1e-10;
-+          if (noz <= DBL_MIN) noz = 1e-10; // avoid FPE
-           double xi  = p(0) / noz;
-           double eta = p(1) / noz;
-@@ -2030,7 +2036,8 @@
-         double det = -trans.Det();
-       
--        if (det <= 0)
-+        //if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           err += frob * frob * frob / det;
-@@ -2102,7 +2109,8 @@
-         ddet *= -1;
-       
--        if (det <= 0)
-+        //if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN) // avoid FPE
-           err += 1e12;
-         else
-           {
-@@ -2184,7 +2192,7 @@
-       
-         det *= -1;
-       
--        if (det <= 0)
-+        if (det <= DBL_MIN)
-           err += 1e12;
-         else
-           {
-@@ -2513,10 +2521,10 @@
-   MeshingParameters :: MeshingParameters ()
-   {
--    optimize3d = "cmdmustm";
-+    optimize3d = (char*)"cmdmustm"; // optimize3d = "cmdmustm";
-     //optimize3d = "cmdmstm";
-     optsteps3d = 3;
--    optimize2d = "smsmsmSmSmSm";
-+    optimize2d = (char*)"smsmsmSmSmSm"; // optimize2d = "smsmsmSmSmSm";
-     optsteps2d = 3;
-     opterrpow = 2;
-     blockfill = 1;
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/meshing/meshtype.hpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp      2012-11-09 19:15:04.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/meshing/meshtype.hpp   2013-02-21 17:46:13.000000000 +0400
-@@ -15,6 +15,7 @@
-     Classes for NETGEN
-   */
-+class Mesh; // added due to compilation errors on some platforms
-   enum ELEMENT_TYPE { 
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/meshing/smoothing2.cpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/meshing/smoothing2.cpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/meshing/smoothing2.cpp    2012-11-09 19:15:04.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/meshing/smoothing2.cpp 2013-02-25 11:20:05.000000000 +0400
-@@ -200,7 +200,8 @@
-     vgrad = 0;
-     badness = 0;
--    ld.meshthis -> GetNormalVector (ld.surfi, ld.sp1, ld.gi1, n);
-+    //normal already computed: ld.meshthis -> GetNormalVector (ld.surfi, ld.sp1, ld.gi1, n);
-+    n = ld.normal;
-     pp1 = ld.sp1 + x(0) * ld.t1 + x(1) * ld.t2;
-     //  meshthis -> ProjectPoint (surfi, pp1);
-@@ -258,7 +259,8 @@
-     vgrad = 0;
-     badness = 0;
--    ld.meshthis -> GetNormalVector (ld.surfi, ld.sp1, ld.gi1, n);
-+    //normal already computed: ld.meshthis -> GetNormalVector (ld.surfi, ld.sp1, ld.gi1, n);
-+    n = ld.normal;
-     pp1 = ld.sp1 + x(0) * ld.t1 + x(1) * ld.t2;
-@@ -417,7 +419,8 @@
-     vgrad = 0;
-     badness = 0;
--    ld.meshthis -> GetNormalVector (ld.surfi, ld.sp1, ld.gi1, n);
-+    //normal already computed: ld.meshthis -> GetNormalVector (ld.surfi, ld.sp1, ld.gi1, n);
-+    n = ld.normal;
-     pp1 = ld.sp1 + x(0) * ld.t1 + x(1) * ld.t2;
-@@ -489,7 +492,8 @@
-     vgrad = 0;
-     badness = 0;
--    ld.meshthis -> GetNormalVector (ld.surfi, ld.sp1, ld.gi1, n);
-+    //normal already computed: ld.meshthis -> GetNormalVector (ld.surfi, ld.sp1, ld.gi1, n);
-+    n = ld.normal;
-     // pp1 = sp1;
-     //    pp1.Add2 (x.Get(1), t1, x.Get(2), t2);
-@@ -916,7 +920,7 @@
-               {
-                 mesh[pi] = Point<3> (origp);
-               }
--          
-+            break; // exit as <fact> is not used anymore
-           }
-       }
-       }
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx 2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx      2013-02-25 13:51:48.000000000 +0400
-@@ -243,9 +243,11 @@
-       Standard_Integer i, nbExt = anExtPS.NbExt();
-       Extrema_POnSurf aPOnSurf;
-       for (i = 1; i <= nbExt; ++i )
--      if (anExtPS.Value( i ) <= TolE)               // V6.3
--        // if (anExtPS.SquareDistance( i ) <= TolE)   // V6.5
--        {
-+        // porting to OCCT6.5.1
-+      //if (anExtPS.Value( i ) <= TolE)               // V6.3
-+      // if (anExtPS.SquareDistance( i ) <= TolE)   // V6.5
-+        if (anExtPS.SquareDistance( i ) <= TolE * TolE)
-+      {
-           aPOnSurf = anExtPS.Point( i );
-           break;
-         }
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx  2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx       2013-02-25 13:48:15.000000000 +0400
-@@ -210,7 +210,7 @@
-     Cc->D1(uc, PC, CTg1);
-     if (!isForward) CTg1.Reverse();
--    Standard_Real anglemin = 3 * PI, tolAng = 1.e-8;
-+    Standard_Real anglemin = 3 * M_PI, tolAng = 1.e-8;
-     // select an edge whose first derivative is most left of CTg1
-     // ie an angle between Tg1 and CTg1 is least
-@@ -234,7 +234,7 @@
-       // -PI < angle < PI
-       Standard_Real angle = Tg1.Angle(CTg1);
--      if (PI - Abs(angle) <= tolAng)
-+      if (M_PI - Abs(angle) <= tolAng)
-       {
-         // an angle is too close to PI; assure that an angle sign really
-         // reflects an edge position: +PI - an edge is worst,
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx 2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx      2013-02-25 13:55:10.000000000 +0400
-@@ -1169,8 +1169,10 @@
-           for (; j<=nbj && ok; ++j) {
-             if (Extrema.IsMin(j)) {
-             hasMin = Standard_True;
--            ok = Extrema.Value(j) <= tol;  // V6.3
-+            // porting to OCCT6.5.1
-+            //ok = Extrema.Value(j) <= tol;  // V6.3
-             // ok = Extrema.SquareDistance(j) <= tol;  // V6.5
-+            ok = Extrema.SquareDistance(j) <= tol * tol;
-           }
-           }
-         }
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occconstruction.cpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp   2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occconstruction.cpp        2013-02-21 17:46:13.000000000 +0400
-@@ -28,7 +28,7 @@
- #include <BRepAlgoAPI_Common.hxx>
- #include <BRepAlgoAPI_Fuse.hxx>
- #include <BRepAlgoAPI_Section.hxx>
--#include <BRepOffsetAPI_Sewing.hxx>
-+//#include <BRepOffsetAPI_Sewing.hxx>
- //#include <BRepAlgo_Sewing.hxx>
- #include <BRepOffsetAPI_MakeOffsetShape.hxx>
- #include <ShapeFix_Shape.hxx>
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occgenmesh.cpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp        2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occgenmesh.cpp     2013-02-21 17:46:13.000000000 +0400
-@@ -57,6 +57,8 @@
-+   
-+   static // useless out of this file
-    double ComputeH (double kappa)
-    {
-       double hret;
-@@ -74,8 +76,7 @@
-    }
--
--
-+   static // useless out of this file
-    void RestrictHTriangle (gp_Pnt2d & par0, gp_Pnt2d & par1, gp_Pnt2d & par2,
-                            BRepLProp_SLProps * prop, Mesh & mesh, int depth, double h = 0)
-    {
-@@ -171,8 +172,8 @@
-          if(h < 1e-4*maxside)
-             return;
--
--         if (h > 30) return;
-+         // commented to restrict H on a large sphere for example
-+         //if (h > 30) return;
-       }
-       if (h < maxside && depth < 10)
-@@ -231,6 +232,7 @@
-+   static // useless out of this file
-    void DivideEdge (TopoDS_Edge & edge, Array<MeshPoint> & ps,
-                     Array<double> & params, Mesh & mesh)
-    {
-@@ -250,8 +252,8 @@
-       hvalue[0] = 0;
-       pnt = c->Value(s0);
--      double olddist = 0;
--      double dist = 0;
-+      //double olddist = 0; -- useless variables
-+      //double dist = 0;
-       int tmpVal = (int)(DIVIDEEDGESECTIONS);
-@@ -259,15 +261,19 @@
-       {
-          oldpnt = pnt;
-          pnt = c->Value(s0+(i/double(DIVIDEEDGESECTIONS))*(s1-s0));
-+         // -- no more than 1 segment per <edge length>/DIVIDEEDGESECTIONS
-          hvalue[i] = hvalue[i-1] +
--            1.0/mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()))*
--            pnt.Distance(oldpnt);
-+         //   1.0/mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()))*
-+         //   pnt.Distance(oldpnt);
-+           min( 1.0,
-+                1.0/mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()))*
-+                pnt.Distance(oldpnt));
-          //(*testout) << "mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z())) " << mesh.GetH(Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()))
-          //      <<  " pnt.Distance(oldpnt) " << pnt.Distance(oldpnt) << endl;
--         olddist = dist;
--         dist = pnt.Distance(oldpnt);
-+         //olddist = dist; -- useless variables
-+         //dist = pnt.Distance(oldpnt);
-       }
-       //  nsubedges = int(ceil(hvalue[DIVIDEEDGESECTIONS]));
-@@ -282,7 +288,10 @@
-       {
-          if (hvalue[i1]/hvalue[DIVIDEEDGESECTIONS]*nsubedges >= i)
-          {
--            params[i] = s0+(i1/double(DIVIDEEDGESECTIONS))*(s1-s0);
-+            // -- for nsubedges comparable to DIVIDEEDGESECTIONS
-+            //params[i] = s0+(i1/double(DIVIDEEDGESECTIONS))*(s1-s0);
-+            double d1 = i1 - (hvalue[i1] - i*hvalue[DIVIDEEDGESECTIONS]/nsubedges)/(hvalue[i1]-hvalue[i1-1]);
-+            params[i] = s0+(d1/double(DIVIDEEDGESECTIONS))*(s1-s0);
-             pnt = c->Value(params[i]);
-             ps[i-1] = MeshPoint (Point3d(pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z()));
-             i++;
-@@ -326,6 +335,7 @@
-       (*testout) << "nedges = " << nedges << endl;
-       double eps = 1e-6 * geom.GetBoundingBox().Diam();
-+      const double eps2 = eps * eps; // -- small optimization
-       for (int i = 1; i <= nvertices; i++)
-       {
-@@ -335,7 +345,8 @@
-          bool exists = 0;
-          if (merge_solids)
-             for (PointIndex pi = 1; pi <= mesh.GetNP(); pi++)
--               if ( Dist2 (mesh[pi], Point<3>(mp)) < eps*eps)
-+               //if ( Dist2 (mesh[pi], Point<3>(mp)) < eps*eps)              
-+               if ( Dist2 (mesh[pi], Point<3>(mp)) < eps2 ) // -- small optimization
-                {
-                   exists = 1;
-                   break;
-@@ -365,6 +376,7 @@
-          {
-             TopoDS_Face face = TopoDS::Face(exp1.Current());
-             int facenr = geom.fmap.FindIndex(face);
-+            if ( facenr < 1 ) continue; // -- to support SALOME sub-meshes
-             if (face2solid[0][facenr-1] == 0)
-                face2solid[0][facenr-1] = solidnr;
-@@ -384,6 +396,7 @@
-       int facenr = 0;
-       int edgenr = 0;
-+      edgenr = mesh.GetNSeg(); // to support SALOME sub-meshes
-       (*testout) << "faces = " << geom.fmap.Extent() << endl;
-       int curr = 0;
-@@ -445,6 +458,7 @@
-                   //(*testout) << "ignoring degenerated edge" << endl;
-                   continue;
-                }
-+               if ( geom.emap.FindIndex(edge) < 1 ) continue; // to support SALOME sub-meshes
-                if (geom.vmap.FindIndex(TopExp::FirstVertex (edge)) ==
-                   geom.vmap.FindIndex(TopExp::LastVertex (edge)))
-@@ -482,15 +496,64 @@
-                }
-                else
-                {
--                  Point<3> fp = occ2ng (BRep_Tool::Pnt (TopExp::FirstVertex (edge)));
--                  Point<3> lp = occ2ng (BRep_Tool::Pnt (TopExp::LastVertex (edge)));
-+                 TopoDS_Iterator vIt( edge, false );
-+                 TopoDS_Vertex v1 = TopoDS::Vertex( vIt.Value() ); vIt.Next();
-+                 TopoDS_Vertex v2 = TopoDS::Vertex( vIt.Value() );
-+                 if ( v1.Orientation() == TopAbs_REVERSED )
-+                   std::swap( v1, v2 );
-+                 const bool isClosedEdge = v1.IsSame( v2 );
-+                 
-+                  Point<3> fp = occ2ng (BRep_Tool::Pnt (v1));
-+                  Point<3> lp = occ2ng (BRep_Tool::Pnt (v2));
-+                  double tol2 = std::min( eps*eps, 1e-6 * Dist2( fp, lp ));
-+                  if ( isClosedEdge )
-+                    tol2 = BRep_Tool::Tolerance( v1 ) * BRep_Tool::Tolerance( v1 );
-                   pnums[0] = -1;
-                   pnums.Last() = -1;
-                   for (PointIndex pi = 1; pi < first_ep; pi++)
-                   {
--                     if (Dist2 (mesh[pi], fp) < eps*eps) pnums[0] = pi;
--                     if (Dist2 (mesh[pi], lp) < eps*eps) pnums.Last() = pi;
-+                    if (Dist2 (mesh[pi], fp) < tol2) pnums[0] = pi;
-+                    if (Dist2 (mesh[pi], lp) < tol2) pnums.Last() = pi;
-+                  }
-+                  if (( isClosedEdge && pnums[0] != pnums.Last() ) ||
-+                      ( !isClosedEdge && pnums[0] == pnums.Last() ))
-+                    pnums[0] = pnums.Last() = -1;
-+                  if ( pnums[0] == -1 || pnums.Last() == -1 )
-+                  {
-+                    // take into account a possible large gap between a vertex and an edge curve
-+                    // end and a large vertex tolerance covering the whole edge
-+                    if ( pnums[0] == -1 )
-+                    {
-+                      double tol = BRep_Tool::Tolerance( v1 );
-+                      for (PointIndex pi = 1; pi < first_ep; pi++)
-+                        if (pi != pnums.Last() && Dist2 (mesh[pi], fp) < 2*tol*tol)
-+                          pnums[0] = pi;
-+
-+                      if ( pnums[0] == -1 )
-+                        pnums[0] = first_ep-1- nvertices + geom.vmap.FindIndex ( v1 );
-+                    }
-+                    if ( isClosedEdge )
-+                    {
-+                      pnums.Last() = pnums[0];
-+                    }
-+                    else
-+                    {
-+                      if ( pnums.Last() == -1 )
-+                      {
-+                        double tol = BRep_Tool::Tolerance( v2 );
-+                        for (PointIndex pi = 1; pi < first_ep; pi++)
-+                          if (pi != pnums[0] && Dist2 (mesh[pi], lp) < 2*tol*tol)
-+                            pnums.Last() = pi;
-+
-+                        if ( pnums.Last() == -1 )
-+                          pnums.Last() = first_ep-1-nvertices + geom.vmap.FindIndex ( v2 );
-+                      }
-+
-+                      if ( Dist2( fp, mesh[PointIndex(pnums[0])]) >
-+                           Dist2( lp, mesh[PointIndex(pnums.Last())]))
-+                      std::swap( pnums[0], pnums.Last() );
-+                    }
-                   }
-                }
-@@ -1458,3 +1521,4 @@
- }
- #endif
-+
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occgeom.cpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occgeom.cpp   2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occgeom.cpp        2013-02-21 17:46:13.000000000 +0400
-@@ -8,6 +8,8 @@
- #include "ShapeAnalysis_CheckSmallFace.hxx"
- #include "ShapeAnalysis_DataMapOfShapeListOfReal.hxx"
- #include "ShapeAnalysis_Surface.hxx"
-+#include <BRepTopAdaptor_FClass2d.hxx> // -- to optimize Project() and FastProject()
-+#include <TopAbs_State.hxx>
- #include "BRepAlgoAPI_Fuse.hxx"
- #include "BRepCheck_Analyzer.hxx"
- #include "BRepLib.hxx"
-@@ -16,10 +18,17 @@
- #include "ShapeFix_FixSmallFace.hxx"
- #include "Partition_Spliter.hxx"
--
- namespace netgen
- {
--   void OCCGeometry :: PrintNrShapes ()
-+  // free data used to optimize Project() and FastProject()
-+  OCCGeometry::~OCCGeometry()
-+  {
-+    NCollection_DataMap<int,BRepTopAdaptor_FClass2d*>::Iterator it(fclsmap);
-+    for (; it.More(); it.Next())
-+      delete it.Value();
-+  }
-+
-+  void OCCGeometry :: PrintNrShapes ()
-    {
-       TopExp_Explorer e;
-       int count = 0;
-@@ -951,25 +960,58 @@
-    }
-+   // returns a projector and a classifier for the given surface
-+   void OCCGeometry::GetFaceTools(int surfi, Handle(ShapeAnalysis_Surface)& proj,
-+                                  BRepTopAdaptor_FClass2d*& cls) const
-+   {
-+     //MSV: organize caching projector in the map
-+     if (fprjmap.IsBound(surfi))
-+     {
-+       proj = fprjmap.Find(surfi);
-+       cls = fclsmap.Find(surfi);
-+     }
-+     else
-+     {
-+       const TopoDS_Face& aFace = TopoDS::Face(fmap(surfi));
-+       Handle(Geom_Surface) aSurf = BRep_Tool::Surface(aFace);
-+       proj = new ShapeAnalysis_Surface(aSurf);
-+       fprjmap.Bind(surfi, proj);
-+       cls = new BRepTopAdaptor_FClass2d(aFace,Precision::Confusion());
-+       fclsmap.Bind(surfi, cls);
-+     }
-+   }
--
--   void OCCGeometry :: Project (int surfi, Point<3> & p) const
-+   // void OCCGeometry :: Project (int surfi, Point<3> & p) const
-+   bool OCCGeometry :: Project (int surfi, Point<3> & p, double& u, double& v) const
-    {
-       static int cnt = 0;
-       if (++cnt % 1000 == 0) cout << "Project cnt = " << cnt << endl;
-       gp_Pnt pnt(p(0), p(1), p(2));
--      double u,v;
--      Handle( Geom_Surface ) thesurf = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
--      Handle( ShapeAnalysis_Surface ) su = new ShapeAnalysis_Surface( thesurf );
--      gp_Pnt2d suval = su->ValueOfUV ( pnt, BRep_Tool::Tolerance( TopoDS::Face(fmap(surfi)) ) );
--      suval.Coord( u, v);
--      pnt = thesurf->Value( u, v );
--
--
-+      // -- Optimization: use cached projector and classifier
-+      // double u,v;
-+      // Handle( Geom_Surface ) thesurf = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
-+      // Handle( ShapeAnalysis_Surface ) su = new ShapeAnalysis_Surface( thesurf );
-+      // gp_Pnt2d suval = su->ValueOfUV ( pnt, BRep_Tool::Tolerance( TopoDS::Face(fmap(surfi)) ) );
-+      // suval.Coord( u, v);
-+      // pnt = thesurf->Value( u, v );  
-+
-+      Handle(ShapeAnalysis_Surface) proj;
-+      BRepTopAdaptor_FClass2d *cls;
-+      GetFaceTools(surfi, proj, cls);
-+  
-+      gp_Pnt2d p2d = proj->ValueOfUV(pnt, Precision::Confusion());
-+      if (cls->Perform(p2d) == TopAbs_OUT)
-+      {
-+        return false;
-+      }
-+      pnt = proj->Value(p2d);
-+      p2d.Coord(u, v);
-+  
-       p = Point<3> (pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z());
-+      return true;
-    }
-@@ -979,54 +1021,69 @@
-    {
-       gp_Pnt p(ap(0), ap(1), ap(2));
--      Handle(Geom_Surface) surface = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
--
--      gp_Pnt x = surface->Value (u,v);
--
--      if (p.SquareDistance(x) <= sqr(PROJECTION_TOLERANCE)) return true;
--
--      gp_Vec du, dv;
--
--      surface->D1(u,v,x,du,dv);
--
--      int count = 0;
--
--      gp_Pnt xold;
--      gp_Vec n;
--      double det, lambda, mu;
--
--      do {
--         count++;
--
--         n = du^dv;
--
--         det = Det3 (n.X(), du.X(), dv.X(),
--            n.Y(), du.Y(), dv.Y(),
--            n.Z(), du.Z(), dv.Z());
--
--         if (det < 1e-15) return false;
--
--         lambda = Det3 (n.X(), p.X()-x.X(), dv.X(),
--            n.Y(), p.Y()-x.Y(), dv.Y(),
--            n.Z(), p.Z()-x.Z(), dv.Z())/det;
--
--         mu     = Det3 (n.X(), du.X(), p.X()-x.X(),
--            n.Y(), du.Y(), p.Y()-x.Y(),
--            n.Z(), du.Z(), p.Z()-x.Z())/det;
--
--         u += lambda;
--         v += mu;
--
--         xold = x;
--         surface->D1(u,v,x,du,dv);
--
--      } while (xold.SquareDistance(x) > sqr(PROJECTION_TOLERANCE) && count < 50);
--
--      //    (*testout) << "FastProject count: " << count << endl;
--
--      if (count == 50) return false;
--
--      ap = Point<3> (x.X(), x.Y(), x.Z());
-+      // -- Optimization: use cached projector and classifier
-+      // Handle(Geom_Surface) surface = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
-+      // 
-+      // gp_Pnt x = surface->Value (u,v);
-+      // 
-+      // if (p.SquareDistance(x) <= sqr(PROJECTION_TOLERANCE)) return true;
-+      // 
-+      // gp_Vec du, dv;
-+      // 
-+      // surface->D1(u,v,x,du,dv);
-+      // 
-+      // int count = 0;
-+      // 
-+      // gp_Pnt xold;
-+      // gp_Vec n;
-+      // double det, lambda, mu;
-+      // 
-+      // do {
-+      //    count++;
-+      // 
-+      //    n = du^dv;
-+      // 
-+      //    det = Det3 (n.X(), du.X(), dv.X(),
-+      //       n.Y(), du.Y(), dv.Y(),
-+      //       n.Z(), du.Z(), dv.Z());
-+      // 
-+      //    if (det < 1e-15) return false;
-+      // 
-+      //    lambda = Det3 (n.X(), p.X()-x.X(), dv.X(),
-+      //       n.Y(), p.Y()-x.Y(), dv.Y(),
-+      //       n.Z(), p.Z()-x.Z(), dv.Z())/det;
-+      // 
-+      //    mu     = Det3 (n.X(), du.X(), p.X()-x.X(),
-+      //       n.Y(), du.Y(), p.Y()-x.Y(),
-+      //       n.Z(), du.Z(), p.Z()-x.Z())/det;
-+      // 
-+      //    u += lambda;
-+      //    v += mu;
-+      // 
-+      //    xold = x;
-+      //    surface->D1(u,v,x,du,dv);
-+      // 
-+      // } while (xold.SquareDistance(x) > sqr(PROJECTION_TOLERANCE) && count < 50);
-+      // 
-+      // //    (*testout) << "FastProject count: " << count << endl;
-+      // 
-+      // if (count == 50) return false;
-+      // 
-+      // ap = Point<3> (x.X(), x.Y(), x.Z());
-+      Handle(ShapeAnalysis_Surface) proj;
-+      BRepTopAdaptor_FClass2d *cls;
-+      GetFaceTools(surfi, proj, cls);
-+    
-+      gp_Pnt2d p2d = proj->NextValueOfUV(gp_Pnt2d(u,v), p, Precision::Confusion());
-+      if (cls->Perform(p2d) == TopAbs_OUT)
-+      {
-+        //cout << "Projection fails" << endl;
-+        return false;
-+      }
-+    
-+      p = proj->Value(p2d);
-+      p2d.Coord(u, v);
-+      ap = Point<3> (p.X(), p.Y(), p.Z());
-       return true;
-    }
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occgeom.hpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occgeom.hpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occgeom.hpp   2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occgeom.hpp        2013-02-21 17:46:13.000000000 +0400
-@@ -15,8 +15,8 @@
- #include "Geom_Curve.hxx"
- #include "Geom2d_Curve.hxx"
- #include "Geom_Surface.hxx"
--#include "GeomAPI_ProjectPointOnSurf.hxx"
--#include "GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx"
-+// #include "GeomAPI_ProjectPointOnSurf.hxx"
-+// #include "GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx"
- #include "BRepTools.hxx"
- #include "TopExp.hxx"
- #include "BRepBuilderAPI_MakeVertex.hxx"
-@@ -42,8 +42,8 @@
- #include "Geom_Curve.hxx"
- #include "Geom2d_Curve.hxx"
- #include "Geom_Surface.hxx"
--#include "GeomAPI_ProjectPointOnSurf.hxx"
--#include "GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx"
-+// #include "GeomAPI_ProjectPointOnSurf.hxx"
-+// #include "GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx"
- #include "TopoDS_Wire.hxx"
- #include "BRepTools_WireExplorer.hxx"
- #include "BRepTools.hxx"
-@@ -68,7 +68,7 @@
- #include "IGESToBRep_Reader.hxx"
- #include "Interface_Static.hxx"
- #include "GeomAPI_ExtremaCurveCurve.hxx"
--#include "Standard_ErrorHandler.hxx"
-+//#include "Standard_ErrorHandler.hxx"
- #include "Standard_Failure.hxx"
- #include "ShapeUpgrade_ShellSewing.hxx"
- #include "ShapeFix_Shape.hxx"
-@@ -80,6 +80,10 @@
- #include "ShapeAnalysis.hxx"
- #include "ShapeBuild_ReShape.hxx"
-+// -- Optimization: to use cached projector and classifier
-+#include <NCollection_DataMap.hxx>
-+class Handle_ShapeAnalysis_Surface;
-+class BRepTopAdaptor_FClass2d;
- // Philippose - 29/01/2009
- // OpenCascade XDE Support
-@@ -192,6 +196,9 @@
-    class OCCGeometry : public NetgenGeometry
-    {
-       Point<3> center;
-+      // -- Optimization: to use cached projector and classifier
-+      mutable NCollection_DataMap<int,Handle_ShapeAnalysis_Surface> fprjmap;
-+      mutable NCollection_DataMap<int,BRepTopAdaptor_FClass2d*> fclsmap;
-    public:
-       TopoDS_Shape shape;
-@@ -247,6 +254,8 @@
-      virtual void Save (string filename) const;
-+      ~OCCGeometry();      // -- to free cached projector and classifier
-+
-       void BuildFMap();
-       Box<3> GetBoundingBox()
-@@ -266,9 +275,14 @@
-       Point<3> Center()
-       {  return center;}
--      void Project (int surfi, Point<3> & p) const;
-+      // void Project (int surfi, Point<3> & p) const; -- optimization
-+      bool Project (int surfi, Point<3> & p, double& u, double& v) const;
-       bool FastProject (int surfi, Point<3> & ap, double& u, double& v) const;
-+      // -- Optimization: to use cached projector and classifier
-+      void GetFaceTools(int surfi, Handle(ShapeAnalysis_Surface)& proj,
-+                        BRepTopAdaptor_FClass2d*& cls) const;
-+
-       OCCSurface GetSurface (int surfi)
-       {
-          cout << "OCCGeometry::GetSurface using PLANESPACE" << endl;
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp       2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp    2013-02-25 13:27:49.000000000 +0400
-@@ -6,6 +6,7 @@
- #include <meshing.hpp>
- #include <GeomLProp_SLProps.hxx>
- #include <ShapeAnalysis_Surface.hxx>
-+#include <GeomAPI_ProjectPointOnCurve.hxx> // -- moved here from occgeom.hpp
- namespace netgen
-@@ -434,23 +435,33 @@
-   void MeshOptimize2dOCCSurfaces :: ProjectPoint (INDEX surfind, Point<3> & p) const
-   {
--    geometry.Project (surfind, p);
-+    // geometry.Project (surfind, p); -- signature of Project() changed for optimization
-+    double u, v;
-+    geometry.Project (surfind, p, u, v);
-   }
-   int MeshOptimize2dOCCSurfaces :: ProjectPointGI (INDEX surfind, Point<3> & p, PointGeomInfo & gi) const
-   {
--    double u = gi.u;
--    double v = gi.v;
-+    //double u = gi.u;
-+    //double v = gi.v;
-     Point<3> hp = p;
--    if (geometry.FastProject (surfind, hp, u, v))
--      {
--      p = hp;
--      return 1;
--      }
--    ProjectPoint (surfind, p); 
--    return CalcPointGeomInfo (surfind, gi, p); 
-+    // -- u and v are computed by FastProject() and Project(), no need to call CalcPointGeomInfo()
-+    // if (geometry.FastProject (surfind, hp, u, v))
-+    //   {
-+    //    p = hp;
-+    //    return 1;
-+    //   }
-+    // ProjectPoint (surfind, p); 
-+    // return CalcPointGeomInfo (surfind, gi, p); 
-+    bool ok;
-+    if (gi.trignum > 0)
-+      ok = geometry.FastProject (surfind, hp, gi.u, gi.v);
-+    else
-+      ok = geometry.Project (surfind, hp, gi.u, gi.v);
-+    p = hp;
-+    return ok;
-   }
-@@ -680,7 +691,8 @@
-       if (!geometry.FastProject (surfi, hnewp, u, v))
-         {
-         //  cout << "Fast projection to surface fails! Using OCC projection" << endl;
--          geometry.Project (surfi, hnewp);
-+          // geometry.Project (surfi, hnewp); -- Project() changed for optimization
-+          geometry.Project (surfi, hnewp, u, v);
-         }
-       newgi.trignum = 1;
-@@ -689,7 +701,7 @@
-       }
-   
-     newp = hnewp;
--  }
-+  }//; -- to compile with -Wall -pedantic
-   void OCCRefinementSurfaces :: 
-@@ -708,14 +720,18 @@
-     hnewp = Point<3> (pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z());
-     newp = hnewp;
-     newgi = ap1;
--  };
-+  }
-   void OCCRefinementSurfaces :: ProjectToSurface (Point<3> & p, int surfi) const
-   {
-     if (surfi > 0)
--      geometry.Project (surfi, p);
--  };
-+    // geometry.Project (surfi, p); -- Project() changed for optimization
-+    {
-+      double u, v;
-+      geometry.Project (surfi, p, u, v);
-+    }
-+  }//; -- to compile with -Wall -pedantic
-   void OCCRefinementSurfaces :: ProjectToSurface (Point<3> & p, int surfi, PointGeomInfo & gi) const
-   {
-@@ -723,9 +739,10 @@
-       if (!geometry.FastProject (surfi, p, gi.u, gi.v))
-       {
-         cout << "Fast projection to surface fails! Using OCC projection" << endl;
--        geometry.Project (surfi, p);
-+          double u, v;
-+        geometry.Project (surfi, p, u, v);
-       }
--  };
-+  }
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/utilities.h netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/utilities.h
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/occ/utilities.h   2012-11-09 19:15:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/occ/utilities.h        2013-02-21 17:47:08.000000000 +0400
-@@ -33,6 +33,7 @@
- #include <string>
- #include <iostream>
-+#include <iomanip>
- #include <cstdlib>
- // #include "SALOME_Log.hxx"
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/libsrc/stlgeom/stlgeommesh.cpp netgen-5.0.0.patched/libsrc/stlgeom/stlgeommesh.cpp
---- netgen-5.0.0.orig/libsrc/stlgeom/stlgeommesh.cpp   2012-11-09 19:15:04.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/libsrc/stlgeom/stlgeommesh.cpp        2013-02-21 17:52:07.000000000 +0400
-@@ -1435,7 +1435,8 @@
-         /*
-         if (!optstring || strlen(optstring) == 0)
-           {
--            mparam.optimize2d = "smcm";
-+            //mparam.optimize2d = (char*)"smcm";
-+              mparam.optimize2d = (char*)"smcm";
-           }
-         else
-           {
-@@ -1453,7 +1454,7 @@
-             mesh -> LoadLocalMeshSize (mparam.meshsizefilename);            
-             mesh -> CalcLocalHFromSurfaceCurvature (mparam.grading, 
-                                                     stlparam.resthsurfmeshcurvfac);
--            mparam.optimize2d = "cmsmSm";
-+            mparam.optimize2d = "(char*)cmsmSm";
-             STLSurfaceOptimization (*stlgeometry, *mesh, mparam);
- #ifdef STAT_STREAM
-             (*statout) << GetTime() << " & ";
-@@ -1560,7 +1561,8 @@
-         /*
-         if (!optstring || strlen(optstring) == 0)
-           {
--            mparam.optimize3d = "cmdmstm";
-+              //mparam.optimize3d = "cmdmstm";
-+            mparam.optimize3d = (char*)"cmdmstm";
-           }
-         else
-           {
-diff -Naur --exclude=CVS netgen-5.0.0.orig/nglib/nglib.h netgen-5.0.0.patched/nglib/nglib.h
---- netgen-5.0.0.orig/nglib/nglib.h    2012-11-09 19:15:00.000000000 +0400
-+++ netgen-5.0.0.patched/nglib/nglib.h 2013-02-21 17:47:08.000000000 +0400
-@@ -24,7 +24,7 @@
- // Philippose - 14.02.2009
- // Modifications for creating a DLL in Windows
- #ifdef WIN32
--   #ifdef NGLIB_EXPORTS || nglib_EXPORTS
-+   #if defined NGLIB_EXPORTS || defined nglib_EXPORTS
-       #define DLL_HEADER   __declspec(dllexport)
-    #else
-       #define DLL_HEADER   __declspec(dllimport)
index ccd4e8c93a10df652300e72a1eec875fafb0b4bc..49d4a6d2882c0a810388ef49f1f6badec64fc417 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/Makefile.am netgen-5.3.1_new/Makefile.am
---- netgen-5.3.1_orig/Makefile.am      2016-10-21 17:32:01.000000000 +0300
-+++ netgen-5.3.1_new/Makefile.am       2016-10-21 17:31:54.000000000 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/Makefile.am netgen-5.3.1_SRC_modif/Makefile.am
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/Makefile.am  2014-08-29 13:55:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/Makefile.am 2017-09-11 18:08:21.217313702 +0300
 @@ -2,7 +2,7 @@
  
  METASOURCES = AUTO
@@ -10,9 +10,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/Makefile.am netgen-5.3.1_new/Makefile.am
  
  # TESTS = ng/netgen -batchmode
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/Makefile.in netgen-5.3.1_new/Makefile.in
---- netgen-5.3.1_orig/Makefile.in      2014-10-06 15:04:37.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/Makefile.in       2016-10-03 16:17:10.164707368 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/Makefile.in netgen-5.3.1_SRC_modif/Makefile.in
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/Makefile.in  2014-10-06 15:04:37.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/Makefile.in 2017-09-11 18:08:21.225312838 +0300
 @@ -280,7 +280,7 @@
  top_srcdir = @top_srcdir@
  ACLOCAL_AMFLAGS = -I m4
@@ -22,9 +22,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/Makefile.in netgen-5.3.1_new/Makefile.in
  all: config.h
        $(MAKE) $(AM_MAKEFLAGS) all-recursive
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/configure.ac netgen-5.3.1_new/configure.ac
---- netgen-5.3.1_orig/configure.ac     2014-10-06 15:00:17.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/configure.ac      2016-09-29 14:34:11.957389447 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/configure.ac netgen-5.3.1_SRC_modif/configure.ac
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/configure.ac 2014-10-06 15:00:17.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/configure.ac        2017-09-11 18:08:21.226312730 +0300
 @@ -20,7 +20,7 @@
  CXXFLAGS="$CXXFLAGS $OPENMP_CXXFLAGS"
  # LDFLAGS="$LDFLAGS $OPENMP_CXXFLAGS"
@@ -45,9 +45,98 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/configure.ac netgen-5.3.1_new/configure.ac
  
  #  -lTKDCAF
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/findip.hpp netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/findip.hpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/findip.hpp        2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/findip.hpp 2016-09-30 20:38:56.662234111 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/csg/Makefile.am netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/csg/Makefile.am
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/csg/Makefile.am       2014-08-29 13:54:06.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/csg/Makefile.am      2017-09-11 18:08:21.234311865 +0300
+@@ -8,7 +8,7 @@
+ AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/libsrc/include  $(TCL_INCLUDES)
+ METASOURCES = AUTO
+-lib_LTLIBRARIES = libcsg.la
++noinst_LTLIBRARIES = libcsg.la
+ libcsg_la_SOURCES = algprim.cpp brick.cpp   \
+@@ -17,12 +17,9 @@
+ manifold.cpp meshsurf.cpp polyhedra.cpp revolution.cpp singularref.cpp \
+ solid.cpp specpoin.cpp spline3d.cpp surface.cpp triapprox.cpp
+-libcsg_la_LIBADD =  $(top_builddir)/libsrc/meshing/libmesh.la
+-
+-
+ if NGGUI
+-lib_LTLIBRARIES += libcsgvis.la 
++lib_LTLIBRARIES = libcsgvis.la 
+ libcsgvis_la_SOURCES = vscsg.cpp csgpkg.cpp
+ libcsgvis_la_LIBADD = libcsg.la
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/geom2d/Makefile.am netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/geom2d/Makefile.am
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/geom2d/Makefile.am    2014-08-29 13:54:06.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/geom2d/Makefile.am   2017-09-11 18:08:21.234311865 +0300
+@@ -4,16 +4,15 @@
+ METASOURCES = AUTO
+-lib_LTLIBRARIES = libgeom2d.la 
++noinst_LTLIBRARIES = libgeom2d.la 
+ if NGGUI
+-lib_LTLIBRARIES += libgeom2dvis.la 
++lib_LTLIBRARIES = libgeom2dvis.la 
+ endif
+ libgeom2d_la_SOURCES = genmesh2d.cpp geom2dmesh.cpp geometry2d.cpp
+-libgeom2d_la_LIBADD =         $(top_builddir)/libsrc/meshing/libmesh.la
+ libgeom2dvis_la_SOURCES = geom2dpkg.cpp vsgeom2d.cpp
+ libgeom2dvis_la_LIBADD = libgeom2d.la
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/interface/Makefile.am netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/interface/Makefile.am
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/interface/Makefile.am 2014-08-29 13:54:02.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/interface/Makefile.am        2017-09-11 18:08:21.234311865 +0300
+@@ -2,14 +2,11 @@
+ AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/libsrc/include -I$(top_srcdir)/libsrc/interface  $(MPI_INCLUDES) $(TCL_INCLUDES) -DOPENGL
+ METASOURCES = AUTO
+-lib_LTLIBRARIES = libinterface.la
++noinst_LTLIBRARIES = libinterface.la
+ libinterface_la_SOURCES = nginterface.cpp nginterface_v2.cpp \
+       read_fnf_mesh.cpp readtetmesh.cpp readuser.cpp writeabaqus.cpp writediffpack.cpp \
+       writedolfin.cpp writeelmer.cpp writefeap.cpp writefluent.cpp writegmsh.cpp writejcm.cpp \
+       writepermas.cpp writetecplot.cpp writetet.cpp writetochnog.cpp writeuser.cpp \
+       wuchemnitz.cpp writegmsh2.cpp writeOpenFOAM15x.cpp 
+-
+-libinterface_la_LIBADD = $(top_builddir)/libsrc/meshing/libmesh.la
+-
+ # libinterface_la_LDFLAGS = -rdynamic
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/Makefile.am netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/Makefile.am
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/Makefile.am   2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/Makefile.am  2017-09-11 18:08:21.234311865 +0300
+@@ -15,7 +15,7 @@
+ METASOURCES = AUTO
+-lib_LTLIBRARIES = libmesh.la
++noinst_LTLIBRARIES = libmesh.la
+ libmesh_la_SOURCES = adfront2.cpp adfront3.cpp bisect.cpp boundarylayer.cpp \
+       clusters.cpp curvedelems.cpp delaunay.cpp delaunay2d.cpp            \
+@@ -30,8 +30,5 @@
+       topology.cpp triarls.cpp validate.cpp zrefine.cpp bcfunctions.cpp   \
+       parallelmesh.cpp  paralleltop.cpp  paralleltop.hpp basegeom.cpp 
+-libmesh_la_LIBADD =  $(top_builddir)/libsrc/linalg/libla.la \
+-      $(top_builddir)/libsrc/gprim/libgprim.la \
+-      $(top_builddir)/libsrc/general/libgen.la \
+-      -lz
++libmesh_la_LIBADD = -lz
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/findip.hpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/findip.hpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/findip.hpp    2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/findip.hpp   2017-09-11 18:08:21.226312730 +0300
 @@ -75,6 +75,9 @@
    static int timer = NgProfiler::CreateTimer ("FindInnerPoint");
    NgProfiler::RegionTimer reg (timer);
@@ -58,9 +147,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/findip.hpp netgen-5.3.1_new/libsrc
    Array<Vec3d> a;
    Array<double> c;
    Mat<3> m, inv;
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/improve3.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/improve3.cpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/improve3.cpp      2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/improve3.cpp       2016-10-03 16:16:57.636639300 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/improve3.cpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/improve3.cpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/improve3.cpp  2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/improve3.cpp 2017-09-11 18:08:21.227312622 +0300
 @@ -1219,6 +1219,7 @@
  
              tetused = 0;
@@ -83,9 +172,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/improve3.cpp netgen-5.3.1_new/libs
              
              bad1 = 0;
              for (int k = 0; k < nsuround; k++)
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/meshtype.cpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp      2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/meshtype.cpp       2016-09-29 14:04:51.500148293 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/meshtype.cpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp  2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/meshtype.cpp 2017-09-11 18:08:21.227312622 +0300
 @@ -1,4 +1,5 @@
  #include <mystdlib.h>
 +#include <float.h> // to get DBL_MIN defined
@@ -171,9 +260,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/meshtype.cpp netgen-5.3.1_new/libs
            err += 1e12;
          else
            {
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/meshtype.hpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp      2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/meshtype.hpp       2016-09-30 14:28:09.147575801 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/meshtype.hpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp  2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/meshing/meshtype.hpp 2017-09-11 18:08:21.228312514 +0300
 @@ -15,6 +15,7 @@
      Classes for NETGEN
    */
@@ -209,9 +298,25 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/meshtype.hpp netgen-5.3.1_new/libs
  #endif
            ;
        }
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx 2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx  2016-09-29 14:44:01.996464598 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Makefile.am netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Makefile.am
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Makefile.am       2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Makefile.am      2017-09-11 18:08:21.234311865 +0300
+@@ -14,10 +14,10 @@
+ METASOURCES = AUTO
+-lib_LTLIBRARIES = libocc.la
++noinst_LTLIBRARIES = libocc.la
+ if NGGUI
+-lib_LTLIBRARIES += liboccvis.la 
++lib_LTLIBRARIES = liboccvis.la 
+ endif
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx     2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx    2017-09-11 18:08:21.228312514 +0300
 @@ -47,9 +47,7 @@
  #include <TopOpeBRep_EdgesIntersector.hxx>
  #include <TopOpeBRep_Point2d.hxx>
@@ -222,9 +327,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.cxx netgen-5.3.1_new
  #include <TopoDS.hxx>
  #include <TopoDS_Edge.hxx>
  #include <TopoDS_Vertex.hxx>
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx 2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx  2016-09-29 14:44:01.996464598 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx     2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx    2017-09-11 18:08:21.228312514 +0300
 @@ -27,7 +27,9 @@
  #ifndef _Partition_Inter2d_HeaderFile
  #define _Partition_Inter2d_HeaderFile
@@ -252,9 +357,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter2d.hxx netgen-5.3.1_new
  class TopoDS_Edge;
  
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx 2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx  2016-09-29 14:44:02.000464619 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx     2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx    2017-09-11 18:08:21.229312406 +0300
 @@ -48,7 +48,6 @@
  #include <TopOpeBRepTool_BoxSort.hxx>
  #include <TopTools_DataMapIteratorOfDataMapOfShapeListOfShape.hxx>
@@ -272,9 +377,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.cxx netgen-5.3.1_new
    }
    if (!S->IsUPeriodic() && !S->IsVPeriodic())
      return;
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx 2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx  2016-09-29 14:44:02.000464619 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx     2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx    2017-09-11 18:08:21.229312406 +0300
 @@ -27,7 +27,9 @@
  #ifndef _Partition_Inter3d_HeaderFile
  #define _Partition_Inter3d_HeaderFile
@@ -337,9 +442,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Inter3d.hxx netgen-5.3.1_new
     TopTools_DataMapOfShapeListOfShape mySameDomainFM;
     TopTools_DataMapOfShapeShape mySameDomainVM;
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx    2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx     2016-09-29 14:44:02.000464619 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx        2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx       2017-09-11 18:08:21.229312406 +0300
 @@ -38,8 +38,6 @@
  #endif
  class TopoDS_Face;
@@ -349,9 +454,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop.hxx netgen-5.3.1_new/li
  
  #ifndef _Standard_HeaderFile
  #include <Standard.hxx>
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx  2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx   2016-09-29 14:04:51.504148314 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx      2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx     2017-09-11 18:08:21.229312406 +0300
 @@ -210,7 +210,7 @@
      Cc->D1(uc, PC, CTg1);
      if (!isForward) CTg1.Reverse();
@@ -370,9 +475,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.cxx netgen-5.3.1_new/
        {
          // an angle is too close to PI; assure that an angle sign really
          // reflects an edge position: +PI - an edge is worst,
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx  2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx   2016-09-29 14:44:02.000464619 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx      2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx     2017-09-11 18:08:21.230312298 +0300
 @@ -24,7 +24,6 @@
  #endif
  class TopoDS_Face;
@@ -381,9 +486,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop2d.hxx netgen-5.3.1_new/
  class BRepAlgo_Image;
  
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx  2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx   2016-09-29 14:44:02.000464619 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx      2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx     2017-09-11 18:08:21.230312298 +0300
 @@ -13,6 +13,9 @@
  #ifndef _TopTools_ListOfShape_HeaderFile
  #include <TopTools_ListOfShape.hxx>
@@ -403,9 +508,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Loop3d.hxx netgen-5.3.1_new/
  class TopoDS_Edge;
  class TopoDS_Face;
  class gp_Vec;
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx 2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx  2016-09-29 14:44:02.000464619 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx     2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx    2017-09-11 18:08:21.230312298 +0300
 @@ -48,7 +48,6 @@
  #include <TopTools_IndexedDataMapOfShapeListOfShape.hxx>
  #include <TopTools_IndexedMapOfShape.hxx>
@@ -414,9 +519,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.cxx netgen-5.3.1_new
  #include <TopTools_MapIteratorOfMapOfShape.hxx>
  #include <TopTools_SequenceOfShape.hxx>
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx 2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx  2016-09-29 14:44:02.004464639 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx     2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx    2017-09-11 18:08:21.231312190 +0300
 @@ -28,9 +28,6 @@
  #ifndef _TopTools_DataMapOfShapeShape_HeaderFile
  #include <TopTools_DataMapOfShapeShape.hxx>
@@ -444,9 +549,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Partition_Spliter.hxx netgen-5.3.1_new
     BRepAlgo_Image myImagesFaces;
     BRepAlgo_Image myImagesEdges;
     BRepAlgo_Image myImageShape;
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occconstruction.cpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp   2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occconstruction.cpp    2016-09-29 14:04:51.500148293 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occconstruction.cpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp       2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occconstruction.cpp      2017-09-11 18:08:21.231312190 +0300
 @@ -28,7 +28,7 @@
  #include <BRepAlgoAPI_Common.hxx>
  #include <BRepAlgoAPI_Fuse.hxx>
@@ -456,9 +561,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occconstruction.cpp netgen-5.3.1_new/l
  //#include <BRepAlgo_Sewing.hxx>
  #include <BRepOffsetAPI_MakeOffsetShape.hxx>
  #include <ShapeFix_Shape.hxx>
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occgenmesh.cpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp        2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occgenmesh.cpp 2016-09-29 14:04:51.500148293 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occgenmesh.cpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp    2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occgenmesh.cpp   2017-09-11 18:08:21.231312190 +0300
 @@ -171,8 +171,8 @@
           if(h < 1e-4*maxside)\r
              return;\r
@@ -702,9 +807,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgenmesh.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc
  \r
        mesh.CalcSurfacesOfNode();\r
        multithread.task = savetask;\r
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occgeom.cpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp   2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occgeom.cpp    2016-09-29 16:22:31.636328123 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occgeom.cpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp       2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occgeom.cpp      2017-09-11 18:08:32.836058020 +0300
 @@ -8,6 +8,8 @@
  #include "ShapeAnalysis_CheckSmallFace.hxx"\r
  #include "ShapeAnalysis_DataMapOfShapeListOfReal.hxx"\r
@@ -732,7 +837,7 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
     void OCCGeometry :: PrintNrShapes ()\r
     {\r
        TopExp_Explorer e;\r
-@@ -112,7 +121,7 @@
+@@ -112,13 +121,13 @@
        double surfacecont = 0;\r
  \r
        {\r
@@ -741,6 +846,13 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
           rebuild->Apply(shape);\r
           for (exp1.Init (shape, TopAbs_EDGE); exp1.More(); exp1.Next())\r
           {\r
+             TopoDS_Edge edge = TopoDS::Edge(exp1.Current());\r
+             if ( BRep_Tool::Degenerated(edge) )\r
+-               rebuild->Remove(edge, false);\r
++               rebuild->Remove(edge);\r
+          }\r
+          shape = rebuild->Apply(shape);\r
+       }\r
 @@ -143,7 +152,7 @@
           cout << endl << "- repairing faces" << endl;\r
  \r
@@ -750,7 +862,16 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
           rebuild->Apply(shape);\r
  \r
  \r
-@@ -200,7 +209,7 @@
+@@ -187,7 +196,7 @@
+                   cout << "(natural bounds added)" <<endl;\r
+                TopoDS_Face newface = sff->Face();\r
\r
+-               rebuild->Replace(face, newface, Standard_False);\r
++               rebuild->Replace(face, newface);\r
+             }\r
\r
+             // Set the original colour of the face to the newly created \r
+@@ -200,13 +209,13 @@
  \r
  \r
        {\r
@@ -759,6 +880,13 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
           rebuild->Apply(shape);\r
           for (exp1.Init (shape, TopAbs_EDGE); exp1.More(); exp1.Next())\r
           {\r
+             TopoDS_Edge edge = TopoDS::Edge(exp1.Current());\r
+             if ( BRep_Tool::Degenerated(edge) )\r
+-               rebuild->Remove(edge, false);\r
++               rebuild->Remove(edge);\r
+          }\r
+          shape = rebuild->Apply(shape);\r
+       }\r
 @@ -217,7 +226,7 @@
           cout << endl << "- fixing small edges" << endl;\r
  \r
@@ -768,6 +896,15 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
           rebuild->Apply(shape);\r
  \r
  \r
+@@ -270,7 +279,7 @@
+                if(replace)\r
+                {\r
+                   TopoDS_Wire newwire = sfw->Wire();\r
+-                  rebuild->Replace(oldwire, newwire, Standard_False);\r
++                  rebuild->Replace(oldwire, newwire);\r
+                }\r
\r
+                //delete sfw; sfw = NULL;\r
 @@ -284,7 +293,7 @@
  \r
           {\r
@@ -777,7 +914,16 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
              rebuild->Apply(shape);\r
  \r
              for (exp1.Init (shape, TopAbs_EDGE); exp1.More(); exp1.Next())\r
-@@ -312,7 +321,7 @@
+@@ -300,7 +309,7 @@
+                      cout << "removing degenerated edge " << emap.FindIndex(edge)\r
+                         << " from vertex " << vmap.FindIndex(TopExp::FirstVertex (edge))\r
+                         << " to vertex " << vmap.FindIndex(TopExp::LastVertex (edge)) << endl;\r
+-                     rebuild->Remove(edge, false);\r
++                     rebuild->Remove(edge);\r
+                   }\r
+                }\r
+             }\r
+@@ -312,13 +321,13 @@
  \r
  \r
           {\r
@@ -786,7 +932,14 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
              rebuild->Apply(shape);\r
              for (exp1.Init (shape, TopAbs_EDGE); exp1.More(); exp1.Next())\r
              {\r
-@@ -438,7 +447,7 @@
+                TopoDS_Edge edge = TopoDS::Edge(exp1.Current());\r
+                if ( BRep_Tool::Degenerated(edge) )\r
+-                  rebuild->Remove(edge, false);\r
++                  rebuild->Remove(edge);\r
+             }\r
+             shape = rebuild->Apply(shape);\r
+          }\r
+@@ -438,13 +447,13 @@
  \r
  \r
        {\r
@@ -795,24 +948,36 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
           rebuild->Apply(shape);\r
           for (exp1.Init (shape, TopAbs_EDGE); exp1.More(); exp1.Next())\r
           {\r
-@@ -483,7 +492,7 @@
+             TopoDS_Edge edge = TopoDS::Edge(exp1.Current());\r
+             if ( BRep_Tool::Degenerated(edge) )\r
+-               rebuild->Remove(edge, false);\r
++               rebuild->Remove(edge);\r
+          }\r
+          shape = rebuild->Apply(shape);\r
+       }\r
+@@ -483,9 +492,9 @@
                    TopoDS_Solid solid = TopoDS::Solid(exp0.Current());\r
                    TopoDS_Solid newsolid = solid;\r
                    BRepLib::OrientClosedSolid (newsolid);\r
 -                  Handle_ShapeBuild_ReShape rebuild = new ShapeBuild_ReShape;\r
 +                  Handle(ShapeBuild_ReShape) rebuild = new ShapeBuild_ReShape;
                    //            rebuild->Apply(shape);\r
-                   rebuild->Replace(solid, newsolid, Standard_False);\r
+-                  rebuild->Replace(solid, newsolid, Standard_False);\r
++                  rebuild->Replace(solid, newsolid);\r
                    TopoDS_Shape newshape = rebuild->Apply(shape, TopAbs_COMPSOLID);//, 1);\r
-@@ -906,7 +915,7 @@
+                   //            TopoDS_Shape newshape = rebuild->Apply(shape);\r
+                   shape = newshape;\r
+@@ -906,8 +915,8 @@
              TopoDS_Solid solid = TopoDS::Solid(exp0.Current());\r
              TopoDS_Solid newsolid = solid;\r
              BRepLib::OrientClosedSolid (newsolid);\r
 -            Handle_ShapeBuild_ReShape rebuild = new ShapeBuild_ReShape;\r
+-            rebuild->Replace(solid, newsolid, Standard_False);\r
 +            Handle(ShapeBuild_ReShape) rebuild = new ShapeBuild_ReShape;
-             rebuild->Replace(solid, newsolid, Standard_False);\r
++            rebuild->Replace(solid, newsolid);\r
  \r
              TopoDS_Shape newshape = rebuild->Apply(shape, TopAbs_SHAPE, 1);\r
+             shape = newshape;\r
 @@ -951,25 +960,58 @@
     }\r
  \r
@@ -854,6 +1019,7 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
 -      gp_Pnt2d suval = su->ValueOfUV ( pnt, BRep_Tool::Tolerance( TopoDS::Face(fmap(surfi)) ) );\r
 -      suval.Coord( u, v);\r
 -      pnt = thesurf->Value( u, v );\r
+-\r
 +      // -- Optimization: use cached projector and classifier
 +      // double u,v;
 +      // Handle( Geom_Surface ) thesurf = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
@@ -865,7 +1031,7 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
 +      Handle(ShapeAnalysis_Surface) proj;
 +      BRepTopAdaptor_FClass2d *cls;
 +      GetFaceTools(surfi, proj, cls);
\r
++\r
 +      gp_Pnt2d p2d = proj->ValueOfUV(pnt, Precision::Confusion());
 +      if (cls->Perform(p2d) == TopAbs_OUT)
 +      {
@@ -891,6 +1057,47 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
 -      if (p.SquareDistance(x) <= sqr(PROJECTION_TOLERANCE)) return true;\r
 -\r
 -      gp_Vec du, dv;\r
+-\r
+-      surface->D1(u,v,x,du,dv);\r
+-\r
+-      int count = 0;\r
+-\r
+-      gp_Pnt xold;\r
+-      gp_Vec n;\r
+-      double det, lambda, mu;\r
+-\r
+-      do {\r
+-         count++;\r
+-\r
+-         n = du^dv;\r
+-\r
+-         det = Det3 (n.X(), du.X(), dv.X(),\r
+-            n.Y(), du.Y(), dv.Y(),\r
+-            n.Z(), du.Z(), dv.Z());\r
+-\r
+-         if (det < 1e-15) return false;\r
+-\r
+-         lambda = Det3 (n.X(), p.X()-x.X(), dv.X(),\r
+-            n.Y(), p.Y()-x.Y(), dv.Y(),\r
+-            n.Z(), p.Z()-x.Z(), dv.Z())/det;\r
+-\r
+-         mu     = Det3 (n.X(), du.X(), p.X()-x.X(),\r
+-            n.Y(), du.Y(), p.Y()-x.Y(),\r
+-            n.Z(), du.Z(), p.Z()-x.Z())/det;\r
+-\r
+-         u += lambda;\r
+-         v += mu;\r
+-\r
+-         xold = x;\r
+-         surface->D1(u,v,x,du,dv);\r
+-\r
+-      } while (xold.SquareDistance(x) > sqr(PROJECTION_TOLERANCE) && count < 50);\r
+-\r
+-      //    (*testout) << "FastProject count: " << count << endl;\r
+-\r
+-      if (count == 50) return false;\r
+-\r
+-      ap = Point<3> (x.X(), x.Y(), x.Z());\r
 +      // -- Optimization: use cached projector and classifier
 +      // Handle(Geom_Surface) surface = BRep_Tool::Surface(TopoDS::Face(fmap(surfi)));
 +      // 
@@ -943,53 +1150,14 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
 +      Handle(ShapeAnalysis_Surface) proj;
 +      BRepTopAdaptor_FClass2d *cls;
 +      GetFaceTools(surfi, proj, cls);
\r
--      surface->D1(u,v,x,du,dv);\r
--\r
--      int count = 0;\r
--\r
--      gp_Pnt xold;\r
--      gp_Vec n;\r
--      double det, lambda, mu;\r
--\r
--      do {\r
--         count++;\r
--\r
--         n = du^dv;\r
--\r
--         det = Det3 (n.X(), du.X(), dv.X(),\r
--            n.Y(), du.Y(), dv.Y(),\r
--            n.Z(), du.Z(), dv.Z());\r
--\r
--         if (det < 1e-15) return false;\r
--\r
--         lambda = Det3 (n.X(), p.X()-x.X(), dv.X(),\r
--            n.Y(), p.Y()-x.Y(), dv.Y(),\r
--            n.Z(), p.Z()-x.Z(), dv.Z())/det;\r
--\r
--         mu     = Det3 (n.X(), du.X(), p.X()-x.X(),\r
--            n.Y(), du.Y(), p.Y()-x.Y(),\r
--            n.Z(), du.Z(), p.Z()-x.Z())/det;\r
--\r
--         u += lambda;\r
--         v += mu;\r
--\r
--         xold = x;\r
--         surface->D1(u,v,x,du,dv);\r
--\r
--      } while (xold.SquareDistance(x) > sqr(PROJECTION_TOLERANCE) && count < 50);\r
--\r
--      //    (*testout) << "FastProject count: " << count << endl;\r
--\r
--      if (count == 50) return false;\r
++\r
 +      gp_Pnt2d p2d = proj->NextValueOfUV(gp_Pnt2d(u,v), p, Precision::Confusion());
 +      if (cls->Perform(p2d) == TopAbs_OUT)
 +      {
 +        //cout << "Projection fails" << endl;
 +        return false;
 +      }
\r
--      ap = Point<3> (x.X(), x.Y(), x.Z());\r
++\r
 +      p = proj->Value(p2d);
 +      p2d.Coord(u, v);
 +      ap = Point<3> (p.X(), p.Y(), p.Z());
@@ -1065,9 +1233,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
        occgeo->face_colours.Nullify();\r
        occgeo->changed = 1;\r
        occgeo->BuildFMap();\r
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.hpp netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occgeom.hpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.hpp   2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occgeom.hpp    2016-09-29 14:44:01.996464598 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occgeom.hpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occgeom.hpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occgeom.hpp       2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occgeom.hpp      2017-09-11 18:08:21.233311974 +0300
 @@ -15,8 +15,8 @@
  #include "Geom_Curve.hxx"\r
  #include "Geom2d_Curve.hxx"\r
@@ -1162,9 +1330,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occgeom.hpp netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
        OCCSurface GetSurface (int surfi)\r
        {\r
           cout << "OCCGeometry::GetSurface using PLANESPACE" << endl;\r
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp       2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp        2016-09-29 14:08:00.045144560 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp   2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp  2017-09-11 18:08:21.233311974 +0300
 @@ -6,6 +6,7 @@
  #include <meshing.hpp>
  #include <GeomLProp_SLProps.hxx>
@@ -1192,7 +1360,7 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.3.1_new/libsr
      if(glob_testout)
        {
        (*testout) << "u " << geominfo.u << " v " << geominfo.v 
-@@ -434,23 +435,33 @@
+@@ -434,23 +438,33 @@
  
    void MeshOptimize2dOCCSurfaces :: ProjectPoint (INDEX surfind, Point<3> & p) const
    {
@@ -1235,7 +1403,7 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.3.1_new/libsr
    }
  
  
-@@ -680,7 +691,8 @@
+@@ -680,7 +694,8 @@
        if (!geometry.FastProject (surfi, hnewp, u, v))
          {
          //  cout << "Fast projection to surface fails! Using OCC projection" << endl;
@@ -1245,7 +1413,7 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.3.1_new/libsr
          }
  
        newgi.trignum = 1;
-@@ -689,7 +701,7 @@
+@@ -689,7 +704,7 @@
        }
    
      newp = hnewp;
@@ -1254,7 +1422,7 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.3.1_new/libsr
  
  
    void OCCRefinementSurfaces :: 
-@@ -708,14 +720,18 @@
+@@ -708,14 +723,18 @@
      hnewp = Point<3> (pnt.X(), pnt.Y(), pnt.Z());
      newp = hnewp;
      newgi = ap1;
@@ -1276,7 +1444,7 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.3.1_new/libsr
  
    void OCCRefinementSurfaces :: ProjectToSurface (Point<3> & p, int surfi, PointGeomInfo & gi) const
    {
-@@ -723,9 +739,10 @@
+@@ -723,9 +742,10 @@
        if (!geometry.FastProject (surfi, p, gi.u, gi.v))
        {
          cout << "Fast projection to surface fails! Using OCC projection" << endl;
@@ -1289,9 +1457,21 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/occmeshsurf.cpp netgen-5.3.1_new/libsr
  
  
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/utilities.h netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/utilities.h
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/utilities.h   2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/utilities.h    2016-09-29 14:04:51.504148314 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occpkg.cpp netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occpkg.cpp
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/occpkg.cpp        2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/occpkg.cpp       2017-09-11 18:08:32.837057913 +0300
+@@ -485,7 +485,7 @@
+                 if (strcmp (argv[2], "Wire") == 0) sh = occgeometry->wmap(nr);\r
+                 if (strcmp (argv[2], "Edge") == 0) sh = occgeometry->emap(nr);\r
\r
+-                rebuild->Replace(sh, sh.Reversed(), Standard_False);\r
++                rebuild->Replace(sh, sh.Reversed());\r
\r
+                 TopoDS_Shape newshape = rebuild->Apply(occgeometry->shape, TopAbs_SHELL, 1);\r
+                 occgeometry->shape = newshape;\r
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/utilities.h netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/utilities.h
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/occ/utilities.h       2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/occ/utilities.h      2017-09-11 18:08:21.233311974 +0300
 @@ -33,6 +33,7 @@
  
  #include <string>
@@ -1300,126 +1480,9 @@ diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/utilities.h netgen-5.3.1_new/libsrc/oc
  #include <cstdlib>
  // #include "SALOME_Log.hxx"
  
-diff -NaurwB netgen-5.3.1_orig/nglib/nglib.h netgen-5.3.1_new/nglib/nglib.h
---- netgen-5.3.1_orig/nglib/nglib.h    2014-08-29 13:54:00.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/nglib/nglib.h     2016-09-29 14:04:51.504148314 +0300
-@@ -24,7 +24,7 @@
- // Philippose - 14.02.2009\r
- // Modifications for creating a DLL in Windows\r
- #ifdef WIN32\r
--   #ifdef NGLIB_EXPORTS || nglib_EXPORTS\r
-+   #if defined NGLIB_EXPORTS || defined nglib_EXPORTS
-       #define DLL_HEADER   __declspec(dllexport)\r
-    #else\r
-       #define DLL_HEADER   __declspec(dllimport)\r
-diff -Naur netgen-5.3.1_orig/libsrc/csg/Makefile.am netgen-5.3.1_new/libsrc/csg/Makefile.am
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/csg/Makefile.am   2014-08-29 13:54:06.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/csg/Makefile.am    2016-11-08 17:48:02.000000000 +0300
-@@ -8,7 +8,7 @@
- AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/libsrc/include  $(TCL_INCLUDES)
- METASOURCES = AUTO
--lib_LTLIBRARIES = libcsg.la
-+noinst_LTLIBRARIES = libcsg.la
- libcsg_la_SOURCES = algprim.cpp brick.cpp   \
-@@ -17,12 +17,9 @@
- manifold.cpp meshsurf.cpp polyhedra.cpp revolution.cpp singularref.cpp \
- solid.cpp specpoin.cpp spline3d.cpp surface.cpp triapprox.cpp
--libcsg_la_LIBADD =  $(top_builddir)/libsrc/meshing/libmesh.la
--
--
- if NGGUI
--lib_LTLIBRARIES += libcsgvis.la 
-+lib_LTLIBRARIES = libcsgvis.la 
- libcsgvis_la_SOURCES = vscsg.cpp csgpkg.cpp
- libcsgvis_la_LIBADD = libcsg.la
-diff -Naur netgen-5.3.1_orig/libsrc/geom2d/Makefile.am netgen-5.3.1_new/libsrc/geom2d/Makefile.am
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/geom2d/Makefile.am        2014-08-29 13:54:06.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/geom2d/Makefile.am 2016-11-08 17:49:13.000000000 +0300
-@@ -4,16 +4,15 @@
- METASOURCES = AUTO
--lib_LTLIBRARIES = libgeom2d.la 
-+noinst_LTLIBRARIES = libgeom2d.la 
- if NGGUI
--lib_LTLIBRARIES += libgeom2dvis.la 
-+lib_LTLIBRARIES = libgeom2dvis.la 
- endif
- libgeom2d_la_SOURCES = genmesh2d.cpp geom2dmesh.cpp geometry2d.cpp
--libgeom2d_la_LIBADD =         $(top_builddir)/libsrc/meshing/libmesh.la
- libgeom2dvis_la_SOURCES = geom2dpkg.cpp vsgeom2d.cpp
- libgeom2dvis_la_LIBADD = libgeom2d.la
-diff -Naur netgen-5.3.1_orig/libsrc/interface/Makefile.am netgen-5.3.1_new/libsrc/interface/Makefile.am
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/interface/Makefile.am     2014-08-29 13:54:02.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/interface/Makefile.am      2016-11-08 17:49:26.000000000 +0300
-@@ -2,14 +2,11 @@
- AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/libsrc/include -I$(top_srcdir)/libsrc/interface  $(MPI_INCLUDES) $(TCL_INCLUDES) -DOPENGL
- METASOURCES = AUTO
--lib_LTLIBRARIES = libinterface.la
-+noinst_LTLIBRARIES = libinterface.la
- libinterface_la_SOURCES = nginterface.cpp nginterface_v2.cpp \
-       read_fnf_mesh.cpp readtetmesh.cpp readuser.cpp writeabaqus.cpp writediffpack.cpp \
-       writedolfin.cpp writeelmer.cpp writefeap.cpp writefluent.cpp writegmsh.cpp writejcm.cpp \
-       writepermas.cpp writetecplot.cpp writetet.cpp writetochnog.cpp writeuser.cpp \
-       wuchemnitz.cpp writegmsh2.cpp writeOpenFOAM15x.cpp 
--
--libinterface_la_LIBADD = $(top_builddir)/libsrc/meshing/libmesh.la
--
- # libinterface_la_LDFLAGS = -rdynamic
-diff -Naur netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/Makefile.am netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/Makefile.am
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/meshing/Makefile.am       2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/meshing/Makefile.am        2016-11-08 17:48:44.000000000 +0300
-@@ -15,7 +15,7 @@
- METASOURCES = AUTO
--lib_LTLIBRARIES = libmesh.la
-+noinst_LTLIBRARIES = libmesh.la
- libmesh_la_SOURCES = adfront2.cpp adfront3.cpp bisect.cpp boundarylayer.cpp \
-       clusters.cpp curvedelems.cpp delaunay.cpp delaunay2d.cpp            \
-@@ -30,8 +30,5 @@
-       topology.cpp triarls.cpp validate.cpp zrefine.cpp bcfunctions.cpp   \
-       parallelmesh.cpp  paralleltop.cpp  paralleltop.hpp basegeom.cpp 
--libmesh_la_LIBADD =  $(top_builddir)/libsrc/linalg/libla.la \
--      $(top_builddir)/libsrc/gprim/libgprim.la \
--      $(top_builddir)/libsrc/general/libgen.la \
--      -lz
-+libmesh_la_LIBADD = -lz
-diff -Naur netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Makefile.am netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Makefile.am
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/occ/Makefile.am   2014-08-29 13:54:03.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/occ/Makefile.am    2016-11-08 17:30:53.000000000 +0300
-@@ -14,10 +14,10 @@
- METASOURCES = AUTO
--lib_LTLIBRARIES = libocc.la
-+noinst_LTLIBRARIES = libocc.la
- if NGGUI
--lib_LTLIBRARIES += liboccvis.la 
-+lib_LTLIBRARIES = liboccvis.la 
- endif
-diff -Naur netgen-5.3.1_orig/libsrc/stlgeom/Makefile.am netgen-5.3.1_new/libsrc/stlgeom/Makefile.am
---- netgen-5.3.1_orig/libsrc/stlgeom/Makefile.am       2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/libsrc/stlgeom/Makefile.am        2016-11-08 18:28:09.000000000 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/stlgeom/Makefile.am netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/stlgeom/Makefile.am
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/libsrc/stlgeom/Makefile.am   2014-08-29 13:54:05.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/libsrc/stlgeom/Makefile.am  2017-09-11 18:08:21.235311757 +0300
 @@ -4,10 +4,10 @@
  AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/libsrc/include $(TCL_INCLUDES)
  METASOURCES = AUTO
@@ -1440,9 +1503,9 @@ diff -Naur netgen-5.3.1_orig/libsrc/stlgeom/Makefile.am netgen-5.3.1_new/libsrc/
 -libstl_la_LIBADD =  $(top_builddir)/libsrc/meshing/libmesh.la
  # libstlvis_la_LIBADD = libstl.la $(top_builddir)/libsrc/linalg/libla.la 
  
-diff -Naur netgen-5.3.1_orig/nglib/Makefile.am netgen-5.3.1_new/nglib/Makefile.am
---- netgen-5.3.1_orig/nglib/Makefile.am        2014-08-29 13:54:00.000000000 +0400
-+++ netgen-5.3.1_new/nglib/Makefile.am 2016-11-08 19:01:17.000000000 +0300
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/nglib/Makefile.am netgen-5.3.1_SRC_modif/nglib/Makefile.am
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/nglib/Makefile.am    2014-08-29 13:54:00.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/nglib/Makefile.am   2017-09-11 18:08:21.235311757 +0300
 @@ -14,6 +14,9 @@
        $(top_builddir)/libsrc/stlgeom/libstl.la \
        $(top_builddir)/libsrc/occ/libocc.la \
@@ -1453,3 +1516,15 @@ diff -Naur netgen-5.3.1_orig/nglib/Makefile.am netgen-5.3.1_new/nglib/Makefile.a
        $(OCCLIBS) $(MPI_LIBS)
  
  libnglib_la_LDFLAGS = -avoid-version
+diff -Naur netgen-5.3.1_SRC_orig/nglib/nglib.h netgen-5.3.1_SRC_modif/nglib/nglib.h
+--- netgen-5.3.1_SRC_orig/nglib/nglib.h        2014-08-29 13:54:00.000000000 +0400
++++ netgen-5.3.1_SRC_modif/nglib/nglib.h       2017-09-11 18:08:21.233311974 +0300
+@@ -24,7 +24,7 @@
+ // Philippose - 14.02.2009\r
+ // Modifications for creating a DLL in Windows\r
+ #ifdef WIN32\r
+-   #ifdef NGLIB_EXPORTS || nglib_EXPORTS\r
++   #if defined NGLIB_EXPORTS || defined nglib_EXPORTS
+       #define DLL_HEADER   __declspec(dllexport)\r
+    #else\r
+       #define DLL_HEADER   __declspec(dllimport)\r
index f54ade782f061d14ea8d3e0e0b1ef4d738b570f8..52236835be0de1478b4377b76c989416f7cdc37c 100755 (executable)
@@ -1,39 +1,27 @@
 #!/bin/sh
 
-src_dir=$1
-install_dir=$2
+src_dir=${1}
+install_dir=${2}
 
-if ! test -d $src_dir/libsrc ; then
-    echo "No dir $src_dir/libsrc ... Bye"
+if ! test -d ${src_dir}/libsrc ; then
+    echo "No dir ${src_dir}/libsrc ... Bye"
     exit 1
 fi
-if ! test -d $install_dir/share/netgen ; then
-    echo "No dir $install_dir/share/netgen ... Bye"
+if ! test -d ${install_dir} ; then
+    echo "No dir ${install_dir} ... Bye"
     exit 1
 fi
 
-dest_dir=$install_dir/share/netgen/include
-mkdir -p $dest_dir > /dev/null 2>&1
-cp -af $src_dir/libsrc/csg/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/general/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/geom2d/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/gprim/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/interface/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/linalg/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/meshing/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/stlgeom/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/visualization/*.hpp $dest_dir
+dest_dir=${install_dir}/include
+mkdir -p ${dest_dir} > /dev/null 2>&1
 
-cp -af $src_dir/libsrc/occ/*.hpp $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/occ/*.hxx $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/occ/*.ixx $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/occ/*.jxx $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/occ/*.h $dest_dir
-
-cp -af $src_dir/libsrc/include/mystdlib.h $dest_dir
-cp -af $src_dir/libsrc/include/mydefs.hpp $dest_dir
-# cp -af $src_dir/libsrc/include/parallel.hpp $dest_dir
-
-rm -f $dest_dir/ngexception.hpp
-rm -f $dest_dir/paralleltop.hpp
-rm -f $dest_dir/soldata.hpp
+for directory in csg general geom2d gprim interface linalg meshing stlgeom visualization
+do
+    cp -af ${src_dir}/libsrc/${directory}/*.hpp ${dest_dir}
+done
+cp -af ${src_dir}/libsrc/include/mystdlib.h ${dest_dir}
+cp -af ${src_dir}/libsrc/include/mydefs.hpp ${dest_dir}
+cp -af ${src_dir}/libsrc/occ/occgeom.hpp ${dest_dir}
+cp -af ${src_dir}/libsrc/occ/occmeshsurf.hpp ${dest_dir}
+cp -af ${src_dir}/libsrc/general/gzstream.h ${dest_dir}
+test -f ${src_dir}/config.h && cp -af ${src_dir}/config.h ${dest_dir}