]> SALOME platform Git repositories - plugins/netgenplugin.git/commitdiff
Salome HOME
Renaming functions and files + minor corrections in runner_main to detect what to do
authorYoann Audouin <yoann.audouin@edf.fr>
Tue, 13 Sep 2022 14:46:00 +0000 (16:46 +0200)
committerYoann Audouin <yoann.audouin@edf.fr>
Wed, 28 Sep 2022 06:17:51 +0000 (08:17 +0200)
15 files changed:
src/NETGENPlugin/CMakeLists.txt
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_DriverParam.cxx [new file with mode: 0644]
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_DriverParam.hxx [new file with mode: 0644]
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY.cxx
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_NETGEN_3D.cxx
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_NETGEN_3D.hxx
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Provider.hxx [deleted file]
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner.cxx [new file with mode: 0644]
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner.hxx [new file with mode: 0644]
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner_main.cxx [new file with mode: 0644]
src/NETGENPlugin/netgen_mesher.cxx [deleted file]
src/NETGENPlugin/netgen_mesher.hxx [deleted file]
src/NETGENPlugin/netgen_param.cxx [deleted file]
src/NETGENPlugin/netgen_param.hxx [deleted file]
src/NETGENPlugin/run_mesher.cxx [deleted file]

index 76f4e4601f2ac5e97fb4f134aeb3a5bd0e4bb066..c97dd9b666c6455b29343e224f1c5984f7319328 100644 (file)
@@ -93,9 +93,8 @@ SET(NETGENEngine_HEADERS
   NETGENPlugin_Mesher.hxx
   NETGENPlugin_Remesher_2D.hxx
   NETGENPlugin_Defs.hxx
-  NETGENPlugin_Provider.hxx
-  netgen_param.hxx
-  netgen_mesher.hxx
+  NETGENPlugin_DriverParam.hxx
+  NETGENPlugin_Runner.hxx
 )
 
 # --- sources ---
@@ -123,12 +122,12 @@ SET(NETGENEngine_SOURCES
   NETGENPlugin_SimpleHypothesis_3D_i.cxx
   NETGENPlugin_Remesher_2D.cxx
   NETGENPlugin_i.cxx
-  netgen_mesher.cxx
-  netgen_param.cxx
+  NETGENPlugin_Runner.cxx
+  NETGENPlugin_DriverParam.cxx
 )
 
-SET(Run_Mesher_SOURCES
-  run_mesher.cxx
+SET(NetgenRunner_SOURCES
+  NETGENPlugin_Runner_main.cxx
 )
 
 # --- scripts ---
@@ -145,9 +144,9 @@ ADD_LIBRARY(NETGENEngine ${NETGENEngine_SOURCES})
 TARGET_LINK_LIBRARIES(NETGENEngine ${_link_LIBRARIES} )
 INSTALL(TARGETS NETGENEngine EXPORT ${PROJECT_NAME}TargetGroup DESTINATION ${SALOME_INSTALL_LIBS})
 
-ADD_EXECUTABLE(run_mesher ${Run_Mesher_SOURCES})
-TARGET_LINK_LIBRARIES(run_mesher ${_link_LIBRARIES} NETGENEngine )
-INSTALL(TARGETS run_mesher EXPORT ${PROJECT_NAME}TargetGroup DESTINATION ${SALOME_INSTALL_BINS})
+ADD_EXECUTABLE(NETGENPlugin_Runner ${NetgenRunner_SOURCES})
+TARGET_LINK_LIBRARIES(NETGENPlugin_Runner ${_link_LIBRARIES} NETGENEngine )
+INSTALL(TARGETS NETGENPlugin_Runner EXPORT ${PROJECT_NAME}TargetGroup DESTINATION ${SALOME_INSTALL_BINS})
 
 INSTALL(FILES ${NETGENEngine_HEADERS} DESTINATION ${SALOME_INSTALL_HEADERS})
 
diff --git a/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_DriverParam.cxx b/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_DriverParam.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..2ddf398
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,214 @@
+// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+// This library is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// This library is distributed in the hope that it will be useful,
+// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+// Lesser General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License along with this library; if not, write to the Free Software
+// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+
+//  File   : NETGENPlugin_DriverParam.hxx
+//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
+//  Module : NETGEN
+//
+#include "NETGENPlugin_DriverParam.hxx"
+
+#include <iostream>
+#include <fstream>
+#include <string>
+#include <cassert>
+
+
+// TODO: Error handling of read/write
+
+/**
+ * @brief Print content of a netgen_params
+ *
+ * @param aParams The object to display
+ */
+void printNetgenParams(netgen_params& aParams){
+  // TODO: prettier print
+  // TODO: Add call to print in log
+  std::cout << "has_netgen_param: " << aParams.has_netgen_param << std::endl;
+  std::cout << "maxh: " << aParams.maxh << std::endl;
+  std::cout << "minh: " << aParams.minh << std::endl;
+  std::cout << "segmentsperedge: " << aParams.segmentsperedge << std::endl;
+  std::cout << "grading: " << aParams.grading << std::endl;
+  std::cout << "curvaturesafety: " << aParams.curvaturesafety << std::endl;
+  std::cout << "secondorder: " << aParams.secondorder << std::endl;
+  std::cout << "quad: " << aParams.quad << std::endl;
+  std::cout << "optimize: " << aParams.optimize << std::endl;
+  std::cout << "fineness: " << aParams.fineness << std::endl;
+  std::cout << "uselocalh: " << aParams.uselocalh << std::endl;
+  std::cout << "merge_solids: " << aParams.merge_solids << std::endl;
+  std::cout << "chordalError: " << aParams.chordalError << std::endl;
+  std::cout << "optsteps2d: " << aParams.optsteps2d << std::endl;
+  std::cout << "optsteps3d: " << aParams.optsteps3d << std::endl;
+  std::cout << "elsizeweight: " << aParams.elsizeweight << std::endl;
+  std::cout << "opterrpow: " << aParams.opterrpow << std::endl;
+  std::cout << "delaunay: " << aParams.delaunay << std::endl;
+  std::cout << "checkoverlap: " << aParams.checkoverlap << std::endl;
+  std::cout << "checkchartboundary: " << aParams.checkchartboundary << std::endl;
+  std::cout << "closeedgefac: " << aParams.closeedgefac << std::endl;
+  std::cout << "has_local_size: " << aParams.has_local_size << std::endl;
+  std::cout << "meshsizefilename: " << aParams.meshsizefilename << std::endl;
+  std::cout << "has_maxelementvolume_hyp: " << aParams.has_maxelementvolume_hyp << std::endl;
+  std::cout << "maxElementVolume: " << aParams.maxElementVolume << std::endl;
+  std::cout << "has_LengthFromEdges_hyp: " << aParams.has_LengthFromEdges_hyp << std::endl;
+}
+
+/**
+ * @brief Import a param_file into a netgen_params structure
+ *
+ * @param param_file Name of the file
+ * @param aParams Structure to fill
+ */
+void importNetgenParams(const std::string param_file, netgen_params& aParams){
+  std::ifstream myfile(param_file);
+  std::string line;
+
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.has_netgen_param = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.maxh = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.minh = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.segmentsperedge = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.grading = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.curvaturesafety = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.secondorder = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.quad = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.optimize = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.fineness = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.uselocalh = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.merge_solids = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.chordalError = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.optsteps2d = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.optsteps3d = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.elsizeweight = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.opterrpow = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.delaunay = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.checkoverlap = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.checkchartboundary = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.closeedgefac = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.has_local_size = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.meshsizefilename = line;
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.has_maxelementvolume_hyp = std::stoi(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.maxElementVolume = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.maxElementVolume = std::stoi(line);
+
+  myfile.close();
+};
+
+/**
+ * @brief Writes the content of a netgen_param into a file
+ *
+ * @param param_file the file
+ * @param aParams the object
+ */
+void exportNetgenParams(const std::string param_file, netgen_params& aParams){
+  std::ofstream myfile(param_file);
+  myfile << aParams.has_netgen_param << std::endl;
+  myfile << aParams.maxh << std::endl;
+  myfile << aParams.minh << std::endl;
+  myfile << aParams.segmentsperedge << std::endl;
+  myfile << aParams.grading << std::endl;
+  myfile << aParams.curvaturesafety << std::endl;
+  myfile << aParams.secondorder << std::endl;
+  myfile << aParams.quad << std::endl;
+  myfile << aParams.optimize << std::endl;
+  myfile << aParams.fineness << std::endl;
+  myfile << aParams.uselocalh << std::endl;
+  myfile << aParams.merge_solids << std::endl;
+  myfile << aParams.chordalError << std::endl;
+  myfile << aParams.optsteps2d << std::endl;
+  myfile << aParams.optsteps3d << std::endl;
+  myfile << aParams.elsizeweight << std::endl;
+  myfile << aParams.opterrpow << std::endl;
+  myfile << aParams.delaunay << std::endl;
+  myfile << aParams.checkoverlap << std::endl;
+  myfile << aParams.checkchartboundary << std::endl;
+  myfile << aParams.closeedgefac << std::endl;
+  myfile << aParams.has_local_size << std::endl;
+  myfile << aParams.meshsizefilename << std::endl;
+  myfile << aParams.has_maxelementvolume_hyp << std::endl;
+  myfile << aParams.maxElementVolume << std::endl;
+  myfile << aParams.has_LengthFromEdges_hyp << std::endl;
+
+  myfile.close();
+};
+
+/**
+ * @brief Compares two netgen_parms object
+ *
+ * @param params1 Object 1
+ * @param params2 Object 2
+
+ * @return true if the two object are identical
+ */
+bool diffNetgenParams(netgen_params params1, netgen_params params2){
+  bool ret = true;
+  ret &= params1.maxh == params2.maxh;
+  ret &= params1.minh == params2.minh;
+  ret &= params1.segmentsperedge == params2.segmentsperedge;
+  ret &= params1.grading == params2.grading;
+  ret &= params1.curvaturesafety == params2.curvaturesafety;
+  ret &= params1.secondorder == params2.secondorder;
+  ret &= params1.quad == params2.quad;
+  ret &= params1.optimize == params2.optimize;
+  ret &= params1.fineness == params2.fineness;
+  ret &= params1.uselocalh == params2.uselocalh;
+  ret &= params1.merge_solids == params2.merge_solids;
+  ret &= params1.chordalError == params2.chordalError;
+  ret &= params1.optsteps2d == params2.optsteps2d;
+  ret &= params1.optsteps3d == params2.optsteps3d;
+  ret &= params1.elsizeweight == params2.elsizeweight;
+  ret &= params1.opterrpow == params2.opterrpow;
+  ret &= params1.delaunay == params2.delaunay;
+  ret &= params1.checkoverlap == params2.checkoverlap;
+  ret &= params1.checkchartboundary == params2.checkchartboundary;
+  ret &= params1.closeedgefac == params2.closeedgefac;
+  ret &= params1.has_local_size == params2.has_local_size;
+  ret &= params1.meshsizefilename == params2.meshsizefilename;
+  ret &= params1.has_maxelementvolume_hyp == params2.has_maxelementvolume_hyp;
+  ret &= params1.maxElementVolume == params2.maxElementVolume;
+  ret &= params1.has_LengthFromEdges_hyp == params2.has_LengthFromEdges_hyp;
+
+  return ret;
+}
diff --git a/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_DriverParam.hxx b/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_DriverParam.hxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0f53512
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,96 @@
+// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+// This library is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// This library is distributed in the hope that it will be useful,
+// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+// Lesser General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License along with this library; if not, write to the Free Software
+// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+
+//  File   : NETGENPlugin_DriverParam.hxx
+//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
+//  Module : NETGEN
+//
+
+#ifndef _NETGENPLUGIN_DRIVERPARAM_HXX_
+#define _NETGENPLUGIN_DRIVERPARAM_HXX_
+
+#include <string>
+
+class NETGENPlugin_Hypothesis;
+class StdMeshers_MaxElementVolume;
+class StdMeshers_ViscousLayers;
+
+struct netgen_params{
+  // Params from NETGENPlugin_Mesher
+  // True if _hypParameters is not null
+  bool has_netgen_param=true;
+  double maxh;
+  double minh;
+  double segmentsperedge;
+  double grading;
+  double curvaturesafety;
+  int secondorder;
+  int quad;
+  bool optimize;
+  int fineness;
+  bool uselocalh;
+  bool merge_solids;
+  double chordalError;
+  int optsteps2d;
+  int optsteps3d;
+  double elsizeweight;
+  int opterrpow;
+  bool delaunay;
+  bool checkoverlap;
+  bool checkchartboundary;
+  int closeedgefac;
+
+
+  // TODO: add localsize (pass through local size file ?)
+  // True if we have a mesh size file or local size info
+  bool has_local_size = false;
+  std::string meshsizefilename;
+
+  // Params from NETGEN3D
+  // True if _hypMaxElementVolume is not null
+  bool has_maxelementvolume_hyp=false;
+  double maxElementVolume=0.0;
+
+  // to replace
+  //NETGENPlugin_Hypothesis *    _hypParameters=nullptr;
+  // to remove ?
+  StdMeshers_MaxElementVolume* _hypMaxElementVolume=nullptr;
+  // to remove ?
+  StdMeshers_ViscousLayers*    _viscousLayersHyp=nullptr;
+  //double                       _progressByTic;
+  bool _quadraticMesh=false;
+
+  // Params from NETGEN2D
+  bool has_LengthFromEdges_hyp=false;
+
+  // Number of threads for the mesher
+  int nbThreads;
+};
+
+void printNetgenParams(netgen_params& aParams);
+
+void importNetgenParams(const std::string param_file, netgen_params& aParams);
+void exportNetgenParams(const std::string param_file, netgen_params& aParams);
+
+bool diffNetgenParams(netgen_params params1, netgen_params params2);
+
+#endif
\ No newline at end of file
index 72a2e6c56345c74e8bcfe4b0b091bca1ae411a0a..36e0d849760bb70c3e888aca3d823e58254ddc2a 100644 (file)
@@ -25,8 +25,7 @@
 
 #include "NETGENPlugin_Mesher.hxx"
 #include "NETGENPlugin_Hypothesis_2D.hxx"
-#include "NETGENPlugin_Provider.hxx"
-#include "netgen_param.hxx"
+#include "NETGENPlugin_DriverParam.hxx"
 
 #include <SMDS_MeshElement.hxx>
 #include <SMDS_MeshNode.hxx>
@@ -41,8 +40,8 @@
 #include <StdMeshers_MaxElementArea.hxx>
 #include <StdMeshers_QuadranglePreference.hxx>
 #include <StdMeshers_ViscousLayers2D.hxx>
-#include "DriverStep.hxx"
-#include "DriverMesh.hxx"
+#include "SMESH_DriverStep.hxx"
+#include "SMESH_DriverMesh.hxx"
 
 
 #include <Precision.hxx>
@@ -324,17 +323,17 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
   fs::path output_mesh_file=tmp_folder / fs::path("output_mesh.med");
   fs::path shape_file=tmp_folder / fs::path("shape.step");
   fs::path param_file=tmp_folder / fs::path("netgen2d_param.txt");
-  fs::path log_file=tmp_folder / fs::path("run_mesher.log");
+  fs::path log_file=tmp_folder / fs::path("run.log");
   //TODO: Handle variable mesh_name
   std::string mesh_name = "Maillage_1";
 
   //Writing Shape
-  export_shape(shape_file.string(), aShape);
+  exportShape(shape_file.string(), aShape);
   //Writing hypo
   netgen_params aParams;
   FillParameters(_hypParameters, aParams);
 
-  export_netgen_params(param_file.string(), aParams);
+  exportNetgenParams(param_file.string(), aParams);
 
   // Exporting element orientation
   exportElementOrientation(aMesh, aShape, aParams, element_orientation_file.string());
@@ -347,7 +346,7 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
     fs::path(std::getenv("NETGENPLUGIN_ROOT_DIR"))/
     fs::path("bin")/
     fs::path("salome")/
-    fs::path("run_mesher");
+    fs::path("NETGENPlugin_Runner");
   cmd = run_mesher_exe.string() +
                   " NETGEN2D " + mesh_file.string() + " "
                                + shape_file.string() + " "
index 7bff3c7559969abffa7e0b2a7c46153ff695477d..367c4192378a116cc3722d976dbc33af06bb18db 100644 (file)
@@ -32,9 +32,7 @@
 
 #include "NETGENPlugin_Hypothesis.hxx"
 
-#include "DriverStep.hxx"
-#include "DriverMesh.hxx"
-#include "netgen_param.hxx"
+#include "NETGENPlugin_DriverParam.hxx"
 
 #include <SMDS_MeshElement.hxx>
 #include <SMDS_MeshNode.hxx>
@@ -50,6 +48,9 @@
 #include <StdMeshers_QuadToTriaAdaptor.hxx>
 #include <StdMeshers_ViscousLayers.hxx>
 #include <SMESH_subMesh.hxx>
+#include <SMESH_DriverStep.hxx>
+#include <SMESH_DriverMesh.hxx>
+
 
 #include <BRepGProp.hxx>
 #include <BRep_Tool.hxx>
@@ -196,7 +197,7 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_3D::CheckHypothesis (SMESH_Mesh&         aMesh,
 }
 
 
-void NETGENPlugin_NETGEN_3D::FillParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp, netgen_params &aParams)
+void NETGENPlugin_NETGEN_3D::fillParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp, netgen_params &aParams)
 {
   aParams.maxh               = hyp->GetMaxSize();
   aParams.minh               = hyp->GetMinSize();
@@ -315,21 +316,21 @@ int NETGENPlugin_NETGEN_3D::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
   fs::path output_mesh_file=tmp_folder / fs::path("output_mesh.med");
   fs::path shape_file=tmp_folder / fs::path("shape.step");
   fs::path param_file=tmp_folder / fs::path("netgen3d_param.txt");
-  fs::path log_file=tmp_folder / fs::path("run_mesher.log");
+  fs::path log_file=tmp_folder / fs::path("run.log");
   //TODO: Handle variable mesh_name
   std::string mesh_name = "Maillage_1";
 
   //Writing Shape
-  export_shape(shape_file.string(), aShape);
+  exportShape(shape_file.string(), aShape);
   auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
   elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
-  std::cout << "Time for export_shape: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+  std::cout << "Time for exportShape: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   //Writing hypo
   netgen_params aParams;
-  FillParameters(_hypParameters, aParams);
+  fillParameters(_hypParameters, aParams);
 
-  export_netgen_params(param_file.string(), aParams);
+  exportNetgenParams(param_file.string(), aParams);
   auto time3 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
   elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time3-time2);
   std::cout << "Time for fill+export param: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
@@ -338,7 +339,7 @@ int NETGENPlugin_NETGEN_3D::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
   exportElementOrientation(aMesh, aShape, aParams, element_orientation_file.string());
   auto time4 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
   elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time4-time3);
-  std::cout << "Time for exportElemnOrient: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+  std::cout << "Time for exportElemOrient: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   aMesh.Unlock();
   // Calling run_mesher
@@ -348,7 +349,7 @@ int NETGENPlugin_NETGEN_3D::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
     fs::path(std::getenv("NETGENPLUGIN_ROOT_DIR"))/
     fs::path("bin")/
     fs::path("salome")/
-    fs::path("run_mesher");
+    fs::path("NETGENPlugin_Runner");
   cmd = run_mesher_exe.string() +
                   " NETGEN3D " + mesh_file.string() + " "
                                + shape_file.string() + " "
@@ -356,8 +357,7 @@ int NETGENPlugin_NETGEN_3D::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
                                + element_orientation_file.string() + " "
                                + std::to_string(aMesh.GetMesherNbThreads()) + " "
                                + new_element_file.string() + " "
-                               + std::to_string(0) + " "
-                               + output_mesh_file.string() +
+                               + "NONE" +
                                " >> " + log_file.string();
 
   //std::cout << "Running command: " << std::endl;
index 4ae5666fba9c55c34ec355c018323a5208cc69a2..9ce54df83846e589e354115ca13696f6553894fb 100644 (file)
@@ -31,7 +31,6 @@
 #ifndef _NETGENPlugin_NETGEN_3D_HXX_
 #define _NETGENPlugin_NETGEN_3D_HXX_
 
-#include "NETGENPlugin_Provider.hxx"
 #include "NETGENPlugin_Defs.hxx"
 #include "NETGENPlugin_Mesher.hxx"
 
@@ -75,7 +74,7 @@ class NETGENPLUGIN_EXPORT NETGENPlugin_NETGEN_3D: public SMESH_3D_Algo
                                 netgen_params& aParams,
                                 const std::string output_file);
 
-  void FillParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp,
+  void fillParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp,
                       netgen_params &aParams);
 
   int RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
diff --git a/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Provider.hxx b/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Provider.hxx
deleted file mode 100644 (file)
index d262789..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,152 +0,0 @@
-// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
-//
-// This library is free software; you can redistribute it and/or
-// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
-// License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
-//
-// This library is distributed in the hope that it will be useful,
-// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
-// Lesser General Public License for more details.
-//
-// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
-// License along with this library; if not, write to the Free Software
-// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
-//
-// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
-//
-
-// File      : NETGENPlugin_Provider.hxx
-// Author    : Yoann AUDOUIN (EDF)
-// Project   : SALOME
-//
-#ifndef _NETGENPlugin_Provider_HXX_
-#define _NETGENPlugin_Provider_HXX_
-
-#include <iostream>
-#include <thread>
-#include <array>
-#include <vector>
-#include <unistd.h>
-#include <mutex>
-
-namespace nglib {
-#include <nglib.h>
-}
-#ifndef OCCGEOMETRY
-#define OCCGEOMETRY
-#endif
-#include <occgeom.hpp>
-#include <meshing.hpp>
-
-template<class T, int NDATA>
-class ProviderPtr{
-  public:
-
-    ProviderPtr(){
-      for(int i=0;i<NDATA;i++){
-        this->_mydata[i] = nullptr;
-        this->_useddata[i] = false;
-      }
-    }
-
-    int take(T** data){
-
-      this->_mymutex.lock();
-      *data = nullptr;
-      for(int i=0;i<NDATA;i++){
-        if(!this->_useddata[i]){
-          if (this->_mydata[i] == nullptr)
-            this->_mydata[i] = new T();
-          this->_useddata[i] = true;
-          *data = this->_mydata[i];
-          this->_mymutex.unlock();
-          return i;
-        }
-      }
-      this->_mymutex.unlock();
-      return -1;
-    };
-
-
-    bool release(int i, bool clean){
-
-      this->_mymutex.lock();
-
-      if(clean){
-        delete this->_mydata[i];
-        this->_mydata[i] = nullptr;
-      }
-
-      this->_useddata[i] = false;
-
-      this->_mymutex.unlock();
-
-      return true;
-    };
-
-    void dump(){
-      std::cout << "Dumping provider:" << std::endl;
-      for(int i=0;i<NDATA;i++){
-        std::cout << " - " << i << " used: " << this->_useddata[i] << std::endl;
-        std::cout << " - adress: " << this->_mydata[i] << std::endl;
-        if (this->_mydata[i] != nullptr)
-          std::cout << " -  i: " << this->_mydata[i]->i << " d: " << this->_mydata[i]->d << std::endl;
-      }
-    };
-
-  private:
-    std::array<T*, NDATA> _mydata;
-    std::array<bool, NDATA> _useddata;
-    std::mutex _mymutex;
-
-};
-
-template<class T, int NDATA>
-class Provider{
-  public:
-
-    Provider() = default;
-
-    int take(T& data){
-
-      this->_mymutex.lock();
-      for(int i=0;i<NDATA;i++){
-        if(!this->_useddata[i]){
-          this->_useddata[i] = true;
-          data = this->_mydata[i];
-          this->_mymutex.unlock();
-          return i;
-        }
-      }
-      this->_mymutex.unlock();
-      return -1;
-    };
-
-
-    bool release(int i){
-
-      this->_mymutex.lock();
-      this->_useddata[i] = false;
-      this->_mymutex.unlock();
-
-      return true;
-    };
-
-    void dump(){
-      std::cout << "Dumping provider:" << std::endl;
-      for(int i=0;i<NDATA;i++){
-        std::cout << " - " << i << " used: " << this->_useddata[i] << std::endl;
-        std::cout << " -  i: " << this->_mydata[i].i << " d: " << this->_mydata[i].d << std::endl;
-      }
-    };
-
-  private:
-    std::array<T, NDATA> _mydata;
-    std::array<bool, NDATA> _useddata;
-    std::mutex _mymutex;
-
-};
-
-#endif
\ No newline at end of file
diff --git a/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner.cxx b/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e69dcd5
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,1051 @@
+// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+// This library is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// This library is distributed in the hope that it will be useful,
+// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+// Lesser General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License along with this library; if not, write to the Free Software
+// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+
+//  File   : NETGENPlugin_Runner.cxx
+//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
+//  Module : SMESH
+//
+
+#include "NETGENPlugin_Runner.hxx"
+
+
+#include "NETGENPlugin_DriverParam.hxx"
+
+#include <fstream>
+#include <vector>
+#include <boost/filesystem.hpp>
+namespace fs = boost::filesystem;
+#include <chrono>
+
+// SMESH include
+#include <SMESH_Mesh.hxx>
+#include <SMESH_subMesh.hxx>
+#include <SMESH_Gen.hxx>
+#include <SMESH_Algo.hxx>
+#include <SMESHDS_Mesh.hxx>
+#include <SMESH_ControlsDef.hxx>
+#include <SMESH_Comment.hxx>
+#include <SMESH_ComputeError.hxx>
+#include <SMESH_MesherHelper.hxx>
+#include <StdMeshers_MaxElementVolume.hxx>
+#include <StdMeshers_QuadToTriaAdaptor.hxx>
+#include <StdMeshers_ViscousLayers.hxx>
+#include <StdMeshers_ViscousLayers2D.hxx>
+#include <SMESH_DriverStep.hxx>
+#include <SMESH_DriverMesh.hxx>
+
+
+// NETGENPlugin
+// #include <NETGENPlugin_Mesher.hxx>
+// #include <NETGENPlugin_Hypothesis.hxx>
+#include "NETGENPlugin_Mesher.hxx"
+#include "NETGENPlugin_Hypothesis.hxx"
+
+
+// OCC include
+#include <TopoDS.hxx>
+#include <BRepClass3d_SolidClassifier.hxx>
+#include <GProp_GProps.hxx>
+#include <BRepGProp.hxx>
+
+#include <Standard_Failure.hxx>
+#include <Standard_ErrorHandler.hxx>
+/*
+  Netgen include files
+*/
+
+#ifndef OCCGEOMETRY
+#define OCCGEOMETRY
+#endif
+#include <occgeom.hpp>
+#include <meshing.hpp>
+
+#ifdef NETGEN_V5
+#include <ngexception.hpp>
+#endif
+#ifdef NETGEN_V6
+#include <core/exception.hpp>
+#endif
+
+namespace nglib {
+#include <nglib.h>
+}
+namespace netgen {
+
+  NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
+  extern MeshingParameters mparam;
+
+  NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
+  extern volatile multithreadt multithread;
+
+  NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
+  extern bool merge_solids;
+
+#ifdef NETGEN_V5
+  extern void OCCSetLocalMeshSize(OCCGeometry & geom, Mesh & mesh);
+#endif
+}
+using namespace nglib;
+
+int error(int error_type, std::string msg)
+{
+ std::cerr << msg << std::endl;
+  return error_type;
+};
+
+int error(const SMESH_Comment& comment)
+{
+  return error(1, "SMESH_Comment error: "+comment);
+};
+
+/**
+ * @brief Set the netgen parameters
+ *
+ * @param aParams Internal structure of parameters
+ * @param mparams Netgen strcuture of parameters
+ */
+void set_netgen_parameters(netgen_params& aParams)
+{
+
+  // Default parameters
+#ifdef NETGEN_V6
+
+  //netgen::mparam.nthreads = std::thread::hardware_concurrency();
+  netgen::mparam.nthreads = aParams.nbThreads;
+  netgen::mparam.parallel_meshing = aParams.nbThreads > 1;
+
+
+  if ( getenv( "SALOME_NETGEN_DISABLE_MULTITHREADING" ))
+  {
+    netgen::mparam.nthreads = 1;
+    netgen::mparam.parallel_meshing = false;
+  }
+
+#endif
+
+  // Initialize global NETGEN parameters:
+  netgen::mparam.maxh               = aParams.maxh;
+  netgen::mparam.minh               = aParams.minh;
+  netgen::mparam.segmentsperedge    = aParams.segmentsperedge;
+  netgen::mparam.grading            = aParams.grading;
+  netgen::mparam.curvaturesafety    = aParams.curvaturesafety;
+  netgen::mparam.secondorder        = aParams.secondorder;
+  netgen::mparam.quad               = aParams.quad;
+  netgen::mparam.uselocalh          = aParams.uselocalh;
+  netgen::merge_solids       = aParams.merge_solids;
+  netgen::mparam.optsteps2d         = aParams.optsteps2d;
+  netgen::mparam.optsteps3d         = aParams.optsteps3d;
+  netgen::mparam.elsizeweight       = aParams.elsizeweight;
+  netgen::mparam.opterrpow          = aParams.opterrpow;
+  netgen::mparam.delaunay           = aParams.delaunay;
+  netgen::mparam.checkoverlap       = aParams.checkoverlap;
+  netgen::mparam.checkchartboundary = aParams.checkchartboundary;
+#ifdef NETGEN_V6
+  // std::string
+  netgen::mparam.meshsizefilename = aParams.meshsizefilename;
+  netgen::mparam.closeedgefac = aParams.closeedgefac;
+
+#else
+  // const char*
+  netgen::mparam.meshsizefilename= aParams.meshsizefilename.empty() ? 0 : aParams.meshsizefilename.c_str();
+#endif
+}
+
+/**
+ * @brief compute mesh with netgen3d
+ *
+ * @param input_mesh_file Input Mesh file
+ * @param shape_file Shape file
+ * @param hypo_file Parameter file
+ * @param new_element_file Binary file containing new nodes and new element info
+ * @param output_mesh If true will export mesh into output_mesh_file
+ * @param output_mesh_file Output Mesh file
+ *
+ * @return error code
+ */
+int netgen3d(const std::string input_mesh_file,
+             const std::string shape_file,
+             const std::string hypo_file,
+             const std::string element_orientation_file,
+             const std::string new_element_file,
+             const std::string output_mesh_file,
+             int nbThreads)
+{
+  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  // Importing mesh
+  SMESH_Gen gen;
+
+  SMESH_Mesh *myMesh = gen.CreateMesh(false);
+  //TODO: To define
+  std::string mesh_name = "Maillage_1";
+
+  importMesh(input_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
+  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
+  std::cout << "Time for importMesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
+  // Importing shape
+  TopoDS_Shape myShape;
+  importShape(shape_file, myShape);
+  auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
+  std::cout << "Time for importShape: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
+  // Importing hypothesis
+  netgen_params myParams;
+
+  importNetgenParams(hypo_file, myParams);
+  auto time3 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time3-time2);
+  std::cout << "Time for import_netgen_param: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+  // Setting number of threads for netgen
+  myParams.nbThreads = nbThreads;
+
+  std::cout << "Meshing with netgen3d" << std::endl;
+  int ret = netgen3dInternal(myShape, *myMesh, myParams,
+                              new_element_file, element_orientation_file,
+                              !output_mesh_file.empty());
+
+
+  if(!ret){
+    std::cout << "Meshing failed" << std::endl;
+    return ret;
+  }
+
+  if(!output_mesh_file.empty()){
+    auto time4 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+    exportMesh(output_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
+    auto time5 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+    elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time5-time4);
+    std::cout << "Time for exportMesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+  }
+
+  return ret;
+}
+
+/**
+ * @brief Compute aShape within aMesh using netgen3d
+ *
+ * @param aShape the shape
+ * @param aMesh the mesh
+ * @param aParams the netgen parameters
+ * @param new_element_file file containing data on the new point/tetra added by netgen
+ * @param element_orientation_file file containing data on the orientation of each element to add to netgen
+ * @param output_mesh if true add element created by netgen into aMesh
+ *
+ * @return error code
+ */
+int netgen3dInternal(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
+                      std::string new_element_file, std::string element_orientation_file,
+                      bool output_mesh)
+{
+
+  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+
+  netgen::multithread.terminate = 0;
+  netgen::multithread.task = "Volume meshing";
+
+  SMESHDS_Mesh* meshDS = aMesh.GetMeshDS();
+
+  SMESH_MesherHelper helper(aMesh);
+  aParams._quadraticMesh = helper.IsQuadraticSubMesh(aShape);
+  helper.SetElementsOnShape( true );
+
+  int Netgen_NbOfNodes = 0;
+  double Netgen_point[3];
+  int Netgen_triangle[3];
+
+  NETGENPlugin_NetgenLibWrapper ngLib;
+  Ng_Mesh * Netgen_mesh = (Ng_Mesh*)ngLib._ngMesh;
+
+  // vector of nodes in which node index == netgen ID
+  vector< const SMDS_MeshNode* > nodeVec;
+  {
+    const int invalid_ID = -1;
+
+    SMESH::Controls::Area areaControl;
+    SMESH::Controls::TSequenceOfXYZ nodesCoords;
+
+    // maps nodes to ng ID
+    typedef map< const SMDS_MeshNode*, int, TIDCompare > TNodeToIDMap;
+    typedef TNodeToIDMap::value_type                     TN2ID;
+    TNodeToIDMap nodeToNetgenID;
+
+    // find internal shapes
+    NETGENPlugin_Internals internals( aMesh, aShape, /*is3D=*/true );
+
+    // ---------------------------------
+    // Feed the Netgen with surface mesh
+    // ---------------------------------
+
+    TopAbs_ShapeEnum mainType = aMesh.GetShapeToMesh().ShapeType();
+    bool checkReverse = ( mainType == TopAbs_COMPOUND || mainType == TopAbs_COMPSOLID );
+
+    SMESH_ProxyMesh::Ptr proxyMesh( new SMESH_ProxyMesh( aMesh ));
+    if ( aParams._viscousLayersHyp )
+    {
+      netgen::multithread.percent = 3;
+      proxyMesh = aParams._viscousLayersHyp->Compute( aMesh, aShape );
+      if ( !proxyMesh )
+        return false;
+    }
+    if ( aMesh.NbQuadrangles() > 0 )
+    {
+      netgen::multithread.percent = 6;
+      StdMeshers_QuadToTriaAdaptor* Adaptor = new StdMeshers_QuadToTriaAdaptor;
+      Adaptor->Compute(aMesh,aShape,proxyMesh.get());
+      proxyMesh.reset( Adaptor );
+    }
+
+    // Get list of elements + their orientation from element_orientation file
+    std::map<vtkIdType, bool> elemOrientation;
+    {
+      // Setting all element orientation to false if there no element orientation file
+      if(element_orientation_file.empty()){
+        SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Face);
+        while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
+          {
+            // check mesh face
+            const SMDS_MeshElement* elem = iteratorElem->next();
+            elemOrientation[elem->GetID()] = false;
+          }
+      } else {
+        std::ifstream df(element_orientation_file, ios::binary|ios::in);
+        int nbElement;
+        bool orient;
+
+        // Warning of the use of vtkIdType (I had issue when run_mesher was compiled with internal vtk) and salome not
+        // Sizeof was the same but how he othered the type was different
+        // Maybe using another type (uint64_t) instead would be better
+        vtkIdType id;
+        df.read((char*)&nbElement, sizeof(int));
+
+        for(int ielem=0;ielem<nbElement;++ielem){
+          df.read((char*) &id, sizeof(vtkIdType));
+          df.read((char*) &orient, sizeof(bool));
+          elemOrientation[id] = orient;
+        }
+      }
+    }
+
+    // Adding elements from Mesh
+    SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Face);
+    bool isRev;
+    bool isInternalFace = false;
+
+    bool isIn;
+
+    while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
+      {
+        // check mesh face
+        const SMDS_MeshElement* elem = iteratorElem->next();
+        if ( !elem )
+          return error( COMPERR_BAD_INPUT_MESH, "Null element encounters");
+        if ( elem->NbCornerNodes() != 3 )
+          return error( COMPERR_BAD_INPUT_MESH, "Not triangle element encounters");
+
+        // Keeping only element that are in the element orientation file
+        isIn = elemOrientation.count(elem->GetID())==1;
+
+        if(!isIn)
+          continue;
+
+        // Get orientation
+        // Netgen requires that all the triangle point outside
+        isRev = elemOrientation[elem->GetID()];
+
+        // Add nodes of triangles and triangles them-selves to netgen mesh
+
+        // add three nodes of triangle
+        bool hasDegen = false;
+        for ( int iN = 0; iN < 3; ++iN )
+        {
+          const SMDS_MeshNode* node = elem->GetNode( iN );
+          const int shapeID = node->getshapeId();
+          if ( node->GetPosition()->GetTypeOfPosition() == SMDS_TOP_EDGE &&
+               helper.IsDegenShape( shapeID ))
+          {
+            // ignore all nodes on degeneraged edge and use node on its vertex instead
+            TopoDS_Shape vertex = TopoDS_Iterator( meshDS->IndexToShape( shapeID )).Value();
+            node = SMESH_Algo::VertexNode( TopoDS::Vertex( vertex ), meshDS );
+            hasDegen = true;
+          }
+          int& ngID = nodeToNetgenID.insert(TN2ID( node, invalid_ID )).first->second;
+          if ( ngID == invalid_ID )
+          {
+            ngID = ++Netgen_NbOfNodes;
+            Netgen_point [ 0 ] = node->X();
+            Netgen_point [ 1 ] = node->Y();
+            Netgen_point [ 2 ] = node->Z();
+            Ng_AddPoint(Netgen_mesh, Netgen_point);
+          }
+
+          Netgen_triangle[ isRev ? 2-iN : iN ] = ngID;
+        }
+        // add triangle
+        if ( hasDegen && (Netgen_triangle[0] == Netgen_triangle[1] ||
+                          Netgen_triangle[0] == Netgen_triangle[2] ||
+                          Netgen_triangle[2] == Netgen_triangle[1] ))
+          continue;
+
+        Ng_AddSurfaceElement(Netgen_mesh, NG_TRIG, Netgen_triangle);
+
+        // TODO: Handle that case (quadrangle 2D) (isInternal is set to false)
+        if ( isInternalFace && !proxyMesh->IsTemporary( elem ))
+        {
+          swap( Netgen_triangle[1], Netgen_triangle[2] );
+          Ng_AddSurfaceElement(Netgen_mesh, NG_TRIG, Netgen_triangle);
+        }
+      }
+
+    // insert old nodes into nodeVec
+    nodeVec.resize( nodeToNetgenID.size() + 1, 0 );
+    TNodeToIDMap::iterator n_id = nodeToNetgenID.begin();
+    for ( ; n_id != nodeToNetgenID.end(); ++n_id )
+      nodeVec[ n_id->second ] = n_id->first;
+    nodeToNetgenID.clear();
+
+    // TODO: Handle internal vertex
+    //if ( internals.hasInternalVertexInSolid() )
+    //{
+    //  netgen::OCCGeometry occgeo;
+    //  NETGENPlugin_Mesher::AddIntVerticesInSolids( occgeo,
+    //                                               (netgen::Mesh&) *Netgen_mesh,
+    //                                               nodeVec,
+    //                                               internals);
+    //}
+  }
+  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
+  std::cout << "Time for fill_in_ngmesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
+  // -------------------------
+  // Generate the volume mesh
+  // -------------------------
+  netgen::multithread.terminate = 0;
+
+  netgen::Mesh* ngMesh = ngLib._ngMesh;
+  Netgen_mesh = ngLib.ngMesh();
+  Netgen_NbOfNodes = Ng_GetNP( Netgen_mesh );
+
+
+  int startWith = netgen::MESHCONST_MESHVOLUME;
+  int endWith   = netgen::MESHCONST_OPTVOLUME;
+  int err = 1;
+
+  NETGENPlugin_Mesher aMesher( &aMesh, helper.GetSubShape(), /*isVolume=*/true );
+  netgen::OCCGeometry occgeo;
+  set_netgen_parameters(aParams);
+
+  if ( aParams.has_netgen_param )
+  {
+    if ( aParams.has_local_size)
+    {
+      if ( ! &ngMesh->LocalHFunction() )
+      {
+        netgen::Point3d pmin, pmax;
+        ngMesh->GetBox( pmin, pmax, 0 );
+        ngMesh->SetLocalH( pmin, pmax, aParams.grading );
+      }
+      aMesher.SetLocalSize( occgeo, *ngMesh );
+
+      try {
+        ngMesh->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
+      } catch (netgen::NgException & ex) {
+        return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
+      }
+    }
+    if ( !aParams.optimize )
+      endWith = netgen::MESHCONST_MESHVOLUME;
+  }
+  else if ( aParams.has_maxelementvolume_hyp )
+  {
+    netgen::mparam.maxh = pow( 72, 1/6. ) * pow( aParams.maxElementVolume, 1/3. );
+    // limitVolumeSize( ngMesh, netgen::mparam.maxh ); // result is unpredictable
+  }
+  else if ( aMesh.HasShapeToMesh() )
+  {
+    aMesher.PrepareOCCgeometry( occgeo, helper.GetSubShape(), aMesh );
+    netgen::mparam.maxh = occgeo.GetBoundingBox().Diam()/2;
+  }
+  else
+  {
+    netgen::Point3d pmin, pmax;
+    ngMesh->GetBox (pmin, pmax);
+    netgen::mparam.maxh = Dist(pmin, pmax)/2;
+  }
+
+  if ( !aParams.has_netgen_param && aMesh.HasShapeToMesh() )
+  {
+    netgen::mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( helper.GetSubShape(), netgen::mparam.maxh );
+  }
+
+  try
+  {
+    OCC_CATCH_SIGNALS;
+
+    ngLib.CalcLocalH(ngMesh);
+    err = ngLib.GenerateMesh(occgeo, startWith, endWith, ngMesh);
+
+    if(netgen::multithread.terminate)
+      return false;
+    if ( err )
+      return error(SMESH_Comment("Error in netgen::OCCGenerateMesh() at ") << netgen::multithread.task);
+  }
+  catch (Standard_Failure& ex)
+  {
+    SMESH_Comment str("Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()");
+    str << " at " << netgen::multithread.task
+        << ": " << ex.DynamicType()->Name();
+    if ( ex.GetMessageString() && strlen( ex.GetMessageString() ))
+      str << ": " << ex.GetMessageString();
+    return error(str);
+  }
+  catch (netgen::NgException& exc)
+  {
+    SMESH_Comment str("NgException");
+    if ( strlen( netgen::multithread.task ) > 0 )
+      str << " at " << netgen::multithread.task;
+    str << ": " << exc.What();
+    return error(str);
+  }
+  catch (...)
+  {
+    SMESH_Comment str("Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()");
+    if ( strlen( netgen::multithread.task ) > 0 )
+      str << " at " << netgen::multithread.task;
+    return error(str);
+  }
+
+  int Netgen_NbOfNodesNew = Ng_GetNP(Netgen_mesh);
+  int Netgen_NbOfTetra    = Ng_GetNE(Netgen_mesh);
+
+  // -------------------------------------------------------------------
+  // Feed back the SMESHDS with the generated Nodes and Volume Elements
+  // -------------------------------------------------------------------
+
+  if ( err )
+  {
+    SMESH_ComputeErrorPtr ce = NETGENPlugin_Mesher::ReadErrors(nodeVec);
+    if ( ce && ce->HasBadElems() )
+      return error( ce );
+  }
+  auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
+  std::cout << "Time for netgen_compute: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
+  bool isOK = ( /*status == NG_OK &&*/ Netgen_NbOfTetra > 0 );// get whatever built
+  if ( isOK && !new_element_file.empty() )
+  {
+    std::ofstream df(new_element_file, ios::out|ios::binary);
+
+    double Netgen_point[3];
+    int    Netgen_tetrahedron[4];
+
+    // Writing nodevec (correspondence netgen numbering mesh numbering)
+    // Number of nodes
+    df.write((char*) &Netgen_NbOfNodes, sizeof(int));
+    df.write((char*) &Netgen_NbOfNodesNew, sizeof(int));
+    for (int nodeIndex = 1 ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodes; ++nodeIndex )
+    {
+      //Id of the point
+      int id = nodeVec.at(nodeIndex)->GetID();
+      df.write((char*) &id, sizeof(int));
+    }
+
+    // Writing info on new points
+    for (int nodeIndex = Netgen_NbOfNodes +1 ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodesNew; ++nodeIndex )
+    {
+      Ng_GetPoint(Netgen_mesh, nodeIndex, Netgen_point );
+      // Coordinates of the point
+      df.write((char *) &Netgen_point, sizeof(double)*3);
+    }
+
+    // create tetrahedrons
+    df.write((char*) &Netgen_NbOfTetra, sizeof(int));
+    for ( int elemIndex = 1; elemIndex <= Netgen_NbOfTetra; ++elemIndex )
+    {
+      Ng_GetVolumeElement(Netgen_mesh, elemIndex, Netgen_tetrahedron);
+      df.write((char*) &Netgen_tetrahedron, sizeof(int)*4);
+    }
+  }
+  auto time3 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time3-time2);
+  std::cout << "Time for write_new_elem: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
+
+  // Adding new elements in aMesh as well
+  if ( output_mesh )
+  {
+    double Netgen_point[3];
+    int    Netgen_tetrahedron[4];
+
+    // create and insert new nodes into nodeVec
+    nodeVec.resize( Netgen_NbOfNodesNew + 1, 0 );
+    int nodeIndex = Netgen_NbOfNodes + 1;
+    for ( ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodesNew; ++nodeIndex )
+    {
+      Ng_GetPoint( Netgen_mesh, nodeIndex, Netgen_point );
+      nodeVec.at(nodeIndex) = helper.AddNode(Netgen_point[0],
+                                             Netgen_point[1],
+                                             Netgen_point[2]);
+    }
+
+    // create tetrahedrons
+    for ( int elemIndex = 1; elemIndex <= Netgen_NbOfTetra; ++elemIndex )
+    {
+      Ng_GetVolumeElement(Netgen_mesh, elemIndex, Netgen_tetrahedron);
+      try
+      {
+        helper.AddVolume (nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[0] ),
+                          nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[1] ),
+                          nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[2] ),
+                          nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[3] ));
+      }
+      catch (...)
+      {
+      }
+    }
+    auto time4 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+    elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time4-time3);
+    std::cout << "Time for add_element_to_smesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
+  }
+
+  return !err;
+}
+
+/**
+ * @brief compute mesh with netgen2d
+ *
+ * @param input_mesh_file Input Mesh file
+ * @param shape_file Shape file
+ * @param hypo_file Parameter file
+ * @param new_element_file Binary file containing new nodes and new element info
+ * @param output_mesh If true will export mesh into output_mesh_file
+ * @param output_mesh_file Output Mesh file
+ *
+ * @return error code
+ */
+int netgen2d(const std::string input_mesh_file,
+             const std::string shape_file,
+             const std::string hypo_file,
+             const std::string element_orientation_file,
+             const std::string new_element_file,
+             const std::string output_mesh_file)
+{
+
+  // Importing mesh
+  SMESH_Gen gen;
+
+  SMESH_Mesh *myMesh = gen.CreateMesh(false);
+  //TODO: To define
+  std::string mesh_name = "Maillage_1";
+
+  importMesh(input_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
+
+  // Importing shape
+  TopoDS_Shape myShape;
+  importShape(shape_file, myShape);
+
+  // Importing hypothesis
+  netgen_params myParams;
+
+  importNetgenParams(hypo_file, myParams);
+
+  std::cout << "Meshing with netgen3d" << std::endl;
+  int ret = netgen2dInternal(myShape, *myMesh, myParams,
+                              new_element_file, element_orientation_file,
+                              !output_mesh_file.empty());
+
+  if(!ret){
+    std::cout << "Meshing failed" << std::endl;
+    return ret;
+  }
+
+  if(!output_mesh_file.empty())
+    exportMesh(output_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
+
+  return ret;
+}
+
+
+// TODO: Not working properly
+/**
+ * @brief Compute aShape within aMesh using netgen2d
+ *
+ * @param aShape the shape
+ * @param aMesh the mesh
+ * @param aParams the netgen parameters
+ * @param new_element_file file containing data on the new point/tetra added by netgen
+ *
+ * @return error code
+ */
+int netgen2dInternal(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
+                      std::string new_element_file, std::string element_orientation_file,
+                      bool output_mesh)
+{
+  netgen::multithread.terminate = 0;
+  netgen::multithread.task = "Surface meshing";
+
+  SMESHDS_Mesh* meshDS = aMesh.GetMeshDS();
+  SMESH_MesherHelper helper(aMesh);
+  helper.SetElementsOnShape( true );
+
+  NETGENPlugin_NetgenLibWrapper ngLib;
+  ngLib._isComputeOk = false;
+
+  netgen::Mesh   ngMeshNoLocSize;
+  netgen::Mesh * ngMeshes[2] = { (netgen::Mesh*) ngLib._ngMesh,  & ngMeshNoLocSize };
+  netgen::OCCGeometry occgeoComm;
+
+  std::map<vtkIdType, bool> elemOrientation;
+
+  typedef map< const SMDS_MeshNode*, int, TIDCompare > TNodeToIDMap;
+  typedef TNodeToIDMap::value_type                     TN2ID;
+  const int invalid_ID = -1;
+  int Netgen_NbOfNodes=0;
+  double Netgen_point[3];
+  int Netgen_segment[2];
+  int Netgen_triangle[3];
+
+  // min / max sizes are set as follows:
+  // if ( _hypParameters )
+  //    min and max are defined by the user
+  // else if ( aParams.has_LengthFromEdges_hyp )
+  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
+  //    max = average segment len of a FACE
+  // else if ( _hypMaxElementArea )
+  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
+  //    max = f( _hypMaxElementArea )
+  // else
+  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
+  //    max = max segment len of a FACE
+  NETGENPlugin_Mesher aMesher( &aMesh, aShape, /*isVolume=*/false);
+  set_netgen_parameters( aParams );
+  const bool toOptimize = aParams.optimize;
+  if ( aParams.has_maxelementvolume_hyp )
+  {
+    netgen::mparam.maxh = sqrt( 2. * aParams.maxElementVolume / sqrt(3.0) );
+  }
+  netgen::mparam.quad = aParams.quad;
+
+  // local size is common for all FACEs in aShape?
+  const bool isCommonLocalSize = ( !aParams.has_LengthFromEdges_hyp && !aParams.has_maxelementvolume_hyp && netgen::mparam.uselocalh );
+  const bool isDefaultHyp = ( !aParams.has_LengthFromEdges_hyp && !aParams.has_maxelementvolume_hyp && !aParams.has_netgen_param );
+
+
+  if ( isCommonLocalSize ) // compute common local size in ngMeshes[0]
+  {
+    //list< SMESH_subMesh* > meshedSM[4]; --> all sub-shapes are added to occgeoComm
+    aMesher.PrepareOCCgeometry( occgeoComm, aShape, aMesh );//, meshedSM );
+
+    // local size set at MESHCONST_ANALYSE step depends on
+    // minh, face_maxh, grading and curvaturesafety; find minh if not set by the user
+    if ( !aParams.has_netgen_param || netgen::mparam.minh < DBL_MIN )
+    {
+      if ( !aParams.has_netgen_param )
+        netgen::mparam.maxh = occgeoComm.GetBoundingBox().Diam() / 3.;
+      netgen::mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( aShape, netgen::mparam.maxh );
+    }
+    // set local size depending on curvature and NOT closeness of EDGEs
+#ifdef NETGEN_V6
+    const double factor = 2; //netgen::occparam.resthcloseedgefac;
+#else
+    const double factor = netgen::occparam.resthcloseedgefac;
+    netgen::occparam.resthcloseedgeenable = false;
+    netgen::occparam.resthcloseedgefac = 1.0 + netgen::mparam.grading;
+#endif
+    occgeoComm.face_maxh = netgen::mparam.maxh;
+#ifdef NETGEN_V6
+    netgen::OCCParameters occparam;
+    netgen::OCCSetLocalMeshSize( occgeoComm, *ngMeshes[0], netgen::mparam, occparam );
+#else
+    netgen::OCCSetLocalMeshSize( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+#endif
+    occgeoComm.emap.Clear();
+    occgeoComm.vmap.Clear();
+
+    // Reading list of element to integrate into netgen mesh
+    {
+      std::ifstream df(element_orientation_file, ios::in|ios::binary);
+      int nbElement;
+      vtkIdType id;
+      bool orient;
+      df.read((char*)&nbElement, sizeof(int));
+
+      for(int ielem=0;ielem<nbElement;++ielem){
+        df.read((char*) &id, sizeof(vtkIdType));
+        df.read((char*) &orient, sizeof(bool));
+        elemOrientation[id] = orient;
+      }
+    }
+
+    bool isIn;
+    // set local size according to size of existing segments
+    SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Edge);
+    while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
+    {
+      const SMDS_MeshElement* seg = iteratorElem->next();
+      // Keeping only element that are in the element orientation file
+      isIn = elemOrientation.count(seg->GetID())==1;
+
+      if(!isIn)
+        continue;
+
+      SMESH_TNodeXYZ n1 = seg->GetNode(0);
+      SMESH_TNodeXYZ n2 = seg->GetNode(1);
+      gp_XYZ p = 0.5 * ( n1 + n2 );
+      netgen::Point3d pi(p.X(), p.Y(), p.Z());
+      ngMeshes[0]->RestrictLocalH( pi, factor * ( n1 - n2 ).Modulus() );
+    }
+
+    // set local size defined on shapes
+    aMesher.SetLocalSize( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+    aMesher.SetLocalSizeForChordalError( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+    try {
+      ngMeshes[0]->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
+    } catch (netgen::NgException & ex) {
+      return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
+    }
+  }
+  netgen::mparam.uselocalh = toOptimize; // restore as it is used at surface optimization
+  // ==================
+  // Loop on all FACEs
+  // ==================
+
+  vector< const SMDS_MeshNode* > nodeVec;
+
+    // prepare occgeom
+    netgen::OCCGeometry occgeom;
+    occgeom.shape = aShape;
+    occgeom.fmap.Add( aShape );
+    occgeom.CalcBoundingBox();
+    occgeom.facemeshstatus.SetSize(1);
+    occgeom.facemeshstatus = 0;
+    occgeom.face_maxh_modified.SetSize(1);
+    occgeom.face_maxh_modified = 0;
+    occgeom.face_maxh.SetSize(1);
+    occgeom.face_maxh = netgen::mparam.maxh;
+
+    // -------------------------
+    // Fill netgen mesh
+    // -------------------------
+    // maps nodes to ng ID
+
+
+    // MESHCONST_ANALYSE step may lead to a failure, so we make an attempt
+    // w/o MESHCONST_ANALYSE at the second loop
+    int err = 0;
+    enum { LOC_SIZE, NO_LOC_SIZE };
+    int iLoop = isCommonLocalSize ? 0 : 1;
+    int faceID = occgeom.fmap.FindIndex(aShape);
+    int solidID = 0;
+    for ( ; iLoop < 2; iLoop++ )
+    {
+      //bool isMESHCONST_ANALYSE = false;
+      //TODO: check how to replace that
+      //InitComputeError();
+
+      netgen::Mesh * ngMesh = ngMeshes[ iLoop ];
+      ngMesh->DeleteMesh();
+
+      if ( iLoop == NO_LOC_SIZE )
+      {
+        ngMesh->SetGlobalH ( netgen::mparam.maxh );
+        ngMesh->SetMinimalH( netgen::mparam.minh );
+        netgen::Box<3> bb = occgeom.GetBoundingBox();
+        bb.Increase (bb.Diam()/10);
+        ngMesh->SetLocalH (bb.PMin(), bb.PMax(), netgen::mparam.grading);
+        aMesher.SetLocalSize( occgeom, *ngMesh );
+        aMesher.SetLocalSizeForChordalError( occgeoComm, *ngMesh );
+        try {
+          ngMesh->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
+        } catch (netgen::NgException & ex) {
+          return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
+        }
+      }
+
+      TNodeToIDMap nodeToNetgenID;
+
+      nodeVec.clear();
+      ngMesh->AddFaceDescriptor( netgen::FaceDescriptor( faceID, solidID, solidID, 0 ));
+          // set local size according to size of existing segments
+      SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Edge);
+      while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
+      {
+        const SMDS_MeshElement* elem = iteratorElem->next();
+        // Keeping only element that are in the element orientation file
+        bool isIn = elemOrientation.count(elem->GetID())==1;
+
+        if(!isIn)
+          continue;
+
+        bool isRev = elemOrientation[elem->GetID()];
+        std::cerr << isRev;
+
+
+
+        for ( int iN = 0; iN < 2; ++iN )
+        {
+          const SMDS_MeshNode* node = elem->GetNode( iN );
+          const int shapeID = node->getshapeId();
+          int& ngID = nodeToNetgenID.insert(TN2ID( node, invalid_ID )).first->second;
+          if ( ngID == invalid_ID )
+          {
+            ngID = ++Netgen_NbOfNodes;
+            Netgen_point [ 0 ] = node->X();
+            Netgen_point [ 1 ] = node->Y();
+            Netgen_point [ 2 ] = node->Z();
+            netgen::MeshPoint mp( netgen::Point<3> (node->X(), node->Y(), node->Z()) );
+            ngMesh->AddPoint ( mp, 1, netgen::EDGEPOINT );
+          }
+          Netgen_segment[ isRev ? 1-iN : iN ] = ngID;
+        }
+        // add segment
+
+        netgen::Segment seg;
+        seg[0] = Netgen_segment[0];
+        seg[1] = Netgen_segment[1];
+        seg.edgenr = ngMesh->GetNSeg() +1;
+        seg.si = faceID;
+
+        ngMesh->AddSegment(seg);
+      }
+      int nbNodes2 = ngMesh->GetNP();
+      int nseg = ngMesh->GetNSeg();
+
+      // insert old nodes into nodeVec
+      nodeVec.resize( nodeToNetgenID.size() + 1, 0 );
+      TNodeToIDMap::iterator n_id = nodeToNetgenID.begin();
+      for ( ; n_id != nodeToNetgenID.end(); ++n_id )
+        nodeVec[ n_id->second ] = n_id->first;
+      nodeToNetgenID.clear();
+
+
+      //if ( !isCommonLocalSize )
+      //limitSize( ngMesh, mparam.maxh * 0.8);
+
+      // -------------------------
+      // Generate surface mesh
+      // -------------------------
+
+      const int startWith = netgen::MESHCONST_MESHSURFACE;
+      const int endWith   = toOptimize ? netgen::MESHCONST_OPTSURFACE : netgen::MESHCONST_MESHSURFACE;
+
+      SMESH_Comment str;
+      try {
+        OCC_CATCH_SIGNALS;
+        err = ngLib.GenerateMesh(occgeom, startWith, endWith, ngMesh);
+        if ( netgen::multithread.terminate )
+          return false;
+        if ( err )
+          str << "Error in netgen::OCCGenerateMesh() at " << netgen::multithread.task;
+      }
+      catch (Standard_Failure& ex)
+      {
+        err = 1;
+        str << "Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()"
+            << " at " << netgen::multithread.task
+            << ": " << ex.DynamicType()->Name();
+        if ( ex.GetMessageString() && strlen( ex.GetMessageString() ))
+          str << ": " << ex.GetMessageString();
+      }
+      catch (...) {
+        err = 1;
+        str << "Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()"
+            << " at " << netgen::multithread.task;
+      }
+      if ( err )
+      {
+        if ( iLoop == LOC_SIZE )
+        {
+          std::cout << "Need second run" << std::endl;
+          /*netgen::mparam.minh = netgen::mparam.maxh;
+          netgen::mparam.maxh = 0;
+          for ( size_t iW = 0; iW < wires.size(); ++iW )
+          {
+            StdMeshers_FaceSidePtr wire = wires[ iW ];
+            const vector<UVPtStruct>& uvPtVec = wire->GetUVPtStruct();
+            for ( size_t iP = 1; iP < uvPtVec.size(); ++iP )
+            {
+              SMESH_TNodeXYZ   p( uvPtVec[ iP ].node );
+              netgen::Point3d np( p.X(),p.Y(),p.Z());
+              double segLen = p.Distance( uvPtVec[ iP-1 ].node );
+              double   size = ngMesh->GetH( np );
+              netgen::mparam.minh = Min( netgen::mparam.minh, size );
+              netgen::mparam.maxh = Max( netgen::mparam.maxh, segLen );
+            }
+          }
+          //cerr << "min " << mparam.minh << " max " << mparam.maxh << endl;
+          netgen::mparam.minh *= 0.9;
+          netgen::mparam.maxh *= 1.1;
+          */
+          continue;
+        }
+        else
+        {
+          //faceErr.reset( new SMESH_ComputeError( COMPERR_ALGO_FAILED, str ));
+        }
+      }
+
+      // ----------------------------------------------------
+      // Fill the SMESHDS with the generated nodes and faces
+      // ----------------------------------------------------
+
+      if(output_mesh)
+      {
+        int nbNodes = ngMesh->GetNP();
+        int nbFaces = ngMesh->GetNSE();
+        std::cout << nbFaces << " " << nbNodes << std::endl;
+
+        int nbInputNodes = (int) nodeVec.size()-1;
+        nodeVec.resize( nbNodes+1, 0 );
+
+        // add nodes
+        for ( int ngID = nbInputNodes + 1; ngID <= nbNodes; ++ngID )
+        {
+          const netgen::MeshPoint& ngPoint = ngMesh->Point( ngID );
+          SMDS_MeshNode * node = meshDS->AddNode(ngPoint(0), ngPoint(1), ngPoint(2));
+          nodeVec[ ngID ] = node;
+        }
+
+        // create faces
+        int i,j;
+        for ( i = 1; i <= nbFaces ; ++i )
+        {
+          Ng_GetVolumeElement(ngLib.ngMesh(), i, Netgen_triangle);
+
+          helper.AddFace (nodeVec.at( Netgen_triangle[0] ),
+                          nodeVec.at( Netgen_triangle[1] ),
+                          nodeVec.at( Netgen_triangle[2] ));
+
+        }
+      } // output_mesh
+
+      break;
+    } // two attempts
+  //} // loop on FACEs
+
+  return true;
+
+}
diff --git a/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner.hxx b/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner.hxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..fe4d6c9
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,70 @@
+// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+// This library is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// This library is distributed in the hope that it will be useful,
+// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+// Lesser General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License along with this library; if not, write to the Free Software
+// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+
+//  File   : NETGENPlugin_Runner.hxx
+//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
+//  Module : NETGEN
+//
+
+#ifndef _NETGENPLUGIN_RUNNER_HXX_
+#define _NETGENPLUGIN_RUNNER_HXX_
+
+#include <string>
+#include <iostream>
+
+class TopoDS_Shape;
+class SMESH_Mesh;
+class SMESH_Comment;
+class netgen_params;
+
+int netgen2dInternal(TopoDS_Shape &aShape,
+             SMESH_Mesh& aMesh,
+             netgen_params& aParams,
+             std::string new_element_file,
+             std::string element_orientation_file,
+             bool output_mesh);
+int netgen2d(const std::string input_mesh_file,
+             const std::string shape_file,
+             const std::string hypo_file,
+             const std::string element_orientation_file,
+             const std::string new_element_file,
+             const std::string output_mesh_file);
+
+int netgen3dInternal(TopoDS_Shape &aShape,
+             SMESH_Mesh& aMesh,
+             netgen_params& aParams,
+             std::string new_element_file,
+             std::string element_orientation_file,
+             bool output_mesh);
+int netgen3d(const std::string input_mesh_file,
+             const std::string shape_file,
+             const std::string hypo_file,
+             const std::string element_orientation_file,
+             const std::string new_element_file,
+             const std::string output_mesh_file,
+             int nbThreads);
+
+//TODO: Tmp function replace by real error handling
+int error(int error_type, std::string msg);
+int error(const SMESH_Comment& comment);
+
+#endif
\ No newline at end of file
diff --git a/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner_main.cxx b/src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Runner_main.cxx
new file mode 100644 (file)
index 0000000..709e118
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,105 @@
+// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
+//
+// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
+// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
+//
+// This library is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// This library is distributed in the hope that it will be useful,
+// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+// Lesser General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License along with this library; if not, write to the Free Software
+// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+//
+// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
+//
+
+//  File   : NETGENplugin_Runnner_main.cxx
+//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
+//  Module : NETGEN
+//
+
+
+#include "NETGENPlugin_Runner.hxx"
+
+#include <stdio.h>
+#include <string.h>
+#include <iostream>
+#include <chrono>
+
+/**
+ * @brief Main function
+ *
+ * @param argc Number of arguments
+ * @param argv Arguments
+ *
+ * @return error code
+ */
+int main(int argc, char *argv[]){
+
+  if(argc!=9||(argc==2 && (strcmp(argv[1], "-h") == 0 || strcmp(argv[1], "--help")==0))){
+    std::cout << "Error in number of arguments "<< argc<<" given expected 8" <<std::endl;
+    std::cout << "Syntax:"<<std::endl;
+    std::cout << "run_mesher MESHER INPUT_MESH_FILE SHAPE_FILE HYPO_FILE" << std::endl;
+    std::cout << "           ELEM_ORIENT_FILE NB_THREADS" << std::endl;
+    std::cout << "           NEW_ELEMENT_FILE OUTPUT_MESH_FILE" << std::endl;
+    std::cout << std::endl;
+    std::cout << " Set argument to NONE to ignore them " << std::endl;
+    std::cout << std::endl;
+    std::cout << "Args:" << std::endl;
+    std::cout << "  MESHER: mesher to use from (NETGEN3D, NETGEN2D)" << std::endl;
+    std::cout << "  INPUT_MESH_FILE: MED File containing lower-dimension-elements already meshed" << std::endl;
+    std::cout << "  SHAPE_FILE: STEP file containing the shape to mesh" << std::endl;
+    std::cout << "  HYPO_FILE: Ascii file containint the list of parameters" << std::endl;
+    std::cout << "  (optional) ELEM_ORIENT_FILE: binary file containing the list of element from INPUT_MESH_FILE associated to the shape and their orientation" << std::endl;
+    std::cout << "  NB_THREADS: Number of thread to use for the mesher" << std::endl;
+    std::cout << "  (optional) NEW_ELEMENT_FILE: (out) contains elements and nodes added by the meshing" << std::endl;
+    std::cout << "  (optional) OUTPUT_MESH_FILE: (out) MED File containing the mesh after the run of the mesher" << std::endl;
+    return 0;
+  }
+  std::string mesher=argv[1];
+  std::string input_mesh_file=argv[2];
+  std::string shape_file=argv[3];
+  std::string hypo_file=argv[4];
+  std::string element_orientation_file=argv[5];
+  int nbThreads=std::stoi(argv[6]);
+  std::string new_element_file=argv[7];
+  std::string output_mesh_file=argv[8];
+
+  if (output_mesh_file == "NONE")
+    output_mesh_file = "";
+  if (element_orientation_file == "NONE")
+    element_orientation_file = "";
+  if (new_element_file == "NONE")
+    new_element_file = "";
+
+  if (mesher=="NETGEN3D"){
+    auto begin = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+    netgen3d(input_mesh_file,
+             shape_file,
+             hypo_file,
+             element_orientation_file,
+             new_element_file,
+             output_mesh_file,
+             nbThreads);
+    auto end = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+    auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(end - begin);
+    std::cout << "Time elapsed: " << elapsed.count()*1e-9 << std::endl;
+  } else if (mesher=="NETGEN2D"){
+    netgen2d(input_mesh_file,
+             shape_file,
+             hypo_file,
+             element_orientation_file,
+             new_element_file,
+             output_mesh_file);
+  } else {
+    std::cerr << "Unknown mesher:" << mesher << std::endl;
+  }
+  return 0;
+}
diff --git a/src/NETGENPlugin/netgen_mesher.cxx b/src/NETGENPlugin/netgen_mesher.cxx
deleted file mode 100644 (file)
index d867f3b..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,1040 +0,0 @@
-// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
-//
-// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
-// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
-//
-// This library is free software; you can redistribute it and/or
-// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
-// License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
-//
-// This library is distributed in the hope that it will be useful,
-// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
-// Lesser General Public License for more details.
-//
-// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
-// License along with this library; if not, write to the Free Software
-// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
-//
-// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
-//
-
-//  File   : netgen_mesher.cxx
-//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
-//  Module : SMESH
-//
-
-#include "netgen_mesher.hxx"
-
-#include "DriverStep.hxx"
-#include "DriverMesh.hxx"
-#include "netgen_param.hxx"
-
-#include <fstream>
-#include <vector>
-#include <filesystem>
-namespace fs = std::filesystem;
-#include <chrono>
-
-// SMESH include
-#include <SMESH_Mesh.hxx>
-#include <SMESH_subMesh.hxx>
-#include <SMESH_Gen.hxx>
-#include <SMESH_Algo.hxx>
-#include <SMESHDS_Mesh.hxx>
-#include <SMESH_ControlsDef.hxx>
-#include <SMESH_Comment.hxx>
-#include <SMESH_ComputeError.hxx>
-#include <SMESH_MesherHelper.hxx>
-#include <StdMeshers_MaxElementVolume.hxx>
-#include <StdMeshers_QuadToTriaAdaptor.hxx>
-#include <StdMeshers_ViscousLayers.hxx>
-#include <StdMeshers_ViscousLayers2D.hxx>
-
-
-// NETGENPlugin
-// #include <NETGENPlugin_Mesher.hxx>
-// #include <NETGENPlugin_Hypothesis.hxx>
-#include "NETGENPlugin_Mesher.hxx"
-#include "NETGENPlugin_Hypothesis.hxx"
-
-
-// OCC include
-#include <TopoDS.hxx>
-#include <BRepClass3d_SolidClassifier.hxx>
-#include <GProp_GProps.hxx>
-#include <BRepGProp.hxx>
-
-#include <Standard_Failure.hxx>
-#include <Standard_ErrorHandler.hxx>
-/*
-  Netgen include files
-*/
-
-#ifndef OCCGEOMETRY
-#define OCCGEOMETRY
-#endif
-#include <occgeom.hpp>
-#include <meshing.hpp>
-
-#ifdef NETGEN_V5
-#include <ngexception.hpp>
-#endif
-#ifdef NETGEN_V6
-#include <core/exception.hpp>
-#endif
-
-namespace nglib {
-#include <nglib.h>
-}
-namespace netgen {
-
-  NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
-  extern MeshingParameters mparam;
-
-  NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
-  extern volatile multithreadt multithread;
-
-  NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
-  extern bool merge_solids;
-
-#ifdef NETGEN_V5
-  extern void OCCSetLocalMeshSize(OCCGeometry & geom, Mesh & mesh);
-#endif
-}
-using namespace nglib;
-
-int error(int error_type, std::string msg)
-{
- std::cerr << msg << std::endl;
-  return error_type;
-};
-
-int error(const SMESH_Comment& comment)
-{
-  return error(1, "SMESH_Comment error: "+comment);
-};
-
-/**
- * @brief Set the netgen parameters
- *
- * @param aParams Internal structure of parameters
- * @param mparams Netgen strcuture of parameters
- */
-void set_netgen_parameters(netgen_params& aParams)
-{
-
-  // Default parameters
-#ifdef NETGEN_V6
-
-  //netgen::mparam.nthreads = std::thread::hardware_concurrency();
-  netgen::mparam.nthreads = aParams.nbThreads;
-  netgen::mparam.parallel_meshing = aParams.nbThreads > 1;
-
-
-  if ( getenv( "SALOME_NETGEN_DISABLE_MULTITHREADING" ))
-  {
-    netgen::mparam.nthreads = 1;
-    netgen::mparam.parallel_meshing = false;
-  }
-
-#endif
-
-  // Initialize global NETGEN parameters:
-  netgen::mparam.maxh               = aParams.maxh;
-  netgen::mparam.minh               = aParams.minh;
-  netgen::mparam.segmentsperedge    = aParams.segmentsperedge;
-  netgen::mparam.grading            = aParams.grading;
-  netgen::mparam.curvaturesafety    = aParams.curvaturesafety;
-  netgen::mparam.secondorder        = aParams.secondorder;
-  netgen::mparam.quad               = aParams.quad;
-  netgen::mparam.uselocalh          = aParams.uselocalh;
-  netgen::merge_solids       = aParams.merge_solids;
-  netgen::mparam.optsteps2d         = aParams.optsteps2d;
-  netgen::mparam.optsteps3d         = aParams.optsteps3d;
-  netgen::mparam.elsizeweight       = aParams.elsizeweight;
-  netgen::mparam.opterrpow          = aParams.opterrpow;
-  netgen::mparam.delaunay           = aParams.delaunay;
-  netgen::mparam.checkoverlap       = aParams.checkoverlap;
-  netgen::mparam.checkchartboundary = aParams.checkchartboundary;
-#ifdef NETGEN_V6
-  // std::string
-  netgen::mparam.meshsizefilename = aParams.meshsizefilename;
-  netgen::mparam.closeedgefac = aParams.closeedgefac;
-
-#else
-  // const char*
-  netgen::mparam.meshsizefilename= aParams.meshsizefilename.empty() ? 0 : aParams.meshsizefilename.c_str();
-#endif
-}
-
-/**
- * @brief compute mesh with netgen3d
- *
- * @param input_mesh_file Input Mesh file
- * @param shape_file Shape file
- * @param hypo_file Parameter file
- * @param new_element_file Binary file containing new nodes and new element info
- * @param output_mesh If true will export mesh into output_mesh_file
- * @param output_mesh_file Output Mesh file
- *
- * @return error code
- */
-int netgen3d(const std::string input_mesh_file,
-             const std::string shape_file,
-             const std::string hypo_file,
-             const std::string element_orientation_file,
-             const std::string new_element_file,
-             bool output_mesh,
-             const std::string output_mesh_file,
-             int nbThreads)
-{
-  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-  // Importing mesh
-  SMESH_Gen gen;
-
-  SMESH_Mesh *myMesh = gen.CreateMesh(false);
-  //TODO: To define
-  std::string mesh_name = "Maillage_1";
-
-  import_mesh(input_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
-  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
-  std::cout << "Time for import_mesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
-
-  // Importing shape
-  TopoDS_Shape myShape;
-  import_shape(shape_file, myShape);
-  auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
-  std::cout << "Time for import_shape: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
-
-  // Importing hypothesis
-  netgen_params myParams;
-
-  import_netgen_params(hypo_file, myParams);
-  auto time3 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time3-time2);
-  std::cout << "Time for import_netgen_param: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
-  // Setting number of threads for netgen
-  myParams.nbThreads = nbThreads;
-
-  std::cout << "Meshing with netgen3d" << std::endl;
-  int ret = netgen3d_internal(myShape, *myMesh, myParams,
-                              new_element_file, element_orientation_file,
-                              output_mesh);
-
-
-  if(!ret){
-    std::cout << "Meshing failed" << std::endl;
-    return ret;
-  }
-
-  if(output_mesh){
-    auto time4 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-    export_mesh(output_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
-    auto time5 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-    elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time5-time4);
-    std::cout << "Time for export_mesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
-  }
-
-  return ret;
-}
-
-/**
- * @brief Compute aShape within aMesh using netgen3d
- *
- * @param aShape the shape
- * @param aMesh the mesh
- * @param aParams the netgen parameters
- * @param new_element_file file containing data on the new point/tetra added by netgen
- *
- * @return error code
- */
-int netgen3d_internal(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
-                      std::string new_element_file, std::string element_orientation_file,
-                      bool output_mesh)
-{
-
-  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-
-  netgen::multithread.terminate = 0;
-  netgen::multithread.task = "Volume meshing";
-
-  SMESHDS_Mesh* meshDS = aMesh.GetMeshDS();
-
-  SMESH_MesherHelper helper(aMesh);
-  aParams._quadraticMesh = helper.IsQuadraticSubMesh(aShape);
-  helper.SetElementsOnShape( true );
-
-  int Netgen_NbOfNodes = 0;
-  double Netgen_point[3];
-  int Netgen_triangle[3];
-
-  NETGENPlugin_NetgenLibWrapper ngLib;
-  Ng_Mesh * Netgen_mesh = (Ng_Mesh*)ngLib._ngMesh;
-
-  // vector of nodes in which node index == netgen ID
-  vector< const SMDS_MeshNode* > nodeVec;
-  {
-    const int invalid_ID = -1;
-
-    SMESH::Controls::Area areaControl;
-    SMESH::Controls::TSequenceOfXYZ nodesCoords;
-
-    // maps nodes to ng ID
-    typedef map< const SMDS_MeshNode*, int, TIDCompare > TNodeToIDMap;
-    typedef TNodeToIDMap::value_type                     TN2ID;
-    TNodeToIDMap nodeToNetgenID;
-
-    // find internal shapes
-    NETGENPlugin_Internals internals( aMesh, aShape, /*is3D=*/true );
-
-    // ---------------------------------
-    // Feed the Netgen with surface mesh
-    // ---------------------------------
-
-    TopAbs_ShapeEnum mainType = aMesh.GetShapeToMesh().ShapeType();
-    bool checkReverse = ( mainType == TopAbs_COMPOUND || mainType == TopAbs_COMPSOLID );
-
-    SMESH_ProxyMesh::Ptr proxyMesh( new SMESH_ProxyMesh( aMesh ));
-    if ( aParams._viscousLayersHyp )
-    {
-      netgen::multithread.percent = 3;
-      proxyMesh = aParams._viscousLayersHyp->Compute( aMesh, aShape );
-      if ( !proxyMesh )
-        return false;
-    }
-    if ( aMesh.NbQuadrangles() > 0 )
-    {
-      netgen::multithread.percent = 6;
-      StdMeshers_QuadToTriaAdaptor* Adaptor = new StdMeshers_QuadToTriaAdaptor;
-      Adaptor->Compute(aMesh,aShape,proxyMesh.get());
-      proxyMesh.reset( Adaptor );
-    }
-
-    // Get list of elements + their orientation from element_orientation file
-    std::map<vtkIdType, bool> elemOrientation;
-    {
-      std::ifstream df(element_orientation_file, ios::binary|ios::in);
-      int nbElement;
-      bool orient;
-
-      // Warning of the use of vtkIdType (I had issue when run_mesher was compiled with internal vtk) and salome not
-      // Sizeof was the same but how he othered the type was different
-      // Maybe using another type (uint64_t) instead would be better
-      vtkIdType id;
-      df.read((char*)&nbElement, sizeof(int));
-
-      for(int ielem=0;ielem<nbElement;++ielem){
-        df.read((char*) &id, sizeof(vtkIdType));
-        df.read((char*) &orient, sizeof(bool));
-        elemOrientation[id] = orient;
-      }
-    }
-
-    // Adding elements from Mesh
-    SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Face);
-    bool isRev;
-    bool isInternalFace = false;
-
-    bool isIn;
-
-    while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
-      {
-        // check mesh face
-        const SMDS_MeshElement* elem = iteratorElem->next();
-        if ( !elem )
-          return error( COMPERR_BAD_INPUT_MESH, "Null element encounters");
-        if ( elem->NbCornerNodes() != 3 )
-          return error( COMPERR_BAD_INPUT_MESH, "Not triangle element encounters");
-
-        // Keeping only element that are in the element orientation file
-        isIn = elemOrientation.count(elem->GetID())==1;
-
-        if(!isIn)
-          continue;
-
-
-        // Get orientation
-        // Netgen requires that all the triangle point outside
-        isRev = elemOrientation[elem->GetID()];
-
-        // Add nodes of triangles and triangles them-selves to netgen mesh
-
-        // add three nodes of triangle
-        bool hasDegen = false;
-        for ( int iN = 0; iN < 3; ++iN )
-        {
-          const SMDS_MeshNode* node = elem->GetNode( iN );
-          const int shapeID = node->getshapeId();
-          if ( node->GetPosition()->GetTypeOfPosition() == SMDS_TOP_EDGE &&
-               helper.IsDegenShape( shapeID ))
-          {
-            // ignore all nodes on degeneraged edge and use node on its vertex instead
-            TopoDS_Shape vertex = TopoDS_Iterator( meshDS->IndexToShape( shapeID )).Value();
-            node = SMESH_Algo::VertexNode( TopoDS::Vertex( vertex ), meshDS );
-            hasDegen = true;
-          }
-          int& ngID = nodeToNetgenID.insert(TN2ID( node, invalid_ID )).first->second;
-          if ( ngID == invalid_ID )
-          {
-            ngID = ++Netgen_NbOfNodes;
-            Netgen_point [ 0 ] = node->X();
-            Netgen_point [ 1 ] = node->Y();
-            Netgen_point [ 2 ] = node->Z();
-            Ng_AddPoint(Netgen_mesh, Netgen_point);
-          }
-
-          Netgen_triangle[ isRev ? 2-iN : iN ] = ngID;
-        }
-        // add triangle
-        if ( hasDegen && (Netgen_triangle[0] == Netgen_triangle[1] ||
-                          Netgen_triangle[0] == Netgen_triangle[2] ||
-                          Netgen_triangle[2] == Netgen_triangle[1] ))
-          continue;
-
-        Ng_AddSurfaceElement(Netgen_mesh, NG_TRIG, Netgen_triangle);
-
-        // TODO: Handle that case (quadrangle 2D) (isInternal is set to false)
-        if ( isInternalFace && !proxyMesh->IsTemporary( elem ))
-        {
-          swap( Netgen_triangle[1], Netgen_triangle[2] );
-          Ng_AddSurfaceElement(Netgen_mesh, NG_TRIG, Netgen_triangle);
-        }
-      }
-
-    // insert old nodes into nodeVec
-    nodeVec.resize( nodeToNetgenID.size() + 1, 0 );
-    TNodeToIDMap::iterator n_id = nodeToNetgenID.begin();
-    for ( ; n_id != nodeToNetgenID.end(); ++n_id )
-      nodeVec[ n_id->second ] = n_id->first;
-    nodeToNetgenID.clear();
-
-    // TODO: Handle internal vertex
-    //if ( internals.hasInternalVertexInSolid() )
-    //{
-    //  netgen::OCCGeometry occgeo;
-    //  NETGENPlugin_Mesher::AddIntVerticesInSolids( occgeo,
-    //                                               (netgen::Mesh&) *Netgen_mesh,
-    //                                               nodeVec,
-    //                                               internals);
-    //}
-  }
-  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
-  std::cout << "Time for fill_in_ngmesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
-
-  // -------------------------
-  // Generate the volume mesh
-  // -------------------------
-  netgen::multithread.terminate = 0;
-
-  netgen::Mesh* ngMesh = ngLib._ngMesh;
-  Netgen_mesh = ngLib.ngMesh();
-  Netgen_NbOfNodes = Ng_GetNP( Netgen_mesh );
-
-
-  int startWith = netgen::MESHCONST_MESHVOLUME;
-  int endWith   = netgen::MESHCONST_OPTVOLUME;
-  int err = 1;
-
-  NETGENPlugin_Mesher aMesher( &aMesh, helper.GetSubShape(), /*isVolume=*/true );
-  netgen::OCCGeometry occgeo;
-  set_netgen_parameters(aParams);
-
-  if ( aParams.has_netgen_param )
-  {
-    if ( aParams.has_local_size)
-    {
-      if ( ! &ngMesh->LocalHFunction() )
-      {
-        netgen::Point3d pmin, pmax;
-        ngMesh->GetBox( pmin, pmax, 0 );
-        ngMesh->SetLocalH( pmin, pmax, aParams.grading );
-      }
-      aMesher.SetLocalSize( occgeo, *ngMesh );
-
-      try {
-        ngMesh->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
-      } catch (netgen::NgException & ex) {
-        return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
-      }
-    }
-    if ( !aParams.optimize )
-      endWith = netgen::MESHCONST_MESHVOLUME;
-  }
-  else if ( aParams.has_maxelementvolume_hyp )
-  {
-    netgen::mparam.maxh = pow( 72, 1/6. ) * pow( aParams.maxElementVolume, 1/3. );
-    // limitVolumeSize( ngMesh, netgen::mparam.maxh ); // result is unpredictable
-  }
-  else if ( aMesh.HasShapeToMesh() )
-  {
-    aMesher.PrepareOCCgeometry( occgeo, helper.GetSubShape(), aMesh );
-    netgen::mparam.maxh = occgeo.GetBoundingBox().Diam()/2;
-  }
-  else
-  {
-    netgen::Point3d pmin, pmax;
-    ngMesh->GetBox (pmin, pmax);
-    netgen::mparam.maxh = Dist(pmin, pmax)/2;
-  }
-
-  if ( !aParams.has_netgen_param && aMesh.HasShapeToMesh() )
-  {
-    netgen::mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( helper.GetSubShape(), netgen::mparam.maxh );
-  }
-
-  try
-  {
-    OCC_CATCH_SIGNALS;
-
-    ngLib.CalcLocalH(ngMesh);
-    err = ngLib.GenerateMesh(occgeo, startWith, endWith, ngMesh);
-
-    if(netgen::multithread.terminate)
-      return false;
-    if ( err )
-      return error(SMESH_Comment("Error in netgen::OCCGenerateMesh() at ") << netgen::multithread.task);
-  }
-  catch (Standard_Failure& ex)
-  {
-    SMESH_Comment str("Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()");
-    str << " at " << netgen::multithread.task
-        << ": " << ex.DynamicType()->Name();
-    if ( ex.GetMessageString() && strlen( ex.GetMessageString() ))
-      str << ": " << ex.GetMessageString();
-    return error(str);
-  }
-  catch (netgen::NgException& exc)
-  {
-    SMESH_Comment str("NgException");
-    if ( strlen( netgen::multithread.task ) > 0 )
-      str << " at " << netgen::multithread.task;
-    str << ": " << exc.What();
-    return error(str);
-  }
-  catch (...)
-  {
-    SMESH_Comment str("Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()");
-    if ( strlen( netgen::multithread.task ) > 0 )
-      str << " at " << netgen::multithread.task;
-    return error(str);
-  }
-
-  int Netgen_NbOfNodesNew = Ng_GetNP(Netgen_mesh);
-  int Netgen_NbOfTetra    = Ng_GetNE(Netgen_mesh);
-
-  // -------------------------------------------------------------------
-  // Feed back the SMESHDS with the generated Nodes and Volume Elements
-  // -------------------------------------------------------------------
-
-  if ( err )
-  {
-    SMESH_ComputeErrorPtr ce = NETGENPlugin_Mesher::ReadErrors(nodeVec);
-    if ( ce && ce->HasBadElems() )
-      return error( ce );
-  }
-  auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
-  std::cout << "Time for netgen_compute: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
-
-  bool isOK = ( /*status == NG_OK &&*/ Netgen_NbOfTetra > 0 );// get whatever built
-  if ( isOK )
-  {
-    std::ofstream df(new_element_file, ios::out|ios::binary);
-
-    double Netgen_point[3];
-    int    Netgen_tetrahedron[4];
-
-    // Writing nodevec (correspondence netgen numbering mesh numbering)
-    // Number of nodes
-    df.write((char*) &Netgen_NbOfNodes, sizeof(int));
-    df.write((char*) &Netgen_NbOfNodesNew, sizeof(int));
-    for (int nodeIndex = 1 ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodes; ++nodeIndex )
-    {
-      //Id of the point
-      int id = nodeVec.at(nodeIndex)->GetID();
-      df.write((char*) &id, sizeof(int));
-    }
-
-    // Writing info on new points
-    for (int nodeIndex = Netgen_NbOfNodes +1 ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodesNew; ++nodeIndex )
-    {
-      Ng_GetPoint(Netgen_mesh, nodeIndex, Netgen_point );
-      // Coordinates of the point
-      df.write((char *) &Netgen_point, sizeof(double)*3);
-    }
-
-    // create tetrahedrons
-    df.write((char*) &Netgen_NbOfTetra, sizeof(int));
-    for ( int elemIndex = 1; elemIndex <= Netgen_NbOfTetra; ++elemIndex )
-    {
-      Ng_GetVolumeElement(Netgen_mesh, elemIndex, Netgen_tetrahedron);
-      df.write((char*) &Netgen_tetrahedron, sizeof(int)*4);
-    }
-  }
-  auto time3 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time3-time2);
-  std::cout << "Time for write_new_elem: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
-
-
-  // Adding new files in aMesh as well
-  if ( output_mesh )
-  {
-    double Netgen_point[3];
-    int    Netgen_tetrahedron[4];
-
-    // create and insert new nodes into nodeVec
-    nodeVec.resize( Netgen_NbOfNodesNew + 1, 0 );
-    int nodeIndex = Netgen_NbOfNodes + 1;
-    for ( ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodesNew; ++nodeIndex )
-    {
-      Ng_GetPoint( Netgen_mesh, nodeIndex, Netgen_point );
-      nodeVec.at(nodeIndex) = helper.AddNode(Netgen_point[0],
-                                             Netgen_point[1],
-                                             Netgen_point[2]);
-    }
-
-    // create tetrahedrons
-    for ( int elemIndex = 1; elemIndex <= Netgen_NbOfTetra; ++elemIndex )
-    {
-      Ng_GetVolumeElement(Netgen_mesh, elemIndex, Netgen_tetrahedron);
-      try
-      {
-        helper.AddVolume (nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[0] ),
-                          nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[1] ),
-                          nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[2] ),
-                          nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[3] ));
-      }
-      catch (...)
-      {
-      }
-    }
-    auto time4 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-    elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time4-time3);
-    std::cout << "Time for add_element_to_smesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
-
-  }
-
-  return !err;
-}
-
-/**
- * @brief compute mesh with netgen2d
- *
- * @param input_mesh_file Input Mesh file
- * @param shape_file Shape file
- * @param hypo_file Parameter file
- * @param new_element_file Binary file containing new nodes and new element info
- * @param output_mesh If true will export mesh into output_mesh_file
- * @param output_mesh_file Output Mesh file
- *
- * @return error code
- */
-int netgen2d(const std::string input_mesh_file,
-             const std::string shape_file,
-             const std::string hypo_file,
-             const std::string element_orientation_file,
-             const std::string new_element_file,
-             bool output_mesh,
-             const std::string output_mesh_file)
-{
-
-  // Importing mesh
-  SMESH_Gen gen;
-
-  SMESH_Mesh *myMesh = gen.CreateMesh(false);
-  //TODO: To define
-  std::string mesh_name = "Maillage_1";
-
-  import_mesh(input_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
-
-  // Importing shape
-  TopoDS_Shape myShape;
-  import_shape(shape_file, myShape);
-
-  // Importing hypothesis
-  netgen_params myParams;
-
-  import_netgen_params(hypo_file, myParams);
-
-  std::cout << "Meshing with netgen3d" << std::endl;
-  int ret = netgen2d_internal(myShape, *myMesh, myParams,
-                              new_element_file, element_orientation_file,
-                              output_mesh);
-
-  if(!ret){
-    std::cout << "Meshing failed" << std::endl;
-    return ret;
-  }
-
-  if(output_mesh)
-    export_mesh(output_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
-
-  return ret;
-}
-
-
-// TODO: Not working properly
-/**
- * @brief Compute aShape within aMesh using netgen2d
- *
- * @param aShape the shape
- * @param aMesh the mesh
- * @param aParams the netgen parameters
- * @param new_element_file file containing data on the new point/tetra added by netgen
- *
- * @return error code
- */
-int netgen2d_internal(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
-                      std::string new_element_file, std::string element_orientation_file,
-                      bool output_mesh)
-{
-  netgen::multithread.terminate = 0;
-  netgen::multithread.task = "Surface meshing";
-
-  SMESHDS_Mesh* meshDS = aMesh.GetMeshDS();
-  SMESH_MesherHelper helper(aMesh);
-  helper.SetElementsOnShape( true );
-
-  NETGENPlugin_NetgenLibWrapper ngLib;
-  ngLib._isComputeOk = false;
-
-  netgen::Mesh   ngMeshNoLocSize;
-  netgen::Mesh * ngMeshes[2] = { (netgen::Mesh*) ngLib._ngMesh,  & ngMeshNoLocSize };
-  netgen::OCCGeometry occgeoComm;
-
-  std::map<vtkIdType, bool> elemOrientation;
-
-  typedef map< const SMDS_MeshNode*, int, TIDCompare > TNodeToIDMap;
-  typedef TNodeToIDMap::value_type                     TN2ID;
-  const int invalid_ID = -1;
-  int Netgen_NbOfNodes=0;
-  double Netgen_point[3];
-  int Netgen_segment[2];
-  int Netgen_triangle[3];
-
-  // min / max sizes are set as follows:
-  // if ( _hypParameters )
-  //    min and max are defined by the user
-  // else if ( aParams.has_LengthFromEdges_hyp )
-  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
-  //    max = average segment len of a FACE
-  // else if ( _hypMaxElementArea )
-  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
-  //    max = f( _hypMaxElementArea )
-  // else
-  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
-  //    max = max segment len of a FACE
-  NETGENPlugin_Mesher aMesher( &aMesh, aShape, /*isVolume=*/false);
-  set_netgen_parameters( aParams );
-  const bool toOptimize = aParams.optimize;
-  if ( aParams.has_maxelementvolume_hyp )
-  {
-    netgen::mparam.maxh = sqrt( 2. * aParams.maxElementVolume / sqrt(3.0) );
-  }
-  netgen::mparam.quad = aParams.quad;
-
-  // local size is common for all FACEs in aShape?
-  const bool isCommonLocalSize = ( !aParams.has_LengthFromEdges_hyp && !aParams.has_maxelementvolume_hyp && netgen::mparam.uselocalh );
-  const bool isDefaultHyp = ( !aParams.has_LengthFromEdges_hyp && !aParams.has_maxelementvolume_hyp && !aParams.has_netgen_param );
-
-
-  if ( isCommonLocalSize ) // compute common local size in ngMeshes[0]
-  {
-    //list< SMESH_subMesh* > meshedSM[4]; --> all sub-shapes are added to occgeoComm
-    aMesher.PrepareOCCgeometry( occgeoComm, aShape, aMesh );//, meshedSM );
-
-    // local size set at MESHCONST_ANALYSE step depends on
-    // minh, face_maxh, grading and curvaturesafety; find minh if not set by the user
-    if ( !aParams.has_netgen_param || netgen::mparam.minh < DBL_MIN )
-    {
-      if ( !aParams.has_netgen_param )
-        netgen::mparam.maxh = occgeoComm.GetBoundingBox().Diam() / 3.;
-      netgen::mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( aShape, netgen::mparam.maxh );
-    }
-    // set local size depending on curvature and NOT closeness of EDGEs
-#ifdef NETGEN_V6
-    const double factor = 2; //netgen::occparam.resthcloseedgefac;
-#else
-    const double factor = netgen::occparam.resthcloseedgefac;
-    netgen::occparam.resthcloseedgeenable = false;
-    netgen::occparam.resthcloseedgefac = 1.0 + netgen::mparam.grading;
-#endif
-    occgeoComm.face_maxh = netgen::mparam.maxh;
-#ifdef NETGEN_V6
-    netgen::OCCParameters occparam;
-    netgen::OCCSetLocalMeshSize( occgeoComm, *ngMeshes[0], netgen::mparam, occparam );
-#else
-    netgen::OCCSetLocalMeshSize( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
-#endif
-    occgeoComm.emap.Clear();
-    occgeoComm.vmap.Clear();
-
-    // Reading list of element to integrate into netgen mesh
-    {
-      std::ifstream df(element_orientation_file, ios::in|ios::binary);
-      int nbElement;
-      vtkIdType id;
-      bool orient;
-      df.read((char*)&nbElement, sizeof(int));
-
-      for(int ielem=0;ielem<nbElement;++ielem){
-        df.read((char*) &id, sizeof(vtkIdType));
-        df.read((char*) &orient, sizeof(bool));
-        elemOrientation[id] = orient;
-      }
-    }
-
-    bool isIn;
-    // set local size according to size of existing segments
-    SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Edge);
-    while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
-    {
-      const SMDS_MeshElement* seg = iteratorElem->next();
-      // Keeping only element that are in the element orientation file
-      isIn = elemOrientation.count(seg->GetID())==1;
-
-      if(!isIn)
-        continue;
-
-      SMESH_TNodeXYZ n1 = seg->GetNode(0);
-      SMESH_TNodeXYZ n2 = seg->GetNode(1);
-      gp_XYZ p = 0.5 * ( n1 + n2 );
-      netgen::Point3d pi(p.X(), p.Y(), p.Z());
-      ngMeshes[0]->RestrictLocalH( pi, factor * ( n1 - n2 ).Modulus() );
-    }
-
-    // set local size defined on shapes
-    aMesher.SetLocalSize( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
-    aMesher.SetLocalSizeForChordalError( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
-    try {
-      ngMeshes[0]->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
-    } catch (netgen::NgException & ex) {
-      return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
-    }
-  }
-  netgen::mparam.uselocalh = toOptimize; // restore as it is used at surface optimization
-  // ==================
-  // Loop on all FACEs
-  // ==================
-
-  vector< const SMDS_MeshNode* > nodeVec;
-
-    // prepare occgeom
-    netgen::OCCGeometry occgeom;
-    occgeom.shape = aShape;
-    occgeom.fmap.Add( aShape );
-    occgeom.CalcBoundingBox();
-    occgeom.facemeshstatus.SetSize(1);
-    occgeom.facemeshstatus = 0;
-    occgeom.face_maxh_modified.SetSize(1);
-    occgeom.face_maxh_modified = 0;
-    occgeom.face_maxh.SetSize(1);
-    occgeom.face_maxh = netgen::mparam.maxh;
-
-    // -------------------------
-    // Fill netgen mesh
-    // -------------------------
-    // maps nodes to ng ID
-
-
-    // MESHCONST_ANALYSE step may lead to a failure, so we make an attempt
-    // w/o MESHCONST_ANALYSE at the second loop
-    int err = 0;
-    enum { LOC_SIZE, NO_LOC_SIZE };
-    int iLoop = isCommonLocalSize ? 0 : 1;
-    int faceID = occgeom.fmap.FindIndex(aShape);
-    int solidID = 0;
-    for ( ; iLoop < 2; iLoop++ )
-    {
-      //bool isMESHCONST_ANALYSE = false;
-      //TODO: check how to replace that
-      //InitComputeError();
-
-      netgen::Mesh * ngMesh = ngMeshes[ iLoop ];
-      ngMesh->DeleteMesh();
-
-      if ( iLoop == NO_LOC_SIZE )
-      {
-        ngMesh->SetGlobalH ( netgen::mparam.maxh );
-        ngMesh->SetMinimalH( netgen::mparam.minh );
-        netgen::Box<3> bb = occgeom.GetBoundingBox();
-        bb.Increase (bb.Diam()/10);
-        ngMesh->SetLocalH (bb.PMin(), bb.PMax(), netgen::mparam.grading);
-        aMesher.SetLocalSize( occgeom, *ngMesh );
-        aMesher.SetLocalSizeForChordalError( occgeoComm, *ngMesh );
-        try {
-          ngMesh->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
-        } catch (netgen::NgException & ex) {
-          return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
-        }
-      }
-
-      TNodeToIDMap nodeToNetgenID;
-
-      nodeVec.clear();
-      ngMesh->AddFaceDescriptor( netgen::FaceDescriptor( faceID, solidID, solidID, 0 ));
-          // set local size according to size of existing segments
-      SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Edge);
-      while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
-      {
-        const SMDS_MeshElement* elem = iteratorElem->next();
-        // Keeping only element that are in the element orientation file
-        bool isIn = elemOrientation.count(elem->GetID())==1;
-
-        if(!isIn)
-          continue;
-
-        bool isRev = elemOrientation[elem->GetID()];
-        std::cerr << isRev;
-
-
-
-        for ( int iN = 0; iN < 2; ++iN )
-        {
-          const SMDS_MeshNode* node = elem->GetNode( iN );
-          const int shapeID = node->getshapeId();
-          int& ngID = nodeToNetgenID.insert(TN2ID( node, invalid_ID )).first->second;
-          if ( ngID == invalid_ID )
-          {
-            ngID = ++Netgen_NbOfNodes;
-            Netgen_point [ 0 ] = node->X();
-            Netgen_point [ 1 ] = node->Y();
-            Netgen_point [ 2 ] = node->Z();
-            netgen::MeshPoint mp( netgen::Point<3> (node->X(), node->Y(), node->Z()) );
-            ngMesh->AddPoint ( mp, 1, netgen::EDGEPOINT );
-          }
-          Netgen_segment[ isRev ? 1-iN : iN ] = ngID;
-        }
-        // add segment
-
-        netgen::Segment seg;
-        seg[0] = Netgen_segment[0];
-        seg[1] = Netgen_segment[1];
-        seg.edgenr = ngMesh->GetNSeg() +1;
-        seg.si = faceID;
-
-        ngMesh->AddSegment(seg);
-      }
-      int nbNodes2 = ngMesh->GetNP();
-      int nseg = ngMesh->GetNSeg();
-
-      // insert old nodes into nodeVec
-      nodeVec.resize( nodeToNetgenID.size() + 1, 0 );
-      TNodeToIDMap::iterator n_id = nodeToNetgenID.begin();
-      for ( ; n_id != nodeToNetgenID.end(); ++n_id )
-        nodeVec[ n_id->second ] = n_id->first;
-      nodeToNetgenID.clear();
-
-
-      //if ( !isCommonLocalSize )
-      //limitSize( ngMesh, mparam.maxh * 0.8);
-
-      // -------------------------
-      // Generate surface mesh
-      // -------------------------
-
-      const int startWith = netgen::MESHCONST_MESHSURFACE;
-      const int endWith   = toOptimize ? netgen::MESHCONST_OPTSURFACE : netgen::MESHCONST_MESHSURFACE;
-
-      SMESH_Comment str;
-      try {
-        OCC_CATCH_SIGNALS;
-        err = ngLib.GenerateMesh(occgeom, startWith, endWith, ngMesh);
-        if ( netgen::multithread.terminate )
-          return false;
-        if ( err )
-          str << "Error in netgen::OCCGenerateMesh() at " << netgen::multithread.task;
-      }
-      catch (Standard_Failure& ex)
-      {
-        err = 1;
-        str << "Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()"
-            << " at " << netgen::multithread.task
-            << ": " << ex.DynamicType()->Name();
-        if ( ex.GetMessageString() && strlen( ex.GetMessageString() ))
-          str << ": " << ex.GetMessageString();
-      }
-      catch (...) {
-        err = 1;
-        str << "Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()"
-            << " at " << netgen::multithread.task;
-      }
-      if ( err )
-      {
-        if ( iLoop == LOC_SIZE )
-        {
-          std::cout << "Need second run" << std::endl;
-          /*netgen::mparam.minh = netgen::mparam.maxh;
-          netgen::mparam.maxh = 0;
-          for ( size_t iW = 0; iW < wires.size(); ++iW )
-          {
-            StdMeshers_FaceSidePtr wire = wires[ iW ];
-            const vector<UVPtStruct>& uvPtVec = wire->GetUVPtStruct();
-            for ( size_t iP = 1; iP < uvPtVec.size(); ++iP )
-            {
-              SMESH_TNodeXYZ   p( uvPtVec[ iP ].node );
-              netgen::Point3d np( p.X(),p.Y(),p.Z());
-              double segLen = p.Distance( uvPtVec[ iP-1 ].node );
-              double   size = ngMesh->GetH( np );
-              netgen::mparam.minh = Min( netgen::mparam.minh, size );
-              netgen::mparam.maxh = Max( netgen::mparam.maxh, segLen );
-            }
-          }
-          //cerr << "min " << mparam.minh << " max " << mparam.maxh << endl;
-          netgen::mparam.minh *= 0.9;
-          netgen::mparam.maxh *= 1.1;
-          */
-          continue;
-        }
-        else
-        {
-          //faceErr.reset( new SMESH_ComputeError( COMPERR_ALGO_FAILED, str ));
-        }
-      }
-
-      // ----------------------------------------------------
-      // Fill the SMESHDS with the generated nodes and faces
-      // ----------------------------------------------------
-
-      if(output_mesh)
-      {
-        int nbNodes = ngMesh->GetNP();
-        int nbFaces = ngMesh->GetNSE();
-        std::cout << nbFaces << " " << nbNodes << std::endl;
-
-        int nbInputNodes = (int) nodeVec.size()-1;
-        nodeVec.resize( nbNodes+1, 0 );
-
-        // add nodes
-        for ( int ngID = nbInputNodes + 1; ngID <= nbNodes; ++ngID )
-        {
-          const netgen::MeshPoint& ngPoint = ngMesh->Point( ngID );
-          SMDS_MeshNode * node = meshDS->AddNode(ngPoint(0), ngPoint(1), ngPoint(2));
-          nodeVec[ ngID ] = node;
-        }
-
-        // create faces
-        int i,j;
-        for ( i = 1; i <= nbFaces ; ++i )
-        {
-          Ng_GetVolumeElement(ngLib.ngMesh(), i, Netgen_triangle);
-
-          helper.AddFace (nodeVec.at( Netgen_triangle[0] ),
-                          nodeVec.at( Netgen_triangle[1] ),
-                          nodeVec.at( Netgen_triangle[2] ));
-
-        }
-      } // output_mesh
-
-      break;
-    } // two attempts
-  //} // loop on FACEs
-
-  return true;
-
-}
diff --git a/src/NETGENPlugin/netgen_mesher.hxx b/src/NETGENPlugin/netgen_mesher.hxx
deleted file mode 100644 (file)
index 996b1ac..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,72 +0,0 @@
-// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
-//
-// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
-// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
-//
-// This library is free software; you can redistribute it and/or
-// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
-// License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
-//
-// This library is distributed in the hope that it will be useful,
-// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
-// Lesser General Public License for more details.
-//
-// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
-// License along with this library; if not, write to the Free Software
-// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
-//
-// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
-//
-
-//  File   : netgen_mesher.hxx
-//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
-//  Module : SMESH
-//
-
-#ifndef _NETGEN_MESHER_HXX_
-#define _NETGEN_MESHER_HXX_
-
-#include <string>
-#include <iostream>
-
-class TopoDS_Shape;
-class SMESH_Mesh;
-class SMESH_Comment;
-class netgen_params;
-
-int netgen2d_internal(TopoDS_Shape &aShape,
-             SMESH_Mesh& aMesh,
-             netgen_params& aParams,
-             std::string new_element_file,
-             std::string element_orientation_file,
-             bool output_mesh);
-int netgen2d(const std::string input_mesh_file,
-             const std::string shape_file,
-             const std::string hypo_file,
-             const std::string element_orienation_file,
-             const std::string new_element_file,
-             bool output_mesh,
-             const std::string output_mesh_file);
-
-int netgen3d_internal(TopoDS_Shape &aShape,
-             SMESH_Mesh& aMesh,
-             netgen_params& aParams,
-             std::string new_element_file,
-             std::string element_orientation_file,
-             bool output_mesh);
-int netgen3d(const std::string input_mesh_file,
-             const std::string shape_file,
-             const std::string hypo_file,
-             const std::string element_orienation_file,
-             const std::string new_element_file,
-             bool output_mesh,
-             const std::string output_mesh_file,
-             int nbThreads);
-
-//TODO: Tmp function replace by real error handling
-int error(int error_type, std::string msg);
-int error(const SMESH_Comment& comment);
-
-#endif
\ No newline at end of file
diff --git a/src/NETGENPlugin/netgen_param.cxx b/src/NETGENPlugin/netgen_param.cxx
deleted file mode 100644 (file)
index 0c69081..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,214 +0,0 @@
-// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
-//
-// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
-// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
-//
-// This library is free software; you can redistribute it and/or
-// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
-// License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
-//
-// This library is distributed in the hope that it will be useful,
-// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
-// Lesser General Public License for more details.
-//
-// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
-// License along with this library; if not, write to the Free Software
-// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
-//
-// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
-//
-
-//  File   : netgen_param.hxx
-//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
-//  Module : SMESH
-//
-#include "netgen_param.hxx"
-
-#include <iostream>
-#include <fstream>
-#include <string>
-#include <cassert>
-
-
-// TODO: Error handling of read/write
-
-/**
- * @brief Print content of a netgen_params
- *
- * @param aParams The object to display
- */
-void print_netgen_params(netgen_params& aParams){
-  // TODO: prettier print
-  // TODO: Add call to print in log
-  std::cout << "has_netgen_param: " << aParams.has_netgen_param << std::endl;
-  std::cout << "maxh: " << aParams.maxh << std::endl;
-  std::cout << "minh: " << aParams.minh << std::endl;
-  std::cout << "segmentsperedge: " << aParams.segmentsperedge << std::endl;
-  std::cout << "grading: " << aParams.grading << std::endl;
-  std::cout << "curvaturesafety: " << aParams.curvaturesafety << std::endl;
-  std::cout << "secondorder: " << aParams.secondorder << std::endl;
-  std::cout << "quad: " << aParams.quad << std::endl;
-  std::cout << "optimize: " << aParams.optimize << std::endl;
-  std::cout << "fineness: " << aParams.fineness << std::endl;
-  std::cout << "uselocalh: " << aParams.uselocalh << std::endl;
-  std::cout << "merge_solids: " << aParams.merge_solids << std::endl;
-  std::cout << "chordalError: " << aParams.chordalError << std::endl;
-  std::cout << "optsteps2d: " << aParams.optsteps2d << std::endl;
-  std::cout << "optsteps3d: " << aParams.optsteps3d << std::endl;
-  std::cout << "elsizeweight: " << aParams.elsizeweight << std::endl;
-  std::cout << "opterrpow: " << aParams.opterrpow << std::endl;
-  std::cout << "delaunay: " << aParams.delaunay << std::endl;
-  std::cout << "checkoverlap: " << aParams.checkoverlap << std::endl;
-  std::cout << "checkchartboundary: " << aParams.checkchartboundary << std::endl;
-  std::cout << "closeedgefac: " << aParams.closeedgefac << std::endl;
-  std::cout << "has_local_size: " << aParams.has_local_size << std::endl;
-  std::cout << "meshsizefilename: " << aParams.meshsizefilename << std::endl;
-  std::cout << "has_maxelementvolume_hyp: " << aParams.has_maxelementvolume_hyp << std::endl;
-  std::cout << "maxElementVolume: " << aParams.maxElementVolume << std::endl;
-  std::cout << "has_LengthFromEdges_hyp: " << aParams.has_LengthFromEdges_hyp << std::endl;
-}
-
-/**
- * @brief Import a param_file into a netgen_params structure
- *
- * @param param_file Name of the file
- * @param aParams Structure to fill
- */
-void import_netgen_params(const std::string param_file, netgen_params& aParams){
-  std::ifstream myfile(param_file);
-  std::string line;
-
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.has_netgen_param = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.maxh = std::stod(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.minh = std::stod(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.segmentsperedge = std::stod(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.grading = std::stod(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.curvaturesafety = std::stod(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.secondorder = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.quad = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.optimize = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.fineness = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.uselocalh = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.merge_solids = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.chordalError = std::stod(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.optsteps2d = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.optsteps3d = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.elsizeweight = std::stod(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.opterrpow = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.delaunay = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.checkoverlap = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.checkchartboundary = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.closeedgefac = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.has_local_size = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.meshsizefilename = line;
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.has_maxelementvolume_hyp = std::stoi(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.maxElementVolume = std::stod(line);
-  std::getline(myfile, line);
-  aParams.maxElementVolume = std::stoi(line);
-
-  myfile.close();
-};
-
-/**
- * @brief Writes the content of a netgen_param into a file
- *
- * @param param_file the file
- * @param aParams the object
- */
-void export_netgen_params(const std::string param_file, netgen_params& aParams){
-  std::ofstream myfile(param_file);
-  myfile << aParams.has_netgen_param << std::endl;
-  myfile << aParams.maxh << std::endl;
-  myfile << aParams.minh << std::endl;
-  myfile << aParams.segmentsperedge << std::endl;
-  myfile << aParams.grading << std::endl;
-  myfile << aParams.curvaturesafety << std::endl;
-  myfile << aParams.secondorder << std::endl;
-  myfile << aParams.quad << std::endl;
-  myfile << aParams.optimize << std::endl;
-  myfile << aParams.fineness << std::endl;
-  myfile << aParams.uselocalh << std::endl;
-  myfile << aParams.merge_solids << std::endl;
-  myfile << aParams.chordalError << std::endl;
-  myfile << aParams.optsteps2d << std::endl;
-  myfile << aParams.optsteps3d << std::endl;
-  myfile << aParams.elsizeweight << std::endl;
-  myfile << aParams.opterrpow << std::endl;
-  myfile << aParams.delaunay << std::endl;
-  myfile << aParams.checkoverlap << std::endl;
-  myfile << aParams.checkchartboundary << std::endl;
-  myfile << aParams.closeedgefac << std::endl;
-  myfile << aParams.has_local_size << std::endl;
-  myfile << aParams.meshsizefilename << std::endl;
-  myfile << aParams.has_maxelementvolume_hyp << std::endl;
-  myfile << aParams.maxElementVolume << std::endl;
-  myfile << aParams.has_LengthFromEdges_hyp << std::endl;
-
-  myfile.close();
-};
-
-/**
- * @brief Compares two netgen_parms object
- *
- * @param params1 Object 1
- * @param params2 Object 2
-
- * @return true if the two object are identical
- */
-bool diff_netgen_params(netgen_params params1, netgen_params params2){
-  bool ret = true;
-  ret &= params1.maxh == params2.maxh;
-  ret &= params1.minh == params2.minh;
-  ret &= params1.segmentsperedge == params2.segmentsperedge;
-  ret &= params1.grading == params2.grading;
-  ret &= params1.curvaturesafety == params2.curvaturesafety;
-  ret &= params1.secondorder == params2.secondorder;
-  ret &= params1.quad == params2.quad;
-  ret &= params1.optimize == params2.optimize;
-  ret &= params1.fineness == params2.fineness;
-  ret &= params1.uselocalh == params2.uselocalh;
-  ret &= params1.merge_solids == params2.merge_solids;
-  ret &= params1.chordalError == params2.chordalError;
-  ret &= params1.optsteps2d == params2.optsteps2d;
-  ret &= params1.optsteps3d == params2.optsteps3d;
-  ret &= params1.elsizeweight == params2.elsizeweight;
-  ret &= params1.opterrpow == params2.opterrpow;
-  ret &= params1.delaunay == params2.delaunay;
-  ret &= params1.checkoverlap == params2.checkoverlap;
-  ret &= params1.checkchartboundary == params2.checkchartboundary;
-  ret &= params1.closeedgefac == params2.closeedgefac;
-  ret &= params1.has_local_size == params2.has_local_size;
-  ret &= params1.meshsizefilename == params2.meshsizefilename;
-  ret &= params1.has_maxelementvolume_hyp == params2.has_maxelementvolume_hyp;
-  ret &= params1.maxElementVolume == params2.maxElementVolume;
-  ret &= params1.has_LengthFromEdges_hyp == params2.has_LengthFromEdges_hyp;
-
-  return ret;
-}
diff --git a/src/NETGENPlugin/netgen_param.hxx b/src/NETGENPlugin/netgen_param.hxx
deleted file mode 100644 (file)
index 0958931..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,96 +0,0 @@
-// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
-//
-// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
-// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
-//
-// This library is free software; you can redistribute it and/or
-// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
-// License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
-//
-// This library is distributed in the hope that it will be useful,
-// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
-// Lesser General Public License for more details.
-//
-// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
-// License along with this library; if not, write to the Free Software
-// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
-//
-// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
-//
-
-//  File   : netgen_param.hxx
-//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
-//  Module : SMESH
-//
-
-#ifndef _NETGEN_PARAM_HXX_
-#define _NETGEN_PARAM_HXX_
-
-#include <string>
-
-class NETGENPlugin_Hypothesis;
-class StdMeshers_MaxElementVolume;
-class StdMeshers_ViscousLayers;
-
-struct netgen_params{
-  // Params from NETGENPlugin_Mesher
-  // True if _hypParameters is not null
-  bool has_netgen_param=true;
-  double maxh;
-  double minh;
-  double segmentsperedge;
-  double grading;
-  double curvaturesafety;
-  int secondorder;
-  int quad;
-  bool optimize;
-  int fineness;
-  bool uselocalh;
-  bool merge_solids;
-  double chordalError;
-  int optsteps2d;
-  int optsteps3d;
-  double elsizeweight;
-  int opterrpow;
-  bool delaunay;
-  bool checkoverlap;
-  bool checkchartboundary;
-  int closeedgefac;
-
-
-  // TODO: add localsize (pass through local size file ?)
-  // True if we have a mesh size file or local size info
-  bool has_local_size = false;
-  std::string meshsizefilename;
-
-  // Params from NETGEN3D
-  // True if _hypMaxElementVolume is not null
-  bool has_maxelementvolume_hyp=false;
-  double maxElementVolume=0.0;
-
-  // to replace
-  //NETGENPlugin_Hypothesis *    _hypParameters=nullptr;
-  // to remove ?
-  StdMeshers_MaxElementVolume* _hypMaxElementVolume=nullptr;
-  // to remove ?
-  StdMeshers_ViscousLayers*    _viscousLayersHyp=nullptr;
-  //double                       _progressByTic;
-  bool _quadraticMesh=false;
-
-  // Params from NETGEN2D
-  bool has_LengthFromEdges_hyp=false;
-
-  // Number of threads for the mesher
-  int nbThreads;
-};
-
-void print_netgen_params(netgen_params& aParams);
-
-void import_netgen_params(const std::string param_file, netgen_params& aParams);
-void export_netgen_params(const std::string param_file, netgen_params& aParams);
-
-bool diff_netgen_params(netgen_params params1, netgen_params params2);
-
-#endif
\ No newline at end of file
diff --git a/src/NETGENPlugin/run_mesher.cxx b/src/NETGENPlugin/run_mesher.cxx
deleted file mode 100644 (file)
index a1a1fbc..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,242 +0,0 @@
-// Copyright (C) 2007-2021  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
-//
-// Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
-// CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
-//
-// This library is free software; you can redistribute it and/or
-// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
-// License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
-//
-// This library is distributed in the hope that it will be useful,
-// but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-// MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
-// Lesser General Public License for more details.
-//
-// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
-// License along with this library; if not, write to the Free Software
-// Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
-//
-// See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
-//
-
-//  File   : run_mesher.cxx
-//  Author : Yoann AUDOUIN, EDF
-//  Module : SMESH
-//
-
-#include "DriverStep.hxx"
-#include "DriverMesh.hxx"
-#include "netgen_param.hxx"
-#include "netgen_mesher.hxx"
-
-#include <SMESH_Mesh.hxx>
-#include <SMESH_Gen.hxx>
-
-#include <TopoDS_Shape.hxx>
-#include <iostream>
-
-#include <chrono>
-
-/**
- * @brief Test of shape Import/Export
- *
- * @param shape_file
- */
-void test_shape(){
-
-  std::cout << "Testing Shape Import/Export" << std::endl;
-  std::string shape_file = "box.step";
-
-  TopoDS_Shape myShape;
-
-  // Test 1 import -> export cmp files
-  std::string shape_file2 = "/tmp/shape.step";
-
-  import_shape(shape_file, myShape);
-  export_shape(shape_file2, myShape);
-
-  assert(diff_step_file(shape_file, shape_file2));
-
-  // Test 2 import->export->import cmp TopoDS_Shape
-  std::string shape_file3 = "/tmp/shape2.step";
-  TopoDS_Shape myShape1, myShape2;
-
-  import_shape(shape_file, myShape1);
-
-  export_shape(shape_file3, myShape1);
-
-  import_shape(shape_file3, myShape2);
-
-  // TODO: See why this does not work
-  // TShape seems to be different
-  //assert(myShape1.IsSame(myShape2));
-
-}
-
-/**
- * @brief test of mesh import/export
- *
- * @param mesh_file
- */
-void test_mesh(){
-
-  std::cout << "Testing Mesh Import/Export" << std::endl;
-  std::string mesh_file = "box.med";
-  SMESH_Gen gen;
-
-  SMESH_Mesh *myMesh = gen.CreateMesh(false);
-  std::string mesh_name = "Maillage_1";
-
-  // Test 1 import -> export cmp files
-  std::string mesh_file2 = "/tmp/mesh.med";
-
-  import_mesh(mesh_file, *myMesh, mesh_name);
-  export_mesh(mesh_file2, *myMesh, mesh_name);
-
-  assert(diff_med_file(mesh_file, mesh_file2, mesh_name));
-
-  // TODO: Compare the two med files via dump ?
-
-  // Test 2 import->export->import cmp TopoDS_Shape
-  std::string mesh_file3 = "/tmp/mesh2.med";
-  SMESH_Mesh *myMesh1 = gen.CreateMesh(false);
-  SMESH_Mesh *myMesh2 = gen.CreateMesh(false);
-
-  import_mesh(mesh_file, *myMesh1, mesh_name);
-
-  export_mesh(mesh_file3, *myMesh1, mesh_name);
-
-  import_mesh(mesh_file3, *myMesh2, mesh_name);
-
-  // TODO: Compare SMESH_Mesh
-  //assert(myMesh1==myMesh2);
-}
-
-/**
- * @brief Test of import/export of netgen param
- *
- */
-void test_netgen_params(){
-
-  std::string param_file = "/tmp/netgen_param.txt";
-  netgen_params myParams, myParams2;
-  myParams.has_netgen_param = true;
-  myParams.maxh = 34.64;
-  myParams.minh = 0.14;
-  myParams.segmentsperedge = 15;
-  myParams.grading = 0.2;
-  myParams.curvaturesafety = 1.5;
-  myParams.secondorder = false;
-  myParams.quad = false;
-  myParams.optimize = true;
-  myParams.fineness = 5;
-  myParams.uselocalh = true;
-  myParams.merge_solids = true;
-  myParams.chordalError = -1;
-  myParams.optsteps2d = 3;
-  myParams.optsteps3d = 3;
-  myParams.elsizeweight = 0.2;
-  myParams.opterrpow = 2;
-  myParams.delaunay = true;
-  myParams.checkoverlap = true;
-  myParams.checkchartboundary = false;
-  myParams.closeedgefac = 2;
-  myParams.has_local_size = false;
-  myParams.meshsizefilename = "";
-  myParams.has_maxelementvolume_hyp = false;
-  myParams.maxElementVolume = 0.0;
-
-  export_netgen_params(param_file, myParams);
-  import_netgen_params(param_file, myParams2);
-
-  assert(diff_netgen_params(myParams, myParams2));
-
-};
-
-void test_netgen3d(){
-
-  std::cout << "Testing NETGEN 3D mesher" << std::endl;
-  netgen3d("box_partial2D1D-2.med",
-           "box-2.step",
-           "box_param.txt",
-           "element_orient.dat",
-           "new_element.dat",
-           true,
-           "box_with3D.med",
-           1);
-
-  // TODO: Check result
-}
-
-/**
- * @brief Main function
- *
- * @param argc Number of arguments
- * @param argv Arguments
- *
- * @return error code
- */
-int main(int argc, char *argv[]){
-
-  if(argc!=10||(argc==2 && (strcmp(argv[1], "-h") == 0 || strcmp(argv[1], "--help")==0))){
-    std::cout << "Error in number of argument"<<std::endl;
-    std::cout << "Syntax:"<<std::endl;
-    std::cout << "run_mesher MESHER INPUT_MESH_FILE SHAPE_FILE HYPO_FILE" << std::endl;
-    std::cout << "           ELEM_ORIENT_FILE NB_THREADS" << std::endl;
-    std::cout << "           NEW_ELEMENT_FILE OUTPUT_MESH_FILE" << std::endl;
-    std::cout << std::endl;
-    std::cout << "Args:" << std::endl;
-    std::cout << "  MESHER: mesher to use from (NETGEN3D, NETGEN2D)" << std::endl;
-    std::cout << "  INPUT_MESH_FILE: MED File containing lower-dimension-elements already meshed" << std::endl;
-    std::cout << "  SHAPE_FILE: STEP file containing the shape to mesh" << std::endl;
-    std::cout << "  HYPO_FILE: Ascii file containint the list of parameters" << std::endl;
-    std::cout << "  ELEM_ORIENT_FILE: binary file containing the list of element from INPUT_MESH_FILE associated to the shape and their orientation" << std::endl;
-    std::cout << "  NB_THREADS: Number of thread to use for the mesher" << std::endl;
-    std::cout << "  NEW_ELEMENT_FILE: (out) contains elements and nodes added by the meshing" << std::endl;
-    std::cout << "  OUTPUT_MESH: If !=0 will export mesh into OUTPUT_MESH_FILE " << std::endl;
-    std::cout << "  OUTPUT_MESH_FILE: MED File containing the mesh after the run of the mesher" << std::endl;
-    return 0;
-  }
-  std::string mesher=argv[1];
-  std::string input_mesh_file=argv[2];
-  std::string shape_file=argv[3];
-  std::string hypo_file=argv[4];
-  std::string element_orientation_file=argv[5];
-  int nbThreads=std::stoi(argv[6]);
-  std::string new_element_file=argv[7];
-  bool output_mesh = std::stoi(argv[8]) != 0;
-  std::string output_mesh_file=argv[9];
-
-  if (mesher=="test"){
-    std::cout << "Running tests" << std::endl;
-    test_shape();
-    test_mesh();
-    test_netgen_params();
-    test_netgen3d();
-  } else if (mesher=="NETGEN3D"){
-    auto begin = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-    netgen3d(input_mesh_file,
-             shape_file,
-             hypo_file,
-             element_orientation_file,
-             new_element_file,
-             output_mesh,
-             output_mesh_file,
-             nbThreads);
-    auto end = std::chrono::high_resolution_clock::now();
-    auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(end - begin);
-    std::cout << "Time elapsed: " << elapsed.count()*1e-9 << std::endl;
-  } else if (mesher=="NETGEN2D"){
-    netgen2d(input_mesh_file,
-             shape_file,
-             hypo_file,
-             element_orientation_file,
-             new_element_file,
-             output_mesh,
-             output_mesh_file);
-  } else {
-    std::cerr << "Unknown mesher:" << mesher << std::endl;
-  }
-  return 0;
-}