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spns #24419 - openmpi partiel
authorNabil Ghodbane <nabil.ghodbane@cea.fr>
Tue, 25 Jan 2022 14:48:36 +0000 (15:48 +0100)
committerNabil Ghodbane <nabil.ghodbane@cea.fr>
Tue, 25 Jan 2022 14:48:36 +0000 (15:48 +0100)
applications/SALOME-master.pyconf
products/compil_scripts/hdf5-1.10.3.sh
products/env_scripts/openmpi.py
products/openmpi.pyconf

index fb38e3897fadd5e24c9bba5fdcae7b5a901c7ffb..d29eda24597763d21b575deed66439bcb4603530 100644 (file)
@@ -51,6 +51,7 @@ APPLICATION :
         freetype : '2.9.1'
         gcc  :  '8.5.0'
         mpc : 'native'
+        mpi4py: '3.0.3'
         gmp : 'native'
         mpfr : 'native'
         gmsh : '4.8.4'
@@ -76,6 +77,7 @@ APPLICATION :
         omniORB : '4.2.2'
         omniORBpy : '4.2.2'
         opencv : '3.2.0'
+        openmpi : '3.1.6'
         openturns: '1.17'
         openVKL: '0.11.0'
         ospray : '2.4.0'
@@ -204,4 +206,18 @@ __overwrite__ :
         __condition__ : "VARS.dist not in ['DB08','DB09', 'FD30']"
         'APPLICATION.rm_products' : ['gcc', 'gmp', 'mpc', 'mpfr']
     }
+    {
+        __condition__ : "VARS.dist in ['DB09']"
+        'APPLICATION.products.hdf5'        : {tag:'1.10.3', base: 'no',  section: 'version_1_10_3',    hpc: 'yes'}
+        'APPLICATION.products.cgns'        : {tag:'4.1.1',  base: 'no',  section: 'default',           hpc: 'yes'}
+        'APPLICATION.products.ParaView'    : {tag:'5.9.0',  base: 'no',  section: 'version_5_9_0_MPI', hpc: 'yes'}
+        'APPLICATION.products.MeshGems'    : {tag:'2.14-1', base: 'no',  section: 'version_2_14_1',    hpc: 'yes'}
+        'APPLICATION.products.PARAVIS'     : {tag:'master', base: 'no',  section: 'default_MPI',       hpc: 'yes'}
+        'APPLICATION.products.MEDCOUPLING' : {tag:'master', base: 'no',  section: 'default_MPI',       hpc: 'yes'}
+    }
+    {
+        __condition__ : "VARS.dist not in ['DB09']"
+        'APPLICATION.rm_products' : ['openmpi', 'mpi4py']
+    }
+
 ]
index a53a0c003751c77382328bf43e82e4d6f672e82a..c1323130a736dfb02b6c265f60cb28bbe596d7b5 100755 (executable)
@@ -22,6 +22,8 @@ then
     CMAKE_OPTIONS+=" -DHDF5_ENABLE_PARALLEL:BOOL=ON"
     CMAKE_OPTIONS+=" -DHDF5_BUILD_CPP_LIB:BOOL=ON"
     CMAKE_OPTIONS+=" -DHDF5_BUILD_TOOLS:BOOL=ON"
+    export CC=$(which mpicc)
+    export CXX=$(which mpic++)
 else
     CMAKE_OPTIONS+=" -DHDF5_ENABLE_PARALLEL:BOOL=OFF"
     CMAKE_OPTIONS+=" -DHDF5_BUILD_CPP_LIB:BOOL=ON"
index 38872b1f0cbcd17d784480442d7552224fd143fc..45c7b23eb8be8f47d3fe54285f382d0a3dac56ca 100644 (file)
@@ -16,8 +16,17 @@ def set_env(env, prereq_dir, version):
     env.prepend('C_INCLUDE_PATH', os.path.join(root, 'include'))  # needed for parallel h5py
 
 def set_nativ_env(env):
-    env.set('MPI_ROOT_DIR', "/usr")  # update for cmake
-    env.set('OPENMPIDIR', "/usr")
-    env.set('MPI_ROOT', "/usr")
-
-
+    prereq_dir='/usr'
+    try:
+        import distro
+        if any(distribution in distro.name().lower() for distribution in ["centos", "fedora"]) :
+            prereq_dir='/usr/lib64/openmpi'
+    except:
+        import platform
+        if any(distribution in platform.linux_distribution()[0].lower() for distribution in ["centos", "fedora"]) :
+            prereq_dir='/usr/lib64/openmpi'
+    env.set('MPI_ROOT_DIR', prereq_dir)
+    env.set('OPENMPIDIR', prereq_dir)
+    env.set('MPI_ROOT', prereq_dir)
+    env.prepend('PATH', os.path.join(prereq_dir, 'bin'))
+    env.prepend('LD_LIBRARY_PATH', os.path.join(prereq_dir,'lib'))
index cfc6ac4c431ce09ce8e0544cdeddf62135ccc3e2..5bd6c6ac6fb05bb48b2de4c82de8afcb3a191a61 100644 (file)
@@ -4,6 +4,13 @@ default :
     build_source : "script"
     compil_script :  $name + ".sh"
     get_source : "archive"
+    system_info :
+    {
+        rpm : ["openmpi"]
+        rpm_dev : ["openmpi-devel"]
+        apt : ["libopenmpi2"]
+        apt_dev : ["libopenmpi-dev"]
+    }
     environ :
     {
        env_script : $name + ".py"
@@ -14,4 +21,4 @@ default :
     source_dir : $APPLICATION.workdir + $VARS.sep + 'SOURCES' + $VARS.sep + $name
     build_dir : $APPLICATION.workdir + $VARS.sep + 'BUILD' + $VARS.sep + $name
     install_dir : 'base'
-}
\ No newline at end of file
+}