]> SALOME platform Git repositories - modules/adao.git/commitdiff
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Added correct __init__ for module behavior
authorJean-Philippe ARGAUD <jean-philippe.argaud@edf.fr>
Wed, 22 Aug 2018 19:53:40 +0000 (21:53 +0200)
committerJean-Philippe ARGAUD <jean-philippe.argaud@edf.fr>
Wed, 22 Aug 2018 19:53:40 +0000 (21:53 +0200)
src/daSalome/Makefile.am
src/daSalome/__init__.py [new file with mode: 0644]

index 4659d896032ce9a6eb02684c32417285d84a7906..72d6e76c96b8ec62d104831a1d1c0547621f6129 100644 (file)
@@ -37,9 +37,11 @@ install-data-local:
        cp -R $(DIR)daYacsSchemaCreator $(ADAODIR)
        cp -R $(DIR)daYacsIntegration $(ADAODIR)
        cp    $(DIR)adaoBuilder.py $(ADAODIR)
+       cp    $(DIR)__init__.py $(ADAODIR)
 
 uninstall-local:
        chmod -R +w $(ADAODIR)
        rm -rf $(ADAODIR)/daYacsSchemaCreator
        rm -rf $(ADAODIR)/daYacsIntegration
        rm  -f $(ADAODIR)/adaoBuilder.py
+       rm  -f $(ADAODIR)/__init__.py
diff --git a/src/daSalome/__init__.py b/src/daSalome/__init__.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..8a60968
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,129 @@
+# -*- coding: utf-8 -*-
+#
+# Copyright (C) 2008-2018 EDF R&D
+#
+# This library is free software; you can redistribute it and/or
+# modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+# License as published by the Free Software Foundation; either
+# version 2.1 of the License.
+#
+# This library is distributed in the hope that it will be useful,
+# but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+# MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
+# Lesser General Public License for more details.
+#
+# You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+# License along with this library; if not, write to the Free Software
+# Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
+#
+# See http://www.salome-platform.org/
+#
+# Author: Jean-Philippe Argaud, jean-philippe.argaud@edf.fr, EDF R&D
+__doc__ = """
+=====================================================
+ADAO: A module for Data Assimilation and Optimization
+=====================================================
+
+About
+-----
+
+**The ADAO module provides data assimilation and optimization**
+features in Python or SALOME context (see
+http://www.salome-platform.org/). Briefly stated, Data Assimilation is
+a methodological framework to compute the optimal estimate of the
+inaccessible true value of a system state, eventually over time. It
+uses information coming from experimental measurements or observations,
+and from numerical *a priori* models, including information about their
+errors. Parts of the framework are also known under the names of
+*parameter estimation*, *inverse problems*, *Bayesian estimation*,
+*optimal interpolation*, etc. More details can be found in the full
+ADAO documentation (see http://www.salome-platform.org/).
+
+Only the use of ADAO text programming interface (API/TUI) is introduced
+here. This interface gives ability to create a calculation object in a
+similar way than the case building obtained through the graphical
+interface (GUI). When one wants to elaborate "by hand" the TUI
+calculation case, it is recommended to extensively use all the ADAO
+module documentation, and to go back if necessary to the graphical
+interface (GUI), to get all the elements allowing to correctly set the
+commands.
+
+A simple setup example of an ADAO TUI calculation case
+------------------------------------------------------
+
+To introduce the TUI interface, lets begin by a simple but complete
+example of ADAO calculation case. All the data are explicitly defined
+inside the script in order to make the reading easier. The whole set of
+commands is the following one::
+
+    from numpy import array, matrix
+    from adao import adaoBuilder
+    case = adaoBuilder.New()
+    case.set( 'AlgorithmParameters', Algorithm='3DVAR' )
+    case.set( 'Background',          Vector=[0, 1, 2] )
+    case.set( 'BackgroundError',     ScalarSparseMatrix=1.0 )
+    case.set( 'Observation',         Vector=array([0.5, 1.5, 2.5]) )
+    case.set( 'ObservationError',    DiagonalSparseMatrix='1 1 1' )
+    case.set( 'ObservationOperator', Matrix='1 0 0;0 2 0;0 0 3' )
+    case.set( 'Observer',            Variable="Analysis", Template="ValuePrinter" )
+    case.execute()
+
+The result of running these commands in SALOME (either as a SALOME
+"*shell*" command, in the Python command window of the interface, or by
+the script execution entry of the menu) is the following::
+
+    Analysis [ 0.25000264  0.79999797  0.94999939]
+
+More advanced examples of ADAO TUI calculation case
+---------------------------------------------------
+
+Real cases involves observations loaded from files, operators
+explicitly defined as generic functions including physical simulators,
+time dependant information in order to deal with forecast analysis in
+addition to calibration or re-analysis. More details can be found in
+the full ADAO documentation (see http://www.salome-platform.org/).
+
+License and requirements
+------------------------
+
+The license for this module is the GNU Lesser General Public License
+(Lesser GPL), as stated here and in the source files::
+
+    <ADAO, a module for Data Assimilation and Optimization>
+
+    Copyright (C) 2008-2018 EDF R&D
+
+    This library is free software; you can redistribute it and/or
+    modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+    License as published by the Free Software Foundation; either
+    version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
+
+    This library is distributed in the hope that it will be useful,
+    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
+    Lesser General Public License for more details.
+
+    You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+    License along with this library; if not, write to the Free Software
+    Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA 02111-1307 USA
+
+    See http://www.salome-platform.org/
+
+In addition, we require that all publication or presentation describing
+work using this software, or all commercial or not products using it,
+quote at least one of the references given below:
+
+    * ADAO, a module for Data Assimilation and Optimization,
+      http://www.salome-platform.org/
+
+    * SALOME The Open Source Integration Platform for Numerical Simulation,
+      http://www.salome-platform.org/
+
+The documentation of the module is also covered by the license and the
+requirement of quoting.
+"""
+
+import os, sys
+sys.path.insert(0, os.path.abspath(os.path.dirname(__file__)))
+
+from daCore.version import name, version, year, date