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Minor documentation and code review corrections (17)
authorJean-Philippe ARGAUD <jean-philippe.argaud@edf.fr>
Fri, 4 Feb 2022 15:44:17 +0000 (16:44 +0100)
committerJean-Philippe ARGAUD <jean-philippe.argaud@edf.fr>
Fri, 4 Feb 2022 15:44:17 +0000 (16:44 +0100)
doc/en/snippets/InnovationAtCurrentAnalysis.rst
doc/en/snippets/InnovationAtCurrentState.rst
doc/en/snippets/SetSeed.rst
doc/en/theory.rst
doc/fr/index.rst
doc/fr/snippets/InnovationAtCurrentAnalysis.rst
doc/fr/snippets/InnovationAtCurrentState.rst
doc/fr/snippets/SetSeed.rst
doc/fr/theory.rst

index 60249a5bdf5b4bae4ebd59731baa56faa10eb3a6..652b3662595a5ab3ac5117aab651149de54937a6 100644 (file)
@@ -2,7 +2,7 @@
 
 InnovationAtCurrentAnalysis
   *List of vectors*. Each element is an innovation vector at current analysis.
-  This quantity is identical to the innovation vector at current state in the
+  This quantity is identical to the innovation vector at analysed state in the
   case of a single-state assimilation.
 
   Example:
index 00c82e24b73e5a8bff7141283d4a3b5c377b6877..8b32751aad61c78b30fd9a133cb1455719d9dddc 100644 (file)
@@ -1,7 +1,8 @@
 .. index:: single: InnovationAtCurrentState
 
 InnovationAtCurrentState
-  *List of vectors*. Each element is an innovation vector at current state.
+  *List of vectors*. Each element is an innovation vector at current state
+  before analysis.
 
   Example:
   ``ds = ADD.get("InnovationAtCurrentState")[-1]``
index d1f0d2a08830a099f5913875032b4d5ddc56750c..186fce05569a207655b69896adfcbed07647e994 100644 (file)
@@ -2,11 +2,12 @@
 
 SetSeed
   *Integer value*. This key allow to give an integer in order to fix the seed
-  of the random generator used in the algorithm. A simple convenient value is
-  for example 1000. By default, the seed is left uninitialized, and so use the
-  default initialization from the computer, which then change at each study. To
-  ensure the reproducibility of results involving random samples, it is
-  strongly advised to initialize the seed.
+  of the random generator used in the algorithm. By default, the seed is left
+  uninitialized, and so use the default initialization from the computer, which
+  then change at each study. To ensure the reproducibility of results involving
+  random samples, it is strongly advised to initialize the seed. A simple
+  convenient value is for example 123456789. It is recommended to put an integer
+  with more than 6 or 7 digits to properly initialize the random generator.
 
   Example:
-  ``{"SetSeed":1000}``
+  ``{"SetSeed":123456789}``
index c92e87faf3425d98452574f1a5e83fdec4063e18..bdb5c53fdaf68a93e0962adaa5bf790bf4a9d943 100644 (file)
@@ -69,7 +69,7 @@ methodological framework`_ in a next section, these two types of applications
 are briefly described. At the end, some detailed information allow `Going
 further in the data assimilation framework`_ and `Going further in the state
 estimation by optimization methods`_, as well as `Going further in data
-assimilation for dynamics`_  and having an `Overview of reduction methods and
+assimilation for dynamics`_  and having `An overview of reduction methods and
 of reduced optimization`_.
 
 Fields reconstruction or measures interpolation
@@ -323,9 +323,11 @@ inspired by [Asch16]_ (Figure 1.5).
 
 It is deliberately simple to remain readable, the dashed lines showing some of
 the simplifications or extensions. For example, it does not specifically
-mention the methods with reductions, some of which were variations of the basic
-methods shown here, nor does it mention the more detailed extensions. It also
-omits the test methods available in ADAO and useful for the study.
+mention the methods with reductions (of which it is given hereafter `An
+overview of reduction methods and of reduced optimization`_), some of which
+were variations of the basic methods shown here, nor does it mention the more
+detailed extensions. It also omits the test methods available in ADAO and
+useful for the study.
 
 Each method mentioned in this diagram is the subject of a specific descriptive
 section in the chapter on :ref:`section_reference_assimilation`. The acronyms
@@ -348,6 +350,107 @@ links:
 - Tabu: :ref:`section_ref_algorithm_TabuSearch`,
 - UKF: :ref:`section_ref_algorithm_UnscentedKalmanFilter`.
 
+An overview of reduction methods and of reduced optimization
+------------------------------------------------------------
+
+.. index:: single: reduction
+.. index:: single: reduction methods
+.. index:: single: reduced methods
+.. index:: single: reduced space
+.. index:: single: neutral sub-space
+.. index:: single: SVD
+.. index:: single: POD
+.. index:: single: PCA
+.. index:: single: Kahrunen-Loeve
+.. index:: single: RBM
+.. index:: single: EIM
+.. index:: single: Fourier
+.. index:: single: wavelets
+.. index:: single: EOF
+.. index:: single: sparse
+
+Data assimilation and optimization approaches always imply a certain amount of
+reiteration of a unitary numerical simulation representing the physics that is
+to be treated. In order to handle this physics as well as possible, this
+elementary numerical simulation is often of large size, even huge, and leads to
+an extremely high computational cost when it is repeated. The complete physical
+simulation is often called "*high fidelity simulation*" (or "*full scale
+simulation*").
+
+To avoid this practical challenge, **different strategies to reduce the cost of
+the optimization calculation exist, and some of them also allow to control the
+numerical error implied by this reduction**. These strategies are seamlessly
+integrated into some of the ADAO methods or are the purpose of special
+algorithms.
+
+To establish such an approach, one seeks to reduce at least one of the
+ingredients that make up the data assimilation or optimization problem. One can
+thus classify the reduction methods according to the ingredient on which they
+operate, knowing that some methods deal with several of them. A rough
+classification is provided here, which the reader can complete by reading
+general mathematical books or articles, or those specialized in his physics.
+
+Reduction of data assimilation or optimization algorithms:
+    the optimization algorithms themselves can generate significant
+    computational costs to process numerical information. Various methods can
+    be used to reduce their algorithmic cost, for example by working in the
+    most suitable reduced space for optimization, or by using multi-level
+    optimization techniques. ADAO has such techniques that are included in
+    variants of classical algorithms, leading to exact or approximate but
+    numerically more efficient resolutions. By default, the algorithmic options
+    chosen in ADAO are always the most efficient when they do not impact the
+    quality of the optimization.
+
+Reduction of the representation of covariances:
+    in data assimilation algorithms, covariances are the most expensive
+    quantities to handle or to store, often becoming the limiting quantities
+    from the point of view of the computational cost. Many methods try to use a
+    reduced representation of these matrices (leading sometimes but not
+    necessarily to reduce the dimension of the optimization space).
+    Classically, factorization, decomposition (spectral, Fourier, wavelets...)
+    or ensemble estimation (EOF...) techniques, or combinations, are used to
+    reduce the numerical load of these covariances in the computations. ADAO
+    uses some of these techniques, in combination with sparse computation
+    techniques, to make the handling of covariance matrices more efficient.
+
+Reduction of the physical model:
+    the simplest way to reduce the cost of the unit calculation consists in
+    reducing the simulation model itself, by representing it in a more economic
+    way. Numerous methods allow this reduction of models by ensuring a more or
+    less rigorous control of the approximation error generated by the
+    reduction. The use of simplified models of the physics allows a reduction
+    but without always producing an error control. On the contrary, all
+    decomposition methods (Fourier, wavelets, SVD, POD, PCA, Kahrunen-Loeve,
+    RBM, EIM, etc.) aim at a reduction of the representation space with an
+    explicit error control. Although they are very frequently used, they must
+    nevertheless be completed by a fine analysis of the interaction with the
+    optimization algorithm in which the reduced computation is inserted, in
+    order to avoid instabilities, discrepancies or inconsistencies that are
+    notoriously harmful. ADAO fully supports the use of this type of reduction
+    method, even if it is often necessary to establish this generic independent
+    reduction prior to the optimization.
+
+Reduction of the data assimilation or optimization space:
+    the size of the optimization space depends greatly on the type of problem
+    treated (estimation of states or parameters) but also on the number of
+    observations available to conduct the data assimilation. It is therefore
+    sometimes possible to conduct the optimization in the smallest space by
+    adapting the internal formulation of the optimization algorithms. When it
+    is possible and judicious, ADAO integrates this kind of reduced formulation
+    to improve the numerical performance without reducing the quality of the
+    optimization.
+
+Combining multiple reductions:
+    many advanced algorithms seek to combine multiple reduction techniques
+    simultaneously. However, it is difficult to have both generic and robust
+    methods, and to use several very efficient reduction techniques at the same
+    time. ADAO integrates some of the most robust methods, but this aspect is
+    still largely the subject of research and development.
+
+One can end this quick overview of reduction methods highlighting that their
+use is ubiquitous in real applications and in numerical tools, and that ADAO
+allows to use proven methods without even knowing it.
+
 Going further in the data assimilation framework
 ------------------------------------------------
 
@@ -689,102 +792,3 @@ representation is as follows:
     **Timeline of steps for data assimilation operators in dynamics**
 
 The concepts described in this diagram can be directly and simply used in ADAO.
-
-Overview of reduction methods and of reduced optimization
----------------------------------------------------------
-
-.. index:: single: reduction
-.. index:: single: reduction methods
-.. index:: single: reduced methods
-.. index:: single: reduced space
-.. index:: single: neutral sub-space
-.. index:: single: SVD
-.. index:: single: POD
-.. index:: single: PCA
-.. index:: single: Kahrunen-Loeve
-.. index:: single: RBM
-.. index:: single: EIM
-.. index:: single: Fourier
-.. index:: single: wavelets
-.. index:: single: EOF
-.. index:: single: sparse
-
-Data assimilation and optimization approaches always imply a certain amount of
-reiteration of a unitary numerical simulation representing the physics that is
-to be treated. In order to handle this physics as well as possible, this
-elementary numerical simulation is often of large size, even huge, and leads to
-an extremely high computational cost when it is repeated. The complete physical
-simulation is often called "*high fidelity simulation*" (or "*full scale
-simulation*").
-
-In a generic way, **different strategies to reduce the cost of the optimization
-calculation exist, and some of them also allow to control the numerical error
-implied by this reduction**.
-
-To establish this, one seeks to reduce at least one of the ingredients that
-make up the data assimilation or optimization problem. One can thus classify
-the reduction methods according to the ingredient on which they operate,
-knowing that some methods deal with several of them. A rough classification is
-provided here, which the reader can complete by reading general mathematical
-books or articles, or those specialized in his physics.
-
-Reduction of data assimilation or optimization algorithms:
-    the optimization algorithms themselves can generate significant
-    computational costs to process numerical information. Various methods can
-    be used to reduce their algorithmic cost, for example by working in the
-    most suitable reduced space for optimization, or by using multi-level
-    optimization techniques. ADAO has such techniques that are included in
-    variants of classical algorithms, leading to exact or approximate but
-    numerically more efficient resolutions. By default, the algorithmic options
-    chosen in ADAO are always the most efficient when they do not impact the
-    quality of the optimization.
-
-Reduction of the representation of covariances:
-    in data assimilation algorithms, covariances are the most expensive
-    quantities to handle or to store, often becoming the limiting quantities
-    from the point of view of the computational cost. Many methods try to use a
-    reduced representation of these matrices (leading sometimes but not
-    necessarily to reduce the dimension of the optimization space).
-    Classically, factorization, decomposition (spectral, Fourier, wavelets...)
-    or ensemble estimation (EOF...) techniques, or combinations, are used to
-    reduce the numerical load of these covariances in the computations. ADAO
-    uses some of these techniques, in combination with sparse computation
-    techniques, to make the handling of covariance matrices more efficient.
-
-Reduction of the physical model:
-    the simplest way to reduce the cost of the unit calculation consists in
-    reducing the simulation model itself, by representing it in a more economic
-    way. Numerous methods allow this reduction of models by ensuring a more or
-    less rigorous control of the approximation error generated by the
-    reduction. The use of simplified models of the physics allows a reduction
-    but without always producing an error control. On the contrary, all
-    decomposition methods (Fourier, wavelets, SVD, POD, PCA, Kahrunen-Loeve,
-    RBM, EIM, etc.) aim at a reduction of the representation space with an
-    explicit error control. Although they are very frequently used, they must
-    nevertheless be completed by a fine analysis of the interaction with the
-    optimization algorithm in which the reduced computation is inserted, in
-    order to avoid instabilities, discrepancies or inconsistencies that are
-    notoriously harmful. ADAO fully supports the use of this type of reduction
-    method, even if it is often necessary to establish this generic independent
-    reduction prior to the optimization.
-
-Reduction of the data assimilation or optimization space:
-    the size of the optimization space depends greatly on the type of problem
-    treated (estimation of states or parameters) but also on the number of
-    observations available to conduct the data assimilation. It is therefore
-    sometimes possible to conduct the optimization in the smallest space by
-    adapting the internal formulation of the optimization algorithms. When it
-    is possible and judicious, ADAO integrates this kind of reduced formulation
-    to improve the numerical performance without reducing the quality of the
-    optimization.
-
-Combining multiple reductions:
-    many advanced algorithms seek to combine multiple reduction techniques
-    simultaneously. However, it is difficult to have both generic and robust
-    methods, and to use several very efficient reduction techniques at the same
-    time. ADAO integrates some of the most robust methods, but this aspect is
-    still largely the subject of research and development.
-
-One can end this quick overview of reduction methods highlighting that their
-use is ubiquitous in real applications and in numerical tools, and that ADAO
-allows to use proven methods without even knowing it.
index 50d1186df4fb5ad2b2aca37f97f72db054e76a57..f469adf61e9dc7766e30ea4feed7ccbd5f6cd845 100644 (file)
@@ -74,7 +74,6 @@ et qui décrivent les commandes et des options d'algorithmes. Un
 Enfin, pour respecter les exigences de licence du module, n'oubliez pas de lire
 la partie :ref:`section_license`.
 
-
 .. toctree::
    :caption: Table des matières
    :name: mastertoc
index 95ed07d7c41e931c8a057c2de61679dd45a30582..f8e319cff9ca3b0923112ab5d0fec15a298b5940 100644 (file)
@@ -3,7 +3,7 @@
 InnovationAtCurrentAnalysis
   *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'innovation à l'état
   analysé courant. Cette quantité est identique au vecteur d'innovation à
-  l'état courant dans le cas d'une assimilation mono-état.
+  l'état analysé dans le cas d'une assimilation mono-état.
 
   Exemple :
   ``ds = ADD.get("InnovationAtCurrentAnalysis")[-1]``
index 392bcfb77e19780287b515a5624bef66618172ad..0f4c2ac373bdde1af2af97ba53f41fc7d264b56a 100644 (file)
@@ -2,7 +2,7 @@
 
 InnovationAtCurrentState
   *Liste de vecteurs*. Chaque élément est un vecteur d'innovation à l'état
-  courant.
+  courant avant analyse.
 
   Exemple :
   ``ds = ADD.get("InnovationAtCurrentState")[-1]``
index f4392c202dd0b2a38d80e70ff7c9c7aa7e67b075..6041c683f76aba05134a5f158363d3738ba52fc9 100644 (file)
@@ -2,11 +2,13 @@
 
 SetSeed
   *Valeur entière*. Cette clé permet de donner un nombre entier pour fixer la
-  graine du générateur aléatoire utilisé dans l'algorithme. Une valeur simple
-  est par exemple 1000. Par défaut, la graine est laissée non initialisée, et
-  elle utilise ainsi l'initialisation par défaut de l'ordinateur, qui varie
-  donc à chaque étude. Pour assurer la reproductibilité de résultats impliquant
-  des tirages aléatoires, il est fortement conseiller d'initialiser la graine.
+  graine du générateur aléatoire utilisé dans l'algorithme. Par défaut, la
+  graine est laissée non initialisée, et elle utilise ainsi l'initialisation
+  par défaut de l'ordinateur, qui varie donc à chaque étude. Pour assurer la
+  reproductibilité de résultats impliquant des tirages aléatoires, il est
+  fortement conseiller d'initialiser la graine. Une valeur simple est par
+  exemple 123456789. Il est conseillé de mettre un entier à plus de 6 ou 7
+  chiffres pour bien initialiser le générateur aléatoire.
 
   Exemple :
-  ``{"SetSeed":1000}``
+  ``{"SetSeed":123456789}``
index e9222b8245370174f33ac970353fb9e7b1e834f0..186608ae13328b405a65ed184240be34e4366bf5 100644 (file)
@@ -76,7 +76,7 @@ ces deux types d'applications. A la fin de ce chapitre, quelques informations
 permettent d'aller plus loin pour `Approfondir le cadre méthodologique de
 l'assimilation de données`_ et `Approfondir l'estimation d'état par des
 méthodes d'optimisation`_, ainsi que pour `Approfondir l'assimilation de
-données pour la dynamique`_ et avoir un `Aperçu des méthodes de réduction et de
+données pour la dynamique`_ et avoir `Un aperçu des méthodes de réduction et de
 l'optimisation réduite`_.
 
 Reconstruction de champs ou interpolation de données
@@ -343,10 +343,11 @@ librement inspiré de [Asch16]_ (Figure 1.5).
 
 Il est volontairement simple pour rester lisible, les lignes tiretées montrant
 certaines des simplifications ou extensions. Ce schéma omet par exemple de
-citer spécifiquement les méthodes avec réductions, dont une partie sont des
-variantes de méthodes de base indiquées ici, ou de citer les extensions les
-plus détaillées. Il omet de même les méthodes de tests disponibles dans ADAO et
-utiles pour la mise en étude.
+citer spécifiquement les méthodes avec réductions (dont il est donné ci-après
+`Un aperçu des méthodes de réduction et de l'optimisation réduite`_), dont une
+partie sont des variantes de méthodes de base indiquées ici, ou de citer les
+extensions les plus détaillées. Il omet de même les méthodes de tests
+disponibles dans ADAO et utiles pour la mise en étude.
 
 Chaque méthode citée dans ce schéma fait l'objet d'une partie descriptive
 spécifique dans le chapitre des :ref:`section_reference_assimilation`. Les
@@ -369,6 +370,114 @@ associés :
 - Tabu : :ref:`section_ref_algorithm_TabuSearch`,
 - UKF : :ref:`section_ref_algorithm_UnscentedKalmanFilter`.
 
+Un aperçu des méthodes de réduction et de l'optimisation réduite
+----------------------------------------------------------------
+
+.. index:: single: réduction
+.. index:: single: méthodes de réduction
+.. index:: single: méthodes réduites
+.. index:: single: espace réduit
+.. index:: single: sous-espace neutre
+.. index:: single: SVD
+.. index:: single: POD
+.. index:: single: PCA
+.. index:: single: Kahrunen-Loeve
+.. index:: single: RBM
+.. index:: single: EIM
+.. index:: single: Fourier
+.. index:: single: ondelettes
+.. index:: single: EOF
+.. index:: single: sparse
+
+Les démarches d'assimilation de données et d'optimisation impliquent toujours
+une certaine réitération d'une simulation numérique unitaire représentant la
+physique que l'on veut traiter. Pour traiter au mieux cette physique, cette
+simulation numérique unitaire est souvent de taille importante voire imposante,
+et conduit à un coût calcul extrêmement important dès lors qu'il est répété. La
+simulation physique complète est souvent appelée "*simulation haute fidélité*"
+(ou "*full scale simulation*").
+
+Pour éviter cette difficulté pratique, **différentes stratégies de réduction du
+coût du calcul d'optimisation existent, et certaines permettent également de
+contrôler au mieux l'erreur numérique impliquée par cette réduction**. Ces
+stratégies sont intégrées de manière transparente à certaines des méthodes
+d'ADAO ou font l'objet d'algorithmes particuliers.
+
+Pour établir une telle démarche, on cherche à réduire au moins l'un des
+ingrédients qui composent le problème d'assimilation de données ou
+d'optimisation. On peut ainsi classer les méthodes de réduction selon
+l'ingrédient sur lequel elles opèrent, en sachant que certaines méthodes
+portent sur plusieurs d'entre eux. On indique ici une classification grossière,
+que le lecteur peut compléter par la lecture d'ouvrages ou d'articles généraux
+en mathématiques ou spécialisés pour sa physique.
+
+Réduction des algorithmes d'assimilation de données ou d'optimisation :
+    les algorithmes d'optimisation eux-mêmes peuvent engendrer des coûts de
+    calculs importants pour traiter les informations numériques. Diverses
+    méthodes permettent de réduire leur coût algorithmique, par exemple en
+    travaillant dans l'espace réduit le plus adéquat pour l'optimisation, ou en
+    utilisant des techniques d'optimisation multi-niveaux. ADAO dispose de
+    telles techniques qui sont incluses dans les variantes d'algorithmes
+    classiques, conduisant à des résolutions exactes ou approximées mais
+    numériquement plus efficaces. Par défaut, les options algorithmiques
+    choisies par défaut dans ADAO sont toujours les plus performantes
+    lorsqu'elles n'impactent pas la qualité de l'optimisation.
+
+Réduction de la représentation des covariances :
+    dans les algorithmes d'assimilation de données, ce sont les covariances qui
+    sont les grandeurs les plus coûteuses à manipuler ou à stocker, devenant
+    souvent les quantités limitantes du point de vue du coût de calcul. De
+    nombreuses méthodes cherchent donc à utiliser une représentation réduite de
+    ces matrices (conduisant parfois mais pas obligatoirement à réduire aussi
+    la dimension l'espace d'optimisation). On utilise classiquement des
+    techniques de factorisation, de décomposition (spectrale, Fourier,
+    ondelettes...) ou d'estimation d'ensemble (EOF...), ou des combinaisons,
+    pour réduire la charge numérique de ces covariances dans les calculs. ADAO
+    utilise certaines de ces techniques, en combinaison avec des techniques de
+    calcul creux ("*sparse*"), pour rendre plus efficace la manipulation des
+    matrices de covariance.
+
+Réduction du modèle physique :
+    la manière la plus simple de réduire le coût du calcul unitaire consiste à
+    réduire le modèle de simulation lui-même, en le représentant de manière
+    numériquement plus économique. De nombreuses méthodes permettent cette
+    réduction de modèles en assurant un contrôle plus ou moins strict de
+    l'erreur d'approximation engendrée par la réduction. L'usage de modèles
+    simplifiés de la physique permet une réduction mais sans toujours produire
+    un contrôle d'erreur. Au contraire, toutes les méthodes de décomposition
+    (Fourier, ondelettes, SVD, POD, PCA, Kahrunen-Loeve, RBM, EIM, etc.) visent
+    ainsi une réduction de l'espace de représentation avec un contrôle d'erreur
+    explicite. Très fréquemment utilisées, elles doivent néanmoins être
+    complétées par une analyse fine de l'interaction avec l'algorithme
+    d'optimisation dans lequel le calcul réduit est inséré, pour éviter des
+    instabilités, incohérences ou inconsistances notoirement préjudiciables.
+    ADAO supporte complètement l'usage de ce type de méthode de réduction, même
+    s'il est souvent nécessaire d'établir cette réduction indépendante
+    générique préalablement à l'optimisation.
+
+Réduction de l'espace d'assimilation de données ou d'optimisation :
+    la taille de l'espace d'optimisation dépend grandement du type de problème
+    traité (estimation d'états ou de paramètres) mais aussi du nombre
+    d'observations dont on dispose pour conduire l'assimilation de données. Il
+    est donc parfois possible de conduire l'optimisation dans l'espace le plus
+    petit par une adaptation de la formulation interne des algorithmes
+    d'optimisation. Lorsque c'est possible et judicieux, ADAO intègre ce genre
+    de formulation réduite pour améliorer la performance numérique sans
+    amoindrir la qualité de l'optimisation.
+
+Combinaison de plusieurs réductions :
+    de nombreux algorithmes avancés cherchent à combiner simultanément
+    plusieurs techniques de réduction. Néanmoins, il est difficile de disposer
+    à la fois de méthodes génériques et robustes, et d'utiliser en même temps
+    de plusieurs techniques très performantes de réduction. ADAO intègre
+    certaines méthodes parmi les plus robustes, mais cet aspect fait toujours
+    largement l'objet de recherches et d'évolutions.
+
+On peut terminer ce rapide tour d'horizon des méthodes de réduction en
+soulignant que leur usage est omni-présent dans les applications réelles et
+dans les outils numériques, et qu'ADAO permet d'utiliser des méthodes éprouvées
+sans même le savoir.
+
 Approfondir le cadre méthodologique de l'assimilation de données
 ----------------------------------------------------------------
 
@@ -729,109 +838,3 @@ discrète. Une représentation possible est la suivante :
 
 Les concepts décrits dans ce schéma peuvent directement et simplement être
 utilisés dans ADAO.
-
-Aperçu des méthodes de réduction et de l'optimisation réduite
--------------------------------------------------------------
-
-.. index:: single: réduction
-.. index:: single: méthodes de réduction
-.. index:: single: méthodes réduites
-.. index:: single: espace réduit
-.. index:: single: sous-espace neutre
-.. index:: single: SVD
-.. index:: single: POD
-.. index:: single: PCA
-.. index:: single: Kahrunen-Loeve
-.. index:: single: RBM
-.. index:: single: EIM
-.. index:: single: Fourier
-.. index:: single: ondelettes
-.. index:: single: EOF
-.. index:: single: sparse
-
-Les démarches d'assimilation de données et d'optimisation impliquent toujours
-une certaine réitération d'une simulation numérique unitaire représentant la
-physique que l'on veut traiter. Pour traiter au mieux cette physique, cette
-simulation numérique unitaire est souvent de taille importante voire imposante,
-et conduit à un coût calcul extrêmement important dès lors qu'il est répété. La
-simulation physique complète est souvent appelée "*simulation haute fidélité*"
-(ou "*full scale simulation*").
-
-De manière générale, **différentes stratégies de réduction du coût du calcul
-d'optimisation existent, et certaines permettent également de contrôler au
-mieux l'erreur numérique impliquée par cette réduction**.
-
-Pour établir cela, on cherche à réduire au moins l'un des ingrédients qui
-composent le problème d'assimilation de données ou d'optimisation. On peut
-ainsi classer les méthodes de réduction selon l'ingrédient sur lequel elles
-opèrent, en sachant que certaines méthodes portent sur plusieurs d'entre eux.
-On indique ici une classification grossière, que le lecteur peut compléter par
-la lecture d'ouvrages ou d'articles généraux en mathématiques ou spécialisés
-pour sa physique.
-
-Réduction des algorithmes d'assimilation de données ou d'optimisation :
-    les algorithmes d'optimisation eux-mêmes peuvent engendrer des coûts de
-    calculs importants pour traiter les informations numériques. Diverses
-    méthodes permettent de réduire leur coût algorithmique, par exemple en
-    travaillant dans l'espace réduit le plus adéquat pour l'optimisation, ou en
-    utilisant des techniques d'optimisation multi-niveaux. ADAO dispose de
-    telles techniques qui sont incluses dans les variantes d'algorithmes
-    classiques, conduisant à des résolutions exactes ou approximées mais
-    numériquement plus efficaces. Par défaut, les options algorithmiques
-    choisies par défaut dans ADAO sont toujours les plus performantes
-    lorsqu'elles n'impactent pas la qualité de l'optimisation.
-
-Réduction de la représentation des covariances :
-    dans les algorithmes d'assimilation de données, ce sont les covariances qui
-    sont les grandeurs les plus coûteuses à manipuler ou à stocker, devenant
-    souvent les quantités limitantes du point de vue du coût de calcul. De
-    nombreuses méthodes cherchent donc à utiliser une représentation réduite de
-    ces matrices (conduisant parfois mais pas obligatoirement à réduire aussi
-    la dimension l'espace d'optimisation). On utilise classiquement des
-    techniques de factorisation, de décomposition (spectrale, Fourier,
-    ondelettes...) ou d'estimation d'ensemble (EOF...), ou des combinaisons,
-    pour réduire la charge numérique de ces covariances dans les calculs. ADAO
-    utilise certaines de ces techniques, en combinaison avec des techniques de
-    calcul creux ("*sparse*"), pour rendre plus efficace la manipulation des
-    matrices de covariance.
-
-Réduction du modèle physique :
-    la manière la plus simple de réduire le coût du calcul unitaire consiste à
-    réduire le modèle de simulation lui-même, en le représentant de manière
-    numériquement plus économique. De nombreuses méthodes permettent cette
-    réduction de modèles en assurant un contrôle plus ou moins strict de
-    l'erreur d'approximation engendrée par la réduction. L'usage de modèles
-    simplifiés de la physique permet une réduction mais sans toujours produire
-    un contrôle d'erreur. Au contraire, toutes les méthodes de décomposition
-    (Fourier, ondelettes, SVD, POD, PCA, Kahrunen-Loeve, RBM, EIM, etc.) visent
-    ainsi une réduction de l'espace de représentation avec un contrôle d'erreur
-    explicite. Très fréquemment utilisées, elles doivent néanmoins être
-    complétées par une analyse fine de l'interaction avec l'algorithme
-    d'optimisation dans lequel le calcul réduit est inséré, pour éviter des
-    instabilités, incohérences ou inconsistances notoirement préjudiciables.
-    ADAO supporte complètement l'usage de ce type de méthode de réduction, même
-    s'il est souvent nécessaire d'établir cette réduction indépendante
-    générique préalablement à l'optimisation.
-
-Réduction de l'espace d'assimilation de données ou d'optimisation :
-    la taille de l'espace d'optimisation dépend grandement du type de problème
-    traité (estimation d'états ou de paramètres) mais aussi du nombre
-    d'observations dont on dispose pour conduire l'assimilation de données. Il
-    est donc parfois possible de conduire l'optimisation dans l'espace le plus
-    petit par une adaptation de la formulation interne des algorithmes
-    d'optimisation. Lorsque c'est possible et judicieux, ADAO intègre ce genre
-    de formulation réduite pour améliorer la performance numérique sans
-    amoindrir la qualité de l'optimisation.
-
-Combinaison de plusieurs réductions :
-    de nombreux algorithmes avancés cherchent à combiner simultanément
-    plusieurs techniques de réduction. Néanmoins, il est difficile de disposer
-    à la fois de méthodes génériques et robustes, et d'utiliser en même temps
-    de plusieurs techniques très performantes de réduction. ADAO intègre
-    certaines méthodes parmi les plus robustes, mais cet aspect fait toujours
-    largement l'objet de recherches et d'évolutions.
-
-On peut terminer ce rapide tour d'horizon des méthodes de réduction en
-soulignant que leur usage est omni-présent dans les applications réelles et
-dans les outils numériques, et qu'ADAO permet d'utiliser des méthodes éprouvées
-sans même le savoir.