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Indexed arrays functions are now part of DataArrayInt.
authorabn <adrien.bruneton@cea.fr>
Mon, 18 Feb 2019 12:30:32 +0000 (13:30 +0100)
committerabn <adrien.bruneton@cea.fr>
Wed, 20 Feb 2019 10:36:59 +0000 (11:36 +0100)
src/MEDCoupling/MEDCoupling1GTUMesh.cxx
src/MEDCoupling/MEDCouplingMemArray.cxx
src/MEDCoupling/MEDCouplingMemArray.hxx
src/MEDCoupling/MEDCouplingUMesh.cxx
src/MEDCoupling/MEDCouplingUMesh.hxx
src/MEDCoupling/MEDCouplingUMesh_intersection.cxx
src/MEDCoupling_Swig/MEDCouplingBasicsTest5.py
src/MEDCoupling_Swig/MEDCouplingCommon.i
src/MEDCoupling_Swig/MEDCouplingMemArray.i

index 577b06238cd848c1915e70b5fc10672b39eb5f58..074ec79873bfeaccb6ace255602c90744c0b8289 100644 (file)
@@ -2851,7 +2851,7 @@ MEDCouplingPointSet *MEDCoupling1DGTUMesh::buildPartOfMySelfKeepCoords(const int
   MCAuto<MEDCoupling1DGTUMesh> ret(new MEDCoupling1DGTUMesh(getName(),*_cm));
   ret->setCoords(_coords);
   DataArrayInt *c=0,*ci=0;
-  MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays(begin,end,_conn,_conn_indx,c,ci);
+  DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays(begin,end,_conn,_conn_indx,c,ci);
   MCAuto<DataArrayInt> cSafe(c),ciSafe(ci);
   ret->setNodalConnectivity(c,ci);
   return ret.retn();
@@ -2863,7 +2863,7 @@ MEDCouplingPointSet *MEDCoupling1DGTUMesh::buildPartOfMySelfKeepCoordsSlice(int
   MCAuto<MEDCoupling1DGTUMesh> ret(new MEDCoupling1DGTUMesh(getName(),*_cm));
   ret->setCoords(_coords);
   DataArrayInt *c=0,*ci=0;
-  MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice(start,end,step,_conn,_conn_indx,c,ci);
+  DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice(start,end,step,_conn,_conn_indx,c,ci);
   MCAuto<DataArrayInt> cSafe(c),ciSafe(ci);
   ret->setNodalConnectivity(c,ci);
   return ret.retn();
index cd08df9b96e401a76c67e63291387a9fdad8646d..9e7408f26d8141bf170762498708e0c0c11b7893 100644 (file)
@@ -6480,6 +6480,424 @@ void DataArrayInt::powEqual(const DataArrayInt *other)
   declareAsNew();
 }
 
+/*!
+ * This method works on a pair input (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn
+ * (\ref numbering-indirect).
+ * This method returns the result of the extraction ( specified by a set of ids in [\b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd ) ).
+ * The selection of extraction is done standardly in new2old format.
+ * This method returns indexed arrays (\ref numbering-indirect) using 2 arrays (arrOut,arrIndexOut).
+ *
+ * \param [in] idsOfSelectBg begin of set of ids of the input extraction (included)
+ * \param [in] idsOfSelectEnd end of set of ids of the input extraction (excluded)
+ * \param [in] arrIn arr origin array from which the extraction will be done.
+ * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
+ * \param [out] arrOut the resulting array
+ * \param [out] arrIndexOut the index array of the resulting array \b arrOut
+ * \sa DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice
+ */
+void DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut)
+{
+  if(!arrIn || !arrIndxIn)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays : input pointer is NULL !");
+  arrIn->checkAllocated(); arrIndxIn->checkAllocated();
+  if(arrIn->getNumberOfComponents()!=1 || arrIndxIn->getNumberOfComponents()!=1)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays : input arrays must have exactly one component !");
+  std::size_t sz=std::distance(idsOfSelectBg,idsOfSelectEnd);
+  const int *arrInPtr=arrIn->begin();
+  const int *arrIndxPtr=arrIndxIn->begin();
+  int nbOfGrps=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
+  if(nbOfGrps<0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays : The format of \"arrIndxIn\" is invalid ! Its nb of tuples should be >=1 !");
+  int maxSizeOfArr=arrIn->getNumberOfTuples();
+  MCAuto<DataArrayInt> arro=DataArrayInt::New();
+  MCAuto<DataArrayInt> arrIo=DataArrayInt::New();
+  arrIo->alloc((int)(sz+1),1);
+  const int *idsIt=idsOfSelectBg;
+  int *work=arrIo->getPointer();
+  *work++=0;
+  int lgth=0;
+  for(std::size_t i=0;i<sz;i++,work++,idsIt++)
+    {
+      if(*idsIt>=0 && *idsIt<nbOfGrps)
+        lgth+=arrIndxPtr[*idsIt+1]-arrIndxPtr[*idsIt];
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays : id located on pos #" << i << " value is " << *idsIt << " ! Must be in [0," << nbOfGrps << ") !";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+      if(lgth>=work[-1])
+        *work=lgth;
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays : id located on pos #" << i << " value is " << *idsIt << " and at this pos arrIndxIn[" << *idsIt;
+          oss << "+1]-arrIndxIn[" << *idsIt << "] < 0 ! The input index array is bugged !";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+    }
+  arro->alloc(lgth,1);
+  work=arro->getPointer();
+  idsIt=idsOfSelectBg;
+  for(std::size_t i=0;i<sz;i++,idsIt++)
+    {
+      if(arrIndxPtr[*idsIt]>=0 && arrIndxPtr[*idsIt+1]<=maxSizeOfArr)
+        work=std::copy(arrInPtr+arrIndxPtr[*idsIt],arrInPtr+arrIndxPtr[*idsIt+1],work);
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays : id located on pos #" << i << " value is " << *idsIt << " arrIndx[" << *idsIt << "] must be >= 0 and arrIndx[";
+          oss << *idsIt << "+1] <= " << maxSizeOfArr << " (the size of arrIn)!";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+    }
+  arrOut=arro.retn();
+  arrIndexOut=arrIo.retn();
+}
+
+/*!
+ * This method works on a pair input (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn
+ * (\ref numbering-indirect).
+ * This method returns the result of the extraction ( specified by a set of ids with a slice given by \a idsOfSelectStart, \a idsOfSelectStop and \a idsOfSelectStep ).
+ * The selection of extraction is done standardly in new2old format.
+ * This method returns indexed arrays (\ref numbering-indirect) using 2 arrays (arrOut,arrIndexOut).
+ *
+ * \param [in] idsOfSelectStart begin of set of ids of the input extraction (included)
+ * \param [in] idsOfSelectStop end of set of ids of the input extraction (excluded)
+ * \param [in] idsOfSelectStep
+ * \param [in] arrIn arr origin array from which the extraction will be done.
+ * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
+ * \param [out] arrOut the resulting array
+ * \param [out] arrIndexOut the index array of the resulting array \b arrOut
+ * \sa DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays
+ */
+void DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice(int idsOfSelectStart, int idsOfSelectStop, int idsOfSelectStep, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                 DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut)
+{
+  if(!arrIn || !arrIndxIn)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice : input pointer is NULL !");
+  arrIn->checkAllocated(); arrIndxIn->checkAllocated();
+  if(arrIn->getNumberOfComponents()!=1 || arrIndxIn->getNumberOfComponents()!=1)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice : input arrays must have exactly one component !");
+  int sz=DataArrayInt::GetNumberOfItemGivenBESRelative(idsOfSelectStart,idsOfSelectStop,idsOfSelectStep,"MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice : Input slice ");
+  const int *arrInPtr=arrIn->begin();
+  const int *arrIndxPtr=arrIndxIn->begin();
+  int nbOfGrps=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
+  if(nbOfGrps<0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice : The format of \"arrIndxIn\" is invalid ! Its nb of tuples should be >=1 !");
+  int maxSizeOfArr=arrIn->getNumberOfTuples();
+  MCAuto<DataArrayInt> arro=DataArrayInt::New();
+  MCAuto<DataArrayInt> arrIo=DataArrayInt::New();
+  arrIo->alloc((int)(sz+1),1);
+  int idsIt=idsOfSelectStart;
+  int *work=arrIo->getPointer();
+  *work++=0;
+  int lgth=0;
+  for(int i=0;i<sz;i++,work++,idsIt+=idsOfSelectStep)
+    {
+      if(idsIt>=0 && idsIt<nbOfGrps)
+        lgth+=arrIndxPtr[idsIt+1]-arrIndxPtr[idsIt];
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice : id located on pos #" << i << " value is " << idsIt << " ! Must be in [0," << nbOfGrps << ") !";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+      if(lgth>=work[-1])
+        *work=lgth;
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice : id located on pos #" << i << " value is " << idsIt << " and at this pos arrIndxIn[" << idsIt;
+          oss << "+1]-arrIndxIn[" << idsIt << "] < 0 ! The input index array is bugged !";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+    }
+  arro->alloc(lgth,1);
+  work=arro->getPointer();
+  idsIt=idsOfSelectStart;
+  for(int i=0;i<sz;i++,idsIt+=idsOfSelectStep)
+    {
+      if(arrIndxPtr[idsIt]>=0 && arrIndxPtr[idsIt+1]<=maxSizeOfArr)
+        work=std::copy(arrInPtr+arrIndxPtr[idsIt],arrInPtr+arrIndxPtr[idsIt+1],work);
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice : id located on pos #" << i << " value is " << idsIt << " arrIndx[" << idsIt << "] must be >= 0 and arrIndx[";
+          oss << idsIt << "+1] <= " << maxSizeOfArr << " (the size of arrIn)!";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+    }
+  arrOut=arro.retn();
+  arrIndexOut=arrIo.retn();
+}
+
+/*!
+ * This method works on an input pair (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn.
+ * This method builds an output pair (\b arrOut,\b arrIndexOut) that is a copy from \b arrIn for all cell ids \b not \b in [ \b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd ) and for
+ * cellIds \b in [ \b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd ) a copy coming from the corresponding values in input pair (\b srcArr, \b srcArrIndex).
+ * This method is an generalization of MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx that performs the same thing but by without building explicitly a result output arrays.
+ *
+ * \param [in] idsOfSelectBg begin of set of ids of the input extraction (included)
+ * \param [in] idsOfSelectEnd end of set of ids of the input extraction (excluded)
+ * \param [in] arrIn arr origin array from which the extraction will be done.
+ * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
+ * \param [in] srcArr input array that will be used as source of copy for ids in [ \b idsOfSelectBg, \b idsOfSelectEnd )
+ * \param [in] srcArrIndex index array of \b srcArr
+ * \param [out] arrOut the resulting array
+ * \param [out] arrIndexOut the index array of the resulting array \b arrOut
+ *
+ * \sa DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx
+ */
+void DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                              const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
+                                              DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut)
+{
+  if(arrIn==0 || arrIndxIn==0 || srcArr==0 || srcArrIndex==0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays : presence of null pointer in input parameter !");
+  MCAuto<DataArrayInt> arro=DataArrayInt::New();
+  MCAuto<DataArrayInt> arrIo=DataArrayInt::New();
+  int nbOfTuples=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
+  std::vector<bool> v(nbOfTuples,true);
+  int offset=0;
+  const int *arrIndxInPtr=arrIndxIn->begin();
+  const int *srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
+  for(const int *it=idsOfSelectBg;it!=idsOfSelectEnd;it++,srcArrIndexPtr++)
+    {
+      if(*it>=0 && *it<nbOfTuples)
+        {
+          v[*it]=false;
+          offset+=(srcArrIndexPtr[1]-srcArrIndexPtr[0])-(arrIndxInPtr[*it+1]-arrIndxInPtr[*it]);
+        }
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays : On pos #" << std::distance(idsOfSelectBg,it) << " value is " << *it << " not in [0," << nbOfTuples << ") !";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+    }
+  srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
+  arrIo->alloc(nbOfTuples+1,1);
+  arro->alloc(arrIn->getNumberOfTuples()+offset,1);
+  const int *arrInPtr=arrIn->begin();
+  const int *srcArrPtr=srcArr->begin();
+  int *arrIoPtr=arrIo->getPointer(); *arrIoPtr++=0;
+  int *arroPtr=arro->getPointer();
+  for(int ii=0;ii<nbOfTuples;ii++,arrIoPtr++)
+    {
+      if(v[ii])
+        {
+          arroPtr=std::copy(arrInPtr+arrIndxInPtr[ii],arrInPtr+arrIndxInPtr[ii+1],arroPtr);
+          *arrIoPtr=arrIoPtr[-1]+(arrIndxInPtr[ii+1]-arrIndxInPtr[ii]);
+        }
+      else
+        {
+          std::size_t pos=std::distance(idsOfSelectBg,std::find(idsOfSelectBg,idsOfSelectEnd,ii));
+          arroPtr=std::copy(srcArrPtr+srcArrIndexPtr[pos],srcArrPtr+srcArrIndexPtr[pos+1],arroPtr);
+          *arrIoPtr=arrIoPtr[-1]+(srcArrIndexPtr[pos+1]-srcArrIndexPtr[pos]);
+        }
+    }
+  arrOut=arro.retn();
+  arrIndexOut=arrIo.retn();
+}
+
+
+/*!
+ * This method works on an input pair (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn.
+ * This method builds an output pair (\b arrOut,\b arrIndexOut) that is a copy from \b arrIn for all cell ids \b not \b in [ \b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd ) and for
+ * cellIds \b in [\b idsOfSelectBg, \b idsOfSelectEnd) a copy coming from the corresponding values in input pair (\b srcArr, \b srcArrIndex).
+ * This method is an generalization of DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx that performs the same thing but by without building explicitly a result output arrays.
+ *
+ * \param [in] start begin of set of ids of the input extraction (included)
+ * \param [in] end end of set of ids of the input extraction (excluded)
+ * \param [in] step step of the set of ids in range mode.
+ * \param [in] arrIn arr origin array from which the extraction will be done.
+ * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
+ * \param [in] srcArr input array that will be used as source of copy for ids in [\b idsOfSelectBg, \b idsOfSelectEnd)
+ * \param [in] srcArrIndex index array of \b srcArr
+ * \param [out] arrOut the resulting array
+ * \param [out] arrIndexOut the index array of the resulting array \b arrOut
+ *
+ * \sa DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays
+ */
+void DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSlice(int start, int end, int step, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                               const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
+                                               DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut)
+{
+  if(arrIn==0 || arrIndxIn==0 || srcArr==0 || srcArrIndex==0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSlice : presence of null pointer in input parameter !");
+  MCAuto<DataArrayInt> arro=DataArrayInt::New();
+  MCAuto<DataArrayInt> arrIo=DataArrayInt::New();
+  int nbOfTuples=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
+  int offset=0;
+  const int *arrIndxInPtr=arrIndxIn->begin();
+  const int *srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
+  int nbOfElemsToSet=DataArray::GetNumberOfItemGivenBESRelative(start,end,step,"DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSlice : ");
+  int it=start;
+  for(int i=0;i<nbOfElemsToSet;i++,srcArrIndexPtr++,it+=step)
+    {
+      if(it>=0 && it<nbOfTuples)
+        offset+=(srcArrIndexPtr[1]-srcArrIndexPtr[0])-(arrIndxInPtr[it+1]-arrIndxInPtr[it]);
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSlice : On pos #" << i << " value is " << it << " not in [0," << nbOfTuples << ") !";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+    }
+  srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
+  arrIo->alloc(nbOfTuples+1,1);
+  arro->alloc(arrIn->getNumberOfTuples()+offset,1);
+  const int *arrInPtr=arrIn->begin();
+  const int *srcArrPtr=srcArr->begin();
+  int *arrIoPtr=arrIo->getPointer(); *arrIoPtr++=0;
+  int *arroPtr=arro->getPointer();
+  for(int ii=0;ii<nbOfTuples;ii++,arrIoPtr++)
+    {
+      int pos=DataArray::GetPosOfItemGivenBESRelativeNoThrow(ii,start,end,step);
+      if(pos<0)
+        {
+          arroPtr=std::copy(arrInPtr+arrIndxInPtr[ii],arrInPtr+arrIndxInPtr[ii+1],arroPtr);
+          *arrIoPtr=arrIoPtr[-1]+(arrIndxInPtr[ii+1]-arrIndxInPtr[ii]);
+        }
+      else
+        {
+          arroPtr=std::copy(srcArrPtr+srcArrIndexPtr[pos],srcArrPtr+srcArrIndexPtr[pos+1],arroPtr);
+          *arrIoPtr=arrIoPtr[-1]+(srcArrIndexPtr[pos+1]-srcArrIndexPtr[pos]);
+        }
+    }
+  arrOut=arro.retn();
+  arrIndexOut=arrIo.retn();
+}
+
+
+/*!
+ * This method works on an input pair (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn.
+ * This method is an specialization of MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays in the case of assignment do not modify the index in \b arrIndxIn.
+ *
+ * \param [in] idsOfSelectBg begin of set of ids of the input extraction (included)
+ * \param [in] idsOfSelectEnd end of set of ids of the input extraction (excluded)
+ * \param [in,out] arrInOut arr origin array from which the extraction will be done.
+ * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
+ * \param [in] srcArr input array that will be used as source of copy for ids in [ \b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd )
+ * \param [in] srcArrIndex index array of \b srcArr
+ *
+ * \sa DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays
+ */
+void DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                     const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex)
+{
+  if(arrInOut==0 || arrIndxIn==0 || srcArr==0 || srcArrIndex==0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : presence of null pointer in input parameter !");
+  int nbOfTuples=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
+  const int *arrIndxInPtr=arrIndxIn->begin();
+  const int *srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
+  int *arrInOutPtr=arrInOut->getPointer();
+  const int *srcArrPtr=srcArr->begin();
+  for(const int *it=idsOfSelectBg;it!=idsOfSelectEnd;it++,srcArrIndexPtr++)
+    {
+      if(*it>=0 && *it<nbOfTuples)
+        {
+          if(srcArrIndexPtr[1]-srcArrIndexPtr[0]==arrIndxInPtr[*it+1]-arrIndxInPtr[*it])
+            std::copy(srcArrPtr+srcArrIndexPtr[0],srcArrPtr+srcArrIndexPtr[1],arrInOutPtr+arrIndxInPtr[*it]);
+          else
+            {
+              std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : On pos #" << std::distance(idsOfSelectBg,it) << " id (idsOfSelectBg[" << std::distance(idsOfSelectBg,it)<< "]) is " << *it << " arrIndxIn[id+1]-arrIndxIn[id]!=srcArrIndex[pos+1]-srcArrIndex[pos] !";
+              throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+            }
+        }
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : On pos #" << std::distance(idsOfSelectBg,it) << " value is " << *it << " not in [0," << nbOfTuples << ") !";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+    }
+}
+
+/*!
+ * This method works on an input pair (\b arr, \b arrIndx) where \b arr indexes is in \b arrIndx.
+ * This method will not impact the size of inout parameter \b arrIndx but the size of \b arr will be modified in case of suppression.
+ *
+ * \param [in] idsToRemoveBg begin of set of ids to remove in \b arr (included)
+ * \param [in] idsToRemoveEnd end of set of ids to remove in \b arr (excluded)
+ * \param [in,out] arr array in which the remove operation will be done.
+ * \param [in,out] arrIndx array in the remove operation will modify
+ * \param [in] offsetForRemoval (by default 0) offset so that for each i in [0,arrIndx->getNumberOfTuples()-1) removal process will be performed in the following range [arr+arrIndx[i]+offsetForRemoval,arr+arr[i+1])
+ * \return true if \b arr and \b arrIndx have been modified, false if not.
+ */
+bool DataArrayInt::RemoveIdsFromIndexedArrays(const int *idsToRemoveBg, const int *idsToRemoveEnd, DataArrayInt *arr, DataArrayInt *arrIndx, int offsetForRemoval)
+{
+  if(!arrIndx || !arr)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::RemoveIdsFromIndexedArrays : some input arrays are empty !");
+  if(offsetForRemoval<0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::RemoveIdsFromIndexedArrays : offsetForRemoval should be >=0 !");
+  std::set<int> s(idsToRemoveBg,idsToRemoveEnd);
+  int nbOfGrps=arrIndx->getNumberOfTuples()-1;
+  int *arrIPtr=arrIndx->getPointer();
+  *arrIPtr++=0;
+  int previousArrI=0;
+  const int *arrPtr=arr->begin();
+  std::vector<int> arrOut;//no utility to switch to DataArrayInt because copy always needed
+  for(int i=0;i<nbOfGrps;i++,arrIPtr++)
+    {
+      if(*arrIPtr-previousArrI>offsetForRemoval)
+        {
+          for(const int *work=arrPtr+previousArrI+offsetForRemoval;work!=arrPtr+*arrIPtr;work++)
+            {
+              if(s.find(*work)==s.end())
+                arrOut.push_back(*work);
+            }
+        }
+      previousArrI=*arrIPtr;
+      *arrIPtr=(int)arrOut.size();
+    }
+  if(arr->getNumberOfTuples()==arrOut.size())
+    return false;
+  arr->alloc((int)arrOut.size(),1);
+  std::copy(arrOut.begin(),arrOut.end(),arr->getPointer());
+  return true;
+}
+
+/*!
+ * This method works on an input pair (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn.
+ * This method is an specialization of MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays in the case of assignment do not modify the index in \b arrIndxIn.
+ *
+ * \param [in] start begin of set of ids of the input extraction (included)
+ * \param [in] end end of set of ids of the input extraction (excluded)
+ * \param [in] step step of the set of ids in range mode.
+ * \param [in,out] arrInOut arr origin array from which the extraction will be done.
+ * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
+ * \param [in] srcArr input array that will be used as source of copy for ids in [\b idsOfSelectBg, \b idsOfSelectEnd)
+ * \param [in] srcArrIndex index array of \b srcArr
+ *
+ * \sa DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSlice DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx
+ */
+void DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice(int start, int end, int step, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                      const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex)
+{
+  if(arrInOut==0 || arrIndxIn==0 || srcArr==0 || srcArrIndex==0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice : presence of null pointer in input parameter !");
+  int nbOfTuples=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
+  const int *arrIndxInPtr=arrIndxIn->begin();
+  const int *srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
+  int *arrInOutPtr=arrInOut->getPointer();
+  const int *srcArrPtr=srcArr->begin();
+  int nbOfElemsToSet=DataArray::GetNumberOfItemGivenBESRelative(start,end,step,"DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice : ");
+  int it=start;
+  for(int i=0;i<nbOfElemsToSet;i++,srcArrIndexPtr++,it+=step)
+    {
+      if(it>=0 && it<nbOfTuples)
+        {
+          if(srcArrIndexPtr[1]-srcArrIndexPtr[0]==arrIndxInPtr[it+1]-arrIndxInPtr[it])
+            std::copy(srcArrPtr+srcArrIndexPtr[0],srcArrPtr+srcArrIndexPtr[1],arrInOutPtr+arrIndxInPtr[it]);
+          else
+            {
+              std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice : On pos #" << i << " id (idsOfSelectBg[" << i << "]) is " << it << " arrIndxIn[id+1]-arrIndxIn[id]!=srcArrIndex[pos+1]-srcArrIndex[pos] !";
+              throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+            }
+        }
+      else
+        {
+          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice : On pos #" << i << " value is " << it << " not in [0," << nbOfTuples << ") !";
+          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
+        }
+    }
+}
+
+
 /*!
  * Returns a C array which is a renumbering map in "Old to New" mode for the input array.
  * This map, if applied to \a start array, would make it sorted. For example, if
index c1d1617d58214ef0982544adbcd436882e2a7af3..640f5e6b476c5d81f315f4cda6c890531fff9e21 100644 (file)
@@ -663,6 +663,21 @@ namespace MEDCoupling
     MEDCOUPLING_EXPORT MemArray<int>& accessToMemArray() { return _mem; }
     MEDCOUPLING_EXPORT const MemArray<int>& accessToMemArray() const { return _mem; }
   public:
+    MEDCOUPLING_EXPORT static void ExtractFromIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                    DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut);
+    MEDCOUPLING_EXPORT static void ExtractFromIndexedArraysSlice(int idsOfSelectStart, int idsOfSelectStop, int idsOfSelectStep, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                     DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut);
+    MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                  const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
+                                                  DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut);
+    MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArraysSlice(int start, int end, int step, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                   const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
+                                                   DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut);
+    MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArraysSameIdx(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                         const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex);
+    MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice(int start, int end, int step, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                          const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex);
+    MEDCOUPLING_EXPORT static bool RemoveIdsFromIndexedArrays(const int *idsToRemoveBg, const int *idsToRemoveEnd, DataArrayInt *arr, DataArrayInt *arrIndx, int offsetForRemoval=0);
     MEDCOUPLING_EXPORT static int *CheckAndPreparePermutation(const int *start, const int *end);
     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt32 *Range(int begin, int end, int step);
   public:
index 203a75294b02da92a519c013019804158d03b4d4..0dfa42cd7a91a5ab16d325095fe012013b09c7d3 100644 (file)
@@ -2016,13 +2016,13 @@ void MEDCouplingUMesh::setPartOfMySelf(const int *cellIdsBg, const int *cellIdsE
     }
   if(easyAssign)
     {
-      MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(cellIdsBg,cellIdsEnd,_nodal_connec,_nodal_connec_index,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec_index);
+      DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(cellIdsBg,cellIdsEnd,_nodal_connec,_nodal_connec_index,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec_index);
       computeTypes();
     }
   else
     {
       DataArrayInt *arrOut=0,*arrIOut=0;
-      MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays(cellIdsBg,cellIdsEnd,_nodal_connec,_nodal_connec_index,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec_index,
+      DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays(cellIdsBg,cellIdsEnd,_nodal_connec,_nodal_connec_index,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec_index,
                                                arrOut,arrIOut);
       MCAuto<DataArrayInt> arrOutAuto(arrOut),arrIOutAuto(arrIOut);
       setConnectivity(arrOut,arrIOut,true);
@@ -2066,13 +2066,13 @@ void MEDCouplingUMesh::setPartOfMySelfSlice(int start, int end, int step, const
     }
   if(easyAssign)
     {
-      MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice(start,end,step,_nodal_connec,_nodal_connec_index,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec_index);
+      DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice(start,end,step,_nodal_connec,_nodal_connec_index,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec_index);
       computeTypes();
     }
   else
     {
       DataArrayInt *arrOut=0,*arrIOut=0;
-      MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSlice(start,end,step,_nodal_connec,_nodal_connec_index,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec_index,
+      DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSlice(start,end,step,_nodal_connec,_nodal_connec_index,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec,otherOnSameCoordsThanThis._nodal_connec_index,
                                                 arrOut,arrIOut);
       MCAuto<DataArrayInt> arrOutAuto(arrOut),arrIOutAuto(arrIOut);
       setConnectivity(arrOut,arrIOut,true);
@@ -2375,7 +2375,7 @@ void MEDCouplingUMesh::findNodesToDuplicate(const MEDCouplingUMesh& otherDimM1On
   DAInt ids(idsTmp);
   // In the neighbor information remove the connection between high dimension cells and its low level constituents which are part
   // of the frontier given in parameter (i.e. the cells of low dimension from the group delimiting the crack):
-  MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays(ids->begin(),ids->end(),desc00,descI00);
+  DataArrayInt::RemoveIdsFromIndexedArrays(ids->begin(),ids->end(),desc00,descI00);
   DataArrayInt *tmp0=0,*tmp1=0;
   // Compute the neighbor of each cell in m0Part2, taking into account the broken link above. Two
   // cells on either side of the crack (defined by the mesh of low dimension) are not neighbor anymore.
@@ -7837,308 +7837,6 @@ bool MEDCouplingUMesh::BuildConvexEnvelopOf2DCellJarvis(const double *coords, co
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::BuildConvexEnvelopOf2DCellJarvis : invalid 2D cell connectivity !");
 }
 
-/*!
- * This method works on an input pair (\b arr, \b arrIndx) where \b arr indexes is in \b arrIndx.
- * This method will not impact the size of inout parameter \b arrIndx but the size of \b arr will be modified in case of suppression.
- *
- * \param [in] idsToRemoveBg begin of set of ids to remove in \b arr (included)
- * \param [in] idsToRemoveEnd end of set of ids to remove in \b arr (excluded)
- * \param [in,out] arr array in which the remove operation will be done.
- * \param [in,out] arrIndx array in the remove operation will modify
- * \param [in] offsetForRemoval (by default 0) offset so that for each i in [0,arrIndx->getNumberOfTuples()-1) removal process will be performed in the following range [arr+arrIndx[i]+offsetForRemoval,arr+arr[i+1])
- * \return true if \b arr and \b arrIndx have been modified, false if not.
- */
-bool MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays(const int *idsToRemoveBg, const int *idsToRemoveEnd, DataArrayInt *arr, DataArrayInt *arrIndx, int offsetForRemoval)
-{
-  if(!arrIndx || !arr)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays : some input arrays are empty !");
-  if(offsetForRemoval<0)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays : offsetForRemoval should be >=0 !");
-  std::set<int> s(idsToRemoveBg,idsToRemoveEnd);
-  int nbOfGrps=arrIndx->getNumberOfTuples()-1;
-  int *arrIPtr=arrIndx->getPointer();
-  *arrIPtr++=0;
-  int previousArrI=0;
-  const int *arrPtr=arr->begin();
-  std::vector<int> arrOut;//no utility to switch to DataArrayInt because copy always needed
-  for(int i=0;i<nbOfGrps;i++,arrIPtr++)
-    {
-      if(*arrIPtr-previousArrI>offsetForRemoval)
-        {
-          for(const int *work=arrPtr+previousArrI+offsetForRemoval;work!=arrPtr+*arrIPtr;work++)
-            {
-              if(s.find(*work)==s.end())
-                arrOut.push_back(*work);
-            }
-        }
-      previousArrI=*arrIPtr;
-      *arrIPtr=(int)arrOut.size();
-    }
-  if(arr->getNumberOfTuples()==arrOut.size())
-    return false;
-  arr->alloc((int)arrOut.size(),1);
-  std::copy(arrOut.begin(),arrOut.end(),arr->getPointer());
-  return true;
-}
-
-/*!
- * This method works on a pair input (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn
- * (\ref numbering-indirect).
- * This method returns the result of the extraction ( specified by a set of ids in [\b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd ) ).
- * The selection of extraction is done standardly in new2old format.
- * This method returns indexed arrays (\ref numbering-indirect) using 2 arrays (arrOut,arrIndexOut).
- *
- * \param [in] idsOfSelectBg begin of set of ids of the input extraction (included)
- * \param [in] idsOfSelectEnd end of set of ids of the input extraction (excluded)
- * \param [in] arrIn arr origin array from which the extraction will be done.
- * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
- * \param [out] arrOut the resulting array
- * \param [out] arrIndexOut the index array of the resulting array \b arrOut
- * \sa MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice
- */
-void MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut)
-{
-  if(!arrIn || !arrIndxIn)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays : input pointer is NULL !");
-  arrIn->checkAllocated(); arrIndxIn->checkAllocated();
-  if(arrIn->getNumberOfComponents()!=1 || arrIndxIn->getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays : input arrays must have exactly one component !");
-  std::size_t sz=std::distance(idsOfSelectBg,idsOfSelectEnd);
-  const int *arrInPtr=arrIn->begin();
-  const int *arrIndxPtr=arrIndxIn->begin();
-  int nbOfGrps=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
-  if(nbOfGrps<0)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays : The format of \"arrIndxIn\" is invalid ! Its nb of tuples should be >=1 !");
-  int maxSizeOfArr=arrIn->getNumberOfTuples();
-  MCAuto<DataArrayInt> arro=DataArrayInt::New();
-  MCAuto<DataArrayInt> arrIo=DataArrayInt::New();
-  arrIo->alloc((int)(sz+1),1);
-  const int *idsIt=idsOfSelectBg;
-  int *work=arrIo->getPointer();
-  *work++=0;
-  int lgth=0;
-  for(std::size_t i=0;i<sz;i++,work++,idsIt++)
-    {
-      if(*idsIt>=0 && *idsIt<nbOfGrps)
-        lgth+=arrIndxPtr[*idsIt+1]-arrIndxPtr[*idsIt];
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays : id located on pos #" << i << " value is " << *idsIt << " ! Must be in [0," << nbOfGrps << ") !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-      if(lgth>=work[-1])
-        *work=lgth;
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays : id located on pos #" << i << " value is " << *idsIt << " and at this pos arrIndxIn[" << *idsIt;
-          oss << "+1]-arrIndxIn[" << *idsIt << "] < 0 ! The input index array is bugged !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-  arro->alloc(lgth,1);
-  work=arro->getPointer();
-  idsIt=idsOfSelectBg;
-  for(std::size_t i=0;i<sz;i++,idsIt++)
-    {
-      if(arrIndxPtr[*idsIt]>=0 && arrIndxPtr[*idsIt+1]<=maxSizeOfArr)
-        work=std::copy(arrInPtr+arrIndxPtr[*idsIt],arrInPtr+arrIndxPtr[*idsIt+1],work);
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays : id located on pos #" << i << " value is " << *idsIt << " arrIndx[" << *idsIt << "] must be >= 0 and arrIndx[";
-          oss << *idsIt << "+1] <= " << maxSizeOfArr << " (the size of arrIn)!";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-  arrOut=arro.retn();
-  arrIndexOut=arrIo.retn();
-}
-
-/*!
- * This method works on a pair input (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn
- * (\ref numbering-indirect).
- * This method returns the result of the extraction ( specified by a set of ids with a slice given by \a idsOfSelectStart, \a idsOfSelectStop and \a idsOfSelectStep ).
- * The selection of extraction is done standardly in new2old format.
- * This method returns indexed arrays (\ref numbering-indirect) using 2 arrays (arrOut,arrIndexOut).
- *
- * \param [in] idsOfSelectStart begin of set of ids of the input extraction (included)
- * \param [in] idsOfSelectStop end of set of ids of the input extraction (excluded)
- * \param [in] idsOfSelectStep
- * \param [in] arrIn arr origin array from which the extraction will be done.
- * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
- * \param [out] arrOut the resulting array
- * \param [out] arrIndexOut the index array of the resulting array \b arrOut
- * \sa MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays
- */
-void MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice(int idsOfSelectStart, int idsOfSelectStop, int idsOfSelectStep, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                 DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut)
-{
-  if(!arrIn || !arrIndxIn)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice : input pointer is NULL !");
-  arrIn->checkAllocated(); arrIndxIn->checkAllocated();
-  if(arrIn->getNumberOfComponents()!=1 || arrIndxIn->getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice : input arrays must have exactly one component !");
-  int sz=DataArrayInt::GetNumberOfItemGivenBESRelative(idsOfSelectStart,idsOfSelectStop,idsOfSelectStep,"MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice : Input slice ");
-  const int *arrInPtr=arrIn->begin();
-  const int *arrIndxPtr=arrIndxIn->begin();
-  int nbOfGrps=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
-  if(nbOfGrps<0)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice : The format of \"arrIndxIn\" is invalid ! Its nb of tuples should be >=1 !");
-  int maxSizeOfArr=arrIn->getNumberOfTuples();
-  MCAuto<DataArrayInt> arro=DataArrayInt::New();
-  MCAuto<DataArrayInt> arrIo=DataArrayInt::New();
-  arrIo->alloc((int)(sz+1),1);
-  int idsIt=idsOfSelectStart;
-  int *work=arrIo->getPointer();
-  *work++=0;
-  int lgth=0;
-  for(int i=0;i<sz;i++,work++,idsIt+=idsOfSelectStep)
-    {
-      if(idsIt>=0 && idsIt<nbOfGrps)
-        lgth+=arrIndxPtr[idsIt+1]-arrIndxPtr[idsIt];
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice : id located on pos #" << i << " value is " << idsIt << " ! Must be in [0," << nbOfGrps << ") !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-      if(lgth>=work[-1])
-        *work=lgth;
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice : id located on pos #" << i << " value is " << idsIt << " and at this pos arrIndxIn[" << idsIt;
-          oss << "+1]-arrIndxIn[" << idsIt << "] < 0 ! The input index array is bugged !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-  arro->alloc(lgth,1);
-  work=arro->getPointer();
-  idsIt=idsOfSelectStart;
-  for(int i=0;i<sz;i++,idsIt+=idsOfSelectStep)
-    {
-      if(arrIndxPtr[idsIt]>=0 && arrIndxPtr[idsIt+1]<=maxSizeOfArr)
-        work=std::copy(arrInPtr+arrIndxPtr[idsIt],arrInPtr+arrIndxPtr[idsIt+1],work);
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice : id located on pos #" << i << " value is " << idsIt << " arrIndx[" << idsIt << "] must be >= 0 and arrIndx[";
-          oss << idsIt << "+1] <= " << maxSizeOfArr << " (the size of arrIn)!";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-  arrOut=arro.retn();
-  arrIndexOut=arrIo.retn();
-}
-
-/*!
- * This method works on an input pair (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn.
- * This method builds an output pair (\b arrOut,\b arrIndexOut) that is a copy from \b arrIn for all cell ids \b not \b in [ \b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd ) and for
- * cellIds \b in [ \b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd ) a copy coming from the corresponding values in input pair (\b srcArr, \b srcArrIndex).
- * This method is an generalization of MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx that performs the same thing but by without building explicitly a result output arrays.
- *
- * \param [in] idsOfSelectBg begin of set of ids of the input extraction (included)
- * \param [in] idsOfSelectEnd end of set of ids of the input extraction (excluded)
- * \param [in] arrIn arr origin array from which the extraction will be done.
- * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
- * \param [in] srcArr input array that will be used as source of copy for ids in [ \b idsOfSelectBg, \b idsOfSelectEnd )
- * \param [in] srcArrIndex index array of \b srcArr
- * \param [out] arrOut the resulting array
- * \param [out] arrIndexOut the index array of the resulting array \b arrOut
- *
- * \sa MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx
- */
-void MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                              const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
-                                              DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut)
-{
-  if(arrIn==0 || arrIndxIn==0 || srcArr==0 || srcArrIndex==0)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays : presence of null pointer in input parameter !");
-  MCAuto<DataArrayInt> arro=DataArrayInt::New();
-  MCAuto<DataArrayInt> arrIo=DataArrayInt::New();
-  int nbOfTuples=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
-  std::vector<bool> v(nbOfTuples,true);
-  int offset=0;
-  const int *arrIndxInPtr=arrIndxIn->begin();
-  const int *srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
-  for(const int *it=idsOfSelectBg;it!=idsOfSelectEnd;it++,srcArrIndexPtr++)
-    {
-      if(*it>=0 && *it<nbOfTuples)
-        {
-          v[*it]=false;
-          offset+=(srcArrIndexPtr[1]-srcArrIndexPtr[0])-(arrIndxInPtr[*it+1]-arrIndxInPtr[*it]);
-        }
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays : On pos #" << std::distance(idsOfSelectBg,it) << " value is " << *it << " not in [0," << nbOfTuples << ") !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-  srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
-  arrIo->alloc(nbOfTuples+1,1);
-  arro->alloc(arrIn->getNumberOfTuples()+offset,1);
-  const int *arrInPtr=arrIn->begin();
-  const int *srcArrPtr=srcArr->begin();
-  int *arrIoPtr=arrIo->getPointer(); *arrIoPtr++=0;
-  int *arroPtr=arro->getPointer();
-  for(int ii=0;ii<nbOfTuples;ii++,arrIoPtr++)
-    {
-      if(v[ii])
-        {
-          arroPtr=std::copy(arrInPtr+arrIndxInPtr[ii],arrInPtr+arrIndxInPtr[ii+1],arroPtr);
-          *arrIoPtr=arrIoPtr[-1]+(arrIndxInPtr[ii+1]-arrIndxInPtr[ii]);
-        }
-      else
-        {
-          std::size_t pos=std::distance(idsOfSelectBg,std::find(idsOfSelectBg,idsOfSelectEnd,ii));
-          arroPtr=std::copy(srcArrPtr+srcArrIndexPtr[pos],srcArrPtr+srcArrIndexPtr[pos+1],arroPtr);
-          *arrIoPtr=arrIoPtr[-1]+(srcArrIndexPtr[pos+1]-srcArrIndexPtr[pos]);
-        }
-    }
-  arrOut=arro.retn();
-  arrIndexOut=arrIo.retn();
-}
-
-/*!
- * This method works on an input pair (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn.
- * This method is an specialization of MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays in the case of assignment do not modify the index in \b arrIndxIn.
- *
- * \param [in] idsOfSelectBg begin of set of ids of the input extraction (included)
- * \param [in] idsOfSelectEnd end of set of ids of the input extraction (excluded)
- * \param [in,out] arrInOut arr origin array from which the extraction will be done.
- * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
- * \param [in] srcArr input array that will be used as source of copy for ids in [ \b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd )
- * \param [in] srcArrIndex index array of \b srcArr
- *
- * \sa MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays
- */
-void MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                     const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex)
-{
-  if(arrInOut==0 || arrIndxIn==0 || srcArr==0 || srcArrIndex==0)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : presence of null pointer in input parameter !");
-  int nbOfTuples=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
-  const int *arrIndxInPtr=arrIndxIn->begin();
-  const int *srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
-  int *arrInOutPtr=arrInOut->getPointer();
-  const int *srcArrPtr=srcArr->begin();
-  for(const int *it=idsOfSelectBg;it!=idsOfSelectEnd;it++,srcArrIndexPtr++)
-    {
-      if(*it>=0 && *it<nbOfTuples)
-        {
-          if(srcArrIndexPtr[1]-srcArrIndexPtr[0]==arrIndxInPtr[*it+1]-arrIndxInPtr[*it])
-            std::copy(srcArrPtr+srcArrIndexPtr[0],srcArrPtr+srcArrIndexPtr[1],arrInOutPtr+arrIndxInPtr[*it]);
-          else
-            {
-              std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : On pos #" << std::distance(idsOfSelectBg,it) << " id (idsOfSelectBg[" << std::distance(idsOfSelectBg,it)<< "]) is " << *it << " arrIndxIn[id+1]-arrIndxIn[id]!=srcArrIndex[pos+1]-srcArrIndex[pos] !";
-              throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-            }
-        }
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : On pos #" << std::distance(idsOfSelectBg,it) << " value is " << *it << " not in [0," << nbOfTuples << ") !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-}
-
 /*!
  * This method works on a pair input (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arr indexes is in \b arrIndxIn.
  * This method expects that these two input arrays come from the output of MEDCouplingUMesh::computeNeighborsOfCells method.
@@ -8191,118 +7889,6 @@ DataArrayInt *MEDCouplingUMesh::ComputeSpreadZoneGraduallyFromSeed(const int *se
 }
 
 
-/*!
- * This method works on an input pair (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn.
- * This method builds an output pair (\b arrOut,\b arrIndexOut) that is a copy from \b arrIn for all cell ids \b not \b in [ \b idsOfSelectBg , \b idsOfSelectEnd ) and for
- * cellIds \b in [\b idsOfSelectBg, \b idsOfSelectEnd) a copy coming from the corresponding values in input pair (\b srcArr, \b srcArrIndex).
- * This method is an generalization of MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx that performs the same thing but by without building explicitly a result output arrays.
- *
- * \param [in] start begin of set of ids of the input extraction (included)
- * \param [in] end end of set of ids of the input extraction (excluded)
- * \param [in] step step of the set of ids in range mode.
- * \param [in] arrIn arr origin array from which the extraction will be done.
- * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
- * \param [in] srcArr input array that will be used as source of copy for ids in [\b idsOfSelectBg, \b idsOfSelectEnd)
- * \param [in] srcArrIndex index array of \b srcArr
- * \param [out] arrOut the resulting array
- * \param [out] arrIndexOut the index array of the resulting array \b arrOut
- *
- * \sa MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays
- */
-void MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSlice(int start, int end, int step, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                               const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
-                                               DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut)
-{
-  if(arrIn==0 || arrIndxIn==0 || srcArr==0 || srcArrIndex==0)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSlice : presence of null pointer in input parameter !");
-  MCAuto<DataArrayInt> arro=DataArrayInt::New();
-  MCAuto<DataArrayInt> arrIo=DataArrayInt::New();
-  int nbOfTuples=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
-  int offset=0;
-  const int *arrIndxInPtr=arrIndxIn->begin();
-  const int *srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
-  int nbOfElemsToSet=DataArray::GetNumberOfItemGivenBESRelative(start,end,step,"MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSlice : ");
-  int it=start;
-  for(int i=0;i<nbOfElemsToSet;i++,srcArrIndexPtr++,it+=step)
-    {
-      if(it>=0 && it<nbOfTuples)
-        offset+=(srcArrIndexPtr[1]-srcArrIndexPtr[0])-(arrIndxInPtr[it+1]-arrIndxInPtr[it]);
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSlice : On pos #" << i << " value is " << it << " not in [0," << nbOfTuples << ") !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-  srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
-  arrIo->alloc(nbOfTuples+1,1);
-  arro->alloc(arrIn->getNumberOfTuples()+offset,1);
-  const int *arrInPtr=arrIn->begin();
-  const int *srcArrPtr=srcArr->begin();
-  int *arrIoPtr=arrIo->getPointer(); *arrIoPtr++=0;
-  int *arroPtr=arro->getPointer();
-  for(int ii=0;ii<nbOfTuples;ii++,arrIoPtr++)
-    {
-      int pos=DataArray::GetPosOfItemGivenBESRelativeNoThrow(ii,start,end,step);
-      if(pos<0)
-        {
-          arroPtr=std::copy(arrInPtr+arrIndxInPtr[ii],arrInPtr+arrIndxInPtr[ii+1],arroPtr);
-          *arrIoPtr=arrIoPtr[-1]+(arrIndxInPtr[ii+1]-arrIndxInPtr[ii]);
-        }
-      else
-        {
-          arroPtr=std::copy(srcArrPtr+srcArrIndexPtr[pos],srcArrPtr+srcArrIndexPtr[pos+1],arroPtr);
-          *arrIoPtr=arrIoPtr[-1]+(srcArrIndexPtr[pos+1]-srcArrIndexPtr[pos]);
-        }
-    }
-  arrOut=arro.retn();
-  arrIndexOut=arrIo.retn();
-}
-
-/*!
- * This method works on an input pair (\b arrIn, \b arrIndxIn) where \b arrIn indexes is in \b arrIndxIn.
- * This method is an specialization of MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays in the case of assignment do not modify the index in \b arrIndxIn.
- *
- * \param [in] start begin of set of ids of the input extraction (included)
- * \param [in] end end of set of ids of the input extraction (excluded)
- * \param [in] step step of the set of ids in range mode.
- * \param [in,out] arrInOut arr origin array from which the extraction will be done.
- * \param [in] arrIndxIn is the input index array allowing to walk into \b arrIn
- * \param [in] srcArr input array that will be used as source of copy for ids in [\b idsOfSelectBg, \b idsOfSelectEnd)
- * \param [in] srcArrIndex index array of \b srcArr
- *
- * \sa MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSlice MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx
- */
-void MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice(int start, int end, int step, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                      const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex)
-{
-  if(arrInOut==0 || arrIndxIn==0 || srcArr==0 || srcArrIndex==0)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice : presence of null pointer in input parameter !");
-  int nbOfTuples=arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1;
-  const int *arrIndxInPtr=arrIndxIn->begin();
-  const int *srcArrIndexPtr=srcArrIndex->begin();
-  int *arrInOutPtr=arrInOut->getPointer();
-  const int *srcArrPtr=srcArr->begin();
-  int nbOfElemsToSet=DataArray::GetNumberOfItemGivenBESRelative(start,end,step,"MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice : ");
-  int it=start;
-  for(int i=0;i<nbOfElemsToSet;i++,srcArrIndexPtr++,it+=step)
-    {
-      if(it>=0 && it<nbOfTuples)
-        {
-          if(srcArrIndexPtr[1]-srcArrIndexPtr[0]==arrIndxInPtr[it+1]-arrIndxInPtr[it])
-            std::copy(srcArrPtr+srcArrIndexPtr[0],srcArrPtr+srcArrIndexPtr[1],arrInOutPtr+arrIndxInPtr[it]);
-          else
-            {
-              std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice : On pos #" << i << " id (idsOfSelectBg[" << i << "]) is " << it << " arrIndxIn[id+1]-arrIndxIn[id]!=srcArrIndex[pos+1]-srcArrIndex[pos] !";
-              throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-            }
-        }
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice : On pos #" << i << " value is " << it << " not in [0," << nbOfTuples << ") !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-}
 
 /*!
  * \b this is expected to be a mesh fully defined whose spaceDim==meshDim.
index 358d6c8e34b4b3fe24249085076313c9933a14d6..25fb72c8d6eb2939a8062e1bf70b06cfc8f3023d 100644 (file)
@@ -266,21 +266,6 @@ namespace MEDCoupling
     MEDCOUPLING_EXPORT static void Intersect2DMeshWith1DLine(const MEDCouplingUMesh *mesh2D, const MEDCouplingUMesh *mesh1D,
                                                              double eps, MEDCouplingUMesh *&splitMesh2D, MEDCouplingUMesh *&splitMesh1D, DataArrayInt *&cellIdInMesh2D, DataArrayInt *&cellIdInMesh1D);
     MEDCOUPLING_EXPORT static bool BuildConvexEnvelopOf2DCellJarvis(const double *coords, const int *nodalConnBg, const int *nodalConnEnd, DataArrayInt *nodalConnecOut);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static bool RemoveIdsFromIndexedArrays(const int *idsToRemoveBg, const int *idsToRemoveEnd, DataArrayInt *arr, DataArrayInt *arrIndx, int offsetForRemoval=0);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static void ExtractFromIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                            DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static void ExtractFromIndexedArraysSlice(int idsOfSelectStart, int idsOfSelectStop, int idsOfSelectStep, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                             DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                          const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
-                                                          DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArraysSameIdx(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                                 const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArraysSlice(int start, int end, int step, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                           const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
-                                                           DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice(int start, int end, int step, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                                  const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex);
     MEDCOUPLING_EXPORT static std::vector<DataArrayInt *> PartitionBySpreadZone(const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn);
     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *ComputeSpreadZoneGradually(const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn);
     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *ComputeSpreadZoneGraduallyFromSeed(const int *seedBg, const int *seedEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn, int nbOfDepthPeeling, int& nbOfDepthPeelingPerformed);
index aa20071e1645cedc2302f0ea01a0f015fe1f71e5..d8092f37f67019ebe1ca691be996a1f45bb30892 100644 (file)
@@ -1810,7 +1810,7 @@ void MEDCouplingUMesh::Intersect2DMeshWith1DLine(const MEDCouplingUMesh *mesh2D,
   if(!idsInDesc2DToBeRefined->empty())
     {
       DataArrayInt *out0(0),*outi0(0);
-      MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays(idsInDesc2DToBeRefined->begin(),idsInDesc2DToBeRefined->end(),dd3,dd4,out0,outi0);
+      DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays(idsInDesc2DToBeRefined->begin(),idsInDesc2DToBeRefined->end(),dd3,dd4,out0,outi0);
       MCAuto<DataArrayInt> outi0s(outi0);
       out0s=out0;
       out0s=out0s->buildUnique();
@@ -2047,7 +2047,7 @@ DataArrayInt *MEDCouplingUMesh::conformize2D(double eps)
   //
   MCAuto<DataArrayInt> mSafe,nSafe,oSafe,pSafe,qSafe,rSafe;
   DataArrayInt *m(0),*n(0),*o(0),*p(0),*q(0),*r(0);
-  MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays(ret->begin(),ret->end(),desc1,descIndx1,m,n); mSafe=m; nSafe=n;
+  DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays(ret->begin(),ret->end(),desc1,descIndx1,m,n); mSafe=m; nSafe=n;
   DataArrayInt::PutIntoToSkylineFrmt(intersectEdge,o,p); oSafe=o; pSafe=p;
   if(middleNeedsToBeUsed)
     { DataArrayInt::PutIntoToSkylineFrmt(middle,q,r); qSafe=q; rSafe=r; }
index 0a922f24da4dd5084ae6f90ef5d8a3532226922f..dbb54a78aae88b770323a0b252ddaa6032a556ca 100644 (file)
@@ -841,7 +841,7 @@ class MEDCouplingBasicsTest5(unittest.TestCase):
         self.assertEqual(a1[3:].front(),11)
         self.assertEqual(a1[4:].convertToDblArr().front(),14.)
         a1c=DataArrayInt([5,7,1,2, 8,11,0, 5,6,3,12, 1,5,2, 13,12,11,7, 6,1,0, 20,21,19,17])
-        d,e=MEDCouplingUMesh.ExtractFromIndexedArraysSlice(1,5,2,a1c,a1)
+        d,e=DataArrayInt.ExtractFromIndexedArraysSlice(1,5,2,a1c,a1)
         self.assertTrue(d.isEqual(DataArrayInt([8,11,0,1,5,2])))
         self.assertTrue(e.isEqual(DataArrayInt([0,3,6])))
         #
@@ -2012,14 +2012,14 @@ class MEDCouplingBasicsTest5(unittest.TestCase):
         # Just to get a nice coords array ...
         mm = MEDCouplingCMesh(); arr = DataArrayDouble([0.0, 1.0,2.0])
         mm.setCoords(arr, arr);  mm = mm.buildUnstructured();   coo = mm.getCoords()
-         
+
         mesh = MEDCouplingUMesh("M", 2)
         mesh.setCoords(coo)
         c = [NORM_POLYGON, 0,1,4,7,6,3,  NORM_QUAD4, 1,2,5,4,  NORM_QUAD4,4,5,8,7]
         cI = [0, 7,12,17]
         mm.setConnectivity(DataArrayInt(c),DataArrayInt(cI))
         mm.checkConsistencyLight()
-        
+
         mm.colinearizeKeepingConform2D(eps)
         c = mm.getNodalConnectivity().getValues()
         cI = mm.getNodalConnectivityIndex().getValues()
@@ -3862,17 +3862,17 @@ class MEDCouplingBasicsTest5(unittest.TestCase):
         arrI=DataArrayInt([0,3,7,8,8,13,15])
         # case where all elts in inputs are in
         arr2=arr.deepCopy() ; arrI2=arrI.deepCopy()
-        self.assertTrue(MEDCouplingUMesh.RemoveIdsFromIndexedArrays([501,502],arr2,arrI2))
+        self.assertTrue(DataArrayInt.RemoveIdsFromIndexedArrays([501,502],arr2,arrI2))
         self.assertTrue(arr2.isEqual(DataArrayInt([101,102,103,201,202,203,204,301,503,504,505,601,602])))
         self.assertTrue(arrI2.isEqual(DataArrayInt([0,3,7,8,8,11,13])))
         # case where part of elts in inputs are in
         arr2=arr.deepCopy() ; arrI2=arrI.deepCopy()
-        self.assertTrue(MEDCouplingUMesh.RemoveIdsFromIndexedArrays([504,507],arr2,arrI2))
+        self.assertTrue(DataArrayInt.RemoveIdsFromIndexedArrays([504,507],arr2,arrI2))
         self.assertTrue(arr2.isEqual(DataArrayInt([101,102,103,201,202,203,204,301,501,502,503,505,601,602])))
         self.assertTrue(arrI2.isEqual(DataArrayInt([0,3,7,8,8,12,14])))
         # case where no elts in inputs are in
         arr2=arr.deepCopy() ; arrI2=arrI.deepCopy()
-        self.assertTrue(not MEDCouplingUMesh.RemoveIdsFromIndexedArrays([1,5,701],arr2,arrI2))
+        self.assertTrue(not DataArrayInt.RemoveIdsFromIndexedArrays([1,5,701],arr2,arrI2))
         self.assertTrue(arr2.isEqual(arr))
         self.assertTrue(arrI2.isEqual(arrI))
         pass
index 8cd2b6c18b0b7f431f64f43e1b186901daac9b1d..6d423abc860f9ba8b6e7168cd5f3ce2460aa67e2 100644 (file)
@@ -2481,167 +2481,6 @@ namespace MEDCoupling
         MEDCouplingUMesh::MergeNodesOnUMeshesSharingSameCoords(meshes,eps);
       }
 
-      static bool RemoveIdsFromIndexedArrays(PyObject *li, DataArrayInt *arr, DataArrayInt *arrIndx, int offsetForRemoval=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
-      {
-        int sw;
-        int singleVal;
-        std::vector<int> multiVal;
-        std::pair<int, std::pair<int,int> > slic;
-        MEDCoupling::DataArrayInt *daIntTyypp=0;
-        if(!arrIndx)
-          throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays : null pointer as arrIndex !");
-        convertIntStarOrSliceLikePyObjToCpp(li,arrIndx->getNumberOfTuples()-1,sw,singleVal,multiVal,slic,daIntTyypp);
-        switch(sw)
-          {
-          case 1:
-            return MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays(&singleVal,&singleVal+1,arr,arrIndx,offsetForRemoval);
-          case 2:
-            return MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays(&multiVal[0],&multiVal[0]+multiVal.size(),arr,arrIndx,offsetForRemoval);
-          case 4:
-            return MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays(daIntTyypp->begin(),daIntTyypp->end(),arr,arrIndx,offsetForRemoval);
-          default:
-            throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays : unrecognized type entered, expected list of int, tuple of int or DataArrayInt !");
-          }
-      }
-      
-      static PyObject *ExtractFromIndexedArrays(PyObject *li, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
-      {
-        DataArrayInt *arrOut=0,*arrIndexOut=0;
-        int sw;
-        int singleVal;
-        std::vector<int> multiVal;
-        std::pair<int, std::pair<int,int> > slic;
-        MEDCoupling::DataArrayInt *daIntTyypp=0;
-        if(!arrIndxIn)
-          throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays : null pointer as arrIndxIn !");
-        convertIntStarOrSliceLikePyObjToCpp(li,arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1,sw,singleVal,multiVal,slic,daIntTyypp);
-        switch(sw)
-          {
-          case 1:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays(&singleVal,&singleVal+1,arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
-              break;
-            }
-          case 2:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays(&multiVal[0],&multiVal[0]+multiVal.size(),arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
-              break;
-            }
-          case 4:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays(daIntTyypp->begin(),daIntTyypp->end(),arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
-              break;
-            }
-          default:
-            throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArrays : unrecognized type entered, expected list of int, tuple of int or DataArrayInt !");
-          }
-        PyObject *ret=PyTuple_New(2);
-        PyTuple_SetItem(ret,0,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
-        PyTuple_SetItem(ret,1,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrIndexOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
-        return ret;
-      }
-
-      static PyObject *ExtractFromIndexedArraysSlice(int strt, int stp, int step, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
-      {
-        DataArrayInt *arrOut=0,*arrIndexOut=0;
-        MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice(strt,stp,step,arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
-        PyObject *ret=PyTuple_New(2);
-        PyTuple_SetItem(ret,0,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
-        PyTuple_SetItem(ret,1,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrIndexOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
-        return ret;
-      }
-
-      static PyObject *ExtractFromIndexedArraysSlice(PyObject *slic, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
-      {
-        if(!PySlice_Check(slic))
-          throw INTERP_KERNEL::Exception("ExtractFromIndexedArraysSlice (wrap) : the first param is not a pyslice !");
-        Py_ssize_t strt=2,stp=2,step=2;
-        if(!arrIndxIn)
-          throw INTERP_KERNEL::Exception("ExtractFromIndexedArraysSlice (wrap) : last array is null !");
-        arrIndxIn->checkAllocated();
-        if(arrIndxIn->getNumberOfComponents()!=1)
-          throw INTERP_KERNEL::Exception("ExtractFromIndexedArraysSlice (wrap) : number of components of last argument must be equal to one !");
-        GetIndicesOfSlice(slic,arrIndxIn->getNumberOfTuples(),&strt,&stp,&step,"ExtractFromIndexedArraysSlice (wrap) : Invalid slice regarding nb of elements !");
-        DataArrayInt *arrOut=0,*arrIndexOut=0;
-        MEDCouplingUMesh::ExtractFromIndexedArraysSlice(strt,stp,step,arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
-        PyObject *ret=PyTuple_New(2);
-        PyTuple_SetItem(ret,0,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
-        PyTuple_SetItem(ret,1,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrIndexOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
-        return ret;
-      }
-
-      static PyObject *SetPartOfIndexedArrays(PyObject *li,
-                                              const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                              const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
-      {
-        DataArrayInt *arrOut=0,*arrIndexOut=0;
-        int sw;
-        int singleVal;
-        std::vector<int> multiVal;
-        std::pair<int, std::pair<int,int> > slic;
-        MEDCoupling::DataArrayInt *daIntTyypp=0;
-        if(!arrIndxIn)
-          throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays : null pointer as arrIndex !");
-        convertIntStarOrSliceLikePyObjToCpp(li,arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1,sw,singleVal,multiVal,slic,daIntTyypp);
-        switch(sw)
-          {
-          case 1:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays(&singleVal,&singleVal+1,arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex,arrOut,arrIndexOut);
-              break;
-            }
-          case 2:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays(&multiVal[0],&multiVal[0]+multiVal.size(),arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex,arrOut,arrIndexOut);
-              break;
-            }
-          case 4:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays(daIntTyypp->begin(),daIntTyypp->end(),arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex,arrOut,arrIndexOut);
-              break;
-            }
-          default:
-            throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArrays : unrecognized type entered, expected list of int, tuple of int or DataArrayInt !");
-          }
-        PyObject *ret=PyTuple_New(2);
-        PyTuple_SetItem(ret,0,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
-        PyTuple_SetItem(ret,1,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrIndexOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
-        return ret;
-      }
-
-      static void SetPartOfIndexedArraysSameIdx(PyObject *li, DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
-                                                const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
-      {
-        int sw;
-        int singleVal;
-        std::vector<int> multiVal;
-        std::pair<int, std::pair<int,int> > slic;
-        MEDCoupling::DataArrayInt *daIntTyypp=0;
-        if(!arrIndxIn)
-          throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : null pointer as arrIndex !");
-        convertIntStarOrSliceLikePyObjToCpp(li,arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1,sw,singleVal,multiVal,slic,daIntTyypp);
-        switch(sw)
-          {
-          case 1:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(&singleVal,&singleVal+1,arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex);
-              break;
-            }
-          case 2:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(&multiVal[0],&multiVal[0]+multiVal.size(),arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex);
-              break;
-            }
-          case 4:
-            {
-              MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(daIntTyypp->begin(),daIntTyypp->end(),arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex);
-              break;
-            }
-          default:
-            throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : unrecognized type entered, expected list of int, tuple of int or DataArrayInt !");
-          }
-      }
-
       PyObject *are2DCellsNotCorrectlyOriented(PyObject *vec, bool polyOnly) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
       {
         double val;
index 7bc107464dc3967dfcec647000d8449bfff904b1..5793efc328d10014616a9ab69afd29ff9f7c9c98 100644 (file)
@@ -4321,7 +4321,169 @@ namespace MEDCoupling
         PyTuple_SetItem(pyRet,1,ret1Py);
         return pyRet;
       }
-    }
+
+      static bool RemoveIdsFromIndexedArrays(PyObject *li, DataArrayInt *arr, DataArrayInt *arrIndx, int offsetForRemoval=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+      {
+        int sw;
+        int singleVal;
+        std::vector<int> multiVal;
+        std::pair<int, std::pair<int,int> > slic;
+        MEDCoupling::DataArrayInt *daIntTyypp=0;
+        if(!arrIndx)
+          throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::RemoveIdsFromIndexedArrays : null pointer as arrIndex !");
+        convertIntStarOrSliceLikePyObjToCpp(li,arrIndx->getNumberOfTuples()-1,sw,singleVal,multiVal,slic,daIntTyypp);
+        switch(sw)
+          {
+          case 1:
+            return DataArrayInt::RemoveIdsFromIndexedArrays(&singleVal,&singleVal+1,arr,arrIndx,offsetForRemoval);
+          case 2:
+            return DataArrayInt::RemoveIdsFromIndexedArrays(&multiVal[0],&multiVal[0]+multiVal.size(),arr,arrIndx,offsetForRemoval);
+          case 4:
+            return DataArrayInt::RemoveIdsFromIndexedArrays(daIntTyypp->begin(),daIntTyypp->end(),arr,arrIndx,offsetForRemoval);
+          default:
+            throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::RemoveIdsFromIndexedArrays : unrecognized type entered, expected list of int, tuple of int or DataArrayInt !");
+          }
+      }
+
+      static PyObject *ExtractFromIndexedArrays(PyObject *li, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+      {
+        DataArrayInt *arrOut=0,*arrIndexOut=0;
+        int sw;
+        int singleVal;
+        std::vector<int> multiVal;
+        std::pair<int, std::pair<int,int> > slic;
+        MEDCoupling::DataArrayInt *daIntTyypp=0;
+        if(!arrIndxIn)
+          throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays : null pointer as arrIndxIn !");
+        convertIntStarOrSliceLikePyObjToCpp(li,arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1,sw,singleVal,multiVal,slic,daIntTyypp);
+        switch(sw)
+          {
+          case 1:
+            {
+              DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays(&singleVal,&singleVal+1,arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
+              break;
+            }
+          case 2:
+            {
+              DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays(&multiVal[0],&multiVal[0]+multiVal.size(),arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
+              break;
+            }
+          case 4:
+            {
+              DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays(daIntTyypp->begin(),daIntTyypp->end(),arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
+              break;
+            }
+          default:
+            throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::ExtractFromIndexedArrays : unrecognized type entered, expected list of int, tuple of int or DataArrayInt !");
+          }
+        PyObject *ret=PyTuple_New(2);
+        PyTuple_SetItem(ret,0,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
+        PyTuple_SetItem(ret,1,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrIndexOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
+        return ret;
+      }
+
+      static PyObject *ExtractFromIndexedArraysSlice(int strt, int stp, int step, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+      {
+        DataArrayInt *arrOut=0,*arrIndexOut=0;
+        DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice(strt,stp,step,arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
+        PyObject *ret=PyTuple_New(2);
+        PyTuple_SetItem(ret,0,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
+        PyTuple_SetItem(ret,1,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrIndexOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
+        return ret;
+      }
+
+      static PyObject *ExtractFromIndexedArraysSlice(PyObject *slic, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+      {
+        if(!PySlice_Check(slic))
+          throw INTERP_KERNEL::Exception("ExtractFromIndexedArraysSlice (wrap) : the first param is not a pyslice !");
+        Py_ssize_t strt=2,stp=2,step=2;
+        if(!arrIndxIn)
+          throw INTERP_KERNEL::Exception("ExtractFromIndexedArraysSlice (wrap) : last array is null !");
+        arrIndxIn->checkAllocated();
+        if(arrIndxIn->getNumberOfComponents()!=1)
+          throw INTERP_KERNEL::Exception("ExtractFromIndexedArraysSlice (wrap) : number of components of last argument must be equal to one !");
+        GetIndicesOfSlice(slic,arrIndxIn->getNumberOfTuples(),&strt,&stp,&step,"ExtractFromIndexedArraysSlice (wrap) : Invalid slice regarding nb of elements !");
+        DataArrayInt *arrOut=0,*arrIndexOut=0;
+        DataArrayInt::ExtractFromIndexedArraysSlice(strt,stp,step,arrIn,arrIndxIn,arrOut,arrIndexOut);
+        PyObject *ret=PyTuple_New(2);
+        PyTuple_SetItem(ret,0,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
+        PyTuple_SetItem(ret,1,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrIndexOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
+        return ret;
+      }
+
+      static PyObject *SetPartOfIndexedArrays(PyObject *li,
+                                              const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                              const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+      {
+        DataArrayInt *arrOut=0,*arrIndexOut=0;
+        int sw;
+        int singleVal;
+        std::vector<int> multiVal;
+        std::pair<int, std::pair<int,int> > slic;
+        MEDCoupling::DataArrayInt *daIntTyypp=0;
+        if(!arrIndxIn)
+          throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays : null pointer as arrIndex !");
+        convertIntStarOrSliceLikePyObjToCpp(li,arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1,sw,singleVal,multiVal,slic,daIntTyypp);
+        switch(sw)
+          {
+          case 1:
+            {
+              DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays(&singleVal,&singleVal+1,arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex,arrOut,arrIndexOut);
+              break;
+            }
+          case 2:
+            {
+              DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays(&multiVal[0],&multiVal[0]+multiVal.size(),arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex,arrOut,arrIndexOut);
+              break;
+            }
+          case 4:
+            {
+              DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays(daIntTyypp->begin(),daIntTyypp->end(),arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex,arrOut,arrIndexOut);
+              break;
+            }
+          default:
+            throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::SetPartOfIndexedArrays : unrecognized type entered, expected list of int, tuple of int or DataArrayInt !");
+          }
+        PyObject *ret=PyTuple_New(2);
+        PyTuple_SetItem(ret,0,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
+        PyTuple_SetItem(ret,1,SWIG_NewPointerObj(SWIG_as_voidptr(arrIndexOut),SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt, SWIG_POINTER_OWN | 0 ));
+        return ret;
+      }
+
+      static void SetPartOfIndexedArraysSameIdx(PyObject *li, DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
+                                                const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+      {
+        int sw;
+        int singleVal;
+        std::vector<int> multiVal;
+        std::pair<int, std::pair<int,int> > slic;
+        MEDCoupling::DataArrayInt *daIntTyypp=0;
+        if(!arrIndxIn)
+          throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : null pointer as arrIndex !");
+        convertIntStarOrSliceLikePyObjToCpp(li,arrIndxIn->getNumberOfTuples()-1,sw,singleVal,multiVal,slic,daIntTyypp);
+        switch(sw)
+          {
+          case 1:
+            {
+              DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(&singleVal,&singleVal+1,arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex);
+              break;
+            }
+          case 2:
+            {
+              DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(&multiVal[0],&multiVal[0]+multiVal.size(),arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex);
+              break;
+            }
+          case 4:
+            {
+              DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx(daIntTyypp->begin(),daIntTyypp->end(),arrIn,arrIndxIn,srcArr,srcArrIndex);
+              break;
+            }
+          default:
+            throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::SetPartOfIndexedArraysSameIdx : unrecognized type entered, expected list of int, tuple of int or DataArrayInt !");
+          }
+      }
+
+    } // end extent
   };
 
   class DataArrayIntTuple;