]> SALOME platform Git repositories - plugins/netgenplugin.git/commitdiff
Salome HOME
partial work for netgen2d in run_mesher + corrections for netgen3d nodeVec + restorin...
authorYoann Audouin <yoann.audouin@edf.fr>
Fri, 9 Sep 2022 07:50:30 +0000 (09:50 +0200)
committerYoann Audouin <yoann.audouin@edf.fr>
Wed, 28 Sep 2022 06:17:27 +0000 (08:17 +0200)
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Mesher.cxx
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_Mesher.hxx
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY.cxx
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY.hxx
src/NETGENPlugin/NETGENPlugin_NETGEN_3D.cxx
src/NETGENPlugin/netgen_mesher.cxx
src/NETGENPlugin/netgen_mesher.hxx
src/NETGENPlugin/netgen_param.cxx
src/NETGENPlugin/netgen_param.hxx
src/NETGENPlugin/run_mesher.cxx

index d1c6cccd8c6fe80bd28bee69708120272b4d200f..56c8e1b94bb3f62b2ee84ec976c0861781d50705 100644 (file)
@@ -576,8 +576,9 @@ void NETGENPlugin_Mesher::SetSelfPointer( NETGENPlugin_Mesher ** ptr )
  */
 //================================================================================
 
-void NETGENPlugin_Mesher::SetDefaultParameters(netgen::MeshingParameters &mparams)
+void NETGENPlugin_Mesher::SetDefaultParameters()
 {
+  netgen::MeshingParameters& mparams = netgen::mparam;
   mparams = netgen::MeshingParameters();
   // maximal mesh edge size
   mparams.maxh            = 0;//NETGENPlugin_Hypothesis::GetDefaultMaxSize();
@@ -618,15 +619,9 @@ void NETGENPlugin_Mesher::SetDefaultParameters(netgen::MeshingParameters &mparam
  */
 //================================================================================
 
-void NETGENPlugin_Mesher::SetDefaultParameters()
+void NETGENPlugin_Mesher::SetParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp)
 {
   netgen::MeshingParameters& mparams = netgen::mparam;
-  SetDefaultParameters(mparams);
-
-}
-
-void NETGENPlugin_Mesher::SetParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp, netgen::MeshingParameters &mparams)
-{
   // Initialize global NETGEN parameters:
   // maximal mesh segment size
   mparams.maxh               = hyp->GetMaxSize();
@@ -691,22 +686,6 @@ void NETGENPlugin_Mesher::SetParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp, netg
 #endif
 }
 
-//=============================================================================
-/*!
- * Pass parameters to NETGEN
- */
-//=============================================================================
-void NETGENPlugin_Mesher::SetParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp)
-{
-  if (hyp)
-  {
-    netgen::MeshingParameters& mparams = netgen::mparam;
-    SetParameters(hyp, mparams);
-  }
-
-
-}
-
 //=============================================================================
 /*!
  * Pass simple parameters to NETGEN
@@ -4519,8 +4498,7 @@ void NETGENPlugin_NetgenLibWrapper::setMesh( Ng_Mesh* mesh )
 
 int NETGENPlugin_NetgenLibWrapper::GenerateMesh( netgen::OCCGeometry& occgeo,
                                                  int startWith, int endWith,
-                                                 netgen::Mesh* & ngMesh ,
-                                                 netgen::MeshingParameters& mparam)
+                                                 netgen::Mesh* & ngMesh)
 {
   int err = 0;
   if ( !ngMesh )
@@ -4530,15 +4508,15 @@ int NETGENPlugin_NetgenLibWrapper::GenerateMesh( netgen::OCCGeometry& occgeo,
 
   ngMesh->SetGeometry( shared_ptr<netgen::NetgenGeometry>( &occgeo, &NOOP_Deleter ));
 
-  mparam.perfstepsstart = startWith;
-  mparam.perfstepsend   = endWith;
+  netgen::mparam.perfstepsstart = startWith;
+  netgen::mparam.perfstepsend   = endWith;
   std::shared_ptr<netgen::Mesh> meshPtr( ngMesh, &NOOP_Deleter );
-  err = occgeo.GenerateMesh( meshPtr, mparam );
+  err = occgeo.GenerateMesh( meshPtr, netgen::mparam );
 
 #else
   #ifdef NETGEN_V5
 
-  err = netgen::OCCGenerateMesh(occgeo, ngMesh, mparam, startWith, endWith);
+  err = netgen::OCCGenerateMesh(occgeo, ngMesh, netgen::mparam, startWith, endWith);
 
   #else
 
index af7d9716651f256757bd8059d5b03648032eec7d..6d06f8147d0cf3ac8a8c554ff4dc24142e7f28d8 100644 (file)
@@ -58,8 +58,6 @@ class TopoDS_Shape;
 namespace netgen {
   class OCCGeometry;
   class Mesh;
-  class MeshingParameters;
-  extern MeshingParameters mparam;
 }
 //=============================================================================
 /*!
@@ -97,16 +95,12 @@ struct NETGENPLUGIN_EXPORT NETGENPlugin_NetgenLibWrapper
 
 
   static int GenerateMesh(netgen::OCCGeometry& occgeo, int startWith, int endWith,
-                          netgen::Mesh* & ngMesh, netgen::MeshingParameters & mparam);
+                          netgen::Mesh* & ngMesh);
   int GenerateMesh(netgen::OCCGeometry& occgeo, int startWith, int endWith )
   {
-
-    return GenerateMesh( occgeo, startWith, endWith, _ngMesh, netgen::mparam );
+    return GenerateMesh( occgeo, startWith, endWith, _ngMesh );
   }
-  static int GenerateMesh(netgen::OCCGeometry& occgeo, int startWith, int endWith,
-                          netgen::Mesh* & ngMesh){
-                            return GenerateMesh(occgeo, startWith, endWith, ngMesh, netgen::mparam);
-                          };
+
   static void CalcLocalH( netgen::Mesh * ngMesh );
 
   static void RemoveTmpFiles();
@@ -139,7 +133,6 @@ class NETGENPLUGIN_EXPORT NETGENPlugin_Mesher
   void SetSelfPointer( NETGENPlugin_Mesher ** ptr );
 
   void SetParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis*          hyp);
-  void SetParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis*          hyp, netgen::MeshingParameters &mparams);
   void SetParameters(const NETGENPlugin_SimpleHypothesis_2D* hyp);
   void SetParameters(const StdMeshers_ViscousLayers*         hyp );
   void SetViscousLayers2DAssigned(bool isAssigned) { _isViscousLayers2D = isAssigned; }
@@ -211,7 +204,6 @@ class NETGENPLUGIN_EXPORT NETGENPlugin_Mesher
                       const bool                            overrideMinH=true);
 
   void SetDefaultParameters();
-  void SetDefaultParameters(netgen::MeshingParameters &mparams);
 
   static SMESH_ComputeErrorPtr ReadErrors(const std::vector< const SMDS_MeshNode* >& nodeVec);
 
index 7b08a3d29095b27c769b1f0e631c041560bb3d2e..72a2e6c56345c74e8bcfe4b0b091bca1ae411a0a 100644 (file)
@@ -26,6 +26,7 @@
 #include "NETGENPlugin_Mesher.hxx"
 #include "NETGENPlugin_Hypothesis_2D.hxx"
 #include "NETGENPlugin_Provider.hxx"
+#include "netgen_param.hxx"
 
 #include <SMDS_MeshElement.hxx>
 #include <SMDS_MeshNode.hxx>
@@ -40,6 +41,9 @@
 #include <StdMeshers_MaxElementArea.hxx>
 #include <StdMeshers_QuadranglePreference.hxx>
 #include <StdMeshers_ViscousLayers2D.hxx>
+#include "DriverStep.hxx"
+#include "DriverMesh.hxx"
+
 
 #include <Precision.hxx>
 #include <Standard_ErrorHandler.hxx>
@@ -51,6 +55,9 @@
 #include <vector>
 #include <limits>
 
+#include <cstdlib>
+#include <boost/filesystem.hpp>
+namespace fs = boost::filesystem;
 /*
   Netgen include files
 */
@@ -65,7 +72,7 @@ namespace nglib {
 //#include <meshtype.hpp>
 namespace netgen {
   NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
-  // extern MeshingParameters mparam;
+  extern MeshingParameters mparam;
 #ifdef NETGEN_V5
   extern void OCCSetLocalMeshSize(OCCGeometry & geom, Mesh & mesh);
 #endif
@@ -220,6 +227,223 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::CheckHypothesis (SMESH_Mesh&         aMesh,
 //   }
 // }
 
+
+// write in a binary file the orientation for each 2D element of the mesh
+void NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::exportElementOrientation(SMESH_Mesh& aMesh,
+                                                           const TopoDS_Shape& aShape,
+                                                           netgen_params& aParams,
+                                                           const std::string output_file)
+{
+  std::map<vtkIdType, bool> elemOrientation;
+
+  SMESH_ProxyMesh::Ptr proxyMesh( new SMESH_ProxyMesh( aMesh ));
+  for ( TopExp_Explorer exEd( aShape, TopAbs_EDGE ); exEd.More(); exEd.Next())
+  {
+    const TopoDS_Shape& aShapeEdge = exEd.Current();
+    const SMESHDS_SubMesh * aSubMeshDSEdge = proxyMesh->GetSubMesh( aShapeEdge );
+    if ( !aSubMeshDSEdge ) continue;
+
+    SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = aSubMeshDSEdge->GetElements();
+    while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
+    {
+      const SMDS_MeshElement* elem = iteratorElem->next();
+      elemOrientation[elem->GetID()] = aShapeEdge.Orientation() == TopAbs_INTERNAL;
+    }
+  }
+
+  std::ofstream df(output_file, ios::out|ios::binary);
+  int size=elemOrientation.size();
+
+  df.write((char*)&size, sizeof(int));
+  for(auto const& [id, orient]:elemOrientation){
+    df.write((char*)&id, sizeof(vtkIdType));
+    df.write((char*)&orient, sizeof(bool));
+  }
+  df.close();
+}
+
+void NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::FillParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp, netgen_params &aParams)
+{
+  //TODO: factorize code with the one from NETGEN3D
+  // Move in netgen_param ?
+  aParams.maxh               = hyp->GetMaxSize();
+  aParams.minh               = hyp->GetMinSize();
+  aParams.segmentsperedge    = hyp->GetNbSegPerEdge();
+  aParams.grading            = hyp->GetGrowthRate();
+  aParams.curvaturesafety    = hyp->GetNbSegPerRadius();
+  aParams.secondorder        = hyp->GetSecondOrder() ? 1 : 0;
+  aParams.quad               = hyp->GetQuadAllowed() ? 1 : 0;
+  aParams.optimize           = hyp->GetOptimize();
+  aParams.fineness           = hyp->GetFineness();
+  aParams.uselocalh          = hyp->GetSurfaceCurvature();
+  aParams.merge_solids       = hyp->GetFuseEdges();
+  aParams.chordalError       = hyp->GetChordalErrorEnabled() ? hyp->GetChordalError() : -1.;
+  aParams.optsteps2d         = aParams.optimize ? hyp->GetNbSurfOptSteps() : 0;
+  aParams.optsteps3d         = aParams.optimize ? hyp->GetNbVolOptSteps()  : 0;
+  aParams.elsizeweight       = hyp->GetElemSizeWeight();
+  aParams.opterrpow          = hyp->GetWorstElemMeasure();
+  aParams.delaunay           = hyp->GetUseDelauney();
+  aParams.checkoverlap       = hyp->GetCheckOverlapping();
+  aParams.checkchartboundary = hyp->GetCheckChartBoundary();
+#ifdef NETGEN_V6
+  // std::string
+  aParams.meshsizefilename = hyp->GetMeshSizeFile();
+#else
+  // const char*
+  aParams.meshsizefilename = hyp->GetMeshSizeFile().empty() ? 0 : hyp->GetMeshSizeFile().c_str();
+#endif
+#ifdef NETGEN_V6
+  aParams.closeedgefac = 2;
+#else
+  aParams.closeedgefac = 0;
+#endif
+  aParams.has_LengthFromEdges_hyp = _hypLengthFromEdges;
+}
+//=============================================================================
+/*!
+ *Here we are going to use the NETGEN mesher remotely
+ */
+//=============================================================================
+
+bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
+                                                const TopoDS_Shape& aShape)
+{
+    aMesh.Lock();
+  SMESH_Hypothesis::Hypothesis_Status hypStatus;
+  CheckHypothesis(aMesh, aShape, hypStatus);
+
+  // Temporary folder for run
+  fs::path tmp_folder = aMesh.tmp_folder / fs::unique_path(fs::path("Face-%%%%-%%%%"));
+  fs::create_directories(tmp_folder);
+  // Using MESH2D generated after all triangles where created.
+  fs::path mesh_file=aMesh.tmp_folder / fs::path("Mesh1D.med");
+  fs::path element_orientation_file=tmp_folder / fs::path("element_orientation.dat");
+  fs::path new_element_file=tmp_folder / fs::path("new_elements.dat");
+  fs::path tmp_mesh_file=tmp_folder / fs::path("tmp_mesh.med");
+  // TODO: Remove that file we do not use it
+  fs::path output_mesh_file=tmp_folder / fs::path("output_mesh.med");
+  fs::path shape_file=tmp_folder / fs::path("shape.step");
+  fs::path param_file=tmp_folder / fs::path("netgen2d_param.txt");
+  fs::path log_file=tmp_folder / fs::path("run_mesher.log");
+  //TODO: Handle variable mesh_name
+  std::string mesh_name = "Maillage_1";
+
+  //Writing Shape
+  export_shape(shape_file.string(), aShape);
+  //Writing hypo
+  netgen_params aParams;
+  FillParameters(_hypParameters, aParams);
+
+  export_netgen_params(param_file.string(), aParams);
+
+  // Exporting element orientation
+  exportElementOrientation(aMesh, aShape, aParams, element_orientation_file.string());
+
+  aMesh.Unlock();
+  // Calling run_mesher
+  // TODO: check if we need to handle the .exe for windows
+  std::string cmd;
+  fs::path run_mesher_exe =
+    fs::path(std::getenv("NETGENPLUGIN_ROOT_DIR"))/
+    fs::path("bin")/
+    fs::path("salome")/
+    fs::path("run_mesher");
+  cmd = run_mesher_exe.string() +
+                  " NETGEN2D " + mesh_file.string() + " "
+                               + shape_file.string() + " "
+                               + param_file.string() + " "
+                               + element_orientation_file.string() + " "
+                               + new_element_file.string() + " "
+                               + std::to_string(0) + " "
+                               + output_mesh_file.string() +
+                               " >> " + log_file.string();
+
+  std::cout << "Running command: " << std::endl;
+  std::cout << cmd << std::endl;
+
+  // Writing command in log
+  std::ofstream flog(log_file.string());
+  flog << cmd << endl;
+  flog.close();
+
+  // TODO: Replace system by something else to handle redirection for windows
+  int ret = system(cmd.c_str());
+
+  // TODO: better error handling (display log ?)
+  if(ret != 0){
+    // Run crahed
+    //throw Exception("Meshing failed");
+    std::cerr << "Issue with command: " << std::endl;
+    std::cerr << cmd << std::endl;
+    return false;
+  }
+
+    aMesh.Lock();
+  std::ifstream df(new_element_file.string(), ios::binary);
+
+  int Netgen_NbOfNodes;
+  int Netgen_NbOfNodesNew;
+  int Netgen_NbOfTria;
+  double Netgen_point[3];
+  int    Netgen_triangle[3];
+  int nodeID;
+
+  SMESH_MesherHelper helper(aMesh);
+  // This function is necessary so that SetElementOnShape works
+  int _quadraticMesh = helper.IsQuadraticSubMesh(aShape);
+  helper.SetElementsOnShape( true );
+
+  // Number of nodes in intial mesh
+  df.read((char*) &Netgen_NbOfNodes, sizeof(int));
+  // Number of nodes added by netgen
+  df.read((char*) &Netgen_NbOfNodesNew, sizeof(int));
+
+  // Filling nodevec (correspondence netgen numbering mesh numbering)
+  vector< const SMDS_MeshNode* > nodeVec ( Netgen_NbOfNodesNew + 1 );
+  for (int nodeIndex = 1 ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodes; ++nodeIndex )
+  {
+    //Id of the point
+    df.read((char*) &nodeID, sizeof(int));
+    nodeVec.at(nodeIndex) = nullptr;
+    SMDS_NodeIteratorPtr iteratorNode = aMesh.GetMeshDS()->nodesIterator();
+    while(iteratorNode->more()){
+      const SMDS_MeshNode* node = iteratorNode->next();
+      if(node->GetID() == nodeID){
+        nodeVec.at(nodeIndex) = node;
+        break;
+      }
+    }
+    if(nodeVec.at(nodeIndex) == nullptr){
+      std::cout << "Error could not identify id";
+      return false;
+    }
+  }
+
+  // Add new points and update nodeVec
+  for (int nodeIndex = Netgen_NbOfNodes +1 ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodesNew; ++nodeIndex )
+  {
+    df.read((char *) &Netgen_point, sizeof(double)*3);
+
+    nodeVec.at(nodeIndex) = helper.AddNode(Netgen_point[0],
+                                           Netgen_point[1],
+                                           Netgen_point[2]);
+  }
+
+  // Add tetrahedrons
+  df.read((char*) &Netgen_NbOfTria, sizeof(int));
+  for ( int elemIndex = 1; elemIndex <= Netgen_NbOfTria; ++elemIndex )
+  {
+    df.read((char*) &Netgen_triangle, sizeof(int)*3);
+    helper.AddFace (nodeVec.at( Netgen_triangle[0] ),
+                    nodeVec.at( Netgen_triangle[1] ),
+                    nodeVec.at( Netgen_triangle[2] ));
+  }
+  df.close();
+
+  aMesh.Unlock();
+
+  return true;
+}
 //=============================================================================
 /*!
  *Here we are going to use the NETGEN mesher
@@ -229,29 +453,23 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::CheckHypothesis (SMESH_Mesh&         aMesh,
 bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
                                           const TopoDS_Shape& aShape)
 {
-  aMesh.Lock();
-  SMESH_Hypothesis::Hypothesis_Status hypStatus;
-  this->CheckHypothesis(aMesh, aShape, hypStatus);
-  aMesh.Unlock();
 
-  netgen::MeshingParameters mparam;
-  int id_mparam = mparam_provider.take(mparam);
+  if(aMesh.IsParallel())
+    return RemoteCompute(aMesh, aShape);
 
   netgen::multithread.terminate = 0;
-  //netgen::multithread.task = "Surface meshing";
+  netgen::multithread.task = "Surface meshing";
 
   SMESHDS_Mesh* meshDS = aMesh.GetMeshDS();
   SMESH_MesherHelper helper(aMesh);
   helper.SetElementsOnShape( true );
 
-  NETGENPlugin_NetgenLibWrapper *ngLib;
-  int id_ngLib = nglib_provider.take(&ngLib);
-  ngLib->_isComputeOk = false;
+  NETGENPlugin_NetgenLibWrapper ngLib;
+  ngLib._isComputeOk = false;
 
   netgen::Mesh   ngMeshNoLocSize;
-  netgen::Mesh * ngMeshes[2] = { (netgen::Mesh*) ngLib->_ngMesh,  & ngMeshNoLocSize };
-  netgen::OCCGeometry *occgeoComm;
-  int id_occgeoComm = occgeom_provider.take(&occgeoComm);
+  netgen::Mesh * ngMeshes[2] = { (netgen::Mesh*) ngLib._ngMesh,  & ngMeshNoLocSize };
+  netgen::OCCGeometry occgeoComm;
 
   // min / max sizes are set as follows:
   // if ( _hypParameters )
@@ -265,21 +483,18 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
   // else
   //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
   //    max = max segment len of a FACE
-  aMesh.Lock();
   NETGENPlugin_Mesher aMesher( &aMesh, aShape, /*isVolume=*/false);
-  // TODO: Only valid for NETGEN2D_Only
-  aMesher.SetDefaultParameters(mparam);
-  aMesher.SetParameters( _hypParameters, mparam ); // _hypParameters -> mparam
+  aMesher.SetParameters( _hypParameters ); // _hypParameters -> netgen::mparam
   const bool toOptimize = _hypParameters ? _hypParameters->GetOptimize() : true;
   if ( _hypMaxElementArea )
   {
-    mparam.maxh = sqrt( 2. * _hypMaxElementArea->GetMaxArea() / sqrt(3.0) );
+    netgen::mparam.maxh = sqrt( 2. * _hypMaxElementArea->GetMaxArea() / sqrt(3.0) );
   }
   if ( _hypQuadranglePreference )
-    mparam.quad = true;
+    netgen::mparam.quad = true;
 
   // local size is common for all FACEs in aShape?
-  const bool isCommonLocalSize = ( !_hypLengthFromEdges && !_hypMaxElementArea && mparam.uselocalh );
+  const bool isCommonLocalSize = ( !_hypLengthFromEdges && !_hypMaxElementArea && netgen::mparam.uselocalh );
   const bool isDefaultHyp = ( !_hypLengthFromEdges && !_hypMaxElementArea && !_hypParameters );
   aMesh.Unlock();
 
@@ -287,15 +502,15 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
   if ( isCommonLocalSize ) // compute common local size in ngMeshes[0]
   {
     //list< SMESH_subMesh* > meshedSM[4]; --> all sub-shapes are added to occgeoComm
-    aMesher.PrepareOCCgeometry( *occgeoComm, aShape, aMesh );//, meshedSM );
+    aMesher.PrepareOCCgeometry( occgeoComm, aShape, aMesh );//, meshedSM );
 
     // local size set at MESHCONST_ANALYSE step depends on
     // minh, face_maxh, grading and curvaturesafety; find minh if not set by the user
-    if ( !_hypParameters || mparam.minh < DBL_MIN )
+    if ( !_hypParameters || netgen::mparam.minh < DBL_MIN )
     {
       if ( !_hypParameters )
-        mparam.maxh = occgeoComm->GetBoundingBox().Diam() / 3.;
-      mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( aShape, mparam.maxh );
+        netgen::mparam.maxh = occgeoComm.GetBoundingBox().Diam() / 3.;
+      netgen::mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( aShape, netgen::mparam.maxh );
     }
     // set local size depending on curvature and NOT closeness of EDGEs
 #ifdef NETGEN_V6
@@ -303,19 +518,19 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
 #else
     const double factor = netgen::occparam.resthcloseedgefac;
     netgen::occparam.resthcloseedgeenable = false;
-    netgen::occparam.resthcloseedgefac = 1.0 + mparam.grading;
+    netgen::occparam.resthcloseedgefac = 1.0 + netgen::mparam.grading;
 #endif
-    occgeoComm->face_maxh = mparam.maxh;
+    occgeoComm.face_maxh = netgen::mparam.maxh;
 #ifdef NETGEN_V6
     netgen::OCCParameters occparam;
-    netgen::OCCSetLocalMeshSize( *occgeoComm, *ngMeshes[0], mparam, occparam );
+    netgen::OCCSetLocalMeshSize( occgeoComm, *ngMeshes[0], netgen::mparam, occparam );
 #else
     aMesh.Lock();
-    netgen::OCCSetLocalMeshSize( *occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+    netgen::OCCSetLocalMeshSize( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
     aMesh.Unlock();
 #endif
-    occgeoComm->emap.Clear();
-    occgeoComm->vmap.Clear();
+    occgeoComm.emap.Clear();
+    occgeoComm.vmap.Clear();
 
     // set local size according to size of existing segments
     TopTools_IndexedMapOfShape edgeMap;
@@ -340,15 +555,15 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
     }
 
     // set local size defined on shapes
-    aMesher.SetLocalSize( *occgeoComm, *ngMeshes[0] );
-    aMesher.SetLocalSizeForChordalError( *occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+    aMesher.SetLocalSize( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+    aMesher.SetLocalSizeForChordalError( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
     try {
-      ngMeshes[0]->LoadLocalMeshSize( mparam.meshsizefilename );
+      ngMeshes[0]->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
     } catch (NgException & ex) {
       return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
     }
   }
-  mparam.uselocalh = toOptimize; // restore as it is used at surface optimization
+  netgen::mparam.uselocalh = toOptimize; // restore as it is used at surface optimization
   // ==================
   // Loop on all FACEs
   // ==================
@@ -414,7 +629,7 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
         }
         if ( nbSegments )
           edgeLength /= double( nbSegments );
-        mparam.maxh = edgeLength;
+        netgen::mparam.maxh = edgeLength;
       }
       else if ( isDefaultHyp )
       {
@@ -434,29 +649,28 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
           }
         }
         edgeLength = sqrt( maxSeg2 ) * 1.05;
-        mparam.maxh = edgeLength;
+        netgen::mparam.maxh = edgeLength;
       }
-      if ( mparam.maxh < DBL_MIN )
-        mparam.maxh = occgeoComm->GetBoundingBox().Diam();
+      if ( netgen::mparam.maxh < DBL_MIN )
+        netgen::mparam.maxh = occgeoComm.GetBoundingBox().Diam();
 
       if ( !isCommonLocalSize )
       {
-        mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( F, mparam.maxh );
+        netgen::mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( F, netgen::mparam.maxh );
       }
     }
 
     // prepare occgeom
-    netgen::OCCGeometry *occgeom;
-    int id_occgeom = occgeom_provider.take(&occgeom);
-    occgeom->shape = F;
-    occgeom->fmap.Add( F );
-    occgeom->CalcBoundingBox();
-    occgeom->facemeshstatus.SetSize(1);
-    occgeom->facemeshstatus = 0;
-    occgeom->face_maxh_modified.SetSize(1);
-    occgeom->face_maxh_modified = 0;
-    occgeom->face_maxh.SetSize(1);
-    occgeom->face_maxh = mparam.maxh;
+    netgen::OCCGeometry occgeom;
+    occgeom.shape = F;
+    occgeom.fmap.Add( F );
+    occgeom.CalcBoundingBox();
+    occgeom.facemeshstatus.SetSize(1);
+    occgeom.facemeshstatus = 0;
+    occgeom.face_maxh_modified.SetSize(1);
+    occgeom.face_maxh_modified = 0;
+    occgeom.face_maxh.SetSize(1);
+    occgeom.face_maxh = netgen::mparam.maxh;
 
     // -------------------------
     // Fill netgen mesh
@@ -477,28 +691,28 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
 
       if ( iLoop == NO_LOC_SIZE )
       {
-        ngMesh->SetGlobalH ( mparam.maxh );
-        ngMesh->SetMinimalH( mparam.minh );
-        Box<3> bb = occgeom->GetBoundingBox();
+        ngMesh->SetGlobalH ( netgen::mparam.maxh );
+        ngMesh->SetMinimalH( netgen::mparam.minh );
+        Box<3> bb = occgeom.GetBoundingBox();
         bb.Increase (bb.Diam()/10);
-        ngMesh->SetLocalH (bb.PMin(), bb.PMax(), mparam.grading);
-        aMesher.SetLocalSize( *occgeom, *ngMesh );
-        aMesher.SetLocalSizeForChordalError( *occgeoComm, *ngMesh );
+        ngMesh->SetLocalH (bb.PMin(), bb.PMax(), netgen::mparam.grading);
+        aMesher.SetLocalSize( occgeom, *ngMesh );
+        aMesher.SetLocalSizeForChordalError( occgeoComm, *ngMesh );
         try {
-          ngMesh->LoadLocalMeshSize( mparam.meshsizefilename );
+          ngMesh->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
         } catch (NgException & ex) {
           return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
         }
       }
 
       nodeVec.clear();
-      faceErr = aMesher.AddSegmentsToMesh( *ngMesh, *occgeom, wires, helper, nodeVec,
+      faceErr = aMesher.AddSegmentsToMesh( *ngMesh, occgeom, wires, helper, nodeVec,
                                            /*overrideMinH=*/!_hypParameters);
       if ( faceErr && !faceErr->IsOK() )
         break;
 
       //if ( !isCommonLocalSize )
-      //limitSize( ngMesh, mparam.maxh * 0.8);
+      //limitSize( ngMesh, netgen::mparam.maxh * 0.8);
 
       // -------------------------
       // Generate surface mesh
@@ -510,7 +724,7 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
       SMESH_Comment str;
       try {
         OCC_CATCH_SIGNALS;
-        err = ngLib->GenerateMesh(*occgeom, startWith, endWith, ngMesh, mparam);
+        err = ngLib.GenerateMesh(occgeom, startWith, endWith, ngMesh);
         if ( netgen::multithread.terminate )
           return false;
         if ( err )
@@ -532,12 +746,12 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
       }
       if ( err )
       {
-        if ( aMesher.FixFaceMesh( *occgeom, *ngMesh, 1 ))
+        if ( aMesher.FixFaceMesh( occgeom, *ngMesh, 1 ))
           break;
         if ( iLoop == LOC_SIZE )
         {
-          mparam.minh = mparam.maxh;
-          mparam.maxh = 0;
+          netgen::mparam.minh = netgen::mparam.maxh;
+          netgen::mparam.maxh = 0;
           for ( size_t iW = 0; iW < wires.size(); ++iW )
           {
             StdMeshers_FaceSidePtr wire = wires[ iW ];
@@ -548,13 +762,13 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
               netgen::Point3d np( p.X(),p.Y(),p.Z());
               double segLen = p.Distance( uvPtVec[ iP-1 ].node );
               double   size = ngMesh->GetH( np );
-              mparam.minh = Min( mparam.minh, size );
-              mparam.maxh = Max( mparam.maxh, segLen );
+              netgen::mparam.minh = Min( netgen::mparam.minh, size );
+             netgen:: mparam.maxh = Max( netgen::mparam.maxh, segLen );
             }
           }
           //cerr << "min " << mparam.minh << " max " << mparam.maxh << endl;
-          mparam.minh *= 0.9;
-          mparam.maxh *= 1.1;
+          netgen::mparam.minh *= 0.9;
+          netgen::mparam.maxh *= 1.1;
           continue;
         }
         else
@@ -563,10 +777,6 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
         }
       }
 
-      occgeom_provider.release(id_occgeoComm, true);
-      occgeom_provider.release(id_occgeom, true);
-      mparam_provider.release(id_mparam);
-      aMesh.Lock();
       // ----------------------------------------------------
       // Fill the SMESHDS with the generated nodes and faces
       // ----------------------------------------------------
@@ -616,9 +826,6 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
       break;
     } // two attempts
   } // loop on FACEs
-  aMesh.Unlock();
-  nglib_provider.release(id_ngLib, true);
-
 
   return true;
 }
index a5d581260b268326693546844a1b6462e8727b6d..b1361edfb4d434ed67531e4ced1a4225095cc664 100644 (file)
 #ifndef _NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY_HXX_
 #define _NETGENPlugin_NETGEN_2D_ONLY_HXX_
 
-#include "NETGENPlugin_Provider.hxx"
-
 #include <SMESH_Algo.hxx>
 #include <SMESH_Mesh.hxx>
 
 class StdMeshers_MaxElementArea;
 class StdMeshers_LengthFromEdges;
 class NETGENPlugin_Hypothesis_2D;
-class NETGENPlugin_NetgenLibWrapper;
+class NETGENPlugin_Hypothesis;
+class netgen_params;
 
 /*!
  * \brief Mesher generating 2D elements on a geometrical face taking
@@ -52,6 +51,16 @@ public:
                                const TopoDS_Shape& aShape,
                                Hypothesis_Status&  aStatus);
 
+  void exportElementOrientation(SMESH_Mesh& aMesh,
+                                const TopoDS_Shape& aShape,
+                                netgen_params& aParams,
+                                const std::string output_file);
+
+  void FillParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp,
+                      netgen_params &aParams);
+
+  virtual bool RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
+                             const TopoDS_Shape& aShape);
   virtual bool Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
                        const TopoDS_Shape& aShape);
 
@@ -69,10 +78,6 @@ protected:
   const NETGENPlugin_Hypothesis_2D*      _hypParameters;
 
   double                                 _progressByTic;
-
-  Provider<netgen::MeshingParameters, 4> mparam_provider;
-  ProviderPtr<netgen::OCCGeometry, 8> occgeom_provider;
-  ProviderPtr<NETGENPlugin_NetgenLibWrapper, 4> nglib_provider;
 };
 
 #endif
index 36ec44139402968fcd0f3fcbcf4935c263904c72..45c81713916e8ace42ba1130108a62c3afea18e1 100644 (file)
@@ -231,7 +231,7 @@ void NETGENPlugin_NETGEN_3D::FillParameters(const NETGENPlugin_Hypothesis* hyp,
 #endif
 }
 
-// wirte in a binary file the orientation for each 2D element of the mesh
+// write in a binary file the orientation for each 2D element of the mesh
 void NETGENPlugin_NETGEN_3D::exportElementOrientation(SMESH_Mesh& aMesh,
                                                       const TopoDS_Shape& aShape,
                                                       netgen_params& aParams,
@@ -294,8 +294,13 @@ int NETGENPlugin_NETGEN_3D::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
                                           const TopoDS_Shape& aShape)
 {
   aMesh.Lock();
+  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
   SMESH_Hypothesis::Hypothesis_Status hypStatus;
   CheckHypothesis(aMesh, aShape, hypStatus);
+  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
+  std::cout << "Time for check_hypo: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
 
   // Temporary folder for run
   fs::path tmp_folder = aMesh.tmp_folder / fs::unique_path(fs::path("Volume-%%%%-%%%%"));
@@ -315,14 +320,24 @@ int NETGENPlugin_NETGEN_3D::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
 
   //Writing Shape
   export_shape(shape_file.string(), aShape);
+  auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
+  std::cout << "Time for export_shape: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
   //Writing hypo
   netgen_params aParams;
   FillParameters(_hypParameters, aParams);
 
   export_netgen_params(param_file.string(), aParams);
+  auto time3 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time3-time2);
+  std::cout << "Time for fill+export param: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   // Exporting element orientation
   exportElementOrientation(aMesh, aShape, aParams, element_orientation_file.string());
+  auto time4 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time4-time3);
+  std::cout << "Time for exportElemnOrient: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   aMesh.Unlock();
   // Calling run_mesher
@@ -353,17 +368,18 @@ int NETGENPlugin_NETGEN_3D::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
 
   // TODO: Replace system by something else to handle redirection for windows
   int ret = system(cmd.c_str());
+  auto time5 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time5-time4);
+  std::cout << "Time for exec of run_mesher: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   // TODO: better error handling (display log ?)
   if(ret != 0){
     // Run crahed
-    //throw Exception("Meshing failed");
     std::cerr << "Issue with command: " << std::endl;
     std::cerr << cmd << std::endl;
     return false;
   }
 
-
   aMesh.Lock();
   std::ifstream df(new_element_file.string(), ios::binary);
 
@@ -386,47 +402,48 @@ int NETGENPlugin_NETGEN_3D::RemoteCompute(SMESH_Mesh&         aMesh,
 
   // Filling nodevec (correspondence netgen numbering mesh numbering)
   vector< const SMDS_MeshNode* > nodeVec ( Netgen_NbOfNodesNew + 1 );
+  //vector<int> nodeTmpVec ( Netgen_NbOfNodesNew + 1 );
+  SMESHDS_Mesh * meshDS = helper.GetMeshDS();
   for (int nodeIndex = 1 ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodes; ++nodeIndex )
   {
     //Id of the point
     df.read((char*) &nodeID, sizeof(int));
-    nodeVec.at(nodeIndex) = nullptr;
-    SMDS_NodeIteratorPtr iteratorNode = aMesh.GetMeshDS()->nodesIterator();
-    while(iteratorNode->more()){
-      const SMDS_MeshNode* node = iteratorNode->next();
-      if(node->GetID() == nodeID){
-        nodeVec.at(nodeIndex) = node;
-        break;
-      }
-    }
-    if(nodeVec.at(nodeIndex) == nullptr){
-      std::cout << "Error could not identify id";
-      return false;
-    }
+    nodeVec.at(nodeIndex) = meshDS->FindNode(nodeID);
   }
 
+  auto time6 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time6-time5);
+  std::cout << "Time for exec of nodeVec: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
+
   // Add new points and update nodeVec
   for (int nodeIndex = Netgen_NbOfNodes +1 ; nodeIndex <= Netgen_NbOfNodesNew; ++nodeIndex )
   {
     df.read((char *) &Netgen_point, sizeof(double)*3);
 
     nodeVec.at(nodeIndex) = helper.AddNode(Netgen_point[0],
-                                           Netgen_point[1],
-                                           Netgen_point[2]);
+                               Netgen_point[1],
+                               Netgen_point[2]);
   }
 
   // Add tetrahedrons
   df.read((char*) &Netgen_NbOfTetra, sizeof(int));
+
   for ( int elemIndex = 1; elemIndex <= Netgen_NbOfTetra; ++elemIndex )
   {
     df.read((char*) &Netgen_tetrahedron, sizeof(int)*4);
-    helper.AddVolume (nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[0] ),
-                      nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[1] ),
-                      nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[2] ),
-                      nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[3] ));
+    helper.AddVolume(
+                  nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[0] ),
+                  nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[1] ),
+                  nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[2] ),
+                  nodeVec.at( Netgen_tetrahedron[3] ));
   }
   df.close();
+  auto time7 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time7-time6);
+  std::cout << "Time for exec of add_in_mesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
+  fs::remove_all(tmp_folder);
   aMesh.Unlock();
 
   return true;
@@ -443,6 +460,7 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_3D::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
 {
   if(aMesh.IsParallel())
     return RemoteCompute(aMesh, aShape);
+  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
 
   netgen::multithread.terminate = 0;
   netgen::multithread.task = "Volume meshing";
@@ -597,6 +615,9 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_3D::Compute(SMESH_Mesh&         aMesh,
   // -------------------------
   // Generate the volume mesh
   // -------------------------
+  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
+  std::cout << "Time for seq:fill_in_ngmesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   return (ngLib._isComputeOk = compute( aMesh, helper, nodeVec, ngLib ));
 }
@@ -684,6 +705,8 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_3D::compute(SMESH_Mesh&                     aMesh,
                                      vector< const SMDS_MeshNode* >& nodeVec,
                                      NETGENPlugin_NetgenLibWrapper&  ngLib)
 {
+  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+
   netgen::multithread.terminate = 0;
 
   netgen::Mesh* ngMesh = ngLib._ngMesh;
@@ -746,6 +769,7 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_3D::compute(SMESH_Mesh&                     aMesh,
   try
   {
     OCC_CATCH_SIGNALS;
+    auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
 
     ngLib.CalcLocalH(ngMesh);
     err = ngLib.GenerateMesh(occgeo, startWith, endWith);
@@ -779,6 +803,9 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_3D::compute(SMESH_Mesh&                     aMesh,
       str << " at " << netgen::multithread.task;
     error(str);
   }
+  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
+  std::cout << "Time for seq:compute: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   int Netgen_NbOfNodesNew = Ng_GetNP(Netgen_mesh);
   int Netgen_NbOfTetra    = Ng_GetNE(Netgen_mesh);
@@ -825,6 +852,10 @@ bool NETGENPlugin_NETGEN_3D::compute(SMESH_Mesh&                     aMesh,
       }
     }
   }
+  auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
+  std::cout << "Time for seq:compute: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
 
   return !err;
 }
index 6b15fb0d79b7d6097ba4cddc53994f0cc9b30586..2969dbaed881f95c6e4ee80e383a18e0ae03d1b1 100644 (file)
 #include <vector>
 #include <filesystem>
 namespace fs = std::filesystem;
+#include <chrono>
 
 // SMESH include
 #include <SMESH_Mesh.hxx>
+#include <SMESH_subMesh.hxx>
 #include <SMESH_Gen.hxx>
 #include <SMESH_Algo.hxx>
 #include <SMESHDS_Mesh.hxx>
@@ -48,6 +50,8 @@ namespace fs = std::filesystem;
 #include <StdMeshers_MaxElementVolume.hxx>
 #include <StdMeshers_QuadToTriaAdaptor.hxx>
 #include <StdMeshers_ViscousLayers.hxx>
+#include <StdMeshers_ViscousLayers2D.hxx>
+
 
 // NETGENPlugin
 // #include <NETGENPlugin_Mesher.hxx>
@@ -72,6 +76,7 @@ namespace fs = std::filesystem;
 #define OCCGEOMETRY
 #endif
 #include <occgeom.hpp>
+#include <meshing.hpp>
 
 #ifdef NETGEN_V5
 #include <ngexception.hpp>
@@ -86,21 +91,28 @@ namespace nglib {
 namespace netgen {
 
   NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
+  extern MeshingParameters mparam;
 
   NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
   extern volatile multithreadt multithread;
 
   NETGENPLUGIN_DLL_HEADER
   extern bool merge_solids;
+
+#ifdef NETGEN_V5
+  extern void OCCSetLocalMeshSize(OCCGeometry & geom, Mesh & mesh);
+#endif
 }
 using namespace nglib;
 
-int error(int error_type, std::string msg){
+int error(int error_type, std::string msg)
+{
  std::cerr << msg << std::endl;
   return error_type;
 };
 
-int error(const SMESH_Comment& comment){
+int error(const SMESH_Comment& comment)
+{
   return error(1, "SMESH_Comment error: "+comment);
 };
 
@@ -110,12 +122,16 @@ int error(const SMESH_Comment& comment){
  * @param aParams Internal structure of parameters
  * @param mparams Netgen strcuture of parameters
  */
-void set_netgen_parameters(netgen_params& aParams){
+void set_netgen_parameters(netgen_params& aParams)
+{
 
   // Default parameters
 #ifdef NETGEN_V6
 
-  netgen::mparam.nthreads = std::thread::hardware_concurrency();
+  //netgen::mparam.nthreads = std::thread::hardware_concurrency();
+  netgen::mparam.nthreads = 2;
+  //netgen::mparam.parallel_meshing = false;
+
 
   if ( getenv( "SALOME_NETGEN_DISABLE_MULTITHREADING" ))
   {
@@ -154,7 +170,7 @@ void set_netgen_parameters(netgen_params& aParams){
 }
 
 /**
- * @brief compute mesh with netgen
+ * @brief compute mesh with netgen3d
  *
  * @param input_mesh_file Input Mesh file
  * @param shape_file Shape file
@@ -171,8 +187,9 @@ int netgen3d(const std::string input_mesh_file,
              const std::string element_orientation_file,
              const std::string new_element_file,
              bool output_mesh,
-             const std::string output_mesh_file){
-
+             const std::string output_mesh_file)
+{
+  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
   // Importing mesh
   SMESH_Gen gen;
 
@@ -181,35 +198,49 @@ int netgen3d(const std::string input_mesh_file,
   std::string mesh_name = "Maillage_1";
 
   import_mesh(input_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
+  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
+  std::cout << "Time for import_mesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   // Importing shape
   TopoDS_Shape myShape;
   import_shape(shape_file, myShape);
+  auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
+  std::cout << "Time for import_shape: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   // Importing hypothesis
-  //TODO: make it
   netgen_params myParams;
 
   import_netgen_params(hypo_file, myParams);
+  auto time3 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time3-time2);
+  std::cout << "Time for import_netgen_param: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   std::cout << "Meshing with netgen3d" << std::endl;
   int ret = netgen3d(myShape, *myMesh, myParams,
                      new_element_file, element_orientation_file,
                      output_mesh);
 
+
   if(!ret){
     std::cout << "Meshing failed" << std::endl;
     return ret;
   }
 
-  if(output_mesh)
+  if(output_mesh){
+    auto time4 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
     export_mesh(output_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
+    auto time5 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+    elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time5-time4);
+    std::cout << "Time for export_mesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+  }
 
   return ret;
 }
 
 /**
- * @brief Compute aShape within aMesh using netgen
+ * @brief Compute aShape within aMesh using netgen3d
  *
  * @param aShape the shape
  * @param aMesh the mesh
@@ -220,7 +251,10 @@ int netgen3d(const std::string input_mesh_file,
  */
 int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
              std::string new_element_file, std::string element_orientation_file,
-             bool output_mesh){
+             bool output_mesh)
+{
+
+  auto time0 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
 
   netgen::multithread.terminate = 0;
   netgen::multithread.task = "Volume meshing";
@@ -298,8 +332,6 @@ int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
 
     // Adding elements from Mesh
     SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Face);
-    int nbedge = meshDS->NbEdges();
-    int nbface = meshDS->NbFaces();
     bool isRev;
     bool isInternalFace = false;
 
@@ -309,7 +341,6 @@ int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
       {
         // check mesh face
         const SMDS_MeshElement* elem = iteratorElem->next();
-        int tmp = elem->GetShapeID();
         if ( !elem )
           return error( COMPERR_BAD_INPUT_MESH, "Null element encounters");
         if ( elem->NbCornerNodes() != 3 )
@@ -387,6 +418,9 @@ int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
     //                                               internals);
     //}
   }
+  auto time1 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time1-time0);
+  std::cout << "Time for fill_in_ngmesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   // -------------------------
   // Generate the volume mesh
@@ -454,7 +488,7 @@ int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
     OCC_CATCH_SIGNALS;
 
     ngLib.CalcLocalH(ngMesh);
-    err = ngLib.GenerateMesh(occgeo, startWith, endWith, ngMesh, netgen::mparam);
+    err = ngLib.GenerateMesh(occgeo, startWith, endWith, ngMesh);
 
     if(netgen::multithread.terminate)
       return false;
@@ -499,6 +533,9 @@ int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
     if ( ce && ce->HasBadElems() )
       return error( ce );
   }
+  auto time2 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time2-time1);
+  std::cout << "Time for netgen_compute: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
 
   bool isOK = ( /*status == NG_OK &&*/ Netgen_NbOfTetra > 0 );// get whatever built
   if ( isOK )
@@ -536,6 +573,10 @@ int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
     }
     df.close();
   }
+  auto time3 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+  elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time3-time2);
+  std::cout << "Time for write_new_elem: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
 
   // Adding new files in aMesh as well
   if ( output_mesh )
@@ -569,7 +610,517 @@ int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
       {
       }
     }
+    auto time4 = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+    elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(time4-time3);
+    std::cout << "Time for add_element_to_smesh: " << elapsed.count() * 1e-9 << std::endl;
+
   }
 
   return !err;
+}
+
+/**
+ * @brief compute mesh with netgen2d
+ *
+ * @param input_mesh_file Input Mesh file
+ * @param shape_file Shape file
+ * @param hypo_file Parameter file
+ * @param new_element_file Binary file containing new nodes and new element info
+ * @param output_mesh If true will export mesh into output_mesh_file
+ * @param output_mesh_file Output Mesh file
+ *
+ * @return error code
+ */
+int netgen2d(const std::string input_mesh_file,
+             const std::string shape_file,
+             const std::string hypo_file,
+             const std::string element_orientation_file,
+             const std::string new_element_file,
+             bool output_mesh,
+             const std::string output_mesh_file)
+{
+
+  // Importing mesh
+  SMESH_Gen gen;
+
+  SMESH_Mesh *myMesh = gen.CreateMesh(false);
+  //TODO: To define
+  std::string mesh_name = "Maillage_1";
+
+  import_mesh(input_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
+
+  // Importing shape
+  TopoDS_Shape myShape;
+  import_shape(shape_file, myShape);
+
+  // Importing hypothesis
+  netgen_params myParams;
+
+  import_netgen_params(hypo_file, myParams);
+
+  std::cout << "Meshing with netgen3d" << std::endl;
+  int ret = netgen2d(myShape, *myMesh, myParams,
+                     new_element_file, element_orientation_file,
+                     output_mesh);
+
+  if(!ret){
+    std::cout << "Meshing failed" << std::endl;
+    return ret;
+  }
+
+  if(output_mesh)
+    export_mesh(output_mesh_file, *myMesh, mesh_name);
+
+  return ret;
+}
+
+/**
+ * @brief Compute aShape within aMesh using netgen2d
+ *
+ * @param aShape the shape
+ * @param aMesh the mesh
+ * @param aParams the netgen parameters
+ * @param new_element_file file containing data on the new point/tetra added by netgen
+ *
+ * @return error code
+ */
+int netgen2d(TopoDS_Shape &aShape, SMESH_Mesh& aMesh, netgen_params& aParams,
+             std::string new_element_file, std::string element_orientation_file,
+             bool output_mesh)
+{
+  netgen::multithread.terminate = 0;
+  netgen::multithread.task = "Surface meshing";
+
+  SMESHDS_Mesh* meshDS = aMesh.GetMeshDS();
+  SMESH_MesherHelper helper(aMesh);
+  helper.SetElementsOnShape( true );
+
+  NETGENPlugin_NetgenLibWrapper ngLib;
+  ngLib._isComputeOk = false;
+
+  netgen::Mesh   ngMeshNoLocSize;
+  netgen::Mesh * ngMeshes[2] = { (netgen::Mesh*) ngLib._ngMesh,  & ngMeshNoLocSize };
+  netgen::OCCGeometry occgeoComm;
+
+  std::map<vtkIdType, bool> elemOrientation;
+
+  typedef map< const SMDS_MeshNode*, int, TIDCompare > TNodeToIDMap;
+  typedef TNodeToIDMap::value_type                     TN2ID;
+  const int invalid_ID = -1;
+  int Netgen_NbOfNodes=0;
+  double Netgen_point[3];
+  int Netgen_segment[2];
+  int Netgen_triangle[3];
+
+  // min / max sizes are set as follows:
+  // if ( _hypParameters )
+  //    min and max are defined by the user
+  // else if ( aParams.has_LengthFromEdges_hyp )
+  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
+  //    max = average segment len of a FACE
+  // else if ( _hypMaxElementArea )
+  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
+  //    max = f( _hypMaxElementArea )
+  // else
+  //    min = aMesher.GetDefaultMinSize()
+  //    max = max segment len of a FACE
+  NETGENPlugin_Mesher aMesher( &aMesh, aShape, /*isVolume=*/false);
+  set_netgen_parameters( aParams );
+  const bool toOptimize = aParams.optimize;
+  if ( aParams.has_maxelementvolume_hyp )
+  {
+    netgen::mparam.maxh = sqrt( 2. * aParams.maxElementVolume / sqrt(3.0) );
+  }
+  netgen::mparam.quad = aParams.quad;
+
+  // local size is common for all FACEs in aShape?
+  const bool isCommonLocalSize = ( !aParams.has_LengthFromEdges_hyp && !aParams.has_maxelementvolume_hyp && netgen::mparam.uselocalh );
+  const bool isDefaultHyp = ( !aParams.has_LengthFromEdges_hyp && !aParams.has_maxelementvolume_hyp && !aParams.has_netgen_param );
+
+
+  if ( isCommonLocalSize ) // compute common local size in ngMeshes[0]
+  {
+    //list< SMESH_subMesh* > meshedSM[4]; --> all sub-shapes are added to occgeoComm
+    aMesher.PrepareOCCgeometry( occgeoComm, aShape, aMesh );//, meshedSM );
+
+    // local size set at MESHCONST_ANALYSE step depends on
+    // minh, face_maxh, grading and curvaturesafety; find minh if not set by the user
+    if ( !aParams.has_netgen_param || netgen::mparam.minh < DBL_MIN )
+    {
+      if ( !aParams.has_netgen_param )
+        netgen::mparam.maxh = occgeoComm.GetBoundingBox().Diam() / 3.;
+      netgen::mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( aShape, netgen::mparam.maxh );
+    }
+    // set local size depending on curvature and NOT closeness of EDGEs
+#ifdef NETGEN_V6
+    const double factor = 2; //netgen::occparam.resthcloseedgefac;
+#else
+    const double factor = netgen::occparam.resthcloseedgefac;
+    netgen::occparam.resthcloseedgeenable = false;
+    netgen::occparam.resthcloseedgefac = 1.0 + netgen::mparam.grading;
+#endif
+    occgeoComm.face_maxh = netgen::mparam.maxh;
+#ifdef NETGEN_V6
+    netgen::OCCParameters occparam;
+    netgen::OCCSetLocalMeshSize( occgeoComm, *ngMeshes[0], netgen::mparam, occparam );
+#else
+    netgen::OCCSetLocalMeshSize( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+#endif
+    occgeoComm.emap.Clear();
+    occgeoComm.vmap.Clear();
+
+    // Reading list of element to integrate into netgen mesh
+    std::ifstream df(element_orientation_file, ios::in|ios::binary);
+    int nbElement;
+    vtkIdType id;
+    bool orient;
+    df.read((char*)&nbElement, sizeof(int));
+
+    for(int ielem=0;ielem<nbElement;++ielem){
+      df.read((char*) &id, sizeof(vtkIdType));
+      df.read((char*) &orient, sizeof(bool));
+      elemOrientation[id] = orient;
+    }
+    df.close();
+
+    bool isIn;
+    // set local size according to size of existing segments
+    SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Edge);
+    while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
+    {
+      const SMDS_MeshElement* seg = iteratorElem->next();
+      // Keeping only element that are in the element orientation file
+      isIn = elemOrientation.count(seg->GetID())==1;
+
+      if(!isIn)
+        continue;
+
+      SMESH_TNodeXYZ n1 = seg->GetNode(0);
+      SMESH_TNodeXYZ n2 = seg->GetNode(1);
+      gp_XYZ p = 0.5 * ( n1 + n2 );
+      netgen::Point3d pi(p.X(), p.Y(), p.Z());
+      ngMeshes[0]->RestrictLocalH( pi, factor * ( n1 - n2 ).Modulus() );
+    }
+
+    // set local size defined on shapes
+    aMesher.SetLocalSize( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+    aMesher.SetLocalSizeForChordalError( occgeoComm, *ngMeshes[0] );
+    try {
+      ngMeshes[0]->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
+    } catch (netgen::NgException & ex) {
+      return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
+    }
+  }
+  netgen::mparam.uselocalh = toOptimize; // restore as it is used at surface optimization
+  // ==================
+  // Loop on all FACEs
+  // ==================
+
+  vector< const SMDS_MeshNode* > nodeVec;
+
+  // TopExp_Explorer fExp( aShape, TopAbs_FACE );
+  // for ( int iF = 0; fExp.More(); fExp.Next(), ++iF )
+  // {
+  //   TopoDS_Face F = TopoDS::Face( fExp.Current() /*.Oriented( TopAbs_FORWARD )*/);
+  //   int    faceID = meshDS->ShapeToIndex( F );
+  //   SMESH_ComputeErrorPtr& faceErr = aMesh.GetSubMesh( F )->GetComputeError();
+
+  //   aParams._quadraticMesh = helper.IsQuadraticSubMesh( F );
+  //   const bool ignoreMediumNodes = aParams._quadraticMesh;
+
+  //   // build viscous layers if required
+  //   if ( F.Orientation() != TopAbs_FORWARD &&
+  //        F.Orientation() != TopAbs_REVERSED )
+  //     F.Orientation( TopAbs_FORWARD ); // avoid pb with TopAbs_INTERNAL
+  //   SMESH_ProxyMesh::Ptr proxyMesh = StdMeshers_ViscousLayers2D::Compute( aMesh, F );
+  //   if ( !proxyMesh )
+  //     continue;
+
+  //   // ------------------------
+  //   // get all EDGEs of a FACE
+  //   // ------------------------
+  //   TSideVector wires =
+  //     StdMeshers_FaceSide::GetFaceWires( F, aMesh, ignoreMediumNodes, faceErr, &helper, proxyMesh );
+  //   if ( faceErr && !faceErr->IsOK() )
+  //     continue;
+  //   size_t nbWires = wires.size();
+  //   if ( nbWires == 0 )
+  //   {
+  //     faceErr.reset
+  //       ( new SMESH_ComputeError
+  //         ( COMPERR_ALGO_FAILED, "Problem in StdMeshers_FaceSide::GetFaceWires()" ));
+  //     continue;
+  //   }
+  //   if ( wires[0]->NbSegments() < 3 ) // ex: a circle with 2 segments
+  //   {
+  //     faceErr.reset
+  //       ( new SMESH_ComputeError
+  //         ( COMPERR_BAD_INPUT_MESH, SMESH_Comment("Too few segments: ")<<wires[0]->NbSegments()) );
+  //     continue;
+  //   }
+
+  //   // ----------------------
+  //   // compute maxh of a FACE
+  //   // ----------------------
+
+  //   if ( !aParams.has_netgen_param )
+  //   {
+  //     double edgeLength = 0;
+  //     if (aParams.has_LengthFromEdges_hyp )
+  //     {
+  //       // compute edgeLength as an average segment length
+  //       smIdType nbSegments = 0;
+  //       for ( size_t iW = 0; iW < nbWires; ++iW )
+  //       {
+  //         edgeLength += wires[ iW ]->Length();
+  //         nbSegments += wires[ iW ]->NbSegments();
+  //       }
+  //       if ( nbSegments )
+  //         edgeLength /= double( nbSegments );
+  //       netgen::mparam.maxh = edgeLength;
+  //     }
+  //     else if ( isDefaultHyp )
+  //     {
+  //       // set edgeLength by a longest segment
+  //       double maxSeg2 = 0;
+  //       for ( size_t iW = 0; iW < nbWires; ++iW )
+  //       {
+  //         const UVPtStructVec& points = wires[ iW ]->GetUVPtStruct();
+  //         if ( points.empty() )
+  //           return error( COMPERR_BAD_INPUT_MESH );
+  //         gp_Pnt pPrev = SMESH_TNodeXYZ( points[0].node );
+  //         for ( size_t i = 1; i < points.size(); ++i )
+  //         {
+  //           gp_Pnt p = SMESH_TNodeXYZ( points[i].node );
+  //           maxSeg2 = Max( maxSeg2, p.SquareDistance( pPrev ));
+  //           pPrev = p;
+  //         }
+  //       }
+  //       edgeLength = sqrt( maxSeg2 ) * 1.05;
+  //       netgen::mparam.maxh = edgeLength;
+  //     }
+  //     if ( netgen::mparam.maxh < DBL_MIN )
+  //       netgen::mparam.maxh = occgeoComm.GetBoundingBox().Diam();
+
+  //     if ( !isCommonLocalSize )
+  //     {
+  //       netgen::mparam.minh = aMesher.GetDefaultMinSize( F, netgen::mparam.maxh );
+  //     }
+  //   }
+
+
+
+    // prepare occgeom
+    netgen::OCCGeometry occgeom;
+    occgeom.shape = aShape;
+    occgeom.fmap.Add( aShape );
+    occgeom.CalcBoundingBox();
+    occgeom.facemeshstatus.SetSize(1);
+    occgeom.facemeshstatus = 0;
+    occgeom.face_maxh_modified.SetSize(1);
+    occgeom.face_maxh_modified = 0;
+    occgeom.face_maxh.SetSize(1);
+    occgeom.face_maxh = netgen::mparam.maxh;
+
+    // -------------------------
+    // Fill netgen mesh
+    // -------------------------
+    // maps nodes to ng ID
+
+
+    // MESHCONST_ANALYSE step may lead to a failure, so we make an attempt
+    // w/o MESHCONST_ANALYSE at the second loop
+    int err = 0;
+    enum { LOC_SIZE, NO_LOC_SIZE };
+    int iLoop = isCommonLocalSize ? 0 : 1;
+    int faceID = occgeom.fmap.FindIndex(aShape);
+    int solidID = 0;
+    for ( ; iLoop < 2; iLoop++ )
+    {
+      //bool isMESHCONST_ANALYSE = false;
+      //TODO: check how to replace that
+      //InitComputeError();
+
+      netgen::Mesh * ngMesh = ngMeshes[ iLoop ];
+      ngMesh->DeleteMesh();
+
+      if ( iLoop == NO_LOC_SIZE )
+      {
+        ngMesh->SetGlobalH ( netgen::mparam.maxh );
+        ngMesh->SetMinimalH( netgen::mparam.minh );
+        netgen::Box<3> bb = occgeom.GetBoundingBox();
+        bb.Increase (bb.Diam()/10);
+        ngMesh->SetLocalH (bb.PMin(), bb.PMax(), netgen::mparam.grading);
+        aMesher.SetLocalSize( occgeom, *ngMesh );
+        aMesher.SetLocalSizeForChordalError( occgeoComm, *ngMesh );
+        try {
+          ngMesh->LoadLocalMeshSize( netgen::mparam.meshsizefilename );
+        } catch (netgen::NgException & ex) {
+          return error( COMPERR_BAD_PARMETERS, ex.What() );
+        }
+      }
+
+      TNodeToIDMap nodeToNetgenID;
+
+      nodeVec.clear();
+      ngMesh->AddFaceDescriptor( netgen::FaceDescriptor( faceID, solidID, solidID, 0 ));
+          // set local size according to size of existing segments
+      SMDS_ElemIteratorPtr iteratorElem = meshDS->elementsIterator(SMDSAbs_Edge);
+      while ( iteratorElem->more() ) // loop on elements on a geom face
+      {
+        const SMDS_MeshElement* elem = iteratorElem->next();
+        // Keeping only element that are in the element orientation file
+        bool isIn = elemOrientation.count(elem->GetID())==1;
+
+        if(!isIn)
+          continue;
+
+        bool isRev = elemOrientation[elem->GetID()];
+        std::cerr << isRev;
+
+
+
+        for ( int iN = 0; iN < 2; ++iN )
+        {
+          const SMDS_MeshNode* node = elem->GetNode( iN );
+          const int shapeID = node->getshapeId();
+          int& ngID = nodeToNetgenID.insert(TN2ID( node, invalid_ID )).first->second;
+          if ( ngID == invalid_ID )
+          {
+            ngID = ++Netgen_NbOfNodes;
+            Netgen_point [ 0 ] = node->X();
+            Netgen_point [ 1 ] = node->Y();
+            Netgen_point [ 2 ] = node->Z();
+            netgen::MeshPoint mp( netgen::Point<3> (node->X(), node->Y(), node->Z()) );
+            ngMesh->AddPoint ( mp, 1, netgen::EDGEPOINT );
+          }
+          Netgen_segment[ isRev ? 1-iN : iN ] = ngID;
+        }
+        // add segment
+
+        netgen::Segment seg;
+        seg[0] = Netgen_segment[0];
+        seg[1] = Netgen_segment[1];
+        seg.edgenr = ngMesh->GetNSeg() +1;
+        seg.si = faceID;
+
+        ngMesh->AddSegment(seg);
+      }
+      int nbNodes2 = ngMesh->GetNP();
+      int nseg = ngMesh->GetNSeg();
+
+      // insert old nodes into nodeVec
+      nodeVec.resize( nodeToNetgenID.size() + 1, 0 );
+      TNodeToIDMap::iterator n_id = nodeToNetgenID.begin();
+      for ( ; n_id != nodeToNetgenID.end(); ++n_id )
+        nodeVec[ n_id->second ] = n_id->first;
+      nodeToNetgenID.clear();
+
+
+      //if ( !isCommonLocalSize )
+      //limitSize( ngMesh, mparam.maxh * 0.8);
+
+      // -------------------------
+      // Generate surface mesh
+      // -------------------------
+
+      const int startWith = netgen::MESHCONST_MESHSURFACE;
+      const int endWith   = toOptimize ? netgen::MESHCONST_OPTSURFACE : netgen::MESHCONST_MESHSURFACE;
+
+      SMESH_Comment str;
+      try {
+        OCC_CATCH_SIGNALS;
+        err = ngLib.GenerateMesh(occgeom, startWith, endWith, ngMesh);
+        if ( netgen::multithread.terminate )
+          return false;
+        if ( err )
+          str << "Error in netgen::OCCGenerateMesh() at " << netgen::multithread.task;
+      }
+      catch (Standard_Failure& ex)
+      {
+        err = 1;
+        str << "Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()"
+            << " at " << netgen::multithread.task
+            << ": " << ex.DynamicType()->Name();
+        if ( ex.GetMessageString() && strlen( ex.GetMessageString() ))
+          str << ": " << ex.GetMessageString();
+      }
+      catch (...) {
+        err = 1;
+        str << "Exception in  netgen::OCCGenerateMesh()"
+            << " at " << netgen::multithread.task;
+      }
+      if ( err )
+      {
+        if ( iLoop == LOC_SIZE )
+        {
+          std::cout << "Need second run" << std::endl;
+          /*netgen::mparam.minh = netgen::mparam.maxh;
+          netgen::mparam.maxh = 0;
+          for ( size_t iW = 0; iW < wires.size(); ++iW )
+          {
+            StdMeshers_FaceSidePtr wire = wires[ iW ];
+            const vector<UVPtStruct>& uvPtVec = wire->GetUVPtStruct();
+            for ( size_t iP = 1; iP < uvPtVec.size(); ++iP )
+            {
+              SMESH_TNodeXYZ   p( uvPtVec[ iP ].node );
+              netgen::Point3d np( p.X(),p.Y(),p.Z());
+              double segLen = p.Distance( uvPtVec[ iP-1 ].node );
+              double   size = ngMesh->GetH( np );
+              netgen::mparam.minh = Min( netgen::mparam.minh, size );
+              netgen::mparam.maxh = Max( netgen::mparam.maxh, segLen );
+            }
+          }
+          //cerr << "min " << mparam.minh << " max " << mparam.maxh << endl;
+          netgen::mparam.minh *= 0.9;
+          netgen::mparam.maxh *= 1.1;
+          */
+          continue;
+        }
+        else
+        {
+          //faceErr.reset( new SMESH_ComputeError( COMPERR_ALGO_FAILED, str ));
+        }
+      }
+
+      // ----------------------------------------------------
+      // Fill the SMESHDS with the generated nodes and faces
+      // ----------------------------------------------------
+
+      if(output_mesh)
+      {
+        int nbNodes = ngMesh->GetNP();
+        int nbFaces = ngMesh->GetNSE();
+        std::cout << nbFaces << " " << nbNodes << std::endl;
+
+        int nbInputNodes = (int) nodeVec.size()-1;
+        nodeVec.resize( nbNodes+1, 0 );
+
+        // add nodes
+        for ( int ngID = nbInputNodes + 1; ngID <= nbNodes; ++ngID )
+        {
+          const netgen::MeshPoint& ngPoint = ngMesh->Point( ngID );
+          SMDS_MeshNode * node = meshDS->AddNode(ngPoint(0), ngPoint(1), ngPoint(2));
+          nodeVec[ ngID ] = node;
+        }
+
+        // create faces
+        int i,j;
+        for ( i = 1; i <= nbFaces ; ++i )
+        {
+          Ng_GetVolumeElement(ngLib.ngMesh(), i, Netgen_triangle);
+
+          helper.AddFace (nodeVec.at( Netgen_triangle[0] ),
+                          nodeVec.at( Netgen_triangle[1] ),
+                          nodeVec.at( Netgen_triangle[2] ));
+
+        }
+      } // output_mesh
+
+      break;
+    } // two attempts
+  //} // loop on FACEs
+
+  return true;
+
 }
\ No newline at end of file
index f1e2fa9228e5443c74a61902480f755f94085e68..2cf7d365f52bb672c78e83ba695e623888ba046c 100644 (file)
@@ -36,6 +36,20 @@ class SMESH_Mesh;
 class SMESH_Comment;
 class netgen_params;
 
+int netgen2d(TopoDS_Shape &aShape,
+             SMESH_Mesh& aMesh,
+             netgen_params& aParams,
+             std::string new_element_file,
+             std::string element_orientation_file,
+             bool output_mesh);
+int netgen2d(const std::string input_mesh_file,
+             const std::string shape_file,
+             const std::string hypo_file,
+             const std::string element_orienation_file,
+             const std::string new_element_file,
+             bool output_mesh,
+             const std::string output_mesh_file);
+
 int netgen3d(TopoDS_Shape &aShape,
              SMESH_Mesh& aMesh,
              netgen_params& aParams,
index 3a4a22b641356987506931bf8845dd81cfd7d684..0c690817b727f1078d53a80babedb8cf2d1e5688 100644 (file)
 #include <string>
 #include <cassert>
 
+
+// TODO: Error handling of read/write
+
 /**
  * @brief Print content of a netgen_params
  *
  * @param aParams The object to display
  */
 void print_netgen_params(netgen_params& aParams){
+  // TODO: prettier print
+  // TODO: Add call to print in log
   std::cout << "has_netgen_param: " << aParams.has_netgen_param << std::endl;
   std::cout << "maxh: " << aParams.maxh << std::endl;
   std::cout << "minh: " << aParams.minh << std::endl;
@@ -57,11 +62,12 @@ void print_netgen_params(netgen_params& aParams){
   std::cout << "delaunay: " << aParams.delaunay << std::endl;
   std::cout << "checkoverlap: " << aParams.checkoverlap << std::endl;
   std::cout << "checkchartboundary: " << aParams.checkchartboundary << std::endl;
+  std::cout << "closeedgefac: " << aParams.closeedgefac << std::endl;
   std::cout << "has_local_size: " << aParams.has_local_size << std::endl;
   std::cout << "meshsizefilename: " << aParams.meshsizefilename << std::endl;
   std::cout << "has_maxelementvolume_hyp: " << aParams.has_maxelementvolume_hyp << std::endl;
   std::cout << "maxElementVolume: " << aParams.maxElementVolume << std::endl;
-  std::cout << "closeedgefac: " << aParams.closeedgefac << std::endl;
+  std::cout << "has_LengthFromEdges_hyp: " << aParams.has_LengthFromEdges_hyp << std::endl;
 }
 
 /**
@@ -124,6 +130,8 @@ void import_netgen_params(const std::string param_file, netgen_params& aParams){
   aParams.has_maxelementvolume_hyp = std::stoi(line);
   std::getline(myfile, line);
   aParams.maxElementVolume = std::stod(line);
+  std::getline(myfile, line);
+  aParams.maxElementVolume = std::stoi(line);
 
   myfile.close();
 };
@@ -161,6 +169,7 @@ void export_netgen_params(const std::string param_file, netgen_params& aParams){
   myfile << aParams.meshsizefilename << std::endl;
   myfile << aParams.has_maxelementvolume_hyp << std::endl;
   myfile << aParams.maxElementVolume << std::endl;
+  myfile << aParams.has_LengthFromEdges_hyp << std::endl;
 
   myfile.close();
 };
@@ -199,6 +208,7 @@ bool diff_netgen_params(netgen_params params1, netgen_params params2){
   ret &= params1.meshsizefilename == params2.meshsizefilename;
   ret &= params1.has_maxelementvolume_hyp == params2.has_maxelementvolume_hyp;
   ret &= params1.maxElementVolume == params2.maxElementVolume;
+  ret &= params1.has_LengthFromEdges_hyp == params2.has_LengthFromEdges_hyp;
 
   return ret;
 }
index fef05f81ead007f06b359509669152620ba0e9a6..7919837ee948be87c6968f4cf226e18d914f1937 100644 (file)
@@ -78,6 +78,9 @@ struct netgen_params{
   StdMeshers_ViscousLayers*    _viscousLayersHyp=nullptr;
   //double                       _progressByTic;
   bool _quadraticMesh=false;
+
+  // Params from NETGEN2D
+  bool has_LengthFromEdges_hyp=false;
 };
 
 void print_netgen_params(netgen_params& aParams);
index 5733cd0e53ac1d254bd65e947078b1ef1da5394f..ae9c7a6ed13b25674b72d6d66dc68e58e169ca30 100644 (file)
@@ -36,6 +36,8 @@
 #include <TopoDS_Shape.hxx>
 #include <iostream>
 
+#include <chrono>
+
 /**
  * @brief Test of shape Import/Export
  *
@@ -183,7 +185,7 @@ int main(int argc, char *argv[]){
     std::cout << "           ELEM_ORIENT_FILE NEW_ELEMENT_FILE OUTPUT_MESH_FILE" << std::endl;
     std::cout << std::endl;
     std::cout << "Args:" << std::endl;
-    std::cout << "  MESHER: mesher to use from (NETGEN3D)" << std::endl;
+    std::cout << "  MESHER: mesher to use from (NETGEN3D, NETGEN2D)" << std::endl;
     std::cout << "  INPUT_MESH_FILE: MED File containing lower-dimension-elements already meshed" << std::endl;
     std::cout << "  SHAPE_FILE: STEP file containing the shape to mesh" << std::endl;
     std::cout << "  HYPO_FILE: Ascii file containint the list of parameters" << std::endl;
@@ -209,6 +211,7 @@ int main(int argc, char *argv[]){
     test_netgen_params();
     test_netgen3d();
   } else if (mesher=="NETGEN3D"){
+    auto begin = std::chrono::high_resolution_clock::now();
     netgen3d(input_mesh_file,
              shape_file,
              hypo_file,
@@ -216,6 +219,17 @@ int main(int argc, char *argv[]){
              new_element_file,
              output_mesh,
              output_mesh_file);
+    auto end = std::chrono::high_resolution_clock::now();
+    auto elapsed = std::chrono::duration_cast<std::chrono::nanoseconds>(end - begin);
+    std::cout << "Time elapsed: " << elapsed.count()*1e-9 << std::endl;
+  } else if (mesher=="NETGEN2D"){
+    netgen2d(input_mesh_file,
+             shape_file,
+             hypo_file,
+             element_orientation_file,
+             new_element_file,
+             output_mesh,
+             output_mesh_file);
   } else {
     std::cerr << "Unknown mesher:" << mesher << std::endl;
   }