Salome HOME
On the road of ParaMEDReader for fields.
[tools/medcoupling.git] / src / MEDLoader / MEDFileMeshLL.hxx
index 56e19db6fbbfad5defa8e6d7138a798f626864b5..4be19e047a2fbdd9156186f4bf950b80987217f9 100644 (file)
@@ -1,9 +1,9 @@
-// Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
+// Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
 //
 // This library is free software; you can redistribute it and/or
 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
 // License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License.
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
 //
 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
@@ -27,6 +27,7 @@
 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
 #include "MEDCouplingCMesh.hxx"
 #include "MEDCoupling1GTUMesh.hxx"
+#include "MEDCouplingPartDefinition.hxx"
 #include "MEDCouplingCurveLinearMesh.hxx"
 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
 
 namespace ParaMEDMEM
 {
   class MEDFileMeshReadSelector;
-  
+
   class MEDFileMeshL2 : public RefCountObject
   {
   public:
     MEDFileMeshL2();
-    std::size_t getHeapMemorySize() const { return 0; }
+    std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
+    std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
     const char *getName() const { return _name.getReprForWrite(); }
     const char *getDescription() const { return _description.getReprForWrite(); }
     const char *getUnivName() const { return _univ_name.getReprForWrite(); }
     const char *getTimeUnit() const { return _dt_unit.getReprForWrite(); }
     int getIteration() const { return _iteration; }
     int getOrder() const { return _order; }
-    double getTime() { return _time; }
-    std::vector<std::string> getAxisInfoOnMesh(med_idt fid, int mId, const char *mName, ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType& meshType, int& nstep, int& Mdim) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    static int GetMeshIdFromName(med_idt fid, const char *mName, ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType& meshType, int& dt, int& it, std::string& dtunit1) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    static double CheckMeshTimeStep(med_idt fid, const char *mname, int nstep, int dt, int it) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    static void ReadFamiliesAndGrps(med_idt fid, const char *mname, std::map<std::string,int>& fams, std::map<std::string, std::vector<std::string> >& grps, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
-    static void WriteFamiliesAndGrps(med_idt fid, const char *mname, const std::map<std::string,int>& fams, const std::map<std::string, std::vector<std::string> >& grps, int tooLongStrPol);
+    double getTime() const { return _time; }
+    MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<PartDefinition> getPartDefOfCoo() const { return _part_coords; }
+    std::vector<std::string> getAxisInfoOnMesh(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType& meshType, int& nstep, int& Mdim);
+    static int GetMeshIdFromName(med_idt fid, const std::string& mName, ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType& meshType, int& dt, int& it, std::string& dtunit1);
+    static double CheckMeshTimeStep(med_idt fid, const std::string& mname, int nstep, int dt, int it);
+    static void ReadFamiliesAndGrps(med_idt fid, const std::string& mname, std::map<std::string,int>& fams, std::map<std::string, std::vector<std::string> >& grps, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
+    static void WriteFamiliesAndGrps(med_idt fid, const std::string& mname, const std::map<std::string,int>& fams, const std::map<std::string, std::vector<std::string> >& grps, int tooLongStrPol);
   protected:
     MEDFileString _name;
     MEDFileString _description;
@@ -63,15 +66,20 @@ namespace ParaMEDMEM
     int _iteration;
     int _order;
     double _time;
+    MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<PartDefinition> _part_coords;
   };
 
   class MEDFileUMeshL2 : public MEDFileMeshL2
   {
   public:
     MEDFileUMeshL2();
-    void loadAll(med_idt fid, int mId, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
-    void loadConnectivity(med_idt fid, int mdim, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
-    void loadCoords(med_idt fid, int mId, const std::vector<std::string>& infosOnComp, const char *mName, int dt, int it) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    std::vector<std::string> loadCommonPart(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it, int& Mdim);
+    void loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
+    void loadPart(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
+    void loadConnectivity(med_idt fid, int mdim, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
+    void loadPartOfConnectivity(med_idt fid, int mdim, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
+    void loadCoords(med_idt fid, int mId, const std::vector<std::string>& infosOnComp, const std::string& mName, int dt, int it);
+    void loadPartCoords(med_idt fid, int mId, const std::vector<std::string>& infosOnComp, const std::string& mName, int dt, int it, int nMin, int nMax);
     int getNumberOfLevels() const { return _per_type_mesh.size(); }
     bool emptyLev(int levId) const { return _per_type_mesh[levId].empty(); }
     const std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >& getLev(int levId) const { return _per_type_mesh[levId]; }
@@ -82,7 +90,7 @@ namespace ParaMEDMEM
     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> getCoordsFamily() const { return _fam_coords; }
     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> getCoordsNum() const { return _num_coords; }
     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> getCoordsName() const { return _name_coords; }
-    static void WriteCoords(med_idt fid, const char *mname, int dt, int it, double time, const DataArrayDouble *coords, const DataArrayInt *famCoords, const DataArrayInt *numCoords, const DataArrayAsciiChar *nameCoords);
+    static void WriteCoords(med_idt fid, const std::string& mname, int dt, int it, double time, const DataArrayDouble *coords, const DataArrayInt *famCoords, const DataArrayInt *numCoords, const DataArrayAsciiChar *nameCoords);
   private:
     void sortTypes();
   private:
@@ -101,19 +109,19 @@ namespace ParaMEDMEM
   {
   public:
     MEDFileCMeshL2();
-    void loadAll(med_idt fid, int mId, const char *mName, int dt, int it) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    void loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it);
     MEDCouplingCMesh *getMesh() { return _cmesh; }
   private:
-    static med_data_type GetDataTypeCorrespondingToSpaceId(int id) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    static med_data_type GetDataTypeCorrespondingToSpaceId(int id);
   private:
     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingCMesh> _cmesh;
   };
-  
+
   class MEDFileCLMeshL2 : public MEDFileStrMeshL2
   {
   public:
     MEDFileCLMeshL2();
-    void loadAll(med_idt fid, int mId, const char *mName, int dt, int it) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    void loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it);
     MEDCouplingCurveLinearMesh *getMesh() { return _clmesh; }
   private:
     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingCurveLinearMesh> _clmesh;
@@ -122,13 +130,15 @@ namespace ParaMEDMEM
   class MEDFileMesh;
   class MEDFileUMeshSplitL1;
 
-  class MEDFileUMeshPermCompute
+  class MEDFileUMeshPermCompute : public BigMemoryObject
   {
   public:
     MEDFileUMeshPermCompute(const MEDFileUMeshSplitL1* st);
     operator MEDCouplingUMesh *() const;
     void operator=(MEDCouplingUMesh *m);
     void updateTime() const;
+    std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
+    std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
   private:
     const MEDFileUMeshSplitL1 *_st;
     mutable std::size_t _mpt_time;
@@ -136,29 +146,35 @@ namespace ParaMEDMEM
     mutable MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> _m;
   };
 
-  class MEDFileUMeshAggregateCompute
+  class MEDFileUMeshAggregateCompute : public BigMemoryObject
   {
   public:
     MEDFileUMeshAggregateCompute();
+    void setName(const std::string& name);
     void assignParts(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh * >& mParts);
+    void assignDefParts(const std::vector<const PartDefinition *>& partDefs);
     void assignUMesh(MEDCouplingUMesh *m);
     MEDCouplingUMesh *getUmesh() const;
     std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> getParts() const;
-    std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> getPartsWithoutComputation() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCoupling1GTUMesh *getPartWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getGeoTypes() const;
+    std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> retrievePartsWithoutComputation() const;
+    MEDCoupling1GTUMesh *retrievePartWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
+    void getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt, int& start, int& stop) const;
     std::size_t getTimeOfThis() const;
-    std::size_t getHeapMemorySize() const;
+    std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
+    std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
     MEDFileUMeshAggregateCompute deepCpy(DataArrayDouble *coords) const;
     bool isEqual(const MEDFileUMeshAggregateCompute& other, double eps, std::string& what) const;
     void clearNonDiscrAttributes() const;
     void synchronizeTinyInfo(const MEDFileMesh& master) const;
     bool empty() const;
     int getMeshDimension() const;
-    std::vector<int> getDistributionOfTypes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    int getSize() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    void setCoords(DataArrayDouble *coords) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-  private:
+    std::vector<int> getDistributionOfTypes() const;
+    int getSize() const;
+    void setCoords(DataArrayDouble *coords);
     void forceComputationOfPartsFromUMesh() const;
+    const PartDefinition *getPartDefOfWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
+  private:
     std::size_t getTimeOfParts() const;
     std::size_t getTimeOfUMesh() const;
   private:
@@ -166,50 +182,60 @@ namespace ParaMEDMEM
     mutable std::size_t _mp_time;
     mutable std::size_t _m_time;
     mutable MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> _m;
+    mutable std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<PartDefinition> > _part_def;
   };
-  
+
   class MEDFileUMeshSplitL1 : public RefCountObject
   {
     friend class MEDFileUMeshPermCompute;
   public:
     MEDFileUMeshSplitL1(const MEDFileUMeshSplitL1& other);
-    MEDFileUMeshSplitL1(const MEDFileUMeshL2& l2, const char *mName, int id);
+    MEDFileUMeshSplitL1(const MEDFileUMeshL2& l2, const std::string& mName, int id);
+    MEDFileUMeshSplitL1(MEDCoupling1GTUMesh *m);
     MEDFileUMeshSplitL1(MEDCouplingUMesh *m);
     MEDFileUMeshSplitL1(MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld);
-    std::size_t getHeapMemorySize() const;
+    void setName(const std::string& name);
+    std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
+    std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
     MEDFileUMeshSplitL1 *deepCpy(DataArrayDouble *coords) const;
-    void setCoords(DataArrayDouble *coords) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    void setCoords(DataArrayDouble *coords);
     bool isEqual(const MEDFileUMeshSplitL1 *other, double eps, std::string& what) const;
     void clearNonDiscrAttributes() const;
     void synchronizeTinyInfo(const MEDFileMesh& master) const;
-    void assignMesh(MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    void assignMesh(MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld);
+    void assignParts(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh * >& mParts);
+    void forceComputationOfParts() const;
     bool empty() const;
     bool presenceOfOneFams(const std::vector<int>& ids) const;
     int getMeshDimension() const;
     void simpleRepr(std::ostream& oss) const;
-    int getSize() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    int getSize() const;
     MEDCouplingUMesh *getFamilyPart(const int *idsBg, const int *idsEnd, bool renum) const;
     DataArrayInt *getFamilyPartArr(const int *idsBg, const int *idsEnd, bool renum) const;
     MEDCouplingUMesh *getWholeMesh(bool renum) const;
-    std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception) { return _m_by_types.getPartsWithoutComputation(); }
-    MEDCoupling1GTUMesh *getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception) { return _m_by_types.getPartWithoutComputation(gt); }
-    std::vector<int> getDistributionOfTypes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception) { return _m_by_types.getDistributionOfTypes(); }
-    DataArrayInt *getOrCreateAndGetFamilyField() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getGeoTypes() const;
+    std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes() const { return _m_by_types.retrievePartsWithoutComputation(); }
+    MEDCoupling1GTUMesh *getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const { return _m_by_types.retrievePartWithoutComputation(gt); }
+    DataArrayInt *extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
+    DataArrayInt *extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
+    std::vector<int> getDistributionOfTypes() const { return _m_by_types.getDistributionOfTypes(); }
+    DataArrayInt *getOrCreateAndGetFamilyField();
     const DataArrayInt *getFamilyField() const;
     const DataArrayInt *getNumberField() const;
     const DataArrayAsciiChar *getNameField() const;
     const DataArrayInt *getRevNumberField() const;
+    const PartDefinition *getPartDef(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
     void eraseFamilyField();
     void setGroupsFromScratch(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, std::map<std::string,int>& familyIds,
-                              std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    void write(med_idt fid, const char *mName, int mdim) const;
+                              std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups);
+    void write(med_idt fid, const std::string& mName, int mdim) const;
     //
     void setFamilyArr(DataArrayInt *famArr);
     void setRenumArr(DataArrayInt *renumArr);
     void setNameArr(DataArrayAsciiChar *nameArr);
-    void changeFamilyIdArr(int oldId, int newId) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    void changeFamilyIdArr(int oldId, int newId);
     //
-    void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N);
     //
     static void ClearNonDiscrAttributes(const MEDCouplingMesh *tmp);
     static std::vector<int> GetNewFamiliesNumber(int nb, const std::map<std::string,int>& families);
@@ -218,6 +244,7 @@ namespace ParaMEDMEM
     static DataArrayInt *Renumber(const DataArrayInt *renum, const DataArrayInt *da);
     static MEDCouplingUMesh *Renumber2(const DataArrayInt *renum, MEDCouplingUMesh *m, const int *cellIds);
   private:
+    void assignCommonPart();
     MEDCouplingUMesh *renumIfNeeded(MEDCouplingUMesh *m, const int *cellIds) const;
     DataArrayInt *renumIfNeededArr(const DataArrayInt *da) const;
     void computeRevNum() const;