Salome HOME
Management of lev -1 even for cell fields on structured meshes
[tools/medcoupling.git] / src / MEDLoader / MEDFileFieldOverView.cxx
index a677c4b05629368989f9458e3918244c2b425d35..5493d88cd6783d7b35ab1d5a17c33fcec0dbd470 100644 (file)
@@ -29,6 +29,8 @@ using namespace ParaMEDMEM;
 const unsigned char MEDMeshMultiLev::PARAMEDMEM_2_VTKTYPE[MEDMeshMultiLev::PARAMEDMEM_2_VTKTYPE_LGTH]=
   {1,3,21,5,9,7,22,34,23,28,255,255,255,255,10,14,13,255,12,255,24,255,16,27,255,26,255,29,255,255,25,42,36,4};
 
+const unsigned char MEDMeshMultiLev::HEXA27_PERM_ARRAY[27]={0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,24,22,21,23,20,25,26};
+
 const char MEDFileField1TSStructItem2::NEWLY_CREATED_PFL_NAME[]="???";
 
 MEDFileMeshStruct *MEDFileMeshStruct::New(const MEDFileMesh *mesh)
@@ -79,6 +81,9 @@ int MEDFileMeshStruct::getLevelOfGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t) co
   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::getLevelOfGeoType : The specified geometric type is not present in the mesh structure !");
 }
 
+/*!
+ * \sa MEDFileMeshStruct::doesManageGeoType
+ */
 int MEDFileMeshStruct::getNumberOfElemsOfGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t) const
 {
   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=_geo_types_distrib.begin();it1!=_geo_types_distrib.end();it1++)
@@ -94,6 +99,42 @@ int MEDFileMeshStruct::getNumberOfElemsOfGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellTy
   throw INTERP_KERNEL::Exception("The specified geometric type is not present in the mesh structure !");
 }
 
+/*!
+ * \sa MEDFileMeshStruct::getNumberOfElemsOfGeoType
+ */
+bool MEDFileMeshStruct::doesManageGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t) const
+{
+  for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=_geo_types_distrib.begin();it1!=_geo_types_distrib.end();it1++)
+    {
+      std::size_t sz=(*it1).size();
+      if(sz%3!=0)
+        throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::doesManageGeoType : internal error in code !");
+      std::size_t nbGeo=sz/3;
+      for(std::size_t i=0;i<nbGeo;i++)
+        if((*it1)[3*i]==(int)t)
+          return true;
+    }
+  return false;
+}
+
+void MEDFileMeshStruct::appendIfImplicitType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t)
+{
+  if(!_mesh->hasImplicitPart())
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::appendIfImplicitType : by default no implicit geo type can be appended !");
+  static const char MSG[]="MEDFileMeshStruct::appendIfImplicitType : the distribution does not looks like structured standard !";
+  if(_geo_types_distrib.size()!=1)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
+  std::size_t sz(_geo_types_distrib[0].size());
+  if(sz%3!=0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::appendIfImplicitType : internal error in code !");
+  std::size_t nbGeo(sz/3);
+  if(nbGeo!=1)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
+  std::vector<int> arr(3); arr[0]=(int)t; arr[1]=_mesh->buildImplicitPartIfAny(t); arr[2]=-1;
+  _geo_types_distrib.push_back(arr);
+}
+
+
 int MEDFileMeshStruct::getNumberOfLevs() const
 {
   return (int)_geo_types_distrib.size();
@@ -598,11 +639,11 @@ void MEDMeshMultiLev::appendVertices(const DataArrayInt *verticesToAdd, DataArra
     }
 }
 
-MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev():_nb_nodes(0),_cell_fam_ids_nocpy(false)
+MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev(const MEDFileMesh *mesh):_mesh(mesh),_nb_nodes(0),_cell_fam_ids_nocpy(false)
 {
 }
 
-MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev(int nbNodes, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):_geo_types(gts),_nb_entities(nbEntities),_nb_nodes(nbNodes),_cell_fam_ids_nocpy(false),_cell_num_ids_nocpy(false),_node_fam_ids_nocpy(false),_node_num_ids_nocpy(false)
+MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev(const MEDFileMesh *mesh, int nbNodes, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):_mesh(mesh),_geo_types(gts),_nb_entities(nbEntities),_nb_nodes(nbNodes),_cell_fam_ids_nocpy(false),_cell_num_ids_nocpy(false),_node_fam_ids_nocpy(false),_node_num_ids_nocpy(false)
 {
   std::size_t sz(_geo_types.size());
   if(sz!=pfls.size() || sz!=nbEntities.size())
@@ -616,7 +657,7 @@ MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev(int nbNodes, const std::vector<INTERP_KERNEL::N
     }
 }
 
-MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev(const MEDMeshMultiLev& other):RefCountObject(other),_pfls(other._pfls),_geo_types(other._geo_types),_nb_entities(other._nb_entities),_node_reduction(other._node_reduction),_nb_nodes(other._nb_nodes),_cell_fam_ids(other._cell_fam_ids),_cell_fam_ids_nocpy(other._cell_fam_ids_nocpy),_cell_num_ids(other._cell_num_ids),_cell_num_ids_nocpy(other._cell_num_ids_nocpy),_node_fam_ids(other._node_fam_ids),_node_fam_ids_nocpy(other._node_fam_ids_nocpy),_node_num_ids(other._node_num_ids),_node_num_ids_nocpy(other._node_num_ids_nocpy)
+MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev(const MEDMeshMultiLev& other):RefCountObject(other),_mesh(other._mesh),_pfls(other._pfls),_geo_types(other._geo_types),_nb_entities(other._nb_entities),_node_reduction(other._node_reduction),_nb_nodes(other._nb_nodes),_cell_fam_ids(other._cell_fam_ids),_cell_fam_ids_nocpy(other._cell_fam_ids_nocpy),_cell_num_ids(other._cell_num_ids),_cell_num_ids_nocpy(other._cell_num_ids_nocpy),_node_fam_ids(other._node_fam_ids),_node_fam_ids_nocpy(other._node_fam_ids_nocpy),_node_num_ids(other._node_num_ids),_node_num_ids_nocpy(other._node_num_ids_nocpy)
 {
 }
 
@@ -627,7 +668,7 @@ MEDUMeshMultiLev *MEDUMeshMultiLev::New(const MEDFileUMesh *m, const std::vector
   return new MEDUMeshMultiLev(m,levs);
 }
 
-MEDUMeshMultiLev::MEDUMeshMultiLev(const MEDFileUMesh *m, const std::vector<int>& levs)
+MEDUMeshMultiLev::MEDUMeshMultiLev(const MEDFileUMesh *m, const std::vector<int>& levs):MEDMeshMultiLev(m)
 {
   if(!m)
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev constructor : null input pointer !");
@@ -730,7 +771,7 @@ MEDUMeshMultiLev *MEDUMeshMultiLev::New(const MEDFileUMesh *m, const std::vector
   return new MEDUMeshMultiLev(m,gts,pfls,nbEntities);
 }
 
-MEDUMeshMultiLev::MEDUMeshMultiLev(const MEDFileUMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):MEDMeshMultiLev(m->getNumberOfNodes(),gts,pfls,nbEntities)
+MEDUMeshMultiLev::MEDUMeshMultiLev(const MEDFileUMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):MEDMeshMultiLev(m,m->getNumberOfNodes(),gts,pfls,nbEntities)
 {
   std::size_t sz(gts.size());
   if(sz<1)
@@ -945,12 +986,25 @@ bool MEDUMeshMultiLev::buildVTUArrays(DataArrayDouble *& coords, DataArrayByte *
         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::getVTUArrays : internal error !");
       if(scur)
         {
-          int nnpc(scur->getNumberOfNodesPerCell());
-          for(int i=0;i<curNbCells;i++,connPtr+=nnpc)
+          if(cur->getCellModelEnum()!=INTERP_KERNEL::NORM_HEXA27)
+            {
+              int nnpc(scur->getNumberOfNodesPerCell());
+              for(int i=0;i<curNbCells;i++,connPtr+=nnpc)
+                {
+                  *dPtr++=nnpc;
+                  dPtr=std::copy(connPtr,connPtr+nnpc,dPtr);
+                  *cPtr++=k; k+=nnpc+1;
+                }
+            }
+          else
             {
-              *dPtr++=nnpc;
-              dPtr=std::copy(connPtr,connPtr+nnpc,dPtr);
-              *cPtr++=k; k+=nnpc+1;
+              for(int i=0;i<curNbCells;i++,connPtr+=27)
+                {
+                  *dPtr++=27;
+                  for(int j=0;j<27;j++,dPtr++)
+                    *dPtr=connPtr[HEXA27_PERM_ARRAY[j]];
+                  *cPtr++=k; k+=28;
+                }
             }
           if(isPolyh)
             { std::fill(ePtr,ePtr+curNbCells,-1); ePtr+=curNbCells; }
@@ -1118,11 +1172,11 @@ void MEDUMeshMultiLev::appendVertices(const DataArrayInt *verticesToAdd, DataArr
 
 //=
 
-MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev():_is_internal(true)
+MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(const MEDFileStructuredMesh *m):MEDMeshMultiLev(m),_is_internal(true)
 {
 }
 
-MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(const MEDFileStructuredMesh *m, const std::vector<int>& lev):_is_internal(true)
+MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(const MEDFileStructuredMesh *m, const std::vector<int>& lev):MEDMeshMultiLev(m),_is_internal(true)
 {
   // ids fields management
   _cell_fam_ids_nocpy=true; _cell_num_ids_nocpy=true;
@@ -1156,7 +1210,7 @@ MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(const MEDFileStructuredMesh
     }
 }
 
-MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(const MEDFileStructuredMesh *m, int nbOfNodes, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):MEDMeshMultiLev(nbOfNodes,gts,pfls,nbEntities),_is_internal(true)
+MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(const MEDFileStructuredMesh *m, int nbOfNodes, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):MEDMeshMultiLev(m,nbOfNodes,gts,pfls,nbEntities),_is_internal(true)
 {
   // ids fields management
   _cell_fam_ids_nocpy=true; _cell_num_ids_nocpy=true;
@@ -1194,6 +1248,43 @@ MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(const MEDStructuredMeshMult
 {
 }
 
+bool MEDStructuredMeshMultiLev::prepareForImplicitUnstructuredMeshCase(MEDMeshMultiLev *&ret) const
+{
+  ret=0;
+  MEDCoupling1GTUMesh *facesIfPresent((static_cast<const MEDFileStructuredMesh *>(_mesh))->getImplicitFaceMesh());
+  if(!facesIfPresent)
+    return false;
+  const DataArrayInt *pfl(0),*nr(_node_reduction);
+  if(!_pfls.empty())
+    pfl=_pfls[0];
+  MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> facesIfPresent2(facesIfPresent); facesIfPresent->incrRef();
+  MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDUMeshMultiLev> ret2(new MEDUMeshMultiLev(*this,facesIfPresent2));
+  if(pfl)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDStructuredMeshMultiLev::prepareForImplicitUnstructuredMeshCase : case is not treated yet for profile on implicit unstructured mesh.");
+  if(nr)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDStructuredMeshMultiLev::prepareForImplicitUnstructuredMeshCase : case is not treated yet for node reduction on implicit unstructured mesh.");
+  ret=ret2.retn();
+  return true;
+}
+
+void MEDStructuredMeshMultiLev::dealWithImplicitUnstructuredMesh(const MEDFileMesh *m)
+{
+  _cell_fam_ids_nocpy=true; _cell_num_ids_nocpy=true;
+  const DataArrayInt *tmp(0);
+  tmp=m->getFamilyFieldAtLevel(-1);
+  if(tmp)
+    {
+      tmp->incrRef();
+      _cell_fam_ids=const_cast<DataArrayInt *>(tmp);
+    }
+  tmp=m->getNumberFieldAtLevel(-1);
+  if(tmp)
+    {
+      tmp->incrRef();
+      _cell_num_ids=const_cast<DataArrayInt *>(tmp);
+    }
+}
+
 void MEDStructuredMeshMultiLev::selectPartOfNodes(const DataArrayInt *pflNodes)
 {
   if(!pflNodes || !pflNodes->isAllocated())
@@ -1257,16 +1348,19 @@ MEDCMeshMultiLev::MEDCMeshMultiLev(const MEDFileCMesh *m, const std::vector<INTE
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : lengthes of gts and pfls must be equal to one !");
   int mdim(m->getMeshDimension());
   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(mdim));
-  if(gt!=gts[0])
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : the unique geo type is invalid regarding meshdim !");
-  _coords.resize(mdim);
-  for(int i=0;i<mdim;i++)
+  if(gt==gts[0])
     {
-      DataArrayDouble *elt(const_cast<DataArrayDouble *>(m->getMesh()->getCoordsAt(i)));
-      if(!elt)
-        throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : presence of null pointer for an vector of double along an axis !");
-      _coords[i]=elt; _coords[i]->incrRef();
+      _coords.resize(mdim);
+      for(int i=0;i<mdim;i++)
+        {
+          DataArrayDouble *elt(const_cast<DataArrayDouble *>(m->getMesh()->getCoordsAt(i)));
+          if(!elt)
+            throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : presence of null pointer for an vector of double along an axis !");
+          _coords[i]=elt; _coords[i]->incrRef();
+        }
     }
+  else
+    dealWithImplicitUnstructuredMesh(m);
 }
 
 MEDCMeshMultiLev::MEDCMeshMultiLev(const MEDCMeshMultiLev& other):MEDStructuredMeshMultiLev(other),_coords(other._coords)
@@ -1283,6 +1377,9 @@ std::vector<int> MEDCMeshMultiLev::getNodeGridStructure() const
 
 MEDMeshMultiLev *MEDCMeshMultiLev::prepare() const
 {
+  MEDMeshMultiLev *retSpecific(0);
+  if(prepareForImplicitUnstructuredMeshCase(retSpecific))
+    return retSpecific;
   const DataArrayInt *pfl(0),*nr(_node_reduction);
   if(!_pfls.empty())
     pfl=_pfls[0];
@@ -1391,15 +1488,18 @@ MEDCurveLinearMeshMultiLev::MEDCurveLinearMeshMultiLev(const MEDFileCurveLinearM
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : null input pointer !");
   if(gts.size()!=1 || pfls.size()!=1)
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : lengthes of gts and pfls must be equal to one !");
-  int mdim(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(m->getMeshDimension()));
-  if(mdim!=gts[0])
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : the unique geo type is invalid regarding meshdim !");
-  DataArrayDouble *coords(const_cast<DataArrayDouble *>(m->getMesh()->getCoords()));
-  if(!coords)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : no coords set !");
-  coords->incrRef();
-  _coords=coords;
-  _structure=m->getMesh()->getNodeGridStructure();
+  INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(m->getMeshDimension()));
+  if(gt==gts[0])
+    {
+      DataArrayDouble *coords(const_cast<DataArrayDouble *>(m->getMesh()->getCoords()));
+      if(!coords)
+        throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : no coords set !");
+      coords->incrRef();
+      _coords=coords;
+      _structure=m->getMesh()->getNodeGridStructure();
+    }
+  else
+    dealWithImplicitUnstructuredMesh(m);
 }
 
 MEDCurveLinearMeshMultiLev::MEDCurveLinearMeshMultiLev(const MEDCurveLinearMeshMultiLev& other):MEDStructuredMeshMultiLev(other),_coords(other._coords),_structure(other._structure)
@@ -1413,6 +1513,9 @@ std::vector<int> MEDCurveLinearMeshMultiLev::getNodeGridStructure() const
 
 MEDMeshMultiLev *MEDCurveLinearMeshMultiLev::prepare() const
 {
+  MEDMeshMultiLev *retSpecific(0);
+  if(prepareForImplicitUnstructuredMeshCase(retSpecific))
+    return retSpecific;
   const DataArrayInt *pfl(0),*nr(_node_reduction);
   if(!_pfls.empty())
     pfl=_pfls[0];
@@ -1500,6 +1603,11 @@ MEDFileField1TSStructItem2::MEDFileField1TSStructItem2(INTERP_KERNEL::Normalized
 
 void MEDFileField1TSStructItem2::checkWithMeshStructForCells(const MEDFileMeshStruct *mst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs)
 {
+  if(!mst->doesManageGeoType(_geo_type))
+    {
+      MEDFileMeshStruct *mstUnConstCasted(const_cast<MEDFileMeshStruct *>(mst));
+      mstUnConstCasted->appendIfImplicitType(_geo_type);
+    }
   int nbOfEnt=mst->getNumberOfElemsOfGeoType(_geo_type);
   checkInRange(nbOfEnt,1,globs);
 }