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Thank you to Yutaka Nishizawa for having report this bug (SALOME forum).
[tools/medcoupling.git] / src / MEDCoupling_Swig / MEDCouplingCommon.i
index d59771988cf30ac3ea2292bef01194473795a5fe..52461a4fc2eb88802d626bea3a02a55857dfc96e 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-// Copyright (C) 2007-2016  CEA/DEN, EDF R&D
+// Copyright (C) 2017  CEA/DEN, EDF R&D
 //
 // This library is free software; you can redistribute it and/or
 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
@@ -18,8 +18,6 @@
 //
 // Author : Anthony Geay (EDF R&D)
 
-%module MEDCoupling
-
 #ifdef WITH_DOCSTRINGS
 %include MEDCoupling_doc.i
 #endif
@@ -363,6 +361,7 @@ using namespace INTERP_KERNEL;
 %newobject MEDCoupling::MEDCouplingUMesh::getBoundingBoxForBBTreeFast;
 %newobject MEDCoupling::MEDCouplingUMesh::getBoundingBoxForBBTree2DQuadratic;
 %newobject MEDCoupling::MEDCouplingUMesh::getBoundingBoxForBBTree1DQuadratic;
+%newobject MEDCoupling::MEDCouplingUMesh::convertDegeneratedCellsAndRemoveFlatOnes;
 %newobject MEDCoupling::MEDCouplingUMeshCellByTypeEntry::__iter__;
 %newobject MEDCoupling::MEDCouplingUMeshCellEntry::__iter__;
 %newobject MEDCoupling::MEDCoupling1GTUMesh::New;
@@ -461,6 +460,8 @@ using namespace INTERP_KERNEL;
 %feature("unref") MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE "$this->decrRef();"
 %feature("unref") MEDCouplingFieldDiscretizationKriging "$this->decrRef();"
 %feature("unref") MEDCouplingFieldDouble "$this->decrRef();"
+%feature("unref") MEDCouplingFieldFloat "$this->decrRef();"
+%feature("unref") MEDCouplingFieldInt "$this->decrRef();"
 %feature("unref") MEDCouplingMultiFields "$this->decrRef();"
 %feature("unref") MEDCouplingFieldTemplate "$this->decrRef();"
 %feature("unref") MEDCouplingMultiFields "$this->decrRef();"
@@ -964,12 +965,12 @@ namespace MEDCoupling
           return self->checkTypeConsistencyAndContig(code,idsPerType);
         }
 
-        PyObject *splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+        PyObject *splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, bool smartPflKiller=true) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
         {
           std::vector<int> code;
           std::vector<DataArrayInt *> idsInPflPerType;
           std::vector<DataArrayInt *> idsPerType;
-          self->splitProfilePerType(profile,code,idsInPflPerType,idsPerType);
+          self->splitProfilePerType(profile,code,idsInPflPerType,idsPerType,smartPflKiller);
           PyObject *ret=PyTuple_New(3);
           //
           if(code.size()%3!=0)
@@ -1226,6 +1227,9 @@ namespace MEDCoupling
     
     void deletePack(const int i, const int j) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     
+    void deleteSimplePack(const int i) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    void deleteSimplePacks(const DataArrayInt* idx) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    
     %extend 
     {
       MEDCouplingSkyLineArray() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
@@ -1309,6 +1313,13 @@ namespace MEDCoupling
           self->replaceSimplePack(idx, vpack.data(), vpack.data()+vpack.size());
         }
         
+      void replaceSimplePacks(const DataArrayInt* idx, PyObject *listePacks) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+        {
+          std::vector<const DataArrayInt*> packs;
+          convertFromPyObjVectorOfObj<const MEDCoupling::DataArrayInt*>(listePacks,SWIGTYPE_p_MEDCoupling__DataArrayInt,"DataArrayInt",packs);
+          self->replaceSimplePacks(idx, packs);
+        }
+        
       void replacePack(const int superIdx, const int idx, PyObject *pack) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
         {
           std::vector<int> vpack;
@@ -1502,8 +1513,8 @@ namespace MEDCoupling
                DataArrayDoubleTuple *aa,*aa2;
                std::vector<double> bb,bb2;
                int sw;
-               const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingPointSet::findNodesOnLine : 1st paramater for point.";
-               const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingPointSet::findNodesOnLine : 2nd paramater for vector.";
+               const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingPointSet::findNodesOnLine : 1st parameter for point.";
+               const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingPointSet::findNodesOnLine : 2nd parameter for vector.";
                const double *p=convertObjToPossibleCpp5_Safe(pt,sw,val,a,aa,bb,msg,1,spaceDim,true);
                const double *v=convertObjToPossibleCpp5_Safe(vec,sw,val2,a2,aa2,bb2,msg2,1,spaceDim,true);
                std::vector<int> nodes;
@@ -1521,8 +1532,8 @@ namespace MEDCoupling
                DataArrayDoubleTuple *aa,*aa2;
                std::vector<double> bb,bb2;
                int sw;
-               const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingPointSet::findNodesOnPlane : 1st paramater for point.";
-               const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingPointSet::findNodesOnPlane : 2nd paramater for vector.";
+               const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingPointSet::findNodesOnPlane : 1st parameter for point.";
+               const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingPointSet::findNodesOnPlane : 2nd parameter for vector.";
                const double *p=convertObjToPossibleCpp5_Safe(pt,sw,val,a,aa,bb,msg,1,spaceDim,true);
                const double *v=convertObjToPossibleCpp5_Safe(vec,sw,val2,a2,aa2,bb2,msg2,1,spaceDim,true);
                std::vector<int> nodes;
@@ -1962,6 +1973,7 @@ namespace MEDCoupling
     void convertQuadraticCellsToLinear() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     DataArrayInt *convertLinearCellsToQuadratic(int conversionType=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     void convertDegeneratedCells() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    DataArrayInt *convertDegeneratedCellsAndRemoveFlatOnes() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     bool areOnlySimplexCells() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     MEDCouplingFieldDouble *getEdgeRatioField() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     MEDCouplingFieldDouble *getAspectRatioField() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
@@ -2379,6 +2391,14 @@ namespace MEDCoupling
           }
       }
 
+      void attractSeg3MidPtsAroundNodes(double ratio, PyObject *nodeIds) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+      {
+        int szArr,sw,iTypppArr;
+        std::vector<int> stdvecTyyppArr;
+        const int *nodeIdsPtr(convertIntStarLikePyObjToCppIntStar(nodeIds,sw,szArr,iTypppArr,stdvecTyyppArr));
+        self->attractSeg3MidPtsAroundNodes(ratio,nodeIdsPtr,nodeIdsPtr+szArr);
+      }
+
       PyObject *getLevArrPerCellTypes(PyObject *li) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
       {
         int sz;
@@ -2923,8 +2943,8 @@ namespace MEDCoupling
         DataArrayDoubleTuple *aa,*aa2;
         std::vector<double> bb,bb2;
         int sw;
-        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::buildSlice3D : 1st paramater for origin.";
-        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::buildSlice3D : 2nd paramater for vector.";
+        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::buildSlice3D : 1st parameter for origin.";
+        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::buildSlice3D : 2nd parameter for vector.";
         const double *orig=convertObjToPossibleCpp5_Safe(origin,sw,val,a,aa,bb,msg,1,spaceDim,true);
         const double *vect=convertObjToPossibleCpp5_Safe(vec,sw,val2,a2,aa2,bb2,msg2,1,spaceDim,true);
         //
@@ -2946,8 +2966,8 @@ namespace MEDCoupling
         DataArrayDoubleTuple *aa,*aa2;
         std::vector<double> bb,bb2;
         int sw;
-        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::buildSlice3DSurf : 1st paramater for origin.";
-        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::buildSlice3DSurf : 2nd paramater for vector.";
+        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::buildSlice3DSurf : 1st parameter for origin.";
+        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::buildSlice3DSurf : 2nd parameter for vector.";
         const double *orig=convertObjToPossibleCpp5_Safe(origin,sw,val,a,aa,bb,msg,1,spaceDim,true);
         const double *vect=convertObjToPossibleCpp5_Safe(vec,sw,val2,a2,aa2,bb2,msg2,1,spaceDim,true);
         //
@@ -2966,8 +2986,8 @@ namespace MEDCoupling
         DataArrayDoubleTuple *aa,*aa2;
         std::vector<double> bb,bb2;
         int sw;
-        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::clipSingle3DCellByPlane : 1st paramater for origin.";
-        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::clipSingle3DCellByPlane : 2nd paramater for vector.";
+        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::clipSingle3DCellByPlane : 1st parameter for origin.";
+        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::clipSingle3DCellByPlane : 2nd parameter for vector.";
         const double *orig=convertObjToPossibleCpp5_Safe(origin,sw,val,a,aa,bb,msg,1,3,true);
         const double *vect=convertObjToPossibleCpp5_Safe(vec,sw,val2,a2,aa2,bb2,msg2,1,3,true);
         MCAuto<MEDCouplingUMesh> ret(self->clipSingle3DCellByPlane(orig,vect,eps));
@@ -2984,8 +3004,8 @@ namespace MEDCoupling
         DataArrayDoubleTuple *aa,*aa2;
         std::vector<double> bb,bb2;
         int sw;
-        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::getCellIdsCrossingPlane : 1st paramater for origin.";
-        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::getCellIdsCrossingPlane : 2nd paramater for vector.";
+        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::getCellIdsCrossingPlane : 1st parameter for origin.";
+        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingUMesh::getCellIdsCrossingPlane : 2nd parameter for vector.";
         const double *orig=convertObjToPossibleCpp5_Safe(origin,sw,val,a,aa,bb,msg,1,spaceDim,true);
         const double *vect=convertObjToPossibleCpp5_Safe(vec,sw,val2,a2,aa2,bb2,msg2,1,spaceDim,true);
         return self->getCellIdsCrossingPlane(orig,vect,eps);
@@ -3976,11 +3996,25 @@ namespace MEDCoupling
          }
        }
   };
+
+  template<class T>
+ class MEDCouplingFieldT : public MEDCoupling::MEDCouplingField
+  {
+  public:
+    TypeOfTimeDiscretization getTimeDiscretization() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+  protected:
+    MEDCouplingFieldT();
+    ~MEDCouplingFieldT();
+  };
+
+  %template(MEDCouplingFieldTdouble) MEDCoupling::MEDCouplingFieldT<double>;
+  %template(MEDCouplingFieldTfloat) MEDCoupling::MEDCouplingFieldT<float>;
+  %template(MEDCouplingFieldTint) MEDCoupling::MEDCouplingFieldT<int>;
   
   class MEDCouplingFieldInt;
   class MEDCouplingFieldFloat;
   
-  class MEDCouplingFieldDouble : public MEDCoupling::MEDCouplingField
+  class MEDCouplingFieldDouble : public MEDCouplingFieldT<double>
   {
   public:
     static MEDCouplingFieldDouble *New(TypeOfField type, TypeOfTimeDiscretization td=ONE_TIME);
@@ -4003,7 +4037,6 @@ namespace MEDCoupling
     MEDCouplingFieldDouble *buildNewTimeReprFromThis(TypeOfTimeDiscretization td, bool deepCopy) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     MEDCouplingFieldDouble *nodeToCellDiscretization() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     MEDCouplingFieldDouble *cellToNodeDiscretization() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    TypeOfTimeDiscretization getTimeDiscretization() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     double getIJ(int tupleId, int compoId) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     double getIJK(int cellId, int nodeIdInCell, int compoId) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     void synchronizeTimeWithMesh() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
@@ -4412,8 +4445,8 @@ namespace MEDCoupling
         std::vector<double> bb,bb2;
         int sw;
         int spaceDim=3;
-        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingFieldDouble::extractSlice3D : 1st paramater for origin.";
-        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingFieldDouble::extractSlice3D : 2nd paramater for vector.";
+        const char msg[]="Python wrap of MEDCouplingFieldDouble::extractSlice3D : 1st parameter for origin.";
+        const char msg2[]="Python wrap of MEDCouplingFieldDouble::extractSlice3D : 2nd parameter for vector.";
         const double *orig=convertObjToPossibleCpp5_Safe(origin,sw,val,a,aa,bb,msg,1,spaceDim,true);
         const double *vect=convertObjToPossibleCpp5_Safe(vec,sw,val2,a2,aa2,bb2,msg2,1,spaceDim,true);
         //
@@ -5183,7 +5216,7 @@ namespace MEDCoupling
        }
   };
 
-  class MEDCouplingFieldInt : public MEDCouplingField
+  class MEDCouplingFieldInt : public MEDCouplingFieldT<int>
   {
   public:
     static MEDCouplingFieldInt *New(TypeOfField type, TypeOfTimeDiscretization td=ONE_TIME);
@@ -5285,7 +5318,7 @@ namespace MEDCoupling
     }
   };
 
-  class MEDCouplingFieldFloat : public MEDCouplingField
+  class MEDCouplingFieldFloat : public MEDCouplingFieldT<float>
   {
   public:
     static MEDCouplingFieldFloat *New(TypeOfField type, TypeOfTimeDiscretization td=ONE_TIME);
@@ -6000,16 +6033,16 @@ def MEDCoupling1DGTUMeshReduce(self):
     return MEDCouplingStdReduceFunct,(MEDCoupling1DGTUMesh,((),(self.__getstate__()),))
 def MEDCouplingFieldDoubleReduce(self):
     self.checkConsistencyLight()
-    d={0:(self.getTypeOfField(),self.getTimeDiscretization())}
-    return MEDCouplingStdReduceFunct,(MEDCouplingFieldDouble,((d,),(self.__getstate__()),))
+    d=(self.getTypeOfField(),self.getTimeDiscretization())
+    return MEDCouplingStdReduceFunct,(MEDCouplingFieldDouble,(d,(self.__getstate__()),))
 def MEDCouplingFieldIntReduce(self):
     self.checkConsistencyLight()
-    d={0:(self.getTypeOfField(),self.getTimeDiscretization())}
-    return MEDCouplingStdReduceFunct,(MEDCouplingFieldInt,((d,),(self.__getstate__()),))
+    d=(self.getTypeOfField(),self.getTimeDiscretization())
+    return MEDCouplingStdReduceFunct,(MEDCouplingFieldInt,(d,(self.__getstate__()),))
 def MEDCouplingFieldFloatReduce(self):
     self.checkConsistencyLight()
-    d={0:(self.getTypeOfField(),self.getTimeDiscretization())}
-    return MEDCouplingStdReduceFunct,(MEDCouplingFieldFloat,((d,),(self.__getstate__()),))
+    d=(self.getTypeOfField(),self.getTimeDiscretization())
+    return MEDCouplingStdReduceFunct,(MEDCouplingFieldFloat,(d,(self.__getstate__()),))
 %}
 
 %pythoncode %{