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Addition of new reference coords including degenerated cells.
[modules/med.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingPointSet.hxx
index 0d8614044fce8502c6078cff22ea0dc5c26dde62..f63360d3fa8bc04084892d6853c6da6f15d5b2db 100644 (file)
@@ -60,10 +60,10 @@ namespace ParaMEDMEM
     MEDCOUPLING_EXPORT const DataArrayDouble *getCoords() const { return _coords; }
     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getCoords() { return _coords; }
     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getCoordinatesAndOwner() const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT void copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other);
+    MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT void checkDeepEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
                                                  DataArrayInt *&cellCor, DataArrayInt *&nodeCor) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
     MEDCOUPLING_EXPORT void checkDeepEquivalOnSameNodesWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
@@ -71,47 +71,47 @@ namespace ParaMEDMEM
     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCoordsEqualIfNotWhy(const MEDCouplingPointSet& other, double prec, std::string& reason) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCoordsEqual(const MEDCouplingPointSet& other, double prec) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCoordsEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingPointSet& other, double prec) const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *deepCpyConnectivityOnly() const throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *deepCpyConnectivityOnly() const = 0;
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other) = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *mergeNodes(double precision, bool& areNodesMerged, int& newNbOfNodes);
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *mergeNodes2(double precision, bool& areNodesMerged, int& newNbOfNodes);
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *mergeMyselfWithOnSameCoords(const MEDCouplingPointSet *other) const = 0;
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void computeNodeIdsAlg(std::vector<bool>& nodeIdsInUse) const throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
-    MEDCOUPLING_EXPORT void getCoordinatesOfNode(int nodeId, std::vector<double>& coo) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void computeNodeIdsAlg(std::vector<bool>& nodeIdsInUse) const = 0;
+    MEDCOUPLING_EXPORT void getCoordinatesOfNode(int nodeId, std::vector<double>& coo) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *buildPermArrayForMergeNode(double precision, int limitNodeId, bool& areNodesMerged, int& newNbOfNodes) const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsNearPoint(const double *pos, double eps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsNearPoints(const double *pos, int nbOfPoints, double eps, DataArrayInt *& c, DataArrayInt *& cI) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsNearPoint(const double *pos, double eps) const;
+    MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsNearPoints(const double *pos, int nbOfPoints, double eps, DataArrayInt *& c, DataArrayInt *& cI) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT void findCommonNodes(double prec, int limitNodeId, DataArrayInt *&comm, DataArrayInt *&commIndex) const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void findCommonCells(int compType, int startCellId, DataArrayInt *& commonCellsArr, DataArrayInt *& commonCellsIArr) const throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void findCommonCells(int compType, int startCellId, DataArrayInt *& commonCellsArr, DataArrayInt *& commonCellsIArr) const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *buildNewNumberingFromCommonNodesFormat(const DataArrayInt *comm, const DataArrayInt *commIndex,
                                                                             int& newNbOfNodes) const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT void getBoundingBox(double *bbox) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void getBoundingBox(double *bbox) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT void zipCoords();
     MEDCOUPLING_EXPORT double getCaracteristicDimension() const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT void recenterForMaxPrecision(double eps) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void recenterForMaxPrecision(double eps);
     MEDCOUPLING_EXPORT void rotate(const double *center, const double *vector, double angle);
     MEDCOUPLING_EXPORT void translate(const double *vector);
     MEDCOUPLING_EXPORT void scale(const double *point, double factor);
-    MEDCOUPLING_EXPORT void changeSpaceDimension(int newSpaceDim, double dftVal=0.) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT void tryToShareSameCoords(const MEDCouplingPointSet& other, double epsilon) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT void duplicateNodesInCoords(const int *nodeIdsToDuplicateBg, const int *nodeIdsToDuplicateEnd) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void tryToShareSameCoordsPermute(const MEDCouplingPointSet& other, double epsilon) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT void findNodesOnPlane(const double *pt, const double *vec, double eps, std::vector<int>& nodes) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT void findNodesOnLine(const double *pt, const double *vec, double eps, std::vector<int>& nodes) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayDouble *MergeNodesArray(const MEDCouplingPointSet *m1, const MEDCouplingPointSet *m2) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayDouble *MergeNodesArray(const std::vector<const MEDCouplingPointSet *>& ms) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void changeSpaceDimension(int newSpaceDim, double dftVal=0.);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void tryToShareSameCoords(const MEDCouplingPointSet& other, double epsilon);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void duplicateNodesInCoords(const int *nodeIdsToDuplicateBg, const int *nodeIdsToDuplicateEnd);
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void tryToShareSameCoordsPermute(const MEDCouplingPointSet& other, double epsilon);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void findNodesOnPlane(const double *pt, const double *vec, double eps, std::vector<int>& nodes) const;
+    MEDCOUPLING_EXPORT void findNodesOnLine(const double *pt, const double *vec, double eps, std::vector<int>& nodes) const;
+    MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayDouble *MergeNodesArray(const MEDCouplingPointSet *m1, const MEDCouplingPointSet *m2);
+    MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayDouble *MergeNodesArray(const std::vector<const MEDCouplingPointSet *>& ms);
     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingPointSet *BuildInstanceFromMeshType(MEDCouplingMeshType type);
     MEDCOUPLING_EXPORT static void Rotate2DAlg(const double *center, double angle, int nbNodes, double *coords);
     MEDCOUPLING_EXPORT static void Rotate3DAlg(const double *center, const double *vect, double angle, int nbNodes, double *coords);
-    MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *ComputeNbOfInteractionsWithSrcCells(const MEDCouplingPointSet *srcMesh, const MEDCouplingPointSet *trgMesh, double eps) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *ComputeNbOfInteractionsWithSrcCells(const MEDCouplingPointSet *srcMesh, const MEDCouplingPointSet *trgMesh, double eps);
     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPart(const int *start, const int *end) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPartRange(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPartRangeAndReduceNodes(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt*& arr) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPartRange(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds) const;
+    MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPartRangeAndReduceNodes(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt*& arr) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellIdsFullyIncludedInNodeIds(const int *partBg, const int *partEnd) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellIdsLyingOnNodes(const int *begin, const int *end, bool fullyIn) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelf(const int *start, const int *end, bool keepCoords=true) const;
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelf2(int start, int end, int step, bool keepCoords=true) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelf2(int start, int end, int step, bool keepCoords=true) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords2(int start, int end, int step) const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfNode(const int *start, const int *end, bool fullyIn) const;
@@ -119,29 +119,28 @@ namespace ParaMEDMEM
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *findBoundaryNodes() const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildBoundaryMesh(bool keepCoords) const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual int getNumberOfNodesInCell(int cellId) const = 0;
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N) = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodes(const int *newNodeNumbers, int newNbOfNodes);
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodes2(const int *newNodeNumbers, int newNbOfNodes);
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const = 0;
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void checkFullyDefined() const throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void checkFullyDefined() const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT void getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT void resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT void serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const;
     MEDCOUPLING_EXPORT void unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2,
                                             const std::vector<std::string>& littleStrings);
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayDouble *getBoundingBoxForBBTree() const = 0;
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayDouble *getBoundingBoxForBBTree(double arcDetEps=1e-12) const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const double *bbox, double eps) const = 0;
     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const INTERP_KERNEL::DirectedBoundingBox& bbox, double eps) = 0;
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *zipCoordsTraducer() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *zipConnectivityTraducer(int compType, int startCellId=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
-    MEDCOUPLING_EXPORT virtual void getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *zipCoordsTraducer();
+    MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *zipConnectivityTraducer(int compType, int startCellId=0);
     //tools
   public:
     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCellsFrom2MeshEqual(const MEDCouplingPointSet *other, int cellId, double prec) const;
   protected:
-    MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
+    MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const;
     MEDCOUPLING_EXPORT static bool intersectsBoundingBox(const double* bb1, const double* bb2, int dim, double eps);
     MEDCOUPLING_EXPORT static bool intersectsBoundingBox(const INTERP_KERNEL::DirectedBoundingBox& bb1, const double* bb2, int dim, double eps);
     MEDCOUPLING_EXPORT void rotate2D(const double *center, double angle);