Salome HOME
Addition of new reference coords including degenerated cells.
[modules/med.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingMesh.cxx
index 1615842b6dce8d4504489b985a2a1c302aeb8a17..181288b4bf3190809ef665a52266f65c02a909b3 100644 (file)
@@ -37,13 +37,13 @@ MEDCouplingMesh::MEDCouplingMesh():_time(0.),_iteration(-1),_order(-1)
 {
 }
 
-MEDCouplingMesh::MEDCouplingMesh(const MEDCouplingMesh& other):_name(other._name),_description(other._description),
+MEDCouplingMesh::MEDCouplingMesh(const MEDCouplingMesh& other):RefCountObject(other),_name(other._name),_description(other._description),
                                                                _time(other._time),_iteration(other._iteration),
                                                                _order(other._order),_time_unit(other._time_unit)
 {
 }
 
-std::size_t MEDCouplingMesh::getHeapMemorySize() const
+std::size_t MEDCouplingMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
 {
   return _name.capacity()+_description.capacity()+_time_unit.capacity();
 }
@@ -56,7 +56,7 @@ bool MEDCouplingMesh::isStructured() const
   return getType()==CARTESIAN;
 }
 
-bool MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+bool MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const
 {
   if(!other)
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy : other instance is NULL !");
@@ -106,7 +106,7 @@ bool MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec,
  *  \param [in] prec - precision value used to compare node coordinates.
  *  \return bool - \c true if the two meshes are equal, \c false else.
  */
-bool MEDCouplingMesh::isEqual(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+bool MEDCouplingMesh::isEqual(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const
 {
   std::string tmp;
   return isEqualIfNotWhy(other,prec,tmp);
@@ -224,7 +224,7 @@ DataArrayInt *MEDCouplingMesh::getCellIdsFullyIncludedInNodeIds(const int *partB
 /*!
  * This method checks fastly that \a this and \a other are equal. All common checks are done here.
  */
-void MEDCouplingMesh::checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+void MEDCouplingMesh::checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const
 {
   if(!other)
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMesh::checkFastEquivalWith : input mesh is null !");
@@ -252,13 +252,26 @@ bool MEDCouplingMesh::areCompatibleForMerge(const MEDCouplingMesh *other) const
 
 /*!
  * This method is equivalent to MEDCouplingMesh::buildPart method except that here the cell ids are specified using slice \a beginCellIds \a endCellIds and \a stepCellIds.
+ * \b WARNING , there is a big difference compared to MEDCouplingMesh::buildPart method.
+ * If the input range is equal all cells in \a this, \a this is returned !
+ *
+ * \return a new ref to be managed by the caller. Warning this ref can be equal to \a this if input slice is exactly equal to the whole cells in the same order.
  *
  * \sa MEDCouplingMesh::buildPart
  */
-MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::buildPartRange(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::buildPartRange(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds) const
 {
-  MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellIds=DataArrayInt::Range(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
-  return buildPart(cellIds->begin(),cellIds->end());
+  if(beginCellIds==0 && endCellIds==getNumberOfCells() && stepCellIds==1)
+    {
+      MEDCouplingMesh *ret(const_cast<MEDCouplingMesh *>(this));
+      ret->incrRef();
+      return ret;
+    }
+  else
+    {
+      MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellIds=DataArrayInt::Range(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
+      return buildPart(cellIds->begin(),cellIds->end());
+    }
 }
 
 /*!
@@ -266,7 +279,7 @@ MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::buildPartRange(int beginCellIds, int endCellId
  *
  * \sa MEDCouplingMesh::buildPartAndReduceNodes
  */
-MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::buildPartRangeAndReduceNodes(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt*& arr) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::buildPartRangeAndReduceNodes(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt*& arr) const
 {
   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellIds=DataArrayInt::Range(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
   return buildPartAndReduceNodes(cellIds->begin(),cellIds->end(),arr);
@@ -301,7 +314,7 @@ MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic(TypeOfField t, int nbO
  * This method copyies all tiny strings from other (name and components name).
  * @throw if other and this have not same mesh type.
  */
-void MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+void MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other)
 {
   if(!other)
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom : input mesh is null !");
@@ -314,7 +327,7 @@ void MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(IN
  * This method copies all attributes that are \b NOT arrays in this.
  * All tiny attributes not usefully for state of \a this are ignored.
  */
-void MEDCouplingMesh::copyTinyInfoFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+void MEDCouplingMesh::copyTinyInfoFrom(const MEDCouplingMesh *other)
 {
   copyTinyStringsFrom(other);
   _time=other->_time;
@@ -361,7 +374,7 @@ void MEDCouplingMesh::copyTinyInfoFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(INTER
  *  \ref cpp_mcmesh_fillFromAnalytic "Here is a C++ example".<br>
  *  \ref  py_mcmesh_fillFromAnalytic "Here is a Python example".
  */
-MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic(TypeOfField t, int nbOfComp, const char *func) const
+MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic(TypeOfField t, int nbOfComp, const std::string& func) const
 {
   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> ret=MEDCouplingFieldDouble::New(t,ONE_TIME);
   ret->setMesh(this);
@@ -376,7 +389,7 @@ MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic(TypeOfField t, int nbO
  * function to coordinates of field location points (defined by the given field type).
  * For example, if \a t == ParaMEDMEM::ON_CELLS, the function is applied to cell
  * barycenters. This method differs from
- * \ref MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic(TypeOfField t, int nbOfComp, const char *func) const "fillFromAnalytic()"
+ * \ref MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic(TypeOfField t, int nbOfComp, const std::string& func) const "fillFromAnalytic()"
  * by the way how variable
  * names, used in the function, are associated with components of coordinates of field
  * location points; here, a variable name corresponding to a component is retrieved from
@@ -411,7 +424,7 @@ MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic(TypeOfField t, int nbO
  *  \ref cpp_mcmesh_fillFromAnalytic2 "Here is a C++ example".<br>
  *  \ref  py_mcmesh_fillFromAnalytic2 "Here is a Python example".
  */
-MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic2(TypeOfField t, int nbOfComp, const char *func) const
+MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic2(TypeOfField t, int nbOfComp, const std::string& func) const
 {
   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> ret=MEDCouplingFieldDouble::New(t,ONE_TIME);
   ret->setMesh(this);
@@ -462,7 +475,7 @@ MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic2(TypeOfField t, int nb
  *  \ref cpp_mcmesh_fillFromAnalytic3 "Here is a C++ example".<br>
  *  \ref  py_mcmesh_fillFromAnalytic3 "Here is a Python example".
  */
-MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic3(TypeOfField t, int nbOfComp, const std::vector<std::string>& varsOrder, const char *func) const
+MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic3(TypeOfField t, int nbOfComp, const std::vector<std::string>& varsOrder, const std::string& func) const
 {
   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> ret=MEDCouplingFieldDouble::New(t,ONE_TIME);
   ret->setMesh(this);
@@ -484,7 +497,7 @@ MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMesh::fillFromAnalytic3(TypeOfField t, int nb
  *          is no more needed.
  *  \throw If the meshes are of different mesh type.
  */
-MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::MergeMeshes(const MEDCouplingMesh *mesh1, const MEDCouplingMesh *mesh2) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::MergeMeshes(const MEDCouplingMesh *mesh1, const MEDCouplingMesh *mesh2)
 {
   if(!mesh1)
     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMesh::MergeMeshes : first parameter is an empty mesh !");
@@ -511,7 +524,7 @@ MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::MergeMeshes(const MEDCouplingMesh *mesh1, cons
  *  \throw If \a meshes[ *i* ]->getMeshDimension() < 0.
  *  \throw If the \a meshes are of different dimension (getMeshDimension()).
  */
-MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::MergeMeshes(std::vector<const MEDCouplingMesh *>& meshes) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::MergeMeshes(std::vector<const MEDCouplingMesh *>& meshes)
 {
   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> > ms1(meshes.size());
   std::vector< const MEDCouplingUMesh * > ms2(meshes.size());
@@ -540,7 +553,7 @@ MEDCouplingMesh *MEDCouplingMesh::MergeMeshes(std::vector<const MEDCouplingMesh
  * 
  * \throw if type is equal to \c INTERP_KERNEL::NORM_ERROR or to an unexisting geometric type.
  */
-INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingMesh::GetCorrespondingPolyType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingMesh::GetCorrespondingPolyType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type)
 {
   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
   return cm.getCorrespondingPolyType();
@@ -553,7 +566,7 @@ INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingMesh::GetCorrespondingPolyType(INTE
  * \throw if type is dynamic as \c INTERP_KERNEL::NORM_POLYHED , \c INTERP_KERNEL::NORM_POLYGON , \c INTERP_KERNEL::NORM_QPOLYG
  * \throw if type is equal to \c INTERP_KERNEL::NORM_ERROR or to an unexisting geometric type.
  */
-int MEDCouplingMesh::GetNumberOfNodesOfGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+int MEDCouplingMesh::GetNumberOfNodesOfGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type)
 {
   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
   if(cm.isDynamic())
@@ -567,13 +580,13 @@ int MEDCouplingMesh::GetNumberOfNodesOfGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCe
  * 
  * \throw if type is equal to \c INTERP_KERNEL::NORM_ERROR or to an unexisting geometric type.
  */
-bool MEDCouplingMesh::IsStaticGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+bool MEDCouplingMesh::IsStaticGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type)
 {
   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
   return !cm.isDynamic();
 }
 
-bool MEDCouplingMesh::IsLinearGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+bool MEDCouplingMesh::IsLinearGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type)
 {
   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
   return !cm.isQuadratic();
@@ -585,7 +598,7 @@ bool MEDCouplingMesh::IsLinearGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType ty
  * 
  * \throw if type is equal to \c INTERP_KERNEL::NORM_ERROR or to an unexisting geometric type.
  */
-int MEDCouplingMesh::GetDimensionOfGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+int MEDCouplingMesh::GetDimensionOfGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type)
 {
   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
   return (int) cm.getDimension();
@@ -597,7 +610,7 @@ int MEDCouplingMesh::GetDimensionOfGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellTy
  * 
  * \throw if type is equal to \c INTERP_KERNEL::NORM_ERROR or to an unexisting geometric type.
  */
-const char *MEDCouplingMesh::GetReprOfGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+const char *MEDCouplingMesh::GetReprOfGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type)
 {
   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
   return cm.getRepr();
@@ -669,7 +682,7 @@ void MEDCouplingMesh::getCellsContainingPoints(const double *pos, int nbOfPoints
  *  \param [in] fileName - the name of the file to write in.
  *  \throw If \a fileName is not a writable file.
  */
-void MEDCouplingMesh::writeVTK(const char *fileName, bool isBinary) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+void MEDCouplingMesh::writeVTK(const std::string& fileName, bool isBinary) const
 {
   std::string cda,pda;
   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayByte> byteArr;
@@ -678,18 +691,18 @@ void MEDCouplingMesh::writeVTK(const char *fileName, bool isBinary) const throw(
   writeVTKAdvanced(fileName,cda,pda,byteArr);
 }
 
-void MEDCouplingMesh::writeVTKAdvanced(const char *fileName, const std::string& cda, const std::string& pda, DataArrayByte *byteData) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
+void MEDCouplingMesh::writeVTKAdvanced(const std::string& fileName, const std::string& cda, const std::string& pda, DataArrayByte *byteData) const
 {
-  std::ofstream ofs(fileName);
+  std::ofstream ofs(fileName.c_str());
   ofs << "<VTKFile type=\""  << getVTKDataSetType() << "\" version=\"0.1\" byte_order=\"" << MEDCouplingByteOrderStr() << "\">\n";
   writeVTKLL(ofs,cda,pda,byteData);
   if(byteData)
     {
       ofs << "<AppendedData encoding=\"raw\">\n_1234";
       ofs << std::flush; ofs.close();
-      std::ofstream ofs2(fileName,std::ios_base::binary | std::ios_base::app);
+      std::ofstream ofs2(fileName.c_str(),std::ios_base::binary | std::ios_base::app);
       ofs2.write(byteData->begin(),byteData->getNbOfElems()); ofs2 << std::flush; ofs2.close();
-      std::ofstream ofs3(fileName,std::ios_base::app); ofs3 << "\n</AppendedData>\n</VTKFile>\n"; ofs3.close();
+      std::ofstream ofs3(fileName.c_str(),std::ios_base::app); ofs3 << "\n</AppendedData>\n</VTKFile>\n"; ofs3.close();
     }
   else
     {