Salome HOME
Addition of QUAD8 to pass MEDReader tests.
[tools/medcoupling.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingMemArray.cxx
index ed815f4aff4a62f6a7435cb81038b3dff1fe73e2..ff071afa6900e094d3a01acf462312d08df7ede6 100644 (file)
@@ -1959,7 +1959,7 @@ bool DataArrayDouble::areIncludedInMe(const DataArrayDouble *other, double prec,
  *               [ \a commIndex[1], \a commIndex[2] ). \a commIndex->getNumberOfTuples()-1
  *               gives the number of groups of coincident tuples.
  *  \throw If \a this is not allocated.
- *  \throw If the number of components is not in [1,2,3].
+ *  \throw If the number of components is not in [1,2,3,4].
  *
  *  \ref cpp_mcdataarraydouble_findcommontuples "Here is a C++ example".
  *
@@ -1970,14 +1970,17 @@ void DataArrayDouble::findCommonTuples(double prec, int limitTupleId, DataArrayI
 {
   checkAllocated();
   int nbOfCompo=getNumberOfComponents();
-  if ((nbOfCompo<1) || (nbOfCompo>3)) //test before work
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findCommonTuples : Unexpected spacedim of coords. Must be 1, 2 or 3.");
+  if ((nbOfCompo<1) || (nbOfCompo>4)) //test before work
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findCommonTuples : Unexpected spacedim of coords. Must be 1, 2, 3 or 4.");
   
   int nbOfTuples=getNumberOfTuples();
   //
   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> c(DataArrayInt::New()),cI(DataArrayInt::New()); c->alloc(0,1); cI->pushBackSilent(0);
   switch(nbOfCompo)
     {
+    case 4:
+      findCommonTuplesAlg<4>(begin(),nbOfTuples,limitTupleId,prec,c,cI);
+      break;
     case 3:
       findCommonTuplesAlg<3>(begin(),nbOfTuples,limitTupleId,prec,c,cI);
       break;
@@ -1988,7 +1991,7 @@ void DataArrayDouble::findCommonTuples(double prec, int limitTupleId, DataArrayI
       findCommonTuplesAlg<1>(begin(),nbOfTuples,limitTupleId,prec,c,cI);
       break;
     default:
-      throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findCommonTuples : nb of components managed are 1,2 and 3 ! not implemented for other number of components !");
+      throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findCommonTuples : nb of components managed are 1,2,3 and 4 ! not implemented for other number of components !");
     }
   comm=c.retn();
   commIndex=cI.retn();
@@ -2185,7 +2188,7 @@ DataArrayInt *DataArrayDouble::computeNbOfInteractionsWith(const DataArrayDouble
  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble that the caller
  *          is to delete using decrRef() as it is no more needed.
  *  \throw If \a this is not allocated.
- *  \throw If the number of components is not in [1,2,3].
+ *  \throw If the number of components is not in [1,2,3,4].
  *
  *  \ref py_mcdataarraydouble_getdifferentvalues "Here is a Python example".
  */
@@ -3293,25 +3296,50 @@ double DataArrayDouble::norm2() const
 
 /*!
  * Returns the maximum norm of the vector defined by \a this array.
+ * This method works even if the number of components is diferent from one.
+ * If the number of elements in \a this is 0, -1. is returned.
  *  \return double - the value of the maximum norm, i.e.
- *          the maximal absolute value among values of \a this array.
+ *          the maximal absolute value among values of \a this array (whatever its number of components).
  *  \throw If \a this is not allocated.
  */
 double DataArrayDouble::normMax() const
 {
   checkAllocated();
-  double ret=-1.;
-  std::size_t nbOfElems=getNbOfElems();
-  const double *pt=getConstPointer();
+  double ret(-1.);
+  std::size_t nbOfElems(getNbOfElems());
+  const double *pt(getConstPointer());
   for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,pt++)
     {
-      double val=std::abs(*pt);
+      double val(std::abs(*pt));
       if(val>ret)
         ret=val;
     }
   return ret;
 }
 
+/*!
+ * Returns the minimum norm (absolute value) of the vector defined by \a this array.
+ * This method works even if the number of components is diferent from one.
+ * If the number of elements in \a this is 0, std::numeric_limits<double>::max() is returned.
+ *  \return double - the value of the minimum norm, i.e.
+ *          the minimal absolute value among values of \a this array (whatever its number of components).
+ *  \throw If \a this is not allocated.
+ */
+double DataArrayDouble::normMin() const
+{
+  checkAllocated();
+  double ret(std::numeric_limits<double>::max());
+  std::size_t nbOfElems(getNbOfElems());
+  const double *pt(getConstPointer());
+  for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,pt++)
+    {
+      double val(std::abs(*pt));
+      if(val<ret)
+        ret=val;
+    }
+  return ret;
+}
+
 /*!
  * Accumulates values of each component of \a this array.
  *  \param [out] res - an array of length \a this->getNumberOfComponents(), allocated 
@@ -4007,17 +4035,44 @@ void DataArrayDouble::sortPerTuple(bool asc)
 
 /*!
  * Converts every value of \a this array to its absolute value.
- *  \throw If \a this is not allocated.
+ * \b WARNING this method is non const. If a new DataArrayDouble instance should be built containing the result of abs DataArrayDouble::computeAbs
+ * should be called instead.
+ *
+ * \throw If \a this is not allocated.
+ * \sa DataArrayDouble::computeAbs
  */
 void DataArrayDouble::abs()
 {
   checkAllocated();
-  double *ptr=getPointer();
-  std::size_t nbOfElems=getNbOfElems();
+  double *ptr(getPointer());
+  std::size_t nbOfElems(getNbOfElems());
   std::transform(ptr,ptr+nbOfElems,ptr,std::ptr_fun<double,double>(fabs));
   declareAsNew();
 }
 
+/*!
+ * This method builds a new instance of \a this object containing the result of std::abs applied of all elements in \a this.
+ * This method is a const method (that do not change any values in \a this) contrary to  DataArrayDouble::abs method.
+ *
+ * \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
+ *         same number of tuples and component as \a this array.
+ *         The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
+ *         needed.
+ * \throw If \a this is not allocated.
+ * \sa DataArrayDouble::abs
+ */
+DataArrayDouble *DataArrayDouble::computeAbs() const
+{
+  checkAllocated();
+  DataArrayDouble *newArr(DataArrayDouble::New());
+  int nbOfTuples(getNumberOfTuples());
+  int nbOfComp(getNumberOfComponents());
+  newArr->alloc(nbOfTuples,nbOfComp);
+  std::transform(begin(),end(),newArr->getPointer(),std::ptr_fun<double,double>(fabs));
+  newArr->copyStringInfoFrom(*this);
+  return newArr;
+}
+
 /*!
  * Apply a liner function to a given component of \a this array, so that
  * an array element <em>(x)</em> becomes \f$ a * x + b \f$.
@@ -4540,6 +4595,8 @@ DataArrayDouble *DataArrayDouble::Aggregate(const DataArrayDouble *a1, const Dat
  * the number of component in the result array is same as that of each of given arrays.
  * Info on components is copied from the first of the given arrays. Number of components
  * in the given arrays must be  the same.
+ * If the number of non null of elements in \a arr is equal to one the returned object is a copy of it
+ * not the object itself.
  *  \param [in] arr - a sequence of arrays to include in the result array.
  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble.
  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
@@ -8338,13 +8395,14 @@ DataArrayIntIterator *DataArrayInt::iterator()
  *          array using decrRef() as it is no more needed.
  *  \throw If \a this is not allocated.
  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1.
+ *  \sa DataArrayInt::getIdsEqualTuple
  */
 DataArrayInt *DataArrayInt::getIdsEqual(int val) const
 {
   checkAllocated();
   if(getNumberOfComponents()!=1)
     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::getIdsEqual : the array must have only one component, you can call 'rearrange' method before !");
-  const int *cptr=getConstPointer();
+  const int *cptr(getConstPointer());
   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New()); ret->alloc(0,1);
   int nbOfTuples=getNumberOfTuples();
   for(int i=0;i<nbOfTuples;i++,cptr++)
@@ -8367,7 +8425,7 @@ DataArrayInt *DataArrayInt::getIdsNotEqual(int val) const
   checkAllocated();
   if(getNumberOfComponents()!=1)
     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::getIdsNotEqual : the array must have only one component, you can call 'rearrange' method before !");
-  const int *cptr=getConstPointer();
+  const int *cptr(getConstPointer());
   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New()); ret->alloc(0,1);
   int nbOfTuples=getNumberOfTuples();
   for(int i=0;i<nbOfTuples;i++,cptr++)
@@ -8376,6 +8434,45 @@ DataArrayInt *DataArrayInt::getIdsNotEqual(int val) const
   return ret.retn();
 }
 
+/*!
+ * Creates a new DataArrayInt containing IDs (indices) of tuples holding tuple equal to those defined by [ \a tupleBg , \a tupleEnd )
+ * This method is an extension of  DataArrayInt::getIdsEqual method.
+ *
+ *  \param [in] tupleBg - the begin (included) of the input tuple to find within \a this.
+ *  \param [in] tupleEnd - the end (excluded) of the input tuple to find within \a this.
+ *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt. The caller is to delete this
+ *          array using decrRef() as it is no more needed.
+ *  \throw If \a this is not allocated.
+ *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != std::distance(tupleBg,tupleEnd).
+ * \throw If \a this->getNumberOfComponents() is equal to 0.
+ * \sa DataArrayInt::getIdsEqual
+ */
+DataArrayInt *DataArrayInt::getIdsEqualTuple(const int *tupleBg, const int *tupleEnd) const
+{
+  std::size_t nbOfCompoExp(std::distance(tupleBg,tupleEnd));
+  checkAllocated();
+  if(getNumberOfComponents()!=(int)nbOfCompoExp)
+    {
+      std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::getIdsEqualTuple : mismatch of number of components. Input tuple has " << nbOfCompoExp << " whereas this array has " << getNumberOfComponents() << " components !";
+      throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
+    }
+  if(nbOfCompoExp==0)
+    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::getIdsEqualTuple : number of components should be > 0 !");
+  MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New()); ret->alloc(0,1);
+  const int *bg(begin()),*end2(end()),*work(begin());
+  while(work!=end2)
+    {
+      work=std::search(work,end2,tupleBg,tupleEnd);
+      if(work!=end2)
+        {
+          std::size_t pos(std::distance(bg,work));
+          if(pos%nbOfCompoExp==0)
+            ret->pushBackSilent(pos/nbOfCompoExp);
+          work++;
+        }
+    }
+  return ret.retn();
+}
 
 /*!
  * Assigns \a newValue to all elements holding \a oldValue within \a this
@@ -8745,6 +8842,8 @@ DataArrayInt *DataArrayInt::Aggregate(const DataArrayInt *a1, const DataArrayInt
  * the number of component in the result array is same as that of each of given arrays.
  * Info on components is copied from the first of the given arrays. Number of components
  * in the given arrays must be  the same.
+ * If the number of non null of elements in \a arr is equal to one the returned object is a copy of it
+ * not the object itself.
  *  \param [in] arr - a sequence of arrays to include in the result array.
  *  \return DataArrayInt * - the new instance of DataArrayInt.
  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
@@ -8899,17 +8998,44 @@ int DataArrayInt::getMinValueInArray() const
 
 /*!
  * Converts every value of \a this array to its absolute value.
- *  \throw If \a this is not allocated.
+ * \b WARNING this method is non const. If a new DataArrayInt instance should be built containing the result of abs DataArrayInt::computeAbs
+ * should be called instead.
+ *
+ * \throw If \a this is not allocated.
+ * \sa DataArrayInt::computeAbs
  */
 void DataArrayInt::abs()
 {
   checkAllocated();
-  int *ptr=getPointer();
-  std::size_t nbOfElems=getNbOfElems();
+  int *ptr(getPointer());
+  std::size_t nbOfElems(getNbOfElems());
   std::transform(ptr,ptr+nbOfElems,ptr,std::ptr_fun<int,int>(std::abs));
   declareAsNew();
 }
 
+/*!
+ * This method builds a new instance of \a this object containing the result of std::abs applied of all elements in \a this.
+ * This method is a const method (that do not change any values in \a this) contrary to  DataArrayInt::abs method.
+ *
+ * \return DataArrayInt * - the new instance of DataArrayInt containing the
+ *         same number of tuples and component as \a this array.
+ *         The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
+ *         needed.
+ * \throw If \a this is not allocated.
+ * \sa DataArrayInt::abs
+ */
+DataArrayInt *DataArrayInt::computeAbs() const
+{
+  checkAllocated();
+  DataArrayInt *newArr(DataArrayInt::New());
+  int nbOfTuples(getNumberOfTuples());
+  int nbOfComp(getNumberOfComponents());
+  newArr->alloc(nbOfTuples,nbOfComp);
+  std::transform(begin(),end(),newArr->getPointer(),std::ptr_fun<int,int>(std::abs));
+  newArr->copyStringInfoFrom(*this);
+  return newArr;
+}
+
 /*!
  * Apply a liner function to a given component of \a this array, so that
  * an array element <em>(x)</em> becomes \f$ a * x + b \f$.