Salome HOME
On the road
[tools/medcoupling.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingMemArray.cxx
index a9e68fdfd442bad3bd5afa96cdfcccf12e66fdc3..566c0797687b55bd7ccf6a474920ee22e46d64ec 100644 (file)
@@ -16,7 +16,7 @@
 //
 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
 //
-// Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
+// Author : Anthony Geay (EDF R&D)
 
 #include "MEDCouplingMemArray.txx"
 
@@ -45,6 +45,8 @@ template class MEDCoupling::DataArrayTemplateClassic<double>;
 template class MEDCoupling::DataArrayTemplateFP<double>;
 template class MEDCoupling::DataArrayIterator<double>;
 template class MEDCoupling::DataArrayIterator<int>;
+template class MEDCoupling::DataArrayDiscrete<Int32>;
+template class MEDCoupling::DataArrayDiscreteSigned<Int32>;
 
 template<int SPACEDIM>
 void DataArrayDouble::findCommonTuplesAlg(const double *bbox, int nbNodes, int limitNodeId, double prec, DataArrayInt *c, DataArrayInt *cI) const
@@ -807,28 +809,6 @@ DataArrayDouble *DataArrayDouble::deepCopy() const
   return new DataArrayDouble(*this);
 }
 
-/*!
- * Returns either a \a deep or \a shallow copy of this array. For more info see
- * \ref MEDCouplingArrayBasicsCopyDeep and \ref MEDCouplingArrayBasicsCopyShallow.
- *  \param [in] dCpy - if \a true, a deep copy is returned, else, a shallow one.
- *  \return DataArrayDouble * - either a new instance of DataArrayDouble (if \a dCpy
- *          == \a true) or \a this instance (if \a dCpy == \a false).
- */
-DataArrayDouble *DataArrayDouble::performCopyOrIncrRef(bool dCpy) const
-{
-  return DataArrayTemplateClassic<double>::PerformCopyOrIncrRef(dCpy,*this);
-}
-
-/*!
- * Assign zero to all values in \a this array. To know more on filling arrays see
- * \ref MEDCouplingArrayFill.
- * \throw If \a this is not allocated.
- */
-void DataArrayDouble::fillWithZero()
-{
-  fillWithValue(0.);
-}
-
 /*!
  * Checks that \a this array is consistently **increasing** or **decreasing** in value,
  * with at least absolute difference value of |\a eps| at each step.
@@ -2415,28 +2395,6 @@ DataArrayDouble *DataArrayDouble::magnitude() const
   return ret;
 }
 
-/*!
- * Computes for each tuple the sum of number of components values in the tuple and return it.
- * 
- * \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
- *          same number of tuples as \a this array and one component.
- *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
- *          needed.
- *  \throw If \a this is not allocated.
- */
-DataArrayDouble *DataArrayDouble::sumPerTuple() const
-{
-  checkAllocated();
-  int nbOfComp(getNumberOfComponents()),nbOfTuple(getNumberOfTuples());
-  MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
-  ret->alloc(nbOfTuple,1);
-  const double *src(getConstPointer());
-  double *dest(ret->getPointer());
-  for(int i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=nbOfComp)
-    *dest=std::accumulate(src,src+nbOfComp,0.);
-  return ret.retn();
-}
-
 /*!
  * Computes the maximal value within every tuple of \a this array.
  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
@@ -3752,50 +3710,9 @@ int DataArrayInt::getHashCode() const
  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCopyDeep.
  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt.
  */
-DataArrayInt *DataArrayInt::deepCopy() const
+DataArrayInt32 *DataArrayInt32::deepCopy() const
 {
-  return new DataArrayInt(*this);
-}
-
-/*!
- * Returns either a \a deep or \a shallow copy of this array. For more info see
- * \ref MEDCouplingArrayBasicsCopyDeep and \ref MEDCouplingArrayBasicsCopyShallow.
- *  \param [in] dCpy - if \a true, a deep copy is returned, else, a shallow one.
- *  \return DataArrayInt * - either a new instance of DataArrayInt (if \a dCpy
- *          == \a true) or \a this instance (if \a dCpy == \a false).
- */
-DataArrayInt *DataArrayInt::performCopyOrIncrRef(bool dCpy) const
-{
-  return DataArrayTemplateClassic<int>::PerformCopyOrIncrRef(dCpy,*this);
-}
-
-/*!
- * Assign zero to all values in \a this array. To know more on filling arrays see
- * \ref MEDCouplingArrayFill.
- * \throw If \a this is not allocated.
- */
-void DataArrayInt::fillWithZero()
-{
-  fillWithValue(0);
-}
-
-/*!
- * Set all values in \a this array so that the i-th element equals to \a init + i
- * (i starts from zero). To know more on filling arrays see \ref MEDCouplingArrayFill.
- *  \param [in] init - value to assign to the first element of array.
- *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1
- *  \throw If \a this is not allocated.
- */
-void DataArrayInt::iota(int init)
-{
-  checkAllocated();
-  if(getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::iota : works only for arrays with only one component, you can call 'rearrange' method before !");
-  int *ptr=getPointer();
-  int ntuples=getNumberOfTuples();
-  for(int i=0;i<ntuples;i++)
-    ptr[i]=init+i;
-  declareAsNew();
+  return new DataArrayInt32(*this);
 }
 
 /*!
@@ -4371,375 +4288,6 @@ MCAuto< MapKeyVal<int> > DataArrayInt::invertArrayN2O2O2NOptimized() const
   return ret;
 }
 
-/*!
- * Equivalent to DataArrayInt::isEqual except that if false the reason of
- * mismatch is given.
- * 
- * \param [in] other the instance to be compared with \a this
- * \param [out] reason In case of inequality returns the reason.
- * \sa DataArrayInt::isEqual
- */
-bool DataArrayInt::isEqualIfNotWhy(const DataArrayInt& other, std::string& reason) const
-{
-  if(!areInfoEqualsIfNotWhy(other,reason))
-    return false;
-  return _mem.isEqual(other._mem,0,reason);
-}
-
-/*!
- * Checks if \a this and another DataArrayInt are fully equal. For more info see
- * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompare.
- *  \param [in] other - an instance of DataArrayInt to compare with \a this one.
- *  \return bool - \a true if the two arrays are equal, \a false else.
- */
-bool DataArrayInt::isEqual(const DataArrayInt& other) const
-{
-  std::string tmp;
-  return isEqualIfNotWhy(other,tmp);
-}
-
-/*!
- * Checks if values of \a this and another DataArrayInt are equal. For more info see
- * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompare.
- *  \param [in] other - an instance of DataArrayInt to compare with \a this one.
- *  \return bool - \a true if the values of two arrays are equal, \a false else.
- */
-bool DataArrayInt::isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayInt& other) const
-{
-  std::string tmp;
-  return _mem.isEqual(other._mem,0,tmp);
-}
-
-/*!
- * Checks if values of \a this and another DataArrayInt are equal. Comparison is
- * performed on sorted value sequences.
- * For more info see\ref MEDCouplingArrayBasicsCompare.
- *  \param [in] other - an instance of DataArrayInt to compare with \a this one.
- *  \return bool - \a true if the sorted values of two arrays are equal, \a false else.
- */
-bool DataArrayInt::isEqualWithoutConsideringStrAndOrder(const DataArrayInt& other) const
-{
-  MCAuto<DataArrayInt> a=deepCopy();
-  MCAuto<DataArrayInt> b=other.deepCopy();
-  a->sort();
-  b->sort();
-  return a->isEqualWithoutConsideringStr(*b);
-}
-
-/*!
- * This method compares content of input vector \a v and \a this.
- * If for each id in \a this v[id]==True and for all other ids id2 not in \a this v[id2]==False, true is returned.
- * For performance reasons \a this is expected to be sorted ascendingly. If not an exception will be thrown.
- *
- * \param [in] v - the vector of 'flags' to be compared with \a this.
- *
- * \throw If \a this is not sorted ascendingly.
- * \throw If \a this has not exactly one component.
- * \throw If \a this is not allocated.
- */
-bool DataArrayInt::isFittingWith(const std::vector<bool>& v) const
-{
-  checkAllocated();
-  if(getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::isFittingWith : number of components of this should be equal to one !");
-  const int *w(begin()),*end2(end());
-  int refVal=-std::numeric_limits<int>::max();
-  int i=0;
-  std::vector<bool>::const_iterator it(v.begin());
-  for(;it!=v.end();it++,i++)
-    {
-      if(*it)
-        {
-          if(w!=end2)
-            {
-              if(*w++==i)
-                {
-                  if(i>refVal)
-                    refVal=i;
-                  else
-                    {
-                      std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::isFittingWith : At pos #" << std::distance(begin(),w-1) << " this is not sorted ascendingly !";
-                      throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
-                    }
-                }
-              else
-                return false;
-            }
-          else
-            return false;
-        }
-    }
-  return w==end2;
-}
-
-/*!
- * This method assumes that \a this has one component and is allocated. This method scans all tuples in \a this and for all tuple equal to \a val
- * put True to the corresponding entry in \a vec.
- * \a vec is expected to be with the same size than the number of tuples of \a this.
- *
- *  \sa DataArrayInt::switchOnTupleNotEqualTo.
- */
-void DataArrayInt::switchOnTupleEqualTo(int val, std::vector<bool>& vec) const
-{
-  checkAllocated();
-  if(getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::switchOnTupleEqualTo : number of components of this should be equal to one !");
-  int nbOfTuples(getNumberOfTuples());
-  if(nbOfTuples!=(int)vec.size())
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::switchOnTupleEqualTo : number of tuples of this should be equal to size of input vector of bool !");
-  const int *pt(begin());
-  for(int i=0;i<nbOfTuples;i++)
-    if(pt[i]==val)
-      vec[i]=true;
-}
-
-/*!
- * This method assumes that \a this has one component and is allocated. This method scans all tuples in \a this and for all tuple different from \a val
- * put True to the corresponding entry in \a vec.
- * \a vec is expected to be with the same size than the number of tuples of \a this.
- * 
- *  \sa DataArrayInt::switchOnTupleEqualTo.
- */
-void DataArrayInt::switchOnTupleNotEqualTo(int val, std::vector<bool>& vec) const
-{
-  checkAllocated();
-  if(getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::switchOnTupleNotEqualTo : number of components of this should be equal to one !");
-  int nbOfTuples(getNumberOfTuples());
-  if(nbOfTuples!=(int)vec.size())
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::switchOnTupleNotEqualTo : number of tuples of this should be equal to size of input vector of bool !");
-  const int *pt(begin());
-  for(int i=0;i<nbOfTuples;i++)
-    if(pt[i]!=val)
-      vec[i]=true;
-}
-
-/*!
- * Computes for each tuple the sum of number of components values in the tuple and return it.
- * 
- * \return DataArrayInt * - the new instance of DataArrayInt containing the
- *          same number of tuples as \a this array and one component.
- *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
- *          needed.
- *  \throw If \a this is not allocated.
- */
-DataArrayInt *DataArrayInt::sumPerTuple() const
-{
-  checkAllocated();
-  int nbOfComp(getNumberOfComponents()),nbOfTuple(getNumberOfTuples());
-  MCAuto<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
-  ret->alloc(nbOfTuple,1);
-  const int *src(getConstPointer());
-  int *dest(ret->getPointer());
-  for(int i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=nbOfComp)
-    *dest=std::accumulate(src,src+nbOfComp,0);
-  return ret.retn();
-}
-
-/*!
- * Checks that \a this array is consistently **increasing** or **decreasing** in value.
- * If not an exception is thrown.
- *  \param [in] increasing - if \a true, the array values should be increasing.
- *  \throw If sequence of values is not strictly monotonic in agreement with \a
- *         increasing arg.
- *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1.
- *  \throw If \a this is not allocated.
- */
-void DataArrayInt::checkMonotonic(bool increasing) const
-{
-  if(!isMonotonic(increasing))
-    {
-      if (increasing)
-        throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::checkMonotonic : 'this' is not INCREASING monotonic !");
-      else
-        throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::checkMonotonic : 'this' is not DECREASING monotonic !");
-    }
-}
-
-/*!
- * Checks that \a this array is consistently **increasing** or **decreasing** in value.
- *  \param [in] increasing - if \a true, array values should be increasing.
- *  \return bool - \a true if values change in accordance with \a increasing arg.
- *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1.
- *  \throw If \a this is not allocated.
- */
-bool DataArrayInt::isMonotonic(bool increasing) const
-{
-  checkAllocated();
-  if(getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::isMonotonic : only supported with 'this' array with ONE component !");
-  int nbOfElements=getNumberOfTuples();
-  const int *ptr=getConstPointer();
-  if(nbOfElements==0)
-    return true;
-  int ref=ptr[0];
-  if(increasing)
-    {
-      for(int i=1;i<nbOfElements;i++)
-        {
-          if(ptr[i]>=ref)
-            ref=ptr[i];
-          else
-            return false;
-        }
-    }
-  else
-    {
-      for(int i=1;i<nbOfElements;i++)
-        {
-          if(ptr[i]<=ref)
-            ref=ptr[i];
-          else
-            return false;
-        }
-    }
-  return true;
-}
-
-/*!
- * This method check that array consistently INCREASING or DECREASING in value.
- */
-bool DataArrayInt::isStrictlyMonotonic(bool increasing) const
-{
-  checkAllocated();
-  if(getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::isStrictlyMonotonic : only supported with 'this' array with ONE component !");
-  int nbOfElements=getNumberOfTuples();
-  const int *ptr=getConstPointer();
-  if(nbOfElements==0)
-    return true;
-  int ref=ptr[0];
-  if(increasing)
-    {
-      for(int i=1;i<nbOfElements;i++)
-        {
-          if(ptr[i]>ref)
-            ref=ptr[i];
-          else
-            return false;
-        }
-    }
-  else
-    {
-      for(int i=1;i<nbOfElements;i++)
-        {
-          if(ptr[i]<ref)
-            ref=ptr[i];
-          else
-            return false;
-        }
-    }
-  return true;
-}
-
-/*!
- * This method check that array consistently INCREASING or DECREASING in value.
- */
-void DataArrayInt::checkStrictlyMonotonic(bool increasing) const
-{
-  if(!isStrictlyMonotonic(increasing))
-    {
-      if (increasing)
-        throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::checkStrictlyMonotonic : 'this' is not strictly INCREASING monotonic !");
-      else
-        throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::checkStrictlyMonotonic : 'this' is not strictly DECREASING monotonic !");
-    }
-}
-
-/*!
- * Creates a new one-dimensional DataArrayInt of the same size as \a this and a given
- * one-dimensional arrays that must be of the same length. The result array describes
- * correspondence between \a this and \a other arrays, so that 
- * <em> other.getIJ(i,0) == this->getIJ(ret->getIJ(i),0)</em>. If such a permutation is
- * not possible because some element in \a other is not in \a this, an exception is thrown.
- *  \param [in] other - an array to compute permutation to.
- *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt, which is a permutation array
- * from \a this to \a other. The caller is to delete this array using decrRef() as it is
- * no more needed.
- *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1.
- *  \throw If \a other->getNumberOfComponents() != 1.
- *  \throw If \a this->getNumberOfTuples() != \a other->getNumberOfTuples().
- *  \throw If \a other includes a value which is not in \a this array.
- * 
- *  \if ENABLE_EXAMPLES
- *  \ref cpp_mcdataarrayint_buildpermutationarr "Here is a C++ example".
- *
- *  \ref py_mcdataarrayint_buildpermutationarr "Here is a Python example".
- *  \endif
- */
-DataArrayInt *DataArrayInt::buildPermutationArr(const DataArrayInt& other) const
-{
-  checkAllocated();
-  if(getNumberOfComponents()!=1 || other.getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::buildPermutationArr : 'this' and 'other' have to have exactly ONE component !");
-  int nbTuple=getNumberOfTuples();
-  other.checkAllocated();
-  if(nbTuple!=other.getNumberOfTuples())
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::buildPermutationArr : 'this' and 'other' must have the same number of tuple !");
-  MCAuto<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
-  ret->alloc(nbTuple,1);
-  ret->fillWithValue(-1);
-  const int *pt=getConstPointer();
-  std::map<int,int> mm;
-  for(int i=0;i<nbTuple;i++)
-    mm[pt[i]]=i;
-  pt=other.getConstPointer();
-  int *retToFill=ret->getPointer();
-  for(int i=0;i<nbTuple;i++)
-    {
-      std::map<int,int>::const_iterator it=mm.find(pt[i]);
-      if(it==mm.end())
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::buildPermutationArr : Arrays mismatch : element (" << pt[i] << ") in 'other' not findable in 'this' !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
-        }
-      retToFill[i]=(*it).second;
-    }
-  return ret.retn();
-}
-
-/*!
- * Elements of \a partOfThis are expected to be included in \a this.
- * The returned array \a ret is so that this[ret]==partOfThis
- *
- * For example, if \a this array contents are [9,10,0,6,4,11,3,8] and if \a partOfThis contains [6,0,11,8]
- * the return array will contain [3,2,5,7].
- *
- * \a this is expected to be a 1 compo allocated array.
- * \param [in] partOfThis - A 1 compo allocated array
- * \return - A newly allocated array to be dealed by caller having the same number of tuples than \a partOfThis.
- * \throw if two same element is present twice in \a this
- * \throw if an element in \a partOfThis is \b NOT in \a this.
- */
-DataArrayInt *DataArrayInt::indicesOfSubPart(const DataArrayInt& partOfThis) const
-{
-  if(getNumberOfComponents()!=1 || partOfThis.getNumberOfComponents()!=1)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::indicesOfSubPart : this and input array must be one component array !");
-  checkAllocated(); partOfThis.checkAllocated();
-  int thisNbTuples(getNumberOfTuples()),nbTuples(partOfThis.getNumberOfTuples());
-  const int *thisPt(begin()),*pt(partOfThis.begin());
-  MCAuto<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
-  ret->alloc(nbTuples,1);
-  int *retPt(ret->getPointer());
-  std::map<int,int> m;
-  for(int i=0;i<thisNbTuples;i++,thisPt++)
-    m[*thisPt]=i;
-  if(m.size()!=thisNbTuples)
-    throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::indicesOfSubPart : some elements appears more than once !");
-  for(int i=0;i<nbTuples;i++,retPt++,pt++)
-    {
-      std::map<int,int>::const_iterator it(m.find(*pt));
-      if(it!=m.end())
-        *retPt=(*it).second;
-      else
-        {
-          std::ostringstream oss; oss << "DataArrayInt::indicesOfSubPart : At pos #" << i << " of input array value is " << *pt << " not in this !";
-          throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str());
-        }
-    }
-  return ret.retn();
-}
-
 /*!
  * Returns a new DataArrayInt containing a renumbering map in "Old to New" mode.
  * This map, if applied to \a this array, would make it sorted. For example, if
@@ -7292,7 +6840,7 @@ DataArrayIntIterator::DataArrayIntIterator(DataArrayInt *da):DataArrayIterator<i
 {
 }
 
-DataArrayIntTuple::DataArrayIntTuple(int *pt, int nbOfComp):DataArrayTuple<int>(pt,nbOfComp)
+DataArrayInt32Tuple::DataArrayInt32Tuple(int *pt, int nbOfComp):DataArrayTuple<int>(pt,nbOfComp)
 {
 }