Salome HOME
Updated copyright comment
[tools/medcoupling.git] / src / INTERP_KERNELTest / MeshTestToolkit.txx
index 6121329e7f65b04f7caf63917a4bcd047f8e05f0..063885089d989f4b767f9f23537a76695172bf07 100644 (file)
@@ -1,9 +1,9 @@
-// Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
+// Copyright (C) 2007-2024  CEA, EDF
 //
 // This library is free software; you can redistribute it and/or
 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
 // License as published by the Free Software Foundation; either
-// version 2.1 of the License.
+// version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
 //
 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
 //
 #include "TestInterpKernelUtils.hxx"
 
-#include "MEDNormalizedUnstructuredMesh.hxx"
-#include "MEDNormalizedUnstructuredMesh.txx"
-
 #include "MeshTestToolkit.hxx"
-#include "MEDMEM_Mesh.hxx"
-#include "MEDMEM_Field.hxx"
-#include "MEDMEM_Support.hxx"
+
+#include "MEDFileMesh.hxx"
+
+#include "MEDCouplingNormalizedUnstructuredMesh.hxx"
+#include "MEDCouplingNormalizedUnstructuredMesh.txx"
+#include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
 
 #include "Interpolation3DSurf.hxx"
 #include "Interpolation2D.txx"
 #include "Interpolation3D.txx"
 
-#include <iostream>
 #include <map>
-#include <vector>
 #include <cmath>
+#include <vector>
+#include <cstring>
+#include <iostream>
 #include <algorithm>
 
 
-// levels : 
+// levels :
 // 1 - titles and volume results
 // 2 - symmetry / diagonal results and intersection matrix output
 // 3 - empty
@@ -48,9 +49,7 @@
 #include <cppunit/extensions/HelperMacros.h>
 
 //#define VOL_PREC 1.0e-6
-
-using namespace MEDMEM;
-using namespace MED_EN;
+using namespace MEDCoupling;
 using namespace INTERP_KERNEL;
 
 namespace INTERP_TEST
@@ -71,7 +70,7 @@ namespace INTERP_TEST
       {
         if(iter->count(i) != 0.0)
           {
-            std::map<int, double>::const_iterator iter2 = iter->find(i);
+            std::map<mcIdType, double>::const_iterator iter2 = iter->find(i);
             vol += fabs(iter2->second);
           }
       }
@@ -90,8 +89,8 @@ namespace INTERP_TEST
   double MeshTestToolkit<SPACEDIM,MESHDIM>::sumCol(const IntersectionMatrix& m, int i) const
   {
     double vol = 0.0;
-    const std::map<int, double>& col = m[i];
-    for(std::map<int, double>::const_iterator iter = col.begin() ; iter != col.end() ; ++iter)
+    const std::map<mcIdType, double>& col = m[i];
+    for(std::map<mcIdType, double>::const_iterator iter = col.begin() ; iter != col.end() ; ++iter)
       {
         vol += fabs(iter->second);
       }
@@ -105,22 +104,10 @@ namespace INTERP_TEST
    * @param tab    pointer to double[no. elements of mesh] array in which to store the volumes
    */
   template <int SPACEDIM, int MESHDIM>
-  void MeshTestToolkit<SPACEDIM,MESHDIM>::getVolumes(MEDMEM::MESH& mesh, double* tab) const
+  void MeshTestToolkit<SPACEDIM,MESHDIM>::getVolumes(MEDCoupling::MEDCouplingUMesh& mesh, double *tab) const
   {
-    const SUPPORT *sup=mesh.getSupportOnAll( MED_CELL );
-    FIELD<double>* f;
-    switch (MESHDIM)
-      {
-      case 2:
-        f=mesh.getArea(sup);
-        break;
-      case 3:
-        f=mesh.getVolume(sup);
-        break;
-      }
-    const double *tabS = f->getValue();
-    std::copy(tabS,tabS+mesh.getNumberOfElements(MED_CELL,MED_ALL_ELEMENTS),tab);
-    f->removeReference();
+    MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> vol=mesh.getMeasureField(true);
+    std::copy(vol->getArray()->begin(),vol->getArray()->end(),tab);
   }
 
   /**
@@ -136,7 +123,7 @@ namespace INTERP_TEST
     std::vector<double> volumes;
     for(IntersectionMatrix::const_iterator iter = m.begin() ; iter != m.end() ; ++iter)
       {
-        for(std::map<int, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
+        for(std::map<mcIdType, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
           {
             volumes.push_back(fabs(iter2->second));
           }
@@ -151,7 +138,7 @@ namespace INTERP_TEST
   }
 
   /**
-   * Verifies if for a given intersection matrix the sum of each row is equal to the volumes 
+   * Verifies if for a given intersection matrix the sum of each row is equal to the volumes
    * of the corresponding source elements and the sum of each column is equal to the volumes
    * of the corresponding target elements. This will be true as long as the meshes correspond
    * to the same geometry. The equalities are in the "epsilon-sense", making sure the relative
@@ -163,17 +150,17 @@ namespace INTERP_TEST
    * @return true if the condition is verified, false if not.
    */
   template <int SPACEDIM, int MESHDIM>
-  bool MeshTestToolkit<SPACEDIM,MESHDIM>::testVolumes(const IntersectionMatrix& m,  MEDMEM::MESH& sMesh,  MEDMEM::MESH& tMesh) const
+  bool MeshTestToolkit<SPACEDIM,MESHDIM>::testVolumes(const IntersectionMatrix& m,  MEDCoupling::MEDCouplingUMesh& sMesh,  MEDCoupling::MEDCouplingUMesh& tMesh) const
   {
     bool ok = true;
 
     // source elements
-    double* sVol = new double[sMesh.getNumberOfElements(MED_CELL,MED_ALL_ELEMENTS)];
+    double* sVol = new double[sMesh.getNumberOfCells()];
     getVolumes(sMesh, sVol);
 
-    for(int i = 0; i < sMesh.getNumberOfElements(MED_CELL,MED_ALL_ELEMENTS); ++i)
+    for(int i = 0; i < sMesh.getNumberOfCells(); ++i)
       {
-        const double sum_row = sumRow(m, i+1);
+        const double sum_row = sumRow(m, i);
         if(!epsilonEqualRelative(sum_row, fabs(sVol[i]), _precision))
           {
             LOG(1, "Source volume inconsistent : vol of cell " << i << " = " << sVol[i] << " but the row sum is " << sum_row );
@@ -183,9 +170,9 @@ namespace INTERP_TEST
       }
 
     // target elements
-    double* tVol = new double[tMesh.getNumberOfElements(MED_CELL,MED_ALL_ELEMENTS)];
+    double* tVol = new double[tMesh.getNumberOfCells()];
     getVolumes(tMesh, tVol);
-    for(int i = 0; i < tMesh.getNumberOfElements(MED_CELL,MED_ALL_ELEMENTS); ++i)
+    for(int i = 0; i < tMesh.getNumberOfCells(); ++i)
       {
         const double sum_col = sumCol(m, i);
         if(!epsilonEqualRelative(sum_col,fabs(tVol[i]), _precision))
@@ -216,14 +203,14 @@ namespace INTERP_TEST
     int i = 0;
     for(IntersectionMatrix::const_iterator iter = m1.begin() ; iter != m1.end() ; ++iter)
       {
-        for(std::map<int, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
+        for(std::map<mcIdType, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
           {
-            int j = iter2->first;
-            if(m2.at(j-1).count(i+1) == 0)
+            mcIdType j = iter2->first;
+            if(m2.at(j).count(i) == 0)
               {
                 if(!epsilonEqual(iter2->second, 0.0, _precision))
                   {
-                    LOG(2, "V1( " << i << ", " << j << ") exists, but V2( " << j - 1 << ", " << i + 1 << ") " << " does not " );
+                    LOG(2, "V1( " << i << ", " << j << ") exists, but V2( " << j << ", " << i << ") " << " does not " );
                     LOG(2, "(" << i << ", " << j << ") fails");
                     compatitable = false;
                   }
@@ -258,17 +245,17 @@ namespace INTERP_TEST
 
     for(IntersectionMatrix::const_iterator iter = m1.begin() ; iter != m1.end() ; ++iter)
       {
-        for(std::map<int, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
+        for(std::map<mcIdType, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
           {
-            int j = iter2->first;
+            mcIdType j = iter2->first;
             const double v1 = fabs(iter2->second);
             //if(m2[j - 1].count(i+1) > 0)
             //  {
-            std::map<int, double> theMap =  m2.at(j-1);
-            const double v2 = fabs(theMap[i + 1]); 
+            std::map<mcIdType, double> theMap =  m2.at(j);
+            const double v2 = fabs(theMap[i]);
             if(v1 != v2)
               {
-                LOG(2, "V1( " << i << ", " << j << ") = " << v1 << " which is different from V2( " << j - 1 << ", " << i + 1 << ") = " << v2 << " | diff = " << v1 - v2 );
+                LOG(2, "V1( " << i << ", " << j << ") = " << v1 << " which is different from V2( " << j << ", " << i << ") = " << v2 << " | diff = " << v1 - v2 );
                 if(!epsilonEqualRelative(v1, v2, _precision))
                   {
                     LOG(2, "(" << i << ", " << j << ") fails");
@@ -280,7 +267,7 @@ namespace INTERP_TEST
       }
     if(!isSymmetric)
       {
-        LOG(1, "*** matrices are not symmetric"); 
+        LOG(1, "*** matrices are not symmetric");
       }
     return isSymmetric;
   }
@@ -296,17 +283,17 @@ namespace INTERP_TEST
   bool MeshTestToolkit<SPACEDIM,MESHDIM>::testDiagonal(const IntersectionMatrix& m) const
   {
     LOG(1, "Checking if matrix is diagonal" );
-    int i = 1;
+    int i = 0;
     bool isDiagonal = true;
     for(IntersectionMatrix::const_iterator iter = m.begin() ; iter != m.end() ; ++iter)
       {
-        for(map<int, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
+        for(std::map<mcIdType, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
           {
-            int j = iter2->first;
+            mcIdType j = iter2->first;
             const double vol = iter2->second;
             if(vol != 0.0 && (i != j))
               {
-                LOG(2, "V( " << i - 1 << ", " << j << ") = " << vol << " which is not zero" );
+                LOG(2, "V( " << i << ", " << j << ") = " << vol << " which is not zero" );
                 if(!epsilonEqual(vol, 0.0, _precision))
                   {
                     LOG(2, "(" << i << ", " << j << ") fails");
@@ -332,12 +319,12 @@ namespace INTERP_TEST
   void MeshTestToolkit<SPACEDIM,MESHDIM>::dumpIntersectionMatrix(const IntersectionMatrix& m) const
   {
     int i = 0;
-    std::cout << "Intersection matrix is " << endl;
+    std::cout << "Intersection matrix is " << std::endl;
     for(IntersectionMatrix::const_iterator iter = m.begin() ; iter != m.end() ; ++iter)
       {
-        for(map<int, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
+        for(std::map<mcIdType, double>::const_iterator iter2 = iter->begin() ; iter2 != iter->end() ; ++iter2)
           {
-            std::cout << "V(" << i << ", " << iter2->first << ") = " << iter2->second << endl;
+            std::cout << "V(" << i << ", " << iter2->first << ") = " << iter2->second << std::endl;
           }
         ++i;
       }
@@ -348,9 +335,9 @@ namespace INTERP_TEST
    * Calculates the intersection matrix for two meshes.
    * If the source and target meshes are the same, a CppUnit assertion raised if testVolumes() returns false.
    *
-   * @param  mesh1path   the path to the file containing the source mesh, relative to {$MED_ROOT_DIR}/share/salome/resources/med/
+   * @param  mesh1path   the path to the file containing the source mesh, relative to {$MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/share/resources/med/
    * @param  mesh1       the name of the source mesh
-   * @param  mesh2path   the path to the file containing the target mesh, relative to {$MED_ROOT_DIR}/share/salome/resources/med/
+   * @param  mesh2path   the path to the file containing the target mesh, relative to {$MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/share/resources/med/
    * @param  mesh2       the name of the target mesh
    * @param  m           intersection matrix in which to store the result of the intersection
    */
@@ -360,13 +347,15 @@ namespace INTERP_TEST
     LOG(1, std::endl << "=== -> intersecting src = " << mesh1path << ", target = " << mesh2path );
 
     LOG(5, "Loading " << mesh1 << " from " << mesh1path);
-    MESH sMesh(MED_DRIVER, INTERP_TEST::getResourceFile(mesh1path), mesh1);
+    MCAuto<MEDFileUMesh> sMeshML=MEDFileUMesh::New(INTERP_TEST::getResourceFile(mesh1path).c_str(),mesh1);
+    MCAuto<MEDCouplingUMesh> sMesh=sMeshML->getMeshAtLevel(0);
 
     LOG(5, "Loading " << mesh2 << " from " << mesh2path);
-    MESH tMesh(MED_DRIVER, INTERP_TEST::getResourceFile(mesh2path), mesh2);
+    MCAuto<MEDFileUMesh> tMeshML=MEDFileUMesh::New(INTERP_TEST::getResourceFile(mesh2path).c_str(),mesh2);
+    MCAuto<MEDCouplingUMesh> tMesh=tMeshML->getMeshAtLevel(0);
 
-    MEDNormalizedUnstructuredMesh<SPACEDIM,MESHDIM> sMesh_wrapper(&sMesh);
-    MEDNormalizedUnstructuredMesh<SPACEDIM,MESHDIM> tMesh_wrapper(&tMesh);
+    MEDCouplingNormalizedUnstructuredMesh<SPACEDIM,MESHDIM> sMesh_wrapper(sMesh);
+    MEDCouplingNormalizedUnstructuredMesh<SPACEDIM,MESHDIM> tMesh_wrapper(tMesh);
 
     if (SPACEDIM==2 && MESHDIM==2)
       {
@@ -387,12 +376,12 @@ namespace INTERP_TEST
       }
     else
       {
-        throw MEDEXCEPTION("Wrong dimensions");
+        throw INTERP_KERNEL::Exception("Wrong dimensions");
       }
     // if reflexive, check volumes
     if(strcmp(mesh1path,mesh2path) == 0)
       {
-        const bool row_and_col_sums_ok = testVolumes(m, sMesh, tMesh);
+        const bool row_and_col_sums_ok = testVolumes(m, *sMesh, *tMesh);
         CPPUNIT_ASSERT_EQUAL_MESSAGE("Row or column sums incorrect", true, row_and_col_sums_ok);
         const bool is_diagonal =testDiagonal(m);
         CPPUNIT_ASSERT_EQUAL_MESSAGE("Self intersection matrix is not diagonal", true, is_diagonal);
@@ -408,12 +397,12 @@ namespace INTERP_TEST
    * it will be confirmed that the intersection matrix is diagonal, otherwise the intersection matrices will be
    * calculated once which each mesh as source mesh, and it will be verified that the they are each others' transpose.
    *
-   * @param  mesh1path   the path to the file containing the source mesh, relative to {$MED_ROOT_DIR}/share/salome/resources/med/
+   * @param  mesh1path   the path to the file containing the source mesh, relative to {$MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/share/resources/med/
    * @param  mesh1       the name of the source mesh
-   * @param  mesh2path   the path to the file containing the target mesh, relative to {$MED_ROOT_DIR}/share/salome/resources/med/
+   * @param  mesh2path   the path to the file containing the target mesh, relative to {$MEDCOUPLING_ROOT_DIR}/share/resources/med/
    * @param  mesh2       the name of the target mesh
    * @param  correctVol  the total volume of the intersection of the two meshes
-   * @param  prec        maximum relative error to be tolerated in volume comparisions
+   * @param  prec        maximum relative error to be tolerated in volume comparisons
    * @param  doubleTest  if false, only the test with mesh 1 as the source mesh and mesh 2 as the target mesh will be performed
    *
    */
@@ -431,7 +420,7 @@ namespace INTERP_TEST
     IntersectionMatrix matrix1;
     calcIntersectionMatrix(mesh1path, mesh1, mesh2path, mesh2, matrix1);
 
-#if LOG_LEVEL >= 2 
+#if LOG_LEVEL >= 2
     dumpIntersectionMatrix(matrix1);
 #endif
 
@@ -452,7 +441,7 @@ namespace INTERP_TEST
     else
       {
         IntersectionMatrix matrix2;
-        calcIntersectionMatrix(mesh2path, mesh2, mesh1path, mesh1, matrix2);    
+        calcIntersectionMatrix(mesh2path, mesh2, mesh1path, mesh1, matrix2);
 
 #if LOG_LEVEL >= 2
         dumpIntersectionMatrix(matrix2);
@@ -471,23 +460,23 @@ namespace INTERP_TEST
 
   /**
    * Utility method used to facilitate the call to intersect meshes.
-   * It calls intersectMeshes, using "mesh1.med" as file name for the mesh with name "mesh1" and 
+   * It calls intersectMeshes, using "mesh1.med" as file name for the mesh with name "mesh1" and
    * "mesh2.med" as file name for the mesh with name "mesh2". The rest of the arguments are passed
    * along as they are.
    *
    * @param  mesh1       the name of the source mesh
    * @param  mesh2       the name of the target mesh
    * @param  correctVol  the total volume of the intersection of the two meshes
-   * @param  prec        maximum relative error to be tolerated in volume comparisions
+   * @param  prec        maximum relative error to be tolerated in volume comparisons
    * @param  doubleTest  if false, only the test with mesh 1 as the source mesh and mesh 2 as the target mesh will be performed
    *
    */
   template <int SPACEDIM, int MESHDIM>
   void MeshTestToolkit<SPACEDIM,MESHDIM>::intersectMeshes(const char* mesh1, const char* mesh2, const double correctVol, const double prec, bool doubleTest) const
   {
-    const string path1 = string(mesh1) + string(".med");
+    const std::string path1 = std::string(mesh1) + std::string(".med");
     std::cout << "here :" << path1 << std::endl;
-    const string path2 = string(mesh2) + string(".med");
+    const std::string path2 = std::string(mesh2) + std::string(".med");
 
     intersectMeshes(path1.c_str(), mesh1, path2.c_str(), mesh2, correctVol, prec, doubleTest);
   }