Salome HOME
Adding multi-functions input capabilities (2)
[modules/adao.git] / doc / en / bibliography.rst
index c1543130e054605eb9d3219e2fed3483009ff3d7..31cde69f9a44d1ee993c7c531a2f248851f8b384 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
 ..
-   Copyright (C) 2008-2015 EDF R&D
+   Copyright (C) 2008-2018 EDF R&D
 
    This file is part of SALOME ADAO module.
 
@@ -29,30 +29,68 @@ Bibliography
 
 .. [Argaud09] Argaud J.-P., Bouriquet B., Hunt J., *Data Assimilation from Operational and Industrial Applications to Complex Systems*, Mathematics Today, pp.150-152, October 2009
 
-.. [Bouttier99] Bouttier B., Courtier P., *Data assimilation concepts and methods*, Meteorological Training Course Lecture Series, ECMWF, 1999, http://www.ecmwf.int/sites/default/files/Data%20assimilation%20concepts%20and%20methods.pdf
+.. [Asch16] Asch M., Bocquet M., Nodet M., *Data Assimilation - Methods, Algorithms and Applications*, SIAM, 2016
 
-.. [Bocquet04] Bocquet M., *Introduction aux principes et méthodes de l'assimilation de données en géophysique*, Lecture Notes, 2014, http://cerea.enpc.fr/HomePages/bocquet/Doc/assim-mb.pdf 
+.. [GilBellosta15] Gil Bellosta C. J., *rPython: Package Allowing R to Call Python*, CRAN, 2015, https://cran.r-project.org/web/packages/rPython/ and http://rpython.r-forge.r-project.org/
+
+.. [Bouttier99] Bouttier B., Courtier P., *Data assimilation concepts and methods*, Meteorological Training Course Lecture Series, ECMWF, 1999
+
+.. [Bocquet04] Bocquet M., *Introduction aux principes et méthodes de l'assimilation de données en géophysique*, Lecture Notes, 2014
 
 .. [Buchinsky98] Buchinsky M., *Recent Advances in Quantile Regression Models: A Practical Guidline for Empirical Research*, Journal of Human Resources, 33(1), pp.88-126, 1998
 
+.. [Burgers98] Burgers G., Van Leuween P. J., Evensen G., *Analysis scheme in the Ensemble Kalman Filter*, Monthly Weather Review, 126, 1719–1724, 1998
+
 .. [Byrd95] Byrd R. H., Lu P., Nocedal J., *A Limited Memory Algorithm for Bound Constrained Optimization*, SIAM Journal on Scientific and Statistical Computing, 16(5), pp.1190-1208, 1995
 
 .. [Cade03] Cade B. S., Noon B. R., *A Gentle Introduction to Quantile Regression for Ecologists*, Frontiers in Ecology and the Environment, 1(8), pp.412-420, 2003
 
+.. [Chakraborty08] Chakraborty U.K., *Advances in differential evolution*, Studies in computational intelligence, Vol.143, Springer, 2008
+
+.. [Evensen94] Evensen G., *Sequential data assimilation with a nonlinear quasi-geostrophic model using monte carlo methods to forecast error statistics*, Journal of Geophysical Research, 99(C5), 10,143–10,162, 1994
+
+.. [Evensen03] Evensen G., *The Ensemble Kalman Filter: theoretical formulation and practical implementation*, Seminar on Recent developments in data assimilation for atmosphere and ocean, ECMWF, 8 to 12 September 2003
+
 .. [Ide97] Ide K., Courtier P., Ghil M., Lorenc A. C., *Unified notation for data assimilation: operational, sequential and variational*, Journal of the Meteorological Society of Japan, 75(1B), pp.181-189, 1997
 
+.. [Johnson08] Johnson S. G., *The NLopt nonlinear-optimization package*, http://ab-initio.mit.edu/nlopt
+
 .. [Kalnay03] Kalnay E., *Atmospheric Modeling, Data Assimilation and Predictability*, Cambridge University Press, 2003
 
-.. [Koenker00] Koenker R., Hallock K. F., *Quantile Regression: an Introduction*, 2000, available at http://www.econ.uiuc.edu/~roger/research/intro/intro.html
+.. [Koenker00] Koenker R., Hallock K. F., *Quantile Regression: an Introduction*, 2000, http://www.econ.uiuc.edu/~roger/research/intro/intro.html
 
 .. [Koenker01] Koenker R., Hallock K. F., *Quantile Regression*, Journal of Economic Perspectives, 15(4), pp.143-156, 2001
 
-.. [Morales11] Morales J.L., Nocedal J., *L-BFGS-B: Remark on Algorithm 778: L-BFGS-B, FORTRAN routines for large scale bound constrained optimization*, ACM Transactions on Mathematical Software, 38(1), 2011
+.. [Morales11] Morales J. L., Nocedal J., *L-BFGS-B: Remark on Algorithm 778: L-BFGS-B, FORTRAN routines for large scale bound constrained optimization*, ACM Transactions on Mathematical Software, 38(1), 2011
+
+.. [Nelder65] Nelder J. A., Mead R., *A simplex method for function minimization*, The Computer Journal, 7, pp.308-313, 1965
+
+.. [Powell64] Powell M. J. D., *An efficient method for finding the minimum of a function of several variables without calculating derivatives*, Computer Journal, 7(2), pp.155-162, 1964
+
+.. [Powell94] Powell M. J. D., *A direct search optimization method that models the objective and constraint functions by linear interpolation*, in Advances in Optimization and Numerical Analysis, eds. S. Gomez and J-P Hennart, Kluwer Academic (Dordrecht), pp. 51-67, 1994
+
+.. [Powell98] Powell M. J. D., *Direct search algorithms for optimization calculations*, Acta Numerica 7, 287-336, 1998
+
+.. [Powell04] Powell M. J. D., *The NEWUOA software for unconstrained optimization without derivatives*, Proc. 40th Workshop on Large Scale Nonlinear Optimization, Erice, Italy, 2004
+
+.. [Powell07] Powell M. J. D., *A view of algorithms for optimization without derivatives*, Cambridge University Technical Report DAMTP 2007/NA03, 2007
+
+.. [Powell09] Powell M. J. D., *The BOBYQA algorithm for bound constrained optimization without derivatives*, Cambridge University Technical Report DAMTP NA2009/06, 2009
+
+.. [Price05] Price K.V., Storn R., Lampinen J., *Differential evolution: a practical approach to global optimization*, Springer, 2005
+
+.. [Python] *Python programming language*, http://www.python.org/
+
+.. [R] *The R Project for Statistical Computing*, http://www.r-project.org/
+
+.. [Rowan90] Rowan T., *Functional Stability Analysis of Numerical Algorithms*, Ph.D. thesis, Department of Computer Sciences, University of Texas at Austin, 1990
 
 .. [Salome] *SALOME The Open Source Integration Platform for Numerical Simulation*, http://www.salome-platform.org/
 
 .. [SalomeMeca] *Salome_Meca and Code_Aster, Analysis of Structures and Thermomechanics for Studies & Research*, http://www.code-aster.org/
 
+.. [Storn97] Storn R., Price, K., *Differential Evolution – A Simple and Efficient Heuristic for global Optimization over Continuous Spaces*, Journal of Global Optimization, 11(1), pp.341-359, 1997
+
 .. [Tarantola87] Tarantola A., *Inverse Problem: Theory Methods for Data Fitting and Parameter Estimation*, Elsevier, 1987
 
 .. [Talagrand97] Talagrand O., *Assimilation of Observations, an Introduction*, Journal of the Meteorological Society of Japan, 75(1B), pp.191-209, 1997
@@ -61,14 +99,18 @@ Bibliography
 
 .. [WikipediaDA] Wikipedia, *Data assimilation*, http://en.wikipedia.org/wiki/Data_assimilation
 
+.. [WikipediaEnKF] Wikipedia, *Ensemble Kalman Filter*, http://en.wikipedia.org/wiki/Ensemble_Kalman_filter
+
 .. [WikipediaMO] Wikipedia, *Mathematical optimization*, https://en.wikipedia.org/wiki/Mathematical_optimization
 
-.. [WikipediaPSO] Wikipedia, *Particle swarm optimization*, https://en.wikipedia.org/wiki/Particle_swarm_optimization
+.. [WikipediaND] Wikipedia, *Nondimensionalization*, https://en.wikipedia.org/wiki/Nondimensionalization
+
+.. [WikipediaPSO] Wikipedia, *Particle Swarm Optimization*, https://en.wikipedia.org/wiki/Particle_swarm_optimization
 
 .. [WikipediaQR] Wikipedia, *Quantile regression*, https://en.wikipedia.org/wiki/Quantile_regression
 
 .. [WikipediaTI] Wikipedia, *Tikhonov regularization*, https://en.wikipedia.org/wiki/Tikhonov_regularization
 
-.. [WikipediaUKF] Wikipedia, *Unscented Kalman filter*, https://en.wikipedia.org/wiki/Unscented_Kalman_filter
+.. [WikipediaUKF] Wikipedia, *Unscented Kalman Filter*, https://en.wikipedia.org/wiki/Unscented_Kalman_filter
 
 .. [Zhu97] Zhu C., Byrd R. H., Nocedal J., *L-BFGS-B: Algorithm 778: L-BFGS-B, FORTRAN routines for large scale bound constrained optimization*, ACM Transactions on Mathematical Software, 23(4), pp.550-560, 1997