src/tepal2med/tepal2med.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2015  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 // ---
  21 // File   : tepal2med.cxx
  22 // Author : Christian VAN WAMBEKE (CEA)
  23 // ---
  24 //
  25 /*
  26 ** prog principal de ghs3dprl
  27 */
  28
  29 #include <stdio.h> /* printf clrscr fopen fread fwrite fclose */
  30 #include <string>
  31 #include <cstring>
  32 #include <cstdlib>
  33 #include <iostream>
  34 #include <sstream>
  35 #include <fstream>
  36 #include <vector>
  37 #ifndef WIN32
  38 #include <unistd.h>
  39 #endif
  40
  41 #include <qstring.h>
  42
  43 #include <QXmlSimpleReader>
  44 #include <QXmlInputSource>
  45 #include <QApplication>
  46
  47 #include "ghs3dprl_msg_parser.h"
  48 #include "dlg_ghs3dmain.h"
  49
  50 #ifdef WIN32
  51 #include <io.h>
  52 #include <windows.h>
  53 #define F_OK 0
  54 #endif
  55
  56 //#include "MEDMEM_Exception.hxx"
  57 //#include "MEDMEM_define.hxx"
  58
  59 #include <med.h>
  60 //#include <med_config.h>
  61 //#include <med_utils.h>
  62 //#include <med_misc.h>
  63
  64 //************************************
  65 med_idt ouvre_fichier_MED(char *fichier,int verbose)
  66 {
  67   med_idt fid = 0;
  68   med_err ret = 0;
  69   med_int majeur,mineur,release;
  70
  71   /* on regarde si le fichier existe */
  72   ret = (int) access(fichier,F_OK);
  73   if (ret < 0) return fid;
  74
  75   /* on regarde s'il s'agit d'un fichier au format HDF5 */
  76   med_bool hdfok,medok;
  77   ret = MEDfileCompatibility(fichier,&hdfok,&medok);
  78   if (ret < 0){
  79      std::cerr<<"File "<<fichier<<" not MED or HDF V5 formatted\n";
  80      return fid;
  81   }
  82
  83   /* Quelle version de MED est utilise par mdump ? */
  84   MEDlibraryNumVersion(&majeur,&mineur,&release);
  85   if (verbose>0)fprintf(stdout,"\nReading %s with MED V%d.%d.%d",
  86                         fichier,majeur,mineur,release);
  87
  88   /* Ouverture du fichier MED en lecture seule */
  89   fid = MEDfileOpen(fichier,MED_ACC_RDONLY);
  90   if (ret < 0) return fid;
  91
  92   MEDfileNumVersionRd(fid, &majeur, &mineur, &release);
  93   if (majeur < 2 || majeur == 2 && mineur < 2) {
  94     fprintf(stderr,"File %s from MED V%d.%d.%d not assumed\n",
  95                    fichier,majeur,mineur,release);
  96     //" version est ant�ieure �la version 2.2";
  97     ret = MEDfileClose(fid);
  98     fid=0; }
  99   else {
 100     if (verbose>0)fprintf(stdout,", file from MED V%d.%d.%d\n",majeur,mineur,release); }
 101
 102   return fid;
 103 }
 104
 105 //************************************
 106 bool ReadFileMED(QString nomfilemed,ghs3dprl_mesh_wrap *mymailw)
 107 {
 108    med_err ret;
 109    med_idt fid=0;
 110    med_int i,j,sdim,mdim,nmaa,edim,majeur_lu,mineur_lu,release_lu,nprofils,nstep;
 111    med_mesh_type type_maillage;
 112    char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
 113    char axisname[MED_SNAME_SIZE+1];
 114    char axisunit[MED_SNAME_SIZE*3+1];
 115    med_sorting_type sortingtype;
 116    med_axis_type axistype;
 117    int numero=1;
 118    QString key,tmp;
 119    med_bool chan;
 120    med_bool tran;
 121
 122    //version qt3
 123    char* chaine = (char*)malloc((nomfilemed.length()+1)*sizeof(char));
 124    strncpy(chaine,nomfilemed.toLatin1().constData(),nomfilemed.length()+1);
 125    //std::cout<<"*** ReadFileMED *** "<<chaine<<"\n";
 126
 127    fid=ouvre_fichier_MED(chaine,mymailw->verbose);
 128    free(chaine);
 129    if (fid == 0) {
 130       std::cerr<<"Problem opening file "<<nomfilemed.toLatin1().constData()<<"\n";
 131       return false;
 132    }
 133
 134    nmaa = MEDnMesh(fid);
 135    if (nmaa <= 0){
 136       std::cerr<<"No meshes in "<<nomfilemed.toLatin1().constData()<<"\n";
 137       ret = MEDfileClose(fid);
 138       return false;
 139    }
 140    if (nmaa > 1) std::cout<<"More than one mesh in "<<nomfilemed.toLatin1().constData()<<", first one taken\n";
 141    ret = MEDmeshInfo(fid,numero,mymailw->nommaa,&sdim,&mdim,&type_maillage,mymailw->maillage_description,
 142                         dtunit,&sortingtype,&nstep,&axistype,axisname,axisunit);
 143    if (ret < 0){
 144       std::cerr<<"Problem MEDmeshInfo in "<<nomfilemed.toLatin1().constData()<<"\n";
 145       ret = MEDfileClose(fid);
 146       return false;
 147    }
 148    //changed with version med: a triangles mesh in 3d is dim 2 now and 3 before 2014
 149    if (mdim != 2 && mdim != 3){
 150       std::cerr<<"Problem mesh dimension should be 2 or 3: "<<mdim<<"\n";
 151       ret = MEDfileClose(fid);
 152       return false;
 153    }
 154    if (sdim != 3){
 155       std::cerr<<"Problem space dimension should be 3: "<<sdim<<"\n";
 156       ret = MEDfileClose(fid);
 157       return false;
 158    }
 159    if (type_maillage != MED_UNSTRUCTURED_MESH){
 160       std::cerr<<"Problem type mesh should be MED_NON_STRUCTURE: "<<type_maillage<<std::endl;
 161       ret = MEDfileClose(fid);
 162       return false;
 163    }
 164
 165    //lecture nb de noeuds
 166    //cf med-3.0.0_install/share/doc/html/maillage_utilisateur.html
 167    med_int nnoe=MEDmeshnEntity(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,
 168       MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_COORDINATE,MED_NO_CMODE,&chan,&tran);
 169               //(med_geometrie_element)0,(med_connectivite)0);
 170    if (nnoe<1){
 171       std::cerr<<"Problem number of Vertices < 1\n";
 172       ret = MEDfileClose(fid);
 173       return false;
 174    }
 175
 176    //nombre d'objets MED : mailles, faces, aretes , ...
 177    med_int nmailles[MED_N_CELL_GEO],nbtria3;
 178    med_int nfaces[MED_N_FACE_GEO];
 179    med_int naretes[MED_N_EDGE_FIXED_GEO],nbseg2;
 180    //med_int nmailles[MED_NBR_GEOMETRIE_MAILLE],nbtria3;
 181    //med_int nfaces[MED_NBR_GEOMETRIE_FACE];
 182    //med_int naretes[MED_NBR_GEOMETRIE_ARETE],nbseg2;
 183    //polygones et polyedres familles equivalences joints
 184    med_int nmpolygones,npolyedres,nfpolygones,nfam,nequ,njnt;
 185
 186    //Combien de mailles, faces ou aretes pour chaque type geometrique ?
 187    /*for (i=0;i<MED_NBR_GEOMETRIE_MAILLE;i++){
 188       nmailles[i]=MEDnEntMaa(fid,mymailw->nommaa,MED_CONN,MED_MAILLE,typmai[i],typ_con);
 189       //lecture_nombre_mailles_standards(fid,nommaa,typmai[i],typ_con,i);
 190       if (mymailw->verbose>6) std::cout<<"NumberOf"<<nommai[i]<<"="<<nmailles[i]<<std::endl;
 191    }*/
 192
 193    nbtria3=MEDmeshnEntity(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,
 194       MED_CELL,MED_TRIA3,MED_CONNECTIVITY,MED_NODAL,&chan,&tran);
 195    nbseg2=MEDmeshnEntity(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,
 196       MED_CELL,MED_SEG2,MED_CONNECTIVITY,MED_NODAL,&chan,&tran);
 197
 198    //combien de familles ?
 199    nfam=MEDnFamily(fid,mymailw->nommaa);
 200    if (mymailw->verbose>2) {
 201       std::cout<<"\nNumberOfFamilies="<<nfam<<std::endl;
 202       std::cout<<"NumberOfVertices="<<nnoe<<std::endl;
 203       std::cout<<"NumberOfMED_SEG2="<<nbseg2<<std::endl;
 204       std::cout<<"NumberOfMED_TRIA3="<<nbtria3<<"\n\n";
 205    }
 206    if (nbtria3<3){
 207       std::cerr<<"Problem number of MED_TRIA3 < 3, not a skin of a volume\n";
 208       ret = MEDfileClose(fid);
 209       return false;
 210    }
 211
 212 med_int ifamdelete=0,idelete;
 213 std::vector<med_int> famdelete = std::vector<med_int>(nfam);
 214 {
 215   med_int ngro;
 216   char *gro;
 217   char nomfam[MED_NAME_SIZE+1];
 218   med_int numfam;
 219   char str1[MED_COMMENT_SIZE+1];
 220   char str2[MED_LNAME_SIZE+1];
 221   med_err ret = 0;
 222
 223   for (i=0;i<nfam;i++) famdelete[i]=0;
 224   for (i=0;i<nfam;i++) {
 225
 226     //nombre de groupes
 227     ngro = MEDnFamilyGroup(fid,mymailw->nommaa,i+1);
 228     if (ngro < 0){
 229        std::cerr<<"Problem reading number of groups of family\n";
 230        continue;
 231     }
 232
 233     //atributs obsolete MED3
 234     //allocation memoire par exces
 235     gro = (char*) malloc(MED_LNAME_SIZE*(ngro+1));
 236
 237     ret = MEDfamilyInfo(fid,mymailw->nommaa,i+1,nomfam,&numfam,gro);
 238     if (ret < 0){
 239        std::cerr<<"Problem reading informations of family\n";
 240        continue;
 241     }
 242
 243     if (mymailw->verbose>8) {
 244      std::cout<<"Family "<<numfam<<" have "<<ngro<<" groups\n";
 245      //affichage des resultats
 246      for (j=0;j<ngro;j++) {
 247       if (j==0) std::cout<<"  Groups :\n";
 248       strncpy(str2,gro+j*MED_LNAME_SIZE,MED_LNAME_SIZE);
 249       str2[MED_LNAME_SIZE] = '\0';
 250       fprintf(stdout,"    name = %s\n",str2);
 251      }
 252      if (i==nfam-1) std::cout<<std::endl;
 253     }
 254     QString sfam,sgro;
 255     sfam=sfam.sprintf("%d",numfam);
 256     idelete=0;
 257     for (j=0;j<ngro;j++){
 258        strncpy(str2,gro+j*MED_LNAME_SIZE,MED_LNAME_SIZE);
 259        str2[MED_LNAME_SIZE]='\0';
 260        sgro=str2;
 261        if (sgro.contains(mymailw->deletegroups)>0) {
 262           //std::cout<<"idelete++ "<<sgro<<std::endl;
 263           idelete++;
 264        }
 265     }
 266
 267     if (idelete==ngro && ngro>0) { //only delete family whith all delete groups
 268        //std::cout<<"famdelete++ "<<numfam<<" "<<ifamdelete<<" "<<ngro<<std::endl;
 269        famdelete[ifamdelete]=numfam;
 270        ifamdelete++;
 271     }
 272
 273     else {
 274      for (j=0;j<ngro;j++){
 275        strncpy(str2,gro+j*MED_LNAME_SIZE,MED_LNAME_SIZE);
 276        str2[MED_LNAME_SIZE]='\0';
 277        sgro=str2;
 278        QRegExp qgroup=QRegExp("Group_Of_All",Qt::CaseSensitive,QRegExp::RegExp);
 279        if (sgro.contains(mymailw->deletegroups)==0){
 280           if (sgro.contains(qgroup)>0) {
 281              sgro="Skin_"+sgro; //pas sur que ce soit pertinent
 282           }
 283           if (mymailw->verbose>8) std::cout<<"families.add("<<sfam.toLatin1().constData()<<
 284                                         ","<<sgro.toLatin1().constData()<<")\n";
 285           mymailw->families.add(sfam,sgro);
 286        }
 287        else {
 288           //sgro="Skin_"+sgro; //pas sur que ce soit pertinent
 289           //std::cout<<"--deletegroups matches \""<<sfam<<","<<sgro<<"\"\n";
 290           if (mymailw->verbose>3) std::cout<<"--deletegroups matches \""<<
 291                                         sgro.toLatin1().constData()<<
 292                                         "\" in family "<<numfam<<std::endl;
 293        }
 294      }
 295     }
 296
 297     /*for (j=0;j<ngro;j++){
 298        strncpy(str2,gro+j*MED_LNAME_SIZE,MED_LNAME_SIZE);
 299        str2[MED_LNAME_SIZE]='\0';
 300        sgro=str2;
 301        //std::cout<<"families.add("<<sfam<<","<<sgro<<")\n";
 302        if (sgro.contains(mymailw->deletegroups)==0){
 303           //sgro="Skin_"+sgro; //pas sur que ce soit pertinent
 304           std::cout<<"families.add("<<sfam<<","<<sgro<<")\n";
 305           mymailw->families.add(sfam,sgro);
 306        }
 307        else {
 308           std::cout<<"--deletegroups matches \""<<sgro<<"\"\n";
 309           famdelete[ifamdelete]=numfam
 310           ifamdelete++;
 311        }
 312     }*/
 313
 314     //on libere la memoire
 315     free(gro);
 316   }
 317 }
 318
 319 //std::cout<<"famdelete"; for (j=0;j<ifamdelete;j++) std::cout<<" "<<famdelete[j]; std::cout<<std::endl;
 320
 321 if (mymailw->verbose>3){
 322    std::cout<<"\nFamiliesAndGroupsOf "<<nomfilemed.toLatin1().constData()<<std::endl;
 323    mymailw->families.write();
 324 }
 325    /* Allocations memoires */
 326    /* table des coordonnees profil : (space dimension * nombre de noeuds ) */
 327    med_float *coo=new med_float[nnoe*sdim];
 328    /* table des numeros de familles des noeuds profil : (nombre de noeuds) */
 329    med_int *famnodesskin=new med_int[nnoe];
 330    //med_int *pfltab=new med_int[1]; //inutilise car on lit tout
 331    //lecture des noeuds : coordonnees
 332    ret=MEDmeshNodeCoordinateRd(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,MED_FULL_INTERLACE,coo);
 333           //mdim,coo,mode_coo,MED_ALL,pfltab,0,&rep,mymailw->nomcoo,mymailw->unicoo);
 334    if (ret < 0){
 335       std::cerr<<"Problem reading nodes\n";
 336       ret = MEDfileClose(fid);
 337       //return false;
 338    }
 339    ret=MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,MED_NODE,MED_NONE,famnodesskin);
 340       //famnodesskin,nnoe,MED_NOEUD,(med_geometrie_element) 0);
 341    if (ret < 0){
 342       std::cerr<<"Problem reading families of nodes\n";
 343       ret = MEDfileClose(fid);
 344       return false;
 345    }
 346    if (mymailw->verbose>9) {
 347      std::cout<<"\nVertices: no x y z family\n";
 348      for (i=0;i<nnoe*mdim;i=i+3) {
 349       fprintf(stdout,"%5d %13.5e %13.5e %13.5e %5d \n",
 350           (i/3+1), coo[i], coo[i+1], coo[i+2], famnodesskin[i/3]);
 351      }
 352      std::cout<<std::endl;
 353    }
 354
 355    med_int *conn2=new med_int[nbseg2*2];
 356    ret=MEDmeshElementConnectivityRd(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,
 357            MED_CELL,MED_SEG2,MED_NODAL,MED_FULL_INTERLACE,conn2);
 358             //mdim,conn2,mode_coo,pfltab,0,MED_MAILLE,MED_SEG2,MED_NOD);
 359    if (ret < 0){
 360       std::cerr<<"Problem reading MED_SEG2\n";
 361       ret = MEDfileClose(fid);
 362       //return false;
 363    }
 364    med_int *famseg2skin=new med_int[nbseg2];
 365    ret=MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,MED_CELL,MED_SEG2,famseg2skin);
 366       //MEDfamLire(fid,mymailw->nommaa,famseg2skin,nbseg2,MED_MAILLE,MED_SEG2);
 367    if (ret < 0){
 368       std::cerr<<"Problem reading families of MED_SEG2\n";
 369       ret = MEDfileClose(fid);
 370       return false;
 371    }
 372    if (mymailw->verbose>9) {
 373      std::cout<<"\nConnectivity MED_SEG2: no node1 node2 family\n";
 374      for (i=0;i<nbseg2*2;i=i+2) {
 375       fprintf(stdout,"%5d %5d %5d %5d \n",
 376           (i/2+1), conn2[i], conn2[i+1], famseg2skin[i/2]);
 377      }
 378      std::cout<<std::endl;
 379    }
 380    //std::cout<<"\ncvw1 conn nbtria3 "<<nbtria3<<"dt "<<MED_NO_DT<<"it "<<MED_NO_IT<<"cell "<<MED_CELL<<"tria3 "<<MED_TRIA3<<std::endl;
 381    med_int *conn3=new med_int[nbtria3*3];
 382    ret=MEDmeshElementConnectivityRd(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,
 383            MED_CELL,MED_TRIA3,MED_NODAL,MED_FULL_INTERLACE,conn3);
 384            //MEDconnLire(fid,mymailw->nommaa,mdim,conn3,mode_coo,pfltab,0,MED_MAILLE,MED_TRIA3,MED_NOD);
 385    if (ret < 0){
 386       std::cerr<<"Problem reading MED_TRIA3\n";
 387       ret = MEDfileClose(fid);
 388       //return false;
 389    }
 390    med_int *famtria3skin=new med_int[nbtria3];
 391    ret=MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mymailw->nommaa,MED_NO_DT,MED_NO_IT,MED_CELL,MED_TRIA3,famtria3skin);
 392         //MEDfamLire(fid,mymailw->nommaa,famtria3skin,nbtria3,MED_MAILLE,MED_TRIA3);
 393    if (ret < 0){
 394       std::cerr<<"Problem reading families of MED_TRIA3\n";
 395       ret = MEDfileClose(fid);
 396       return false;
 397    }
 398    if (mymailw->verbose>9) {
 399      std::cout<<"\nConnectivity MED_TRIA3: no node1 node2 node3 family\n";
 400      for (i=0;i<nbtria3*3;i=i+3) {
 401       fprintf(stdout,"%5d %5d %5d %5d %5d \n",
 402           (i/3+1), conn3[i], conn3[i+1], conn3[i+2], famtria3skin[i/3]);
 403      }
 404      std::cout<<std::endl;
 405    }
 406
 407   /*liberation memoire?
 408   delete[] coo;
 409   delete[] nomnoe;
 410   delete[] numnoe;
 411   delete[] nufano;*/
 412
 413   if (ifamdelete>0) {
 414    //std::cout<<"!!!!!!!!nodes "<<famnodesskin[0]<<" "<<nnoe<<famdelete[1]<<std::endl;
 415    for (i=0;i<nnoe;i++) {
 416     for (j=0;j<ifamdelete;j++) {
 417       if (famnodesskin[i]==famdelete[j]) {
 418        //std::cout<<"nodes "<<famnodesskin[i]<<" "<<i<<" "<<famdelete[j]<<std::endl;
 419        famnodesskin[i]=0; }
 420     }
 421    }
 422    for (i=0;i<nbseg2;i++) {
 423     for (j=0;j<ifamdelete;j++) {
 424       if (famseg2skin[i]==famdelete[j]) famseg2skin[i]=0;
 425     }
 426    }
 427    for (i=0;i<nbtria3;i++) {
 428     for (j=0;j<ifamdelete;j++) {
 429       if (famtria3skin[i]==famdelete[j]) famtria3skin[i]=0;
 430     }
 431    }
 432   }
 433    //stocks data for future use
 434    CVWtab *montab;
 435    bool ok;
 436
 437    montab=new CVWtab(nnoe*mdim,coo);
 438    tmp="SKIN_VERTICES_COORDINATES";
 439    ok=mymailw->insert_key(tmp,montab);
 440
 441    montab=new CVWtab(nnoe,famnodesskin);
 442    tmp="SKIN_VERTICES_FAMILIES";
 443    ok=mymailw->insert_key(tmp,montab);
 444
 445    montab=new CVWtab(nbseg2*2,conn2);
 446    tmp="SKIN_SEG2_CONNECTIVITIES";
 447    ok=mymailw->insert_key(tmp,montab);
 448
 449    montab=new CVWtab(nbtria3,famseg2skin);
 450    tmp="SKIN_SEG2_FAMILIES";
 451    ok=mymailw->insert_key(tmp,montab);
 452
 453    montab=new CVWtab(nbtria3*3,conn3);
 454    tmp="SKIN_TRIA3_CONNECTIVITIES";
 455    ok=mymailw->insert_key(tmp,montab);
 456
 457    montab=new CVWtab(nbtria3,famtria3skin);
 458    tmp="SKIN_TRIA3_FAMILIES";
 459    ok=mymailw->insert_key(tmp,montab);
 460
 461    //if (mymailw->verbose>6) ok=mymailw->list_keys_mesh_wrap();
 462
 463    ret = MEDfileClose(fid);
 464    if (ret < 0){
 465       std::cerr<<"Problem closing "<<nomfilemed.toLatin1().constData()<<"\n";
 466       return false;
 467    }
 468    return true;
 469 }
 470
 471 /*
 472 //************************************
 473 string char2string(char *d, int lg)
 474 {
 475    string fin;
 476    for (int i=0;i<lg-1;i++){
 477        fin=fin+d[i];
 478    }
 479    return fin;
 480 }
 481
 482 //************************************
 483 bool string2int(const string &s, int *v)
 484 //string s=argv[1] ; int ii;
 485 //ok=string2int(s,&ii);
 486 //std::cout<<"test "<<ii<<" "<<ok<<std::endl;
 487 {
 488    string splus=s + " -1"; //evite conversion ok sur "+9truc" qui passe sinon
 489    istringstream ss(splus);
 490    int v2;
 491    if (ss >> *v >> v2) return true; else {*v=0 ;return false;}
 492 }
 493
 494 //************************************
 495 bool string2float(const string &s, float *v)
 496 //float ff;
 497 //ok=string2float(s,&ff);
 498 //std::cout<<"test3 "<<ff<<" "<<ok<<std::endl;
 499 {
 500    string splus=s + " -1"; //evite conversion ok sur "+9truc" qui passe sinon
 501    istringstream ss(splus);
 502    float v2;
 503    if (ss >> *v >> v2) return true; else {*v=0. ;return false;}
 504 }
 505
 506 //************************************
 507 string int2string(const int &v)
 508 {
 509    ostringstream ss;
 510    ss<<v;
 511    return ss.str();
 512 }
 513
 514 //************************************
 515 string float2string(const float &v)
 516 {
 517    ostringstream ss;
 518    ss<<v;
 519    return ss.str();
 520 }
 521 */
 522
 523 //************************************
 524 int main(int argc, char *argv[])
 525 {
 526    bool ok;
 527    int i,nb,nbfiles,limit_swap,nbelem_limit_swap,limit_swap_defaut,verbose;
 528    QString path,pathini,casename,casenamemed,fileskinmed,
 529            tmp,cmd,format,
 530            test,menu,launchtepal,background,deletegroups,
 531            version="V3.0 (MED3+tepalv1)";
 532
 533    char *chelp=NULL,
 534         *ccasename=NULL,
 535         *cnumber=NULL,
 536         *cmedname=NULL,
 537         *climitswap=NULL,
 538         *cverbose=NULL,
 539         *ctest=NULL,
 540         *cmenu=NULL,
 541         *claunchtepal=NULL,
 542         *cbackground=NULL,
 543         *cdeletegroups=NULL;
 544
 545    for (i = 0; i < argc; i++){
 546       if (!strncmp (argv[i], "--help", sizeof ("--help"))) chelp = &(argv[i][0]);
 547       else if (!strncmp (argv[i], "--casename=", sizeof ("--casename"))) ccasename = &(argv[i][sizeof ("--casename")]);
 548       else if (!strncmp (argv[i], "--number=", sizeof ("--number"))) cnumber = &(argv[i][sizeof ("--number")]);
 549       else if (!strncmp (argv[i], "--medname=", sizeof ("--medname"))) cmedname = &(argv[i][sizeof ("--medname")]);
 550       else if (!strncmp (argv[i], "--limitswap=", sizeof ("--limitswap"))) climitswap = &(argv[i][sizeof ("--limitswap")]);
 551       else if (!strncmp (argv[i], "--verbose=", sizeof ("--verbose"))) cverbose = &(argv[i][sizeof ("--verbose")]);
 552       else if (!strncmp (argv[i], "--test=", sizeof ("--test"))) ctest = &(argv[i][sizeof ("--test")]);
 553       else if (!strncmp (argv[i], "--menu=", sizeof ("--menu"))) cmenu = &(argv[i][sizeof ("--menu")]);
 554       else if (!strncmp (argv[i], "--launchtepal=", sizeof ("--launchtepal"))) claunchtepal = &(argv[i][sizeof ("--launchtepal")]);
 555       else if (!strncmp (argv[i], "--background=", sizeof ("--background"))) cbackground = &(argv[i][sizeof ("--background")]);
 556       else if (!strncmp (argv[i], "--deletegroups=", sizeof ("--deletegroups"))) cdeletegroups = &(argv[i][sizeof ("--deletegroups")]);
 557       }
 558
 559    if (argc < 2 || chelp){
 560       std::cout<<"tepal2med "<<version.toLatin1().constData()<<" Available options:\n"
 561       "   --help         : produces this help message\n"<<
 562       "   --casename     : path and name of input tepal2med files which are\n"<<
 563       "                       - output files of tepal .msg .noboite .faces .points .glo\n"<<
 564       "                       - output file of GHS3DPRL_Plugin casename_skin.med (optional)\n"<<
 565       "                         with initial skin and its initial groups\n"<<
 566       "   --number       : number of partitions\n"<<
 567       "   --medname      : path and name of output MED files\n"<<
 568       "   --limitswap    : max size of working cpu memory (Mo) (before swapping on .temp files)\n"<<
 569       "   --verbose      : trace of execution (0->6)\n"<<
 570       "   --test         : more tests about joints, before generation of output files\n"<<
 571       "   --menu         : a GUI menu for option number\n"<<
 572       "   --launchtepal  : also launch tepal on files casename.faces and casename.points and option number\n"<<
 573       "   --background   : force background mode from launch tepal and generation of final MED files (big meshes)\n"<<
 574       "   --deletegroups : regular expression (see QRegExp) which matches unwanted groups in final MED files\n"<<
 575       "                    (try --deletegroups=\"(\\bJOINT)\"\n"<<
 576       "                    (try --deletegroups=\"(\\bAll_Nodes|\\bAll_Faces)\"\n"<<
 577       "                    (try --deletegroups=\"((\\bAll_|\\bNew_)(N|F|T))\"\n";
 578       std::cout<<"example:\n   tepal2med --casename=/tmp/GHS3DPRL --number=2 --medname=DOMAIN "<<
 579                                     "--limitswap=1000 --verbose=0 --test=yes --menu=no --launchtepal=no\n\n";
 580       return 1;  //no output files
 581    }
 582
 583    if (!ccasename){
 584       std::cerr<<"--casename: a path/name is expected\n\n";
 585       return 1;
 586    }
 587    casename=ccasename;
 588    if (!cnumber){
 589       std::cerr<<"--number: an integer is expected\n\n";
 590       return 1;
 591    }
 592    tmp=cnumber;
 593    nbfiles=tmp.toLong(&ok,10);
 594    if (!ok){
 595       std::cerr<<"--number: an integer is expected\n\n";
 596       return 1;
 597    }
 598    if (nbfiles<=0){
 599       std::cerr<<"--number: a positive integer is expected\n\n";
 600       return 1;
 601    }
 602    if (nbfiles>2048){ //delirium in 2008
 603       std::cerr<<"--number: a positive integer <= 2048 is expected\n\n";
 604       return 1;
 605    }
 606    if (!cmedname) cmedname=ccasename;
 607    casenamemed=cmedname;
 608    limit_swap_defaut=1000; //1000Mo
 609    limit_swap=limit_swap_defaut;
 610    if (climitswap){
 611       tmp=climitswap;
 612       limit_swap=tmp.toLong(&ok,10);
 613       if (!ok){
 614          std::cerr<<"--limitswap: an integer is expected. try 1000\n\n";
 615          return 1;
 616       }
 617       if (limit_swap<1 || limit_swap>32000){
 618          std::cerr<<"--limitswap: [1->32000] expected. try 1000\n\n";
 619          return 1;
 620       }
 621    }
 622    //default 1GOctet/8(for float)
 623    nbelem_limit_swap=limit_swap*1000000; //100%
 624    CVWtab::memorymax=nbelem_limit_swap;
 625
 626    verbose=1; //default
 627    if (cverbose){
 628       tmp=cverbose;
 629       verbose=tmp.toLong(&ok,10);
 630       if (!ok){
 631          std::cerr<<"--verbose: an integer is expected\n\n";
 632          return 1;
 633       }
 634       if (verbose<0){
 635          std::cerr<<"--verbose: a positive integer is expected\n\n";
 636          return 1;
 637       }
 638    }
 639
 640    test="no"; //default
 641    if (ctest){
 642       tmp=ctest;
 643       if (tmp=="yes") test="yes";
 644    }
 645
 646    menu="no"; //default
 647    if (cmenu){
 648       tmp=cmenu;
 649       if (tmp=="yes") menu="yes";
 650    }
 651
 652    launchtepal="no"; //default
 653    if (claunchtepal){
 654       tmp=claunchtepal;
 655       if (tmp=="yes") launchtepal="yes";
 656    }
 657
 658    background="no"; //default
 659    if (cbackground){
 660       tmp=cbackground;
 661       if (tmp=="yes") background="yes";
 662    }
 663
 664
 665    // We must always have an application
 666    if (menu=="yes") {
 667     QApplication a(argc,argv);
 668     dlg_ghs3dmain *m = new dlg_ghs3dmain();
 669     m->setWindowTitle("tepal2med 3.0");
 670     m->show();
 671     a.exec();
 672     if ( m->result() == QDialog::Accepted ) {
 673       std::cout<<"parameters "<<m->KeepFiles()<<" "<<m->NbPart()<<std::endl;
 674       nbfiles=m->NbPart();
 675     }
 676     else {
 677       return 1;
 678     }
 679     delete m;
 680    }
 681
 682    int n=casenamemed.count('/');
 683    if (n>0)
 684       path=casenamemed.section('/',-n-1,-2)+"/";
 685    else
 686       path="./";
 687       casenamemed=casenamemed.section('/',-1);
 688    if (casenamemed.length()>20){
 689       std::cerr<<"--medname truncated (no more 20 characters)"<<std::endl;
 690       casenamemed.truncate(20);
 691    }
 692
 693    n=casename.count('/');
 694    if (n>0)
 695       pathini=casename.section('/',-n-1,-2)+"/";
 696    else
 697       pathini="./";
 698       casename=casename.section('/',-1);
 699    if (casename.length()>20){
 700       std::cerr<<"--casename truncated (no more 20 characters)"<<std::endl;
 701       casename.truncate(20);
 702    }
 703
 704    /*std::cout<<"CaseNameMed="<<casenamemed<<std::endl;
 705    std::cout<<"PathMed="<<path<<std::endl;*/
 706
 707    deletegroups="(\\bxyz)"; //default improbable name
 708    if (cdeletegroups){
 709       deletegroups=cdeletegroups;
 710    }
 711
 712    //verbose=5;
 713    if (verbose>0)
 714    std::cout<<"tepal2med "<<version.toLatin1().constData()<<" parameters:"<<
 715          "\n   --casename="<<pathini.toLatin1().constData()<<casename.toLatin1().constData()<<
 716          "\n   --number="<<nbfiles<<
 717          "\n   --medname="<<path.toLatin1().constData()<<casenamemed.toLatin1().constData()<<
 718          "\n   --limitswap="<<limit_swap<<
 719          "\n   --verbose="<<verbose<<
 720          "\n   --test="<<test.toLatin1().constData()<<
 721          "\n   --menu="<<menu.toLatin1().constData()<<
 722          "\n   --launchtepal="<<launchtepal.toLatin1().constData()<<
 723          "\n   --background="<<background.toLatin1().constData()<<
 724          "\n   --deletegroups=\""<<deletegroups.toLatin1().constData()<<"\"\n";
 725
 726    //utile si appel par plugin ghs3dprl sur big meshes et tepal sur plusieurs jours
 727 #ifndef WIN32
 728    if (background=="yes"){
 729       pid_t pid = fork();
 730       if (pid > 0) {
 731          //Process father
 732          exit(0); //temporary ok for plugin
 733       }
 734       //process children
 735       //On rend le fils independant de tout terminal
 736       //from here everything in background: tepal AND generation of final MED files
 737       setsid();
 738       system("sleep 10");  //for debug
 739    }
 740 #else
 741    printf("background mode is not supported on win32 platform !\n");
 742 #endif
 743
 744    //"tepal -f exemple1 -n 4"
 745    if (launchtepal=="yes"){
 746       //tepal64.exe  -f /home/wambeke/tmp/GHS3DPRL -n 5 --tetmesh_args  "-c 0"
 747       //cmd="tepal --tetmesh_args \"-c 0\" -f "+pathini+casename+" -n "+cmd.sprintf("%d",nbfiles)+" > "+path+"tepal.log";
 748       cmd="tepal -f "+pathini+casename+" -n "+cmd.sprintf("%d",nbfiles)+" > "+path+"tepal.log";
 749       std::cout<<"\nlaunchtepal command: background="<<cbackground<<
 750             "\n      "<<cmd.toLatin1().constData()<<std::endl;
 751       system(cmd.toLatin1().constData()); // run
 752       //sometimes it is better to wait flushing files on slow filesystem...
 753       system("sleep 3");
 754    }
 755    ghs3dprl_mesh_wrap *mymailw=new ghs3dprl_mesh_wrap;
 756    //no constructor, later maybe
 757    mymailw->nbfiles=0;
 758    mymailw->nbfilestot=nbfiles;
 759    //for huge cases big array swap in huge binary files
 760    mymailw->nbelem_limit_swap=nbelem_limit_swap;
 761    mymailw->verbose=verbose;
 762    mymailw->casename=casename;
 763    mymailw->medname=casenamemed;
 764    mymailw->path=path;
 765    mymailw->pathini=pathini;
 766    mymailw->deletegroups=QRegExp(deletegroups,Qt::CaseSensitive,QRegExp::RegExp);
 767    ghs3dprl_msg_parser handler;
 768    //constructor later maybe
 769    //handler.verbose=true;
 770    handler.mailw=mymailw;
 771    mymailw->families.no=1;
 772    //std::cout<<"coucou1 "<<mymailw->families.no<<std::endl;
 773    //mymailw->families.add(casename,casenamemed);
 774    format=format.sprintf("%d",nbfiles);
 775    int nbf=format.length();
 776    format=format.sprintf(".%%.%dd.%%.%dd",nbf,nbf);
 777    mymailw->format=format;
 778    mymailw->format_tetra=format; //here is tepal: not used
 779    mymailw->for_tetrahpc=false; //to know what files to read: .noboite or .mesh
 780
 781    //something like "/home/wambeke/tmp/GHS3DPRL_skin.med"
 782    fileskinmed=pathini+casename+"_skin.med";
 783    //fileskinmed="/home/wambeke/tmp/GHS3DPRL_skin.med";
 784    /*for debug
 785    {
 786    char ctmp[fileskinmed.length()+1] ; strcpy(ctmp,fileskinmed);
 787    int res=dumpMED(&ctmp[0],1);
 788    }*/
 789    int ret = access(fileskinmed.toLatin1().constData(),F_OK); //on regarde si le fichier existe
 790    if (ret >= 0) {
 791       ok=ReadFileMED(fileskinmed,mymailw); }
 792    else {
 793       if (verbose>0)std::cout<<"Initial skin file <"<<fileskinmed.toLatin1().constData()<<"> does not exist\n"; }
 794
 795
 796 //if test read all files before (only small files)
 797  if (test=="yes"){
 798    if (verbose>0) std::cout<<"\nReading output files of tepal as input files of tepal2med...\n";
 799
 800    //read files .msg
 801    //supposed big files big arrays so don't read with parser
 802    mymailw->nbfiles=0;
 803    for (int i=1; i<=nbfiles; i++){
 804       mymailw->nofile=i;
 805       tmp=pathini+casename+tmp.sprintf(format.toLatin1().constData(),nbfiles,i)+".msg";
 806       if (verbose>0) std::cout<<"FileName="<<tmp.toLatin1().constData()<<std::endl;
 807       ok=mymailw->ReadFileMSGnew(tmp);
 808    }
 809    if (verbose>0)
 810       std::cout<<"NumberOfFilesMSGacquired="<<mymailw->nbfiles<<"\n\n";
 811    if (mymailw->nbfiles != nbfiles){
 812       std::cerr<<"NumberOfFiles != NumberOfFilesAcquired is unexpected\n\n";
 813       return 1;
 814    }
 815
 816    /*old version with xml parser too slow
 817    QXmlSimpleReader reader;
 818    reader.setContentHandler(&handler);
 819    //read files .msg
 820    for (int i=1; i<=nbfiles; i++)
 821    {
 822       mymailw->nofile=i;
 823       //tmp=casename+tmp.sprintf(".%d.%d.msg",nbfiles,i);
 824       tmp=pathini+casename+tmp.sprintf(format,nbfiles,i)+".msg";
 825       if (verbose>0) std::cout<<"FileName="<<tmp<<std::endl;
 826       QFile File(tmp);
 827       QXmlInputSource source(&File);
 828       reader.parse(source);
 829       File.close();
 830    }
 831    if (verbose>0)
 832       std::cout<<"NumberOfFilesMSGAcquired="<<mymailw->nbfiles<<"\n";
 833    if (mymailw->nbfiles != nbfiles){
 834       std::cerr<<"Problem NumberOfFiles != NumberOfFilesAcquired\n";
 835       return 1;
 836    }
 837
 838    if (test=="yes"){
 839       ok=mymailw->test_msg_wrap();
 840       if (ok){
 841          if (verbose>0) std::cout<<"\nResult_test_msg_wrap=ok\n\n";
 842       }
 843       else{
 844          std::cerr<<"\nResult_test_msg_wrap=NO_OK!\n\n";
 845          return 1;
 846       }
 847    }
 848    */
 849
 850    //after verification remove unusued data
 851    //"NE0 FI" for/from <version>1.0</version>
 852    //after verification remove duplicates data
 853    //for debug but don't do that because reliability
 854    // and locality of datas files
 855    //" RE " for duplicates <receive>
 856    //int nb=mymailw->remove_key_mesh_wrap(QRegExp("( NE0 | RE)",true,false));
 857
 858    //because <send> equals <receive>
 859    nb=0;
 860    nb=mymailw->remove_key_mesh_wrap(QRegExp("RE",Qt::CaseSensitive,QRegExp::RegExp));
 861    if (verbose>3) std::cout<<"NumberOfKeysRemoved="<<nb<<std::endl;
 862    if (verbose>3) ok=mymailw->list_keys_mesh_wrap();
 863
 864    //test read files .noboiteb
 865    //tmp=casename+".noboiteb";
 866    //ok=mymailw->ReadFileNOBOITEB(tmp);
 867
 868    //read files .noboite
 869    //supposed big files
 870    mymailw->nbfiles=0;
 871    for (int i=1; i<=nbfiles; i++){
 872       mymailw->nofile=i;
 873       tmp=pathini+casename+tmp.sprintf(format.toLatin1().constData(),nbfiles,i)+".noboite";
 874       if (verbose>0) std::cout<<"FileName="<<tmp.toLatin1().constData()<<std::endl;
 875       ok=mymailw->ReadFileNOBOITE(tmp);
 876    }
 877    if (verbose>0)
 878       std::cout<<"NumberOfFilesNOBOITEAcquired="<<mymailw->nbfiles<<"\n";
 879    if (mymailw->nbfiles != nbfiles){
 880       std::cerr<<"NumberOfFiles != NumberOfFilesAcquired is unexpected\n";
 881       return 1;
 882    }
 883
 884    //if (test=="yes"){
 885       ok=mymailw->test_vertices_wrap();
 886       if (ok){
 887          if (verbose>0) std::cout<<"\nResult_test_vertices_wrap=ok\n\n";
 888       }
 889       else{
 890          std::cerr<<"\nResult_test_vertices_wrap=NO_OK!\n\n";
 891          return 1;
 892       }
 893    //}
 894
 895    //read files .faces
 896    mymailw->nbfiles=0;
 897    for (int i=1; i<=nbfiles; i++){
 898       mymailw->nofile=i;
 899       tmp=pathini+casename+tmp.sprintf(format.toLatin1().constData(),nbfiles,i)+".faces";
 900       if (verbose>0) std::cout<<"FileName="<<tmp.toLatin1().constData()<<std::endl;
 901       ok=mymailw->ReadFileFACES(tmp);
 902    }
 903    if (verbose>0)
 904       std::cout<<"NumberOfFilesFACESAcquired="<<mymailw->nbfiles<<"\n\n";
 905    if (mymailw->nbfiles != nbfiles){
 906       std::cerr<<"NumberOfFiles != NumberOfFilesAcquired is unexpected\n\n";
 907       return 1;
 908    }
 909
 910    /*
 911    //read files .points
 912    mymailw->nbfiles=0;
 913    for (int i=1; i<=nbfiles; i++){
 914       mymailw->nofile=i;
 915       tmp=pathini+casename+tmp.sprintf(format.toLatin1().constData(),nbfiles,i)+".points";
 916       if (verbose>0) std::cout<<"FileName="<<tmp.toLatin1().constData()<<std::endl;
 917       ok=mymailw->ReadFilePOINTS(tmp);
 918    }
 919    if (verbose>0)
 920       std::cout<<"NumberOfFilesPOINTSAcquired="<<mymailw->nbfiles<<"\n\n";
 921    if (mymailw->nbfiles != nbfiles)
 922    {
 923       std::cerr<<"NumberOfFiles != NumberOfFilesAcquired is unexpected\n\n";
 924       return 1;
 925    }
 926    */
 927
 928    //read files .glo
 929    //supposed big files big arrays so don't read with parser
 930    mymailw->nbfiles=0;
 931    for (int i=1; i<=nbfiles; i++){
 932       mymailw->nofile=i;
 933       tmp=pathini+casename+tmp.sprintf(format.toLatin1().constData(),nbfiles,i)+".glo";
 934       if (verbose>0) std::cout<<"FileName="<<tmp.toLatin1().constData()<<std::endl;
 935       ok=mymailw->ReadFileGLO(tmp);
 936       //mymailw->SwapOutOfMemory_key_mesh_wrap(QRegExp("GL",true,false));
 937    }
 938    if (verbose>0)
 939       std::cout<<"NumberOfFilesGLOAcquired="<<mymailw->nbfiles<<"\n\n";
 940    if (mymailw->nbfiles != nbfiles){
 941       std::cerr<<"NumberOfFiles != NumberOfFilesAcquired is unexpected\n\n";
 942       return 1;
 943    }
 944
 945    /*exemples
 946    ok=mymailw->list_keys_mesh_wrap();
 947    tmp="FA RE NE4 FI1";
 948    ok=mymailw->list_onekey_mesh_wrap(tmp);
 949    tmp="FA SE NE4 FI1";
 950    ok=mymailw->list_onekey_mesh_wrap(tmp);
 951    tmp="FA RE NE1 FI4";
 952    ok=mymailw->list_onekey_mesh_wrap(tmp);
 953    tmp="FA SE NE1 FI4";
 954    ok=mymailw->list_onekey_mesh_wrap(tmp);
 955
 956    tmp="FA RE NE4 FI1";
 957    ok=mymailw->list_onekey_mesh_wrap(tmp);*/
 958
 959    //test remove points (type 3)
 960    //nb=mymailw->remove_key_mesh_wrap(QRegExp("PO",true,false));
 961    //std::cout<<"***remove_key_mesh_wrap*** remove nb="<<nb<<std::endl;
 962    //ok=mymailw->list_keys_mesh_wrap();
 963
 964    ok=mymailw->Find_VerticesDomainToVerticesSkin();
 965  }  //end if test
 966
 967    ok=mymailw->Write_MEDfiles_v2(true); //deletekeys=true
 968
 969    nb=mymailw->remove_all_keys_mesh_wrap();
 970    if (verbose>3)std::cout<<"***remove_all_key_mesh_wrap*** "<<nb<<" keys removed\n";
 971    if (verbose>0)std::cout<<std::endl<<"===end of "<<argv[0]<<"==="<<std::endl;
 972
 973    //for debug
 974    //int res=dumpMED("/home/wambeke/tmp/DOMAIN_1.med",1);
 975
 976    return 0; //ok
 977 }