src/medtool/src/MEDPartitioner/MEDPARTITIONER_ParMetisGraph.cxx

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  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "MEDPARTITIONER_ParMetisGraph.hxx"
  21 #include "MEDPARTITIONER_ParaDomainSelector.hxx"
  22 #include "MEDPARTITIONER_Utils.hxx"
  23
  24 #include "MEDCouplingSkyLineArray.hxx"
  25 #include "InterpKernelException.hxx"
  26
  27 #include <iostream>
  28
  29 #ifdef MED_ENABLE_PARMETIS
  30 #include <parmetis.h>
  31 // #if PARMETIS_MAJOR_VERSION == 4
  32 //    #define ParMETIS_PartKway ParMETIS_V3_PartKway
  33 // #endif
  34 #endif
  35
  36 using namespace MEDPARTITIONER;
  37
  38 ParMETISGraph::ParMETISGraph():Graph()
  39 {
  40 }
  41
  42 ParMETISGraph::ParMETISGraph(ParaMEDMEM::MEDCouplingSkyLineArray* graph, int* edgeweight)
  43   :Graph(graph,edgeweight)
  44 {
  45 }
  46
  47 ParMETISGraph::~ParMETISGraph()
  48 {
  49 }
  50
  51 void ParMETISGraph::partGraph(int ndomain,
  52                            const std::string& options_string,
  53                            ParaDomainSelector *parallelizer)
  54 {
  55   using std::vector;
  56   vector<int> ran,vx,va; //for randomize
  57
  58   if (MyGlobals::_Verbose>10)
  59     std::cout << "proc " << MyGlobals::_Rank << " : ParMETISGraph::partGraph" << std::endl;
  60
  61   // number of graph vertices
  62   int n=_graph->getNumberOf();
  63   //graph
  64   int * xadj=const_cast<int*>(_graph->getIndex());
  65   int * adjncy=const_cast<int*>(_graph->getValue());
  66   //constraints
  67   int * vwgt=_cell_weight;
  68   int * adjwgt=_edge_weight;
  69   int wgtflag=(_edge_weight!=0)?1:0+(_cell_weight!=0)?2:0;
  70   //base 0 or 1
  71   int base=0;
  72   //ndomain
  73   int nparts=ndomain;
  74   //options
  75   /*
  76     (0=default_option,option,random_seed) see defs.h
  77     #define PMV3_OPTION_DBGLVL 1
  78     #define PMV3_OPTION_SEED 2
  79     #define PMV3_OPTION_IPART 3
  80     #define PMV3_OPTION_PSR 3
  81     seems no changes int options[4]={1,0,33,0}; //test for a random seed of 33
  82   */
  83   int options[4]={0,0,0,0};
  84   // output parameters
  85   int edgecut;
  86 #if !defined(MED_ENABLE_PARMETIS)
  87   throw INTERP_KERNEL::Exception("ParMETISGraph::partGraph : PARMETIS is not available. Check your products, please.");
  88 #else
  89   int* partition=new int[n];
  90
  91   if (MyGlobals::_Verbose>10)
  92     std::cout << "proc " << MyGlobals::_Rank << " : ParMETISGraph::partGraph ParMETIS_PartKway new" << std::endl;
  93   int * vtxdist=parallelizer->getProcVtxdist();
  94   MPI_Comm comm=MPI_COMM_WORLD;
  95   ParMETIS_PartKway(vtxdist, xadj, adjncy, vwgt,
  96                                     adjwgt, &wgtflag, &base, &nparts, options,
  97                                     &edgecut, partition, &comm );
  98
  99
 100   /*doc from parmetis.h
 101     void __cdecl ParMETIS_PartKway(
 102     idxtype *vtxdist, idxtype *xadj, idxtype *adjncy, idxtype *vwgt,
 103     idxtype *adjwgt, int *wgtflag, int *numflag, int *nparts, int *options,
 104     int *edgecut, idxtype *part, MPI_Comm *comm);
 105
 106     void __cdecl ParMETIS_V3_PartKway(
 107     idxtype *vtxdist, idxtype *xadj, idxtype *adjncy, idxtype *vwgt,
 108     idxtype *adjwgt, int *wgtflag, int *numflag, int *ncon, int *nparts,
 109     float *tpwgts, float *ubvec, int *options, int *edgecut, idxtype *part,
 110     MPI_Comm *comm);
 111   */
 112
 113   vector<int> index(n+1);
 114   vector<int> value(n);
 115   index[0]=0;
 116   if (ran.size()>0 && MyGlobals::_Atomize==0) //there is randomize
 117     {
 118       if (MyGlobals::_Is0verbose>100)
 119         std::cout << "randomize" << std::endl;
 120       for (int i=0; i<n; i++)
 121         {
 122           index[i+1]=index[i]+1;
 123           value[ran[i]]=partition[i];
 124         }
 125     }
 126   else
 127     {
 128       for (int i=0; i<n; i++)
 129         {
 130           index[i+1]=index[i]+1;
 131           value[i]=partition[i];
 132         }
 133     }
 134   delete [] partition;
 135
 136   //creating a skylinearray with no copy of the index and partition array
 137   //the fifth argument true specifies that only the pointers are passed
 138   //to the object
 139
 140   _partition = new ParaMEDMEM::MEDCouplingSkyLineArray(index,value);
 141 #endif
 142 }
 143