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Updating documentation by review and snippets (3)
[modules/adao.git] / src / daComposant / daAlgorithms / TabuSearch.py
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2 #
3 # Copyright (C) 2008-2019 EDF R&D
4 #
5 # This library is free software; you can redistribute it and/or
6 # modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
7 # License as published by the Free Software Foundation; either
8 # version 2.1 of the License.
9 #
10 # This library is distributed in the hope that it will be useful,
11 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13 # Lesser General Public License for more details.
14 #
15 # You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
16 # License along with this library; if not, write to the Free Software
17 # Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
18 #
19 # See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
20 #
21 # Author: Jean-Philippe Argaud, jean-philippe.argaud@edf.fr, EDF R&D
22
23 import logging
24 from daCore import BasicObjects
25 import numpy
26
27 # ==============================================================================
28 class ElementaryAlgorithm(BasicObjects.Algorithm):
29     def __init__(self):
30         BasicObjects.Algorithm.__init__(self, "TABUSEARCH")
31         self.defineRequiredParameter(
32             name     = "MaximumNumberOfSteps",
33             default  = 50,
34             typecast = int,
35             message  = "Nombre maximal de pas d'optimisation",
36             minval   = 1,
37             )
38         self.defineRequiredParameter(
39             name     = "SetSeed",
40             typecast = numpy.random.seed,
41             message  = "Graine fixée pour le générateur aléatoire",
42             )
43         self.defineRequiredParameter(
44             name     = "LengthOfTabuList",
45             default  = 50,
46             typecast = int,
47             message  = "Longueur de la liste tabou",
48             minval   = 1,
49             )
50         self.defineRequiredParameter(
51             name     = "NumberOfElementaryPerturbations",
52             default  = 1,
53             typecast = int,
54             message  = "Nombre de perturbations élémentaires pour choisir une perturbation d'état",
55             minval   = 1,
56             )
57         self.defineRequiredParameter(
58             name     = "NoiseDistribution",
59             default  = "Uniform",
60             typecast = str,
61             message  = "Distribution pour générer les perturbations d'état",
62             listval  = ["Gaussian","Uniform"],
63             )
64         self.defineRequiredParameter(
65             name     = "QualityCriterion",
66             default  = "AugmentedWeightedLeastSquares",
67             typecast = str,
68             message  = "Critère de qualité utilisé",
69             listval  = ["AugmentedWeightedLeastSquares","AWLS","DA",
70                         "WeightedLeastSquares","WLS",
71                         "LeastSquares","LS","L2",
72                         "AbsoluteValue","L1",
73                         "MaximumError","ME"],
74             )
75         self.defineRequiredParameter(
76             name     = "NoiseHalfRange",
77             default  = [],
78             typecast = numpy.matrix,
79             message  = "Demi-amplitude des perturbations uniformes centrées d'état pour chaque composante de l'état",
80             )
81         self.defineRequiredParameter(
82             name     = "StandardDeviation",
83             default  = [],
84             typecast = numpy.matrix,
85             message  = "Ecart-type des perturbations gaussiennes d'état pour chaque composante de l'état",
86             )
87         self.defineRequiredParameter(
88             name     = "NoiseAddingProbability",
89             default  = 1.,
90             typecast = float,
91             message  = "Probabilité de perturbation d'une composante de l'état",
92             minval   = 0.,
93             maxval   = 1.,
94             )
95         self.defineRequiredParameter(
96             name     = "StoreInternalVariables",
97             default  = False,
98             typecast = bool,
99             message  = "Stockage des variables internes ou intermédiaires du calcul",
100             )
101         self.defineRequiredParameter(
102             name     = "StoreSupplementaryCalculations",
103             default  = [],
104             typecast = tuple,
105             message  = "Liste de calculs supplémentaires à stocker et/ou effectuer",
106             listval  = [
107                 "BMA",
108                 "OMA",
109                 "OMB",
110                 "CurrentState",
111                 "CostFunctionJ",
112                 "CostFunctionJb",
113                 "CostFunctionJo",
114                 "Innovation",
115                 "SimulatedObservationAtBackground",
116                 "SimulatedObservationAtCurrentState",
117                 "SimulatedObservationAtOptimum",
118                 ]
119             )
120         self.defineRequiredParameter( # Pas de type
121             name     = "Bounds",
122             message  = "Liste des valeurs de bornes",
123             )
124         self.requireInputArguments(
125             mandatory= ("Xb", "Y", "HO", "R", "B"),
126             )
127
128     def run(self, Xb=None, Y=None, U=None, HO=None, EM=None, CM=None, R=None, B=None, Q=None, Parameters=None):
129         self._pre_run(Parameters, Xb, Y, R, B, Q)
130         #
131         if self._parameters["NoiseDistribution"] == "Uniform":
132             nrange = numpy.ravel(self._parameters["NoiseHalfRange"]) # Vecteur
133             if nrange.size != Xb.size:
134                 raise ValueError("Noise generation by Uniform distribution requires range for all variable increments. The actual noise half range vector is:\n%s"%nrange)
135         elif self._parameters["NoiseDistribution"] == "Gaussian":
136             sigma = numpy.ravel(self._parameters["StandardDeviation"]) # Vecteur
137             if sigma.size != Xb.size:
138                 raise ValueError("Noise generation by Gaussian distribution requires standard deviation for all variable increments. The actual standard deviation vector is:\n%s"%sigma)
139         #
140         # Opérateur d'observation
141         # -----------------------
142         Hm = HO["Direct"].appliedTo
143         #
144         # Précalcul des inversions de B et R
145         # ----------------------------------
146         BI = B.getI()
147         RI = R.getI()
148         #
149         # Définition de la fonction de deplacement
150         # ----------------------------------------
151         def Tweak( x, NoiseDistribution, NoiseAddingProbability ):
152             _X  = numpy.matrix(numpy.ravel( x )).T
153             if NoiseDistribution == "Uniform":
154                 for i in range(_X.size):
155                     if NoiseAddingProbability >= numpy.random.uniform():
156                         _increment = numpy.random.uniform(low=-nrange[i], high=nrange[i])
157                         # On ne traite pas encore le dépassement des bornes ici
158                         _X[i] += _increment
159             elif NoiseDistribution == "Gaussian":
160                 for i in range(_X.size):
161                     if NoiseAddingProbability >= numpy.random.uniform():
162                         _increment = numpy.random.normal(loc=0., scale=sigma[i])
163                         # On ne traite pas encore le dépassement des bornes ici
164                         _X[i] += _increment
165             #
166             return _X
167         #
168         def StateInList( x, TL ):
169             _X  = numpy.ravel( x )
170             _xInList = False
171             for state in TL:
172                 if numpy.all(numpy.abs( _X - numpy.ravel(state) ) <= 1e-16*numpy.abs(_X)):
173                     _xInList = True
174             # if _xInList: import sys ; sys.exit()
175             return _xInList
176         #
177         # Minimisation de la fonctionnelle
178         # --------------------------------
179         _n = 0
180         _S = Xb
181         # _qualityS = CostFunction( _S, self._parameters["QualityCriterion"] )
182         _qualityS = BasicObjects.CostFunction3D(
183                    _S,
184             _Hm  = Hm,
185             _BI  = BI,
186             _RI  = RI,
187             _Xb  = Xb,
188             _Y   = Y,
189             _SSC = self._parameters["StoreSupplementaryCalculations"],
190             _QM  = self._parameters["QualityCriterion"],
191             _SSV = self.StoredVariables,
192             _sSc = False,
193             )
194         _Best, _qualityBest   =   _S, _qualityS
195         _TabuList = []
196         _TabuList.append( _S )
197         while _n < self._parameters["MaximumNumberOfSteps"]:
198             _n += 1
199             if len(_TabuList) > self._parameters["LengthOfTabuList"]:
200                 _TabuList.pop(0)
201             _R = Tweak( _S, self._parameters["NoiseDistribution"], self._parameters["NoiseAddingProbability"] )
202             # _qualityR = CostFunction( _R, self._parameters["QualityCriterion"] )
203             _qualityR = BasicObjects.CostFunction3D(
204                        _R,
205                 _Hm  = Hm,
206                 _BI  = BI,
207                 _RI  = RI,
208                 _Xb  = Xb,
209                 _Y   = Y,
210                 _SSC = self._parameters["StoreSupplementaryCalculations"],
211                 _QM  = self._parameters["QualityCriterion"],
212                 _SSV = self.StoredVariables,
213                 _sSc = False,
214                 )
215             for nbt in range(self._parameters["NumberOfElementaryPerturbations"]-1):
216                 _W = Tweak( _S, self._parameters["NoiseDistribution"], self._parameters["NoiseAddingProbability"] )
217                 # _qualityW = CostFunction( _W, self._parameters["QualityCriterion"] )
218                 _qualityW = BasicObjects.CostFunction3D(
219                            _W,
220                     _Hm  = Hm,
221                     _BI  = BI,
222                     _RI  = RI,
223                     _Xb  = Xb,
224                     _Y   = Y,
225                     _SSC = self._parameters["StoreSupplementaryCalculations"],
226                     _QM  = self._parameters["QualityCriterion"],
227                     _SSV = self.StoredVariables,
228                     _sSc = False,
229                     )
230                 if (not StateInList(_W, _TabuList)) and ( (_qualityW < _qualityR) or StateInList(_R,_TabuList) ):
231                     _R, _qualityR   =   _W, _qualityW
232             if (not StateInList( _R, _TabuList )) and (_qualityR < _qualityS):
233                 _S, _qualityS   =   _R, _qualityR
234                 _TabuList.append( _S )
235             if _qualityS < _qualityBest:
236                 _Best, _qualityBest   =   _S, _qualityS
237             #
238             if self._parameters["StoreInternalVariables"] or self._toStore("CurrentState"):
239                 self.StoredVariables["CurrentState"].store( _Best )
240             if self._toStore("SimulatedObservationAtCurrentState"):
241                 _HmX = Hm( numpy.asmatrix(numpy.ravel( _Best )).T )
242                 _HmX = numpy.asmatrix(numpy.ravel( _HmX )).T
243                 self.StoredVariables["SimulatedObservationAtCurrentState"].store( _HmX )
244             self.StoredVariables["CostFunctionJb"].store( 0. )
245             self.StoredVariables["CostFunctionJo"].store( 0. )
246             self.StoredVariables["CostFunctionJ" ].store( _qualityBest )
247         #
248         # Obtention de l'analyse
249         # ----------------------
250         Xa = numpy.asmatrix(numpy.ravel( _Best )).T
251         #
252         self.StoredVariables["Analysis"].store( Xa.A1 )
253         #
254         if self._toStore("Innovation") or \
255             self._toStore("OMB") or \
256             self._toStore("SimulatedObservationAtBackground"):
257             HXb = Hm(Xb)
258             d = Y - HXb
259         if self._toStore("OMA") or \
260            self._toStore("SimulatedObservationAtOptimum"):
261             HXa = Hm(Xa)
262         #
263         # Calculs et/ou stockages supplémentaires
264         # ---------------------------------------
265         if self._toStore("Innovation"):
266             self.StoredVariables["Innovation"].store( numpy.ravel(d) )
267         if self._toStore("BMA"):
268             self.StoredVariables["BMA"].store( numpy.ravel(Xb) - numpy.ravel(Xa) )
269         if self._toStore("OMA"):
270             self.StoredVariables["OMA"].store( numpy.ravel(Y) - numpy.ravel(HXa) )
271         if self._toStore("OMB"):
272             self.StoredVariables["OMB"].store( numpy.ravel(d) )
273         if self._toStore("SimulatedObservationAtBackground"):
274             self.StoredVariables["SimulatedObservationAtBackground"].store( numpy.ravel(HXb) )
275         if self._toStore("SimulatedObservationAtOptimum"):
276             self.StoredVariables["SimulatedObservationAtOptimum"].store( numpy.ravel(HXa) )
277         #
278         self._post_run(HO)
279         return 0
280
281 # ==============================================================================
282 if __name__ == "__main__":
283     print('\n AUTODIAGNOSTIC \n')