src/daComposant/daAlgorithms/QuantileRegression.py

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   2 #
   3 # Copyright (C) 2008-2019 EDF R&D
   4 #
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   6 # modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
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   9 #
  10 # This library is distributed in the hope that it will be useful,
  11 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
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  16 # License along with this library; if not, write to the Free Software
  17 # Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  18 #
  19 # See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  20 #
  21 # Author: Jean-Philippe Argaud, jean-philippe.argaud@edf.fr, EDF R&D
  22
  23 import logging
  24 from daCore import BasicObjects
  25 import numpy
  26
  27 # ==============================================================================
  28 class ElementaryAlgorithm(BasicObjects.Algorithm):
  29     def __init__(self):
  30         BasicObjects.Algorithm.__init__(self, "QUANTILEREGRESSION")
  31         self.defineRequiredParameter(
  32             name     = "Quantile",
  33             default  = 0.5,
  34             typecast = float,
  35             message  = "Quantile pour la regression de quantile",
  36             minval   = 0.,
  37             maxval   = 1.,
  38             )
  39         self.defineRequiredParameter(
  40             name     = "Minimizer",
  41             default  = "MMQR",
  42             typecast = str,
  43             message  = "Minimiseur utilisé",
  44             listval  = ["MMQR"],
  45             )
  46         self.defineRequiredParameter(
  47             name     = "MaximumNumberOfSteps",
  48             default  = 15000,
  49             typecast = int,
  50             message  = "Nombre maximal de pas d'optimisation",
  51             minval   = 1,
  52             )
  53         self.defineRequiredParameter(
  54             name     = "CostDecrementTolerance",
  55             default  = 1.e-6,
  56             typecast = float,
  57             message  = "Maximum de variation de la fonction d'estimation lors de l'arrêt",
  58             )
  59         self.defineRequiredParameter(
  60             name     = "StoreInternalVariables",
  61             default  = False,
  62             typecast = bool,
  63             message  = "Stockage des variables internes ou intermédiaires du calcul",
  64             )
  65         self.defineRequiredParameter(
  66             name     = "StoreSupplementaryCalculations",
  67             default  = [],
  68             typecast = tuple,
  69             message  = "Liste de calculs supplémentaires à stocker et/ou effectuer",
  70             listval  = [
  71                 "Analysis",
  72                 "BMA",
  73                 "CostFunctionJ",
  74                 "CostFunctionJb",
  75                 "CostFunctionJo",
  76                 "CurrentState",
  77                 "Innovation",
  78                 "OMA",
  79                 "OMB",
  80                 "SimulatedObservationAtBackground",
  81                 "SimulatedObservationAtCurrentState",
  82                 "SimulatedObservationAtOptimum",
  83                 ]
  84             )
  85         self.defineRequiredParameter( # Pas de type
  86             name     = "Bounds",
  87             message  = "Liste des valeurs de bornes",
  88             )
  89         self.requireInputArguments(
  90             mandatory= ("Xb", "Y", "HO" ),
  91             )
  92
  93     def run(self, Xb=None, Y=None, U=None, HO=None, EM=None, CM=None, R=None, B=None, Q=None, Parameters=None):
  94         self._pre_run(Parameters, Xb, Y, R, B, Q)
  95         #
  96         Hm = HO["Direct"].appliedTo
  97         #
  98         # Utilisation éventuelle d'un vecteur H(Xb) précalculé
  99         # ----------------------------------------------------
 100         if HO["AppliedInX"] is not None and "HXb" in HO["AppliedInX"]:
 101             HXb = Hm( Xb, HO["AppliedInX"]["HXb"])
 102         else:
 103             HXb = Hm( Xb )
 104         HXb = numpy.asmatrix(numpy.ravel( HXb )).T
 105         #
 106         # Calcul de l'innovation
 107         # ----------------------
 108         if Y.size != HXb.size:
 109             raise ValueError("The size %i of observations Y and %i of observed calculation H(X) are different, they have to be identical."%(Y.size,HXb.size))
 110         if max(Y.shape) != max(HXb.shape):
 111             raise ValueError("The shapes %s of observations Y and %s of observed calculation H(X) are different, they have to be identical."%(Y.shape,HXb.shape))
 112         d  = Y - HXb
 113         #
 114         # Définition de la fonction-coût
 115         # ------------------------------
 116         def CostFunction(x):
 117             _X  = numpy.asmatrix(numpy.ravel( x )).T
 118             if self._parameters["StoreInternalVariables"] or self._toStore("CurrentState"):
 119                 self.StoredVariables["CurrentState"].store( _X )
 120             _HX = Hm( _X )
 121             _HX = numpy.asmatrix(numpy.ravel( _HX )).T
 122             if self._toStore("SimulatedObservationAtCurrentState"):
 123                 self.StoredVariables["SimulatedObservationAtCurrentState"].store( _HX )
 124             Jb  = 0.
 125             Jo  = 0.
 126             J   = Jb + Jo
 127             self.StoredVariables["CostFunctionJb"].store( Jb )
 128             self.StoredVariables["CostFunctionJo"].store( Jo )
 129             self.StoredVariables["CostFunctionJ" ].store( J )
 130             return _HX
 131         #
 132         def GradientOfCostFunction(x):
 133             _X      = numpy.asmatrix(numpy.ravel( x )).T
 134             Hg = HO["Tangent"].asMatrix( _X )
 135             return Hg
 136         #
 137         # Point de démarrage de l'optimisation : Xini = Xb
 138         # ------------------------------------
 139         if isinstance(Xb, type(numpy.matrix([]))):
 140             Xini = Xb.A1.tolist()
 141         else:
 142             Xini = list(Xb)
 143         #
 144         # Minimisation de la fonctionnelle
 145         # --------------------------------
 146         if self._parameters["Minimizer"] == "MMQR":
 147             import mmqr
 148             Minimum, J_optimal, Informations = mmqr.mmqr(
 149                 func        = CostFunction,
 150                 x0          = Xini,
 151                 fprime      = GradientOfCostFunction,
 152                 bounds      = self._parameters["Bounds"],
 153                 quantile    = self._parameters["Quantile"],
 154                 maxfun      = self._parameters["MaximumNumberOfSteps"],
 155                 toler       = self._parameters["CostDecrementTolerance"],
 156                 y           = Y,
 157                 )
 158             nfeval = Informations[2]
 159             rc     = Informations[4]
 160         else:
 161             raise ValueError("Error in Minimizer name: %s"%self._parameters["Minimizer"])
 162         #
 163         # Obtention de l'analyse
 164         # ----------------------
 165         Xa = numpy.asmatrix(numpy.ravel( Minimum )).T
 166         #
 167         self.StoredVariables["Analysis"].store( Xa.A1 )
 168         #
 169         if self._toStore("OMA") or \
 170             self._toStore("SimulatedObservationAtOptimum"):
 171             HXa = Hm(Xa)
 172         #
 173         # Calculs et/ou stockages supplémentaires
 174         # ---------------------------------------
 175         if self._toStore("Innovation"):
 176             self.StoredVariables["Innovation"].store( numpy.ravel(d) )
 177         if self._toStore("BMA"):
 178             self.StoredVariables["BMA"].store( numpy.ravel(Xb - Xa) )
 179         if self._toStore("OMA"):
 180             self.StoredVariables["OMA"].store( numpy.ravel(Y - HXa) )
 181         if self._toStore("OMB"):
 182             self.StoredVariables["OMB"].store( numpy.ravel(d) )
 183         if self._toStore("SimulatedObservationAtBackground"):
 184             self.StoredVariables["SimulatedObservationAtBackground"].store( numpy.ravel(HXb) )
 185         if self._toStore("SimulatedObservationAtOptimum"):
 186             self.StoredVariables["SimulatedObservationAtOptimum"].store( numpy.ravel(HXa) )
 187         #
 188         self._post_run(HO)
 189         return 0
 190
 191 # ==============================================================================
 192 if __name__ == "__main__":
 193     print('\n AUTODIAGNOSTIC\n')