src/ParaMEDMEM_Swig/ParaMEDMEMCommon.i

   1 // Copyright (C) 2017-2020  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 %include std_set.i
  21
  22 %template() std::set<int>;
  23
  24 %{
  25 #include "CommInterface.hxx"
  26 #include "ProcessorGroup.hxx"
  27 #include "Topology.hxx"
  28 #include "MPIProcessorGroup.hxx"
  29 #include "DEC.hxx"
  30 #include "InterpKernelDEC.hxx"
  31 #include "NonCoincidentDEC.hxx"
  32 #include "StructuredCoincidentDEC.hxx"
  33 #include "ParaMESH.hxx"
  34 #include "ParaFIELD.hxx"
  35 #include "ICoCoMEDField.hxx"
  36 #include "ComponentTopology.hxx"
  37 #include "ParaUMesh.hxx"
  38 #include "ParaSkyLineArray.hxx"
  39
  40 using namespace INTERP_KERNEL;
  41 using namespace MEDCoupling;
  42 using namespace ICoCo;
  43 %}
  44
  45 %include "InterpolationOptions.hxx"
  46 %include "ProcessorGroup.hxx"
  47 %include "DECOptions.hxx"
  48 %include "ParaMESH.hxx"
  49 %include "ParaFIELD.hxx"
  50 %include "MPIProcessorGroup.hxx"
  51 %include "ComponentTopology.hxx"
  52 %include "DEC.hxx"
  53 %include "DisjointDEC.hxx"
  54 %include "InterpKernelDEC.hxx"
  55 %include "StructuredCoincidentDEC.hxx"
  56
  57 %include "ICoCoField.hxx"
  58 %rename(ICoCoMEDField) ICoCo::MEDField;
  59 %include "ICoCoMEDField.hxx"
  60
  61 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::New;
  62 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getMesh;
  63 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getGlobalCellIds;
  64 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getGlobalNodeIds;
  65 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getCellIdsLyingOnNodes;
  66 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeCells;
  67 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeCellField;
  68 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeNodeField;
  69 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::New;
  70 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::equiRedistribute;
  71 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::getSkyLineArray;
  72 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::getGlobalIdsArray;
  73
  74 %feature("unref") ParaSkyLineArray "$this->decrRef();"
  75 %feature("unref") ParaUMesh "$this->decrRef();"
  76
  77 %nodefaultctor;
  78
  79 namespace MEDCoupling
  80 {
  81   class CommInterface
  82   {
  83   public:
  84     CommInterface();
  85     virtual ~CommInterface();
  86     int worldSize() const;
  87     int commSize(MPI_Comm comm, int* size) const;
  88     int commRank(MPI_Comm comm, int* rank) const;
  89     int commGroup(MPI_Comm comm, MPI_Group* group) const;
  90     int groupIncl(MPI_Group group, int size, int* ranks, MPI_Group* group_output) const;
  91     int commCreate(MPI_Comm comm, MPI_Group group, MPI_Comm* comm_output) const;
  92     int groupFree(MPI_Group* group) const;
  93     int commFree(MPI_Comm* comm) const;
  94
  95     int send(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int target, int tag, MPI_Comm comm) const;
  96     int recv(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status) const;
  97     int sendRecv(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
  98                  int dest, int sendtag, void* recvbuf, int recvcount,
  99                  MPI_Datatype recvtype, int source, int recvtag, MPI_Comm comm,
 100                  MPI_Status* status);
 101
 102     int Isend(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int target,
 103               int tag, MPI_Comm comm, MPI_Request *request) const;
 104     int Irecv(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int source,
 105               int tag, MPI_Comm comm, MPI_Request* request) const;
 106
 107     int wait(MPI_Request *request, MPI_Status *status) const;
 108     int test(MPI_Request *request, int *flag, MPI_Status *status) const;
 109     int requestFree(MPI_Request *request) const;
 110     int waitany(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *index, MPI_Status *status) const;
 111     int testany(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *index, int *flag, MPI_Status *status) const;
 112     int waitall(int count, MPI_Request *array_of_requests, MPI_Status *array_of_status) const { return MPI_Waitall(count, array_of_requests, array_of_status); }
 113     int testall(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *flag, MPI_Status *array_of_status) const;
 114     int waitsome(int incount, MPI_Request *array_of_requests,int *outcount, int *array_of_indices, MPI_Status *array_of_status) const;
 115     int testsome(int incount, MPI_Request *array_of_requests, int *outcount,
 116                  int *array_of_indices, MPI_Status *array_of_status) const;
 117     int probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status *status) const;
 118     int Iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int *flag, MPI_Status *status) const;
 119     int cancel(MPI_Request *request) const;
 120     int testCancelled(MPI_Status *status, int *flag) const;
 121     int barrier(MPI_Comm comm) const;
 122     int errorString(int errorcode, char *string, int *resultlen) const;
 123     int getCount(MPI_Status *status, MPI_Datatype datatype, int *count) const;
 124
 125     int broadcast(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int root, MPI_Comm comm) const;
 126     int allGather(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 127                   void* recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 128                   MPI_Comm comm) const;
 129     int allToAll(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 130                  void* recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 131                  MPI_Comm comm) const;
 132     int allToAllV(void* sendbuf, int* sendcounts, int* senddispls,
 133                   MPI_Datatype sendtype, void* recvbuf, int* recvcounts,
 134                   int* recvdispls, MPI_Datatype recvtype,
 135                   MPI_Comm comm) const;
 136
 137     int reduce(void* sendbuf, void* recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root, MPI_Comm comm) const;
 138     int allReduce(void* sendbuf, void* recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm) const;
 139     %extend
 140     {
 141       PyObject *allGatherArrays(const DataArrayIdType *array) const
 142       {
 143         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > ret;
 144         self->allGatherArrays(MPI_COMM_WORLD,array,ret);
 145         return convertFromVectorAutoObjToPyObj<DataArrayIdType>(ret,SWIGTITraits<mcIdType>::TI);
 146       }
 147
 148       PyObject *allToAllArrays(PyObject *arrays) const
 149       {
 150         std::vector< DataArrayIdType * > arraysIn;
 151         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > arrayOut;
 152         convertFromPyObjVectorOfObj<MEDCoupling::DataArrayIdType*>(arrays,SWIGTITraits<mcIdType>::TI,"DataArrayIdType",arraysIn);
 153         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > arraysIn2(FromVecToVecAuto<DataArrayIdType>(arraysIn));
 154         self->allToAllArrays(MPI_COMM_WORLD,arraysIn2,arrayOut);
 155         return convertFromVectorAutoObjToPyObj<DataArrayIdType>(arrayOut,SWIGTITraits<mcIdType>::TI);
 156       }
 157     }
 158   };
 159
 160   class ParaUMesh : public RefCountObject
 161   {
 162   public:
 163     static ParaUMesh *New(MEDCouplingUMesh *mesh, DataArrayIdType *globalCellIds, DataArrayIdType *globalNodeIds);
 164     ParaUMesh *redistributeCells(const DataArrayIdType *globalCellIds) const;
 165     DataArrayIdType *redistributeCellField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayIdType *fieldValueToRed) const;
 166     DataArrayDouble *redistributeCellField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayDouble *fieldValueToRed) const;
 167     DataArrayIdType *redistributeNodeField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayIdType *fieldValueToRed) const;
 168     DataArrayDouble *redistributeNodeField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayDouble *fieldValueToRed) const;
 169     %extend
 170     {
 171       ParaUMesh(MEDCouplingUMesh *mesh, DataArrayIdType *globalCellIds, DataArrayIdType *globalNodeIds)
 172       {
 173         return ParaUMesh::New(mesh,globalCellIds,globalNodeIds);
 174       }
 175
 176       MEDCouplingUMesh *getMesh()
 177       {
 178         MEDCouplingUMesh *ret(self->getMesh());
 179         if(ret) ret->incrRef();
 180         return ret;
 181       }
 182
 183       DataArrayIdType *getGlobalCellIds()
 184       {
 185         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalCellIds());
 186         if(ret) ret->incrRef();
 187         return ret;
 188       }
 189
 190       DataArrayIdType *getGlobalNodeIds()
 191       {
 192         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalNodeIds());
 193         if(ret) ret->incrRef();
 194         return ret;
 195       }
 196
 197       DataArrayIdType *getCellIdsLyingOnNodes(const DataArrayIdType *globalNodeIds, bool fullyIn) const
 198       {
 199         MCAuto<DataArrayIdType> ret(self->getCellIdsLyingOnNodes(globalNodeIds,fullyIn));
 200         return ret.retn();
 201       }
 202     }
 203   };
 204
 205   class ParaSkyLineArray : public RefCountObject
 206   {
 207   public:
 208     static ParaSkyLineArray *New(MEDCouplingSkyLineArray *ska, DataArrayIdType *globalIds);
 209     %extend
 210     {
 211       ParaSkyLineArray(MEDCouplingSkyLineArray *ska, DataArrayIdType *globalIds)
 212       {
 213         return ParaSkyLineArray::New(ska,globalIds);
 214       }
 215
 216       ParaSkyLineArray *equiRedistribute(mcIdType nbOfEntities) const
 217       {
 218         MCAuto<ParaSkyLineArray> ret(self->equiRedistribute(nbOfEntities));
 219         return ret.retn();
 220       }
 221
 222       MEDCouplingSkyLineArray *getSkyLineArray() const
 223       {
 224         MEDCouplingSkyLineArray *ret(self->getSkyLineArray());
 225         if(ret)
 226           ret->incrRef();
 227         return ret;
 228       }
 229
 230       DataArrayIdType *getGlobalIdsArray() const
 231       {
 232         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalIdsArray());
 233         if(ret)
 234           ret->incrRef();
 235         return ret;
 236       }
 237     }
 238   };
 239 }
 240
 241 /* This object can be used only if MED_ENABLE_FVM is defined*/
 242 #ifdef MED_ENABLE_FVM
 243 class NonCoincidentDEC : public DEC
 244 {
 245 public:
 246   NonCoincidentDEC(ProcessorGroup& source, ProcessorGroup& target);
 247 };
 248 #endif
 249
 250 %extend MEDCoupling::ParaMESH
 251 {
 252   PyObject *getGlobalNumberingCell2() const
 253   {
 254     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingCell();
 255     mcIdType size=self->getCellMesh()->getNumberOfCells();
 256     PyObject *ret=PyList_New(size);
 257     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 258       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 259     return ret;
 260   }
 261
 262   PyObject *getGlobalNumberingFace2() const
 263   {
 264     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingFace();
 265     mcIdType size=self->getFaceMesh()->getNumberOfCells();
 266     PyObject *ret=PyList_New(size);
 267     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 268       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 269     return ret;
 270   }
 271
 272   PyObject *getGlobalNumberingNode2() const
 273   {
 274     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingNode();
 275     mcIdType size=self->getCellMesh()->getNumberOfNodes();
 276     PyObject *ret=PyList_New(size);
 277     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 278       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 279     return ret;
 280   }
 281 }