src/ParaMEDMEM_Swig/ParaMEDMEMCommon.i

   1 // Copyright (C) 2017-2020  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 %include std_set.i
  21
  22 %template() std::set<int>;
  23
  24 %{
  25 #include "CommInterface.hxx"
  26 #include "ProcessorGroup.hxx"
  27 #include "Topology.hxx"
  28 #include "MPIProcessorGroup.hxx"
  29 #include "DEC.hxx"
  30 #include "InterpKernelDEC.hxx"
  31 #include "NonCoincidentDEC.hxx"
  32 #include "StructuredCoincidentDEC.hxx"
  33 #include "ParaMESH.hxx"
  34 #include "ParaFIELD.hxx"
  35 #include "ICoCoMEDField.hxx"
  36 #include "ComponentTopology.hxx"
  37 #include "ParaUMesh.hxx"
  38 #include "ParaSkyLineArray.hxx"
  39
  40 using namespace INTERP_KERNEL;
  41 using namespace MEDCoupling;
  42 using namespace ICoCo;
  43 %}
  44
  45 %include "InterpolationOptions.hxx"
  46 %include "ProcessorGroup.hxx"
  47 %include "DECOptions.hxx"
  48 %include "ParaMESH.hxx"
  49 %include "ParaFIELD.hxx"
  50 %include "MPIProcessorGroup.hxx"
  51 %include "ComponentTopology.hxx"
  52 %include "DEC.hxx"
  53 %include "DisjointDEC.hxx"
  54 %include "InterpKernelDEC.hxx"
  55 %include "StructuredCoincidentDEC.hxx"
  56
  57 %include "ICoCoField.hxx"
  58 %rename(ICoCoMEDField) ICoCo::MEDField;
  59 %include "ICoCoMEDField.hxx"
  60
  61 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getCellIdsLyingOnNodes;
  62 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::equiRedistribute;
  63 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::getSkyLineArray;
  64 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::getGlobalIdsArray;
  65
  66 %feature("unref") ParaSkyLineArray "$this->decrRef();"
  67
  68 %nodefaultctor;
  69
  70 namespace MEDCoupling
  71 {
  72   class CommInterface
  73   {
  74   public:
  75     CommInterface();
  76     virtual ~CommInterface();
  77     int worldSize() const;
  78     int commSize(MPI_Comm comm, int* size) const;
  79     int commRank(MPI_Comm comm, int* rank) const;
  80     int commGroup(MPI_Comm comm, MPI_Group* group) const;
  81     int groupIncl(MPI_Group group, int size, int* ranks, MPI_Group* group_output) const;
  82     int commCreate(MPI_Comm comm, MPI_Group group, MPI_Comm* comm_output) const;
  83     int groupFree(MPI_Group* group) const;
  84     int commFree(MPI_Comm* comm) const;
  85
  86     int send(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int target, int tag, MPI_Comm comm) const;
  87     int recv(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status) const;
  88     int sendRecv(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
  89                  int dest, int sendtag, void* recvbuf, int recvcount,
  90                  MPI_Datatype recvtype, int source, int recvtag, MPI_Comm comm,
  91                  MPI_Status* status);
  92
  93     int Isend(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int target,
  94               int tag, MPI_Comm comm, MPI_Request *request) const;
  95     int Irecv(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int source,
  96               int tag, MPI_Comm comm, MPI_Request* request) const;
  97
  98     int wait(MPI_Request *request, MPI_Status *status) const;
  99     int test(MPI_Request *request, int *flag, MPI_Status *status) const;
 100     int requestFree(MPI_Request *request) const;
 101     int waitany(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *index, MPI_Status *status) const;
 102     int testany(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *index, int *flag, MPI_Status *status) const;
 103     int waitall(int count, MPI_Request *array_of_requests, MPI_Status *array_of_status) const { return MPI_Waitall(count, array_of_requests, array_of_status); }
 104     int testall(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *flag, MPI_Status *array_of_status) const;
 105     int waitsome(int incount, MPI_Request *array_of_requests,int *outcount, int *array_of_indices, MPI_Status *array_of_status) const;
 106     int testsome(int incount, MPI_Request *array_of_requests, int *outcount,
 107                  int *array_of_indices, MPI_Status *array_of_status) const;
 108     int probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status *status) const;
 109     int Iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int *flag, MPI_Status *status) const;
 110     int cancel(MPI_Request *request) const;
 111     int testCancelled(MPI_Status *status, int *flag) const;
 112     int barrier(MPI_Comm comm) const;
 113     int errorString(int errorcode, char *string, int *resultlen) const;
 114     int getCount(MPI_Status *status, MPI_Datatype datatype, int *count) const;
 115
 116     int broadcast(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int root, MPI_Comm comm) const;
 117     int allGather(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 118                   void* recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 119                   MPI_Comm comm) const;
 120     int allToAll(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 121                  void* recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 122                  MPI_Comm comm) const;
 123     int allToAllV(void* sendbuf, int* sendcounts, int* senddispls,
 124                   MPI_Datatype sendtype, void* recvbuf, int* recvcounts,
 125                   int* recvdispls, MPI_Datatype recvtype,
 126                   MPI_Comm comm) const;
 127
 128     int reduce(void* sendbuf, void* recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root, MPI_Comm comm) const;
 129     int allReduce(void* sendbuf, void* recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm) const;
 130   };
 131
 132   class ParaUMesh
 133   {
 134   public:
 135     ParaUMesh(MEDCouplingUMesh *mesh, DataArrayIdType *globalCellIds, DataArrayIdType *globalNodeIds);
 136     %extend
 137     {
 138       DataArrayIdType *getCellIdsLyingOnNodes(const DataArrayIdType *globalNodeIds, bool fullyIn) const
 139       {
 140         MCAuto<DataArrayIdType> ret(self->getCellIdsLyingOnNodes(globalNodeIds,fullyIn));
 141         return ret.retn();
 142       }
 143     }
 144   };
 145
 146   class ParaSkyLineArray : public RefCountObject
 147   {
 148   public:
 149     static ParaSkyLineArray *New(MEDCouplingSkyLineArray *ska, DataArrayIdType *globalIds);
 150     %extend
 151     {
 152       ParaSkyLineArray(MEDCouplingSkyLineArray *ska, DataArrayIdType *globalIds)
 153       {
 154         return ParaSkyLineArray::New(ska,globalIds);
 155       }
 156
 157       ParaSkyLineArray *equiRedistribute(mcIdType nbOfEntities) const
 158       {
 159         MCAuto<ParaSkyLineArray> ret(self->equiRedistribute(nbOfEntities));
 160         return ret.retn();
 161       }
 162
 163       MEDCouplingSkyLineArray *getSkyLineArray() const
 164       {
 165         MEDCouplingSkyLineArray *ret(self->getSkyLineArray());
 166         if(ret)
 167           ret->incrRef();
 168         return ret;
 169       }
 170
 171       DataArrayIdType *getGlobalIdsArray() const
 172       {
 173         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalIdsArray());
 174         if(ret)
 175           ret->incrRef();
 176         return ret;
 177       }
 178     }
 179   };
 180 }
 181
 182 /* This object can be used only if MED_ENABLE_FVM is defined*/
 183 #ifdef MED_ENABLE_FVM
 184 class NonCoincidentDEC : public DEC
 185 {
 186 public:
 187   NonCoincidentDEC(ProcessorGroup& source, ProcessorGroup& target);
 188 };
 189 #endif
 190
 191 %extend MEDCoupling::ParaMESH
 192 {
 193   PyObject *getGlobalNumberingCell2() const
 194   {
 195     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingCell();
 196     mcIdType size=self->getCellMesh()->getNumberOfCells();
 197     PyObject *ret=PyList_New(size);
 198     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 199       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 200     return ret;
 201   }
 202
 203   PyObject *getGlobalNumberingFace2() const
 204   {
 205     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingFace();
 206     mcIdType size=self->getFaceMesh()->getNumberOfCells();
 207     PyObject *ret=PyList_New(size);
 208     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 209       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 210     return ret;
 211   }
 212
 213   PyObject *getGlobalNumberingNode2() const
 214   {
 215     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingNode();
 216     mcIdType size=self->getCellMesh()->getNumberOfNodes();
 217     PyObject *ret=PyList_New(size);
 218     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 219       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 220     return ret;
 221   }
 222 }