src/ParaMEDMEM_Swig/ParaMEDMEMCommon.i

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  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 %include std_set.i
  21
  22 %template() std::set<int>;
  23
  24 %{
  25 #include "CommInterface.hxx"
  26 #include "ProcessorGroup.hxx"
  27 #include "Topology.hxx"
  28 #include "MPIProcessorGroup.hxx"
  29 #include "DEC.hxx"
  30 #include "InterpKernelDEC.hxx"
  31 #include "NonCoincidentDEC.hxx"
  32 #include "StructuredCoincidentDEC.hxx"
  33 #include "ParaMESH.hxx"
  34 #include "ParaFIELD.hxx"
  35 #include "ICoCoMEDField.hxx"
  36 #include "ComponentTopology.hxx"
  37 #include "ParaUMesh.hxx"
  38 #include "ParaSkyLineArray.hxx"
  39 #include "ParaDataArray.hxx"
  40
  41 using namespace INTERP_KERNEL;
  42 using namespace MEDCoupling;
  43 using namespace ICoCo;
  44 %}
  45
  46 %include "InterpolationOptions.hxx"
  47 %include "ProcessorGroup.hxx"
  48 %include "DECOptions.hxx"
  49 %include "ParaMESH.hxx"
  50 %include "ParaFIELD.hxx"
  51 %include "MPIProcessorGroup.hxx"
  52 %include "ComponentTopology.hxx"
  53 %include "DEC.hxx"
  54 %include "DisjointDEC.hxx"
  55 %include "InterpKernelDEC.hxx"
  56 %include "StructuredCoincidentDEC.hxx"
  57
  58 %include "ICoCoField.hxx"
  59 %rename(ICoCoMEDField) ICoCo::MEDField;
  60 %include "ICoCoMEDField.hxx"
  61
  62 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::New;
  63 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getMesh;
  64 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getGlobalCellIds;
  65 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getGlobalNodeIds;
  66 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getCellIdsLyingOnNodes;
  67 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeCells;
  68 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeCellField;
  69 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeNodeField;
  70 %newobject MEDCoupling::ParaDataArrayInt32::New;
  71 %newobject MEDCoupling::ParaDataArrayInt32::buildComplement;
  72 %newobject MEDCoupling::ParaDataArrayInt64::New;
  73 %newobject MEDCoupling::ParaDataArrayInt64::buildComplement;
  74 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::New;
  75 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::equiRedistribute;
  76 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::getSkyLineArray;
  77 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::getGlobalIdsArray;
  78
  79 %feature("unref") ParaSkyLineArray "$this->decrRef();"
  80 %feature("unref") ParaUMesh "$this->decrRef();"
  81 %feature("unref") ParaDataArrayInt32 "$this->decrRef();"
  82 %feature("unref") ParaDataArrayInt64 "$this->decrRef();"
  83
  84 %nodefaultctor;
  85
  86 namespace MEDCoupling
  87 {
  88   class CommInterface
  89   {
  90   public:
  91     CommInterface();
  92     virtual ~CommInterface();
  93     int worldSize() const;
  94     int commSize(MPI_Comm comm, int* size) const;
  95     int commRank(MPI_Comm comm, int* rank) const;
  96     int commGroup(MPI_Comm comm, MPI_Group* group) const;
  97     int groupIncl(MPI_Group group, int size, int* ranks, MPI_Group* group_output) const;
  98     int commCreate(MPI_Comm comm, MPI_Group group, MPI_Comm* comm_output) const;
  99     int groupFree(MPI_Group* group) const;
 100     int commFree(MPI_Comm* comm) const;
 101
 102     int send(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int target, int tag, MPI_Comm comm) const;
 103     int recv(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status) const;
 104     int sendRecv(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 105                  int dest, int sendtag, void* recvbuf, int recvcount,
 106                  MPI_Datatype recvtype, int source, int recvtag, MPI_Comm comm,
 107                  MPI_Status* status);
 108
 109     int Isend(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int target,
 110               int tag, MPI_Comm comm, MPI_Request *request) const;
 111     int Irecv(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int source,
 112               int tag, MPI_Comm comm, MPI_Request* request) const;
 113
 114     int wait(MPI_Request *request, MPI_Status *status) const;
 115     int test(MPI_Request *request, int *flag, MPI_Status *status) const;
 116     int requestFree(MPI_Request *request) const;
 117     int waitany(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *index, MPI_Status *status) const;
 118     int testany(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *index, int *flag, MPI_Status *status) const;
 119     int waitall(int count, MPI_Request *array_of_requests, MPI_Status *array_of_status) const { return MPI_Waitall(count, array_of_requests, array_of_status); }
 120     int testall(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *flag, MPI_Status *array_of_status) const;
 121     int waitsome(int incount, MPI_Request *array_of_requests,int *outcount, int *array_of_indices, MPI_Status *array_of_status) const;
 122     int testsome(int incount, MPI_Request *array_of_requests, int *outcount,
 123                  int *array_of_indices, MPI_Status *array_of_status) const;
 124     int probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status *status) const;
 125     int Iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int *flag, MPI_Status *status) const;
 126     int cancel(MPI_Request *request) const;
 127     int testCancelled(MPI_Status *status, int *flag) const;
 128     int barrier(MPI_Comm comm) const;
 129     int errorString(int errorcode, char *string, int *resultlen) const;
 130     int getCount(MPI_Status *status, MPI_Datatype datatype, int *count) const;
 131
 132     int broadcast(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int root, MPI_Comm comm) const;
 133     int allGather(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 134                   void* recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 135                   MPI_Comm comm) const;
 136     int allToAll(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 137                  void* recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 138                  MPI_Comm comm) const;
 139     int allToAllV(void* sendbuf, int* sendcounts, int* senddispls,
 140                   MPI_Datatype sendtype, void* recvbuf, int* recvcounts,
 141                   int* recvdispls, MPI_Datatype recvtype,
 142                   MPI_Comm comm) const;
 143
 144     int reduce(void* sendbuf, void* recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root, MPI_Comm comm) const;
 145     int allReduce(void* sendbuf, void* recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm) const;
 146     %extend
 147     {
 148       PyObject *allGatherArrays(const DataArrayIdType *array) const
 149       {
 150         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > ret;
 151         self->allGatherArrays(MPI_COMM_WORLD,array,ret);
 152         return convertFromVectorAutoObjToPyObj<DataArrayIdType>(ret,SWIGTITraits<mcIdType>::TI);
 153       }
 154
 155       PyObject *allToAllArrays(PyObject *arrays) const
 156       {
 157         std::vector< DataArrayIdType * > arraysIn;
 158         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > arrayOut;
 159         convertFromPyObjVectorOfObj<MEDCoupling::DataArrayIdType*>(arrays,SWIGTITraits<mcIdType>::TI,"DataArrayIdType",arraysIn);
 160         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > arraysIn2(FromVecToVecAuto<DataArrayIdType>(arraysIn));
 161         self->allToAllArrays(MPI_COMM_WORLD,arraysIn2,arrayOut);
 162         return convertFromVectorAutoObjToPyObj<DataArrayIdType>(arrayOut,SWIGTITraits<mcIdType>::TI);
 163       }
 164     }
 165   };
 166
 167   class ParaUMesh : public RefCountObject
 168   {
 169   public:
 170     static ParaUMesh *New(MEDCouplingUMesh *mesh, DataArrayIdType *globalCellIds, DataArrayIdType *globalNodeIds);
 171     ParaUMesh *redistributeCells(const DataArrayIdType *globalCellIds) const;
 172     DataArrayIdType *redistributeCellField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayIdType *fieldValueToRed) const;
 173     DataArrayDouble *redistributeCellField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayDouble *fieldValueToRed) const;
 174     DataArrayIdType *redistributeNodeField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayIdType *fieldValueToRed) const;
 175     DataArrayDouble *redistributeNodeField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayDouble *fieldValueToRed) const;
 176     %extend
 177     {
 178       ParaUMesh(MEDCouplingUMesh *mesh, DataArrayIdType *globalCellIds, DataArrayIdType *globalNodeIds)
 179       {
 180         return ParaUMesh::New(mesh,globalCellIds,globalNodeIds);
 181       }
 182
 183       MEDCouplingUMesh *getMesh()
 184       {
 185         MEDCouplingUMesh *ret(self->getMesh());
 186         if(ret) ret->incrRef();
 187         return ret;
 188       }
 189
 190       DataArrayIdType *getGlobalCellIds()
 191       {
 192         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalCellIds());
 193         if(ret) ret->incrRef();
 194         return ret;
 195       }
 196
 197       DataArrayIdType *getGlobalNodeIds()
 198       {
 199         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalNodeIds());
 200         if(ret) ret->incrRef();
 201         return ret;
 202       }
 203
 204       DataArrayIdType *getCellIdsLyingOnNodes(const DataArrayIdType *globalNodeIds, bool fullyIn) const
 205       {
 206         MCAuto<DataArrayIdType> ret(self->getCellIdsLyingOnNodes(globalNodeIds,fullyIn));
 207         return ret.retn();
 208       }
 209     }
 210   };
 211
 212   class ParaDataArray : public RefCountObject
 213   {
 214   };
 215
 216   class ParaDataArrayInt32 : public ParaDataArray
 217   {
 218   public:
 219     static ParaDataArrayInt32 *New(DataArrayInt32 *seqDa);
 220     DataArrayIdType *buildComplement(int nbOfElems) const;
 221     %extend
 222     {
 223       ParaDataArrayInt32(DataArrayInt32 *seqDa)
 224       {
 225         return ParaDataArrayInt32::New(seqDa);
 226       }
 227     }
 228   };
 229
 230   class ParaDataArrayInt64 : public ParaDataArray
 231   {
 232   public:
 233     static ParaDataArrayInt64 *New(DataArrayInt64 *seqDa);
 234     DataArrayIdType *buildComplement(long nbOfElems) const;
 235     %extend
 236     {
 237       ParaDataArrayInt64(DataArrayInt64 *seqDa)
 238       {
 239         return ParaDataArrayInt64::New(seqDa);
 240       }
 241     }
 242   };
 243
 244   class ParaSkyLineArray : public RefCountObject
 245   {
 246   public:
 247     static ParaSkyLineArray *New(MEDCouplingSkyLineArray *ska, DataArrayIdType *globalIds);
 248     %extend
 249     {
 250       ParaSkyLineArray(MEDCouplingSkyLineArray *ska, DataArrayIdType *globalIds)
 251       {
 252         return ParaSkyLineArray::New(ska,globalIds);
 253       }
 254
 255       ParaSkyLineArray *equiRedistribute(mcIdType nbOfEntities) const
 256       {
 257         MCAuto<ParaSkyLineArray> ret(self->equiRedistribute(nbOfEntities));
 258         return ret.retn();
 259       }
 260
 261       MEDCouplingSkyLineArray *getSkyLineArray() const
 262       {
 263         MEDCouplingSkyLineArray *ret(self->getSkyLineArray());
 264         if(ret)
 265           ret->incrRef();
 266         return ret;
 267       }
 268
 269       DataArrayIdType *getGlobalIdsArray() const
 270       {
 271         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalIdsArray());
 272         if(ret)
 273           ret->incrRef();
 274         return ret;
 275       }
 276     }
 277   };
 278 }
 279
 280 /* This object can be used only if MED_ENABLE_FVM is defined*/
 281 #ifdef MED_ENABLE_FVM
 282 class NonCoincidentDEC : public DEC
 283 {
 284 public:
 285   NonCoincidentDEC(ProcessorGroup& source, ProcessorGroup& target);
 286 };
 287 #endif
 288
 289 %extend MEDCoupling::ParaMESH
 290 {
 291   PyObject *getGlobalNumberingCell2() const
 292   {
 293     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingCell();
 294     mcIdType size=self->getCellMesh()->getNumberOfCells();
 295     PyObject *ret=PyList_New(size);
 296     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 297       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 298     return ret;
 299   }
 300
 301   PyObject *getGlobalNumberingFace2() const
 302   {
 303     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingFace();
 304     mcIdType size=self->getFaceMesh()->getNumberOfCells();
 305     PyObject *ret=PyList_New(size);
 306     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 307       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 308     return ret;
 309   }
 310
 311   PyObject *getGlobalNumberingNode2() const
 312   {
 313     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingNode();
 314     mcIdType size=self->getCellMesh()->getNumberOfNodes();
 315     PyObject *ret=PyList_New(size);
 316     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 317       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 318     return ret;
 319   }
 320 }
 321
 322 %pythoncode %{
 323 if MEDCouplingUse64BitIDs():
 324   ParaDataArrayInt = ParaDataArrayInt64
 325 else:
 326   ParaDataArrayInt = ParaDataArrayInt32
 327 %}