src/ParaMEDMEM_Swig/ParaMEDMEMCommon.i

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  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 %include std_set.i
  21
  22 %template() std::set<int>;
  23
  24 %{
  25 #include "CommInterface.hxx"
  26 #include "ProcessorGroup.hxx"
  27 #include "Topology.hxx"
  28 #include "MPIProcessorGroup.hxx"
  29 #include "DEC.hxx"
  30 #include "InterpKernelDEC.hxx"
  31 #include "NonCoincidentDEC.hxx"
  32 #include "StructuredCoincidentDEC.hxx"
  33 #include "OverlapDEC.hxx"
  34 #include "ParaMESH.hxx"
  35 #include "ParaFIELD.hxx"
  36 #include "ICoCoMEDDoubleField.hxx"
  37 #include "ICoCoMEDIntField.hxx"
  38 #include "ComponentTopology.hxx"
  39 #include "ParaUMesh.hxx"
  40 #include "ParaSkyLineArray.hxx"
  41 #include "ParaDataArray.hxx"
  42
  43 using namespace INTERP_KERNEL;
  44 using namespace MEDCoupling;
  45 using namespace ICoCo;
  46 %}
  47
  48 %include "InterpolationOptions.hxx"
  49 %include "ProcessorGroup.hxx"
  50 %include "DECOptions.hxx"
  51 %include "ParaMESH.hxx"
  52 %include "ParaFIELD.hxx"
  53 %include "MPIProcessorGroup.hxx"
  54 %include "ComponentTopology.hxx"
  55 %include "DEC.hxx"
  56 %include "DisjointDEC.hxx"
  57 %include "InterpKernelDEC.hxx"
  58 %include "StructuredCoincidentDEC.hxx"
  59 %include "OverlapDEC.hxx"
  60
  61 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::New;
  62 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getMesh;
  63 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getGlobalCellIds;
  64 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getGlobalNodeIds;
  65 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::getCellIdsLyingOnNodes;
  66 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeCells;
  67 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeCellField;
  68 %newobject MEDCoupling::ParaUMesh::redistributeNodeField;
  69 %newobject MEDCoupling::ParaDataArrayInt32::New;
  70 %newobject MEDCoupling::ParaDataArrayInt32::buildComplement;
  71 %newobject MEDCoupling::ParaDataArrayInt64::New;
  72 %newobject MEDCoupling::ParaDataArrayInt64::buildComplement;
  73 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::New;
  74 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::equiRedistribute;
  75 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::getSkyLineArray;
  76 %newobject MEDCoupling::ParaSkyLineArray::getGlobalIdsArray;
  77
  78 %feature("unref") ParaSkyLineArray "$this->decrRef();"
  79 %feature("unref") ParaUMesh "$this->decrRef();"
  80 %feature("unref") ParaDataArrayInt32 "$this->decrRef();"
  81 %feature("unref") ParaDataArrayInt64 "$this->decrRef();"
  82
  83 %nodefaultctor;
  84
  85 namespace MEDCoupling
  86 {
  87   class CommInterface
  88   {
  89   public:
  90     CommInterface();
  91     virtual ~CommInterface();
  92     int worldSize() const;
  93     int commSize(MPI_Comm comm, int* size) const;
  94     int commRank(MPI_Comm comm, int* rank) const;
  95     int commGroup(MPI_Comm comm, MPI_Group* group) const;
  96     int groupIncl(MPI_Group group, int size, int* ranks, MPI_Group* group_output) const;
  97     int commCreate(MPI_Comm comm, MPI_Group group, MPI_Comm* comm_output) const;
  98     int groupFree(MPI_Group* group) const;
  99     int commFree(MPI_Comm* comm) const;
 100
 101     int send(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int target, int tag, MPI_Comm comm) const;
 102     int recv(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status) const;
 103     int sendRecv(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 104                  int dest, int sendtag, void* recvbuf, int recvcount,
 105                  MPI_Datatype recvtype, int source, int recvtag, MPI_Comm comm,
 106                  MPI_Status* status);
 107
 108     int Isend(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int target,
 109               int tag, MPI_Comm comm, MPI_Request *request) const;
 110     int Irecv(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int source,
 111               int tag, MPI_Comm comm, MPI_Request* request) const;
 112
 113     int wait(MPI_Request *request, MPI_Status *status) const;
 114     int test(MPI_Request *request, int *flag, MPI_Status *status) const;
 115     int requestFree(MPI_Request *request) const;
 116     int waitany(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *index, MPI_Status *status) const;
 117     int testany(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *index, int *flag, MPI_Status *status) const;
 118     int waitall(int count, MPI_Request *array_of_requests, MPI_Status *array_of_status) const { return MPI_Waitall(count, array_of_requests, array_of_status); }
 119     int testall(int count, MPI_Request *array_of_requests, int *flag, MPI_Status *array_of_status) const;
 120     int waitsome(int incount, MPI_Request *array_of_requests,int *outcount, int *array_of_indices, MPI_Status *array_of_status) const;
 121     int testsome(int incount, MPI_Request *array_of_requests, int *outcount,
 122                  int *array_of_indices, MPI_Status *array_of_status) const;
 123     int probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status *status) const;
 124     int Iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int *flag, MPI_Status *status) const;
 125     int cancel(MPI_Request *request) const;
 126     int testCancelled(MPI_Status *status, int *flag) const;
 127     int barrier(MPI_Comm comm) const;
 128     int errorString(int errorcode, char *string, int *resultlen) const;
 129     int getCount(MPI_Status *status, MPI_Datatype datatype, int *count) const;
 130
 131     int broadcast(void* buffer, int count, MPI_Datatype datatype, int root, MPI_Comm comm) const;
 132     int allGather(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 133                   void* recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 134                   MPI_Comm comm) const;
 135     int allToAll(void* sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 136                  void* recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 137                  MPI_Comm comm) const;
 138     int allToAllV(void* sendbuf, int* sendcounts, int* senddispls,
 139                   MPI_Datatype sendtype, void* recvbuf, int* recvcounts,
 140                   int* recvdispls, MPI_Datatype recvtype,
 141                   MPI_Comm comm) const;
 142
 143     int reduce(void* sendbuf, void* recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root, MPI_Comm comm) const;
 144     int allReduce(void* sendbuf, void* recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm) const;
 145     %extend
 146     {
 147       PyObject *allGatherArrays(const DataArrayIdType *array) const
 148       {
 149         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > ret;
 150         self->allGatherArrays(MPI_COMM_WORLD,array,ret);
 151         return convertFromVectorAutoObjToPyObj<DataArrayIdType>(ret,SWIGTITraits<mcIdType>::TI);
 152       }
 153
 154       PyObject *allToAllArrays(PyObject *arrays) const
 155       {
 156         std::vector< DataArrayIdType * > arraysIn;
 157         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > arrayOut;
 158         convertFromPyObjVectorOfObj<MEDCoupling::DataArrayIdType*>(arrays,SWIGTITraits<mcIdType>::TI,"DataArrayIdType",arraysIn);
 159         std::vector< MCAuto<DataArrayIdType> > arraysIn2(FromVecToVecAuto<DataArrayIdType>(arraysIn));
 160         self->allToAllArrays(MPI_COMM_WORLD,arraysIn2,arrayOut);
 161         return convertFromVectorAutoObjToPyObj<DataArrayIdType>(arrayOut,SWIGTITraits<mcIdType>::TI);
 162       }
 163     }
 164   };
 165
 166   class ParaUMesh : public RefCountObject
 167   {
 168   public:
 169     static ParaUMesh *New(MEDCouplingUMesh *mesh, DataArrayIdType *globalCellIds, DataArrayIdType *globalNodeIds);
 170     ParaUMesh *redistributeCells(const DataArrayIdType *globalCellIds) const;
 171     DataArrayIdType *redistributeCellField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayIdType *fieldValueToRed) const;
 172     DataArrayDouble *redistributeCellField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayDouble *fieldValueToRed) const;
 173     DataArrayIdType *redistributeNodeField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayIdType *fieldValueToRed) const;
 174     DataArrayDouble *redistributeNodeField(const DataArrayIdType *globalCellIds, const DataArrayDouble *fieldValueToRed) const;
 175     %extend
 176     {
 177       ParaUMesh(MEDCouplingUMesh *mesh, DataArrayIdType *globalCellIds, DataArrayIdType *globalNodeIds)
 178       {
 179         return ParaUMesh::New(mesh,globalCellIds,globalNodeIds);
 180       }
 181
 182       MEDCouplingUMesh *getMesh()
 183       {
 184         MEDCouplingUMesh *ret(self->getMesh());
 185         if(ret) ret->incrRef();
 186         return ret;
 187       }
 188
 189       DataArrayIdType *getGlobalCellIds()
 190       {
 191         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalCellIds());
 192         if(ret) ret->incrRef();
 193         return ret;
 194       }
 195
 196       DataArrayIdType *getGlobalNodeIds()
 197       {
 198         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalNodeIds());
 199         if(ret) ret->incrRef();
 200         return ret;
 201       }
 202
 203       DataArrayIdType *getCellIdsLyingOnNodes(const DataArrayIdType *globalNodeIds, bool fullyIn) const
 204       {
 205         MCAuto<DataArrayIdType> ret(self->getCellIdsLyingOnNodes(globalNodeIds,fullyIn));
 206         return ret.retn();
 207       }
 208     }
 209   };
 210
 211   class ParaDataArray : public RefCountObject
 212   {
 213   };
 214
 215   class ParaDataArrayInt32 : public ParaDataArray
 216   {
 217   public:
 218     static ParaDataArrayInt32 *New(DataArrayInt32 *seqDa);
 219     DataArrayIdType *buildComplement(int nbOfElems) const;
 220     %extend
 221     {
 222       ParaDataArrayInt32(DataArrayInt32 *seqDa)
 223       {
 224         return ParaDataArrayInt32::New(seqDa);
 225       }
 226     }
 227   };
 228
 229   class ParaDataArrayInt64 : public ParaDataArray
 230   {
 231   public:
 232     static ParaDataArrayInt64 *New(DataArrayInt64 *seqDa);
 233     DataArrayIdType *buildComplement(long nbOfElems) const;
 234     %extend
 235     {
 236       ParaDataArrayInt64(DataArrayInt64 *seqDa)
 237       {
 238         return ParaDataArrayInt64::New(seqDa);
 239       }
 240     }
 241   };
 242
 243   class ParaSkyLineArray : public RefCountObject
 244   {
 245   public:
 246     static ParaSkyLineArray *New(MEDCouplingSkyLineArray *ska, DataArrayIdType *globalIds);
 247     %extend
 248     {
 249       ParaSkyLineArray(MEDCouplingSkyLineArray *ska, DataArrayIdType *globalIds)
 250       {
 251         return ParaSkyLineArray::New(ska,globalIds);
 252       }
 253
 254       ParaSkyLineArray *equiRedistribute(mcIdType nbOfEntities) const
 255       {
 256         MCAuto<ParaSkyLineArray> ret(self->equiRedistribute(nbOfEntities));
 257         return ret.retn();
 258       }
 259
 260       MEDCouplingSkyLineArray *getSkyLineArray() const
 261       {
 262         MEDCouplingSkyLineArray *ret(self->getSkyLineArray());
 263         if(ret)
 264           ret->incrRef();
 265         return ret;
 266       }
 267
 268       DataArrayIdType *getGlobalIdsArray() const
 269       {
 270         DataArrayIdType *ret(self->getGlobalIdsArray());
 271         if(ret)
 272           ret->incrRef();
 273         return ret;
 274       }
 275     }
 276   };
 277 }
 278
 279 /* This object can be used only if MED_ENABLE_FVM is defined*/
 280 #ifdef MED_ENABLE_FVM
 281 class NonCoincidentDEC : public DEC
 282 {
 283 public:
 284   NonCoincidentDEC(ProcessorGroup& source, ProcessorGroup& target);
 285 };
 286 #endif
 287
 288 %extend MEDCoupling::ParaMESH
 289 {
 290   PyObject *getGlobalNumberingCell2() const
 291   {
 292     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingCell();
 293     mcIdType size=self->getCellMesh()->getNumberOfCells();
 294     PyObject *ret=PyList_New(size);
 295     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 296       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 297     return ret;
 298   }
 299
 300   PyObject *getGlobalNumberingFace2() const
 301   {
 302     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingFace();
 303     mcIdType size=self->getFaceMesh()->getNumberOfCells();
 304     PyObject *ret=PyList_New(size);
 305     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 306       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 307     return ret;
 308   }
 309
 310   PyObject *getGlobalNumberingNode2() const
 311   {
 312     const mcIdType *tmp=self->getGlobalNumberingNode();
 313     mcIdType size=self->getCellMesh()->getNumberOfNodes();
 314     PyObject *ret=PyList_New(size);
 315     for(mcIdType i=0;i<size;i++)
 316       PyList_SetItem(ret,i,PyInt_FromLong(tmp[i]));
 317     return ret;
 318   }
 319 }
 320
 321 %pythoncode %{
 322 if MEDCouplingUse64BitIDs():
 323   ParaDataArrayInt = ParaDataArrayInt64
 324 else:
 325   ParaDataArrayInt = ParaDataArrayInt32
 326 %}