src/MEDPartitioner/Test/MEDPARTITIONERTest.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2016  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "MEDPARTITIONERTest.hxx"
  21
  22 #include "MEDPARTITIONER_MeshCollection.hxx"
  23 #include "MEDPARTITIONER_ParallelTopology.hxx"
  24 #include "MEDPARTITIONER_ParaDomainSelector.hxx"
  25 #include "MEDPARTITIONER_Utils.hxx"
  26
  27 #include "CellModel.hxx"
  28 #include "MEDFileMesh.hxx"
  29 #include "MEDLoader.hxx"
  30 #include "MEDLoaderBase.hxx"
  31 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  32 #include "MEDCouplingMappedExtrudedMesh.hxx"
  33 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  34 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  35 #include "MEDCouplingMultiFields.hxx"
  36
  37 #include <cppunit/TestAssert.h>
  38
  39 #include <sstream>
  40 #include <fstream>
  41 #include <cmath>
  42 #include <list>
  43 #include <stdexcept>
  44 #include <cstdlib>
  45 #include <vector>
  46 #ifdef WIN32
  47 #include<direct.h>
  48 #define getcwd _getcwd
  49 #else
  50 #include <unistd.h>
  51 #endif
  52
  53 #ifdef HAVE_MPI
  54 #include <mpi.h>
  55 #endif
  56
  57 using namespace std;
  58 using namespace MEDCoupling;
  59 using namespace MEDPARTITIONER;
  60
  61 void MEDPARTITIONERTest::setSize(int ni, int nj, int nk)
  62 {
  63   this->_ni=ni;  //nb of hexa9
  64   this->_nj=nj;
  65   this->_nk=nk;
  66   this->_ntot=_ni*_nj*_nk;
  67   string ijk=IntToStr(ni)+"x"+IntToStr(nj)+"x"+IntToStr(nk);
  68   this->_file_name="tmp_testMesh_"+ijk+".med";
  69   this->_file_name_with_faces="tmp_testMeshWithFaces_"+ijk+".med";
  70   string ij=IntToStr(ni)+"x"+IntToStr(nj);
  71   this->_file_name2="tmp_testMesh_"+ij+".med";
  72   this->_mesh_name="testMesh";
  73 }
  74
  75 void MEDPARTITIONERTest::setSmallSize()
  76 {
  77   setSize(2,3,5); //nb of hexa9
  78 }
  79
  80 void MEDPARTITIONERTest::setMedianSize()
  81 {
  82   setSize(20,30,50); //nb of hexa9
  83 }
  84
  85 void MEDPARTITIONERTest::setbigSize()
  86 {
  87   setSize(200,300,500); //nb of hexa9
  88 }
  89
  90 std::string MEDPARTITIONERTest::getPartitionerExe() const
  91 {
  92   std::string execName;
  93   if ( getenv("MEDCOUPLING_ROOT_DIR") )
  94     {
  95       execName=getenv("MEDCOUPLING_ROOT_DIR");  //.../INSTALL/MED
  96       execName+="/bin/medpartitioner";
  97       std::ifstream my_file(execName.c_str());
  98       if (my_file.good())
  99         return execName;
 100     }
 101   execName = getcwd(NULL, 0);
 102   execName += "/../../MEDPartitioner/medpartitioner";
 103   if (! std::ifstream(execName.c_str()))
 104     CPPUNIT_FAIL("Can't find medpartitioner, please set MEDCOUPLING_ROOT_DIR");
 105   return execName;
 106 }
 107
 108 // ============================================================================
 109 /*!
 110  *  Set up the environment called at every CPPUNIT_TEST ()
 111  */
 112 // ============================================================================
 113 void MEDPARTITIONERTest::setUp()
 114 {
 115   this->_verbose=0;
 116 #if defined(HAVE_MPI)
 117   if (MyGlobals::_Rank==-1)  //do once only
 118     {
 119       MPI_Init(0,0);
 120       MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &MyGlobals::_World_Size);
 121       MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &MyGlobals::_Rank);
 122     }
 123 #else
 124   //sequential : no MPI
 125   MyGlobals::_World_Size=1;
 126   MyGlobals::_Rank=0;
 127 #endif
 128
 129   if (_verbose>10)
 130     {
 131 #if defined(HAVE_MPI)
 132       cout<<"\ndefined(HAVE_MPI)"<<endl;
 133 #else
 134       cout<<"\nNOT defined(HAVE_MPI)"<<endl;
 135 #endif
 136 #if defined(MED_ENABLE_PARMETIS)
 137       cout<<"defined(MED_ENABLE_PARMETIS)"<<endl;
 138 #else
 139       cout<<"NOT defined(MED_ENABLE_PARMETIS)"<<endl;
 140 #endif
 141 #if defined(MED_ENABLE_METIS)
 142       cout<<"defined(MED_ENABLE_METIS)"<<endl;
 143 #else
 144       cout<<"NOT defined(MED_ENABLE_METIS)"<<endl;
 145 #endif
 146 #if defined(MED_ENABLE_SCOTCH)
 147       cout<<"defined(MED_ENABLE_SCOTCH)"<<endl;
 148 #else
 149       cout<<"NOT defined(MED_ENABLE_SCOTCH)"<<endl;
 150 #endif
 151     }
 152 }
 153
 154 // ============================================================================
 155 /*!
 156  *  - delete
 157  */
 158 // ============================================================================
 159 void MEDPARTITIONERTest::tearDown()
 160 {
 161 }
 162
 163 MEDCoupling::MEDCouplingUMesh * MEDPARTITIONERTest::buildCUBE3DMesh()
 164 //only hexa8
 165 {
 166   vector<int> conn;
 167   vector<double> coor;
 168   for (int k=0; k<=_nk; k++)
 169     for (int j=0; j<=_nj; j++)
 170       for (int i=0; i<=_ni; i++)
 171         {
 172           coor.push_back(i+.1);
 173           coor.push_back(j+.2);
 174           coor.push_back(k+.3);
 175         }
 176   int ii;
 177   for (int k=0; k<_nk; k++)
 178     for (int j=0; j<_nj; j++)
 179       for (int i=0; i<_ni; i++)
 180         {
 181           ii=i + j*(_ni+1) + k*(_ni+1)*(_nj+1);
 182           conn.push_back(ii);
 183           conn.push_back(ii+1);
 184           ii=ii + _ni + 2 ;
 185           conn.push_back(ii);
 186           conn.push_back(ii-1);
 187
 188           ii=i + j*(_ni+1) + (k+1)*(_ni+1)*(_nj+1);
 189           conn.push_back(ii);
 190           conn.push_back(ii+1);
 191           ii=ii + _ni + 2 ;
 192           conn.push_back(ii);
 193           conn.push_back(ii-1);
 194         }
 195
 196   /*
 197   if (_verbose)  //only for debug
 198     {
 199       cout<< "\nnb coor " << (_ni+1)*(_nj+1)*(_nk+1)*3 << " " << coor.size() << endl;
 200       for (int i=0; i<(int)coor.size(); i++)
 201         cout << coor[i] << " ";
 202       cout << endl;
 203       cout << "\nnb conn " << (_ni)*(_nj)*(_nk)*8 << " " << conn.size() << endl;
 204       for (int i=0; i<(int)conn.size(); i=i+8)
 205         {
 206           for (int j=0; j<8; j++)
 207             cout << conn[i+j] << " ";
 208           cout << endl;
 209         }
 210       cout << endl;
 211     }
 212   */
 213
 214   MEDCouplingUMesh *mesh=MEDCouplingUMesh::New();
 215   mesh->setMeshDimension(3);
 216   int nbc=conn.size()/8; //nb of cells
 217   int nbv=coor.size()/3; //nb of vertices
 218   mesh->allocateCells(nbc);
 219   for(int i=0; i<nbc; i++)
 220     {
 221       int onehexa[8];
 222       std::copy(conn.begin()+i*8,conn.begin()+(i+1)*8,onehexa);
 223       if (false) //(_verbose)
 224         {
 225           for (int j=0; j<8; j++) cout<<onehexa[j]<<" ";
 226           cout<<endl;
 227         }
 228       mesh->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8,8,onehexa);
 229     }
 230   mesh->finishInsertingCells();
 231   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 232   myCoords->alloc(nbv,3);
 233   std::copy(coor.begin(),coor.end(),myCoords->getPointer());
 234   mesh->setCoords(myCoords);
 235   mesh->setName(_mesh_name.c_str());
 236   myCoords->decrRef();
 237   mesh->checkConsistencyLight();
 238   return mesh;
 239 }
 240
 241 MEDCoupling::MEDCouplingUMesh * MEDPARTITIONERTest::buildCARRE3DMesh()
 242 //only quad4 in oblique (k=j)
 243 {
 244   vector<int> conn;
 245   vector<double> coor;
 246   for (int j=0; j<=_nj; j++)
 247     for (int i=0; i<=_ni; i++)
 248       {
 249         int k=j;
 250         coor.push_back(i+.1);
 251         coor.push_back(j+.2);
 252         coor.push_back(k+.3);
 253       }
 254   int ii;
 255   int k=0;
 256   for (int j=0; j<_nj; j++)
 257     for (int i=0; i<_ni; i++)
 258       {
 259         ii=i + j*(_ni+1) + k*(_ni+1)*(_nj+1);
 260         conn.push_back(ii);
 261         conn.push_back(ii+1);
 262         ii=ii + _ni + 2 ;
 263         conn.push_back(ii);
 264         conn.push_back(ii-1);
 265       }
 266
 267   if (false) //(_verbose)
 268     {
 269       cout<<"\nnb coor "<<(_ni+1)*(_nj+1)*3<<" "<<coor.size()<<endl;
 270       for (int i=0; i<(int)coor.size(); i++)
 271         cout << coor[i] << " ";
 272       cout<<endl;
 273       cout<<"\nnb conn "<<(_ni)*(_nj)*4<<" "<<conn.size()<<endl;
 274       for (int i=0; i<(int)conn.size(); i=i+4)
 275         {
 276           for (int j=0; j<4; j++) cout<<conn[i+j]<<" ";
 277           cout<<endl;
 278         }
 279       cout<<endl;
 280     }
 281
 282   MEDCouplingUMesh *mesh=MEDCouplingUMesh::New();
 283   mesh->setMeshDimension(2);
 284   int nbc=conn.size()/4; //nb of cells
 285   int nbv=coor.size()/3; //nb of vertices
 286   mesh->allocateCells(nbc);
 287   for(int i=0; i<nbc; i++)
 288     {
 289       int onequa[4];
 290       std::copy(conn.begin()+i*4,conn.begin()+(i+1)*4,onequa);
 291       if (false) //(_verbose)
 292         {
 293           for (int j=0; j<4; j++) cout<<onequa[j]<<" ";
 294           cout<<endl;
 295         }
 296       mesh->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4,4,onequa);
 297     }
 298   mesh->finishInsertingCells();
 299   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 300   myCoords->alloc(nbv,3);
 301   std::copy(coor.begin(),coor.end(),myCoords->getPointer());
 302   mesh->setCoords(myCoords);
 303   mesh->setName(_mesh_name.c_str());
 304   myCoords->decrRef();
 305   mesh->checkConsistencyLight();
 306   return mesh;
 307 }
 308
 309 MEDCoupling::MEDCouplingUMesh * MEDPARTITIONERTest::buildFACE3DMesh()
 310 //only quad4 on a global face of the CUBE3D (k=0)
 311 {
 312   vector<int> conn;
 313   vector<double> coor;
 314   for (int j=0; j<=_nj; j++)
 315     for (int i=0; i<=_ni; i++)
 316       {
 317         int k=0;
 318         coor.push_back(i+.1);
 319         coor.push_back(j+.2);
 320         coor.push_back(k+.3);
 321       }
 322   int ii;
 323   int k=0;
 324   for (int j=0; j<_nj; j++)
 325     for (int i=0; i<_ni; i++)
 326       {
 327         ii=i + j*(_ni+1) + k*(_ni+1)*(_nj+1);
 328         conn.push_back(ii);
 329         conn.push_back(ii+1);
 330         ii=ii + _ni + 2 ;
 331         conn.push_back(ii);
 332         conn.push_back(ii-1);
 333       }
 334
 335   if (false) //(_verbose)
 336     {
 337       cout<<"\nnb coor "<<(_ni+1)*(_nj+1)*3<<" "<<coor.size()<<endl;
 338       for (int i=0; i<(int)coor.size(); i++)
 339         cout << coor[i] << " ";
 340       cout<<endl;
 341       cout<<"\nnb conn "<<(_ni)*(_nj)*4<<" "<<conn.size()<<endl;
 342       for (int i=0; i<(int)conn.size(); i=i+4)
 343         {
 344           for (int j=0; j<4; j++)
 345             cout << conn[i+j] << " ";
 346           cout << endl;
 347         }
 348       cout << endl;
 349     }
 350
 351   MEDCouplingUMesh *mesh=MEDCouplingUMesh::New();
 352   mesh->setMeshDimension(2);
 353   int nbc=conn.size()/4; //nb of cells
 354   int nbv=coor.size()/3; //nb of vertices
 355   mesh->allocateCells(nbc);
 356   for(int i=0; i<nbc; i++)
 357     {
 358       int onequa[4];
 359       std::copy(conn.begin()+i*4,conn.begin()+(i+1)*4,onequa);
 360       if (false) //(_verbose)
 361         {
 362           for (int j=0; j<4; j++) cout<<onequa[j]<<" ";
 363           cout<<endl;
 364         }
 365       mesh->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4,4,onequa);
 366     }
 367   mesh->finishInsertingCells();
 368   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 369   myCoords->alloc(nbv,3);
 370   std::copy(coor.begin(),coor.end(),myCoords->getPointer());
 371   mesh->setCoords(myCoords);
 372   mesh->setName(_mesh_name.c_str());
 373   myCoords->decrRef();
 374   mesh->checkConsistencyLight();
 375   return mesh;
 376 }
 377
 378 MEDCouplingFieldDouble * MEDPARTITIONERTest::buildVecFieldOnCells(string myfileName)
 379 {
 380   //int ni=2,nj=3,nk=5; //nb of hexa9
 381   vector<double> field;
 382   for (int k=0; k<_nk; k++)
 383     for (int j=0; j<_nj; j++)
 384       for (int i=0; i<_ni; i++)
 385         {
 386           field.push_back(i+.1);
 387           field.push_back(j+.2);
 388           field.push_back(k+.3);
 389         }
 390
 391   MEDCouplingUMesh *mesh=ReadUMeshFromFile(myfileName.c_str(),_mesh_name.c_str(),0);
 392   int nbOfCells=mesh->getNumberOfCells();
 393   MEDCouplingFieldDouble *f1=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,ONE_TIME);
 394   f1->setName("VectorFieldOnCells");
 395   f1->setDescription("DescriptionOfFieldOnCells"); //not saved in file?
 396   f1->setMesh(mesh);
 397   DataArrayDouble *myField=DataArrayDouble::New();
 398   myField->alloc(nbOfCells,3);
 399   std::copy(field.begin(),field.end(),myField->getPointer());
 400   f1->setArray(myField);
 401   myField->setInfoOnComponent(0,"vx");
 402   myField->setInfoOnComponent(1,"vy");
 403   myField->setInfoOnComponent(2,"vz");
 404   myField->decrRef();
 405   f1->setTime(2.,0,1);
 406   f1->checkConsistencyLight();
 407   mesh->decrRef();
 408   return f1;
 409 }
 410
 411 MEDCouplingFieldDouble * MEDPARTITIONERTest::buildVecFieldOnNodes()
 412 {
 413   //int ni=2,nj=3,nk=5; //nb of hexa9
 414   vector<double> field;
 415   for (int k=0; k<=_nk; k++)
 416     for (int j=0; j<=_nj; j++)
 417       for (int i=0; i<=_ni; i++)
 418         {
 419           field.push_back(i+.1);
 420           field.push_back(j+.2);
 421           field.push_back(k+.3);
 422         }
 423
 424   MEDCouplingUMesh *mesh=ReadUMeshFromFile(_file_name.c_str(),_mesh_name.c_str(),0);
 425   int nbOfNodes=mesh->getNumberOfNodes();
 426   MEDCouplingFieldDouble *f1=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_NODES,ONE_TIME);
 427   f1->setName("VectorFieldOnNodes");
 428   f1->setDescription("DescriptionOfFieldOnNodes"); //not saved in file?
 429   f1->setMesh(mesh);
 430   DataArrayDouble *myField=DataArrayDouble::New();
 431   myField->alloc(nbOfNodes,3);
 432   std::copy(field.begin(),field.end(),myField->getPointer());
 433   f1->setArray(myField);
 434   myField->setInfoOnComponent(0,"vx");
 435   myField->setInfoOnComponent(1,"vy");
 436   myField->setInfoOnComponent(2,"vz");
 437   myField->decrRef();
 438   f1->setTime(2.,0,1);
 439   f1->checkConsistencyLight();
 440   mesh->decrRef();
 441   return f1;
 442 }
 443
 444
 445 void MEDPARTITIONERTest::createTestMeshWithoutField()
 446 {
 447   {
 448     MEDCouplingUMesh * mesh = buildCUBE3DMesh();
 449     WriteUMesh(_file_name.c_str(),mesh,true);
 450     if (_verbose) cout<<endl<<_file_name<<" created"<<endl;
 451     if (_ntot<1000000) //too long
 452       {
 453         MEDCouplingUMesh *mesh_rw=ReadUMeshFromFile(_file_name.c_str(),mesh->getName().c_str(),0);
 454         if (_verbose) cout<<_file_name<<" reread"<<endl;
 455         CPPUNIT_ASSERT(mesh->isEqual(mesh_rw,1e-12));
 456         mesh_rw->decrRef();
 457       }
 458     mesh->decrRef();
 459   }
 460
 461   {
 462     vector<const MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*> meshes;
 463     MEDCouplingUMesh * mesh1 = buildCUBE3DMesh();
 464     MEDCouplingUMesh * mesh2 = buildFACE3DMesh();
 465     mesh1->setName("testMesh");
 466     mesh2->setName("theFaces");
 467     mesh2->tryToShareSameCoordsPermute(*mesh1, 1e-9);
 468     mesh2->checkConsistencyLight();
 469     mesh1->checkConsistencyLight();
 470     meshes.push_back(mesh1);
 471     meshes.push_back(mesh2);
 472     WriteUMeshes(_file_name_with_faces.c_str(), meshes, true);
 473
 474     MEDCoupling::MEDFileUMesh* mfm=MEDCoupling::MEDFileUMesh::New(_file_name_with_faces.c_str(), mesh1->getName().c_str());
 475     DataArrayInt* FacesFam=DataArrayInt::New();
 476     FacesFam->alloc(mfm->getSizeAtLevel(-1),1);
 477     FacesFam->fillWithValue(-1);
 478     DataArrayInt* CellsFam=DataArrayInt::New();
 479     CellsFam->alloc(mfm->getSizeAtLevel(0),1);
 480     CellsFam->fillWithValue(1);
 481     mfm->setFamilyFieldArr(-1,FacesFam);
 482     mfm->setFamilyFieldArr(0,CellsFam);
 483     map<string,int> theFamilies;
 484     theFamilies["FAMILLE_ZERO"]=0;
 485     theFamilies["FamilyFaces"]=-1;
 486     theFamilies["FamilyCells"]=1;
 487     map<string, vector<string> > theGroups;
 488     theGroups["GroupFaces"].push_back("FamilyFaces");
 489     theGroups["GroupCells"].push_back("FamilyCells");
 490     mfm->setFamilyInfo(theFamilies);
 491     mfm->setGroupInfo(theGroups);
 492     mfm->write(_file_name_with_faces.c_str(),0);
 493     FacesFam->decrRef();
 494     CellsFam->decrRef();
 495
 496     /*ce truc marche pas!
 497       MEDCoupling::MEDFileUMesh* mfm=MEDCoupling::MEDFileUMesh::New(_file_name_with_faces.c_str(), mesh1->getName());
 498       vector<const MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*> ms;
 499       ms.push_back(mesh2);
 500       mfm->setGroupsFromScratch(-1, ms);
 501       mfm->write(_file_name_with_faces.c_str(),0);
 502     */
 503
 504     if (_verbose) cout<<endl<<_file_name_with_faces<<" created"<<endl;
 505     if (_ntot<1000000) //too long
 506       {
 507         MEDCouplingUMesh *mesh_rw=ReadUMeshFromFile(_file_name_with_faces.c_str(),mesh1->getName().c_str(),0);
 508         if (_verbose) cout<<_file_name_with_faces<<" reread"<<endl;
 509         CPPUNIT_ASSERT(mesh1->isEqual(mesh_rw,1e-12));
 510         mesh_rw->decrRef();
 511       }
 512     mesh1->decrRef();
 513     mesh2->decrRef();
 514     mfm->decrRef();
 515   }
 516
 517   {
 518     MEDCouplingUMesh * mesh = buildCARRE3DMesh();
 519     WriteUMesh(_file_name2.c_str(),mesh,true);
 520     if (_verbose) cout<<endl<<_file_name2<<" created"<<endl;
 521     MEDCouplingUMesh *mesh_rw=ReadUMeshFromFile(_file_name2.c_str(),mesh->getName().c_str(),0);
 522     if (_verbose) cout<<_file_name2<<" reread"<<endl;
 523     CPPUNIT_ASSERT(mesh->isEqual(mesh_rw,1e-12));
 524     mesh_rw->decrRef();
 525     mesh->decrRef();
 526   }
 527 }
 528
 529 /*
 530 create a set of nbx*nby*nbz files mesh of ni*ny*nz cells
 531 */
 532 void MEDPARTITIONERTest::createHugeTestMesh(int ni, int nj, int nk, int nbx, int nby, int nbz, int nbTarget)
 533 {
 534   setSize(ni,nj,nk);
 535   _nb_target_huge=nbTarget;
 536   MEDCouplingUMesh * mesh = buildCUBE3DMesh();
 537   //int nbx=1, nby=1, nbz=2;
 538   std::vector< double > cooDep,cooFin;
 539   mesh->getCoordinatesOfNode(0, cooDep);
 540   mesh->getCoordinatesOfNode(mesh->getNumberOfNodes()-1, cooFin);
 541   //cout<<endl<<cooDep[0]<<" "<<cooDep[1]<<" "<<cooDep[2]<<endl;
 542   //cout<<cooFin[0]<<" "<<cooFin[1]<<" "<<cooFin[2]<<endl;
 543
 544   string tagXml="\
 545 <?xml version=\"1.0\" encoding=\"UTF-8\"?>\n \
 546 <root>\n \
 547   <version maj=\"2\" min=\"3\" ver=\"1\"/>\n \
 548   <description what=\"\" when=\"YYMMDDHHmm\"/>\n \
 549   <content>\n \
 550     <mesh name=\"testMesh\"/>\n \
 551   </content>\n \
 552   <splitting>\n \
 553     <subdomain number=\"$subdomainNumber\"/>\n \
 554     <global_numbering present=\"no\"/>\n \
 555   </splitting>\n \
 556   <files>\n$tagSubfile \
 557   </files>\n \
 558   <mapping>\n$tagMesh \
 559   </mapping>\n \
 560 </root>\n";
 561
 562   string tagSubfiles, tagSubfile="\
 563     <subfile id=\"$xyz\">\n \
 564       <name>$fileName</name>\n \
 565       <machine>localhost</machine>\n \
 566     </subfile>\n";
 567   string tagMeshes, tagMesh="\
 568     <mesh name=\"testMesh\">\n \
 569       <chunk subdomain=\"$xyz\">\n \
 570         <name>testMesh</name>\n \
 571       </chunk>\n \
 572     </mesh>\n";
 573
 574   int xyz=1;
 575   string sxyz;
 576   DataArrayDouble* coordsInit=mesh->getCoords()->deepCopy();
 577   double* ptrInit=coordsInit->getPointer();
 578   double deltax=cooFin[0]-cooDep[0];
 579   double deltay=cooFin[1]-cooDep[1];
 580   double deltaz=cooFin[2]-cooDep[2];
 581
 582   double dz=0.;
 583   for (int z=0; z<nbz; z++)
 584     {
 585       double dy=0.;
 586       for (int y=0; y<nby; y++)
 587         {
 588           double dx=0.;
 589           for (int x=0; x<nbx; x++)
 590             {
 591               string fileName;
 592               sxyz=IntToStr(xyz);
 593               fileName="tmp_testMeshHuge_"+IntToStr(_ni)+"x"+IntToStr(_nj)+"x"+IntToStr(_nk)+"_"+sxyz+".med";
 594
 595               DataArrayDouble* coords=mesh->getCoords();
 596               //int nbOfComp=coords->getNumberOfComponents();  //be 3D
 597               int nbOfTuple=coords->getNumberOfTuples();
 598               double* ptr=coords->getPointer();
 599               double* ptrini=ptrInit;
 600               for (int i=0; i<nbOfTuple; i++)
 601                 {
 602                   *ptr=(*ptrini)+dx; ptr++; ptrini++; //be 3D
 603                   *ptr=(*ptrini)+dy; ptr++; ptrini++;
 604                   *ptr=(*ptrini)+dz; ptr++; ptrini++;
 605                 }
 606
 607               WriteUMesh(fileName.c_str(),mesh,true);
 608
 609               tagSubfiles+=tagSubfile;
 610               tagSubfiles.replace(tagSubfiles.find("$xyz"),4,sxyz);
 611               tagSubfiles.replace(tagSubfiles.find("$fileName"),9,fileName);
 612
 613               tagMeshes+=tagMesh;
 614               tagMeshes.replace(tagMeshes.find("$xyz"),4,sxyz);
 615               xyz++;
 616               dx+=deltax;
 617             }
 618           dy+=deltay;
 619         }
 620       dz+=deltaz;
 621     }
 622   coordsInit->decrRef();
 623
 624   tagXml.replace(tagXml.find("$subdomainNumber"),16,sxyz);
 625   tagXml.replace(tagXml.find("$tagSubfile"),11,tagSubfiles);
 626   tagXml.replace(tagXml.find("$tagMesh"),8,tagMeshes);
 627
 628   string nameFileXml;
 629   _file_name_huge_xml="tmp_testMeshHuge_"+IntToStr(_ni)+"x"+IntToStr(_nj)+"x"+IntToStr(_nk)+"_"+sxyz+".xml";
 630   std::ofstream f(_file_name_huge_xml.c_str());
 631   f<<tagXml;
 632   f.close();
 633   //cout<<"\n"<<tagXml<<endl;
 634   if (_verbose)
 635     cout<<endl<<nameFileXml<<" created"<<endl;
 636   mesh->decrRef();
 637 }
 638
 639 void MEDPARTITIONERTest::createTestMeshWithVecFieldOnCells()
 640 {
 641   {
 642     string name=_file_name;
 643     MEDCouplingFieldDouble *f1=buildVecFieldOnCells(name);
 644     name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnCells.med");
 645     WriteField(name.c_str(),f1,true);
 646     f1->setTime(3.,1,1);  //time,it,order
 647     f1->applyFunc("x/2.");
 648     WriteField(name.c_str(),f1,false);
 649     if (_verbose) cout<<endl<<name<<" created"<<endl;
 650     if (_ntot<1000000) //too long
 651       {
 652         MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> f2=ReadFieldCell(name.c_str(),f1->getMesh()->getName().c_str(),0,f1->getName().c_str(),0,1);
 653         //DataArrayDouble *res=f2->getArray();
 654         if (_verbose) cout<<name<<" reread"<<endl;
 655         //CPPUNIT_ASSERT(f1->isEqual(f2,1e-12,1e-12));
 656       }
 657     f1->decrRef();
 658   }
 659   {
 660     string name=_file_name;
 661     MEDCouplingFieldDouble *f1=buildVecFieldOnCells(name);
 662     name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnGaussNe.med");
 663     MEDCouplingFieldDouble *f3=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_GAUSS_NE,ONE_TIME);
 664     f3->setMesh(f1->getMesh());
 665     //cout<<"\nNumberOfMeshPlacesExpected "<<f3->getNumberOfMeshPlacesExpected()<<" "
 666     //                                     /*<<getNumberOfTuples(f1->getMesh())<<" "*/
 667     //                                     <<f3->getMesh()->getNumberOfNodes()<<" "
 668     //                                     <<f3->getMesh()->getNumberOfCells()<<endl;
 669     f3->setName("MyFieldOnGaussNE");
 670     f3->setDescription("MyDescriptionNE");
 671     DataArrayDouble *array=DataArrayDouble::New();
 672     //int nb=f1->getMesh()->getNumberOfNodes();
 673
 674     /*8 pt de gauss by cell
 675       int nb=f3->getMesh()->getNumberOfCells()*8;
 676       array->alloc(nb,2);
 677       double *ptr=array->getPointer();
 678       for (int i=0; i<nb*2; i=i+2) {ptr[i]=(double)(i/8) ; ptr[i]=2.*(double)(i/8);}
 679     */
 680
 681     //more nbptgauss=8 by default needs set MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell
 682     //theory: (may be) http://www.code-aster.org/V2/doc/v9/fr/man_r/r3/r3.06.03.pdf
 683     int nbptgauss=8; //nb pt de gauss by cell
 684     int nbcell=f3->getMesh()->getNumberOfCells();
 685     int nb=nbcell*nbptgauss;
 686     int nbcomp=2;
 687     array->alloc(nb,nbcomp);
 688     double *ptr=array->getPointer();
 689     int ii=0;
 690     for (int i=0; i<nbcell; i++)
 691       for (int j=0; j<nbptgauss; j++)
 692         for (int k=0; k<nbcomp; k++)
 693           {
 694             //123.4 for 12th cell,3rd component, 4th gausspoint
 695             ptr[ii]=(double)((i+1)*10+(k+1))+((double)(j+1))/10.;
 696             ii++;
 697           }
 698     array->setInfoOnComponent(0,"vGx");
 699     array->setInfoOnComponent(1,"vGy");
 700     f3->setTime(4.,5,6);
 701     f3->setArray(array);
 702     array->decrRef();
 703     WriteField(name.c_str(),f3,true);
 704     if (_verbose) cout<<endl<<name<<" created"<<endl;
 705     f3->checkConsistencyLight();
 706     f1->decrRef();
 707     if (_ntot<1000000) //too long
 708       {
 709         MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> f4=ReadField(ON_GAUSS_NE, name.c_str(), f3->getMesh()->getName().c_str(), 0, "MyFieldOnGaussNE", 5, 6);
 710         if (_verbose) cout<<"MyFieldOnGaussNE reread"<<endl;
 711       }
 712     f3->decrRef();
 713   }
 714   {
 715     string name=_file_name_with_faces;
 716     MEDCouplingFieldDouble *f1=buildVecFieldOnCells(name);
 717     name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnCells.med");
 718     WriteField(name.c_str(),f1,true);
 719     if (_verbose) cout<<endl<<name<<" created"<<endl;
 720     if (_ntot<1000000) //too long
 721       {
 722         MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> f2=ReadFieldCell(name.c_str(),f1->getMesh()->getName().c_str(),0,f1->getName().c_str(),0,1);
 723         if (_verbose) cout<<name<<" reread"<<endl;
 724         //CPPUNIT_ASSERT(f1->isEqual(f2,1e-12,1e-12)); assertion failed!!
 725       }
 726     f1->decrRef();
 727   }
 728 }
 729
 730 void MEDPARTITIONERTest::createTestMeshWithVecFieldOnNodes()
 731 {
 732   MEDCouplingFieldDouble *f1=buildVecFieldOnNodes();
 733   string name=_file_name;
 734   name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnNodes.med");
 735   WriteField(name.c_str(),f1,true);
 736   if (_verbose) cout<<endl<<name<<" created"<<endl;
 737   if (_ntot<1000000) //too long
 738     {
 739       MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> f2=ReadFieldNode(name.c_str(),f1->getMesh()->getName().c_str(),0,f1->getName().c_str(),0,1);
 740       if (_verbose) cout<<name<<" reread"<<endl;
 741       //CPPUNIT_ASSERT(f1->isEqual(f2,1e-12,1e-12)); assertion failed!!
 742     }
 743   f1->decrRef();
 744 }
 745
 746 void MEDPARTITIONERTest::verifyTestMeshWithVecFieldOnNodes()
 747 {
 748   string name=_file_name;
 749   name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnNodes.med");
 750   MEDCouplingUMesh * m=ReadUMeshFromFile(name.c_str(),_mesh_name.c_str(),0);
 751   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> types(m->getAllGeoTypes());
 752   if (_verbose)
 753     {
 754       cout<<"\n types in "<<name<<" : ";
 755       //for (std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::iterator t=types.begin(); t!=types.end(); ++t) cout<<" "<<*t;
 756       for (std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::const_iterator t=types.begin(); t!=types.end(); ++t)
 757         {
 758           //INTERP_KERNEL::CellModel essai=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(*t);
 759           cout<<" "<<(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(*t)).getRepr();
 760         }
 761       cout<<endl;
 762     }
 763   m->decrRef();
 764
 765   MEDFileUMesh * mf = MEDFileUMesh::New(_file_name.c_str(),_mesh_name.c_str(),-1,-1);
 766   vector<int> lev;
 767   lev=mf->getNonEmptyLevels();
 768   if (_verbose)
 769     {
 770       cout<<" levels in "<<name<<" : ";
 771       for (vector<int>::iterator l=lev.begin(); l!=lev.end(); ++l) cout<<" "<<*l;
 772       cout<<endl;
 773     }
 774   mf->decrRef();
 775 }
 776
 777 void MEDPARTITIONERTest::createTestMeshes()
 778 {
 779   createTestMeshWithoutField();
 780   createTestMeshWithVecFieldOnCells();
 781   createTestMeshWithVecFieldOnNodes();
 782 }
 783
 784 void MEDPARTITIONERTest::deleteTestMeshes()
 785 {
 786   string cmd="rm *tmp_testMesh*";
 787   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
 788   system(cmd.c_str());  //may be not if debug
 789 }
 790
 791 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionSingle()
 792 {
 793   setSmallSize();
 794   createTestMeshes();
 795   MyGlobals::_World_Size=1;
 796   MyGlobals::_Rank=0;
 797   string fileName=_file_name_with_faces;
 798   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 799   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 800   CPPUNIT_ASSERT(collection.isParallelMode());
 801   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, collection.getMeshDimension());
 802   CPPUNIT_ASSERT(collection.getName()=="testMesh");
 803   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1,collection.getNbOfLocalMeshes());
 804   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1,collection.getNbOfGlobalMeshes());
 805   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(_ni*_nj*_nk,collection.getNbOfLocalCells());
 806   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(_ni*_nj,collection.getNbOfLocalFaces());
 807 }
 808
 809 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionXml()
 810 {
 811   setSmallSize();
 812   createHugeTestMesh(_ni, _nj, _nk, 2, 2, 2, 32); //xml but not so huge
 813   string fileName=_file_name_huge_xml;
 814   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 815   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 816   CPPUNIT_ASSERT(collection.isParallelMode());
 817   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, collection.getMeshDimension());
 818   CPPUNIT_ASSERT(collection.getName()=="testMesh");
 819   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(8,collection.getNbOfLocalMeshes());
 820   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(8,collection.getNbOfGlobalMeshes());
 821   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(_ni*_nj*_nk*8,collection.getNbOfLocalCells());
 822   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0,collection.getNbOfLocalFaces());
 823 }
 824
 825
 826 //#################for metis
 827
 828
 829
 830 #if defined(MED_ENABLE_METIS)
 831 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionSinglePartitionMetis()
 832 {
 833   setSmallSize();
 834   createTestMeshes();
 835   //MyGlobals::_Verbose=500;
 836   string fileName=_file_name_with_faces;
 837   int ndomains=2;
 838   bool split_family=false;
 839   bool empty_groups=false;
 840   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 841   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 842
 843   MEDPARTITIONER::ParallelTopology* aPT = (MEDPARTITIONER::ParallelTopology*) collection.getTopology();
 844   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
 845   //Creating the graph and partitioning it
 846   auto_ptr< MEDPARTITIONER::Topology > new_topo;
 847   new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,MEDPARTITIONER::Graph::METIS) );
 848   //Creating a new mesh collection from the partitioning
 849   MEDPARTITIONER::MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get(),split_family,empty_groups);
 850
 851   //example to create files
 852   //MyGlobals::_General_Informations.clear();
 853   //MyGlobals::_General_Informations.push_back(SerializeFromString("finalMeshName=Merge"));
 854   //if (MyGlobals::_Verbose>100) cout << "generalInformations : \n"<<ReprVectorOfString(MyGlobals::_General_Informations);
 855   //new_collection.write("ttmp")
 856
 857   CPPUNIT_ASSERT(new_collection.isParallelMode());
 858   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, new_collection.getMeshDimension());
 859   CPPUNIT_ASSERT(new_collection.getName()==collection.getName());
 860   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
 861   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
 862   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
 863   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalFaces(),new_collection.getNbOfLocalFaces());
 864 }
 865
 866 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionComplexPartitionMetis()
 867 {
 868   setSmallSize();
 869   createHugeTestMesh(_ni, _nj, _nk, 2, 2, 2, 32); //xml on 2*2*2 meshes but not so huge
 870   string fileName=_file_name_huge_xml;
 871   bool split_family=false;
 872   bool empty_groups=false;
 873   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 874   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 875
 876   MEDPARTITIONER::ParallelTopology* aPT = (MEDPARTITIONER::ParallelTopology*) collection.getTopology();
 877   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
 878
 879   for (int ndomains=2 ; ndomains<=16 ; ndomains++)
 880     {
 881       //Creating the graph and partitioning it
 882       auto_ptr< MEDPARTITIONER::Topology > new_topo;
 883       new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,MEDPARTITIONER::Graph::METIS) );
 884       //Creating a new mesh collection from the partitioning
 885       MEDPARTITIONER::MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get(),split_family,empty_groups);
 886
 887       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
 888       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
 889       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
 890       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalFaces(),new_collection.getNbOfLocalFaces());
 891     }
 892 }
 893
 894 void MEDPARTITIONERTest::testMetisSmallSize()
 895 {
 896   //#if !defined(HAVE_MPI)
 897   setSmallSize();
 898   createTestMeshes();
 899   std::string MetisOrScotch("metis");
 900   launchMetisOrScotchMedpartitionerOnTestMeshes(MetisOrScotch);
 901   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForMesh(MetisOrScotch);
 902   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnCells(MetisOrScotch);
 903   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnGaussNe(MetisOrScotch);
 904   //#endif
 905 }
 906 #endif
 907
 908
 909 //#################for scotch
 910
 911
 912 #if defined(MED_ENABLE_SCOTCH)
 913 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionSinglePartitionScotch()
 914 {
 915   setSmallSize();
 916   createTestMeshes();
 917   //MyGlobals::_Verbose=500;
 918   string fileName=_file_name_with_faces;
 919   int ndomains=2;
 920   bool split_family=false;
 921   bool empty_groups=false;
 922   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 923   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 924
 925   MEDPARTITIONER::ParallelTopology* aPT = (MEDPARTITIONER::ParallelTopology*) collection.getTopology();
 926   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
 927   //Creating the graph and partitioning it
 928   auto_ptr< MEDPARTITIONER::Topology > new_topo;
 929   new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,MEDPARTITIONER::Graph::SCOTCH) );
 930   //Creating a new mesh collection from the partitioning
 931   MEDPARTITIONER::MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get(),split_family,empty_groups);
 932
 933   //example to create files
 934   //MyGlobals::_General_Informations.clear();
 935   //MyGlobals::_General_Informations.push_back(SerializeFromString("finalMeshName=Merge"));
 936   //if (MyGlobals::_Verbose>100) cout << "generalInformations : \n"<<ReprVectorOfString(MyGlobals::_General_Informations);
 937   //new_collection.write("ttmp")
 938
 939   CPPUNIT_ASSERT(new_collection.isParallelMode());
 940   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, new_collection.getMeshDimension());
 941   CPPUNIT_ASSERT(new_collection.getName()==collection.getName());
 942   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
 943   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
 944   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
 945   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalFaces(),new_collection.getNbOfLocalFaces());
 946 }
 947
 948 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionComplexPartitionScotch()
 949 {
 950   setSmallSize();
 951   createHugeTestMesh(_ni, _nj, _nk, 2, 2, 2, 32); //xml on 2*2*2 meshes but not so huge
 952   string fileName=_file_name_huge_xml;
 953   bool split_family=false;
 954   bool empty_groups=false;
 955   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 956   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 957
 958   MEDPARTITIONER::ParallelTopology* aPT = (MEDPARTITIONER::ParallelTopology*) collection.getTopology();
 959   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
 960
 961   for (int ndomains=2 ; ndomains<=16 ; ndomains++)
 962     {
 963       //Creating the graph and partitioning it
 964       auto_ptr< MEDPARTITIONER::Topology > new_topo;
 965       new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,MEDPARTITIONER::Graph::SCOTCH) );
 966       //Creating a new mesh collection from the partitioning
 967       MEDPARTITIONER::MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get(),split_family,empty_groups);
 968
 969       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
 970       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
 971       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
 972       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalFaces(),new_collection.getNbOfLocalFaces());
 973     }
 974 }
 975
 976 void MEDPARTITIONERTest::testScotchSmallSize()
 977 {
 978   //#if !defined(HAVE_MPI)
 979   setSmallSize();
 980   createTestMeshes();
 981   std::string MetisOrScotch("scotch");
 982   launchMetisOrScotchMedpartitionerOnTestMeshes(MetisOrScotch);
 983   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForMesh(MetisOrScotch);
 984   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnCells(MetisOrScotch);
 985   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnGaussNe(MetisOrScotch);
 986   //#endif
 987 }
 988 #endif
 989
 990 void MEDPARTITIONERTest::launchMetisOrScotchMedpartitionerOnTestMeshes(std::string MetisOrScotch)
 991 {
 992   int res;
 993   string cmd,execName,sourceName,targetName;
 994
 995   execName=getPartitionerExe();
 996
 997   cmd="which "+execName+" 2>/dev/null 1>/dev/null";  //no trace
 998   res=system(cmd.c_str());
 999   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL_MESSAGE(execName + " - INVALID PATH TO medpartitioner", 0, res);
1000
1001   cmd=execName+" --ndomains=2 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1002   sourceName=_file_name;
1003   targetName=_file_name;
1004   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo2_");
1005   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1006   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1007   res=system(cmd.c_str());
1008   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1009
1010   cmd=execName+" --ndomains=5 --split-method="+MetisOrScotch; //on less proc
1011   sourceName=_file_name;
1012   targetName=_file_name;
1013   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo5_");
1014   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1015   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1016   res=system(cmd.c_str());
1017   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1018
1019   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on 1 proc
1020   sourceName=targetName+".xml";
1021   targetName=_file_name;
1022   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1023   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1024   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1025   res=system(cmd.c_str());
1026   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1027
1028   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on more proc
1029   //sourceName=targetName+".xml";
1030   targetName=_file_name;
1031   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1032   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1033   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1034   res=system(cmd.c_str());
1035   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1036 }
1037
1038 void MEDPARTITIONERTest::verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForMesh(std::string MetisOrScotch)
1039 {
1040   int res;
1041   string fileName,cmd,execName,sourceName,targetName,input;
1042   execName=getPartitionerExe();
1043   fileName=_file_name_with_faces;
1044
1045   MEDCoupling::MEDFileUMesh* initialMesh=MEDCoupling::MEDFileUMesh::New(fileName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1046   MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* cellMesh=initialMesh->getLevel0Mesh(false);
1047   MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* faceMesh=initialMesh->getLevelM1Mesh(false);
1048
1049   cmd=execName+" --ndomains=5 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1050   sourceName=fileName;
1051   targetName=fileName;
1052   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo5_");
1053   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1054   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1055   res=system(cmd.c_str());
1056   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1057   input=targetName+".xml";
1058
1059   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
1060   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(input,parallelizer);
1061   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, collection.getMeshDimension());
1062   std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*>cellMeshes=collection.getMesh();
1063   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(5, (int) cellMeshes.size());
1064   int nbcells=0;
1065   for (std::size_t i = 0; i < cellMeshes.size(); i++)
1066     nbcells+=cellMeshes[i]->getNumberOfCells();
1067   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL((int)cellMesh->getNumberOfCells(), nbcells);
1068
1069   std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*>faceMeshes=collection.getFaceMesh();
1070   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(5, (int) faceMeshes.size());
1071   int nbfaces=0;
1072   for (std::size_t i=0; i < faceMeshes.size(); i++)
1073     nbfaces+=faceMeshes[i]->getNumberOfCells();
1074   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL((int)faceMesh->getNumberOfCells(), nbfaces);
1075
1076   //merge split meshes and test equality
1077   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1078   sourceName=targetName+".xml";
1079   targetName=fileName;
1080   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1081   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1082   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1083   res=system(cmd.c_str());
1084   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1085
1086   string refusedName=targetName+"1.med";
1087   MEDCoupling::MEDFileUMesh* refusedMesh=MEDCoupling::MEDFileUMesh::New(refusedName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1088   MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* refusedCellMesh=refusedMesh->getLevel0Mesh(false);
1089   MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* refusedFaceMesh=refusedMesh->getLevelM1Mesh(false);
1090
1091   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), refusedCellMesh->getNumberOfCells());
1092   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(faceMesh->getNumberOfCells(), refusedFaceMesh->getNumberOfCells());
1093
1094   /*not the good job
1095     MEDCoupling::MEDCouplingMesh* mergeCell=cellMesh->mergeMyselfWith(refusedCellMesh);
1096     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), mergeCell->getNumberOfCells());
1097
1098     MEDCoupling::MEDCouplingMesh* mergeFace=faceMesh->mergeMyselfWith(refusedFaceMesh);
1099     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(faceMesh->getNumberOfCells(), mergeFace->getNumberOfCells());
1100
1101     CPPUNIT_ASSERT(faceMesh->isEqual(refusedFaceMesh,1e-12));
1102   */
1103
1104   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> meshes;
1105   std::vector<DataArrayInt *> corr;
1106   meshes.push_back(cellMesh);
1107   refusedCellMesh->tryToShareSameCoordsPermute(*cellMesh, 1e-9);
1108   meshes.push_back(refusedCellMesh);
1109   MEDCouplingUMesh* fusedCell=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(meshes,0,corr);
1110   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), fusedCell->getNumberOfCells());
1111
1112   meshes.resize(0);
1113   for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1114     corr[i]->decrRef();
1115   corr.resize(0);
1116   meshes.push_back(faceMesh);
1117   refusedFaceMesh->tryToShareSameCoordsPermute(*faceMesh, 1e-9);
1118   meshes.push_back(refusedFaceMesh);
1119   MEDCouplingUMesh* fusedFace=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(meshes,0,corr);
1120   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(faceMesh->getNumberOfCells(), fusedFace->getNumberOfCells());
1121
1122   for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1123     corr[i]->decrRef();
1124   fusedFace->decrRef();
1125   refusedFaceMesh->decrRef();
1126   faceMesh->decrRef();
1127   fusedCell->decrRef();
1128   refusedCellMesh->decrRef();
1129   refusedMesh->decrRef();
1130   cellMesh->decrRef();
1131   initialMesh->decrRef();
1132   //done in ~collection
1133   //for (int i = 0; i < faceMeshes.size(); i++) faceMeshes[i]->decrRef();
1134   //for (int i = 0; i < cellMeshes.size(); i++) cellMeshes[i]->decrRef();
1135 }
1136
1137 void MEDPARTITIONERTest::verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnCells(std::string MetisOrScotch)
1138 {
1139   int res;
1140   string fileName,cmd,execName,sourceName,targetName,input;
1141   execName=getPartitionerExe();
1142   fileName=_file_name;
1143   fileName.replace(fileName.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnCells.med");
1144
1145   MEDCoupling::MEDFileUMesh* initialMesh=MEDCoupling::MEDFileUMesh::New(fileName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1146   MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* cellMesh=initialMesh->getLevel0Mesh(false);
1147
1148   cmd=execName+" --ndomains=5 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1149   sourceName=fileName;
1150   targetName=fileName;
1151   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo5_");
1152   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1153   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1154   res=system(cmd.c_str());
1155   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1156   input=targetName+".xml";
1157
1158   //merge split meshes and test equality
1159   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1160   sourceName=targetName+".xml";
1161   targetName=fileName;
1162   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1163   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1164   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1165   res=system(cmd.c_str());
1166   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1167
1168   string refusedName=targetName+"1.med";
1169   MEDCoupling::MEDFileUMesh* refusedMesh=MEDCoupling::MEDFileUMesh::New(refusedName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1170   MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* refusedCellMesh=refusedMesh->getLevel0Mesh(false);
1171
1172   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), refusedCellMesh->getNumberOfCells());
1173
1174   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> meshes;
1175   std::vector<DataArrayInt *> corr;
1176   meshes.push_back(cellMesh);
1177   refusedCellMesh->tryToShareSameCoordsPermute(*cellMesh, 1e-9);
1178   meshes.push_back(refusedCellMesh);
1179   MEDCouplingUMesh* fusedCell=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(meshes,0,corr);
1180   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), fusedCell->getNumberOfCells());
1181
1182   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> field1=ReadFieldCell(fileName.c_str(),initialMesh->getName().c_str(),0,"VectorFieldOnCells",0,1);
1183   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> field2=ReadFieldCell(refusedName.c_str(),refusedCellMesh->getName().c_str(),0,"VectorFieldOnCells",0,1);
1184
1185   int nbcells=corr[1]->getNumberOfTuples();
1186   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL((int)cellMesh->getNumberOfCells(), nbcells);
1187   //use corr to test equality of field
1188   DataArrayDouble* f1=field1->getArray();
1189   DataArrayDouble* f2=field2->getArray();
1190   if (_verbose>300)
1191     {
1192       cout<<"\nf1 : "<<f1->reprZip();
1193       cout<<"\nf2 : "<<f2->reprZip(); //field2->advancedRepradvancedRepr();
1194       for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1195         cout << "\ncorr " << i << " : " << corr[i]->reprZip();
1196
1197     }
1198   int nbequal=0;
1199   int nbcomp=field1->getNumberOfComponents();
1200   double* p1=f1->getPointer();
1201   double* p2=f2->getPointer();
1202   int* pc=corr[1]->getPointer();
1203   for (int i = 0; i < nbcells; i++)
1204     {
1205       int i1=pc[i]*nbcomp;
1206       int i2=i*nbcomp;
1207       for (int j = 0; j < nbcomp; j++)
1208         {
1209           if (p1[i1+j]==p2[i2+j]) nbequal++;
1210           //cout<<" "<<p1[i1+j]<<"="<<p2[i2+j];
1211         }
1212     }
1213   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(nbcells*nbcomp, nbequal);
1214
1215   for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1216     corr[i]->decrRef();
1217   fusedCell->decrRef();
1218   refusedMesh->decrRef();
1219   refusedCellMesh->decrRef();
1220   cellMesh->decrRef();
1221   initialMesh->decrRef();
1222 }
1223
1224 void MEDPARTITIONERTest::verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnGaussNe(std::string MetisOrScotch)
1225 {
1226   int res;
1227   string fileName,cmd,execName,sourceName,targetName,input;
1228   execName=getPartitionerExe();
1229   fileName=_file_name;
1230   fileName.replace(fileName.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnGaussNe.med");
1231
1232   MEDCoupling::MEDFileUMesh* initialMesh=MEDCoupling::MEDFileUMesh::New(fileName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1233   MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* cellMesh=initialMesh->getLevel0Mesh(false);
1234
1235   cmd=execName+" --ndomains=5 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1236   sourceName=fileName;
1237   targetName=fileName;
1238   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo5_");
1239   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1240   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1241   res=system(cmd.c_str());
1242   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1243   input=targetName+".xml";
1244
1245   //merge split meshes and test equality
1246   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1247   sourceName=targetName+".xml";
1248   targetName=fileName;
1249   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1250   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1251   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1252   res=system(cmd.c_str());
1253   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1254
1255   string refusedName=targetName+"1.med";
1256   MEDCoupling::MEDFileUMesh* refusedMesh=MEDCoupling::MEDFileUMesh::New(refusedName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1257   MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* refusedCellMesh=refusedMesh->getLevel0Mesh(false);
1258
1259   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), refusedCellMesh->getNumberOfCells());
1260
1261   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> meshes;
1262   std::vector<DataArrayInt *> corr;
1263   meshes.push_back(cellMesh);
1264   refusedCellMesh->tryToShareSameCoordsPermute(*cellMesh, 1e-9);
1265   meshes.push_back(refusedCellMesh);
1266   MEDCouplingUMesh* fusedCell=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(meshes,0,corr);
1267   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), fusedCell->getNumberOfCells());
1268
1269   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> field1=ReadField(ON_GAUSS_NE,fileName.c_str(),initialMesh->getName().c_str(),0,"MyFieldOnGaussNE",5,6);
1270   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> field2=ReadField(ON_GAUSS_NE,refusedName.c_str(),refusedCellMesh->getName().c_str(),0,"MyFieldOnGaussNE",5,6);
1271
1272   int nbcells=corr[1]->getNumberOfTuples();
1273   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL((int)cellMesh->getNumberOfCells(), nbcells);
1274   //use corr to test equality of field
1275   DataArrayDouble* f1=field1->getArray();
1276   DataArrayDouble* f2=field2->getArray();
1277   if (_verbose>300)
1278     {
1279       cout << "\nf1 : " << f1->reprZip(); //123.4 for 12th cell,3rd component, 4th gausspoint
1280       cout << "\nf2 : " << f2->reprZip(); //field2->advancedRepradvancedRepr();
1281       for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1282         cout << "\ncorr " << i << " : " << corr[i]->reprZip();
1283
1284     }
1285   int nbequal=0;
1286   int nbptgauss=8;
1287   int nbcomp=field1->getNumberOfComponents();
1288   double* p1=f1->getPointer();
1289   double* p2=f2->getPointer();
1290   int* pc=corr[1]->getPointer();
1291   for (int i = 0; i < nbcells; i++)
1292     {
1293       int i1=pc[i]*nbcomp*nbptgauss;
1294       int i2=i*nbcomp*nbptgauss;
1295       for (int j = 0; j < nbcomp*nbptgauss; j++)
1296         {
1297           if (p1[i1+j]==p2[i2+j]) nbequal++;
1298           //cout<<" "<<p1[i1+j]<<"="<<p2[i2+j];
1299         }
1300     }
1301   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(nbcells*nbcomp*nbptgauss, nbequal);
1302
1303   for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1304     corr[i]->decrRef();
1305   fusedCell->decrRef();
1306   refusedMesh->decrRef();
1307   refusedCellMesh->decrRef();
1308   cellMesh->decrRef();
1309   initialMesh->decrRef();
1310 }
1311
1312 //================================================================================
1313 /*!
1314  * \brief Test for 0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements
1315  */
1316 //================================================================================
1317
1318 void MEDPARTITIONERTest::testCreateBoundaryFaces2D()
1319 {
1320   // Fixed complains are:
1321   // - 2D is not available
1322   // - groups and family handling is bugged (probably due to bug in the handling
1323   //   of arrayTo in castIntField())
1324   // - creates boundary faces option is not handled
1325
1326   // Create a 2D mesh in a file
1327
1328   const char fileName[] = "tmp_testCreateBoundaryFaces2D.med";
1329
1330   const int idFam1 = 3, idFam2 = 2;
1331   int nbFam1, nbFam2, nbc;
1332   {
1333     const int nbX = 20, nbY = 15;
1334     vector<int> conn;
1335     vector<double> coor;
1336     for (int j=0; j<=nbY; j++)
1337       for (int i=0; i<=nbX; i++)
1338         {
1339           coor.push_back(i+.1);
1340           coor.push_back(j+.2);
1341         }
1342     int ii;
1343     for (int j=0; j<nbY; j++)
1344       for (int i=0; i<nbX; i++)
1345         {
1346           ii=i + j*(nbX+1);
1347           conn.push_back(ii);
1348           conn.push_back(ii+1);
1349           ii=ii + nbX + 2 ;
1350           conn.push_back(ii);
1351           conn.push_back(ii-1);
1352         }
1353     MEDCouplingUMesh *mesh=MEDCouplingUMesh::New();
1354     mesh->setMeshDimension(2);
1355
1356     nbc=conn.size()/4; //nb of cells
1357     mesh->allocateCells(nbc);
1358     int* pConn = &conn[0];
1359     for(int i=0; i<nbc; i++, pConn+=4)
1360       mesh->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4,4,pConn);
1361     mesh->finishInsertingCells();
1362
1363     int nbv=coor.size()/2; //nb of vertices
1364     DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
1365     myCoords->useArray( &coor[0], /*ownership=*/false, CPP_DEALLOC, nbv, 2 );
1366     mesh->setCoords(myCoords);
1367     mesh->setName("FacesIn2D");
1368     myCoords->decrRef();
1369     mesh->checkConsistencyLight();
1370
1371     // groups of cells
1372     DataArrayInt* cellsFam=DataArrayInt::New();
1373     cellsFam->alloc(nbc,1);
1374     nbFam1 = nbc/3, nbFam2 = nbc/2;
1375     int iE = 0;
1376     for ( int i = 0; i < nbFam1; ++i ) cellsFam->getPointer()[ iE++ ] = idFam1;
1377     for ( int i = 0; i < nbFam2; ++i ) cellsFam->getPointer()[ iE++ ] = idFam2;
1378     for (            ; iE < nbc;     ) cellsFam->getPointer()[ iE++ ] = 0;
1379     map<string,int> theFamilies;
1380     theFamilies["FAMILLE_ZERO"]=0;
1381     theFamilies["Family1"     ]=idFam1;
1382     theFamilies["Family2"     ]=idFam2;
1383     map<string, vector<string> > theGroups;
1384     theGroups["Group1"].push_back("Family1");
1385     theGroups["Group2"].push_back("Family2");
1386
1387     // write mesh
1388     MEDFileUMesh * fileMesh = MEDFileUMesh::New();
1389     fileMesh->setMeshAtLevel(0, mesh);
1390     fileMesh->setFamilyInfo(theFamilies);
1391     fileMesh->setGroupInfo(theGroups);
1392     fileMesh->setFamilyFieldArr(0, cellsFam);
1393     fileMesh->write(fileName,2);
1394
1395     cellsFam->decrRef();
1396     mesh    ->decrRef();
1397     fileMesh->decrRef();
1398
1399   } // mesh creation
1400
1401   // Partition the mesh into 4 parts
1402
1403   const int ndomains = 4;
1404   ParaDomainSelector parallelizer(false);
1405   MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
1406   ParallelTopology* aPT = (ParallelTopology*) collection.getTopology();
1407   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
1408
1409   std::auto_ptr< Topology > new_topo;
1410 #if defined(MED_ENABLE_METIS) || defined(MED_ENABLE_PARMETIS)
1411   new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,Graph::METIS) );
1412 #endif
1413 #if defined(MED_ENABLE_SCOTCH)
1414   if ( !new_topo.get() )
1415     new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,Graph::SCOTCH) );
1416 #endif
1417   if ( !new_topo.get() )
1418     return;
1419
1420   // Check that "2D is available"
1421
1422   const char xmlName[] = "tmp_testCreateBoundaryFaces2D";
1423   {
1424     MyGlobals::_Create_Boundary_Faces = true;
1425     MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get());
1426
1427     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
1428     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
1429     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
1430     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0,collection.getNbOfLocalFaces());
1431     CPPUNIT_ASSERT      (new_collection.getNbOfLocalFaces() > 0 );
1432
1433     MyGlobals::_General_Informations.clear();
1434     MyGlobals::_General_Informations.push_back(SerializeFromString("finalMeshName=2D"));
1435     new_collection.write( xmlName );
1436   }
1437
1438   // Check that "groups and family handling is NOT bugged"
1439
1440   MeshCollection new_collection(std::string(xmlName)+".xml");
1441   std::map< int, int > famId2nb; // count total nb of cells in divided families
1442   std::map< int, int >::iterator id2nn;
1443   {
1444     const std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*>& famIdsVec = new_collection.getCellFamilyIds();
1445     for ( size_t i = 0; i < famIdsVec.size(); ++i )
1446       {
1447         MEDCoupling::DataArrayInt* famIdsArr = famIdsVec[i];
1448         for ( int j = famIdsArr->getNbOfElems()-1; j >= 0; --j )
1449           {
1450             id2nn = famId2nb.insert( make_pair( famIdsArr->getPointer()[j], 0 )).first;
1451             id2nn->second++;
1452           }
1453       }
1454   }
1455   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 3, (int) famId2nb.size() ); // 3 fams/groups in all
1456   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( 0      ));
1457   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( idFam1 ));
1458   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( idFam2 ));
1459   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( nbFam1, famId2nb[ idFam1 ]);
1460   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( nbFam2, famId2nb[ idFam2 ]);
1461   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( nbc - nbFam1 - nbFam2, famId2nb[ 0 ]);
1462
1463   // Check that "creates boundary faces option is handled"
1464
1465   famId2nb.clear();
1466   const std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*>& famIdsVec = new_collection.getFaceFamilyIds();
1467   for ( size_t i = 0; i < famIdsVec.size(); ++i )
1468     {
1469       MEDCoupling::DataArrayInt* famIdsArr = famIdsVec[i];
1470       for ( int j = famIdsArr->getNbOfElems()-1; j >= 0; --j )
1471         {
1472           id2nn = famId2nb.insert( make_pair( famIdsArr->getPointer()[j], 0 )).first;
1473           id2nn->second++;
1474         }
1475     }
1476
1477   CPPUNIT_ASSERT( !famId2nb.empty() );
1478
1479   // for each "JOINT_n_p_..." group there must be "JOINT_p_n_..." group
1480   // of the same size
1481   std::map<std::string,int>& famName2id = new_collection.getFamilyInfo();
1482   std::map<std::string,int>::iterator na2id = famName2id.begin(), na2id2;
1483   std::set< int > okFamIds;
1484   okFamIds.insert(0);
1485   for ( ; na2id != famName2id.end(); ++na2id )
1486     {
1487       if ( okFamIds.count( na2id->second ) || na2id->first[0] != 'J')
1488         continue;
1489       na2id2 = na2id;
1490       bool groupOK = false;
1491       while ( !groupOK && ++na2id2 != famName2id.end() )
1492         groupOK = ( na2id2->first.find_first_not_of( na2id->first ) == std::string::npos );
1493
1494       CPPUNIT_ASSERT( groupOK );
1495       CPPUNIT_ASSERT( na2id->second != na2id2->second);
1496       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( na2id2->second ));
1497       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( na2id->second ));
1498       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( (int) famId2nb[ na2id2->second ],
1499                             (int) famId2nb[ na2id->second ]);
1500       okFamIds.insert( na2id2->second );
1501     }
1502 }