src/MEDPartitioner/Test/MEDPARTITIONERTest.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2015  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "MEDPARTITIONERTest.hxx"
  21
  22 #include "MEDPARTITIONER_MeshCollection.hxx"
  23 #include "MEDPARTITIONER_ParallelTopology.hxx"
  24 #include "MEDPARTITIONER_ParaDomainSelector.hxx"
  25 #include "MEDPARTITIONER_Utils.hxx"
  26
  27 #include "CellModel.hxx"
  28 #include "MEDFileMesh.hxx"
  29 #include "MEDLoader.hxx"
  30 #include "MEDLoaderBase.hxx"
  31 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  32 #include "MEDCouplingExtrudedMesh.hxx"
  33 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  34 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  35 #include "MEDCouplingMultiFields.hxx"
  36
  37 #include <cppunit/TestAssert.h>
  38
  39 #include <sstream>
  40 #include <cmath>
  41 #include <list>
  42 #include <stdexcept>
  43 #include <cstdlib>
  44 #include <vector>
  45
  46 #ifdef HAVE_MPI
  47 #include <mpi.h>
  48 #endif
  49
  50 using namespace std;
  51 using namespace ParaMEDMEM;
  52 using namespace MEDPARTITIONER;
  53
  54 void MEDPARTITIONERTest::setSize(int ni, int nj, int nk)
  55 {
  56   this->_ni=ni;  //nb of hexa9
  57   this->_nj=nj;
  58   this->_nk=nk;
  59   this->_ntot=_ni*_nj*_nk;
  60   string ijk=IntToStr(ni)+"x"+IntToStr(nj)+"x"+IntToStr(nk);
  61   this->_file_name="tmp_testMesh_"+ijk+".med";
  62   this->_file_name_with_faces="tmp_testMeshWithFaces_"+ijk+".med";
  63   string ij=IntToStr(ni)+"x"+IntToStr(nj);
  64   this->_file_name2="tmp_testMesh_"+ij+".med";
  65   this->_mesh_name="testMesh";
  66 }
  67
  68 void MEDPARTITIONERTest::setSmallSize()
  69 {
  70   setSize(2,3,5); //nb of hexa9
  71 }
  72
  73 void MEDPARTITIONERTest::setMedianSize()
  74 {
  75   setSize(20,30,50); //nb of hexa9
  76 }
  77
  78 void MEDPARTITIONERTest::setbigSize()
  79 {
  80   setSize(200,300,500); //nb of hexa9
  81 }
  82
  83 std::string MEDPARTITIONERTest::getPartitionerExe() const
  84 {
  85   std::string execName;
  86   if ( getenv("top_builddir")) // make distcheck
  87     {
  88       execName = getenv("top_builddir");
  89       execName += "/src/MEDPartitioner/medpartitioner";
  90     }
  91   else if ( getenv("MED_ROOT_DIR") )
  92     {
  93       execName=getenv("MED_ROOT_DIR");  //.../INSTALL/MED
  94       execName+="/bin/salome/medpartitioner";
  95     }
  96   else
  97     {
  98       CPPUNIT_FAIL("Can't find medpartitioner, neither MED_ROOT_DIR nor top_builddir is set");
  99     }
 100   return execName;
 101 }
 102
 103 // ============================================================================
 104 /*!
 105  *  Set up the environment called at every CPPUNIT_TEST ()
 106  */
 107 // ============================================================================
 108 void MEDPARTITIONERTest::setUp()
 109 {
 110   this->_verbose=0;
 111 #if defined(HAVE_MPI)
 112   if (MyGlobals::_Rank==-1)  //do once only
 113     {
 114       MPI_Init(0,0);
 115       MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &MyGlobals::_World_Size);
 116       MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &MyGlobals::_Rank);
 117     }
 118 #else
 119   //sequential : no MPI
 120   MyGlobals::_World_Size=1;
 121   MyGlobals::_Rank=0;
 122 #endif
 123
 124   if (_verbose>10)
 125     {
 126 #if defined(HAVE_MPI)
 127       cout<<"\ndefined(HAVE_MPI)"<<endl;
 128 #else
 129       cout<<"\nNOT defined(HAVE_MPI)"<<endl;
 130 #endif
 131 #if defined(MED_ENABLE_PARMETIS)
 132       cout<<"defined(MED_ENABLE_PARMETIS)"<<endl;
 133 #else
 134       cout<<"NOT defined(MED_ENABLE_PARMETIS)"<<endl;
 135 #endif
 136 #if defined(MED_ENABLE_METIS)
 137       cout<<"defined(MED_ENABLE_METIS)"<<endl;
 138 #else
 139       cout<<"NOT defined(MED_ENABLE_METIS)"<<endl;
 140 #endif
 141 #if defined(MED_ENABLE_SCOTCH)
 142       cout<<"defined(MED_ENABLE_SCOTCH)"<<endl;
 143 #else
 144       cout<<"NOT defined(MED_ENABLE_SCOTCH)"<<endl;
 145 #endif
 146     }
 147 }
 148
 149 // ============================================================================
 150 /*!
 151  *  - delete
 152  */
 153 // ============================================================================
 154 void MEDPARTITIONERTest::tearDown()
 155 {
 156 }
 157
 158 ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh * MEDPARTITIONERTest::buildCUBE3DMesh()
 159 //only hexa8
 160 {
 161   vector<int> conn;
 162   vector<double> coor;
 163   for (int k=0; k<=_nk; k++)
 164     for (int j=0; j<=_nj; j++)
 165       for (int i=0; i<=_ni; i++)
 166         {
 167           coor.push_back(i+.1);
 168           coor.push_back(j+.2);
 169           coor.push_back(k+.3);
 170         }
 171   int ii;
 172   for (int k=0; k<_nk; k++)
 173     for (int j=0; j<_nj; j++)
 174       for (int i=0; i<_ni; i++)
 175         {
 176           ii=i + j*(_ni+1) + k*(_ni+1)*(_nj+1);
 177           conn.push_back(ii);
 178           conn.push_back(ii+1);
 179           ii=ii + _ni + 2 ;
 180           conn.push_back(ii);
 181           conn.push_back(ii-1);
 182
 183           ii=i + j*(_ni+1) + (k+1)*(_ni+1)*(_nj+1);
 184           conn.push_back(ii);
 185           conn.push_back(ii+1);
 186           ii=ii + _ni + 2 ;
 187           conn.push_back(ii);
 188           conn.push_back(ii-1);
 189         }
 190
 191   /*
 192   if (_verbose)  //only for debug
 193     {
 194       cout<< "\nnb coor " << (_ni+1)*(_nj+1)*(_nk+1)*3 << " " << coor.size() << endl;
 195       for (int i=0; i<(int)coor.size(); i++)
 196         cout << coor[i] << " ";
 197       cout << endl;
 198       cout << "\nnb conn " << (_ni)*(_nj)*(_nk)*8 << " " << conn.size() << endl;
 199       for (int i=0; i<(int)conn.size(); i=i+8)
 200         {
 201           for (int j=0; j<8; j++)
 202             cout << conn[i+j] << " ";
 203           cout << endl;
 204         }
 205       cout << endl;
 206     }
 207   */
 208
 209   MEDCouplingUMesh *mesh=MEDCouplingUMesh::New();
 210   mesh->setMeshDimension(3);
 211   int nbc=conn.size()/8; //nb of cells
 212   int nbv=coor.size()/3; //nb of vertices
 213   mesh->allocateCells(nbc);
 214   for(int i=0; i<nbc; i++)
 215     {
 216       int onehexa[8];
 217       std::copy(conn.begin()+i*8,conn.begin()+(i+1)*8,onehexa);
 218       if (false) //(_verbose)
 219         {
 220           for (int j=0; j<8; j++) cout<<onehexa[j]<<" ";
 221           cout<<endl;
 222         }
 223       mesh->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8,8,onehexa);
 224     }
 225   mesh->finishInsertingCells();
 226   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 227   myCoords->alloc(nbv,3);
 228   std::copy(coor.begin(),coor.end(),myCoords->getPointer());
 229   mesh->setCoords(myCoords);
 230   mesh->setName(_mesh_name.c_str());
 231   myCoords->decrRef();
 232   mesh->checkCoherency();
 233   return mesh;
 234 }
 235
 236 ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh * MEDPARTITIONERTest::buildCARRE3DMesh()
 237 //only quad4 in oblique (k=j)
 238 {
 239   vector<int> conn;
 240   vector<double> coor;
 241   for (int j=0; j<=_nj; j++)
 242     for (int i=0; i<=_ni; i++)
 243       {
 244         int k=j;
 245         coor.push_back(i+.1);
 246         coor.push_back(j+.2);
 247         coor.push_back(k+.3);
 248       }
 249   int ii;
 250   int k=0;
 251   for (int j=0; j<_nj; j++)
 252     for (int i=0; i<_ni; i++)
 253       {
 254         ii=i + j*(_ni+1) + k*(_ni+1)*(_nj+1);
 255         conn.push_back(ii);
 256         conn.push_back(ii+1);
 257         ii=ii + _ni + 2 ;
 258         conn.push_back(ii);
 259         conn.push_back(ii-1);
 260       }
 261
 262   if (false) //(_verbose)
 263     {
 264       cout<<"\nnb coor "<<(_ni+1)*(_nj+1)*3<<" "<<coor.size()<<endl;
 265       for (int i=0; i<(int)coor.size(); i++)
 266         cout << coor[i] << " ";
 267       cout<<endl;
 268       cout<<"\nnb conn "<<(_ni)*(_nj)*4<<" "<<conn.size()<<endl;
 269       for (int i=0; i<(int)conn.size(); i=i+4)
 270         {
 271           for (int j=0; j<4; j++) cout<<conn[i+j]<<" ";
 272           cout<<endl;
 273         }
 274       cout<<endl;
 275     }
 276
 277   MEDCouplingUMesh *mesh=MEDCouplingUMesh::New();
 278   mesh->setMeshDimension(2);
 279   int nbc=conn.size()/4; //nb of cells
 280   int nbv=coor.size()/3; //nb of vertices
 281   mesh->allocateCells(nbc);
 282   for(int i=0; i<nbc; i++)
 283     {
 284       int onequa[4];
 285       std::copy(conn.begin()+i*4,conn.begin()+(i+1)*4,onequa);
 286       if (false) //(_verbose)
 287         {
 288           for (int j=0; j<4; j++) cout<<onequa[j]<<" ";
 289           cout<<endl;
 290         }
 291       mesh->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4,4,onequa);
 292     }
 293   mesh->finishInsertingCells();
 294   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 295   myCoords->alloc(nbv,3);
 296   std::copy(coor.begin(),coor.end(),myCoords->getPointer());
 297   mesh->setCoords(myCoords);
 298   mesh->setName(_mesh_name.c_str());
 299   myCoords->decrRef();
 300   mesh->checkCoherency();
 301   return mesh;
 302 }
 303
 304 ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh * MEDPARTITIONERTest::buildFACE3DMesh()
 305 //only quad4 on a global face of the CUBE3D (k=0)
 306 {
 307   vector<int> conn;
 308   vector<double> coor;
 309   for (int j=0; j<=_nj; j++)
 310     for (int i=0; i<=_ni; i++)
 311       {
 312         int k=0;
 313         coor.push_back(i+.1);
 314         coor.push_back(j+.2);
 315         coor.push_back(k+.3);
 316       }
 317   int ii;
 318   int k=0;
 319   for (int j=0; j<_nj; j++)
 320     for (int i=0; i<_ni; i++)
 321       {
 322         ii=i + j*(_ni+1) + k*(_ni+1)*(_nj+1);
 323         conn.push_back(ii);
 324         conn.push_back(ii+1);
 325         ii=ii + _ni + 2 ;
 326         conn.push_back(ii);
 327         conn.push_back(ii-1);
 328       }
 329
 330   if (false) //(_verbose)
 331     {
 332       cout<<"\nnb coor "<<(_ni+1)*(_nj+1)*3<<" "<<coor.size()<<endl;
 333       for (int i=0; i<(int)coor.size(); i++)
 334         cout << coor[i] << " ";
 335       cout<<endl;
 336       cout<<"\nnb conn "<<(_ni)*(_nj)*4<<" "<<conn.size()<<endl;
 337       for (int i=0; i<(int)conn.size(); i=i+4)
 338         {
 339           for (int j=0; j<4; j++)
 340             cout << conn[i+j] << " ";
 341           cout << endl;
 342         }
 343       cout << endl;
 344     }
 345
 346   MEDCouplingUMesh *mesh=MEDCouplingUMesh::New();
 347   mesh->setMeshDimension(2);
 348   int nbc=conn.size()/4; //nb of cells
 349   int nbv=coor.size()/3; //nb of vertices
 350   mesh->allocateCells(nbc);
 351   for(int i=0; i<nbc; i++)
 352     {
 353       int onequa[4];
 354       std::copy(conn.begin()+i*4,conn.begin()+(i+1)*4,onequa);
 355       if (false) //(_verbose)
 356         {
 357           for (int j=0; j<4; j++) cout<<onequa[j]<<" ";
 358           cout<<endl;
 359         }
 360       mesh->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4,4,onequa);
 361     }
 362   mesh->finishInsertingCells();
 363   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 364   myCoords->alloc(nbv,3);
 365   std::copy(coor.begin(),coor.end(),myCoords->getPointer());
 366   mesh->setCoords(myCoords);
 367   mesh->setName(_mesh_name.c_str());
 368   myCoords->decrRef();
 369   mesh->checkCoherency();
 370   return mesh;
 371 }
 372
 373 MEDCouplingFieldDouble * MEDPARTITIONERTest::buildVecFieldOnCells(string myfileName)
 374 {
 375   //int ni=2,nj=3,nk=5; //nb of hexa9
 376   vector<double> field;
 377   for (int k=0; k<_nk; k++)
 378     for (int j=0; j<_nj; j++)
 379       for (int i=0; i<_ni; i++)
 380         {
 381           field.push_back(i+.1);
 382           field.push_back(j+.2);
 383           field.push_back(k+.3);
 384         }
 385
 386   MEDCouplingUMesh *mesh=MEDLoader::ReadUMeshFromFile(myfileName.c_str(),_mesh_name.c_str(),0);
 387   int nbOfCells=mesh->getNumberOfCells();
 388   MEDCouplingFieldDouble *f1=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,ONE_TIME);
 389   f1->setName("VectorFieldOnCells");
 390   f1->setDescription("DescriptionOfFieldOnCells"); //not saved in file?
 391   f1->setMesh(mesh);
 392   DataArrayDouble *myField=DataArrayDouble::New();
 393   myField->alloc(nbOfCells,3);
 394   std::copy(field.begin(),field.end(),myField->getPointer());
 395   f1->setArray(myField);
 396   myField->setInfoOnComponent(0,"vx");
 397   myField->setInfoOnComponent(1,"vy");
 398   myField->setInfoOnComponent(2,"vz");
 399   myField->decrRef();
 400   f1->setTime(2.,0,1);
 401   f1->checkCoherency();
 402   mesh->decrRef();
 403   return f1;
 404 }
 405
 406 MEDCouplingFieldDouble * MEDPARTITIONERTest::buildVecFieldOnNodes()
 407 {
 408   //int ni=2,nj=3,nk=5; //nb of hexa9
 409   vector<double> field;
 410   for (int k=0; k<=_nk; k++)
 411     for (int j=0; j<=_nj; j++)
 412       for (int i=0; i<=_ni; i++)
 413         {
 414           field.push_back(i+.1);
 415           field.push_back(j+.2);
 416           field.push_back(k+.3);
 417         }
 418
 419   MEDCouplingUMesh *mesh=MEDLoader::ReadUMeshFromFile(_file_name.c_str(),_mesh_name.c_str(),0);
 420   int nbOfNodes=mesh->getNumberOfNodes();
 421   MEDCouplingFieldDouble *f1=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_NODES,ONE_TIME);
 422   f1->setName("VectorFieldOnNodes");
 423   f1->setDescription("DescriptionOfFieldOnNodes"); //not saved in file?
 424   f1->setMesh(mesh);
 425   DataArrayDouble *myField=DataArrayDouble::New();
 426   myField->alloc(nbOfNodes,3);
 427   std::copy(field.begin(),field.end(),myField->getPointer());
 428   f1->setArray(myField);
 429   myField->setInfoOnComponent(0,"vx");
 430   myField->setInfoOnComponent(1,"vy");
 431   myField->setInfoOnComponent(2,"vz");
 432   myField->decrRef();
 433   f1->setTime(2.,0,1);
 434   f1->checkCoherency();
 435   mesh->decrRef();
 436   return f1;
 437 }
 438
 439
 440 void MEDPARTITIONERTest::createTestMeshWithoutField()
 441 {
 442   {
 443     MEDCouplingUMesh * mesh = buildCUBE3DMesh();
 444     MEDLoader::WriteUMesh(_file_name.c_str(),mesh,true);
 445     if (_verbose) cout<<endl<<_file_name<<" created"<<endl;
 446     if (_ntot<1000000) //too long
 447       {
 448         MEDCouplingUMesh *mesh_rw=MEDLoader::ReadUMeshFromFile(_file_name.c_str(),mesh->getName().c_str(),0);
 449         if (_verbose) cout<<_file_name<<" reread"<<endl;
 450         CPPUNIT_ASSERT(mesh->isEqual(mesh_rw,1e-12));
 451         mesh_rw->decrRef();
 452       }
 453     mesh->decrRef();
 454   }
 455
 456   {
 457     vector<const ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*> meshes;
 458     MEDCouplingUMesh * mesh1 = buildCUBE3DMesh();
 459     MEDCouplingUMesh * mesh2 = buildFACE3DMesh();
 460     mesh1->setName("testMesh");
 461     mesh2->setName("theFaces");
 462     mesh2->tryToShareSameCoordsPermute(*mesh1, 1e-9);
 463     mesh2->checkCoherency();
 464     mesh1->checkCoherency();
 465     meshes.push_back(mesh1);
 466     meshes.push_back(mesh2);
 467     MEDLoader::WriteUMeshes(_file_name_with_faces.c_str(), meshes, true);
 468
 469     ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* mfm=ParaMEDMEM::MEDFileUMesh::New(_file_name_with_faces.c_str(), mesh1->getName().c_str());
 470     DataArrayInt* FacesFam=DataArrayInt::New();
 471     FacesFam->alloc(mfm->getSizeAtLevel(-1),1);
 472     FacesFam->fillWithValue(-1);
 473     DataArrayInt* CellsFam=DataArrayInt::New();
 474     CellsFam->alloc(mfm->getSizeAtLevel(0),1);
 475     CellsFam->fillWithValue(1);
 476     mfm->setFamilyFieldArr(-1,FacesFam);
 477     mfm->setFamilyFieldArr(0,CellsFam);
 478     map<string,int> theFamilies;
 479     theFamilies["FAMILLE_ZERO"]=0;
 480     theFamilies["FamilyFaces"]=-1;
 481     theFamilies["FamilyCells"]=1;
 482     map<string, vector<string> > theGroups;
 483     theGroups["GroupFaces"].push_back("FamilyFaces");
 484     theGroups["GroupCells"].push_back("FamilyCells");
 485     mfm->setFamilyInfo(theFamilies);
 486     mfm->setGroupInfo(theGroups);
 487     mfm->write(_file_name_with_faces.c_str(),0);
 488     FacesFam->decrRef();
 489     CellsFam->decrRef();
 490
 491     /*ce truc marche pas!
 492       ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* mfm=ParaMEDMEM::MEDFileUMesh::New(_file_name_with_faces.c_str(), mesh1->getName());
 493       vector<const ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*> ms;
 494       ms.push_back(mesh2);
 495       mfm->setGroupsFromScratch(-1, ms);
 496       mfm->write(_file_name_with_faces.c_str(),0);
 497     */
 498
 499     if (_verbose) cout<<endl<<_file_name_with_faces<<" created"<<endl;
 500     if (_ntot<1000000) //too long
 501       {
 502         MEDCouplingUMesh *mesh_rw=MEDLoader::ReadUMeshFromFile(_file_name_with_faces.c_str(),mesh1->getName().c_str(),0);
 503         if (_verbose) cout<<_file_name_with_faces<<" reread"<<endl;
 504         CPPUNIT_ASSERT(mesh1->isEqual(mesh_rw,1e-12));
 505         mesh_rw->decrRef();
 506       }
 507     mesh1->decrRef();
 508     mesh2->decrRef();
 509     mfm->decrRef();
 510   }
 511
 512   {
 513     MEDCouplingUMesh * mesh = buildCARRE3DMesh();
 514     MEDLoader::WriteUMesh(_file_name2.c_str(),mesh,true);
 515     if (_verbose) cout<<endl<<_file_name2<<" created"<<endl;
 516     MEDCouplingUMesh *mesh_rw=MEDLoader::ReadUMeshFromFile(_file_name2.c_str(),mesh->getName().c_str(),0);
 517     if (_verbose) cout<<_file_name2<<" reread"<<endl;
 518     CPPUNIT_ASSERT(mesh->isEqual(mesh_rw,1e-12));
 519     mesh_rw->decrRef();
 520     mesh->decrRef();
 521   }
 522 }
 523
 524 /*
 525 create a set of nbx*nby*nbz files mesh of ni*ny*nz cells
 526 */
 527 void MEDPARTITIONERTest::createHugeTestMesh(int ni, int nj, int nk, int nbx, int nby, int nbz, int nbTarget)
 528 {
 529   setSize(ni,nj,nk);
 530   _nb_target_huge=nbTarget;
 531   MEDCouplingUMesh * mesh = buildCUBE3DMesh();
 532   //int nbx=1, nby=1, nbz=2;
 533   std::vector< double > cooDep,cooFin;
 534   mesh->getCoordinatesOfNode(0, cooDep);
 535   mesh->getCoordinatesOfNode(mesh->getNumberOfNodes()-1, cooFin);
 536   //cout<<endl<<cooDep[0]<<" "<<cooDep[1]<<" "<<cooDep[2]<<endl;
 537   //cout<<cooFin[0]<<" "<<cooFin[1]<<" "<<cooFin[2]<<endl;
 538
 539   string tagXml="\
 540 <?xml version=\"1.0\" encoding=\"UTF-8\"?>\n \
 541 <root>\n \
 542   <version maj=\"2\" min=\"3\" ver=\"1\"/>\n \
 543   <description what=\"\" when=\"YYMMDDHHmm\"/>\n \
 544   <content>\n \
 545     <mesh name=\"testMesh\"/>\n \
 546   </content>\n \
 547   <splitting>\n \
 548     <subdomain number=\"$subdomainNumber\"/>\n \
 549     <global_numbering present=\"no\"/>\n \
 550   </splitting>\n \
 551   <files>\n$tagSubfile \
 552   </files>\n \
 553   <mapping>\n$tagMesh \
 554   </mapping>\n \
 555 </root>\n";
 556
 557   string tagSubfiles, tagSubfile="\
 558     <subfile id=\"$xyz\">\n \
 559       <name>$fileName</name>\n \
 560       <machine>localhost</machine>\n \
 561     </subfile>\n";
 562   string tagMeshes, tagMesh="\
 563     <mesh name=\"testMesh\">\n \
 564       <chunk subdomain=\"$xyz\">\n \
 565         <name>testMesh</name>\n \
 566       </chunk>\n \
 567     </mesh>\n";
 568
 569   int xyz=1;
 570   string sxyz;
 571   DataArrayDouble* coordsInit=mesh->getCoords()->deepCpy();
 572   double* ptrInit=coordsInit->getPointer();
 573   double deltax=cooFin[0]-cooDep[0];
 574   double deltay=cooFin[1]-cooDep[1];
 575   double deltaz=cooFin[2]-cooDep[2];
 576
 577   double dz=0.;
 578   for (int z=0; z<nbz; z++)
 579     {
 580       double dy=0.;
 581       for (int y=0; y<nby; y++)
 582         {
 583           double dx=0.;
 584           for (int x=0; x<nbx; x++)
 585             {
 586               string fileName;
 587               sxyz=IntToStr(xyz);
 588               fileName="tmp_testMeshHuge_"+IntToStr(_ni)+"x"+IntToStr(_nj)+"x"+IntToStr(_nk)+"_"+sxyz+".med";
 589
 590               DataArrayDouble* coords=mesh->getCoords();
 591               //int nbOfComp=coords->getNumberOfComponents();  //be 3D
 592               int nbOfTuple=coords->getNumberOfTuples();
 593               double* ptr=coords->getPointer();
 594               double* ptrini=ptrInit;
 595               for (int i=0; i<nbOfTuple; i++)
 596                 {
 597                   *ptr=(*ptrini)+dx; ptr++; ptrini++; //be 3D
 598                   *ptr=(*ptrini)+dy; ptr++; ptrini++;
 599                   *ptr=(*ptrini)+dz; ptr++; ptrini++;
 600                 }
 601
 602               MEDLoader::WriteUMesh(fileName.c_str(),mesh,true);
 603
 604               tagSubfiles+=tagSubfile;
 605               tagSubfiles.replace(tagSubfiles.find("$xyz"),4,sxyz);
 606               tagSubfiles.replace(tagSubfiles.find("$fileName"),9,fileName);
 607
 608               tagMeshes+=tagMesh;
 609               tagMeshes.replace(tagMeshes.find("$xyz"),4,sxyz);
 610               xyz++;
 611               dx+=deltax;
 612             }
 613           dy+=deltay;
 614         }
 615       dz+=deltaz;
 616     }
 617   coordsInit->decrRef();
 618
 619   tagXml.replace(tagXml.find("$subdomainNumber"),16,sxyz);
 620   tagXml.replace(tagXml.find("$tagSubfile"),11,tagSubfiles);
 621   tagXml.replace(tagXml.find("$tagMesh"),8,tagMeshes);
 622
 623   string nameFileXml;
 624   _file_name_huge_xml="tmp_testMeshHuge_"+IntToStr(_ni)+"x"+IntToStr(_nj)+"x"+IntToStr(_nk)+"_"+sxyz+".xml";
 625   std::ofstream f(_file_name_huge_xml.c_str());
 626   f<<tagXml;
 627   f.close();
 628   //cout<<"\n"<<tagXml<<endl;
 629   if (_verbose)
 630     cout<<endl<<nameFileXml<<" created"<<endl;
 631   mesh->decrRef();
 632 }
 633
 634 void MEDPARTITIONERTest::createTestMeshWithVecFieldOnCells()
 635 {
 636   {
 637     string name=_file_name;
 638     MEDCouplingFieldDouble *f1=buildVecFieldOnCells(name);
 639     name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnCells.med");
 640     MEDLoader::WriteField(name.c_str(),f1,true);
 641     f1->setTime(3.,1,1);  //time,it,order
 642     f1->applyFunc("x/2.");
 643     MEDLoader::WriteField(name.c_str(),f1,false);
 644     if (_verbose) cout<<endl<<name<<" created"<<endl;
 645     if (_ntot<1000000) //too long
 646       {
 647         MEDCouplingFieldDouble *f2=MEDLoader::ReadFieldCell(name.c_str(),f1->getMesh()->getName().c_str(),0,f1->getName().c_str(),0,1);
 648         //DataArrayDouble *res=f2->getArray();
 649         if (_verbose) cout<<name<<" reread"<<endl;
 650         //CPPUNIT_ASSERT(f1->isEqual(f2,1e-12,1e-12));
 651         f2->decrRef();
 652       }
 653     f1->decrRef();
 654   }
 655   {
 656     string name=_file_name;
 657     MEDCouplingFieldDouble *f1=buildVecFieldOnCells(name);
 658     name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnGaussNe.med");
 659     MEDCouplingFieldDouble *f3=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_GAUSS_NE,ONE_TIME);
 660     f3->setMesh(f1->getMesh());
 661     //cout<<"\nNumberOfMeshPlacesExpected "<<f3->getNumberOfMeshPlacesExpected()<<" "
 662     //                                     /*<<getNumberOfTuples(f1->getMesh())<<" "*/
 663     //                                     <<f3->getMesh()->getNumberOfNodes()<<" "
 664     //                                     <<f3->getMesh()->getNumberOfCells()<<endl;
 665     f3->setName("MyFieldOnGaussNE");
 666     f3->setDescription("MyDescriptionNE");
 667     DataArrayDouble *array=DataArrayDouble::New();
 668     //int nb=f1->getMesh()->getNumberOfNodes();
 669
 670     /*8 pt de gauss by cell
 671       int nb=f3->getMesh()->getNumberOfCells()*8;
 672       array->alloc(nb,2);
 673       double *ptr=array->getPointer();
 674       for (int i=0; i<nb*2; i=i+2) {ptr[i]=(double)(i/8) ; ptr[i]=2.*(double)(i/8);}
 675     */
 676
 677     //more nbptgauss=8 by default needs set MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell
 678     //theory: (may be) http://www.code-aster.org/V2/doc/v9/fr/man_r/r3/r3.06.03.pdf
 679     int nbptgauss=8; //nb pt de gauss by cell
 680     int nbcell=f3->getMesh()->getNumberOfCells();
 681     int nb=nbcell*nbptgauss;
 682     int nbcomp=2;
 683     array->alloc(nb,nbcomp);
 684     double *ptr=array->getPointer();
 685     int ii=0;
 686     for (int i=0; i<nbcell; i++)
 687       for (int j=0; j<nbptgauss; j++)
 688         for (int k=0; k<nbcomp; k++)
 689           {
 690             //123.4 for 12th cell,3rd component, 4th gausspoint
 691             ptr[ii]=(double)((i+1)*10+(k+1))+((double)(j+1))/10.;
 692             ii++;
 693           }
 694     array->setInfoOnComponent(0,"vGx");
 695     array->setInfoOnComponent(1,"vGy");
 696     f3->setTime(4.,5,6);
 697     f3->setArray(array);
 698     array->decrRef();
 699     MEDLoader::WriteField(name.c_str(),f3,true);
 700     if (_verbose) cout<<endl<<name<<" created"<<endl;
 701     f3->checkCoherency();
 702     f1->decrRef();
 703     if (_ntot<1000000) //too long
 704       {
 705         MEDCouplingFieldDouble* f4=MEDLoader::ReadField(ON_GAUSS_NE,
 706                                                         name.c_str(), f3->getMesh()->getName().c_str(), 0, "MyFieldOnGaussNE", 5, 6);
 707         if (_verbose) cout<<"MyFieldOnGaussNE reread"<<endl;
 708         f4->decrRef();
 709       }
 710     f3->decrRef();
 711   }
 712   {
 713     string name=_file_name_with_faces;
 714     MEDCouplingFieldDouble *f1=buildVecFieldOnCells(name);
 715     name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnCells.med");
 716     MEDLoader::WriteField(name.c_str(),f1,true);
 717     if (_verbose) cout<<endl<<name<<" created"<<endl;
 718     if (_ntot<1000000) //too long
 719       {
 720         MEDCouplingFieldDouble *f2=MEDLoader::ReadFieldCell(name.c_str(),f1->getMesh()->getName().c_str(),0,f1->getName().c_str(),0,1);
 721         if (_verbose) cout<<name<<" reread"<<endl;
 722         //CPPUNIT_ASSERT(f1->isEqual(f2,1e-12,1e-12)); assertion failed!!
 723         f2->decrRef();
 724       }
 725     f1->decrRef();
 726   }
 727 }
 728
 729 void MEDPARTITIONERTest::createTestMeshWithVecFieldOnNodes()
 730 {
 731   MEDCouplingFieldDouble *f1=buildVecFieldOnNodes();
 732   string name=_file_name;
 733   name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnNodes.med");
 734   MEDLoader::WriteField(name.c_str(),f1,true);
 735   if (_verbose) cout<<endl<<name<<" created"<<endl;
 736   if (_ntot<1000000) //too long
 737     {
 738       MEDCouplingFieldDouble *f2=MEDLoader::ReadFieldNode(name.c_str(),f1->getMesh()->getName().c_str(),0,f1->getName().c_str(),0,1);
 739       if (_verbose) cout<<name<<" reread"<<endl;
 740       //CPPUNIT_ASSERT(f1->isEqual(f2,1e-12,1e-12)); assertion failed!!
 741       f2->decrRef();
 742     }
 743   f1->decrRef();
 744 }
 745
 746 void MEDPARTITIONERTest::verifyTestMeshWithVecFieldOnNodes()
 747 {
 748   string name=_file_name;
 749   name.replace(name.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnNodes.med");
 750   MEDCouplingUMesh * m=MEDLoader::ReadUMeshFromFile(name.c_str(),_mesh_name.c_str(),0);
 751   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> types(m->getAllGeoTypes());
 752   if (_verbose)
 753     {
 754       cout<<"\n types in "<<name<<" : ";
 755       //for (std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::iterator t=types.begin(); t!=types.end(); ++t) cout<<" "<<*t;
 756       for (std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::const_iterator t=types.begin(); t!=types.end(); ++t)
 757         {
 758           //INTERP_KERNEL::CellModel essai=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(*t);
 759           cout<<" "<<(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(*t)).getRepr();
 760         }
 761       cout<<endl;
 762     }
 763   m->decrRef();
 764
 765   MEDFileUMesh * mf = MEDFileUMesh::New(_file_name.c_str(),_mesh_name.c_str(),-1,-1);
 766   vector<int> lev;
 767   lev=mf->getNonEmptyLevels();
 768   if (_verbose)
 769     {
 770       cout<<" levels in "<<name<<" : ";
 771       for (vector<int>::iterator l=lev.begin(); l!=lev.end(); ++l) cout<<" "<<*l;
 772       cout<<endl;
 773     }
 774   mf->decrRef();
 775 }
 776
 777 void MEDPARTITIONERTest::createTestMeshes()
 778 {
 779   createTestMeshWithoutField();
 780   createTestMeshWithVecFieldOnCells();
 781   createTestMeshWithVecFieldOnNodes();
 782 }
 783
 784 void MEDPARTITIONERTest::deleteTestMeshes()
 785 {
 786   string cmd="rm *tmp_testMesh*";
 787   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
 788   system(cmd.c_str());  //may be not if debug
 789 }
 790
 791 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionSingle()
 792 {
 793   setSmallSize();
 794   createTestMeshes();
 795   MyGlobals::_World_Size=1;
 796   MyGlobals::_Rank=0;
 797   string fileName=_file_name_with_faces;
 798   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 799   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 800   CPPUNIT_ASSERT(collection.isParallelMode());
 801   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, collection.getMeshDimension());
 802   CPPUNIT_ASSERT(collection.getName()=="testMesh");
 803   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1,collection.getNbOfLocalMeshes());
 804   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1,collection.getNbOfGlobalMeshes());
 805   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(_ni*_nj*_nk,collection.getNbOfLocalCells());
 806   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(_ni*_nj,collection.getNbOfLocalFaces());
 807 }
 808
 809 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionXml()
 810 {
 811   setSmallSize();
 812   createHugeTestMesh(_ni, _nj, _nk, 2, 2, 2, 32); //xml but not so huge
 813   string fileName=_file_name_huge_xml;
 814   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 815   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 816   CPPUNIT_ASSERT(collection.isParallelMode());
 817   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, collection.getMeshDimension());
 818   CPPUNIT_ASSERT(collection.getName()=="testMesh");
 819   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(8,collection.getNbOfLocalMeshes());
 820   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(8,collection.getNbOfGlobalMeshes());
 821   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(_ni*_nj*_nk*8,collection.getNbOfLocalCells());
 822   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0,collection.getNbOfLocalFaces());
 823 }
 824
 825
 826 //#################for metis
 827
 828
 829
 830 #if defined(MED_ENABLE_METIS)
 831 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionSinglePartitionMetis()
 832 {
 833   setSmallSize();
 834   createTestMeshes();
 835   //MyGlobals::_Verbose=500;
 836   string fileName=_file_name_with_faces;
 837   int ndomains=2;
 838   bool split_family=false;
 839   bool empty_groups=false;
 840   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 841   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 842
 843   MEDPARTITIONER::ParallelTopology* aPT = (MEDPARTITIONER::ParallelTopology*) collection.getTopology();
 844   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
 845   //Creating the graph and partitioning it
 846   auto_ptr< MEDPARTITIONER::Topology > new_topo;
 847   new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,MEDPARTITIONER::Graph::METIS) );
 848   //Creating a new mesh collection from the partitioning
 849   MEDPARTITIONER::MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get(),split_family,empty_groups);
 850
 851   //example to create files
 852   //MyGlobals::_General_Informations.clear();
 853   //MyGlobals::_General_Informations.push_back(SerializeFromString("finalMeshName=Merge"));
 854   //if (MyGlobals::_Verbose>100) cout << "generalInformations : \n"<<ReprVectorOfString(MyGlobals::_General_Informations);
 855   //new_collection.write("ttmp")
 856
 857   CPPUNIT_ASSERT(new_collection.isParallelMode());
 858   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, new_collection.getMeshDimension());
 859   CPPUNIT_ASSERT(new_collection.getName()==collection.getName());
 860   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
 861   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
 862   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
 863   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalFaces(),new_collection.getNbOfLocalFaces());
 864 }
 865
 866 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionComplexPartitionMetis()
 867 {
 868   setSmallSize();
 869   createHugeTestMesh(_ni, _nj, _nk, 2, 2, 2, 32); //xml on 2*2*2 meshes but not so huge
 870   string fileName=_file_name_huge_xml;
 871   bool split_family=false;
 872   bool empty_groups=false;
 873   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 874   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 875
 876   MEDPARTITIONER::ParallelTopology* aPT = (MEDPARTITIONER::ParallelTopology*) collection.getTopology();
 877   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
 878
 879   for (int ndomains=2 ; ndomains<=16 ; ndomains++)
 880     {
 881       //Creating the graph and partitioning it
 882       auto_ptr< MEDPARTITIONER::Topology > new_topo;
 883       new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,MEDPARTITIONER::Graph::METIS) );
 884       //Creating a new mesh collection from the partitioning
 885       MEDPARTITIONER::MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get(),split_family,empty_groups);
 886
 887       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
 888       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
 889       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
 890       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalFaces(),new_collection.getNbOfLocalFaces());
 891     }
 892 }
 893
 894 void MEDPARTITIONERTest::testMetisSmallSize()
 895 {
 896   //#if !defined(HAVE_MPI)
 897   setSmallSize();
 898   createTestMeshes();
 899   std::string MetisOrScotch("metis");
 900   launchMetisOrScotchMedpartitionerOnTestMeshes(MetisOrScotch);
 901   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForMesh(MetisOrScotch);
 902   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnCells(MetisOrScotch);
 903   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnGaussNe(MetisOrScotch);
 904   //#endif
 905 }
 906 #endif
 907
 908
 909 //#################for scotch
 910
 911
 912 #if defined(MED_ENABLE_SCOTCH)
 913 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionSinglePartitionScotch()
 914 {
 915   setSmallSize();
 916   createTestMeshes();
 917   //MyGlobals::_Verbose=500;
 918   string fileName=_file_name_with_faces;
 919   int ndomains=2;
 920   bool split_family=false;
 921   bool empty_groups=false;
 922   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 923   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 924
 925   MEDPARTITIONER::ParallelTopology* aPT = (MEDPARTITIONER::ParallelTopology*) collection.getTopology();
 926   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
 927   //Creating the graph and partitioning it
 928   auto_ptr< MEDPARTITIONER::Topology > new_topo;
 929   new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,MEDPARTITIONER::Graph::SCOTCH) );
 930   //Creating a new mesh collection from the partitioning
 931   MEDPARTITIONER::MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get(),split_family,empty_groups);
 932
 933   //example to create files
 934   //MyGlobals::_General_Informations.clear();
 935   //MyGlobals::_General_Informations.push_back(SerializeFromString("finalMeshName=Merge"));
 936   //if (MyGlobals::_Verbose>100) cout << "generalInformations : \n"<<ReprVectorOfString(MyGlobals::_General_Informations);
 937   //new_collection.write("ttmp")
 938
 939   CPPUNIT_ASSERT(new_collection.isParallelMode());
 940   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, new_collection.getMeshDimension());
 941   CPPUNIT_ASSERT(new_collection.getName()==collection.getName());
 942   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
 943   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
 944   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
 945   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalFaces(),new_collection.getNbOfLocalFaces());
 946 }
 947
 948 void MEDPARTITIONERTest::testMeshCollectionComplexPartitionScotch()
 949 {
 950   setSmallSize();
 951   createHugeTestMesh(_ni, _nj, _nk, 2, 2, 2, 32); //xml on 2*2*2 meshes but not so huge
 952   string fileName=_file_name_huge_xml;
 953   bool split_family=false;
 954   bool empty_groups=false;
 955   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
 956   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
 957
 958   MEDPARTITIONER::ParallelTopology* aPT = (MEDPARTITIONER::ParallelTopology*) collection.getTopology();
 959   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
 960
 961   for (int ndomains=2 ; ndomains<=16 ; ndomains++)
 962     {
 963       //Creating the graph and partitioning it
 964       auto_ptr< MEDPARTITIONER::Topology > new_topo;
 965       new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,MEDPARTITIONER::Graph::SCOTCH) );
 966       //Creating a new mesh collection from the partitioning
 967       MEDPARTITIONER::MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get(),split_family,empty_groups);
 968
 969       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
 970       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
 971       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
 972       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalFaces(),new_collection.getNbOfLocalFaces());
 973     }
 974 }
 975
 976 void MEDPARTITIONERTest::testScotchSmallSize()
 977 {
 978   //#if !defined(HAVE_MPI)
 979   setSmallSize();
 980   createTestMeshes();
 981   std::string MetisOrScotch("scotch");
 982   launchMetisOrScotchMedpartitionerOnTestMeshes(MetisOrScotch);
 983   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForMesh(MetisOrScotch);
 984   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnCells(MetisOrScotch);
 985   verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnGaussNe(MetisOrScotch);
 986   //#endif
 987 }
 988 #endif
 989
 990 void MEDPARTITIONERTest::launchMetisOrScotchMedpartitionerOnTestMeshes(std::string MetisOrScotch)
 991 {
 992   int res;
 993   string cmd,execName,sourceName,targetName;
 994
 995   execName=getPartitionerExe();
 996
 997   cmd="which "+execName+" 2>/dev/null 1>/dev/null";  //no trace
 998   res=system(cmd.c_str());
 999   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL_MESSAGE(execName + " - INVALID PATH TO medpartitioner", 0, res);
1000
1001   cmd=execName+" --ndomains=2 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1002   sourceName=_file_name;
1003   targetName=_file_name;
1004   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo2_");
1005   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1006   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1007   res=system(cmd.c_str());
1008   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1009
1010   cmd=execName+" --ndomains=5 --split-method="+MetisOrScotch; //on less proc
1011   sourceName=_file_name;
1012   targetName=_file_name;
1013   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo5_");
1014   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1015   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1016   res=system(cmd.c_str());
1017   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1018
1019   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on 1 proc
1020   sourceName=targetName+".xml";
1021   targetName=_file_name;
1022   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1023   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1024   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1025   res=system(cmd.c_str());
1026   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1027
1028   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on more proc
1029   //sourceName=targetName+".xml";
1030   targetName=_file_name;
1031   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1032   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1033   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1034   res=system(cmd.c_str());
1035   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1036 }
1037
1038 void MEDPARTITIONERTest::verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForMesh(std::string MetisOrScotch)
1039 {
1040   int res;
1041   string fileName,cmd,execName,sourceName,targetName,input;
1042   execName=getPartitionerExe();
1043   fileName=_file_name_with_faces;
1044
1045   ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* initialMesh=ParaMEDMEM::MEDFileUMesh::New(fileName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1046   ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* cellMesh=initialMesh->getLevel0Mesh(false);
1047   ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* faceMesh=initialMesh->getLevelM1Mesh(false);
1048
1049   cmd=execName+" --ndomains=5 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1050   sourceName=fileName;
1051   targetName=fileName;
1052   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo5_");
1053   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1054   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1055   res=system(cmd.c_str());
1056   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1057   input=targetName+".xml";
1058
1059   MEDPARTITIONER::ParaDomainSelector parallelizer(false);
1060   MEDPARTITIONER::MeshCollection collection(input,parallelizer);
1061   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3, collection.getMeshDimension());
1062   std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>cellMeshes=collection.getMesh();
1063   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(5, (int) cellMeshes.size());
1064   int nbcells=0;
1065   for (std::size_t i = 0; i < cellMeshes.size(); i++)
1066     nbcells+=cellMeshes[i]->getNumberOfCells();
1067   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), nbcells);
1068
1069   std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>faceMeshes=collection.getFaceMesh();
1070   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(5, (int) faceMeshes.size());
1071   int nbfaces=0;
1072   for (std::size_t i=0; i < faceMeshes.size(); i++)
1073     nbfaces+=faceMeshes[i]->getNumberOfCells();
1074   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(faceMesh->getNumberOfCells(), nbfaces);
1075
1076   //merge split meshes and test equality
1077   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1078   sourceName=targetName+".xml";
1079   targetName=fileName;
1080   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1081   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1082   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1083   res=system(cmd.c_str());
1084   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1085
1086   string refusedName=targetName+"1.med";
1087   ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* refusedMesh=ParaMEDMEM::MEDFileUMesh::New(refusedName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1088   ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* refusedCellMesh=refusedMesh->getLevel0Mesh(false);
1089   ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* refusedFaceMesh=refusedMesh->getLevelM1Mesh(false);
1090
1091   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), refusedCellMesh->getNumberOfCells());
1092   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(faceMesh->getNumberOfCells(), refusedFaceMesh->getNumberOfCells());
1093
1094   /*not the good job
1095     ParaMEDMEM::MEDCouplingMesh* mergeCell=cellMesh->mergeMyselfWith(refusedCellMesh);
1096     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), mergeCell->getNumberOfCells());
1097
1098     ParaMEDMEM::MEDCouplingMesh* mergeFace=faceMesh->mergeMyselfWith(refusedFaceMesh);
1099     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(faceMesh->getNumberOfCells(), mergeFace->getNumberOfCells());
1100
1101     CPPUNIT_ASSERT(faceMesh->isEqual(refusedFaceMesh,1e-12));
1102   */
1103
1104   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> meshes;
1105   std::vector<DataArrayInt *> corr;
1106   meshes.push_back(cellMesh);
1107   refusedCellMesh->tryToShareSameCoordsPermute(*cellMesh, 1e-9);
1108   meshes.push_back(refusedCellMesh);
1109   MEDCouplingUMesh* fusedCell=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(meshes,0,corr);
1110   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), fusedCell->getNumberOfCells());
1111
1112   meshes.resize(0);
1113   for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1114     corr[i]->decrRef();
1115   corr.resize(0);
1116   meshes.push_back(faceMesh);
1117   refusedFaceMesh->tryToShareSameCoordsPermute(*faceMesh, 1e-9);
1118   meshes.push_back(refusedFaceMesh);
1119   MEDCouplingUMesh* fusedFace=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(meshes,0,corr);
1120   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(faceMesh->getNumberOfCells(), fusedFace->getNumberOfCells());
1121
1122   for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1123     corr[i]->decrRef();
1124   fusedFace->decrRef();
1125   refusedFaceMesh->decrRef();
1126   faceMesh->decrRef();
1127   fusedCell->decrRef();
1128   refusedCellMesh->decrRef();
1129   refusedMesh->decrRef();
1130   cellMesh->decrRef();
1131   initialMesh->decrRef();
1132   //done in ~collection
1133   //for (int i = 0; i < faceMeshes.size(); i++) faceMeshes[i]->decrRef();
1134   //for (int i = 0; i < cellMeshes.size(); i++) cellMeshes[i]->decrRef();
1135 }
1136
1137 void MEDPARTITIONERTest::verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnCells(std::string MetisOrScotch)
1138 {
1139   int res;
1140   string fileName,cmd,execName,sourceName,targetName,input;
1141   execName=getPartitionerExe();
1142   fileName=_file_name;
1143   fileName.replace(fileName.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnCells.med");
1144
1145   ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* initialMesh=ParaMEDMEM::MEDFileUMesh::New(fileName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1146   ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* cellMesh=initialMesh->getLevel0Mesh(false);
1147
1148   cmd=execName+" --ndomains=5 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1149   sourceName=fileName;
1150   targetName=fileName;
1151   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo5_");
1152   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1153   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1154   res=system(cmd.c_str());
1155   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1156   input=targetName+".xml";
1157
1158   //merge split meshes and test equality
1159   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1160   sourceName=targetName+".xml";
1161   targetName=fileName;
1162   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1163   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1164   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1165   res=system(cmd.c_str());
1166   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1167
1168   string refusedName=targetName+"1.med";
1169   ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* refusedMesh=ParaMEDMEM::MEDFileUMesh::New(refusedName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1170   ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* refusedCellMesh=refusedMesh->getLevel0Mesh(false);
1171
1172   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), refusedCellMesh->getNumberOfCells());
1173
1174   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> meshes;
1175   std::vector<DataArrayInt *> corr;
1176   meshes.push_back(cellMesh);
1177   refusedCellMesh->tryToShareSameCoordsPermute(*cellMesh, 1e-9);
1178   meshes.push_back(refusedCellMesh);
1179   MEDCouplingUMesh* fusedCell=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(meshes,0,corr);
1180   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), fusedCell->getNumberOfCells());
1181
1182   MEDCouplingFieldDouble* field1=MEDLoader::ReadFieldCell(fileName.c_str(),initialMesh->getName().c_str(),0,"VectorFieldOnCells",0,1);
1183   MEDCouplingFieldDouble* field2=MEDLoader::ReadFieldCell(refusedName.c_str(),refusedCellMesh->getName().c_str(),0,"VectorFieldOnCells",0,1);
1184
1185   int nbcells=corr[1]->getNumberOfTuples();
1186   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), nbcells);
1187   //use corr to test equality of field
1188   DataArrayDouble* f1=field1->getArray();
1189   DataArrayDouble* f2=field2->getArray();
1190   if (_verbose>300)
1191     {
1192       cout<<"\nf1 : "<<f1->reprZip();
1193       cout<<"\nf2 : "<<f2->reprZip(); //field2->advancedRepradvancedRepr();
1194       for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1195         cout << "\ncorr " << i << " : " << corr[i]->reprZip();
1196
1197     }
1198   int nbequal=0;
1199   int nbcomp=field1->getNumberOfComponents();
1200   double* p1=f1->getPointer();
1201   double* p2=f2->getPointer();
1202   int* pc=corr[1]->getPointer();
1203   for (int i = 0; i < nbcells; i++)
1204     {
1205       int i1=pc[i]*nbcomp;
1206       int i2=i*nbcomp;
1207       for (int j = 0; j < nbcomp; j++)
1208         {
1209           if (p1[i1+j]==p2[i2+j]) nbequal++;
1210           //cout<<" "<<p1[i1+j]<<"="<<p2[i2+j];
1211         }
1212     }
1213   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(nbcells*nbcomp, nbequal);
1214
1215   for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1216     corr[i]->decrRef();
1217   field1->decrRef();
1218   field2->decrRef();
1219   fusedCell->decrRef();
1220   refusedMesh->decrRef();
1221   refusedCellMesh->decrRef();
1222   cellMesh->decrRef();
1223   initialMesh->decrRef();
1224 }
1225
1226 void MEDPARTITIONERTest::verifyMetisOrScotchMedpartitionerOnSmallSizeForFieldOnGaussNe(std::string MetisOrScotch)
1227 {
1228   int res;
1229   string fileName,cmd,execName,sourceName,targetName,input;
1230   execName=getPartitionerExe();
1231   fileName=_file_name;
1232   fileName.replace(fileName.find(".med"),4,"_WithVecFieldOnGaussNe.med");
1233
1234   ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* initialMesh=ParaMEDMEM::MEDFileUMesh::New(fileName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1235   ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* cellMesh=initialMesh->getLevel0Mesh(false);
1236
1237   cmd=execName+" --ndomains=5 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1238   sourceName=fileName;
1239   targetName=fileName;
1240   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_partitionedTo5_");
1241   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1242   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1243   res=system(cmd.c_str());
1244   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1245   input=targetName+".xml";
1246
1247   //merge split meshes and test equality
1248   cmd=execName+" --ndomains=1 --split-method="+MetisOrScotch;  //on same proc
1249   sourceName=targetName+".xml";
1250   targetName=fileName;
1251   targetName.replace(targetName.find(".med"),4,"_remergedFrom5_");
1252   cmd+=" --input-file="+sourceName+" --output-file="+targetName+" --verbose="+IntToStr(_verbose);
1253   if (_verbose) cout<<endl<<cmd<<endl;
1254   res=system(cmd.c_str());
1255   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0, res);
1256
1257   string refusedName=targetName+"1.med";
1258   ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* refusedMesh=ParaMEDMEM::MEDFileUMesh::New(refusedName.c_str(),_mesh_name.c_str());
1259   ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* refusedCellMesh=refusedMesh->getLevel0Mesh(false);
1260
1261   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), refusedCellMesh->getNumberOfCells());
1262
1263   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> meshes;
1264   std::vector<DataArrayInt *> corr;
1265   meshes.push_back(cellMesh);
1266   refusedCellMesh->tryToShareSameCoordsPermute(*cellMesh, 1e-9);
1267   meshes.push_back(refusedCellMesh);
1268   MEDCouplingUMesh* fusedCell=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(meshes,0,corr);
1269   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), fusedCell->getNumberOfCells());
1270
1271   MEDCouplingFieldDouble* field1=MEDLoader::ReadField(ON_GAUSS_NE,fileName.c_str(),initialMesh->getName().c_str(),0,"MyFieldOnGaussNE",5,6);
1272   MEDCouplingFieldDouble* field2=MEDLoader::ReadField(ON_GAUSS_NE,refusedName.c_str(),refusedCellMesh->getName().c_str(),0,"MyFieldOnGaussNE",5,6);
1273
1274   int nbcells=corr[1]->getNumberOfTuples();
1275   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(cellMesh->getNumberOfCells(), nbcells);
1276   //use corr to test equality of field
1277   DataArrayDouble* f1=field1->getArray();
1278   DataArrayDouble* f2=field2->getArray();
1279   if (_verbose>300)
1280     {
1281       cout << "\nf1 : " << f1->reprZip(); //123.4 for 12th cell,3rd component, 4th gausspoint
1282       cout << "\nf2 : " << f2->reprZip(); //field2->advancedRepradvancedRepr();
1283       for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1284         cout << "\ncorr " << i << " : " << corr[i]->reprZip();
1285
1286     }
1287   int nbequal=0;
1288   int nbptgauss=8;
1289   int nbcomp=field1->getNumberOfComponents();
1290   double* p1=f1->getPointer();
1291   double* p2=f2->getPointer();
1292   int* pc=corr[1]->getPointer();
1293   for (int i = 0; i < nbcells; i++)
1294     {
1295       int i1=pc[i]*nbcomp*nbptgauss;
1296       int i2=i*nbcomp*nbptgauss;
1297       for (int j = 0; j < nbcomp*nbptgauss; j++)
1298         {
1299           if (p1[i1+j]==p2[i2+j]) nbequal++;
1300           //cout<<" "<<p1[i1+j]<<"="<<p2[i2+j];
1301         }
1302     }
1303   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(nbcells*nbcomp*nbptgauss, nbequal);
1304
1305   for (std::size_t i = 0; i < corr.size(); i++)
1306     corr[i]->decrRef();
1307   field1->decrRef();
1308   field2->decrRef();
1309   fusedCell->decrRef();
1310   refusedMesh->decrRef();
1311   refusedCellMesh->decrRef();
1312   cellMesh->decrRef();
1313   initialMesh->decrRef();
1314 }
1315
1316 //================================================================================
1317 /*!
1318  * \brief Test for 0021756: [CEA 602] MEDPartitioner improvements
1319  */
1320 //================================================================================
1321
1322 void MEDPARTITIONERTest::testCreateBoundaryFaces2D()
1323 {
1324   // Fixed complains are:
1325   // - 2D is not available
1326   // - groups and family handling is bugged (probably due to bug in the handling
1327   //   of arrayTo in castIntField())
1328   // - creates boundary faces option is not handled
1329
1330   // Create a 2D mesh in a file
1331
1332   const char fileName[] = "tmp_testCreateBoundaryFaces2D.med";
1333
1334   const int idFam1 = 3, idFam2 = 2;
1335   int nbFam1, nbFam2, nbc;
1336   {
1337     const int nbX = 20, nbY = 15;
1338     vector<int> conn;
1339     vector<double> coor;
1340     for (int j=0; j<=nbY; j++)
1341       for (int i=0; i<=nbX; i++)
1342         {
1343           coor.push_back(i+.1);
1344           coor.push_back(j+.2);
1345         }
1346     int ii;
1347     for (int j=0; j<nbY; j++)
1348       for (int i=0; i<nbX; i++)
1349         {
1350           ii=i + j*(nbX+1);
1351           conn.push_back(ii);
1352           conn.push_back(ii+1);
1353           ii=ii + nbX + 2 ;
1354           conn.push_back(ii);
1355           conn.push_back(ii-1);
1356         }
1357     MEDCouplingUMesh *mesh=MEDCouplingUMesh::New();
1358     mesh->setMeshDimension(2);
1359
1360     nbc=conn.size()/4; //nb of cells
1361     mesh->allocateCells(nbc);
1362     int* pConn = &conn[0];
1363     for(int i=0; i<nbc; i++, pConn+=4)
1364       mesh->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4,4,pConn);
1365     mesh->finishInsertingCells();
1366
1367     int nbv=coor.size()/2; //nb of vertices
1368     DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
1369     myCoords->useArray( &coor[0], /*ownership=*/false, CPP_DEALLOC, nbv, 2 );
1370     mesh->setCoords(myCoords);
1371     mesh->setName("FacesIn2D");
1372     myCoords->decrRef();
1373     mesh->checkCoherency();
1374
1375     // groups of cells
1376     DataArrayInt* cellsFam=DataArrayInt::New();
1377     cellsFam->alloc(nbc,1);
1378     nbFam1 = nbc/3, nbFam2 = nbc/2;
1379     int iE = 0;
1380     for ( int i = 0; i < nbFam1; ++i ) cellsFam->getPointer()[ iE++ ] = idFam1;
1381     for ( int i = 0; i < nbFam2; ++i ) cellsFam->getPointer()[ iE++ ] = idFam2;
1382     for (            ; iE < nbc;     ) cellsFam->getPointer()[ iE++ ] = 0;
1383     map<string,int> theFamilies;
1384     theFamilies["FAMILLE_ZERO"]=0;
1385     theFamilies["Family1"     ]=idFam1;
1386     theFamilies["Family2"     ]=idFam2;
1387     map<string, vector<string> > theGroups;
1388     theGroups["Group1"].push_back("Family1");
1389     theGroups["Group2"].push_back("Family2");
1390
1391     // write mesh
1392     MEDFileUMesh * fileMesh = MEDFileUMesh::New();
1393     fileMesh->setMeshAtLevel(0, mesh);
1394     fileMesh->setFamilyInfo(theFamilies);
1395     fileMesh->setGroupInfo(theGroups);
1396     fileMesh->setFamilyFieldArr(0, cellsFam);
1397     fileMesh->write(fileName,2);
1398
1399     cellsFam->decrRef();
1400     mesh    ->decrRef();
1401     fileMesh->decrRef();
1402
1403   } // mesh creation
1404
1405   // Partition the mesh into 4 parts
1406
1407   const int ndomains = 4;
1408   ParaDomainSelector parallelizer(false);
1409   MeshCollection collection(fileName,parallelizer);
1410   ParallelTopology* aPT = (ParallelTopology*) collection.getTopology();
1411   aPT->setGlobalNumerotationDefault(collection.getParaDomainSelector());
1412
1413   std::auto_ptr< Topology > new_topo;
1414 #if defined(MED_ENABLE_METIS) || defined(MED_ENABLE_PARMETIS)
1415   new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,Graph::METIS) );
1416 #endif
1417 #if defined(MED_ENABLE_SCOTCH)
1418   if ( !new_topo.get() )
1419     new_topo.reset( collection.createPartition(ndomains,Graph::SCOTCH) );
1420 #endif
1421   if ( !new_topo.get() )
1422     return;
1423
1424   // Check that "2D is available"
1425
1426   const char xmlName[] = "tmp_testCreateBoundaryFaces2D";
1427   {
1428     MyGlobals::_Creates_Boundary_Faces = true;
1429     MeshCollection new_collection(collection,new_topo.get());
1430
1431     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfLocalMeshes());
1432     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(ndomains,new_collection.getNbOfGlobalMeshes());
1433     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(collection.getNbOfLocalCells(),new_collection.getNbOfLocalCells());
1434     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(0,collection.getNbOfLocalFaces());
1435     CPPUNIT_ASSERT      (new_collection.getNbOfLocalFaces() > 0 );
1436
1437     MyGlobals::_General_Informations.clear();
1438     MyGlobals::_General_Informations.push_back(SerializeFromString("finalMeshName=2D"));
1439     new_collection.write( xmlName );
1440   }
1441
1442   // Check that "groups and family handling is NOT bugged"
1443
1444   MeshCollection new_collection(std::string(xmlName)+".xml");
1445   std::map< int, int > famId2nb; // count total nb of cells in divided families
1446   std::map< int, int >::iterator id2nn;
1447   {
1448     const std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& famIdsVec = new_collection.getCellFamilyIds();
1449     for ( size_t i = 0; i < famIdsVec.size(); ++i )
1450       {
1451         ParaMEDMEM::DataArrayInt* famIdsArr = famIdsVec[i];
1452         for ( int j = famIdsArr->getNbOfElems()-1; j >= 0; --j )
1453           {
1454             id2nn = famId2nb.insert( make_pair( famIdsArr->getPointer()[j], 0 )).first;
1455             id2nn->second++;
1456           }
1457       }
1458   }
1459   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 3, (int) famId2nb.size() ); // 3 fams/groups in all
1460   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( 0      ));
1461   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( idFam1 ));
1462   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( idFam2 ));
1463   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( nbFam1, famId2nb[ idFam1 ]);
1464   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( nbFam2, famId2nb[ idFam2 ]);
1465   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( nbc - nbFam1 - nbFam2, famId2nb[ 0 ]);
1466
1467   // Check that "creates boundary faces option is handled"
1468
1469   famId2nb.clear();
1470   const std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& famIdsVec = new_collection.getFaceFamilyIds();
1471   for ( size_t i = 0; i < famIdsVec.size(); ++i )
1472     {
1473       ParaMEDMEM::DataArrayInt* famIdsArr = famIdsVec[i];
1474       for ( int j = famIdsArr->getNbOfElems()-1; j >= 0; --j )
1475         {
1476           id2nn = famId2nb.insert( make_pair( famIdsArr->getPointer()[j], 0 )).first;
1477           id2nn->second++;
1478         }
1479     }
1480
1481   CPPUNIT_ASSERT( !famId2nb.empty() );
1482
1483   // for each "JOINT_n_p_..." group there must be "JOINT_p_n_..." group
1484   // of the same size
1485   std::map<std::string,int>& famName2id = new_collection.getFamilyInfo();
1486   std::map<std::string,int>::iterator na2id = famName2id.begin(), na2id2;
1487   std::set< int > okFamIds;
1488   okFamIds.insert(0);
1489   for ( ; na2id != famName2id.end(); ++na2id )
1490     {
1491       if ( okFamIds.count( na2id->second ) || na2id->first[0] != 'J')
1492         continue;
1493       na2id2 = na2id;
1494       bool groupOK = false;
1495       while ( !groupOK && ++na2id2 != famName2id.end() )
1496         groupOK = ( na2id2->first.find_first_not_of( na2id->first ) == std::string::npos );
1497
1498       CPPUNIT_ASSERT( groupOK );
1499       CPPUNIT_ASSERT( na2id->second != na2id2->second);
1500       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( na2id2->second ));
1501       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( 1, (int) famId2nb.count( na2id->second ));
1502       CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( (int) famId2nb[ na2id2->second ],
1503                             (int) famId2nb[ na2id->second ]);
1504       okFamIds.insert( na2id2->second );
1505     }
1506 }