src/MEDPartitioner/MEDPARTITIONER_ScotchGraph.cxx

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  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "MEDPARTITIONER_Graph.hxx"
  21 #include "MEDPARTITIONER_ScotchGraph.hxx"
  22 #include "MEDPARTITIONER_Utils.hxx"
  23
  24 #include "MEDCouplingSkyLineArray.hxx"
  25
  26 #include <cstdio>
  27
  28 #ifdef MED_ENABLE_SCOTCH
  29 extern "C"
  30 {
  31 #define restrict
  32 #include "scotch.h"
  33 }
  34 #endif
  35
  36 using namespace MEDPARTITIONER;
  37
  38 SCOTCHGraph::SCOTCHGraph():Graph()
  39 {
  40 }
  41
  42 SCOTCHGraph::SCOTCHGraph(MEDCoupling::MEDCouplingSkyLineArray* graph, int* edgeweight):Graph(graph,edgeweight)
  43 {
  44 }
  45
  46 SCOTCHGraph::~SCOTCHGraph()
  47 {
  48 }
  49
  50 void SCOTCHGraph::partGraph(int ndomain, const std::string& options_string, ParaDomainSelector* sel)
  51 {
  52   if (MyGlobals::_Verbose>10)
  53     std::cout << "proc " << MyGlobals::_Rank << " : SCOTCHGraph::partGraph" << std::endl;
  54
  55   //number of graph vertices
  56   int n = _graph->getNumberOf();
  57   //graph
  58   int * xadj=const_cast<int*>(_graph->getIndex());
  59   int * adjncy=const_cast<int*>(_graph->getValue());
  60   //ndomain
  61   int nparts=ndomain;
  62
  63 #if !defined(MED_ENABLE_SCOTCH)
  64   throw INTERP_KERNEL::Exception("SCOTCHGraph::partGraph : SCOTCH is not available. Check your products, please.");
  65 #else
  66   //output parameters
  67   int* partition = new int[n+1];
  68
  69   SCOTCH_Graph scotch_graph;
  70   SCOTCH_graphInit(&scotch_graph);
  71   SCOTCH_graphBuild(&scotch_graph,
  72                     0, //base first indice 0
  73                     n, //nb of graph nodes
  74                     xadj,
  75                     0,
  76                     _cell_weight, //graph vertices loads
  77                     0,
  78                     xadj[n], //number of edges
  79                     adjncy,
  80                     _edge_weight);
  81   SCOTCH_Strat scotch_strategy;
  82   SCOTCH_stratInit(&scotch_strategy);
  83
  84   //!user-defined options for the strategy
  85   if (options_string!="")
  86     SCOTCH_stratGraphMap(&scotch_strategy,options_string.c_str());
  87
  88   if (nparts>1)
  89     {
  90       if (MyGlobals::_Verbose>10) std::cout << "SCOTCHGraph::graphPart SCOTCH_graphPart" << std::endl;
  91       SCOTCH_graphPart(&scotch_graph,nparts,&scotch_strategy,partition);
  92     }
  93   else  //partition for 1 subdomain
  94     {
  95     for (int i=0; i<n+1; i++)
  96       partition[i]=0;
  97     }
  98
  99   SCOTCH_stratExit(&scotch_strategy);
 100   SCOTCH_graphExit(&scotch_graph);
 101
 102   std::vector<int> index(n+1);
 103   std::vector<int> value(n);
 104   index[0]=0;
 105   for (int i=0; i<n; i++)
 106     {
 107       index[i+1]=index[i]+1;
 108       value[i]=partition[i];
 109     }
 110   delete [] partition;
 111
 112   //creating a skylinearray with no copy of the index and partition array
 113   //the fifth argument true specifies that only the pointers are passed
 114   //to the object
 115   _partition = new MEDCoupling::MEDCouplingSkyLineArray(index,value);
 116 #endif
 117 }